BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg495876 Length=2457 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G57800.1 | Symbols: FLP1, YRE, CER3, WAX2 | Fatty acid hydro... 3821 0.0 > AT5G57800.1 | Symbols: FLP1, YRE, CER3, WAX2 | Fatty acid hydroxylase superfamily | chr5:23420209-23424052 FORWARD LENGTH=2499 Length=2499 Score = 3821 bits (2069), Expect = 0.0 Identities = 2347/2472 (95%), Gaps = 56/2472 (2%) Strand=Plus/Plus Query 29 TTTCTGGGG-TTTTAATTCTCTCAACGAAC----TAAAAATCTCAACTAAAATTCTCCAT 83 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 41 TTTCTGGGGTTTTTAATTCTCTCAACGAACAAAAAAAAAAACTCAACTAATATTCTCCAT 100 Query 84 CATCTTTCTTCAAGATTTAAGAGAGAAACCTTATCGTTAAATtctctc-tctctctTCTT 142 | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| Sbjct 101 CCTCTTTCTTC-AGATTT-A-AGAGAAACCTTATCGTTATATTCTCTCTTCTCTTTTCTT 157 Query 143 TTTGACTCCCACAAGAGAAGAAAGCAAATTTCTTTTTCTCAGGATTGCTTGAAAACTGGA 202 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 158 TTTGACTCCCAC-A-AGAAGAAAGCAAATTTCTTTTTCTCAGGATTGCTTGAAAACTGTA 215 Query 203 GAAATCTTTAAGG-TTTTTTAGACCAATAAGAG-C-------gagagagagagag--aga 251 ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| Sbjct 216 GAAATCTTTAAGGTTTTTTTACACCAATAAGAGTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA 275 Query 252 gagaTCTATTCATAAAAAAGACA-G--A--T-AA-T-C-------T--C--AAATAACAA 292 ||||||||||||||||||||||| | | | || | | | | | ||||||| Sbjct 276 GAGATCTATTCATAAAAAAGACAGGTAATCTCAACTCCGAGGAGATAACTGATATAACAA 335 Query 293 TTTGagagaat---aagaagaagaagaagaagaccaagc-agaagaaTGGTTGCTCTTTT 348 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| Sbjct 336 TTTGAGAGAATAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACCAAGCTA-AAGAATGGTTGCTTTTTT 394 Query 349 ATCAGCTTGGCCTTGGGAAAACTTTGGCAACCTCAAGTATCTTCTCTACGCTCCATTAGC 408 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 395 ATCAGCTTGGCCTTGGGAAAACTTTGGCAATCTCAAGTATCTTCTCTACGCTCCATTAGC 454 Query 409 TGCACAAGTAGTGTACTCGTGGGTATATGAAGAAGATATCTCAAAGGTTCTTTGGTGTAT 468 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 455 TGCACAAGTAGTGTACTCGTGGGTCTATGAAGAAGATATCTCAAAGGTTCTTTGGTGTAT 514 Query 469 TCATATTCTCATAATCTGTGGACTCAAAGCACTCGTTCATGAACTATGGAGCGTTTTCAA 528 |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515 TCATATTCTCATAATCTGCGGTCTCAAAGCACTTGTTCATGAACTATGGAGCGTTTTCAA 574 Query 529 CAACATGCTTTTCGTGACTCGTACTCTAAGGATTAACCCTAAAGGCATCGACTTTAAGCA 588 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 575 CAACATGCTTTTCGTGACTCGTACTCTAAGGATTAACCCTAAAGGGATCGACTTTAAACA 634 Query 589 GATTGATCACGAATGGCACTGGGACAATTACATAATCCTACAAGCAATAATAGTGAGCCT 648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 635 GATTGATCACGAATGGCACTGGGACAATTACATAATCCTACAAGCAATAATAGTGAGCCT 694 Query 649 GATCTGTTACATGTCACCACCATTGATGATGATGATAAACAGTCTTCCTCTGTGGAACAC 708 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 695 GATCTGTTACATGTCACCACCATTGATGATGATGATAAACAGTCTTCCTCTGTGGAACAC 754 Query 709 GAAAGGACTCATCGCATTAATTGTGCTACATGTGACTTTCTCAGAGCCTTTATACTACTT 768 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 755 GAAAGGACTCATCGCATTAATTGTGCTACATGTGACTTTCTCAGAGCCTTTATACTACTT 814 Query 769 TCTGCACAGATCTTTCCATCGTAACAACTACTTCTTCACCCATTACCACTCTTTCCACCA 828 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 815 TCTGCACAGATCTTTCCATCGTAACAACTACTTCTTCACACATTACCACTCTTTCCACCA 874 Query 829 CTCATCTCCTGTTCCACATCCCATGACTGCTGGAAACGCAACGTTATTAGAAAACCTTAT 888 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 875 CTCATCTCCTGTTCCACATCCCATGACTGCTGGAAACGCAACGTTATTGGAAAACATTAT 934 Query 889 CCTCTGTGTTGTAGCTGGTGTTCCTTTGATTGGATCTTGCTTGTTTGGTGTTGGATCATT 948 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 935 CCTCTGTGTCGTAGCTGGTGTTCCATTGATTGGATGTTGCTTGTTTGGTGTTGGATCATT 994 Query 949 AAGTGTC-ATCTACGGTTACGCTGTTATGTTTGATTTCATGAGATGTTTAGGACATTGTA 1007 ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 995 AAGTG-CGATCTACGGTTACGCTGTTATGTTTGATTTCATGAGGTGTTTAGGACATTGTA 1053 Query 1008 ACGTTGAGATCTTCTCTCACAAGCTGTTCGAGATGCTTCCAATCCTACGATATCTCATCT 1067 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct 1054 ACGTTGAGATATTCTCTCACAAGCTGTTCGAGATTCTTCCAGTCTTACGATATCTCATCT 1113 Query 1068 ACACTCCAACGTACCATAGTCTGCATCATCAAGAAATGGGGACCAACTTTTGTCTATTTA 1127 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1114 ATACTCCAACGTACCATAGTCTGCATCATCAAGAAATGGGGACCAACTTTTGTCTATTTA 1173 Query 1128 TGCCTATCTTTGATGTTTTGGGCGATACACAAAACCAAAACTCATGGGAACTCCAAAAGA 1187 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1174 TGCCTCTCTTTGATGTTTTGGGCGATACACAAAACCCAAACTCATGGGAACTCCAAAAGA 1233 Query 1188 AGATTCGTTTGAGTGCAGGGGAACGGAAGAGAGTGCCGGAGTTCGTGTTCTTAGCTCACG 1247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1234 AGATTCGTTTGAGTGCAGGGGAACGGAAGAGAGTGCCGGAGTTTGTGTTCTTAGCTCACG 1293 Query 1248 GAGTTGATGTGATGTCGGCGATGCATGCACCGTTCGTGTTCAGATCTTTTGCTTCAATGC 1307 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1294 GAGTTGATGTAATGTCGGCGATGCATGCACCGTTCGTGTTCAGATCTTTTGCTTCAATGC 1353 Query 1308 CATACACTACGAGGATTTTCTTGCTACCGATGTGGCCATTCACGTTCTGTGTTATGTTGG 1367 |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1354 CATATACCACAAGGATATTCTTGCTACCGATGTGGCCATTCACGTTCTGTGTTATGTTGG 1413 Query 1368 GCATGTGGGCTTGGTCAAAGACTTTTCTTTTCAGCTTTTATACCCTTAGGAACAATCTTT 1427 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 1414 GCATGTGGGCTTGGTCAAAGACTTTTCTTTTCAGCTTCTATACCCTCAGGAACAATCTTT 1473 Query 1428 GCCAGACTTGGGGAGTTCCAAGATTCGGATTCCAATACTTCTTACCGTTTGCTACACAAG 1487 | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1474 GTCAGACTTGGGGCGTTCCTAGATTCGGATTCCAATACTTCTTACCGTTTGCTACAAAAG 1533 Query 1488 GCATTAATGATCAGATCGAGGCTGCGATTCTTAGAGCTGATAAGATTGGTGTTAAAGTTA 1547 | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1534 GAATTAATGATCAAATTGAGGCTGCGATTCTTAGAGCTGATAAGATTGGTGTTAAAGTTA 1593 Query 1548 TAAGCTTGGCTGCTCTCAACAAGAACGAAGCTCTAAATGGTGGTGGAACACTGTTTGTCA 1607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1594 TAAGCTTGGCTGCTCTCAACAAGAACGAAGCTCTAAATGGTGGTGGAACACTGTTTGTCA 1653 Query 1608 ACAAGCATCCTGACCTTAGAGTTCGTGTGGTTCATGGGAACACTTTAACTGCAGCAGTGA 1667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1654 ACAAGCATCCTGACCTTAGAGTTCGTGTGGTTCATGGGAACACTTTAACTGCAGCAGTGA 1713 Query 1668 TTCTCAATGAAATTCCAAAAGATGTGAAAGAGGTTTTCTTGACTGGAGCCACTTCTAAGC 1727 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1714 TTCTCTATGAAATTCCAAAAGATGTGAATGAGGTTTTCTTGACTGGAGCCACTTCTAAGC 1773 Query 1728 TGGGAAGAGCTATTGCTCTTTACCTTTGTCGCCGTGGAGTGAGAGTTCTCATGTTGACAT 1787 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1774 TGGGAAGAGCTATTGCTCTTTACCTTTGTCGCCGTGGAGTGAGAGTTCTCATGTTGACAT 1833 Query 1788 TATCTGTGGAAAGGTTCCAAAAGATTCAGAAAGAGGCTCCTGTTGAGTTCCAGAACTACC 1847 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1834 TGTCTATGGAAAGGTTCCAAAAGATTCAGAAAGAGGCTCCTGTTGAGTTCCAGAACAACC 1893 Query 1848 TTGTACAAGTGACCAAATACAATGCTGCTCAACACTGCAAGACTTGGATCGTTGGAAAAT 1907 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1894 TTGTACAAGTGACCAAATACAATGCTGCTCAACACTGCAAGACTTGGATCGTTGGAAAAT 1953 Query 1908 GGTTAACACCAAGAGAGCAGAGCTGGGCTCCTGCAGGGACGCATTTCCATCAGTTTGTGG 1967 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1954 GGTTAACACCAAGAGAGCAGAGCTGGGCTCCTGCAGGGACGCATTTCCATCAGTTTGTGG 2013 Query 1968 TGCCACCGATCCTCAAGTTTAGACGGAACTGCACTTACGGCGATCTAGCAGCTATGAAGC 2027 ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2014 TGCCACCAATCCTTAAGTTTAGAAGGAACTGCACTTACGGTGATCTAGCAGCTATGAAGC 2073 Query 2028 TCCCTAAAGATGTTGAAGGACTCGGAACTTGCGAGTACACGATGGAGAGAGGGGTAGTGC 2087 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 2074 TCCCTAAAGATGTTGAAGGACTCGGAACTTGCGAGTACACGATGGAGAGAGGGGTGGTAC 2133 Query 2088 ACGCGTGCCATGCAGGAGGAGTGGTTCATATGCTTGAGGGTTGGAAGCATCATGAGGTTG 2147 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2134 ATGCGTGCCATGCAGGAGGAGTGGTTCATATGCTTGAGGGTTGGAAGCATCATGAGGTTG 2193 Query 2148 GAGCCATTGACGTTGACCGTATCGATTTGGTGTGGGAAGCAGCCATGAAGTATGGTCTTA 2207 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2194 GAGCCATTGATGTTGACCGTATCGATTTGGTGTGGGAAGCAGCCATGAAGTATGGTCTTA 2253 Query 2208 GCGCTGTTTCTTCACTCACAAATTGAGTGAAGAGAGAGACACTTTTCATTGTTGTCTTT- 2266 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2254 GTGCTGTTTCTTCACTCACAAATTGAGTGAAGAGAGAGACACGTTTCATTGTTGTCTTTT 2313 Query 2267 GACTCTCCCAAGATTGGTCATTCTTTGTACAGGTGAAAAG-GACGCAAGCAGGAAAAGAA 2325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || Sbjct 2314 GACTCTCCCAAGATTGGTCATTCTTTGTACAGGTGAAAGGAGATGCAAGCAGGAAAA-AA 2372 Query 2326 AAATTAGAATTTCACCTTATGTTATTGTTTTACCTTTTATTAATGATGTATTCCtttttt 2385 || | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || Sbjct 2373 AAGT-AGAATTTCACCTTATGT-ATTGTTTTATCTTTTATTAATGATGTATTACTTTCTT 2430 Query 2386 ttttAGATTTCCTTAGTATTAATATATATGCACCTAATTTCCAAGAAAATTCAACAAAGC 2445 ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2431 TTT-AGATTTCCTTAATATTAATATAT--GCACCTAATTTCCAAGAAAATTCAACAAAGC 2487 Query 2446 TTTAAATTATCC 2457 ||| |||||||| Sbjct 2488 TTTTAATTATCC 2499 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 121905671490 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5