BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495918
Length=5992
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G58140.2 | Symbols: PHOT2, NPL1 | phototropin 2 | chr5:23524... 5956 0.0
AT5G58150.1 | Symbols: | Leucine-rich repeat protein kinase fa... 4093 0.0
> AT5G58140.2 | Symbols: PHOT2, NPL1 | phototropin 2 | chr5:23524427-23533111
FORWARD LENGTH=6033
Length=6033
Score = 5956 bits (3225), Expect = 0.0
Identities = 3625/3818 (95%), Gaps = 28/3818 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1867 ATCCAAGCGGGTGGAGAAACAGTGGGACTACATCATTTCAAACCAATAAAACCCCTGGGC 1926
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1860 ATCCAAGCGAGTGGAGAAACAGTGGGACTACATCATTTCAAACCAATAAAACCGTTGGGC 1919
Query 1927 TCTGGTGATACTGGCAGTGTCCATCTGGTTGAGCTGAAGGGTACGGGTGAATTATATGCC 1986
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 1920 TCTGGTGATACTGGCAGTGTCCATTTGGTTGAGCTGAAGGGCACGGGTGAACTATATGCC 1979
Query 1987 ATGAAAGCAATGGAGAAAGCAATGATGTTGAATCGTAACAAGGCTCACCGAGCATGCATC 2046
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1980 ATGAAAGCAATGGAGAAAACAATGATGTTGAATCGTAACAAGGCTCACCGAGCGTGCATC 2039
Query 2047 GAAAGGGAAATCATTTCCCTTCTGGATCATCCTTTCCTTCCCACTCTCTACACTTCTTTT 2106
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 2040 GAAAGGGAAATCATTTCCCTTCTGGATCATCCATTCCTTCCTACTCTCTACGCTTCTTTT 2099
Query 2107 CAGACATCTACACACGTTTGTTTGATTACAGACTTCTGCCCAGGTGGAGAGTTGTTTGCA 2166
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 CAGACCTCTACGCACGTCTGTTTGATTACAGACTTCTGCCCAGGTGGAGAGTTGTTTGCA 2159
Query 2167 CTGCTTGACAGACAACCTATGAAAATATTGACAGAGGACTCTGCAAGGTTTTATGCAGCA 2226
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2160 CTACTTGACAGACAACCTATGAAAATATTGACAGAAGACTCTGCAAGGTTCTATGCAGCA 2219
Query 2227 GAGGTCGTTATCGGCTTAGAATATCTTCACTGCTTAGGAATTGTATATCGAGACCTGAAG 2286
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GAGGTTGTTATCGGCTTAGAATATCTTCACTGCTTAGGAATTGTATATCGAGACCTGAAG 2279
Query 2287 CCTGAAAATATACTGCTCAAGAAGGATGGACACATTGTATTAGCTGACTTTGATTTATCA 2346
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2280 CCTGAGAATATACTGCTCAAGAAGGATGGACACATAGTATTGGCTGACTTTGATTTATCA 2339
Query 2347 TTCATGACGACCTGCACACCCCAGCTTATTATTCCAGCTGCACCTAGCAAACGAAGGAGA 2406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TTCATGACGACCTGCACACCCCAGCTTATTATTCCAGCTGCACCTAGCAAACGAAGGAGA 2399
Query 2407 TCTAAGAGTCAACCACTACCCACATTTGTTGCAGAACCAAGTACCCAGTCAAACTCGTTC 2466
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 TCCAAAAGTCAACCACTACCCACATTTGTTGCAGAACCAAGTACCCAGTCAAACTCGTTC 2459
Query 2467 GTCGGAACTGAAGAATACATTGCGCCTGAGATAATCACGGGTGCTGGTCATACAAGTGCT 2526
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GTAGGAACTGAAGAATACATTGCGCCTGAGATAATCACGGGTGCTGGTCATACAAGTGCT 2519
Query 2527 ATTGATTGGTGGGCACTGGGTATCTTGTTGTATGAGATGCTTTATGGTCGCACACCTTTC 2586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 ATTGATTGGTGGGCACTGGGTATCTTGTTGTATGAGATGCTTTATGGTCGCACACCTTTC 2579
Query 2587 AGGGGTAAGAATAGGCAAAAGACATTTGCCAACATCTTGCACAAAGATCTCACCTTCCCC 2646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2580 AGGGGTAAGAATAGGCAAAAGACATTTGCCAACATCTTGCACAAAGATCTCACTTTCCCC 2639
Query 2647 AGCAGTATCCCTGTAAGTCTTGTAGGTAGACAGTTGATCAACACGTTGTTAAATAGAGAT 2706
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 AGCAGTATCCCTGTGAGTCTTGTAGGTAGACAGTTGATCAACACGTTGTTAAATAGAGAT 2699
Query 2707 CCGAGCAGTCGATTAGGATCCAAAGGTGGGGCAAATGAGATAAAGCAGCACGCTTTCTTC 2766
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2700 CCGAGCAGTCGGTTAGGATCCAAAGGTGGGGCAAATGAGATAAAGCAGCATGCTTTCTTT 2759
Query 2767 CGCGGGATCAATTGGCCTCTCATACGAGGCATGAGTCCTCCACCACTGGATGCACCATTG 2826
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2760 CGCGGGATCAATTGGCCTCTCATACGAGGCATGAGTCCTCCACCACTGGATGCACCGTTG 2819
Query 2827 AACATTATCGAGAAAGATCCGAATGCCAAAGATATAAAGTGGGAAGATGATGGAGTTCTT 2886
| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2820 AGCATAATCGAAAAAGATCCGAATGCCAAAGATATAAAGTGGGAAGATGATGGAGTGCTT 2879
Query 2887 GTGAATTCTACGGACTTGGACATTGACCTCTTCTAATCCCACTCTT--TGTCTCTGCTTT 2944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||
Sbjct 2880 GTGAATTCTACGGACTTGGACATTGACCTCTTCTAATCCTATTCTTCCTCTCTCTGCCTT 2939
Query 2945 TGATTCTCATATTATGCAAAACTCTTCTTCACAATAAAAGCCAAGGTGTTGTTGTACTTG 3004
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 TGATTCTCAAATTATGCAAAACTCTTCTTCTCAATAAAAGCCAAGGTGTTGTTGTACTTG 2999
Query 3005 TAGATGTTTTTACATATAAACGGCTCGTTTCATGTTTTTCCATTTCTTCTAATCAACAAC 3064
||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 TAG-T-TGCTTAAATATAAACGGCTCTTTTCATGTTTTTCCATTTCTTCTAATCAACAAC 3057
Query 3065 GATAAACATACAACAAC--AA-ACTTGTTGTTAATAATGATGTTAAGTGTCATAAGCCCA 3121
|||||||||| | ||| || | |||||||| | ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3058 AATAAACATAC-A-AACTTAAGA-GCCATGTTAATATTCATGTTAAGTGTGATAAGCCCA 3114
Query 3122 TTATAAGGCCCACTAACTGGCCCATTAGTAGTTGGGAGAAATGTCTTTGAGAAGTCCAAC 3181
|||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 TTATGAGGCCCA-TAACTAGCCCACTAGTAGTTGGGAGAAATGTCTTTGAGAAGTCCAAC 3173
Query 3182 CACCTGCTGCATCGTAGGTCGCTTCCATGGCAGATCGGCGGTGCACAAGTACCCTATCTT 3241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3174 CACCTGCTGCATCGTAGGTCGCTTCCATGGCAGATCGGCGGTACACAAGTACCCTATCTT 3233
Query 3242 CACCGCCTCCGCGATTTCATCCTCTGGAACTGTCTCTCGCATCGTCGGATCAATGGCTCT 3301
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3234 CACCGCCTCCGCGATTTCATCCTCCGGAACTGTCTCTTGCATCGTCGGATCAATGGCTCT 3293
Query 3302 CAATCCTTGTCCCTGCCTCACTAACCCTCTCACCCAATTCACCAAGTC-CTCCTCCGGCT 3360
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 3294 CAATCCTTGTCCCTGCCTCACCAACCCTCTCACCCAATTCACCAAGTCAC-CCTCCGGCT 3352
Query 3361 TCTTCCCACTCACAAGCTCAAGCAAAACAACTCCAAAGCTATACACATCGGATTCTAATG 3420
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3353 TCTTCCCACTCACGAGCTCAAGCAAAACAACTCCAAAGCTATACACATCGGATTCTAATG 3412
Query 3421 TCGGAGAAGCATTTCGCTCCTGTTCCGGTGATGTGTACCCGTCTAAACTTTCGGAACCGG 3480
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3413 TCGGAGAAGCATTTCGCTCCTGTTCCGGTGGTGTGTACCCGTCTAAACTTTCGGAACCGG 3472
Query 3481 GAAATTCCTCGTCCAAGAGTTTGACTAATCCAAAGTCTGCTAAACGTGGCTCCTGGCTAG 3540
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3473 GAAATTGCTCGTCCAAGAGTTTAACTAAACCAAAGTCTGCTAAGCGTGGCTCCTGGCTAG 3532
Query 3541 AGTCTAACCAGATTGTTGCAGCCTTCACTTCTCCGTGGACCATTGGAGGAATGCAGCCAT 3600
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3533 AGTCTAACAAGATTGTTGCAGCCTTCACTTCTCCGTGGACCATTGGAGGAATGCAGCCAT 3592
Query 3601 GGTGAAGGAAAGCTAATGCCCTCGCTGTCCCCAAAGCTATCTTATGCCGAAGTCTCCACG 3660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3593 GGTGAAGGAAAGCTAATGCCCTCGCTGTCCCCAAAGCTATCTTATGCCGAAGTCTCCAAG 3652
Query 3661 GTGCAGAATCGTCTGCGTTGTTATGGAGTA-AGCTTTGCAGATTAACCATGTCTAGGTCC 3719
|||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3653 GTGCAGAATCATCTCCGTTGTTATGGAGTAGA-CTTTGCAAATTAACCATGTCTAAGTCC 3711
Query 3720 TCGTAGATCGCAATTCTTTGCTCTGTGGCTATACAGTATCCACAGAGCGGGACAAGATTT 3779
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3712 TCGTAGATTGCAATTCTTTGCTCTGTCGCTATACAGTATCCACAGAGCGGGAAAAGATTT 3771
Query 3780 GGGTGATTGATCCTGGCGAGACGTTCAAAAGCAATCGAGACTTCCGTATCAGTCAATGTG 3839
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3772 GGGTGATTGATCCTAGCGAGACGTTCAAATGCAATCGAGACTTCAGTATCAGTCAATGTG 3831
Query 3840 CTTCCACTTGGGACAACTTTTATAGCTGCTCTGAATCCATTGGGTAGGACTGCTCCATAA 3899
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||
Sbjct 3832 GTTCCACTTGGGATAACTTTTAGAGCTGCTCTGAATCCACCGGGTAAGACTGCTCCGTAA 3891
Query 3900 GTAGGACCAGACTTGCCTTCCGACAACAATGTGCCTCTGTCGAAGTTGAAAGTCGCAGCC 3959
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3892 GTAGGACCAGACTTGCCTTCCCACAACATTGTGCCTCTGTCGAAGTTGAAAGTCGCAGCC 3951
Query 3960 TTTAGGTCTGCAAGCGTCATCTTCATCAATGGCTTGTCGATCATTACCACAGGGATTTGC 4019
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3952 TTTAGGTCTGCAAGCGTCATTTTCATTAATGGCTTGTCGATCATTACCACAGGGATTTGC 4011
Query 4020 GTTGCGTGCTTGACATCGGTGGTTGAGTCATTTTGGTCTGGGGAGTTGGGTTCTGTGTTG 4079
||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4012 GTTGCTTGCTTGATATCAGTGGTTGAGTCGTGTTGGTCTGGGGAGTTGGGTTCTGTGTTG 4071
Query 4080 TTTATGGCTAGCTTTGTTGCCCAAGTTCTTGATTTTCTTCTACCTCTCAAGACTACAAGT 4139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 4072 TTTATGGCTAGCTTTGTTGCCCAAGTTCTTGATTTTCTTCTAACTCTCAAGGCTACAAGT 4131
Query 4140 ATGAGCAATAGTCCTACAAGTAAGAACGCCATTGAGATTGCTAACCCCAAACCAATCTTA 4199
||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4132 ATGAGCAGTAGTCCTATAAGTAAGAACGCCATGGAGATTGCTAACCCCAAACCAATCTTA 4191
Query 4200 AGCCCTGTCTTCTTCTTGTTGACTTTCTTTCCTTTTGTAACAATTGGCTTTGCAGCGAAG 4259
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4192 AGCCCTGTATTCTTCTTGTTGACTTTCTTTCCTTTTGTAATAATTGGCTTTGCAGCGAAG 4251
Query 4260 GGGCAGTTGTTTGTAG-AGTTAATGAATGATCTCTGTATTGTTTCTTGTGAGAAGTTGGG 4318
|||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4252 GGGCAGTTGTTTCTAATA-TTAATGAAGGATCTCTGGATTGTTTCTTGGGAGAAGTTGGG 4310
Query 4319 GATGCAAAAGGTTAGATTGTTGTAAGAGAAGTTAAACCTTTGCATCATGGGGAGTTTCTC 4378
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4311 GTTGCAAAAGGTTAGATTGTTGAAAGAGAAGTTAAACCTTTGCATCATGGCGAGTTTCTC 4370
Query 4379 CAGAATCGGCCTTGGGATGTCTCCGTCTAGCTTATTCAGCGAGAGATCAAGTACTTCAAT 4438
|| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4371 CAAAAGCGGCCTTGGGATATCTCCGTCTAGCTTATTCAACGAGAGATCAAGTACTTCAAT 4430
Query 4439 GTTCTTGAGGCTCAACATAGGCACATGGCCAGTGAGATTATTGGAGGAGAGATCAAGAAC 4498
|||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4431 GTTCTTGACGCTCAGCATAGGCACGTGGCCAGTGAGATTATTGGAGGAGAGATCAAGAAC 4490
Query 4499 CTTCAGATGACTCAGCCGCGAGATTTCACTCGGAATGATATTAGTGAGATTGGTCCTTGA 4558
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4491 CTTCAGATGACTCAGCCGCGAGATTTCACGCGGAATGATATTAGTGAGATTGGTCCTTGA 4550
Query 4559 TAGGTTCAGATAATGTAGCGCTGAAAGCTTGCCGATTTGC-GGGAACTTCT-GTGCCCTG 4616
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||
Sbjct 4551 TAGATTCAGATAATGTAGCGCAGAAAGCTTGCCGATTT-CTGGGAACT-CTTGTGCCCTG 4608
Query 4617 AATCGATTGCACGCGAGGTTAAGGTATCCCAGCTTATGAGCTGAACTCAAACCATTAAAT 4676
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4609 AATCGATTGCACGCGAGGTTAAGGTGTCCCAGCTTGTGAGCTGAACTCAAACCATTGAAT 4668
Query 4677 ATATGACCGACAAAGCTATTATCAGACAAGTCAAGATGAATCAGACTAGACCAGTTGTGT 4736
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4669 ATATGGCCGACAAAGCTATTATCGGACAAGTCAAGATGAATCAGACTAGACCAGTTGTGT 4728
Query 4737 TTGTGGCCGGGTATTAACTGCAAGATATGCTCATCAAATCGGTTTTCACTGAGATCAACT 4796
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4729 TTGTGGCCGGGTATTAACTGCAAGATATGCCCATCAAATCGGTTTTCACTGAGATCAACT 4788
Query 4797 GTTTCCACGTTTTCATGCAAGACTCCTATCAATGAACCCTGAAACAGATTCCTTGAAAGG 4856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 4789 GTTTCCACGTTTTCATGCAAGACTCCTATCAATGAACCCTGAAACAGATTTCGTGAAAGG 4848
Query 4857 TTCAAGCTTTTTAGTTGTGGGAAAGCTGAACCAAAACCGACAGGCAGAGGCCCGCTGAGC 4916
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||
Sbjct 4849 TTCAAGCTTTTTAGTAGTGGGAAAGCTGAACCAAAACCGACAGGCAGAGACTCGTTGAGG 4908
Query 4917 CTGTTGGATGAGAGGTCGATGGAGACTAGAGATTGGCAATGGAGGAGTCCTGGAGGGACG 4976
| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 4909 CGGTTGGATGAGAGGTCGATGGAGAGTAGAGATCGGCAATGGACAAGTTCTGGAGGGACG 4968
Query 4977 CCAGACTGAAAGTCATTGTTGTGGAGCTTGAGAGTTGTTAGATTGACAAGGGAGCTTATA 5036
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4969 CCAAACTGAAAGTCATTGTTGTGGAGCTTGAGAGTTGTTAGATTGACAAGGTTGCTTATT 5028
Query 5037 GCAGCAGGGATTTCACCAGAGAAGCTGTTGAAAGAAAGATCAAGGGTGTGAAGCGACATG 5096
|| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5029 GCGGCAGGGATTTTGCCAGAGATGCTGTTGAAAGAAAGATCAAGGGTGTGAAGCGACATG 5088
Query 5097 AAATTGCCGATGTTGCTGGGAAGACGCTCAGAAATCCGGTTGGAGGAGAGATTGAGACTC 5156
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5089 AAATTGCCGATGTTGCTGGGAAGAGGCTCAGAAATCCGGTTGGAGGAGAGATTGAGACTC 5148
Query 5157 TCAAGCAAGCTGAGACTCCACAAATCCGAGGGTAGAGACGTAATCTTGTTTCCACTGACA 5216
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5149 TCAAGCAAGCTGAGACTCCACAAATCCGAGGGGAGAGACGTAATCTTGTTTCCACTGAGA 5208
Query 5217 TCTAAAGTTTGGAGCTTACTCATTTTGCCAATGGTGTTGTCGGGGATCGAACCAGACAGG 5276
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5209 TCTAAAGTTTGGAGCTTACTCATTTTGCCAATAGTGTTGTCGGGGATCGAACCAGACAGG 5268
Query 5277 TCCAACCCAGAAGCCGAAATATGGAGCACATTCTCTCTAGAGTCACAGACGACCACTCCT 5336
||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5269 TCCAACCCAGAAGCCGAAATATGCAACACATTCTCACTAGAGTCACAGACGACCACTCCT 5328
Query 5337 GGCCATGAACATGAAG-AAGAAAATGTGTGAGCTTGGGGAGAATTGGGTAATCTCAATGC 5395
||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5329 GGCCATGAACAC-AAGGAAGAAAACGTATGAGCTTGGGGAGAATTGGGTAATCTCATTGC 5387
Query 5396 GGAGAAGAAGCTGGAGAGATAATAAGCGTCGGTGTTAGGATCTAGGCTCGTCAGATGCTT 5455
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5388 GGAGAAGAAGCTAGAGAGATGATAAGCGTCGGTGTTGGGATCTAGGCTCGTCAGATGCTT 5447
Query 5456 GACGAAGAAGGAGAAGAACAGAAGAGATCCCCATAGAGACAACCTCATAATTTGGTGTTG 5515
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 5448 GACGAAGAAGGAGAAGAACAGGAGAGATCCCCATAGAGACAACCTCATAACTTGGTGGTG 5507
Query 5516 TCTGG-AGGTGGAGAAAAGT-GGATGGGAAAGCTCAGAAAGAAGACAGACTGTGTGAAAA 5573
||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5508 TCTGGGAC-TGGAGAAA-GTTGGATGGGAAAGCTCAGAAAGAAGACAGACTGTGTGAAAA 5565
Query 5574 GAAGAAAAGACATAATGGAATCACGGGGCAGAGAGGTGATGATAGTTTAGAATACATTGA 5633
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5566 GAAGAAAAGACATAATGGAATCACGGGGCATAGAGGTGATGATAGTTTAGAATACATTGA 5625
Query 5634 GATCCCTTTCACGTGCACAGCTTCaaaaaaaaT-AGAA 5670
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5626 AATCCCTTTCACGTGCACAGCTTCAAAAAAAATCAGAA 5663
Score = 2747 bits (1487), Expect = 0.0
Identities = 1688/1782 (95%), Gaps = 25/1782 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGAAACAGTACAGTTGTGTTTTTTAATTGGTCTATCTATCTCTCAAAGT-TTTCTCATC 59
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||
Sbjct 1 TGGAAACAGTACAGTTGTGTTTTTTAATTGGTCTATC--TCTCT---A-TCTTTCTCATC 54
Query 60 GTCTTTGCTCCTTTTAAAGACTCTGTACTATATTTCCATGAGTTGCAGCTGATAAAGCTA 119
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 GTCTTTGCTCCTTTTAAAGACTGTGTACTATATTTCCATGAGTTGCAGCTGATAAAGCTA 114
Query 120 CTCTGGTATTATTCATTACTCTGTTTCGCCAAAAGAAAGAGAATAAAGAAACATTATGGA 179
|||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 115 CTCT-G-ACTATTCATTACTCTGTTTCGCCATAAGAAAGAGAATAAAGAAACGTTATGGA 172
Query 180 GAGGCCTAGAGCCCCTCCATCTCCCTTGAATGATACGGAGCCATTAACTGAACGTAGATC 239
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 173 GAGGCCAAGAGCCCCTCCATCTCCTTTGAATGATGCGGAGTCATTAAGTGAACGTAGATC 232
Query 240 CCTTGAGATTTTCAACCC-TCAGAGTGGAAAAGAGACACATGGATCAACTTCTTCTTCGT 298
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 233 TCTTGAGATTTTCAACCCTTC-GAGTGGAAAAGAGACACATGGATCAACTTCTTCTTC-T 290
Query 299 T-AAAGCCTCCTCTTGATGGCAACAGCAAAGCCAGCAGTAGTAAGTGGATGGAGTTTCAA 357
| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 TCAAAGCCTCCTCTTGATGGCAACAACAAAGGTAGTAGTAGTAAGTGGATGGAGTTTCAA 350
Query 358 GATTCCGCTAGGATAACTGAAAGAACTGCTGAATGGGGAATATCAGCTGTTAAGCCGGAC 417
|||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 351 GATTCCGCTAAGATTACAGAAAGAACCGCTGAATGGGGATTGTCAGCTGTTAAGCCGGAT 410
Query 418 TCGGGAGAAGATGGCATTAGTTTCAAGTTGTCCAGTGAAGTGGAACGAAGCAAGAACATG 477
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 TCGGGAGACGATGGCATTAGTTTCAAGCTGTCCAGTGAAGTGGAACGAAGCAAGAACATG 470
Query 478 TCTAGGAGGTCATCCGAAGAATCTACATCTTCTGAATCAGGGGCCTTCCCTAGAGTATCC 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 TCTAGGAGGTCATCCGAAGAATCTACATCTTCTGAATCAGGGGCCTTCCCTAGAGTATCC 530
Query 538 CAGGAGCTCAAAACCGCTCTATCCACCTTGCAGCAGACCTTTGTTGTTTCTGACGCCACA 597
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 531 CAGGAGCTCAAAACTGCTCTATCCACGTTGCAGCAGACTTTTGTTGTCTCTGACGCTACA 590
Query 598 CAACCACACTGTCCCATAGTGTATGCCAGCAGTGGATTCTTCACCATGACTGGTTATTCT 657
|| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 591 CAGCCTCACTGTCCCATAGTCTATGCCAGCAGTGGATTCTTTACCATGACTGGTTATTCT 650
Query 658 TCCAAGGAAATTGTTGGAAGGAACTGCCGGTTTCTGCAAGGGCCAGACACCGACAAGAAT 717
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 TCCAAGGAAATTGTTGGAAGAAACTGCCGGTTTCTGCAAGGGCCAGACACCGACAAGAAT 710
Query 718 GAGGTTGCCAAAATCAGAGATTGTGTCAAGAATGGAAAGAGTTACTGTGGAAGGCTGTTA 777
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 711 GAGGTTGCCAAAATCAGAGATTGTGTCAAGAATGGAAAAAGTTACTGTGGAAGGCTGTTA 770
Query 778 AACTACAAAAAGGACGGAACTCCCTTCTGGAATCTTCTCACAGTCACTCCTATCAAGGAC 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 AACTACAAAAAGGACGGAACTCCCTTCTGGAATCTTCTCACAGTCACTCCTATCAAGGAC 830
Query 838 GACCAAGGAAACACCATCAAGTTCATTGGGATGCAGGTTGAAGTTAGCAAATACACAGAA 897
||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GACCAGGGCAATACCATCAAGTTCATTGGGATGCAGGTTGAAGTTAGCAAATACACAGAA 890
Query 898 GGGGTAAATGATAAAGCATTGAGGCCTAATGGACTCTCCAAATCCTTGATTCGATATGAT 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 GGGGTAAATGATAAAGCATTGAGGCCTAATGGACTCTCCAAATCCTTGATTCGATATGAT 950
Query 958 GCTCGCCAGAAGGAGAAAGCTTTGGATTCCATCACAGAGGTTGTGCAGACAATAAGACAT 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 951 GCTCGCCAGAAGGAGAAAGCTTTGGATTCCATCACAGAGGTTGTGCAAACTATAAGACAT 1010
Query 1018 CGCAAGTCTCAAGTTCAGGAATCCGTGAGCAATAGTA-A-TATGGTGACGCCTGATAGTT 1075
|| |||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| | |||||||||||
Sbjct 1011 CGTAAGTCTCAAGTTCAGGAATCCGTGAGCAAT-G-ACACTATGGTAAAGCCTGATAGTT 1068
Query 1076 -TG--AC---TACACCTGGTAGACAAA-ATAGACAATCAGATGAGGCTTCAAAGTCATTC 1128
| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1069 CTACTACACCTACACCTGGTAGACAAACA-AGACAGTCAGATGAGGCTTCAAAGTCTTTC 1127
Query 1129 AGGACACCTGGACGTGTTTCTACTCCAACGGGGACGAAGCTCAAAAGCTCTAGTAACAAG 1188
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |
Sbjct 1128 AGGACACCTGGACGTGTTTCTACTCCAACGGGGTCAAAGCTCAAAAGCTCGAATAACAGG 1187
Query 1189 CATGAAGATCTCTTACGTATGGAACCTGAAGAATTGATGTTGAGCACAGAAGTAATAGGG 1248
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 CATGAAGATCTTTTACGTATGGAACCCGAAGAATTGATGTTGAGCACAGAAGTAATAGGG 1247
Query 1249 CAGAGGGACAGTTGGGACCTATCAGATAGAGAAAGGGATATACGCCAAGGGATTGATCTA 1308
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 CAGAGGGACAGTTGGGACCTATCGGATAGAGAAAGGGATATACGCCAAGGGATTGATCTA 1307
Query 1309 GCTACCACTCTTGAGCGCATAGAGAAAAATTTCGTCATCAGTGATCCTCGTCTCCCTGAT 1368
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 GCTACCACTCTTGAGCGCATAGAGAAGAATTTCGTCATCAGTGATCCTCGTCTCCCTGAT 1367
Query 1369 AATCCCATTATTTTTGCATCAGACAGCTTTCTTGAACTGACAGAGTATACACGCGAGGAA 1428
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1368 AATCCCATTATCTTTGCATCAGACAGCTTTCTTGAATTGACAGAGTATTCACGCGAGGAA 1427
Query 1429 ATTTTGGGGAGAAATTGTCGGTTTCTTCAGGGGCCAGAGACAGATCAAGCGACTGTCCAG 1488
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 ATATTGGGGAGAAATTGTCGGTTTCTTCAGGGGCCAGAGACAGATCAAGCGACTGTCCAG 1487
Query 1489 AAGATAAGAGACGCAATTAGAGATCAGACGGAGATAACTGTGCAGTTGATAAACTACACT 1548
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 AAGATAAGAGACGCAATTAGAGATCAGAGGGAGATTACTGTGCAGTTGATAAACTACACT 1547
Query 1549 AAAAGCGGAAAGAAATTCTGGAATTTATTCCACTTGCAACCTATGCGTGATCAAAAGGGA 1608
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1548 AAAAGCGGAAAGAAATTCTGGAACTTATTCCACTTGCAACCTATGCGTGATCAGAAGGGA 1607
Query 1609 GAGCTTCAATACTTCATCGGTGTGCAGCTTGATGGAAGTGATCATGTAGAGCCCCTCCAA 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 GAGCTTCAATACTTCATCGGTGTGCAGCTTGATGGAAGTGATCATGTAGAGCCCCTCCAA 1667
Query 1669 AATCGTTTGTCTGAGAGAACAGAGATACAAAGTTCTAAATTGGTGAAAACTACAGCCACA 1728
|||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| || |||
Sbjct 1668 AATCGTTTGTCTGAGAGAACAGAGATGCAGAGTTCGAAATTGGTGAAAGCTACGGCAACA 1727
Query 1729 AATGTAGATGAAGCTGTCAGAGAACTTCCAGATGCTAATACG 1770
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1728 AATGTAGATGAAGCTGTCAGAGAGCTTCCAGATGCTAATACG 1769
Score = 520 bits (281), Expect = 9e-146
Identities = 317/333 (95%), Gaps = 7/333 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 5667 AGAAGAAGAAGATAAGGGTTGAAAAGTTTGGGGGAGTTCCGGAGTTGAGAGTTGAGTTTT 5726
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5691 AGAAGAAGAAGATAAGAGTTGAATAGTTTGGGGGAGTTCCGGAGTTGAGAGTTGAGTTTT 5750
Query 5727 TGGTTGTATCGTATATGGACACTGGAGAAAGTGGGAAGAGAAGAGAG--TCGTTGAAAGT 5784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5751 TGGTTGTATCGTATATGGACACTGGAGAAAGTGGGAAGAGAAGAGAGAGTCGTTGAAAGT 5810
Query 5785 CaaaaaaaGAGATATGTGGAGATTATAATTAGGTAAAGTATTT-GCTAGTGAGTTATAAG 5843
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5811 CAAAAAAAGGGATATGTGGAGATTATAATTAGGTAAAGTATTTCGCTAGTGAGTTATAAG 5870
Query 5844 AAAA-TATGA-AAATGGAATCTGTCTCAGACCTTTTGTGAATTTTTC-AAATCCCAAAGT 5900
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5871 AAAAATATGATAAATGGAATCTGTCTCAGACCTTTTGTGAATTTTTCCAAATCCCAAAGT 5930
Query 5901 TGTCAATGGATTTGGTGAGTGGAGGAGTGGGTGGCTGTTGTGGTTTCTCATTTCAGCAGT 5960
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5931 TGTCAATGGATTTGGTGAGTGGAGGAGTGGGTGGTTGTTGTGGTTTCTCATTTCAGTAGT 5990
Query 5961 ATTTCC-TTATTAATGTAAAAATTCACTGTTTT 5992
||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5991 GTTTTGGTTATTAATGTAAAAATTCACTTTTTT 6023
Score = 110 bits (59), Expect = 2e-22
Identities = 66/69 (96%), Gaps = 1/69 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1799 ATA-GCGGCCCGAGGACCTGTGGGCTGCACACTCGAAGCCTGTCTATCCTCTACCTCACA 1857
||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1765 ATACGCGGCCCGAAGACCTGTGGGCTGCACACTCGAAGCCTGTCTATCCTCTGCCTCACA 1824
Query 1858 ATAAGGAGA 1866
|||||||||
Sbjct 1825 ATAAGGAGA 1833
> AT5G58150.1 | Symbols: | Leucine-rich repeat protein kinase
family protein | chr5:23530081-23532840 REVERSE LENGTH=2760
Length=2760
Score = 4093 bits (2216), Expect = 0.0
Identities = 2522/2669 (94%), Gaps = 24/2669 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 3014 TTACATATAAACGGCTCGTTTCATGTTTTTCCATTTCTTCTAATCAACAACGATAAACAT 3073
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2756 TTAAATATAAACGGCTCTTTTCATGTTTTTCCATTTCTTCTAATCAACAACAATAAACAT 2697
Query 3074 ACAACAAC--AA-ACTTGTTGTTAATAATGATGTTAAGTGTCATAAGCCCATTATAAGGC 3130
|| | ||| || | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 2696 AC-A-AACTTAAGA-GCCATGTTAATATTCATGTTAAGTGTGATAAGCCCATTATGAGGC 2640
Query 3131 CCACTAACTGGCCCATTAGTAGTTGGGAGAAATGTCTTTGAGAAGTCCAACCACCTGCTG 3190
||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 CCA-TAACTAGCCCACTAGTAGTTGGGAGAAATGTCTTTGAGAAGTCCAACCACCTGCTG 2581
Query 3191 CATCGTAGGTCGCTTCCATGGCAGATCGGCGGTGCACAAGTACCCTATCTTCACCGCCTC 3250
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 CATCGTAGGTCGCTTCCATGGCAGATCGGCGGTACACAAGTACCCTATCTTCACCGCCTC 2521
Query 3251 CGCGATTTCATCCTCTGGAACTGTCTCTCGCATCGTCGGATCAATGGCTCTCAATCCTTG 3310
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 CGCGATTTCATCCTCCGGAACTGTCTCTTGCATCGTCGGATCAATGGCTCTCAATCCTTG 2461
Query 3311 TCCCTGCCTCACTAACCCTCTCACCCAATTCACCAAGTC-CTCCTCCGGCTTCTTCCCAC 3369
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2460 TCCCTGCCTCACCAACCCTCTCACCCAATTCACCAAGTCAC-CCTCCGGCTTCTTCCCAC 2402
Query 3370 TCACAAGCTCAAGCAAAACAACTCCAAAGCTATACACATCGGATTCTAATGTCGGAGAAG 3429
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 TCACGAGCTCAAGCAAAACAACTCCAAAGCTATACACATCGGATTCTAATGTCGGAGAAG 2342
Query 3430 CATTTCGCTCCTGTTCCGGTGATGTGTACCCGTCTAAACTTTCGGAACCGGGAAATTCCT 3489
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2341 CATTTCGCTCCTGTTCCGGTGGTGTGTACCCGTCTAAACTTTCGGAACCGGGAAATTGCT 2282
Query 3490 CGTCCAAGAGTTTGACTAATCCAAAGTCTGCTAAACGTGGCTCCTGGCTAGAGTCTAACC 3549
||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 CGTCCAAGAGTTTAACTAAACCAAAGTCTGCTAAGCGTGGCTCCTGGCTAGAGTCTAACA 2222
Query 3550 AGATTGTTGCAGCCTTCACTTCTCCGTGGACCATTGGAGGAATGCAGCCATGGTGAAGGA 3609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGATTGTTGCAGCCTTCACTTCTCCGTGGACCATTGGAGGAATGCAGCCATGGTGAAGGA 2162
Query 3610 AAGCTAATGCCCTCGCTGTCCCCAAAGCTATCTTATGCCGAAGTCTCCACGGTGCAGAAT 3669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2161 AAGCTAATGCCCTCGCTGTCCCCAAAGCTATCTTATGCCGAAGTCTCCAAGGTGCAGAAT 2102
Query 3670 CGTCTGCGTTGTTATGGAGTA-AGCTTTGCAGATTAACCATGTCTAGGTCCTCGTAGATC 3728
| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2101 CATCTCCGTTGTTATGGAGTAGA-CTTTGCAAATTAACCATGTCTAAGTCCTCGTAGATT 2043
Query 3729 GCAATTCTTTGCTCTGTGGCTATACAGTATCCACAGAGCGGGACAAGATTTGGGTGATTG 3788
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2042 GCAATTCTTTGCTCTGTCGCTATACAGTATCCACAGAGCGGGAAAAGATTTGGGTGATTG 1983
Query 3789 ATCCTGGCGAGACGTTCAAAAGCAATCGAGACTTCCGTATCAGTCAATGTGCTTCCACTT 3848
||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1982 ATCCTAGCGAGACGTTCAAATGCAATCGAGACTTCAGTATCAGTCAATGTGGTTCCACTT 1923
Query 3849 GGGACAACTTTTATAGCTGCTCTGAATCCATTGGGTAGGACTGCTCCATAAGTAGGACCA 3908
|||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1922 GGGATAACTTTTAGAGCTGCTCTGAATCCACCGGGTAAGACTGCTCCGTAAGTAGGACCA 1863
Query 3909 GACTTGCCTTCCGACAACAATGTGCCTCTGTCGAAGTTGAAAGTCGCAGCCTTTAGGTCT 3968
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1862 GACTTGCCTTCCCACAACATTGTGCCTCTGTCGAAGTTGAAAGTCGCAGCCTTTAGGTCT 1803
Query 3969 GCAAGCGTCATCTTCATCAATGGCTTGTCGATCATTACCACAGGGATTTGCGTTGCGTGC 4028
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1802 GCAAGCGTCATTTTCATTAATGGCTTGTCGATCATTACCACAGGGATTTGCGTTGCTTGC 1743
Query 4029 TTGACATCGGTGGTTGAGTCATTTTGGTCTGGGGAGTTGGGTTCTGTGTTGTTTATGGCT 4088
|||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 TTGATATCAGTGGTTGAGTCGTGTTGGTCTGGGGAGTTGGGTTCTGTGTTGTTTATGGCT 1683
Query 4089 AGCTTTGTTGCCCAAGTTCTTGATTTTCTTCTACCTCTCAAGACTACAAGTATGAGCAAT 4148
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1682 AGCTTTGTTGCCCAAGTTCTTGATTTTCTTCTAACTCTCAAGGCTACAAGTATGAGCAGT 1623
Query 4149 AGTCCTACAAGTAAGAACGCCATTGAGATTGCTAACCCCAAACCAATCTTAAGCCCTGTC 4208
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622 AGTCCTATAAGTAAGAACGCCATGGAGATTGCTAACCCCAAACCAATCTTAAGCCCTGTA 1563
Query 4209 TTCTTCTTGTTGACTTTCTTTCCTTTTGTAACAATTGGCTTTGCAGCGAAGGGGCAGTTG 4268
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 TTCTTCTTGTTGACTTTCTTTCCTTTTGTAATAATTGGCTTTGCAGCGAAGGGGCAGTTG 1503
Query 4269 TTTGTAG-AGTTAATGAATGATCTCTGTATTGTTTCTTGTGAGAAGTTGGGGATGCAAAA 4327
||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 1502 TTTCTAATA-TTAATGAAGGATCTCTGGATTGTTTCTTGGGAGAAGTTGGGGTTGCAAAA 1444
Query 4328 GGTTAGATTGTTGTAAGAGAAGTTAAACCTTTGCATCATGGGGAGTTTCTCCAGAATCGG 4387
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 1443 GGTTAGATTGTTGAAAGAGAAGTTAAACCTTTGCATCATGGCGAGTTTCTCCAAAAGCGG 1384
Query 4388 CCTTGGGATGTCTCCGTCTAGCTTATTCAGCGAGAGATCAAGTACTTCAATGTTCTTGAG 4447
||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 CCTTGGGATATCTCCGTCTAGCTTATTCAACGAGAGATCAAGTACTTCAATGTTCTTGAC 1324
Query 4448 GCTCAACATAGGCACATGGCCAGTGAGATTATTGGAGGAGAGATCAAGAACCTTCAGATG 4507
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 GCTCAGCATAGGCACGTGGCCAGTGAGATTATTGGAGGAGAGATCAAGAACCTTCAGATG 1264
Query 4508 ACTCAGCCGCGAGATTTCACTCGGAATGATATTAGTGAGATTGGTCCTTGATAGGTTCAG 4567
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1263 ACTCAGCCGCGAGATTTCACGCGGAATGATATTAGTGAGATTGGTCCTTGATAGATTCAG 1204
Query 4568 ATAATGTAGCGCTGAAAGCTTGCCGATTTGC-GGGAACTTCT-GTGCCCTGAATCGATTG 4625
|||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1203 ATAATGTAGCGCAGAAAGCTTGCCGATTT-CTGGGAACT-CTTGTGCCCTGAATCGATTG 1146
Query 4626 CACGCGAGGTTAAGGTATCCCAGCTTATGAGCTGAACTCAAACCATTAAATATATGACCG 4685
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1145 CACGCGAGGTTAAGGTGTCCCAGCTTGTGAGCTGAACTCAAACCATTGAATATATGGCCG 1086
Query 4686 ACAAAGCTATTATCAGACAAGTCAAGATGAATCAGACTAGACCAGTTGTGTTTGTGGCCG 4745
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 ACAAAGCTATTATCGGACAAGTCAAGATGAATCAGACTAGACCAGTTGTGTTTGTGGCCG 1026
Query 4746 GGTATTAACTGCAAGATATGCTCATCAAATCGGTTTTCACTGAGATCAACTGTTTCCACG 4805
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 GGTATTAACTGCAAGATATGCCCATCAAATCGGTTTTCACTGAGATCAACTGTTTCCACG 966
Query 4806 TTTTCATGCAAGACTCCTATCAATGAACCCTGAAACAGATTCCTTGAAAGGTTCAAGCTT 4865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 965 TTTTCATGCAAGACTCCTATCAATGAACCCTGAAACAGATTTCGTGAAAGGTTCAAGCTT 906
Query 4866 TTTAGTTGTGGGAAAGCTGAACCAAAACCGACAGGCAGAGGCCCGCTGAGCCTGTTGGAT 4925
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||||
Sbjct 905 TTTAGTAGTGGGAAAGCTGAACCAAAACCGACAGGCAGAGACTCGTTGAGGCGGTTGGAT 846
Query 4926 GAGAGGTCGATGGAGACTAGAGATTGGCAATGGAGGAGTCCTGGAGGGACGCCAGACTGA 4985
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 845 GAGAGGTCGATGGAGAGTAGAGATCGGCAATGGACAAGTTCTGGAGGGACGCCAAACTGA 786
Query 4986 AAGTCATTGTTGTGGAGCTTGAGAGTTGTTAGATTGACAAGGGAGCTTATAGCAGCAGGG 5045
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||
Sbjct 785 AAGTCATTGTTGTGGAGCTTGAGAGTTGTTAGATTGACAAGGTTGCTTATTGCGGCAGGG 726
Query 5046 ATTTCACCAGAGAAGCTGTTGAAAGAAAGATCAAGGGTGTGAAGCGACATGAAATTGCCG 5105
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 ATTTTGCCAGAGATGCTGTTGAAAGAAAGATCAAGGGTGTGAAGCGACATGAAATTGCCG 666
Query 5106 ATGTTGCTGGGAAGACGCTCAGAAATCCGGTTGGAGGAGAGATTGAGACTCTCAAGCAAG 5165
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 ATGTTGCTGGGAAGAGGCTCAGAAATCCGGTTGGAGGAGAGATTGAGACTCTCAAGCAAG 606
Query 5166 CTGAGACTCCACAAATCCGAGGGTAGAGACGTAATCTTGTTTCCACTGACATCTAAAGTT 5225
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 605 CTGAGACTCCACAAATCCGAGGGGAGAGACGTAATCTTGTTTCCACTGAGATCTAAAGTT 546
Query 5226 TGGAGCTTACTCATTTTGCCAATGGTGTTGTCGGGGATCGAACCAGACAGGTCCAACCCA 5285
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 TGGAGCTTACTCATTTTGCCAATAGTGTTGTCGGGGATCGAACCAGACAGGTCCAACCCA 486
Query 5286 GAAGCCGAAATATGGAGCACATTCTCTCTAGAGTCACAGACGACCACTCCTGGCCATGAA 5345
|||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 GAAGCCGAAATATGCAACACATTCTCACTAGAGTCACAGACGACCACTCCTGGCCATGAA 426
Query 5346 CATGAAG-AAGAAAATGTGTGAGCTTGGGGAGAATTGGGTAATCTCAATGCGGAGAAGAA 5404
|| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 425 CAC-AAGGAAGAAAACGTATGAGCTTGGGGAGAATTGGGTAATCTCATTGCGGAGAAGAA 367
Query 5405 GCTGGAGAGATAATAAGCGTCGGTGTTAGGATCTAGGCTCGTCAGATGCTTGACGAAGAA 5464
||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 GCTAGAGAGATGATAAGCGTCGGTGTTGGGATCTAGGCTCGTCAGATGCTTGACGAAGAA 307
Query 5465 GGAGAAGAACAGAAGAGATCCCCATAGAGACAACCTCATAATTTGGTGTTGTCTGG-AGG 5523
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
Sbjct 306 GGAGAAGAACAGGAGAGATCCCCATAGAGACAACCTCATAACTTGGTGGTGTCTGGGAC- 248
Query 5524 TGGAGAAAAGT-GGATGGGAAAGCTCAGAAAGAAGACAGACTGTGTGAAAAGAAGAAAAG 5582
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 TGGAGAAA-GTTGGATGGGAAAGCTCAGAAAGAAGACAGACTGTGTGAAAAGAAGAAAAG 189
Query 5583 ACATAATGGAATCACGGGGCAGAGAGGTGATGATAGTTTAGAATACATTGAGATCCCTTT 5642
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 188 ACATAATGGAATCACGGGGCATAGAGGTGATGATAGTTTAGAATACATTGAAATCCCTTT 129
Query 5643 CACGTGCACAGCTTCaaaaaaaaT-AGAA 5670
|||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 128 CACGTGCACAGCTTCAAAAAAAATCAGAA 100
Score = 122 bits (66), Expect = 3e-26
Identities = 70/72 (97%), Gaps = 0/72 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 5667 AGAAGAAGAAGATAAGGGTTGAAAAGTTTGGGGGAGTTCCGGAGTTGAGAGTTGAGTTTT 5726
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 AGAAGAAGAAGATAAGAGTTGAATAGTTTGGGGGAGTTCCGGAGTTGAGAGTTGAGTTTT 13
Query 5727 TGGTTGTATCGT 5738
||||||||||||
Sbjct 12 TGGTTGTATCGT 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 298995245724
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5