BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg496177 Length=1599 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2682 0.0 AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2061 0.0 AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2061 0.0 AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2050 0.0 AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domai... 436 2e-121 AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832 RE... 228 2e-58 > AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family protein | chr5:24288658-24291020 FORWARD LENGTH=1764 Length=1764 Score = 2682 bits (1452), Expect = 0.0 Identities = 1553/1602 (97%), Gaps = 6/1602 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACACTTTCGTAGCCGCAAGCCTCCTCTCAGATTCTTA 60 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACATTTTCGTAGCCGCAAGACTCCTTTCAGATTCTTA 60 Query 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGAT 120 Query 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180 Query 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCA 240 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCA 240 Query 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTC 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTA 300 Query 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGAT 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGAT 360 Query 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420 Query 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480 Query 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCC 540 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCC 540 Query 541 ACTACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 541 ACCACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600 Query 601 CTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAG 660 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| Sbjct 601 CTGAAGAAGGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAG 660 Query 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTT 720 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTT 720 Query 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCA 780 Query 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACC 840 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACT 840 Query 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900 Query 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960 Query 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCC 1020 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCC 1020 Query 1021 AAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCAC 1080 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1021 AAGGATGATCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCAC 1080 Query 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140 Query 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200 Query 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCC 1260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCC 1260 Query 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCATTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATG 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCTTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATG 1320 Query 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380 Query 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGATGAGACTTTCGTTATGATGGA 1440 |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGATGAGACTTTCGTTATGATCGA 1440 Query 1441 CTCTCTTATGGTTTTCTTTGGTTCTTAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCttttt-tttt- 1498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1441 CTCTCTTATGGTTTTCTTTGGTTCTTAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCTTTTTCTTTTT 1500 Query 1499 -ctctttatttctatgactttcttctctcttcctcctttttggatatctctgagactttt 1557 |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 TCTCTTTATTTCTGTGACTTTCT-CTCTC--CCTCCTTTTTGGATATCTCTGAGACTTTT 1557 Query 1558 tATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 TATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599 > AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family protein | chr1:2462953-2465504 REVERSE LENGTH=1864 Length=1864 Score = 2061 bits (1116), Expect = 0.0 Identities = 1274/1352 (94%), Gaps = 4/1352 (0%) Strand=Plus/Plus Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 118 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 177 Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188 |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 178 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 236 Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 237 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 296 Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 297 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 356 Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368 |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 357 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 416 Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 417 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 476 Query 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488 ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 477 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 536 Query 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 596 Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 597 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 656 Query 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668 |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 657 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 716 Query 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 776 Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 777 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 836 Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 837 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 896 Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 897 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 956 Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| Sbjct 957 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1016 Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| Sbjct 1017 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1076 Query 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088 ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1136 Query 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148 ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1196 Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1197 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCTAA 1256 Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268 || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1316 Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327 ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 1317 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGA 1375 Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387 | ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1376 CTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTTA 1435 Query 1388 CCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGA 1419 ||||||||||||||||||| || || || ||| Sbjct 1436 CCAAGGCTGCAGTCAAGAAGGGTGCCAAGTGA 1467 > AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family protein | chr1:2454846-2457321 FORWARD LENGTH=1783 Length=1783 Score = 2061 bits (1116), Expect = 0.0 Identities = 1274/1352 (94%), Gaps = 4/1352 (0%) Strand=Plus/Plus Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 114 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 173 Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188 |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 174 TCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 232 Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 233 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 292 Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 293 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 352 Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368 |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 353 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 412 Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 413 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 472 Query 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488 ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 473 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 532 Query 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 533 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 592 Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 593 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 652 Query 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668 |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 653 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 712 Query 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 713 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 772 Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 773 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 832 Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 833 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 892 Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 893 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 952 Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| Sbjct 953 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1012 Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| Sbjct 1013 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1072 Query 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088 ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1073 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1132 Query 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148 ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1133 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1192 Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1193 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1252 Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268 ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1253 GTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1312 Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327 ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 1313 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGA 1371 Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387 | ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 1372 CTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1431 Query 1388 CCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGA 1419 |||||||||| |||||||| || || || ||| Sbjct 1432 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1463 > AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family protein | chr1:2458244-2460790 FORWARD LENGTH=1807 Length=1807 Score = 2050 bits (1110), Expect = 0.0 Identities = 1274/1354 (94%), Gaps = 8/1354 (1%) Strand=Plus/Plus Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 126 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 185 Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188 ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 186 TCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTGATCGA 244 Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 245 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 304 Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 305 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 364 Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368 |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 365 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 424 Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 425 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 484 Query 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488 ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 485 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTCCTTGC 544 Query 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 545 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 604 Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608 ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 605 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 664 Query 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668 |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 665 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 724 Query 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 725 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 784 Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 785 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 844 Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 845 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 904 Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 905 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 964 Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| Sbjct 965 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1024 Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028 ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| Sbjct 1025 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAGGATGA 1084 Query 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088 ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1085 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1144 Query 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTC-TCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1147 ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1145 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAG-TCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1203 Query 1148 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1204 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1263 Query 1208 AGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1267 | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1264 AATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1323 Query 1268 TTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAG 1326 | ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1324 TGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAG 1382 Query 1327 ACCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTC 1386 || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1383 ACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTT 1442 Query 1387 ACCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAA-TGA 1419 |||||||||||||| ||||| || || ||| ||| Sbjct 1443 ACCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTGC-AAAGTGA 1475 > AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domain-containing protein | chr1:13112506-13113136 FORWARD LENGTH=631 Length=631 Score = 436 bits (236), Expect = 2e-121 Identities = 343/396 (87%), Gaps = 1/396 (0%) Strand=Plus/Plus Query 987 GGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGC 1046 ||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| Sbjct 133 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 191 Query 1047 CAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGC 1106 | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | Sbjct 192 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 251 Query 1107 CCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 252 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 311 Query 1167 GATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGA 1226 ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| Sbjct 312 GATTGACTGGCGTACTGGTCATGAGATTGAGAAGGAGCCAAAGTTTTTAAAGAACAGTGA 371 Query 1227 CGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTA 1286 || | ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||| | ||| Sbjct 372 GGCCGCTATTATTAATATGACTCCCACCAAGCCTATGGTGGTTGAGGCTTACTCTGCGTA 431 Query 1287 CCCACCATTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTAT 1346 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| Sbjct 432 CCCACCCCTGGGACGTTTTGCTATTAGGGACATGAGGCAAACCGTTGGTGTTGGAGTTAT 491 Query 1347 CAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAA 1382 |||||| || | |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 492 CAAGAGTGTTGTCAAGAAGGACCCAAGTGGAGCCAA 527 > AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832 REVERSE LENGTH=814 Length=814 Score = 228 bits (123), Expect = 2e-58 Identities = 170/193 (88%), Gaps = 1/193 (1%) Strand=Plus/Minus Query 987 GGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGC 1046 ||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| Sbjct 195 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 137 Query 1047 CAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGC 1106 | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | Sbjct 136 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 77 Query 1107 CCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1166 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 76 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 17 Query 1167 GATTGACAGGCGT 1179 ||||||| ||||| Sbjct 16 GATTGACTGGCGT 4 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 78965457285 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5