BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg497139
Length=2807
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
ATCG01180.1 | Symbols: RRN23S.2 | chloroplast-encoded 23S ribos... 5131 0.0
ATCG00950.1 | Symbols: RRN23S.1 | chloroplast-encoded 23S ribos... 5131 0.0
AT2G07706.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis tha... 139 1e-31
AT5G66530.1 | Symbols: | Galactose mutarotase-like superfamily... 56.5 1e-06
> ATCG01180.1 | Symbols: RRN23S.2 | chloroplast-encoded 23S ribosomal
RNA | chrC:131149-133958 REVERSE LENGTH=2810
Length=2810
Score = 5131 bits (2778), Expect = 0.0
Identities = 2803/2813 (99%), Gaps = 9/2813 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 60
Query 61 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 120
Query 121 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 180
Query 181 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 240
Query 241 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCAATAAAAGCGTCGTGCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 241 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCAAAAAAAGCGTCGTGCT 300
Query 301 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 360
Query 361 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 420
Query 421 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 480
Query 481 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 540
Query 541 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 600
Query 601 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 660
Query 661 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 720
Query 721 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 780
Query 781 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 840
Query 841 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 900
Query 901 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 960
Query 961 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 1020
Query 1021 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 1080
Query 1081 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 1140
Query 1141 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 1200
Query 1201 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 1260
Query 1261 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 1320
Query 1321 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 1380
Query 1381 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 1440
Query 1441 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 1500
Query 1501 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 1560
Query 1561 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 1620
Query 1621 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 1680
Query 1681 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 1740
Query 1741 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 1800
Query 1801 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 1860
Query 1861 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGC 1920
Query 1921 GGCCGTAACTATAACGGTCCTA-G----CGAAATTCCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCCG 1975
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCC-TTGTCGGGTAAGTTCCGACCCG 1979
Query 1976 CACGAAAGGCGTAACGATCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAATAGACATGT 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CACGAAAGGCGTAACGATCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAATAGACATGT 2039
Query 2036 CTGTGAAGATGCGGACTACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCC 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 CTGTGAAGATGCGGACTACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCC 2099
Query 2096 CTGGGATTGGCTTTGGGCTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCCCCTT 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 CTGGGATTGGCTTTGGGCTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCCCCTT 2159
Query 2156 CCgggggggCCCGAGCCATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTG 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 CCGGGGGGGCCCGAGCCATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTG 2219
Query 2216 TGTCAGGACCTACGGGCCAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCC 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TGTCAGGACCTACGGGCCAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCC 2279
Query 2276 TCCCAAAAGGTAACGGAGGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCG 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TCCCAAAAGGTAACGGAGGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCG 2339
Query 2336 AGTGCAAAGGCAGAAGGGAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTC 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AGTGCAAAGGCAGAAGGGAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTC 2399
Query 2396 GGCCTTAGTGATCCGACGGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACT 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 GGCCTTAGTGATCCGACGGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACT 2459
Query 2456 CTAGGGATAACAGGCTGATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTC 2515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 CTAGGGATAACAGGCTGATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTC 2519
Query 2516 GATGTCGGCTCTTCGCCACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCA 2575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 GATGTCGGCTCTTCGCCACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCA 2579
Query 2576 TTAAAGCGGTACGTGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGT-CGGTCCCATATCCGGG 2634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 2580 TTAAAGCGGTACGTGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCC-ATATCCGG- 2637
Query 2635 TGTGGGCGTTAGAGCATTGAGAGGACCTTTCCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 TGTGGGCGTTAGAGCATTGAGAGGACCTTTCCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 2697
Query 2695 CCTCTGGTGTACCAGTTATCGTGCCCACGGTAAACGCTGGGTAGCCAAGTGCGGAGCGGA 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 CCTCTGGTGTACCAGTTATCGTGCCCACGGTAAACGCTGGGTAGCCAAGTGCGGAGCGGA 2757
Query 2755 TAACTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGCCCACCCCAAGATGAGTGCTCTCCT 2807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 TAACTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGCCCACCCCAAGATGAGTGCTCTCCT 2810
> ATCG00950.1 | Symbols: RRN23S.1 | chloroplast-encoded 23S ribosomal
RNA | chrC:104691-107500 FORWARD LENGTH=2810
Length=2810
Score = 5131 bits (2778), Expect = 0.0
Identities = 2803/2813 (99%), Gaps = 9/2813 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 60
Query 61 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 120
Query 121 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 180
Query 181 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 240
Query 241 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCAATAAAAGCGTCGTGCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 241 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCAAAAAAAGCGTCGTGCT 300
Query 301 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 360
Query 361 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 420
Query 421 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 480
Query 481 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 540
Query 541 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 600
Query 601 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 660
Query 661 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 720
Query 721 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 780
Query 781 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 840
Query 841 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 900
Query 901 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 960
Query 961 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 1020
Query 1021 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 1080
Query 1081 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 1140
Query 1141 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 1200
Query 1201 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 1260
Query 1261 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 1320
Query 1321 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 1380
Query 1381 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 1440
Query 1441 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 1500
Query 1501 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 1560
Query 1561 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 1620
Query 1621 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 1680
Query 1681 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 1740
Query 1741 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 1800
Query 1801 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 1860
Query 1861 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGC 1920
Query 1921 GGCCGTAACTATAACGGTCCTA-G----CGAAATTCCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCCG 1975
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCC-TTGTCGGGTAAGTTCCGACCCG 1979
Query 1976 CACGAAAGGCGTAACGATCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAATAGACATGT 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CACGAAAGGCGTAACGATCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAATAGACATGT 2039
Query 2036 CTGTGAAGATGCGGACTACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCC 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 CTGTGAAGATGCGGACTACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCC 2099
Query 2096 CTGGGATTGGCTTTGGGCTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCCCCTT 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 CTGGGATTGGCTTTGGGCTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCCCCTT 2159
Query 2156 CCgggggggCCCGAGCCATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTG 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 CCGGGGGGGCCCGAGCCATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTG 2219
Query 2216 TGTCAGGACCTACGGGCCAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCC 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TGTCAGGACCTACGGGCCAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCC 2279
Query 2276 TCCCAAAAGGTAACGGAGGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCG 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TCCCAAAAGGTAACGGAGGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCG 2339
Query 2336 AGTGCAAAGGCAGAAGGGAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTC 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AGTGCAAAGGCAGAAGGGAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTC 2399
Query 2396 GGCCTTAGTGATCCGACGGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACT 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 GGCCTTAGTGATCCGACGGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACT 2459
Query 2456 CTAGGGATAACAGGCTGATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTC 2515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 CTAGGGATAACAGGCTGATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTC 2519
Query 2516 GATGTCGGCTCTTCGCCACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCA 2575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 GATGTCGGCTCTTCGCCACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCA 2579
Query 2576 TTAAAGCGGTACGTGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGT-CGGTCCCATATCCGGG 2634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 2580 TTAAAGCGGTACGTGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCC-ATATCCGG- 2637
Query 2635 TGTGGGCGTTAGAGCATTGAGAGGACCTTTCCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 TGTGGGCGTTAGAGCATTGAGAGGACCTTTCCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 2697
Query 2695 CCTCTGGTGTACCAGTTATCGTGCCCACGGTAAACGCTGGGTAGCCAAGTGCGGAGCGGA 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 CCTCTGGTGTACCAGTTATCGTGCCCACGGTAAACGCTGGGTAGCCAAGTGCGGAGCGGA 2757
Query 2755 TAACTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGCCCACCCCAAGATGAGTGCTCTCCT 2807
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 TAACTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGCCCACCCCAAGATGAGTGCTCTCCT 2810
> AT2G07706.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: unknown protein (TAIR:ATMG00470.1);
Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae
- 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants
- 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI
BLink). | chr2:3381901-3386102 REVERSE LENGTH=2080
Length=2080
Score = 139 bits (75), Expect = 1e-31
Identities = 84/88 (95%), Gaps = 1/88 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1000 GAGAGGGAAACAGCCCGGATCACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGG 1059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 220 GAGAGGGAAACAGCCCGGATCACCAGCTAAGGCCCCCAAATGGCCGCTCAGTTATAAAGG 279
Query 1060 AGGTAGGGGTGCAGAGACAGCCA-GGAG 1086
||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 280 AGGTAGGGGTGCAGAGACAGCCAAGGAG 307
> AT5G66530.1 | Symbols: | Galactose mutarotase-like superfamily
protein | chr5:26553744-26555691 REVERSE LENGTH=1117
Length=1117
Score = 56.5 bits (30), Expect = 1e-06
Identities = 30/30 (100%), Gaps = 0/30 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2665 CCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 2694
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 CCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 68
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 139464101540
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5