BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg895977
Length=6774
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G00450.1 | Symbols: CRP, CCT | RNA polymerase II transcripti... 5664 0.0
> AT4G00450.1 | Symbols: CRP, CCT | RNA polymerase II transcription
mediators | chr4:202416-211003 FORWARD LENGTH=7108
Length=7108
Score = 5664 bits (3067), Expect = 0.0
Identities = 3338/3472 (96%), Gaps = 6/3472 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3306 GGGTGGGAGAAACCTTGTAACTATGCCAAGGAATGTTGAAAACAACATGTGTGAAATAGG 3365
|||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3303 GGGTGGAAGAAACCTTGTAACTGTACCAAGGAATGTTGAAAACAACATGTGTGAAATAGG 3362
Query 3366 GGAGGCTATTTTAGTATCATCACTGAGGAGGTATGAAAACATTCTACTTTCAGCTGATCT 3425
||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3363 CGAGGCGATTCTAGTATCATCACTGAGAAGGTATGAAAACATTCTACTTTCAGCTGATCT 3422
Query 3426 TGTTCCTGAGGCCATGACAGCTTTGATGAACCGTGTTGCATCACTTATGCCTAGTAATGG 3485
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3423 TGTTCCTGAGGCCATGACAGCTTTGATGAACCGTGCTGCATCACTTATGTCTAGTAATGG 3482
Query 3486 AAAGATTTCTGGATCAGCAGCCTTAGTTTATGCTCGCTATATTTTGAAAAGATATGGAAG 3545
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3483 AAAAATTTCTGGATCAGCAGCCTTAGTTTATACTCGCTATATTTTGAAAAGATATGGAAG 3542
Query 3546 TCTTCCCAGTGTTGTGGAATGGCATAACAATTTCAAAGCAACATGCGAAAAGAGGCTTCT 3605
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||
Sbjct 3543 CCTCCCCAGTGTTGTGGAATGGCATAACAATTTCAAAGCAACATCCGAAAAGAAGCTACT 3602
Query 3606 TTCTGAACTAGATCATACACGATCAGGAAATGGTGAGTATGGGAACCCCCTTGGGGTTCC 3665
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3603 TTCTGAACTAGATCATACGCGATCAGGAAATGGTGAGTATGGGAACCCCCTCGGGGTTCC 3662
Query 3666 AGCAGGAGTAGATAATCCAGATGACTATTTACGaaaaaaaaTCAGCATCGGCGGTACACG 3725
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 3663 AGCAGGAGTAGATAATCCAGATGACTATTTACGTAAAAAAATCAGCATTGGCGGTGCACG 3722
Query 3726 TCCTTCAAGAGTGGGTTTGAATATGCGAGAGGTTGTGCAACGACATGTTGAAGAGGCGAC 3785
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3723 TCCTTCAAGAGTGGGTTTGAGTATGCGAGATGTTTTGCAACGACATGTTGAAGAGGCGAC 3782
Query 3786 TCATTATCTCAGAAAACTCACTGGGACTGGTACTATGAAAGCCTCACTTACCGAGAAAAA 3845
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||
Sbjct 3783 TCATTATCTCAAAAAACTCATTGGGACTGGTACTATGAAAGCCTCTCTCGCTGAGAAAAA 3842
Query 3846 TGATGACGGGTATCAGGTGGCTCAACAAATTGTAGTTGGACTAATGGACTGCATTAGACA 3905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3843 TGATGACGGGTATCAGGTGGCTCAACAAATTGTAGTTGGACTAATGGACTGCATTAGACA 3902
Query 3906 GACCGGTGGTGCAGCTCAAGAGGGTGATCCCTCTTTGGTTTCTTCTGCGGTTTCTGCGAT 3965
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3903 GACTGGCGGTGCAGCTCAAGAGGGTGATCCCTCTTTGGTTTCTTCTGCGGTTTCTGCGAT 3962
Query 3966 TATAAACAGTGTAGGCCTTTCCA-TGGCAAGGATTTCAGATTTCTCTTTGGGAAACATTT 4024
|||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3963 TATAAACAGTGTAGGCCTTT-CAGTGGCAAGGATTACAGATTTCTCTTTGGGAAACATTT 4021
Query 4025 ATCAGAATCATCCATCTGGCGTCGATTCATCTAATATTGCACGATACATTTTACAAATCC 4084
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4022 ATCAGAATCATCCTTCTGGCGTTGATTCATCTAATATTGCACGATACATTTTACGAATCC 4081
Query 4085 ATATAACCTGCCTGTGCCTTCTTAAGGAAGCTCTTGGAGAGCGTCAAAGCCGAGTGTTTG 4144
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4082 ATATAACCTGTCTGTGCCTTCTTAAGGAAGCTCTTGGAGAGCGTCAAAGCCGAGTGTTTG 4141
Query 4145 AAATAGCACTTGCAACAGAAAGTTCCACTGCTCTTGCTGGAGCTTTTGCTCCGGGGAAGG 4204
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||
Sbjct 4142 AAATAGCACTTGCAACAGAAAGTTCCACTGCGCTTACTGGAGTTTTTGCTCCTGTGAAGG 4201
Query 4205 GATCACGAGGTCAGCATCAGCTATCTCCTGAATCCTATGATTCAAATGCCAACAATTCAA 4264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4202 GATCACGAGGTCAGCATCAGCTATCTCCTGAATCCTATGATTCAAATGCAAACAATTCAA 4261
Query 4265 CAAAT-GATATGCCGAACGGTACTGGAAAAATGGCGCTGAGTAGAG-GAACAAAAATTAC 4322
| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||
Sbjct 4262 C-AATCGATATGTCGAATGGTACTGGAAAAATGGCGCTGAGCAGAGCG-ACAAAAATTAC 4319
Query 4323 TGCAGCTGTATCTGCACTTGTTATAGGTTCTATCACACATGGTGTTATAACCCTTGAGAG 4382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4320 TGCAGCTGTATCTGCACTTGTTATAGGTTCTATCACACATGGTGTTATAACCCTTGAGAG 4379
Query 4383 GATTGTTGGTCTGCTGAGACTAAAGGAGTACTTAGATTTCGTTCAGTTTGTAAGGCGTAC 4442
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4380 GATTGTTGGTCTACTGAGACTAAAGGATTACTTAGATTTCGTTCAGTTTGTAAGGCGTAC 4439
Query 4443 AAAATCGAGTTCTAATGGCAGTGCTAGATCCATGGGGGCCTCTAAAGTGGAAAGCCCTAT 4502
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4440 AAAATCGAGTTCTAATGGCAGTGCTAGATCCATGGGAGCCTCTAAAGTGGAAAGCCCTAT 4499
Query 4503 TGAAGTGTATGTACATTGGTTCAGACTCCTTGTTGGTAACTGTAAAACTGTTTCGGAAGG 4562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4500 TGAAGTGTATGTACATTGGTTCAGACTCCTTGTTGGTAACTGTAAAACTGTTTCGGAAGG 4559
Query 4563 GCTGGTTTTGGAGCTTGTGGGAGAATCTTCCGTGGTGGCTATATCACGCATGCAGCGTAT 4622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4560 GCTGGTTTTGGAGCTTGTGGGAGAATCTTCCGTGGTGGCTATATCACGCATGCAGCGTAT 4619
Query 4623 GCTTCCGCTGAAATTGGTCTTCCCACCAGCCTATTCAATTATTGCGTTTGTTCTATGGAG 4682
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4620 GCTTCCGCTGAAATTGGTCTTCCCACCAGCCTATTCAATTATTGCGTTTGTTCTGTGGAG 4679
Query 4683 GCCTTTTGTTTCGAATAGTAACTCTAACTCCGGCGTCCATGAAGACACTCACCGCCTTTA 4742
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4680 GCCTTTTGTTTCAAATAGTAACTCTAACTCCAGCGTCCATGAAGACACTCACCGCCTTTA 4739
Query 4743 TCAGTCTTTGACAATGGCCTTCCATGATGTTATTAAGCACCTTCCTTTCCGAGACGTGTG 4802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4740 TCAGTCTTTGACAATGGCCTTCCATGATGTTATTAAGCATCTTCCTTTCCGAGACGTGTG 4799
Query 4803 CTTGAGAGACACCCAGGGACTTTATGAACTGATAGTTGCTGATTCCACAGATGCTGAGTT 4862
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4800 CTTCAGAGACACCCAGGGACTTTATGAACTGATAGTTGCTGATTCCACAGATGCTGAATT 4859
Query 4863 TGCGTCGGTATTTGAATCGTATGGTTTGGATATGCACTTGAAATCTGTGGCCTTTGCTCC 4922
||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4860 TGCGTCGGTGTTTGAATCGCATGGATTGGATATGCACTTGAAATCTGTGGCCTTTGCTCC 4919
Query 4923 TCTTCGAGCACGTCTTTTCTTCAATTCCATAATTGATTGTAAGGTGCCATCCTCTGGTTA 4982
||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4920 TCTTCGAGCGCGTCTTTTCTTAAATTCCCTAATTGATTGTAAGGTGCCATCCTCTGGTTA 4979
Query 4983 TTCCCATGAAGGAGTTAGTGAAGCAAAAAACCGACACCAGGGAAATGGAACAAAGCTTGT 5042
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4980 TTCCCATGAAGGAGTTAGTGAAGCAAAAAACCGACATCAGGGAAATGGAACAAAGCTTGT 5039
Query 5043 GGACAAGCTTGTATCTTTATTAGATTGCCTGCAACCTGCAAAATTTCACTGGCAGTGGGT 5102
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5040 GGACAAGCTTGTATCTGTATTAGATTGCCTGCAGCCTGCAAAATTTCACTGGCAGTGGGT 5099
Query 5103 TGAACTCAGGCTGCTTCTAAACGAGCAAGCACTTACTGAGAAACTCGAAAATCATGATAT 5162
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5100 TGAACTCAGGCTGCTTCTAAACGAGCAAGCACTTGCTGAGAAACTCGAAAATCATGATAT 5159
Query 5163 GCCTTTGACCGATGCAATACGATCTTCCTGCCCTACCTCTGAGAAGCCTGCTGCCTCTGA 5222
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5160 GCCTTTGACAGATGCAATACGATCTTCCTGTCCTACCTCTGAGAAGCCTGATGCCTCTGA 5219
Query 5223 GTATGAGAAAAATTTCATTCAAATGCTCCTCACAAGGTTATTGGTTAGACCTGATGCAGT 5282
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5220 GAATGAGAAAAATTTCATTCAAATCCTCCTCACAAGGTTATTGGTTAGACCTGATGCGGT 5279
Query 5283 CCCACTTTTCTCAGAAGTGGTTCATCTCTTTGGTAGATCGGTTGAGGATTCAATGTTGAA 5342
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5280 CCCTCTTTTCTCAGAAGTGGTTCATCTCTTCGGTAGATCGGTTGAGGATTCAATGTTGAA 5339
Query 5343 GCAAGCTGAATGGATTCTAGGAGGTCAAGAAGTTCTTTTTGGACGAAAAACAATCAGACA 5402
||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5340 GCAAGCTGAATGGTTTCTAGCAGGCCAAGATGTTCTTTTTGGACGAAAAACAATCAGACA 5399
Query 5403 AAAACTGATTATTGTAGGTGAAAGCAAAGGACTTCCCACGAAACCTCAGTTTTGGAAACC 5462
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5400 AAAACTGATTATTGTAGGTGAAAGCAAAGGACTCCCCACGAAACCTCAGTTTTGGAAACC 5459
Query 5463 TTGGGGTTGGTGCAACAACTCTAGTTCCGATCATATTACAACAAACAAAGCAGGGAAGAA 5522
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 5460 TTGGGGTTGGTGCAACAGCTCTAGTTCCGATCATATTACAGCAAACAAGGCAGGGAAGAA 5519
Query 5523 AAGGAAGTTTGAAATTACTTCTATCGAAGAAGGGGAAGTGATTGAGGAAGGGTCAGGTTC 5582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5520 AAGGAAGTTTGAAATTACTTCTATCGAAGAAGGGGAAGTGATTGAGGAAGGTTCAGGTTC 5579
Query 5583 AAAAAAGGTATTATTACCCCGGGCAGTAGATGAGAATAGTCCCAGTGTTGGCTATGGGAT 5642
|| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5580 AAGAAAGGTATTATTACCCCGGGTATTGGATGAGAATAGTCCCAGTGTTGGCTATGGGAT 5639
Query 5643 TACAACTGAGAGGGCTTTTGTTCAGCTAGTGCTTCCATGCATAGACCAAAGCTCTGATGA 5702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5640 TACAACTGAGAGGGCTTTTGTTCAGCTAGTGCTTCCATGCATAGACCAAAGCTCTGATGA 5699
Query 5703 ATCTCGAAGTACCTTTGTGAATGAGTTGGTAAGACAGTTTAGCAATATTGAGCAGCAATT 5762
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5700 GTCTCGAAGTACCTTTGTGAATGAGTTGGTAAGACAGTTTAGCAATATTGAGCAGCAATT 5759
Query 5763 AAGTTCAGTTACCAACCACAGTACAACAAACAACAAGCACATGGGAACTGCTTCTTCTGG 5822
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5760 AAGTTCAGTTACCAACCGCAGTACAACAAGCAACAAGCAAATGGGAACTGCTTCTTCTGG 5819
Query 5823 GTCTGAGATTTCATCAAATAAAGGAAGTACCCGGAAGGGCCTTCGCGGTGGTAGCCCTAG 5882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5820 GTCTGAGATTTCATCAAATAAAGGAAGTACCCGGAAGGGCCTTCGCGGTGGTAGCCCTAG 5879
Query 5883 TTTGGCAAGAAGATCCTCAACCAATATTACTGACACTGCGCCGCCGCCTTCCCCTGCTGC 5942
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5880 TTTGGCAAGAAGATCCTCAGCCAATACTACTGACACTTCGCCGCCGCCTTCCCCTGCTGC 5939
Query 5943 TTTGAGAGCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCAATTTCTTCTAAGATTACTGCCTGTCATCTG 6002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5940 TTTGAGAGCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCAATTTCTTCTAAGATTACTGCCTGTCATCTG 5999
Query 6003 CGGGGAACCTTCATTTAGGAACACGAGACATGCACTTGCATCTACAATAGTCCGTCTACT 6062
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 6000 CGGGGAACCTTCATTTAAGAACACCAGACATGCACTTGCGTCTACAATAGTTCGTCTACT 6059
Query 6063 TGGAAGCCGAGTAGTTTATGAAGATTATGCTGTCTGCTCTCCTCGTATTGAGGTATCAAA 6122
||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||
Sbjct 6060 TGGAAGCAGAGTAGTTTATGAAGATTATGCTGTATGTTCTCCTCGTAGTGAGCTATCAAA 6119
Query 6123 GGCAGAAACAGAATCAACAATAGATCCTTCTTCCATGGCAGATCTCTCTAGTGAAGTCTT 6182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6120 GGCAGAAACAGAATCAACAATAGATCCTTCTTCCATGGCAGATCTCTCTAGTGAAGTCTT 6179
Query 6183 ATTTGACCGGTTACTGTTTGTACTCCATGGGTTGTTAAGCAATCACCAGCCAAAATGGCT 6242
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6180 ATTTGACCGGTTACTGTTTGTACTCCATGGGCTGTTAAGCAATCACCAGCCAAAATGGCT 6239
Query 6243 AAAGCCAAGGCCTTCCTCTAGTGAACCATCCAAAGACTTTACCTTGTTTGATCGCGATGC 6302
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6240 AAAGCCAAGGCCTTCCTCTAATGAATCATCCAAAGACTTTACCTTGTTTGATCGCGATGC 6299
Query 6303 AGCAGAGAGCTTACAGAATGAGCTTTCGCGGATGCAGTTACCAGACACCATTAGATGGCG 6362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6300 AGCAGAGAGCTTACAGAATGAGCTTTCGCGGATGCAGTTACCAGACACCATTAGATGGCG 6359
Query 6363 GATCCAATCAGCGATGCCAATCCTCCTTCCTTCTCTACGCTGTTCTCTCTCGTGCCAGCC 6422
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6360 GATCCAAGCAGCGATGCCAATCCTCCTTCCTTCTCTACGCTGTTCTCTCTCATGCCAGCC 6419
Query 6423 TCATTCCGTTCCGCCAACTGCACTCACACTTGTTCAACCCTCTGGATCTGCCGCTGCTGC 6482
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||
Sbjct 6420 TCATTCTGTTCCGCCAACCGCACTCACACTTGTTCAGCCCTCTGGATCTACTGCTGCTGC 6479
Query 6483 TGGACCCAACCAAAGAAACTCCCCTGCCATATCGAAAACTGGAACCGCAGCAGTGCAAGG 6542
|||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||
Sbjct 6480 TGGAACCAATCAAAGAAACTCCCCTGCCATATCGAAAAGTGGAACTGCAGCAGCACAAGG 6539
Query 6543 GAAGCTGAAGCAGACAGTGTTGGCACCACCTCAACAACAAGAAGCAGATAACACGGATGT 6602
||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6540 GAAGCTGAAGCCGACAATGTTGGCACCACATCAACAACAAGAAGCAGACAACACGGATGT 6599
Query 6603 GGTTGACCCGTGGACGCTTCTCGAAGATGGGACAAGTTCAGGTCTATCAAGCAGCAACGC 6662
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6600 GGTTGACCCGTGGACGCTCCTCGAAGATGGGACAAGTTCAGGTCTATCAAGCAGCAACGC 6659
Query 6663 TTCAAACAGCAGCGACATGGCCAATCTCCGAGCCACCTGTTGGCTGAAAGGTGCAGTTAG 6722
|||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6660 TTCAAATAGCAGCGACATGGCCAACCTTCGAGCCACCTGTTGGCTGAAAGGTGCAGTCAG 6719
Query 6723 GGTCAGACGGACTGATCTAACTTATGTTGGTTCAGTAGACGACGACAGCTGA 6774
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6720 GGTCAGACGGACTGATCTAACTTACGTTGGTTCAGTAGACGACGACAGCTGA 6771
Score = 4732 bits (2562), Expect = 0.0
Identities = 2739/2824 (97%), Gaps = 14/2824 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 491 AGGCTGGTCAGGTTTATGGGGTGCCTCTCTCTGGTTCGCTTCTATGTAAGCCTGGATTTC 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 AGGCTGGTCAGGTTTATGGGGTGCCTCTCTCTGGTTCGCTTCTATGTAAGCCTGGATTTC 481
Query 551 CAGAACAAAGATCATGTGGGGAGGAGACAAAGAAAAAATGGATCGAGAGTTTATCACAAC 610
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 CAGAACAAAGGTCATGTGGGGAGGAGACAAAGAAAAGATGGATCGAGAGTTTATCACAAC 541
Query 611 AGCACAAACGATTGCGCTCTTTGGCTGATAACATTCCTGGATATAGGAGAAAAACCTTAT 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 AGCACAAACGATTGCGCTCTTTGGCTGATAACATTCCTGGATATAGGAGAAAAACCTTAT 601
Query 671 TTGAGGTCCTTATAAGGAACAATGTCCCACTATTGAGAGCTACTTGGTTTATAAAAGTGA 730
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 TTGAAGTCCTTATAAGGAACAATGTCCCACTATTGAGAGCTACTTGGTTTATAAAAGTGA 661
Query 731 CTTATCTCAATCAGGTACATTGTTGGGC-A-AGA---GTGCGACCTAGTCCTGCTGCTAT 785
|||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 CTTATCTCAATCAGGTACATTGTTGGGCAATAAATTGGTGCGACCTAGTCCTGCTGCTAT 721
Query 786 TTCTTCAGGAACACCTGACAAGACACAAGCTTCTCGGTGTGAGCAATGGACAAAAGATGT 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 TTCTTCAGGAACACCTGACAAGACACAAGCTTCTCGGTGTGAGCAATGGACAAAAGATGT 781
Query 846 TATTGAATATTTGCAATACCTCTTGGATGAACTTTTGTCACGGAATAGCTCATTTACTGC 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 782 TATTGAATATTTGCAATACCTCTTGGATGAACTTTTGTCACGGAATAGCTCATTTCCTGC 841
Query 906 TCAGCAAACTAGAGATAGGTCACCACAGATGCTTTATACAGGATCAATGCAAAAGAATAG 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 TCAGCAAACTAGAGATAGGTCACCACAGATGCTTTATACAGGATCAATGCAAAAGAATAG 901
Query 966 TCCAGCATCAGCAAGCCTTTACGGCGAGGAAACATCTCTACATTTTAAATGGTGGTATAT 1025
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 TCCAGCATCAACAAGCCTTTACGGCGAGGAAACATCTCTACATTTTAAATGGTGGTATAT 961
Query 1026 GGTGCGTCTTCTACAGTGGCACCATGCTGAAGGGCTTCTTTTTCCTAATCTCATTGTTGA 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GGTGCGTCTTCTACAGTGGCACCATGCTGAAGGGCTTCTTTTTCCTAATCTCATTGTTGA 1021
Query 1086 TTGGGTTCTCAAGCTCTTACAGCTTTGTGAATTTCCCTTTTGC-TTACTGCAGGAAAAGG 1144
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1022 TTGGGTTCTCAAGCTCTTACAGCTTTGTGAATTTCCATTTTGCTTTACTGCAGGAAAAGG 1081
Query 1145 AGGTCTTTGAAATTTTGCAGTTGCTACTCCCCATTGTGTATGGTGTTTTAGAGAGTATTG 1204
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 AGATCTTTGAAATTTTGCAGCTGCTACTCCCCATTGTGTATGGTGTTTTAGAGAGTATTG 1141
Query 1205 TTCTCTCTCAGACATATGTACAGAGTCTTGTAGCTATTGCTGTCCGTTTCATTCAGGAAC 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 TTCTCTCTCAGACATATGTACAGAGTCTTGTAGCTATTGCTGTCCGTTTCATTCAGGAAC 1201
Query 1265 CTGCTCCTGGTGGATCTGATCTTGTTGATAACTCTCGAAGAGCTTATACTCTCTCTGCTC 1324
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1202 CTGCTCCTGGTGGATCTGATCTTGTTGATAACTCTCGAAGAGCTTATACTCTATCTGCTC 1261
Query 1325 TAATTGAGATGGTTCGCTACTTGGTACTTGCTGCACCCGACACACTTGTTGCTTCAGATT 1384
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1262 TAATTGAGATGGTTCGCTACTTGGTACTTGCTGCACCCGACACATTTGTTGCTTCAGATT 1321
Query 1385 GCTTTCCTCTTCCTCCTTCCATAGCAGCATGTGGACCTAATGATGTGAGCTATACGTCAA 1444
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 TCTTTCCTCTTCCTCCTTCCGTAGCAGCATGTGGACCTAATGATGTGAGCTATACGTCAA 1381
Query 1445 AGGGTTACGAGAATCTGGAAAAGCTGAGAAGTAACTCTGCAGAGAATTCTACCCAGTTTC 1504
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||
Sbjct 1382 AGGCTTATGAGAATCTGGAAAAGCTGAGAAGTAACTCTGCGGAGATTTCTGCCCAGTTTC 1441
Query 1505 AAGGAAGAGGAGTTGTTTCCCGGTTTGAGTTCCTTTCTTTTGATTATACCATTTCAACTA 1564
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1442 AAGGAAGAGGAGTTCTTTCCCGGTTTGAGTTCCTTTCTTTTGATTATACCATTTCAACCA 1501
Query 1565 TTCAAAGAAGTGCAGATGATTTGGCAAAGATAGCTAGCGCTGGTTACCCTCAACATAACA 1624
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 TTCAAAGAAGTGCAGATGATTTGGCAAAGATAGCTAGCGCTGGTTACCCTCAACATAACG 1561
Query 1625 TGGCTAAAGCTGTTCAGGCCTTGGATAAAGCTTTGTCGGATGGAGATATCAGAGCTGCTT 1684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 TGGCTAAAGCTGTTCAGGCCTTGGATAAAGCTTTGTCGGATGGAGATATCAGAGCTGCTT 1621
Query 1685 ACAGTTATCTCTTTGAGGACCTTTGCAATGGAGCCGTTGATGAGACCTGGATTGCTGACG 1744
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1622 ACAGTTATCTCTTTGAAGACCTTTGCAATGGAGCCGTTGATGAGGCCTGGATTACTGACG 1681
Query 1745 TCAGTCCATGTTTAAGATCATCCCTTAGATGGATTGGCGCTATTAGCACATCCTTTGTTT 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 TCAGTCCATGTTTAAGATCATCCCTTAGATGGATTGGCGCTATTAGCACATCCTTTGTTT 1741
Query 1805 GCTCCGtttttttCCTTATAGAATGGGCTACATGTGATTTTAGAGATTTCCGTGCCGGTG 1864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1742 GCTCCGTTTTTTTCCTTATAGAATGGGCTACATGTGATTTTAGAGATTTCCGTGCTGGTG 1801
Query 1865 TGCCCAAAGATATCAAGTTCTCTGGCAGAAAAGATTGTTCTCAGGTGTATTTAGTCATTC 1924
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802 TGCCTAAAGATATCAAGTTCTCTGGCAGAAAAGATTGTTCTCAGGTGTATTTAGTCATTC 1861
Query 1925 AGCTTCTGAAGCAAAAGATTCTGGGTGGAGAATTCGCAGCTCGCAAAGGAAAGAACAGTC 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1862 AGCTTCTGAAGCAAAAGATTCTGGGTGGAGAATTCACAGCTCGCAAAGGAAAGAATTGTC 1921
Query 1985 GCAACAATTTGCCTGGTGTTTCTAAACCTAGCAGTTC-AGTGGATGCTTTTGAAAGCCCG 2043
|||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1922 GCAACAATTTTCTTGGTGTTTCTAAACCTAGCGGTTCGA-TGGATGCATTTGAAAGCCCG 1980
Query 2044 GGCCCATTACATGATATCATAGTCTGTTGGATTGATCAGCATGAGGTACACAGGGGAGGA 2103
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1981 GGCCCATTACATGATATCATAGTCTGTTGGATTGATCAGCATGAGGTACACAAGGGAGGA 2040
Query 2104 GCAAAGCGCTTGCAATTACTTGTTTTTGAACTTATACGTTCTGGAATCTTTAATCCCATA 2163
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GCAAAGCGCTTGCAATTACTCGTTTTTGAACTTATACGTTCTGGAATCTTTAATCCCATA 2100
Query 2164 GCATACGTGAGGCAACTCATAGTTAGTGGGATGATCGATGTGATTCAACCTGCTGTTGAT 2223
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GCATATGTGAGGCAACTCATAGTTAGCGGGATGATCGATGTGATTCAACCTGCTGTTGAT 2160
Query 2224 CCTGAAAGGAGAATGAGGCACCATCGCATATTGAAACAGCTACCTGGGTGTTTTGTACAT 2283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 CCTGAAAGGAGAATGAGGCACCATCGCATATTGAAACAGCTACCTGGGTGTTTTGTACAT 2220
Query 2284 GAAACCCTAGAGGAAGCTCAACTCTTTGGAGGGGATAAGCTTTCCGAGGCTGTGAGGACT 2343
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2221 GAAACCTTAGAGGAAGCTCAACTCTTTGGAGGGGATAAGCTTTCCGAGGCTGTGAGAACT 2280
Query 2344 TATTCTAACGAACGGCGCCTTCTTCTTCGAGAACTGCTTGTTGAGAAAGGTAAATATTGG 2403
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2281 TATTCTAATGAACGGCGCCTTCTTCTTCGAGAACTGCTTGTTGAGAAAGGTAAATACTGG 2340
Query 2404 AATAATATAGTTCTGTCAGATCAGAAGTCAAAGAAACATT-CCACTTCCCTTCCGTCTGT 2462
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2341 AATAATTTAGTTCTCTCAGATCAGAAGTCAAAGAAA-ATTTCCACTTCCCTTTCGTCTGT 2399
Query 2463 TGTTTTTCCAAGGCCGTGTAATTCCATG-GCCAATAGTGAGGGACCTCGCAAACATACCA 2521
| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 TATTTTTCCAAGGGCGTGTAATGCCAAGAGC-AATAGTAAGGGACCTCGCAAACATACCA 2458
Query 2522 AGAGTCGTGTGGATATTAGAGAACTAAAGGAGCGCATATCAGCTGTACTGCAGTTTCCAG 2581
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2459 AGAGTAGTGTGGATATTAGAGAACTAAAGGAGCGCATATCAGCTCTACTGCAGTTTCCAG 2518
Query 2582 GTATGTCATGTGGTGTGAAAAATCCAATGCAAGAGGAATTCCAAAATAGTGTTAAGAGAT 2641
||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 GTATGTCATGTGGTGTGGAAACCCCAGTGCGAGATGAATTCCAAAATAGTGTTAAGAGAT 2578
Query 2642 CTAGTGGATCTGTGTATAGCAAGATAGATCAACCAGAAGCTACACCAGGGTGTGAAGACT 2701
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CAAGTGGATCTGTGTATAGCAAGATGGATCAACCAGAAGCTACACCAGGGTGTGAAGACT 2638
Query 2702 GTAGAAGAGCAAAAAGACCAAAAATGAACGATGAAAAGAGCTCTTGCTATCAAGGGAATT 2761
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 GTAGAAGAGCAAAAAGACCAAAAATGAATGATGAAAAGAGCTCTTGCTATCAAGGGAATT 2698
Query 2762 CACCAATTGCATCAGATGAAGAAGATAACTGGTGGATCAAGAAAGGATCAAAAACTCTGG 2821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2699 CACCAATTGCATCAGATGAAGAAGATAACTGGTGGATCAAGAAAGGATCGAAAACTGTGG 2758
Query 2822 AGTCTTCTCTGAAGGTTGATCCTCAGATAGAGTTAACTAAACAAGTACCACGGGGTAGGC 2881
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2759 AGTCTTCTCTGAAGGTTGATCCTCAGATAGAGATAACTAAACAAGTACCACGAGGTAGGC 2818
Query 2882 AGAAGATGGCGCGTAAGACACAGTCGCTGGCTCAACTACAAGCTGCTAGAATTGAAGGTA 2941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 AGAAGATGGCGCGTAAGACACAGTCGCTGGCTCAACTACAAGCTGCTAGAATTGAAGGTA 2878
Query 2942 GCCAGGGCGCTTCAACGAGTCATGTTTGTGATAATAAAGTAAGCTGTCCTCATCATGGCC 3001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 GCCAGGGCGCTTCAACGAGTCATGTTTGTGATAATAAAGTAAGCTGTCCTCATCATGGCC 2938
Query 3002 CTGGAGTGGAAGGAGAAAATCATAAGGTGGTTGATGTGTTTAGAACTTCCACCCCTGTGG 3061
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 CTGGAGTGGAAGGAGAAAATCAGAAGGTGGTTGATGTGTTTAGAACTTCCACCCCTGTGG 2998
Query 3062 ATATTGTATCTGTTGGAAACTCTTTGAAGCAGCTACAGTTTGTTGATAAGCGGTCTATTG 3121
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2999 ATATGGTATCTGTTGGAAACTCTTTGAAGCAGCTACAGTTTGTTGATAAGCGATCTATTG 3058
Query 3122 CAGTTTGGATTACTACTGTTGTTCGGCAACTTGTTGAAGAGCCCCAAAAGAGCAGTGTGA 3181
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 CAGTTTGGCTTACTACTGCAGTTCGGCAACTTGTTGAAGAGCCCCAAAAGAGCAGTGTGA 3118
Query 3182 GAGTTGGGCAGTTCAATAGAGGTGCTCCAGTTGAGGAGAAGAGCACAATTAGGTGGAAGC 3241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3119 GAGTTGGGCAGTTCAATAGAGGTGCTCCAGTTGAGGAGAAGAACACAATTAGGTGGAAGC 3178
Query 3242 TTGGGGCAGACGAGCTAT-CTTCCATATTATTTCTCTTGGATATCTCTCTTGACTTGGTT 3300
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 TTGGGGCAGACGAGCTATACT-CCATATTATTTCTCTTGGATATCTCTCTTGACTTGGTT 3237
Query 3301 TCAG 3304
||||
Sbjct 3238 TCAG 3241
Score = 640 bits (346), Expect = 0.0
Identities = 407/433 (94%), Gaps = 18/433 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCAAAGGTATCATCCTGCCAACTGCTCTAGTGCAGTCAACAATAGTGCTGTAGGTGGT 60
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 10 ATGCAAAGGTATCATGCTGCCAACTGCACTAGTGCAGTCAACAATAGTGCTATAGGTGGT 69
Query 61 GCATCCGCTAGGGACTCAGGACGAGCTGATTCCTCTTCGATTGGAAACTATTCCCTAAAC 120
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 70 GCATCCGCGAGGGACTCAGGACGAGCTGATTCCTCTTCGATTGGAAACTATTCACTAAAC 129
Query 121 TCCAGGCATGTTGATAGAAAGAAGAGACCACCACCGTTGACACCCTACAAGTTGAAGTGT 180
| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 T-C---C------------AG--GAGACCACCACCGTTGACACCCTACAAGTTGAAGTGT 171
Query 181 GAAAAGGACGGTCTGAATTCCCGATTAGGGCCGCCTGATTTTCATCCTCCTACATCAAAT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 172 GAAAAGGACGGTCTGAATTCCCGATTAGGGCCGCCTGATTTTCATCCTCCAACATCAAAT 231
Query 241 TCTCCCGAAGAGAATCTGACCAAAGAGTACGTTCAATTTGGATACAAGGAAACTGTTGAT 300
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 TCTCCCGAAGAGAATCTGACCAAAGAGTATGTTCAATTTGGATACAAGGAAACTGTTGAT 291
Query 301 GGACTTAAGGAATCCGAAGAAATTATATTGTCCCAGGTCCATACTTTCTCAAAGCCTGTT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GGACTTAAGGAATCCGAAGAAATTATATTGTCCCAGGTCCATACTTTCTCAAAGCCTGTT 351
Query 361 GTCCATAAGTGCAAAGAGGCAGTCAGAAAGTGTCTTAGAGCTATCAATGAATCTCGTGCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 GTCCATAAGTGCAAAGAGGCAGTCAGAAAGTGTCTTAGAGCTATCAATGAATCTCGTGCA 411
Query 421 CTGAAGCGTAAGG 433
|||||||| ||||
Sbjct 412 CTGAAGCGCAAGG 424
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 338199518386
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5