BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg898366 Length=6132 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G54280.2 | Symbols: RGD3 | DNA binding;ATP binding;nucleic a... 9507 0.0 > AT3G54280.2 | Symbols: RGD3 | DNA binding;ATP binding;nucleic acid binding;binding;helicases;ATP binding;DNA binding;helicases | chr3:20091976-20104257 FORWARD LENGTH=6632 Length=6632 Score = 9507 bits (5148), Expect = 0.0 Identities = 5546/5734 (97%), Gaps = 44/5734 (1%) Strand=Plus/Plus Query 420 GGAGTACGACATTTTGAATGACAATTCCAAGAATCCAAAGGATCGAGTGGCTCGTCAGAA 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 651 GGAGTACGACATTTTGAATGACAATTCCAAGAATCCAAGGGATCGAGTGGCTCGTCAGAA 710 Query 480 AAAGAATCTCCGACGACGTCTAGGTTTGGACATGTGCGAGCAGTTCATGGATGTCAATGA 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 711 AAAGAATCTCCGACGACGTCTAGGTTTGGACATGTGCGAGCAGTTCATGGATGTCAATGA 770 Query 540 AATGATTAGAGATGAGGATCTTATTGAGCAGAAGTCCAATGTTCCTGCGAATGGGGTTGG 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 771 AATGATTAGAGATGAGGATCTTATTGAGCAGAAGTCCAATGTTCCTGCCAATGGGGTTGG 830 Query 600 GAACAGATTATACGCAAACTATTCTCCACATCATATTCAACAATTCGTTTCAAGGATGGT 659 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| Sbjct 831 GAACAGATTATACGCAAACTGTTCTCCACATCATATCCAGCAATTCGTTTCAAGAATGGT 890 Query 660 TCCCCGTGTCAATTCTAGGAGGCCAAGCGCAAGGGAATTGAATTTACTGAAACGAAAAGC 719 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 891 TCCCCGCGTCAATTCTAGGAGGCCAAGCGCAAGGGAATTGAATTTACTGAAACGAAAAGC 950 Query 720 AAAAATAAGCTCAAAAGATCAAGCTAAAGGTAGCTGCGAAGTAGCAGATGTTGAGATGCC 779 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 951 AAAAATAAGCTCTAAAGATCAAGCTAAAGGTAGCTGCGAAGTAGCAGATGTTGAGATGTC 1010 Query 780 ATCGTCTCA---TGCCTCAACCTCAAAAAGAATATCGTCCGACTCATTGGACTCGAACAA 836 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1011 ATCGTCTCATGTTGCCTCAACCTCAAAAAGAATATTGTCCGACTCATTGGACTCGAGCAA 1070 Query 837 GGCGGACATTGGTAATGAGGATGATATCGAGCCTGATGGGGATGGAAAATGGCCTTTCCA 896 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1071 GGCGGACATTGGTAATGAGGATGATATCGAGCCTGATGGGGATGGAAAATGGCCTTTCCA 1130 Query 897 TAGTTTTGTTGAGCAACTTATTCTTGACATGTTTGACCCTGCATGGGAGATCCGCCATGG 956 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1131 TAGTTTTGTTGAGCAACTTATTCTTGACATGTTTGACCCTGCATGGGAGATCCGCCATGG 1190 Query 957 AAGTGTAATGGCTCTCAGAGAAATATTAATGCTTCATGGTGGTTCTGCTGGAGTGTCAAC 1016 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1191 AAGTGTAATGGCTCTCAGAGAAATATTAATGCTTCATGGTGGTTCTGCTGGAGTGTCAAC 1250 Query 1017 AGAAGAGTTTAGCTCAGATAATGGGTTTGAGTTGAAAGAAGTCTTGAACAAAGTAACACG 1076 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 1251 AGAAGAGTTTAGTTCAGATAATGGGTTTGAGTTGAAAGACGTCTTGAATAAAGTAACACG 1310 Query 1077 AGAAAGAGAAATCGACTTAAATATGCAGGTTTCAGAAAATGAGCTGGAGCCACTTCGGAA 1136 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1311 AGAAAGAGAAATCGACTTGAATATGCAGGTTTCAGAAAATGAGCTGGAGCCACTTCGGAA 1370 Query 1137 AAGACCTAAGATTGAAGATCCATCAAAATCATTTATTGATAACACTGTTTTAGAAGTTAT 1196 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1371 AAGACCTAAGATTGAAGATCCATCAAAATCTTTTATTGATAACACTGTTTTAGAAGTTAT 1430 Query 1197 TGGGGGTTACTCTGATATTAATGTTAAAGATGAAGATGCTGAGTTTTTACTGCCACCAGT 1256 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1431 TGGGGGTGACTATGATATTAATGTTAAAGATGAAGATGCTGAGTTTTTGCTGCCACCAGT 1490 Query 1257 GAAGGTCAATGGTCAAACTGACTCTAATTCTACGAAAGTGGAACCTCAATCTTCTATGGA 1316 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1491 GAAGGTCAATGGTCAAACTGACTGTAGTTCTACGAAACTGGAACCTCAATCTTCTATGGA 1550 Query 1317 TGATTCGTCATCTCACTCTGAAATAAACCATGTGGCAGAGGTTAACAATCATTTTGAAGA 1376 ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1551 TGACTCGACATCTCACTCTGAAATAAACCATGTGGCAGAGGTTAACAATCATTTTGAAGA 1610 Query 1377 TAAGAGTTTTATTGAGGAAGC-AGTTATACCTAAGCATCAGGAAGAAAATCTCGAAGTGT 1435 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1611 TAAGAGTTTTATTGAGGA-GCCAGTTATACCTAAGCAACAGGAAGAAAATCTCGAAGTGT 1669 Query 1436 TGGATTTGGTTAAACAAGCTAGGCATTCTTGGATAAAAAATTTTGAATTTCTCCAGGATT 1495 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1670 TGGATTTGGTCAAACAAGCTAGGCATTCTTGGATAAAAAATTTTGAATTTCTCCAGGATT 1729 Query 1496 GCACCATTCGCTTCTTATGTGTGCTTTCACTTGACCGATTTGGGGATTATATTTCTGATC 1555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1730 GCACCATTCGCTTCTTATGTGTGCTTTCACTTGACCGATTTGGGGATTATATTTCTGATC 1789 Query 1556 AGGTAGTTGCTCCTGTGCGGGAAGCTTGTGCCCAAGCACTTGGTGCTACTTTCAAATACA 1615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1790 AGGTAGTTGCTCCTGTGCGGGAAGCTTGTGCCCAAGCACTTGGTGCTACTTTCAAATACA 1849 Query 1616 TGAATCCCTCGGTGATTTATGAGACATTAAATATCTTGCTTCAGATGCAGCGCCGGCCTG 1675 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1850 TGAATCCCTCGTTGATTTATGAGACATTAAATATCTTGCTTCAGATGCAGCGCCGGCCTG 1909 Query 1676 AATGGGAAATTCGTCATGGAAGTCTTTTGGGCATCAAGTACTTGGTTGCTGTGCGACAGG 1735 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1910 AATGGGAAATTCGTCATGGAAGTCTTTTAGGCATCAAGTACTTGGTTGCTGTGCGACAGG 1969 Query 1736 AAATGCTCCAAGATTTGCTTGGCTATATTCTTCCGGCGTGTAAAGCAGGGTTGGAGGATT 1795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1970 AAATGCTCCAAGATTTGCTTGGCTATATTCTTCCGGCGTGTAAAGCAGGGTTGGAGGATT 2029 Query 1796 CTGACGATGATGTGCGAGCAGTTGCTGCTGATGCTCTTATACCGGCAGCAGCTGCTATTG 1855 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2030 CTGACGATGATGTGCGAGCAGTTGCCGCTGATGCTCTTATACCGGCAGCAGCTGCTATTG 2089 Query 1856 TCTCTTTGAGAGGACAGACATTACTTTCCATTGTCATGCTACTGTGGGATATCTTGCTTG 1915 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2090 TCTCTTTGAGAGGACAGACATTACTTTCCATTGTCATGCTACTGTGGGATATCTTACTTG 2149 Query 1916 AGTTGGATGACTTAAGTCCATCAACCAGCAGTGTTATGAACCTCCTGGCAGAAATCTATT 1975 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2150 AGTTGGATGACTTAAGTCCATCAACAAGCAGTATTATGAACCTCCTGGCAGAAATTTATT 2209 Query 1976 CTCAAGATGACATGACCCTGGTGATGCATGAGGAATTATCACTGGGGGAGGAACAAAATA 2035 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2210 CTCAAGATGACATGACCCTAGTGATGCATGAGGAATTATCACTGGGGGAGGAACAAAATA 2269 Query 2036 TTGACCTCAATGAAATGGGTCCTATCGAGAGTATTGGAGAAAGAAGAGATGTCAAGGAAA 2095 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2270 TTGAACTCAATGAAATGGGTCATATCGAGAGTATTGGAGAAAGAAGAGATGTAAAGGAAA 2329 Query 2096 GCCCTTATGCATTATCAGGTTTAGCCCCTAGGTTGTGGCCATTTACGAGGCACGACATTA 2155 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | Sbjct 2330 GCCCTTATGCATTATCAGGTTTGGCCCCTAGGTTGTGGCCATTCACGAGGCATGACATAA 2389 Query 2156 CATCAGTTCGATTTTCTGCTATTCGAACTCTGGAACGACTTCTTGAAGCTGGATGCAGAA 2215 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2390 CATCAGTTCGATTTTCTGCTATTCGAACTCTGGAACGACTTCTTGAAGCTGGATGCAGAA 2449 Query 2216 AGAACATTTCTGAGCAGTCTAAAAGTTCTTTTTGGCCATCTTCTATTTTAGGGGACACCC 2275 | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2450 AAAACATTTCTGGGCAGTCTAAAAGTTCTTTTTGGCCATCTTCTATTTTAGGGGACACCC 2509 Query 2276 TGAGAATCGTCTTTCAAAATCTTTTGCTTGAATCAACTGAGGAGATTCTGGAGTGTTCGG 2335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2510 TGAGAATCGTCTTTCAAAATCTTTTGCTTGAATCAACTGAGGAGATTCTGGAGTGTTCAG 2569 Query 2336 AGAGAGTGTGGAGACTATTGGTTCAGTGCCCAGTGGATGATTTAGAAGACGCTGCAAAAT 2395 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| Sbjct 2570 AGAGAGTGTGGAGACTATTGGTTCAGTGCCCAGTGGATGATCTAGAAGACACGGCAAAAT 2629 Query 2396 TCTATATGGCTTCGTGGATAGAACTTGCAGCTACTCCTTATGGCTCCACATTGGATGCTA 2455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2630 TCTATATGGCTTCGTGGATAGAACTTGCAGCTACTCCTTATGGCTCCACATTGGATGCTA 2689 Query 2456 CGAAAATGTTTTGGCCAGTAGCTCCCCCTCGTAAGAGTCATTTCAAAGCTGCTGCTAAGA 2515 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2690 CAAAAATGTTTTGGCCAGTAGCTCCCCCTCGTAAGAGTCATTTCAAAGCTGCTGCTAAGA 2749 Query 2516 TGAAAGCTGTCAAACTTGAGAACGAAGCTTCTAGCATTCTGGGATTTGATTATGCAAGAA 2575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2750 TGAAAGCTGTCAAACTTGAGAACGAAGCTTCTAGCATTCTGGGATTTGATTATGCAAGAA 2809 Query 2576 GTTCTGCTTCCCTCGAAAAACATGAAGATGCTTCTGCCAGGTCCACTAAAATTATCGTCG 2635 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2810 GTTCTGCTTCCCTTGAAAAACAGGAAGATGCTTCTGCCAGGTCCACTAAAATTATTGTCG 2869 Query 2636 GCTCTGATATGGAAATGTCAGTGACCCGCACCCGGGTAGTTACAGCATCTGCATTAGGTA 2695 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2870 GCTCTGATATGGAGATGTCAGTGACCCGTACCCGGGTAGTTACAGCATCTGCATTAGGTA 2929 Query 2696 TCTTTGCATCCCGGTTGCGAGAGGGTTCAATGCAGTTTGTGGTAGATCCACTGAGTAGTA 2755 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2930 TCTTTGCATCCCGGTTGCGAGAGGGTTCAATGCAGTTTGTGGTAGATCCACTGAGTAGTA 2989 Query 2756 CTCTTACTTCTCTGTCCGGTGTTCAGCGCCAGGTTGCGTCCATTGTGCTCATCTCTTGGT 2815 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2990 CTCTTACTTCTATGTCCGGTGTTCAGCGCCAGGTTGGGTCCATTGTGCTCATCTCTTGGT 3049 Query 2816 TCAGAGAAACAAAATGCAAGGCCCCTTCTGATGGAAGTGGAAGTTTGCCTGGTTTTCCTA 2875 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3050 TCAGAGAAACTAAATGCAAGGCCCCTTCTGATGGAAGTGGAAGTTTGCCTGGTTTCCCTA 3109 Query 2876 GTCCTCTTAAAAAATGGCTGCTAGATTTGTTAGCTTGCTCAGACCCTGCTTTCCCTACTA 2935 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3110 GTCCTCTGAAAAAATGGCTGCTAGATTTGTTAGCTTGCGCAGACCCTGCTTTCCCTACTA 3169 Query 2936 AAGACATACTTCTTCCTTATGCTGAGCTCTCAAGAACATACACGAAAATGAGGAATGAAG 2995 |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3170 AAGACATATTTCTTCCTTATGCTGAACTCTCAAGAACATACACTAAAATGAGGAATGAAG 3229 Query 2996 CTTCTCAGTTTTTGCATACAGTTGAAACCTGCCATTGTTTTGATAAGTTATTATCAACGA 3055 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3230 CTTCTCAGTTGTTGCATACAGTTGAAACCTGCCATTGTTTTGATAAGTTATTATCAACGA 3289 Query 3056 ATAAACTCAATGTGGAGAGCGTGACTGCCGATGAGACAATTGACTTTGCATCAACACTAG 3115 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3290 ATAAACTCAATGTGGAGAGCGTGACTGCTGATGAGACAATTGACTTTGCATCAACACTAG 3349 Query 3116 CTTTGTGGAACAAAGAAAGTGTTGGAAATGAATCCTTAGAAAAGCAAGTTTTTGAAGATG 3175 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3350 ATTTGTGGAACAAAGAAAGTGCTGGAAATGAATCCTTAGAAAAGCAAGTTTTTGAAGACG 3409 Query 3176 TGGAGTCATCTAGGCAACAGCTATTAAGTACTGCTGGTTATTTAAAGTGTGTTCAGAGTA 3235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3410 TGGAGTCATCTAGGCAACAGCTATTAAGTACTGCTGGTTATTTAAAGTGTGTCCAGAGTA 3469 Query 3236 ATCTACATATCACAGTCACCTCCCTGATCGCTGCTGCAGTTGTTTGGATGTCAGAATTTC 3295 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3470 ATCTACATATCACAGTCACCTCCCTGGTCGCTGCTGCAGTTGTTTGGATGTCAGAATTTC 3529 Query 3296 CTGCTAGACTTAATCCAATCATCTTGCCGCTGATGGCTTCGATTAAAAGAGAGCAGGAAC 3355 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3530 CTGCTAGACTTAATCCAATAATCTTGCCGCTGATGGCTTCGATTAAAAGAGAGCAGGAAC 3589 Query 3356 AAATACTACAGCAAATAGCTGCTGAGGCTCTTGCAGAGCTCATTGCATACTGCGTAGATC 3415 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3590 AAATACTACAACAAATAGCTGCTGAGGCTCTTGCAGAGCTCATTGCATACTGCGTAGATC 3649 Query 3416 GGAAGCCAAGCCCCAATGACAAGTTAATCAAGAATATCTGTAGCTTGACGTGCATGGATC 3475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3650 GGAAGCCAAGCCCCAATGACAAGTTAATCAAGAATATCTGTAGCTTGACGTGCATGGATC 3709 Query 3476 CTAGCGAAACACCTCAAGCTAGCATCATTAGCTCTATGGATATCATTGATGATATGGATT 3535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3710 CTAGCGAAACACCTCAAGCTAGCATCATTAGCTCTATGGATATCGTTGATGATATGGATT 3769 Query 3536 TTCTGTCCTCGCGGAGTAACGCAGGAAAACAAAAAGCAAAAGTCGTGTTGGCTGGTGGCG 3595 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3770 TTCTGTCCTCACGGAGTAACACAGGAAAACAAAAAGCAAAAGTCGTGTTGGCTAGTGGCG 3829 Query 3596 AAGATAGGTCTAAAGTTGAGGGTTTTATCACGAGGAGAGGATCTGAACTCGCGTTGAAGC 3655 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3830 AAGATAGGTCTAAAGTTGAGGGTTTTATCACGAGAAGAGGATCTGAACTCGCGTTGAAGC 3889 Query 3656 ATTTAAGCTTGAAATTTGGTGGTTCCTTGTTTGACAAACTCCCAAAATTGTGGGAGTGCC 3715 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3890 ATTTAAGCTTGAAATTTGGTGGTTCCTTGTTTGACAAACTCCCAAAATTATGGGAGTGCC 3949 Query 3716 TCACTGAGGTTCTTGTTCCTGAAATTCCTGCTGATCAACAGAATATTGACCTTAAAATAG 3775 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3950 TCACTGAGGTTCTTGTTCCTGAAATTCCTTCAGATCAACAGAAGATTGACCTTAAAATAG 4009 Query 3776 AATCTATTTCGGATCCACAGGT------------------GGT---ACGTTCAATAGCAC 3814 |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct 4010 AATCTATTTCGGATCCACAGGTCTTAATAAACAACATCCAGGTGGTACGTTCAATAGCAC 4069 Query 3815 CAGTGATGGAAGAAACACTTAAACCTAGACTACTCAGTCTCCTGCCTTGTATTTTCAAAT 3874 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4070 CAGTGATGGAAGAAACACTGAAACCTAGACTGCTCAGTCTTCTGCCTTGTATTTTCAAAT 4129 Query 3875 GCGTTCGCCATTCCCATGTAGCTGTTAGATTGGCTGCTTCTAGATGTGTTATGACAATGG 3934 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4130 GTGTTCGCCATTCCCATGTGGCTGTTAGATTGGCTGCTTCTAGATGTGTTATGACAATGG 4189 Query 3935 CTAAATCAATGACAACAAATGTCATGGCAGCAGTAGTGGAAGGTGCTATTCCAATGTTGG 3994 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4190 CTAAATCAATGACAACAGATGTCATGGCAGCAGTAGTGGAAAGTGCTATTCCAATGTTGG 4249 Query 3995 GAGATTTGACATGCATTAATGCTAGACAAGGCGCAGGAATGCTTATTGGTTTACTTGTTC 4054 ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 4250 GAGATTTAACATGCATTAGTGGTAGACAAGGCGCAGGAATGCTTATTGGTTTGCTTGTGC 4309 Query 4055 AAGGGCTGGGTGTTGAACTGGTTCCATATTCTCCTCTATTGGTTGTTCCCCTCCTAAGAT 4114 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 4310 AAGGGCTGGGTGTTGAACTGGTTCCATATTCTCCTCTATTGGTTGTTCCTCTCCTGAGAT 4369 Query 4115 GCATGAGCGATGTTGACAGTTCAGTCAGGCAGAGCGTGACACGTAGCTTTGCTGCCCTTG 4174 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4370 GCATGAGCGATGTTGACAGTTCAGTCAGGCAGAGCGTAACACGTAGCTTTGCTGCCCTTG 4429 Query 4175 TGCCTATGCTTCCATTAGCACGTGGCGCACCCCCTCCTGTCGGGTTGAGCAAGGATCTAT 4234 | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 4430 TACCTATGCTTCCATTAGCACGTGGTGTTCCCCCTCCCGTCGGGTTGAGCAAAGATCTAT 4489 Query 4235 CTAGCAATGCAGAGGATGCAAAATTTTTGGAACAGCTACTTGACAACTCCCATATAGATG 4294 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 4490 CTAGCAATGCAGAGGATGCAAAATTTTTGGAGCAGCTTCTTGACAACTCCCATATCGATG 4549 Query 4295 ATTACAAGCTTTGCACTGAGCTAAAAGTTCAATTAAGAAGGTATCAACAAGAAGGAATCA 4354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4550 ATTACAAGCTTTGCACTGAGCTAAAAGTTCAATTAAGAAGGTATCAACAAGAAGGAATCA 4609 Query 4355 ATTGGTTAGGATTCCTGAAGCGTTTTAAGCTCCATGGAATTCTCTGCGATGATATGGGGC 4414 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4610 ATTGGTTAGGATTCCTAAAGCGTTTTAAGCTCCATGGAATTCTCTGCGATGATATGGGGC 4669 Query 4415 TTGGTAAGACGCTTCAAGCATCTGCAATTGTGGCATCTGATGCAGCAGAGCGTCGTGGTT 4474 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4670 TTGGTAAGACTCTTCAAGCATCTGCAATTGTGGCATCCGATGCAGCAGAGCGTCGTGGTT 4729 Query 4475 CAACAGATGAACCAGATGTTTTTCCATCTATAATTGTTTGCCCTTCAACATTAGTTGGTC 4534 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4730 CAACAGATGAACTGGATGTTTTTCCATCTATAATTGTTTGCCCTTCAACATTAGTTGGTC 4789 Query 4535 ATTGGGCATTTGAAATTGAGAAGTATATCGACCTTTCTCTGCTAAGCGTGTTGCAGTATG 4594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4790 ATTGGGCATTTGAAATTGAGAAGTATATCGACCTTTCTCTGCTAAGCGTGTTGCAATATG 4849 Query 4595 TTGGCTCTGTTCAAGACCGTGTTTCTCTCCGTGAACAGTTCAACAACCACAATGTCATTA 4654 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4850 TTGGCTCTGCTCAAGACCGCGTTTCTCTCCGTGAACAGTTCAACAACCATAATGTCATTA 4909 Query 4655 TAACATCTTATGATGTGGTCCGCAAGGATGTTGATTATCTGACACAATTTTCATGGAACT 4714 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4910 TAACATCTTATGATGTGGTCCGCAAGGATGTTGATTATCTGACGCAATTTTCATGGAACT 4969 Query 4715 ACTGTATCCTGGATGAGGGGCACATAATTAAGAATGCTAAATCTAAAATAACTTCAGCAG 4774 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 4970 ACTGTATCCTGGATGAGGGGCACATAATTAAGAATGCTAAATCTAAAATTACTGCAGCAG 5029 Query 4775 TAAAACAATTGAAGGCCCAGCACCGACTTATCCTTAGTGGAACACCAATACAGAATAATA 4834 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5030 TCAAACAATTGAAGGCCCAGCACCGGCTTATCCTTAGTGGAACACCAATACAGAATAATA 5089 Query 4835 TCATGGAGCTGTGGTCCCTTTTTGACTTCTTGATGCCTGGATTTCTTGGGACAGAGAGAC 4894 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5090 TCATGGAGCTGTGGTCCCTTTTTGACTTCTTGATGCCTGGATTTCTTGGGACAGAGAGAC 5149 Query 4895 AGTTTCAAGCATCTTATGGAAAACCGTTGCTGGCAGCTAGAGATCCTAAATGCTCTGCTA 4954 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5150 AGTTTCAAGCATCTTATGGAAAACCATTGCTGGCAGCTAGAGATCCTAAATGCTCTGCTA 5209 Query 4955 AGGATGCTGAAGCGGGTGTACTGGCAATGGAAGCACTCCATAAGCAGGTTATGCCATTCT 5014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5210 AGGATGCTGAAGCGGGTGTACTGGCAATGGAAGCACTCCATAAGCAGGTTATGCCATTCT 5269 Query 5015 TACTCAGACGTACGAAAGAGGAAGTCCTCTCTGATTTGCCAGAAAAAATCATTCAGGACA 5074 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5270 TACTCAGACGTACGAAAGAGGAAGTCCTCTCTGATTTGCCAGAAAAAATCATTCAGGACA 5329 Query 5075 GATACTGTGACCTTAGTCCTGTGCAGTTGAAGCTTTATGAGCAATTTTCTGGTTCAAGTG 5134 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5330 GATATTGTGACCTTAGTCCTGTCCAGTTGAAGCTTTATGAGCAATTTTCTGGTTCAAGTG 5389 Query 5135 CTAAGCAAGAAATATCTAGTATCATAAAAGTTGATGGGTCAGCAGATTCTGGAAATGCAG 5194 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 5390 CTAAGCAAGAAATATCTAGTATCATAAAAGTTGATGGGTCAGCAGATTCCGGAAATGCAG 5449 Query 5195 ATGTTGCGCCAACAAAAGCATCCACACACGTTTTCCAGGCACTGCAGTACCTGCTTAAAC 5254 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 5450 ATGTTGCGCCAACAAAAGCATCCACACACGTTTTCCAGGCACTACAGTACCTGCTTAAAC 5509 Query 5255 TCTGCAGTCATCCGCTTCTTGTTCTTGGGGATAAGGTTACAGAGCCGGTGGCTTCTGATT 5314 ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 5510 TCTGCAGTCATCCGCTTCTTGTTCTAGGCGATAAGGTCACAGAGCCGGTGGCTTCTGATT 5569 Query 5315 TGTCAGCAATGATAAATGGATGTTCGGATATTATCACTGAGCTTCACAAAGTTCAACACT 5374 || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5570 TGGCAGCAATGATAAATGGATGTTCGGACATTATCACTGAGCTTCATAAAGTTCAACACT 5629 Query 5375 CTCCAAAGCTTGTTGCTCTTCAGGAAATTTTAGAAGAATGTGGAATAGGTTCTGATGCTT 5434 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5630 CTCCAAAGCTTGTAGCTCTTCAGGAAATTTTAGAAGAATGTGGAATAGGTTCTGATGCTT 5689 Query 5435 CTAGTTCAGATGGCACTCTTAGTGTAGGCCAGCACAGAGTTCTGATATTTGCACAGCACA 5494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5690 CTAGTTCAGATGGCACTCTTAGTGTAGGCCAGCACAGAGTTCTGATATTTGCACAGCACA 5749 Query 5495 AAGCTTTGCTGGATATCATTGAAAAGGACTTGTTTCAAGCCCACATGAAAAGTGTCACAT 5554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5750 AAGCTTTGCTGGATATCATTGAAAAGGACTTGTTTCAAGCCCACATGAAAAGTGTCACAT 5809 Query 5555 ATATGCGACTAGATGGTTCAGTTGTACCGGAGAAAAGGTTTGAGATTGTGAAGGCCTTTA 5614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 5810 ATATGCGACTAGATGGTTCAGTTGTACCGGAGAAAAGGTTTGAGATTGTGAAAGCCTTTA 5869 Query 5615 ATTCAGATCCTACAATTGATGTTCTGCTCCTGACAACACATGTTGGTGGGCTTGGGTTGA 5674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5870 ATTCAGATCCTACAATTGATGTTCTGCTCCTGACAACACATGTTGGTGGGCTTGGGTTGA 5929 Query 5675 ACCTGACCTCTGCTGATACACTTGTATTTATGGAGCATGATTGGAATCCAATGCGTGATC 5734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5930 ACCTGACCTCTGCTGATACACTTGTATTTATGGAGCATGATTGGAACCCAATGCGTGATC 5989 Query 5735 ATCAGGTGAACAAACTGTGGCAGGCGATGGACAGAGCGCATAGATTGGGACAGAAGAGAG 5794 |||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5990 ATCAGG----C-----G----A-----TGGACAGAGCGCATAGATTGGGACAGAAGAGAG 6031 Query 5795 TTGTAAATGTACACCGTCTGATAATGCGTGGCACACTTGAAGAGAAAGTGATGAGTCTCC 5854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6032 TTGTAAATGTACACCGTCTGATAATGCGTGGCACACTTGAAGAGAAAGTGATGAGTCTCC 6091 Query 5855 AAAGATTCAAAGTGTCGGTTGCCAATACAGTAATCAATGCTGAGAATGCAAGTATGAAGA 5914 ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 6092 AAAAATTCAAAGTGTCGGTTGCCAATACGGTAATCAATGCTGAGAATGCGAGTATGAAGA 6151 Query 5915 CAATGAACACTGATCAGTTGCTCGACTTATTTGCTTCAGCTGAAACTTCTAAAAAGGGTG 5974 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 6152 CAATGAACACTGATCAGTTGCTTGACTTGTTTGCTTCAGCTGAAACGTCTAAAAAGGGTG 6211 Query 5975 GTGCGTCTTCGAAGAATGGATCAGAGGAGAATGACCAGATTGCTGGAACTGGAAAAGGAC 6034 ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 6212 GTGGGTCTTCGAAGAAGGGATCAGAGGATAATGATCAGATTGCTGGAACTGGAAAAGGAA 6271 Query 6035 TGAAGGCAATTCTAGGAAACTTAGAAGAACTGTGGGATCAATCACAGTACACAGAAGAGT 6094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6272 TGAAGGCAATTCTAGGAAACTTAGAAGAACTGTGGGATCAATCACAGTACACAGAAGAGT 6331 Query 6095 ACAATCTTAGCCAGTTCTTAGCTAAGCTCAACGG 6128 |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 6332 ACAATCTTAGCCAGTTCTTAACTAAGCTCAACGG 6365 Score = 717 bits (388), Expect = 0.0 Identities = 410/421 (97%), Gaps = 0/421 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCACATCAACAATCTTCCCGACTCAATCGTCTCCTTACTTTGTTGGACACTGGTTCA 60 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 139 ATGGCACAGCAACAATCTTCCCGACTCAATCGTCTCCTTACTTTGTTGGACACTGGTTCA 198 Query 61 ACTCAAGCTACTCGGCTAACTGCAGCCAAGCAGATCGGGGATATTGCAAAGTCTCATCCT 120 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 199 ACACAAGCTACTCGGCTAACTGCAGCCAAGCAGATCGGGGATATTGCAAAGTCTCATCCT 258 Query 121 CAGGACTTGAGCTCTCTTCTGAGAAAGGTTTTGCATCACCTCCGTAGTAAAAAGTGGGAT 180 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 259 CAGGACTTGAGCTCTCTTTTGAGAAAGGTTTTGCATCACCTCCGTAGTAAAAAGTGGGAT 318 Query 181 ACGAGGGTTGCTGCTGCTCATGCTATTGGTGCCATTGTTTTGAATGTCAAACATCCTTCA 240 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 319 ACGAGGGTTGCTGCTGCTCATGCCATTGGTGCCATTGTTCTGAATGTCAAACATCCTTCA 378 Query 241 TTGAGTGAACTGTTAAATTCTTTAGCAACGAAGTTGGGTGAGGCCGGGATATCTGATAAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 379 TTGAGTGAACTGTTAAATTCTTTAGCAACGAAGTTGGGTGAGGCAGGGATATCTGATAAT 438 Query 301 GTAGATGAAGTGGTGGCTTTGCGCAATCTTCAGTCCAAGATTCTGGCAAATGCACCCTTT 360 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 439 GTAGATGAAGTGGTGGCTTTCCGCAATCTTCAGTCAAAGATTCTGGCAAATGCGCCCTTT 498 Query 361 AGAAGCTTTGAGATGAATAAGGTTTTAGAGTTTGGCGCTTTGTTGGCATCTGGTGGACAG 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 499 AGAAGCTTTGAGATGAATAAGGTTTTAGAGTTTGGCGCTTTGTTGGCTTCTGGTGGGCAG 558 Query 421 G 421 | Sbjct 559 G 559 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 306013913464 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5