BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg902294 Length=2484 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G42890.1 | Symbols: AML2, ML2 | MEI2-like 2 | chr2:17849819-... 4098 0.0 > AT2G42890.1 | Symbols: AML2, ML2 | MEI2-like 2 | chr2:17849819-17854553 FORWARD LENGTH=3138 Length=3138 Score = 4098 bits (2219), Expect = 0.0 Identities = 2403/2492 (96%), Gaps = 11/2492 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAGCTAGAACCCAAGAAATCACTATCTGCTGACATGCCATCTTTGCTGAGTAGATCA 60 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 ATGGAGCTAGAACCCAATAAATCACTATCTGCTGATATGCCATCTTTGCTGAGTAGATCA 357 Query 61 TCTGAAGCTTTTAATGGAGGCAGTGGATATCGTTCTGCAAGTGATCTCAGCATGTTCTCA 120 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 358 TCTGAAGCTTTTAATGGAGGCACTGGATATCGTTCTTCAAGTGATCTCAGCATGTTCTCA 417 Query 121 AGCTCATTGCCTACACTTTTTCATGAAAAGCTGAATATGACTGATTCAGATAGTTGGCTC 180 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 AGCTCATTGCCCACACTTTTTCATGAAAAGCTGAATATGACTGATTCAGATAGTTGGCTC 477 Query 181 TCCTTTGATGATAGCTCACCCAATCTGAACAAACTTGGCATAGGAAACTCAGAGAAGGAT 240 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct 478 TCCTTTGATGAAAGCTCACCCAATCTGAACAAACTTGTCATAGGAAACTCAGAGAAAGAT 537 Query 241 TCTTTGGAAGATGTTGAACCCGATTCTTTAGATATCTTGCTTCCTGAGGATGAAAATGAG 300 |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 538 TCTTTGGAAGATGTTGAACCCGATGCTTTAGAAATATTGCTGCCTGAGGATGAAAATGAG 597 Query 301 CTCCTTCCTGGCCTCATTGACGAACTTAATTTTACCGGGTTGCCTGATG-A---G--GAT 354 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | | ||| Sbjct 598 CTCCTTCCTGGCCTCATTGATGAGCTTAATTTTACCGGGTTGCCTGATGAACTTGACGAT 657 Query 355 CTTGAAGAGTGTGATGTCTTTTGCACAGGAGGGGGTATGGAGTTGGATGTTGAATCCCAA 414 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 CTCGAAGAGTGTGATGTCTTTTGCACGGGAGGGGGTATGGAGTTGGATGTTGAATCCCAA 717 Query 415 GATAATCATGCTGTTGATGCATCAGGGATGCAGATATCTGATCGCGGTGCTGCAAATGCA 474 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 GATAATCATGCTGTTGATGCGTCAGGGATGCAGATTTCTGATCGCGGTGCTGCAAATGCA 777 Query 475 TTTGTTCCTCGTAAACGTCCCAATACGGCTGGTAGAGTTTCAGTGGAACATCCGAACGGT 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 778 TTTGTTCCTCGTAAACGTCCCAATACGGCTGGTAGAGTTTCAGTGGAACATCCAAACGGT 837 Query 535 GAACATCCTTCAAGGACATTATTTGTGAGGAATATCAACAGCAGTGTTGAGGATTCTGAG 594 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 838 GAACATCCTTCAAGGACATTATTTGTTAGGAATATCAACAGCAGTGTCGAGGATTCTGAG 897 Query 595 TTAAGCGCCCTTTTTGAGCCGTTTGGGGAGATCAGAAGTTTGTATACTGCATGCAAAAGC 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 898 TTAAGCGCCCTTTTTGAGCCGTTTGGGGAGATCAGAAGTTTGTACACTGCATGTAAAAGC 957 Query 655 AGGGGTTTTGTAATGATATCCTACTACGATATTCGAGCTGCTCATGCCGCAATGCGTGCA 714 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 AGGGGGTTTGTTATGATATCCTACTACGATATTCGAGCTGCTCATGCCGCAATGCGTGCA 1017 Query 715 CTACAGAACACACTCTTAAGAAAAAGGACACTAGACATTCACTTTTCCATTCCTAAAGAA 774 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 CTACAGAACACACTTTTAAGAAAAAGGACACTGGACATTCACTTTTCCATTCCTAAAGAA 1077 Query 775 AATCCATCAGAGAAGGATATGAATCAAGGAACTCTTGTGATTTTTAATGTGGATACAACA 834 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1078 AATCCATCAGAGAAGGATATGAATCAAGGAACTCTTGTGATTTTTAATGTGGACACAACA 1137 Query 835 GTATCAAACGATGAGCTCCTTCAACT-TTTCGGTGCCTATGGTGAAATAAGAGAGATTAG 893 ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 GTATCGAATGATGAGCTCCTTCAGCTGTTT-GGTGCCTATGGTGAAATAAGAGAGATTAG 1196 Query 894 AGAAACCCCGAACAGACGATTTCACAGGTTCATTGAGTACTATGATGTTAGAGATGCAGA 953 ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 AGAAACCCCAAACAGGCGATTCCACAGGTTCATTGAGTACTATGATGTTAGAGATGCAGA 1256 Query 954 AACAGCCTTGAAAGCACTGAATAGAAGCGAGATAGGTGGAAAATGTATAAAGCTCGAACT 1013 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 GACAGCCTTGAAAGCACTGAATAGAAGCGAGATAGGTGGAAAATGTATAAAGCTCGAACT 1316 Query 1014 TAGTCGTCCTGGAGGGGCTCGTCGACTGTCGGTCCCGTCACAAAGTCAAGATTTGGACAG 1073 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1317 TAGTCGTCCTGGAGGGGCTCGTCGACTGTCGGTCCCGTCACAAAGTCAAGATTTGGAGAG 1376 Query 1074 AAACGAAGTTACAAATTTCTACAATCAAGTAGGTTCACATGTTGCTAATTCTCCACCAGG 1133 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1377 AACCGAAGTTACAAATTTCTACAATCAAGTAGGTTCACATGTTGCTAATTCTCCACCAGG 1436 Query 1134 TAACTGGCCAATTGGCAGCCCAGTGAAGGGCTCTCCTTCGCATGCCTTTACGAGGCCACA 1193 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 TAACTGGCCAATTGGTAGCCCAGTGAAGGGCTCTCCTTCGCATGCCTTTACGAGGCCACA 1496 Query 1194 TGGTCTAGGAATGGTCAGGCCAGTTAACTCAGATAATATGCCGGGACTGGCTTCTATTCT 1253 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 1497 TGGTCTAGGAATGGTCAGGCCAGTTAACTCAGACAATATGCCAGGACTGGCTTCAATTCT 1556 Query 1254 TCCTGCTCATCCCTCTAGCTTTCATGGATTTTCACCAGTCAGTAATGACCAAGGGCTATT 1313 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1557 TCCTGCTCATCCTTCTAGCTTTCATGGATTTTCACCAGTCAGTAATGACCAAGGGCTATT 1616 Query 1314 GAATCATCCAAACCAAACTATTCTGAATAAGGGATTGATGCACAATGTTGCCTATGGGCA 1373 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 1617 GAATCATTCAAACCAAACTATTCTGAATAAGGGATTGATGCACAACATTTCCTATGGGCA 1676 Query 1374 ACCTCATTCTTTGCCAGAGCATATAACAGGGGGAATTTCCAACTCCATGAGGTTTATAGC 1433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 ACCTCATTCTTTGCCAGAGCATATAACAGGGGGAATTTCCAACTCCATGAGGTTTATAGC 1736 Query 1434 TCCACACTCCTCAGGATTTGGGACTTCATCTGATCACCGCTATCGCTGGGGAAGCCCTCC 1493 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 TCCACACTCCTCAGGATTCGGGACTTCATCTGATCACCGCTATCGCTGGGGAAGCCCTCC 1796 Query 1494 TCAGCATATGAATTATCCTGGTTACACTGGAGTGTCGTCGTCATCGTCATCTACTGAACG 1553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1797 TCAGCATATGAATTATCCTGGTTACACTGGAGTGTCGTCGTCATCGTCATCTACTGAACG 1856 Query 1554 TCCTTTCACTGTCAGGCATGGTTTTCCATTTGCTGAGAGGCAAGCTTCATTGCTTGGAAA 1613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1857 TCCTTTCACTGTCAGGCATGGTTTTCCATTTGCTGAGAGGCAGGCTTCATTGCTTGGAAA 1916 Query 1614 ATACCAGCATCATGTAGGCTCTGCTCCCTCAAGCATTCATTTTAATACCCAAATGAATTG 1673 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1917 ATACCAGCATCATGTGGGCTCTGCTCCCTCAAGCATTCATTTTAATACACAAATGAATTG 1976 Query 1674 CTACCCGGGATCACCAGAGATACCCCTTGGATTTGGTGATATGGGAATCAACAGA---TA 1730 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 1977 CTACACGGGATCACCAGAGATACCCCTTGGATTTAGTGATATGGGAATCAACAGAAACTA 2036 Query 1731 TAACAATGCCCATGGAAAAGCAAACCTTGGTGTTAGTCTACCGGGAAACCGTAGTGAACA 1790 ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 2037 TAACAGTGCTCATGGAAAAGCAAACCTTGGTGTTAGTCTACCGGGGAACAGTAGTGAACA 2096 Query 1791 GAAATTCACTGGCTTTGGCATGTCTTCAATGCCTACAGTTCCTTTCGGTGGGAGTAGAGG 1850 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2097 GGATTTCACTGGCTTTGGCATGTCTTCAATGCCTACAGTTCCTTTCGGTGGGAGTAGAGG 2156 Query 1851 ATTACAATCAGTAAGGCCTGAACCTTTTGATGAGCAGGGTAGGATCCATAACCACGAGAC 1910 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2157 ATTACAATCAGTAAGGCCTGAACCTTTTGCTGAGCAGGGTAGGATACATAACCACGAGAG 2216 Query 1911 TCACAACCAGAATCAGTTCATAGATGGTGGGAGATATCATATTGACTTGGATAGGATTGC 1970 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2217 TCACAATCAGAATCAGTTCATAGATGGTGGGAGATATCATATCGACTTGGATAGGATTGC 2276 Query 1971 TAGTGGAGATGAAATCCGGACTACATTAATCATTAAAAACATCCCAAACAAGTACACTTA 2030 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2277 TAGTGGAGATGAAATCCGAACTACATTAATCATCAAAAACATCCCAAACAAGTACACTTA 2336 Query 2031 CAAGATGCTGGTGGCTGAAATCGACGAAAAGCACAAGGGAGACTATGACTTTCTATGCTT 2090 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2337 CAAGATGCTGGTGGCTGAAATCGACGAAAAGCACAAGGGAGACTATGACTTTCTATGCTT 2396 Query 2091 ACCGACAGACTTTAAGAATAAGTGCAACATGGGTCACGCTTTTATCAACTTGGTCTCTCC 2150 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2397 GCCGACAGACTTTAAGAATAAATGCAACATGGGTCACGCTTTTATCAACATGGTCTCTCC 2456 Query 2151 ATTGCACATCGTTCCCTTCCAACAGACTTTCAGTGGTAAAATATGGGAGAAATTCAACAG 2210 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2457 ATTGCACATCGTTCCCTTCCAACAGACTTTCAATGGTAAAATATGGGAGAAATTCAACAG 2516 Query 2211 TGGGAAAGTTGCTTCATTGGCATATGCAGAGATCCAAGGAAAGTCTGCTCTTGCGTCATA 2270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2517 TGGGAAAGTTGCTTCATTGGCATATGCAGAGATCCAAGGAAAGTCTGCCCTTGCGTCATA 2576 Query 2271 CATGCAGACTCCAAGTTCTATGAAGGAAGATAAGCAATTGTTTCCAGAAGTCTCCTACCA 2330 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2577 CATGCAGACTCCAAGTTCTATGAAGGAACAAAAGCAATTGTTTCCAGAAGTCTCCTACCA 2636 Query 2331 TGATGAGGGTCAAGACGCCAATGATCACGAGCAACTTTTTTCAAGCATTTGGAACATAAC 2390 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2637 TGATGATGGTCAAGACGCCAATGATCACGAGCAACTGTTTTCAAGCATTTGGAACATAAC 2696 Query 2391 CGCGCCTGATTCAGATTGGTCTTACACAATGGATCTTCTCGAAAGTACGAGGGAGAACGG 2450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| Sbjct 2697 CGCGCCTGATTCAGATTGGTCTTACACAATGGATCTTATCGAAAATCCGAGGGAGAACGG 2756 Query 2451 TAACTCCAAGAATCCTGCAGAAGAGTCCTCTT 2482 ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2757 TAACTCCAAGAATGCTGCAGAAGAGTCCTCTT 2788 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 123260178951 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5