BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg908375
Length=2574
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G68020.2 | Symbols: ATTPS6, TPS6 | UDP-Glycosyltransferase /... 4191 0.0
> AT1G68020.2 | Symbols: ATTPS6, TPS6 | UDP-Glycosyltransferase
/ trehalose-phosphatase family protein | chr1:25497290-25500374
FORWARD LENGTH=2919
Length=2919
Score = 4191 bits (2269), Expect = 0.0
Identities = 2480/2583 (96%), Gaps = 9/2583 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTTTCAAGATCATATTCGAATCTGTTGGAGTTAGCTTCAGGAGACTCACCAACGTTT 60
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 ATGGTTTCAAGATCGTATTCAAATCTGTTGGAGTTAGCTTCAGGAGACTCACCAACGTTT 263
Query 61 GGACGCATGAACCGACAAATCCCAAGAATCATGGCCGTTGCTGGAATCATGTCAAACATC 120
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 GGACGCATGAACCGACAAATCCCACGAATCATGGCCGTTGCTGGAATCATGTCAAACATC 323
Query 121 GATAATGACTCTAAAGAAACTGATCTGTCTCCTAAAGATCGTATCATCATTGTAGCTAAT 180
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 324 GATAATGACTCTAAAGACACTGATCTGTCTCCTAAAGATCGTATCATCATTGTAGCCAAT 383
Query 181 GAATTACCAATCCGAGCTCAGAGAA-GGCT-A--G--AGGGTAGT-G--GTAGTAGTACT 231
|||||||| || ||||||||||||| || | | | | |||||| | ||||||||| |
Sbjct 384 GAATTACCTATACGAGCTCAGAGAAGGGTTGATGGTAATGGTAGTGGTAGTAGTAGTAGT 443
Query 232 AGTACTTGTTGTAGCAAAGGTTGGAACTTTTCTTGGGATGAGAATTCACTTCTTCTTCAA 291
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 444 AGTACTTGTTGTAGCAAAGGTTGGAACTTTTCTTGGGATGAGAATTCACTTCTTCTCCAA 503
Query 292 TTGAAAGATGGGTTAGGAGATGAAGCTATTGAAGTTATCTATGTTGGTTGTTTGAAAGAA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 TTGAAAGATGGGTTAGGAGATGAAGCTATTGAAGTTATCTATGTTGGTTGTTTGAAAGAA 563
Query 352 GAGATTCCTCTTAATGAGCAAGAAGAAGTGTATCAGGTTCTTCTTGAGAGTTTCAAGTGT 411
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 GAGATTCCTCTTAATGAGCAAGAAGAAGTGTATCAGATTCTTCTTGAGAGTTTCAAGTGT 623
Query 412 GTGCCTACGTTCTTGCCTTTGGATTTGTATACTAGATACTACCATGGATTCTGTAAGCAA 471
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624 GTGCCTACGTTTTTGCCTTTGGATTTGTACACTAGATACTACCATGGATTCTGTAAGCAA 683
Query 472 CAGCTTTGGCCTTTGTTTCATTACATGTTGCCACTTTCTCCTGATCTTGGAGGTAGGTTT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 CAGCTTTGGCCTTTGTTTCATTACATGTTGCCACTTTCTCCTGATCTTGGAGGTAGGTTT 743
Query 532 GATAGGGCTCTCTGGCAAGCTTATGTCTCTGTGAACAAGATTTTTGCTGATAGGATTATG 591
|||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 744 GATAGGACTTTGTGGCAAGCTTATGTCTCTGTGAACAAGATTTTTGCTGATAGAATTATG 803
Query 592 GAAGTGATTAATCCTGAGGATGATTTTGTGTGGATACATGATTATCATTTGATGGTTTTG 651
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 GAGGTGATTAATCCTGAGGATGATTTTGTGTGGATACATGATTATCATTTGATGGTTTTG 863
Query 652 CCTACTTTCTTGAGGAAGAGGTTTAATAGGGTGAAGCTTGGTTTCTTCCTTCATAGTCCG 711
|||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 CCTACTTTCTTGAGGAAGAGGTTTAACAGAGTCAAGCTTGGTTTCTTCCTTCATAGTCCA 923
Query 712 TTTCCATCGTCTGAGATTTACAAAACTTTGCCTATTCGTGAGGAGCTTCTTCGGGCTTTG 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 924 TTTCCATCGTCTGAGATTTACAAAACTTTGCCTATTCGTGAAGAGCTTCTTCGGGCTTTG 983
Query 772 CTAAACTCGGATTTGATAGGGTTCCATACTTTTGACTACGCAAGGCATTTCTTGTCTTGT 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 984 CTAAACTCGGATTTGATAGGGTTCCATACTTTTGACTACGCTAGGCATTTCTTGTCTTGT 1043
Query 832 TGTAGTCGAATGCTCGGTCTTACTTATGAATCTAAGAGAGGATACATTGGACTTGAGTAT 891
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044 TGTAGTCGAATGCTTGGTCTTACTTATGAATCTAAGAGAGGATACATTGGACTTGAGTAT 1103
Query 892 TACGGTAGAACCGTGAGTATCAAAATTTTGCCTGTGGGAATTCATATGGGTCAGCTTCAG 951
|| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1104 TATGGTAGAACCGTGAGTATCAAAATTCTACCTGTTGGAATCCACATGGGTCAGCTTCAG 1163
Query 952 TCGGTTTTGAGCTTACCCGAGACTGAAAGGAAAGTCGGGGAGCTTATTGAGCGGTATGGT 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1164 TCGGTTTTGAGCTTACCCGAGACTGAAAGGAAAGTCGGGGAACTTATTGAACGGTATGGT 1223
Query 1012 CGAAAGGGCAGGACAATGCTGCTCGGTGTGGATGACATGGACATTTTTAAAGGGATAACC 1071
||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1224 CGAAAAGGCAGGACGATGCTGCTTGGTGTGGATGATATGGACATTTTCAAAGGGATTACT 1283
Query 1072 TTGAAGCTTTTGGCTATGGAGCAGCTGCTTATGCAACATCCTGAATGGCAAGGGAAGGTT 1131
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 TTAAAGCTGTTGGCTATGGAGCAGCTGCTTATGCAACATCCTGAATGGCAAGGGAAGGTT 1343
Query 1132 GTGTTGGTGCAGATAGCTAATCCGGCGAGAGGGAAAGGGAAAGATGTCAAAGAGATGCAA 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1344 GTGTTGGTGCAGATAGCTAATCCGGCGAGAGGGAAAGGGAAAGATGTTAAAGAGATGCAA 1403
Query 1192 GCTGAGACGGATTCAACTGTTAAGCGGATTAATGAGACGTTTGGGAGACCCGGATATGAT 1251
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1404 GCTGAGACGTATTCAACTGTTAAGCGGATTAATGAAACGTTTGGGAGACCCGGTTACGAT 1463
Query 1252 CCTATAGTATTGATTGATGCACCGTTGAAGTTCTATGAAAGGGTTGCTTATTACGTAGTA 1311
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464 CCTATAGTATTGATCGATGCACCGTTGAAGTTCTATGAAAGGGTTGCTTATTACGTAGTA 1523
Query 1312 GCTGAGTGTTGTTTGGTGACTGCGGTTAGGGATGGAATGAATCTTATACCTTACGAATAC 1371
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1524 GCTGAGTGTTGTTTGGTGACAGCGGTTAGGGATGGGATGAATCTTATACCTTATGAGTAC 1583
Query 1372 ATAGTTTCCCGTCAAGGAAATGAGAAGCTGGACAAAATTTTAAAGCTGGAGCCGAATAAT 1431
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||
Sbjct 1584 ATAGTTTCTCGTCAAGGAAATGAGAAACTGGACAAAATTCTGAAGCTGGAGGCGAATAAT 1643
Query 1432 CATAACAAGAAAAGCATGCTAGTGGTTTCTGAGTTTATTGGTTGCTCTCCGTCGCTAAGT 1491
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1644 CGTAACAAGAAAAGCATGCTGGTGGTTTCTGAGTTTATTGGTTGCTCTCCATCGCTAAGC 1703
Query 1492 GGAGCCATTCGTGTTAATCCCTGGAATGTTGATGCAGTAGCTGATGCAATGGATAGTGCC 1551
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 GGAGCCATTCGTGTTAATCCATGGAATGTTGATGCAGTAGCTGATGCAATGGATAGTGCC 1763
Query 1552 CTTGAAGTGGCTGAACCGGAGAAGCAGCTAAGGCATGAGAAGCATTACAAGTATGTGAGC 1611
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 CTTGAAGTAGCTGAACCGGAGAAGCAGCTAAGACATGAGAAGCATTACAAGTATGTGAGC 1823
Query 1612 ACACATGATGTTGGTTATTGGGCTCGTAGCTTCCTCCAAGATCTTGAGAGGAGTTGTGGT 1671
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 ACACATGATGTTGGCTATTGGGCTCGTAGCTTCCTCCAAGATCTTGAGAGGAGTTGTGGT 1883
Query 1672 GAACATGGACGAAGGAGGTGTTGGGGAATTGGGTTTGGTCTCAGTTTCAGAGTTGTGGCA 1731
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1884 GAGCATGGACGAAGGAGGTGTTGGGGAATTGGGTTTGGTCTCAGTTTCAGAGTTGTGGCA 1943
Query 1732 CTAGACCAGAGCTTCAGAAAGCTGTCAATGGAACACATAGTATCAGCTTATAAGAGGACA 1791
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944 CTAGACCAGAGCTTCAGGAAGCTGTCAATGGAACACATAGTATCAGCTTATAAGAGGACA 2003
Query 1792 AAGACACGGGCTATCCTTTTGGACTACGATGATACTTTAATGCCACAGGGCTCTATCGAT 1851
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2004 AAGACACGGGCTATCCTTTTAGACTATGATGATACTTTAATGCCACAAGGCTCGATCGAT 2063
Query 1852 AAAAGACCTTCATCGAAGTCAATCGACATCTTGAACACCTTGTGTAGGGACAAGGGCAAT 1911
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064 AAAAGGCCTTCATCGAAGTCAATCGACATATTGAACACCTTGTGTAGGGACAAGGGCAAT 2123
Query 1912 CTGGTGTTCATTGTTAGCGCCAAAAGCCGAGAAACTCTATCGGACTGGTTTAGTCCTTGT 1971
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2124 CTGGTGTTCATTGTTAGTGCTAAAAGCCGAGAAACTCTATCGGACTGGTTTAGTCCTTGT 2183
Query 1972 GAGAAGCTTGGAATTGCTGCGGAACATGGCTATTTTCTGAGGCTAAGGAAGGCAGTAGAA 2031
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2184 GAGAAGCTTGGTATTGCTGCTGAACATGGCTATTTTCTGAGGCTAAGGAAGGCAGTAGAG 2243
Query 2032 TGGGAAAACTGTGTGGCAGCAGCAGATTGTTCTTGGAAGCAAATTGCAGAGCCTGTGATG 2091
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2244 TGGGAAAACTGTGTGGCAGCAGTAGATTGTTCTTGGAAGCAAATTGCCGAGCCTGTGATG 2303
Query 2092 GAACTCTACACTGAGACAACCGATGGATCAACAATTGAAGACAAGGAGACTGCTCTTGTT 2151
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2304 GAACTCTACACCGAGACAACCGATGGCTCAACAATTGAAGACAAGGAGACTGCTCTTGTT 2363
Query 2152 TGGAGTTATGAGGATGCTGACCCTGATTTTGGCTCATGTCAAGCTAAGGAACTTCTAGAT 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364 TGGAGTTATGAGGATGCTGACCCTGATTTTGGCTCATGTCAAGCTAAGGAACTTCTAGAT 2423
Query 2212 CATCTTGAAAGTGTCCTTGCCAATGAACCTGTAACAGTCAAGCGAGGACAGAACTATGTT 2271
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2424 CATCTTGAAAGTGTCCTTGCCAATGAACCTGTAACAGTGAAACGAGGACAGAACTATGTT 2483
Query 2272 GAGGTCAAGCCACAGGGCGTGAGCAAAGGACTTATCGCCAGAAGGATGCTTTCGATGATG 2331
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 2484 GAGGTCAAGCCACAGGGCGTGAGCAAGGGACTTATAGCGAGAAGGATGCTTTCGATGATG 2543
Query 2332 CAAGAAAGAGGAACACTTCCTGAGTTTGTCCTATGTATTGGAGATGACCGATCTGATGAA 2391
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2544 CAAGAAAGAGGAACACTTCCTGAGTTTGTTCTATGTATTGGAGATGACCGGTCTGACGAA 2603
Query 2392 GACATGTTTGAGGTGATATGCAGTTCCACTGAAGGCCCTTCAATTGCCCCAAGAGCTGAG 2451
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2604 GACATGTTTGAGGTGATCTGCAGTTCCACTGAAGGCCCTTCGATTGCCCCAAGAGCTGAG 2663
Query 2452 ATTTTCGCTTGTACTGTCGGTCAAAAGCCTAGCAAGGCCAAGTATTACCTGGATGACACT 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664 ATTTTCGCTTGTACTGTCGGTCAAAAGCCTAGCAAGGCCAAGTATTACCTGGATGACACT 2723
Query 2512 ACTGAGATTGTCAGGTTAATGCATGGGTTAGCTTCTGTTACAGACCAGATCACTCCTGTT 2571
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 ACTGAGATTGTCAGGTTAATGCATGGTTTAGCTTCTGTTACAGACCAGATCACTCCTGTT 2783
Query 2572 TAA 2574
|||
Sbjct 2784 TAA 2786
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 127775203821
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5