BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg908972 Length=1473 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G73602.1 | Symbols: CPuORF32 | conserved peptide upstream op... 2444 0.0 AT1G73600.2 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent met... 2431 0.0 > AT1G73602.1 | Symbols: CPuORF32 | conserved peptide upstream open reading frame 32 | chr1:27670626-27673569 FORWARD LENGTH=1841 Length=1841 Score = 2444 bits (1323), Expect = 0.0 Identities = 1426/1476 (97%), Gaps = 6/1476 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCTGT-GTATGGCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCACTCTGT 59 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 200 ATGGCT-TCGTATGGCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCATTCAGT 258 Query 60 GGGATTGAGTGTAGAGGCCATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGA 119 |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 259 GGGATTGAGTGTTGAAGCTATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGA 318 Query 120 ACGTCCTGAGATACTTGCGCTTCTTCCACCGATTGAAGGGAAAACAGTGCTAGAGTTTGG 179 ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 319 ACGTCCTGAGATACTTGCGTTTCTTCCACCTATTGAAGGGACAACAGTGCTAGAGTTTGG 378 Query 180 TGCTGGAATTGGTCGTTTCACTACT-AATTTAGCTCACAAGGCTGGCCAGCTCATTGCGG 238 |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||| Sbjct 379 TGCTGGAATTGGTCGTTTTACTACTGAA-TTAGCTCAGAAGGCCGGCCAGGTCATTGCGG 437 Query 239 TTGACTTCATTGAAAGTGTTATCAAAAAGAATCAAAACATTAACGGGCACTACAAGAACG 298 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 438 TTGACTTCATTGAAAGTGTTATCAAAAAGAATGAGAACATTAACGGTCACTACAAGAACG 497 Query 299 TCAAATTTCTGTGCGCTGATGTCACATCGCCAAATATGAACTTTCTAAACGAGTCTATGG 358 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 498 TCAAATTTCTGTGCGCTGATGTCACATCACCAAATATGAACTTTCCAAATGAGTCTATGG 557 Query 359 ATCTGATATTCTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGAT-AGAGAGGTTGAAGATTTG 417 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 558 ATCTGATATTCTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGATCA-AGAGGTTGAAGATTTG 616 Query 418 GCGAAAAAGATGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGT 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 617 GCGAAAAAGATGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGT 676 Query 478 TTCCATCAGTCTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAA 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 677 TTCCATCAGTCTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAA 736 Query 538 TTTTACACAAAGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAA 597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 737 TTTTACACAAAGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAA 796 Query 598 CTCTCTTTGGTTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAAC 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 797 CTCTCTTTGGTTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAAC 856 Query 658 CAGATATGCTGGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTC 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 857 CAGATATGCTGGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTC 916 Query 718 TTGGACAATGTCCAGTATAAGTCAAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTATTTGGAGAA 777 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 917 TTGGACAATGTCCAGTATAAGTCTAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTCTTTGGAGAA 976 Query 778 GGCTTTGTTAGCACAGGGGGACTCGAGACAACGAAGGAATTTGTGGATATGCTTGATCTG 837 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 977 GGGTTTGTTAGCACAGGGGGACTCGAGACAACAAAGGAATTCGTGGATATGCTGGATCTG 1036 Query 838 AAACCTGGCCAGAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATG 897 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1037 AAACCTGGCCAAAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATG 1096 Query 898 GCTGAGAACTTTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTT 957 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1097 GCTGAGAACTTTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTT 1156 Query 958 GCGCTTGAACATGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACC 1017 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1157 GCGCTTGAACACGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACC 1216 Query 1018 AAAAAGGAGTATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTACAGCAGAGACACCATTCTGCAT 1077 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 1217 AAGAAGGAGTATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTATAGCAGAGACACCATTCTACAT 1276 Query 1078 ATCCAAGACAAGCCAGCATTGTTCAGAACATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAA 1137 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1277 ATCCAAGACAAGCCAGCATTGTTCAGAAGATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAA 1336 Query 1138 GTTCTCATCACTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTTCAGACTTTGCAAACTAT 1197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 1337 GTTCTCATCACTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTCCAGACTTTGCAATCTAC 1396 Query 1198 ATCAAGCAACGAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGAC 1257 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1397 ATCAAGAAACGAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGAT 1456 Query 1258 GCTGGATTCGAAGAGGTAACCACAGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAA 1317 ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1457 GCTGGTTTCGAGGAGGTAATCGCGGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAA 1516 Query 1318 CGGGAACTGGATGCAGTAGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGCGACTTCTCGGAAGAG 1377 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 1517 CGGGAACTGGATGCAGTGGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGTGACTTCTCGAAAGAG 1576 Query 1378 GATTACGAGGATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAG 1437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1577 GATTACGAGGATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAG 1636 Query 1438 CAGAAGTGGGGTTTGTTCATCGCCAAGAGAAATTGA 1473 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1637 CAGAAGTGGGGTTTGTTCATCGCCAAGAGAAACTGA 1672 > AT1G73600.2 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | chr1:27669152-27673572 FORWARD LENGTH=1759 Length=1759 Score = 2431 bits (1316), Expect = 0.0 Identities = 1417/1466 (97%), Gaps = 5/1466 (0%) Strand=Plus/Plus Query 10 TATGGCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCACTCTGTGGGATTGAGT 69 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 125 TAT-GCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCATTCAGTGGGATTGAGT 183 Query 70 GTAGAGGCCATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGAACGTCCTGAG 129 || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 184 GTTGAAGCTATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGAACGTCCTGAG 243 Query 130 ATACTTGCGCTTCTTCCACCGATTGAAGGGAAAACAGTGCTAGAGTTTGGTGCTGGAATT 189 ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 244 ATACTTGCGTTTCTTCCACCTATTGAAGGGACAACAGTGCTAGAGTTTGGTGCTGGAATT 303 Query 190 GGTCGTTTCACTACT-AATTTAGCTCACAAGGCTGGCCAGCTCATTGCGGTTGACTTCAT 248 |||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 304 GGTCGTTTTACTACTGAA-TTAGCTCAGAAGGCCGGCCAGGTCATTGCGGTTGACTTCAT 362 Query 249 TGAAAGTGTTATCAAAAAGAATCAAAACATTAACGGGCACTACAAGAACGTCAAATTTCT 308 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 363 TGAAAGTGTTATCAAAAAGAATGAGAACATTAACGGTCACTACAAGAACGTCAAATTTCT 422 Query 309 GTGCGCTGATGTCACATCGCCAAATATGAACTTTCTAAACGAGTCTATGGATCTGATATT 368 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 423 GTGCGCTGATGTCACATCACCAAATATGAACTTTCCAAATGAGTCTATGGATCTGATATT 482 Query 369 CTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGAT-AGAGAGGTTGAAGATTTGGCGAAAAAGA 427 ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 483 CTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGATCA-AGAGGTTGAAGATTTGGCGAAAAAGA 541 Query 428 TGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGTTTCCATCAGT 487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 542 TGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGTTTCCATCAGT 601 Query 488 CTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAATTTTACACAA 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 602 CTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAATTTTACACAA 661 Query 548 AGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAACTCTCTTTGG 607 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 662 AGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAACTCTCTTTGG 721 Query 608 TTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAACCAGATATGCT 667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 722 TTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAACCAGATATGCT 781 Query 668 GGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTCTTGGACAATG 727 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 782 GGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTCTTGGACAATG 841 Query 728 TCCAGTATAAGTCAAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTATTTGGAGAAGGCTTTGTTA 787 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 842 TCCAGTATAAGTCTAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTCTTTGGAGAAGGGTTTGTTA 901 Query 788 GCACAGGGGGACTCGAGACAACGAAGGAATTTGTGGATATGCTTGATCTGAAACCTGGCC 847 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 902 GCACAGGGGGACTCGAGACAACAAAGGAATTCGTGGATATGCTGGATCTGAAACCTGGCC 961 Query 848 AGAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATGGCTGAGAACT 907 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 962 AAAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATGGCTGAGAACT 1021 Query 908 TTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTTGCGCTTGAAC 967 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1022 TTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTTGCGCTTGAAC 1081 Query 968 ATGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACCAAAAAGGAGT 1027 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1082 ACGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACCAAGAAGGAGT 1141 Query 1028 ATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTACAGCAGAGACACCATTCTGCATATCCAAGACA 1087 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1142 ATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTATAGCAGAGACACCATTCTACATATCCAAGACA 1201 Query 1088 AGCCAGCATTGTTCAGAACATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAAGTTCTCATCA 1147 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1202 AGCCAGCATTGTTCAGAAGATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAAGTTCTCATCA 1261 Query 1148 CTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTTCAGACTTTGCAAACTATATCAAGCAAC 1207 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| Sbjct 1262 CTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTCCAGACTTTGCAATCTACATCAAGAAAC 1321 Query 1208 GAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGACGCTGGATTCG 1267 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 1322 GAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGATGCTGGTTTCG 1381 Query 1268 AAGAGGTAACCACAGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAACGGGAACTGG 1327 | ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1382 AGGAGGTAATCGCGGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAACGGGAACTGG 1441 Query 1328 ATGCAGTAGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGCGACTTCTCGGAAGAGGATTACGAGG 1387 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1442 ATGCAGTGGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGTGACTTCTCGAAAGAGGATTACGAGG 1501 Query 1388 ATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAGCAGAAGTGGG 1447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1502 ATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAGCAGAAGTGGG 1561 Query 1448 GTTTGTTCATCGCCAAGAGAAATTGA 1473 |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1562 GTTTGTTCATCGCCAAGAGAAACTGA 1587 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 72640188615 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5