BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg909961 Length=3864 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G02990.3 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unkn... 6191 0.0 > AT1G02990.3 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CW-type Zinc Finger (TAIR:AT3G62900.1). | chr1:681396-687315 REVERSE LENGTH=4379 Length=4379 Score = 6191 bits (3352), Expect = 0.0 Identities = 3706/3872 (96%), Gaps = 43/3872 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGATTTTGGTGAGTAGTAGCGATGCTAGAAGCGAATTAGGGTTAGGGTTTGGTGGATTA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 215 ATGATTTTGGTGAGTAGTAGCGATGCTAGAAGCGAATTAGGGTTAGGGTTTGGTGGATTA 274 Query 61 GGTGAAGAAATCATGCAAGATTGTGACTTTGAGGAAGAAAGCACACATTCTTATGTTTCT 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 275 GGTGAAGAAATCATGCAAGATTGTGACTTTGAGGAAGAAAGTACACATTCTTATGTTTCT 334 Query 121 TGCGTTGACCCAGATGTTGCTCTCTCTTATATCGATGAGAAACTTGAAAACGTCTTGGGA 180 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 335 TGCGTTGACCCAGATGTTGCTCTCTCTTACATTGATGAGAAACTCGAAAACGTCTTGGGA 394 Query 181 CATTTTCAGAAAGATTTTGAAGGTGGAGTTTCAGCTGAAAATTTGGGTGCAAAGTTTGGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 395 CATTTTCAGAAAGATTTTGAAGGTGGAGTTTCTGCTGAAAATTTGGGTGCAAAGTTTGGT 454 Query 241 GGCTATGGTTCCTTTTTGTCTATGTATCAGAGATCTCCTGTTTCTTCACGTCCTAAGACT 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 455 GGCTATGGTTCCTTTTTGTCTATGTATCAGAGATCTCCTGTTTGTTCACGTCCTAAGACT 514 Query 301 CCACCAGATGTTCAACAAAACCAATTGGGGGGTCGATCTAATTGCTCAGCTTCATCACTT 360 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515 TCACCAGAAGTTCAACAAAACCAATTGGGTGGTCGATCTAATTGCTCAGCTTCATCACTA 574 Query 361 GTACCTCAACTATCAATATCCGGATCCTCTTCGAAACCTCCTGCCTCTGATGTTTTCGTC 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 575 GTACCTCAACTATCAATATCCGGATCCGCTTCAAAACCTCCTGCTTCTGATGTTTTGGTC 634 Query 421 AAATTAAAAAAGTTCGTCAAATCAAGTAATATAGGGACACCTGATAGCAAACAAAAACCT 480 |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct 635 AAATTAAACAAGTTTGTCAAATCAAGTCATATAGGGACACCTGATAGCAAACACATGTCT 694 Query 481 GACACAAAAATTTCTTCTTCTGCTCCATCAAATCATAAGACTCTCAGACTTCGTATAAAA 540 ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 695 GACGCAAAAACTTCTTCTTCTGCTCCATCAAATCATAAGACTCTCAGGTTTCGTATAAAA 754 Query 541 GTTGGTTCGAGTGACCTCTCTTCACTCAAAAACGTTTCTACCTATACTAAAGAAGGCCTC 600 |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 755 GTTGGTTCAAGTGACCTCTCGTCACTCAAAAACGTTTCTACCTTTACTAAAGAAGGCCTC 814 Query 601 AATATGCTACCATCAGCATCGCGGGTGAATTGCCTTTCAGAAGTTGAACAAGACTTACTG 660 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 815 AATATGCTACCATCAGCATCGCGGGTGAATTGCCTCTCAGAAGTTGAACAAGATTTACTG 874 Query 661 AATGGGATTTGTGATTCACCGACTAAAATTCTTATGGCTATGGTGTCATTCCCTTTGCAT 720 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 875 AATGGGATTTGTGATTCGCCCACTAAAATTCTTATGGCTATGGTGTCATTCCCTTTGCAT 934 Query 721 AAAGATCAGCTGTTATCACCTCTCTCTGATGATCTTATTTTGTTGGGATCGAAAGAAAAG 780 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 935 AAAGATCAGCTGTTATCACCTCTCTCTGATGATCTTATTCAGTTGGGATCGAAAGAAAAG 994 Query 781 ATTTTCAAAGATGCTGGATATGGTTCTGCAAACAAGTCGGACT-CAAAAAGTACACCCGA 839 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| Sbjct 995 ATTTTGAAAGATGCTGGATATGGTTCTACAAACAAGACGGA-TGCAAAAAGTACACCCGA 1053 Query 840 TGATTTGGTTGTTTCTGATTCACAAAAGCGTGCTGGTAAGTTTTCC-ATTGGGAAGAAGG 898 || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 1054 TGGTTTAGTTGTTTCTGATTCACAAAAGCGTGCTGGTAAG-TTTCCTATTGGGAAGAAGG 1112 Query 899 AAAAGTTAAGGGATAGGGTAAAGTATAGGCCACCGTCAAACAAGCGTGACAGAAATCATA 958 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1113 AAAAGTTAAGGGATAGGGTAAAGTATAGGCCACCGTCAAACAAGCTTGACAGAAATCATA 1172 Query 959 CTGTATCCAATACTGAAAAAGAGGCTGACAAAGAGTCCTGCGAGGAGCTTGTTTCCAAGA 1018 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1173 CCGTATCCAATACTGAAAAAGAGGCTGACAAAGAGTCCTGTGAGGAGCTTGTTTCCAAGA 1232 Query 1019 CTATGAAGCTTCCACTTTTATCCTGTCTATCACCGTCATATATCCACCCAGCAAAAGAGA 1078 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1233 CTATGAAGCTTCCACTTTTATCCTGTCTATCACCTTCATATATCCACCCGGCAAAAGAGA 1292 Query 1079 TTGATAAAGTATCAGATTCTAATGTGGAG-GTTATATCAAGAGGAACGAACAAAGATGCA 1137 ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1293 TTGATAACGTATCAGATTCTAATGTGGAGAG-TATATTAAGAGGAACGAACAAAGATGCA 1351 Query 1138 GCTTTGATGGGTTCAAAGCCGGAACTAGAAGATAATGTAGTGGCATTTTCAGATCGAAGC 1197 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1352 GCTTTGATGGGTTCAAAGCCGGAACTAGAAGATAATGTAGTGGCATTTTCAGATCGAAGT 1411 Query 1198 GTTAAGGAAACTGAAAGTATTAACGTAAGAAAAGACGTTTACCTGATAAAAGGTGAACCT 1257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1412 GTTAAGGAAACTGAAAGTATTAACGTAAGAAAAGACGTGTACCTGATAAAAGGTGAACCT 1471 Query 1258 CTAAACTCATTGGAAAGTAATTCCAAGAGGGAGAAAGCTCCAAGTATTGAACATGTAGAT 1317 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1472 CTAAACTCATTGGAAAGTAATCCCAAGCGGGAGAAAGCTCCAAGTATTGAACATGTAGAT 1531 Query 1318 TATTCTTCTGTGGTTAAGGGTAGTCAGAGTGAGACAAGGAATGAAGAGCAAATTTTAAAG 1377 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1532 TATTCTTCTGTGGTTAAGGGTACTCAGAGTGAGACAAGGAATGAAGAGCAAATTTTAAAG 1591 Query 1378 TCAAAACTGCCTAAAGCACAGAAGTCACAAAAAAGTTCAAGCTCCATTGTTTCCATGAAT 1437 |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1592 TCAAAACTGCCTAAAGTACAGAGGTCACAAAAAGGTTCAAGCTCCATTGTTACCATGAAT 1651 Query 1438 AGTCTGAGAGGCAAGGACGCGGCTGTAAATATAATTAAGAAGAATGTACCAGATAAATTG 1497 |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1652 AGTCAGAGAGGCAAGGACGCTGCTGTAAATATAATTAAGAAGAATGTACCAGATAAATTG 1711 Query 1498 CAGGAAGATATTGGAGAATCCGAACACATGTATAAGGGATTCTTTGGTGATTCGAAAGAA 1557 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1712 CAGGAAGATATTGAAGAATCCGAACACATGTGTAAGGGATTCTTTGGTGATTCGAAAGAA 1771 Query 1558 TCaaaagaagaaaaacaaagtagt-ccgatacttaaagctgaaaaagcaaagctttcaga 1616 ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct 1772 TCAAAAGAAGAAAAACAAATTAGTCCCG-TACTTAAAGCTGAGAAAGAAAAGCTTTCAGA 1830 Query 1617 agaaaaTGCATTGGAG-GAGAGTTTCAACAGTGTTAAAAATGATGAAGAGGCTTGTGACC 1675 |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1831 AGAAAATGCATTGG-GCGAGAGTTTCAACAGTGTTAAAAATGATGAAGAGGCTTGTGATC 1889 Query 1676 ATCTAAATTTGGTATGTGAACCTGATTTGAAACACCTTATTAAGCCGAGTGACTTGAATG 1735 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1890 ATCTAAATTTGGTATGTGAACCTGATTTGAAACACCTTATTAAGCCGAGTGACTTGAATG 1949 Query 1736 AAGATAGGCACACCACTAAGCAGAGTGTTAGACGGGAAGTGAAAAATAAGCATTCTCTTG 1795 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1950 AAGATAGGCACACCACCAAGCAGAGTGTTAGACGGGAAGTGAAAAATAAGCATTCTCTTG 2009 Query 1796 AAGGAGGAATGGAGAATATGGGAATGGAATCTGAAAGGGAACTTTCTGGGGTTTCTAAGA 1855 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2010 AAGGAGGAATGGAGAATATGGGAATGGAATCTGAAAGGGAACTTTCTGGGGTTTCTAAGA 2069 Query 1856 AACCAAAGACTGGAAAATCACGATTTTCCACTTTAGATCAACCTGGATCCAACAAATCCA 1915 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2070 AACCAAAGACTGGAAAATCACGATTTTCCGCTGTAGATCAACCTGGATCCAACAAATCCA 2129 Query 1916 ACCAAATTCTGGACGTTTTAGATACTAACAAAACTATGATTACTCAAGCCTCAGCCGAAA 1975 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2130 ACCAAATTCTGGAAGTTTTAGATACTAACAAAACTATGATTACTCAAGCCTTAGCCGAAA 2189 Query 1976 ATGTCAAGGATTTTGCTAAGGCTTCCTCGCATGGCGAACGTGATGACAGAAAGAGGAAAC 2035 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2190 ATGTCAAGGATTTTGCTAAGGCTTCCTCGCATGGCGAACGTGATGACAGAAAGAGGAAAC 2249 Query 2036 TGAAGGAAAATGAAGAAAGTGGAGATTGTATGAGACCTAGAGAAGCTGCAGTAATAGAGT 2095 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | Sbjct 2250 TGAAGGAAAATGAGGAAAGTGGAGATTGTATGAGACTTAGAGAAGCTGCAGTAATGGAAT 2309 Query 2096 CAAGTGGAGAGAACGTTAGAAAAAGTAAGAGGCTTAAAGGTTCAAGTTGTGATGAAAAAG 2155 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2310 CAAGTGGAGAGAACGTTAGAAAGAGAAAGAGGCTTAAAGGTTCAAGTTGTGATGAAAAAG 2369 Query 2156 AGTTGCCTTTTAGTAGTGAAAGCTGTGATAAGGAAAGAAGAGTTAGTCAAGAAAATGGTA 2215 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2370 AGTTGCCTTTTAGTAGTGAAAGCTGTGATAAGGAAAGAAGTGTTAGTCAAGAAAATGGTA 2429 Query 2216 GAGATTGTGCTTCCCATCTACCTTTTATAGC-GTCCTCTCCGATTTTGTGTAAGGATTTG 2274 ||||| ||||||| |||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2430 GAGATAGTGCTTCTCATCTACCTTCTACA-CTGTCCTCTCCGAGTTTGTGTAAGGATTTG 2488 Query 2275 GGCTCTGAAATTATCAAAAATAATGTCTGCGAA-GCCAAAGGTTCACTAGTTGAATCAGT 2333 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2489 GGCTCTGAAATTATCAAAAATAATGTCCGCGAAAGT-AAAGGTTCACTAGTTGAATCAGT 2547 Query 2334 TGCCCCTTCGGCCTTGAGAGTGTTAGACTCAGGTGAGCTTAAATCAGGAAGAATTTCAGA 2393 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2548 TGCCCCTTTGGCCTTGAGAGTGTTAGACTCAGGTGAGCTTAAATCAGGAAGAATTTCAGA 2607 Query 2394 GAGGGATGAATACCATGATGCTGATTCTAATACTGGTGATACGTTAAAAAGATGCCGAGA 2453 |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2608 AAGGGATGAGTACCATGATACTGATTATAATGCTGGTGAGACGTTAAAAAGATGCCGAGA 2667 Query 2454 TGGTGAGGCTTATAGCACTATCGATAGACCAGGGACAACAAAGAAGGCTGCAGAAAATTC 2513 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2668 TGGTGAGGCTTATAGTACTATCGATAGACCAGGGACAACAAAGAAGGCTGCAGAAGATTC 2727 Query 2514 CAAGGATAGAGAAAGAGCATATGGTGAAGATTGTTCAATTGAAAACTTTAAACCAAAGAA 2573 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2728 CAAGGATAGAGAAAGAGCATATGGGGAGGATTGTTCAATTGAAAACTTAAAACCAAAGAA 2787 Query 2574 GTCAGGGAGATGTCCTGGTGAAAATTGCATAGAGGGTGGCTCTAAGCAAAAGAGTAGGGA 2633 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct 2788 GTCAGGGAGATATCCTGGTGAAAATTGCATAGAGGGTGACTCTAAGCAAAAGAGTAGAGA 2847 Query 2634 AGAGGGGTCATCTGCACCTTCGAAAGAGAATAACTGGGGTCTGGTGAATGACGTGCAAGA 2693 ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2848 AGAGGAGTCATCTGCACCTTCGAAAGATAATAACTGGGGTCTGGTGAATAACGTGCAAGA 2907 Query 2694 TCTTGGCACTGCTGTTaaagtaaaaagaaaagaaagcaggagcaagaaaagacctgctag 2753 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2908 TCTTGGCACTGCTGTTAAAGTAAAAACAAAAGAAAGCAGGAGCAAGAAAAGACCTGCTAG 2967 Query 2754 aaaagTGTCTTTGGAGAGTAATAAAGAAGACTCAAGGGAATATCAAGATCCTAATACTAA 2813 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2968 AAAAGTGTCTATGGAGTGTAATAAAGAAGACTCAAGGGAATATCAAGATCCTAATACTAA 3027 Query 2814 GCTAGATAGAAGTAGTAGTCATTTTTCTTCTCGACAGAAACCTGATACAGCAAACACTTC 2873 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3028 GCTAGATAGAAGTGGTAGTCATTTTTCTTCTCGACAGAAACCTGATACAGCAAACACTTC 3087 Query 2874 TCGTGGGAAAAGCAACCCATTGGAAGTGACCACTGAGAAATTAAAGAATAAATCAGCTTC 2933 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3088 TCGTGGGAAAAGCAACCCATTGGAAGTGACCACTGAGCAATTAAAGAATAAATCAGCTTC 3147 Query 2934 ACCAGCTGGCACAGATCAGGTTGAAGTCTTGGGTCACGGCACTGAGATATCAAATACAAA 2993 ||||||| || || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3148 ACCAGCT--CA-AG-T----T-GAAGTCTTGGGTCACGACACTGAGATATCAAATACAAA 3198 Query 2994 GAAACAGAGACTGCGGAATGATAATCACAGTGTGACCCACGATGAAGGTTCGCGAAACCA 3053 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3199 GAAACAGAGACTGCGGAATGATAATCACAGTGTGACCCACGATGAAGGTTCGCGAAACCA 3258 Query 3054 AAAGCAAAATGGAAGTAGGCATAAGGATCATGTTGGCTTAAGCCCTTTGAAAAAGGAATC 3113 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3259 AAAGCAAAATGGAAGTAGGCATAAGGATCATGTTGGCTTAAGCCCTTTCAAAAAGGAATC 3318 Query 3114 CACGAGTCAGACTGCCTCCAACTCAATCAAAGAGGCTACAGACTTGAAACACATGGCTGA 3173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3319 CACGAGTCAGACTGCCTCCAACTCAATCAAAGAGGCTACAGACTTGAAACACATGGCTGA 3378 Query 3174 TCGTCTTAAGAATGCTGTGTCCAATCACGAGAGCACAGGTGTTTACTTTCAGGCAGCTCT 3233 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3379 TCGTCTTAAGAATGCTGTGTCCAATCACGAGAGCACAGGTGTTTACTTTCAGGCAGCGCT 3438 Query 3234 TAAGTTTCTTCATGGTGCCTCCCTTTTGGAGTCATCTGGCATTGATAATGCTACACATAA 3293 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3439 TAAGTTTCTTCATGGTGCCTCCCTTTTGGAGTCATCTGGCA---------C--------- 3480 Query 3294 GACCATTGCCAGATCCAAGGATATTTATGGCAGCACAGCAAAACTTTGCGAGTTCTGTGC 3353 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3481 GACCATTGCCAGATCCAAGGATATTTACGGCAGCACAGCCAAACTTTGCGAGTTCTGTGC 3540 Query 3354 TCATGAATACGAGAAAAATAAAGATATGGGGGCTGCTGCTCTGGCTTATAAATGTATGGA 3413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3541 TCATGAATACGAGAAAAATAAAGATATGGGGGCTGCTGCTCTGGCTTATAAATGTATGGA 3600 Query 3414 AGTAGCTTATCTAAGGATAACTTATACCTCCCATGGTAACATAAGAAGATACAGATATGA 3473 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3601 AGTAGCTTATCTAAGGATAACATATACCTCCCATGGTAACATAAGAAGATGCAGATATGA 3660 Query 3474 GTTGCAAGCAGCTTTGCAAGTGATTCCTTCAGGTGAATCTCCTTCCTTTGCTTCTGATGG 3533 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3661 GTTGCAAGCAGCTTTGCAAGTGATTCCTTCAGGTGAATCTCCTTCCTTTGCTTCTGATGG 3720 Query 3534 TGAAAATTCAAACCACACATTGGCAGCGGAAAAGTTTGCTTTGTCCAACAATGTGAGATC 3593 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3721 TGAAAATTCAAACCACACATTAACAGCGGAAAAGTTTGCTTTGTCCAACACTGTGAGATC 3780 Query 3594 ATCCCCTAGCGTAACCGGAAACCATGTTATCTCTTCAGGAAACAATTCCTCTCTTTCACA 3653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3781 ATCCCCTAGCGTAACCGGAAACCATGTTATCTCTTCAGGAAACAATTCCTCTCTTTCACA 3840 Query 3654 GCTTTTGGCATTTTCGCAAAACGTAAGCT-CTGCTATGGATGCGTCAAGAAAAGCGCAGA 3712 |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 3841 GCTTTTGGCATTTTCGAAAAACGTAAACTAC-GCTATGGAAGCATCAAGAAAAGCGCAGA 3899 Query 3713 TTGCATTAGCAGCTGCAAAGGGAAAATCGTATGAAACCAGATACAGTAGTGATGGTATAA 3772 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct 3900 TTGCATTAGCAGCTGCAAAGGGAAAATCGTTTGAAACGAGATACAGTAGTAATGGTATAA 3959 Query 3773 CATGCATCAAAAGGGCTCTTGACTTGAATTTTCAGGACATGGAGAAACTGTTGCATGTGG 3832 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3960 CATGCATCAAAAGGGCTCTTGACTTCAATTTTCAGGACATGGAGAAACTGTTGCATGTGG 4019 Query 3833 TGAGGCTTGCAATGGAATCCATAAACCGGTGA 3864 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4020 TGAGGCTTGCAATGGAATCCATAAACCGGTGA 4051 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 192490560291 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5