BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg912744 Length=2400 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G29400.1 | Symbols: AML5, ML5 | MEI2-like protein 5 | chr1:1... 3936 0.0 > AT1G29400.1 | Symbols: AML5, ML5 | MEI2-like protein 5 | chr1:10290040-10294478 REVERSE LENGTH=2880 Length=2880 Score = 3936 bits (2131), Expect = 0.0 Identities = 2313/2403 (96%), Gaps = 3/2403 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGATATTCCACATGAAGCAGAAGCTGGAGCTTGGGGGATTCTCCCTGGATTTGGTCGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 125 ATGGATATTCCACATGAAGCAGAAGCTGGAGCTTGGGGGATTCTCCCTGGTTTTGGTCGT 184 Query 61 CACCATCATCCCTCCAGTGATGCTACTTTGTTCTCCAGTTCTTTACCTGTTTTTCCCCGT 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 185 CACCATCATCCCTCCAGTGATGCTACTTTGTTCTCCAGTTCTTTACCTGTTTTCCCCCGT 244 Query 121 GGAAAACTGCAATTGAGTGATAACAGAGATGGTTTCTCACTGATAGATGATACGGCTGTT 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 245 GGAAAACTGCAATTGAGTGATAACAGAGATGGTTTCTCACTGATAGACGATACGGCTGTT 304 Query 181 TCTCGCCCAAACAAGTTTAACGAAAGTGCTGATGACTTTGAATCTCATTCCATTGGAAAC 240 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 305 TCTCGCACAAACAAGTTTAACGAAAGTGCTGATGACTTTGAATCTCATTCCATTGGAAAC 364 Query 241 CTGCTCCCTGATGAAGAGGATCTTTTGACTGGGATGATGGATGATCTTGACCTGGGCGAC 300 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 365 CTGCTCCCTGATGAAGAGGATCTTTTGACAGGGATGATGGATGATCTTGACCTGGGGGAG 424 Query 301 TTACCAGATGCTGATGATTATGATCTTTTTGGTAGTGGAGGAGGAATGGAACTTGACACT 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 425 TTACCAGATGCTGATGATTATGATCTTTTTGGTAGTGGAGGAGGAATGGAACTTGACGCT 484 Query 361 GATTTTCGAGACAACTTGAGCATGAGTGGTCCTCCAAGGTTATCCCTTTCAAGTCTTGGT 420 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 485 GATTTTCGAGACAACTTGAGTATGAGTGGTCCTCCAAGGCTATCACTTTCAAGTCTTGGT 544 Query 421 GGAAATGCGATTCCGCAATTCAATATTCCAAATGGTGCGGGAACAGTTGCTGGTGAGCAT 480 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 545 GGAAATGCAATTCCGCAATTCAATATTCCAAATGGTGCAGGAACAGTTGCTGGTGAGCAT 604 Query 481 CCTTATGGTGAACATCCCTCGAGAACTTTGTTTGTCCGGAATATTAACAGCAATGTAGAG 540 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 605 CCTTATGGTGAACATCCCTCGAGAACATTGTTTGTCCGGAATATTAACAGCAATGTAGAA 664 Query 541 GACTCTGAACTCACAGCTCTCTTTGAGCAATACGGTGACATTAGAACGCTCTATACTACT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 665 GACTCTGAACTCACAGCTCTCTTTGAGCAATACGGTGATATTAGAACGCTCTATACCACT 724 Query 601 TGTAAGCATAGGGGATTTGTCATGATATCTTATTATGACATTCGTTCTGCTCGAATGGCT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 725 TGTAAGCATAGGGGATTTGTCATGATATCTTATTATGACATTCGTTCTGCTCGAATGGCT 784 Query 661 ATGCGGTCTTTACAGAATAAGCCATTAAGACGGAGAAAATTAGACATTCACTTCTCAATT 720 ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 785 ATGAGGTCTTTACAGAATAAGCCATTAAGACGTAGAAAATTGGACATTCACTTCTCAATT 844 Query 721 CCTAAGGATAATCCATCTGAGAAAGATATGAATCAGGGGACATTAGTGGTTTTTAACCTG 780 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 845 CCAAAGGATAATCCATCTGAGAAAGATATGAATCAGGGGACATTAGTGGTGTTTAACCTG 904 Query 781 GATCCCTCAATTTCTAATGATGACTTACATGGAATTTTTGGTGTTCATGGCGAGATCAAA 840 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 905 GATCCTTCAATTTCTAATGATGACTTACATGGAATTTTTGGTGCTCATGGCGAGATCAAA 964 Query 841 GAGATAAGGGAAACACCACATAAGAGGCATCACAAATTCGTTGAGTTTTATGATGTCCGA 900 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 965 GAGATAAGAGAAACACCACATAAGAGGCATCACAAATTCGTCGAGTTTTATGATGTCCGC 1024 Query 901 GGTGCTGAAGCCGCATTGAAGGCATTAAACAGGTGTGAGATTGCAGGAAAACGTATAAAG 960 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1025 GGTGCTGAAGCAGCATTGAAGGCATTAAACAGGTGTGAGATTGCAGGAAAACGTATAAAG 1084 Query 961 GTTGAACCTAGTCGCCCTGGAGGAGCTCGTCGAAGCCTGATGTTGCAACTTAACCAAGAA 1020 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1085 GTTGAACCTAGTCGCCCTGGAGGAGCTCGTCGAAGCCTGATGTTGCAACTTAACCAAGAT 1144 Query 1021 CTTGAGAACGATGATTTGCATTACCTACCAATGATTGGTTCACCCATGGCAAACTCTCCC 1080 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1145 CTTGAGAACGATGATTTGCACTACCTACCGATGATTGGTTCACCCATGGCAAACTCTCCC 1204 Query 1081 CCAATGCAAGGTAACTGGATGCTGAACAGTCCCGTGGAAGGTAGTCCGCTTCAAAGTGTA 1140 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1205 CCAATGCAAGGTAACTGGCCGCTGAACAGTCCCGTGGAAGGTAGTCCGCTTCAAAGTGTA 1264 Query 1141 CTTAGTAGGTCACCTGTTTATGGGTTAAGTCCTACAAGGAACGGCCACTTGTCTGGTTTG 1200 ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1265 CTTAGCAGGTCACCTGTTTTTGGCTTAAGTCCTACAAGGAACGGCCACTTGTCTGGTTTG 1324 Query 1201 GCTTCTGCTCTAAATTCACAAGGACCAAGCTCGAAGCTTGCACCCATTGGCAGGGGTCAA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1325 GCTTCTGCTCTAAATTCACAAGGACCAAGCTCGAAGCTTGCACCCATTGGCAGGGGTCAA 1384 Query 1261 AGTGGTAGCAACGGCTTCCAACAGTCATCACATTTATTCCAAGAGCCTAAGCTGGAGAAG 1320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct 1385 ATTGGTAGCAACGGCTTCCAACAGTCATCACATTTATTCCAAGAGCCTAAGATGGATAAT 1444 Query 1321 AAGTACACAGGAAATATCTCTCCTTCTGGTCCTTTGATCTCAAATGGTGGTGGAATTGAG 1380 ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1445 AAGTACACAGGAAATCTCTCTCCTTCAGGTCCTTTGATCTCAAATGGAGGTGGAATTGAG 1504 Query 1381 ACGTTGTCGGGTTCAGAGTTTCTCTGGGGAAGTCCTAACTCACGCTCTGAACCTTCAAGT 1440 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1505 ACGTTGTCGGGTTCAGAGTTTCTCTGGGGAAGTCCTAACGCACGCTCTGAACCTTCAAGT 1564 Query 1441 TCCTCGGTTTGGTCAACATCATCAACTGGGAATCCACTCTTCTCAGCTCGGGTAGACCGA 1500 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 1565 TCCTCGGTTTGGTCAACATCATCCACTGGGAATCCACTCTTCTCAACTCGAGTAGACCGA 1624 Query 1501 TCTGTTCCATTTCCGCATCAGCATCAAAATCAAAGTCGTAGCCATCATCACTTCCATGTT 1560 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1625 TCTGTTCCATTTCCACATCAGCATCAAAATCAAAGTCGTAGCCATCATCACTTCCATGTT 1684 Query 1561 GGGTCTGCACCATCTGGTGTTCCTCTAGAAAAGCATTTTGGATTCGTCCCAGAGTCTTCA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1685 GGGTCTGCACCATCTGGTGTTCCTCTAGAAAAGCATTTTGGATTCGTCCCAGAGTCTTCA 1744 Query 1621 AAGGACACTTTGTTCATGAACACTGTTGGTTTTCAAGGAATGAGTGGAATGGGTCTCAAC 1680 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1745 AAGGACGCTTTGTTCATGAACACTGTTGGTCTTCAAGGAATGAGTGGAATGGGTCTCAAC 1804 Query 1681 GGTGGAAGTTTCTCGTCAAAAATGGCAAATAATGGGATCATTAACCCTGTAAGCATGGCC 1740 |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 1805 GGTGGAAGTTTCTCTTCCAAAATGGCAAATAATGGGATCATTAACTCTGGAAGCATGGCC 1864 Query 1741 GAAAACGGTTTTTCAAGTTACAGAATGATGTCTTCACCAAGATTCAGCCCCATGTTCTTA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1865 GAAAACGGTTTTTCAAGTTACAGAATGATGTCTTCACCGAGATTCAGCCCCATGTTCTTA 1924 Query 1801 AGCAGTGGTCTAAACCCAGGACGGTTCACCTCTGGCTTCGACGGTTTGTATGAAAATGGA 1860 ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 1925 AGCAGCGGTCTAAACCCAGGGCGGTTCGCCTCTGGCTTTGACAGTTTGTATGAAAATGGT 1984 Query 1861 AGGCCTCGTAGAGTCGAGAACAATTCGAACCAGGTTGAGAGCAGGAAACAGTTTCAACTT 1920 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1985 AGGCCTCGTAGAGTTGAGAACAATTCGAACCAGGTTGAGAGCAGGAAACAGTTTCAACTT 2044 Query 1921 GATTTGGACAAAATTCTTAATGGAGAGGATTCTCGGACTACCTTGATGATTAAAAACATA 1980 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2045 GATTTGGAGAAAATTCTTAATGGAGAGGATTCTCGGACTACCTTGATGATTAAAAACATT 2104 Query 1981 CCAAACAAATACACCTCAAAGATGTTGTTAGCTGCAATTGATGAAAAGAACCAAGGAACT 2040 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2105 CCAAACAAATACACCTCGAAGATGTTGTTAGCTGCAATCGATGAAAAGAACCAAGGAACT 2164 Query 2041 TACAACTTTCTCTATTTGCCCATTGATTTCAAGAACAAATGCAATGTTGGCTATGCATTC 2100 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2165 TACAACTTTCTCTATTTGCCCATTGATTTCAAGAACAAATGCAATGTGGGCTATGCATTC 2224 Query 2101 ATCAACATGCTCACTCCAGAACTCATCATTCCTTTTTACGAGGCTTTTAACGGGAAGAAG 2160 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 2225 ATCAACATGCTCAATCCAGAACTCATCATTCCATTTTATGAGGCTTTTAATGGGAAGAAG 2284 Query 2161 TGGGAGAAGTTCAACAGTGAGAAAGTAGCTTCATTGGCATATGCTCGGATACAAGGAAAA 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2285 TGGGAGAAGTTCAACAGTGAGAAAGTAGCTTCATTGGCATATGCTCGGATACAAGGAAAA 2344 Query 2221 TCTGCCCTTATAGCTCATTTTCAGAACTCAAGCTTGATGAATGAAGATATGCGCTGCCGT 2280 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2345 TCTGCCCTTATAGCCCATTTTCAGAACTCAAGCTTGATGAATGAAGATATGCGTTGTCGT 2404 Query 2281 CCAATTATCTTCGATGCTCCTAACAATCCAGACTCTGTTGAACAGGTTGTCGTTGAGGAA 2340 |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 2405 CCAATTATCTTCGACACTCCCAACAATCCAGAGTCTGTTGAACAGGTTGTTGATGAGGAA 2464 Query 2341 ACTAAGAATGTGGATCTTCTTGACTCTGAGCTCAGTGATGATG--G-CAGAGAGAAAAGC 2397 |||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| Sbjct 2465 TCTAAGAATATGGACCTCCTCGACTCTCAGCTCAGTGATGATGATGGCAGAGAGAGAAGC 2524 Query 2398 TGA 2400 ||| Sbjct 2525 TGA 2527 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 119176093830 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5