BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg917411 Length=3240 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G57110.1 | Symbols: ACA8, AT-ACA8 | autoinhibited Ca2+ -ATPa... 5177 0.0 > AT5G57110.1 | Symbols: ACA8, AT-ACA8 | autoinhibited Ca2+ -ATPase, isoform 8 | chr5:23109438-23117544 REVERSE LENGTH=3637 Length=3637 Score = 5177 bits (2803), Expect = 0.0 Identities = 3080/3217 (96%), Gaps = 6/3217 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGACAAGTCTCTTGAAGCCATCGCCGGGACGACGACGGGGAACCGATTTGGAGTCTGGT 60 ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||| Sbjct 122 ATGACGAGTCTCTTGAAGTCATCGCCTGGACGACGCCGTGGAGGCGATGTGGAGTCTGGG 181 Query 61 AAGACTGATA-ACGCTGACTCCGATAGCGATACTTTCTACATCCCCTCGAAGAATGCTTC 119 |||| ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 182 AAGAGTGA-ACACGCAGACTCTGATAGCGACACTTTCTACATCCCATCGAAGAATGCTTC 240 Query 120 AATTGAGCGGCTTCAACAGTGGAGAAAAGCTGCTCTGGTTCTCAATGCCTCCCGGAGATT 179 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 241 TATTGAGCGGCTTCAACAGTGGAGAAAAGCTGCACTGGTTCTCAATGCGTCCCGGAGATT 300 Query 180 CCGTTACACCTTGGACTTGAAGAAGGAGCAAGAAACGAGGGAAATGCGACAGAAGATCAG 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 301 CCGGTACACCTTGGACTTGAAGAAGGAGCAAGAAACGAGGGAAATGAGACAGAAGATCAG 360 Query 240 AAGCCATGCTCATGCTCTCTTGGCTGCGAATCGTTTTATGGATATGGGACGTGAG-CAAG 298 ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct 361 AAGTCATGCTCATGCTCTTTTGGCGGCGAATCGTTTTATGGATATGGGACGTGAGTC-AG 419 Query 299 GAGGTGAGAAAACAACAGCGCCTGCAACTCCGGCTGGTGATTTTGGAATTACACCTGAAC 358 ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 420 GAGTTGAAAAAACAACTGGGCCTGCAACTCCGGCTGGTGATTTTGGAATTACTCCTGAAC 479 Query 359 AGCTTGTGATAATGTCAAAGGATCACAACACTGGTTCCCTGGAGCAATATGGAGGGGCTC 418 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 480 AGCTTGTGATAATGTCAAAGGATCACAACAGTGGTGCCCTGGAGCAATATGGAGGGACTC 539 Query 419 AAGGATTGTCAAATTTGCTCAAGACAAATCCAGAGAAAGGTATCAGTGGAGATGATGATG 478 |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 540 AAGGATTGGCCAATTTGCTCAAGACAAATCCAGAGAAAGGTATCAGTGGCGATGATGATG 599 Query 479 ACTTGCTAAAGCGCAAGACCGTTTATGGATCAAACACCTATCCTCGCAAGAAAGGCAAAG 538 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 600 ACTTGCTAAAGCGCAAGACCATTTATGGATCAAACACATATCCTCGCAAGAAAGGGAAAG 659 Query 539 GGTTTCTGAGGTTTCTTTGGGATGCTTGCCATGATCTCACCTTGATCATTTTAATGGTTG 598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 GGTTTCTGAGGTTTCTTTGGGATGCTTGCCATGATCTCACCTTGATCATTTTAATGGTTG 719 Query 599 CTGCAGTAGCGTCTTTAGCACTTGGGATAAAAACAGAGGGTATCAAAGAAGGATGGTATG 658 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 CTGCTGTAGCGTCTTTAGCACTTGGGATAAAAACAGAGGGTATCAAAGAAGGATGGTATG 779 Query 659 ATGGAGGAAGCATTGCATTTGCTGTGATTCTTGTGGTTGTTGTGACAGCTGTCAGTGACT 718 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| Sbjct 780 ATGGAGGAAGCATTGCATTTGCTGTGATTCTTGTGATTGTTGTGACGGCTGTCAGTGACT 839 Query 719 ACAAACAGTCGCTCCAGTTTCAAAACTTGAATGATGAAAAGAGAAACATACATCTGGAGG 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 ACAAACAGTCGCTCCAGTTTCAAAACTTGAATGATGAAAAGAGAAACATACATCTGGAGG 899 Query 779 TGTTAAGAGGTGGAAGACGAGTGGAAATTTCGATCTATGACATAGTGGTGGGTGATGTCA 838 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 TGTTAAGAGGTGGAAGACGAGTGGAGATTTCGATCTATGACATAGTGGTGGGTGATGTCA 959 Query 839 TACCCCTCAACATTGGCAATCAGGTTCCTGCGGATGGAATCCTGATAGCTGGCCACTCTC 898 | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| Sbjct 960 TTCCTCTCAACATTGGCAATCAGGTTCCTGCTGATGGAGTACTGATATCTGGCCACTCTC 1019 Query 899 TTGCCGTTGATGAGTCTAGCATGACTGGAGAGAGCAAAATAGTTAACAAAGACGCCAACA 958 | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 1020 TCGCCCTTGATGAATCTAGCATGACTGGAGAGAGCAAAATTGTTAACAAAGACGCTAACA 1079 Query 959 AGGACCCATTCTTAATGTCTGGCTGTAAAGTGGCAGATGGAAATGGTTCTATGCTGGTTA 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 AGGACCCATTCTTAATGTCTGGCTGTAAAGTGGCAGATGGAAATGGTTCTATGCTGGTTA 1139 Query 1019 CTGGTGTTGGAGTCAACACTGAATGGGGATTGCTGATGGCCAGTATTTCTGAAGACAATG 1078 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 CTGGTGTTGGAGTCAACACTGAATGGGGATTGCTGATGGCCAGTATTTCTGAAGACAATG 1199 Query 1079 GTGAAGAAACTCCATTGCAGGTGCGCTTAAATGGGGTAGCTACTTTTATTGGTTCAATTG 1138 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 GTGAAGAAACTCCCTTGCAGGTGCGCTTAAATGGGGTAGCTACTTTTATTGGTTCAATTG 1259 Query 1139 GCTTAGCGGTTGCTGCTGCTGTACTAGTGATTCTTCTGACTCGATATTTCACTGGTCACA 1198 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1260 GCTTAGCGGTGGCTGCTGCTGTGCTAGTGATTCTTCTGACTCGATATTTCACTGGTCACA 1319 Query 1199 CTAAAGCCGCTAATGGAGGTCCTCAATTTGTTAAAGGCAAGACAAAAATCGGTCATG-TA 1257 |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct 1320 CTAAAGACAATAATGGAGGTCCTCAATTCGTTAAAGGCAAGACAAAAGTCGGTCATGTTA 1379 Query 1258 GTTGATGATGTGATCAAAGTCCTTACCGTAGCGGTTACAATTGTCGTAGTGGCAGTGCCT 1317 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1380 -TTGATGATGTGGTCAAAGTCCTTACCGTAGCGGTTACAATTGTCGTAGTGGCAGTGCCT 1438 Query 1318 GAGGGTCTTCCATTGGCTGTTACTTTAACCCTTGCCTATTCAATGAGGAAAATGATGGCA 1377 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 GAGGGTCTTCCTTTGGCTGTTACTTTAACCCTTGCCTATTCAATGAGGAAAATGATGGCA 1498 Query 1378 GATAAGGCTTTGGTGAGGAGGCTATCTGCTTGCGAGACAATGGGCTCTGCCACCACTATT 1437 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1499 GATAAGGCTTTGGTGCGGAGGCTATCTGCTTGCGAGACAATGGGCTCTGCCACCACTATT 1558 Query 1438 TGCAGTGATAAAACTGGAACACTAACTTTGAATCAGATGACAGTGGTTGAGTCGTATGCT 1497 ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 1559 TGCAGCGATAAAACTGGAACACTAACTCTGAATCAGATGACTGTGGTTGAGTCTTATGCT 1618 Query 1498 GGGGGCaaaaaaaCAGATACTGAACAATTGCCAGCAACTATCACTTCGTTAGTTGTTGAA 1557 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 1619 GGGGGCAAGAAAACAGATACTGAACAATTGCCAGCAACTATCACTTCGCTAGTAGTTGAA 1678 Query 1558 GGAATATCTCAAAACACAACTGGTAGTATTTTTGTCCCAGAGGGCGGCGGTGATTTAGAG 1617 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 1679 GGAATATCTCAAAACACAACTGGTAGTATTTTTGTCCCAGAGGGTGGAGGTGATTTAGAG 1738 Query 1618 TACTCTGGTTCACCAACAGAAAAGGCCATTCTTGGCTGGGGAGTTAAGCTGGGAATGAAT 1677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1739 TACTCTGGTTCACCAACAGAAAAGGCCATTCTTGGCTGGGGAGTTAAGCTGGGAATGAAT 1798 Query 1678 TTTGAGACAGCCAGGTCGCAGTCTTCAATCCTTCATGCTTTTCCATTTAACTCAGAGAAG 1737 || ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 TTCGAGACAGCCCGATCGCAGTCTTCTATTCTTCATGCTTTTCCATTTAACTCAGAGAAG 1858 Query 1738 AAACGTGGTGGTGTTGCTGTAAAAACGGCTGATGGTGAAGTTCATGTTCACTGGAAAGGA 1797 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 AAACGTGGTGGTGTTGCTGTAAAAACGGCTGATGGTGAAGTTCATGTTCACTGGAAAGGA 1918 Query 1798 GCTTCTGAAATTGTCCTGGCATCATGCAGAAGCTACATCGATGAGGATGGTAATGTGGCA 1857 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 GCTTCTGAAATTGTCCTGGCATCATGCCGAAGCTACATCGATGAGGATGGTAATGTGGCA 1978 Query 1858 CCAATGACTGATGACAAGGCATTGTTTTTCAAGAATGGCATTAACGATATGGCTGGAAGA 1917 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1979 CCAATGACTGACGACAAGGCATCGTTTTTCAAGAATGGCATTAATGATATGGCTGGAAGA 2038 Query 1918 ACCTTACGATGTGTTGCACTCGCCTTTAGAACCTATGAGGCTGAAAAGGTCCCAACAGGC 1977 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2039 ACCTTACGATGTGTTGCACTCGCCTTTAGAACCTATGAGGCTGAAAAGGTCCCAACAGGC 2098 Query 1978 GAAGAGCTCTCAAAGTGGGTACTCCCAGAGGATGACCTTATTTTATTAGCTATAGTAGGC 2037 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 2099 GAAGAGCTCTCAAAGTGGGTACTCCCAGAGGATGATCTTATATTATTAGCTATAGTGGGC 2158 Query 2038 ATAAAGGATCCATGTAGACCAGGAGTCAAAGATTCAGTTCAGTTGTGTCAAAATGCTGGT 2097 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2159 ATAAAGGATCCATGTAGACCAGGAGTCAAAGATTCAGTTGTGTTGTGTCAAAATGCTGGT 2218 Query 2098 GTCAAGGTTCGTATGGTTACTGGTGACAACGTCCAAACTGCCAGGGCTATTGCCTTGGAA 2157 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2219 GTCAAGGTCCGTATGGTTACTGGTGACAACGTCCAAACTGCCAGGGCTATTGCCTTGGAA 2278 Query 2158 TGTGGAATATTAACTTCAGATTCAGATCTCTCTGAGCCTACTCTCATTGAAGGAAAATCA 2217 ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2279 TGTGGAATACTAAGTTCAGATGCAGATCTCTCCGAGCCTACTCTCATTGAAGGAAAATCA 2338 Query 2218 TTCCGTGCGATGACTGATGCAGGAAGGGACAAGATTAGTGACAAAATATCAGTTATGGGC 2277 ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2339 TTCCGTGAGATGACTGATGCAGAAAGGGACAAGATTAGTGACAAAATATCGGTTATGGGC 2398 Query 2278 CGATCATCGCCCAATGACAAACTTCTGCTGGTACAATCTCTGAGACGACAAGGGCATATT 2337 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2399 CGATCATCTCCCAATGACAAACTTCTGCTGGTACAATCTCTGAGACGACAAGGGCATGTT 2458 Query 2338 GTTGCAGTCACCGGGGATGGGACAAATGATGCTCCTGCGTTGCACGAGGCAGATATTGGT 2397 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2459 GTTGCTGTCACCGGGGATGGGACAAATGATGCTCCTGCATTGCACGAGGCAGATATTGGT 2518 Query 2398 CTTGCTATGGGAATAGCAGGAACAGAAGTGGCTAAGGAGAGTTCGGACATCATCATCTTG 2457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2519 CTTGCTATGGGAATAGCAGGAACAGAAGTGGCTAAGGAGAGTTCGGACATCATCATCTTG 2578 Query 2458 GATGACAACTTTGCTTCAGTTGTCAAGGTTGTTCGCTGGGGACGATCAGTGTACGCCAAC 2517 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 2579 GATGACAACTTTGCTTCAGTTGTCAAGGTTGTTCGATGGGGGCGATCAGTGTATGCCAAC 2638 Query 2518 ATTCAGAAATTCATCCAATTTCAGCTCACAGTCAATGTCGCCGCTCTCATAATTAACGTT 2577 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 2639 ATTCAGAAGTTCATCCAATTTCAGCTCACAGTCAATGTCGCCGCTCTCGTAATTAATGTT 2698 Query 2578 GTAGCTGCTATTTCGAGTGGTGATGTTCCACTTACCGCTGTGCAGCTTCTCTGGGTTAAT 2637 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2699 GTAGCTGCTATTTCGAGTGGTGACGTTCCACTTACCGCTGTGCAGCTTCTCTGGGTTAAT 2758 Query 2638 CTGATAATGGACACTCTTGGAGCATTGGCTTTGGCTACTGAACCACCCACTGATCACCTC 2697 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2759 CTGATAATGGACACTCTTGGAGCATTGGCTTTGGCTACTGAACCACCCACTGATCACCTC 2818 Query 2698 ATGGGGAGGCCTCCAGTTGGCAGAAAAGAACCTCTTATTACCAACATCATGTGGAGAAAC 2757 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2819 ATGGGGAGGCCTCCAGTTGGCAGAAAAGAACCTCTTATTACCAACATCATGTGGAGAAAC 2878 Query 2758 TTGTTGATCCAGGCTACCTATCAAGTGAGTGTATTGTTAACACTCAATTTCGGAGGCATA 2817 ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2879 TTGCTGATCCAGGCTATTTATCAAGTGAGTGTATTGTTAACACTCAATTTCCGAGGCATA 2938 Query 2818 AGCATACTTGGCCTGGAGCATGAAGAGCATGCACACGCCACCAGAGTGAAGAACACAATA 2877 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2939 AGCATACTTGGCCTGGAGCATGAAGTGCATGAACACGCCACTAGAGTGAAGAACACAATA 2998 Query 2878 ATCTTCAACGCCTTTGTTCTCTGCCAAGCTTTCAATGAGTTCAATGCTCGTAAACCAGAT 2937 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2999 ATCTTCAACGCCTTTGTTCTCTGCCAAGCTTTCAATGAGTTCAATGCTCGTAAACCAGAT 3058 Query 2938 GAGAAGAACATCTTCAAAGGTGTGATCAAGAATCGTCTCTTTATGGGAATAGTTGTCATA 2997 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct 3059 GAGAAGAACATCTTCAAAGGTGTGATCAAGAATCGTCTCTTTATGGGAATAATAGTCATA 3118 Query 2998 ACTCTCGTCCTCCAGGTTATCATTGTTGAGTTCCTCGGTAAATTTGCTTCCACGACGAAA 3057 ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3119 ACTCTTGTGCTCCAGGTTATCATTGTTGAGTTCCTTGGTAAATTCGCTTCCACGACGAAA 3178 Query 3058 CTTGACTGGAAACAATGGCTAATCTGTGTTGGCATCGGTGTTATCAGTTGGCCACTTGCT 3117 || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3179 CTAAACTGGAAGCAATGGCTTATCTGTGTTGGCATCGGTGTTATCAGTTGGCCTCTTGCT 3238 Query 3118 TTGGTCGGGAAATTCATTCCGGTGCCAGCAGCTCCTTTAAGCAACAAACTGTCAGCACTG 3177 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| Sbjct 3239 TTGGTCGGGAAATTCATTCCGGTGCCTGCAGCTCCTATAAGCAACAAATTGAAAGTACTA 3298 Query 3178 AAATGCTGGGGCAAGAAGAAAAAGTCTTCTGGAGAAG 3214 |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3299 AAATTCTGGGGCAAGAAGAAAAATTCTTCTGGAGAAG 3335 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 161186387859 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5