BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg919087
Length=4589
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G04120.1 | Symbols: ATMRP5, MRP5, ATABCC5, ABCC5 | multidrug... 7657 0.0
> AT1G04120.1 | Symbols: ATMRP5, MRP5, ATABCC5, ABCC5 | multidrug
resistance-associated protein 5 | chr1:1064454-1070927 REVERSE
LENGTH=5277
Length=5277
Score = 7657 bits (4146), Expect = 0.0
Identities = 4450/4598 (97%), Gaps = 16/4598 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTCTCACAAATCTTT-TCGATCATGGATTTTAATGAGATCTCGTTGATCTTTCGAGAG 59
|||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 CTCTATCACAAATCTTTCCCGATCATGGATTTTATTGAGATCTCGTTGATCTTTCGAGAG 374
Query 60 CATTTACCACTATTGGAACTCTGTTCGGTC-TCCATCAACCTCCTACTTTTTCTGGTGTT 118
||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 375 CATTTGCCACTACTGGAACTATGTTCGGTCAT-CATCAACCTCCTACTCTTTCTTGTCTT 433
Query 119 TCTATTTGCTGTCTCTGCGAGGCAGATTCTCGTCTGTGTGAGAAGAGGCAGAGATAGAAT 178
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 434 TCTATTTGCTGTCTCCGCGAGGCAGATTCTCGTCTGCGTGAGAAGAGGCAGAGATAGGCT 493
Query 179 CTCTAAGGACGATACGGTTTCAGCTTCTAATGTTAGCTTGGAAAGAGAGGTTAACCATGT 238
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 CTCTAAGGACGATACGGTTTCAGCTTCTAATCTTAGCTTGGAAAGAGAGGTTAACCATGT 553
Query 239 TAGTGTTGGGTTTGGGTTTAAACTGTCTTTGCTCTGTTGCTTATATGTGTTAGGCGTGCA 298
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 554 TAGTGTTGGGTTTGGGTTTAATCTGTCTTTGCTCTGTTGCTTATATGTGTTAGGCGTCCA 613
Query 299 AGTTTTGGTGTTAGGT-T-TCGATGGGATTAAGGTTATAAGAGAAGTCAGTGACTGGTTT 356
||||||||||||| || | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 AGTTTTGGTGTTA-GTATAT-GATGGGGTTAAGGTTAGAAGAGAAGTCAGTGACTGGTTT 671
Query 357 GTTCTTTGCTTTCCAGCTGCTCAGAGTTTAGCTTGGTTTGTCCTTAGCTTTTTAGTTCTT 416
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 672 GTTCTTTGCTTTCCAGCTTCTCAGAGTTTAGCTTGGTTTGTCCTTAGCTTCTTAGTTCTT 731
Query 417 CATTTGAAATACAAGTCTTCAGAGAAGCTACCCTTCTTGGTGAGGATATGGTGGTTCTTG 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 732 CATTTGAAATACAAGTCTTCAGAGAAGCTACCCTTCTTGGTGAGGATATGGTGGTTCCTG 791
Query 477 GCGTTTTTGATTTGTCTGTGTACTATGTATGTGGATGGAAAAAGGCTAGCGATTGAAGGT 536
||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 792 GCGTTTTCGATTTGCCTCTGTACTATGTATGTCGATGGAAGAAGGCTAGCCATTGAAGGT 851
Query 537 TGGAGCGGATGTTCTTCTCATGTTGTCGCCAATTTAGCTGTTACACCTGCTCTTGGGTTT 596
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 852 TGGAGCAGATGTTCTTCTCATGTTGTCGCCAATTTAGCTGTTACACCTGCTCTTGGGTTT 911
Query 597 CTTTGCTTTGTGGCGTTGAGAGGCGTTTCTGGTATTCAAGTTACCCGAAGCTCTTCTGAT 656
|| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 912 CTCTGCTTTCTGGCCTGGAGAGGCGTTTCTGGTATTCAAGTTACCAGAAGCTCCTCTGAT 971
Query 657 CTCCAAGAGCCTTTGCTTGTTGAAGAAGAGGCAGCTTGTCTTAAAGTTACTCCATATAGT 716
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 972 CTTCAAGAGCCTTTGCTTGTTGAAGAAGAGGCAGCTTGTCTTAAAGTTACTCCATATAGT 1031
Query 717 ACTGCTGGACTACTTAGCC-TACTTACGCTTTCATGGTTGGATCCACTTCTCTCGGCCGG 775
|||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1032 ACTGCTGGGCTAGTTAGCCTTA-TTACGCTTTCATGGTTGGATCCACTTCTCTCGGCTGG 1090
Query 776 TTCAAAAAGACCGCTTGAGCTTAAAGATATACCGCTTCTTGCACCAAGAGATAGAGCCAA 835
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 TTCAAAAAGACCGCTTGAGCTTAAGGATATACCGCTTCTTGCACCAAGAGATAGAGCCAA 1150
Query 836 ATCAAGTTACAAGGTCTTGAAGTCGAATTGGAAGAGGT-CAAAATCCGAGAATCCTTCAA 894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||
Sbjct 1151 ATCAAGTTACAAGGTCTTGAAGTCGAATTGGAAGAGATGC-AAGTCCGAGAATCCTTCAA 1209
Query 895 AGCCTCCTTCTCTAGCTCGTGCAATTCTGAAATCCTTTTGGAAAGAAGCAGCTTGCAATG 954
||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1210 AGCCTCCTTCTTTAGCTCGTGCAATTATGAAATCATTTTGGAAAGAAGCTGCTTGCAATG 1269
Query 955 CCGTCTTTGCTGGGTTGAATACTCTCGTGTCCTATGTCGGTCCTTACTTGATCAGCTACT 1014
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 CCGTATTTGCTGGGTTGAATACTCTTGTGTCCTATGTCGGTCCTTACTTGATCAGCTACT 1329
Query 1015 TTGTTGATTATCTTGGAGGGAAGGAGATTTTCCCTCATGAAGGATATGTTCTCGCTGGGA 1074
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1330 TTGTTGATTATCTTGGAGGGAAGGAGATTTTCCCTCATGAAGGATACGTACTCGCTGGGA 1389
Query 1075 TATTCTTTACTTCCAAGCTTATAGAGACAGTCACCACCCGCCAATGGTATATGGGTGTTG 1134
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1390 TATTCTTTACGTCCAAGCTTATAGAGACAGTCACCACCCGCCAGTGGTATATGGGTGTTG 1449
Query 1135 ATATCTTAGGGATGCATGTTAGGTCAGCTCTTACAGCGATGGTATACCGAAAAGGTCTCA 1194
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450 ATATCCTAGGGATGCATGTTAGATCAGCTCTTACAGCAATGGTATACCGAAAAGGTCTCA 1509
Query 1195 AACTTTCGAGTATAGCCAAGCAGAACCACACGAGCGGTGAAATTGTAAACTACATGGCAG 1254
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 AACTTTCAAGTATAGCCAAGCAGAACCACACGAGCGGTGAAATTGTAAACTACATGGCAG 1569
Query 1255 TCGATGTCCAGCGCATAGGAGATTACTCATGGTATCTTCATGATATTTGGATGCTTCCTA 1314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1570 TCGATGTCCAGCGCATAGGAGATTACTCATGGTATCTTCATGATATTTGGATGCTTCCGA 1629
Query 1315 TGCAAATAGTTCTTGCTCTTGCAATCCTATATAAAAGCGTGGGGATAGCTTCTGTAGCTA 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 1630 TGCAAATAGTTCTTGCTCTTGCAATCCTATATAAAAGCGTGGGCATAGCTGCTGTAGCTA 1689
Query 1375 CATTGGTTGCTACAATAATCTCGATTCTTGTCACAATTCCATTGGCTAAGGTCCAGGAAG 1434
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 1690 CATTGGTTGCTACAATAATCTCGATTCTTGTCACGATTCCACTCGCTAAGGTCCAGGAAG 1749
Query 1435 ACTATCAAGATAAGTTGATGACTGCAAAAGATGAAAGAATGAGGAAAACCTCAGAGTGTC 1494
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 ACTATCAAGATAAGTTGATGACTGCGAAAGATGAAAGAATGAGGAAAACCTCAGAGTGTC 1809
Query 1495 TTAGGAACATGAGAGTTCTGAAATTGCAGGCATGGGAAGATCGTTATAGAGTGAGATTGG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 TTAGGAACATGAGAGTTCTGAAATTGCAGGCATGGGAAGATCGTTATAGAGTGAGATTGG 1869
Query 1555 AAGAAATGAGGGAAGAGGAGTATGGTTGGCTTCGCAAAGCCTTATATTCCCAGGCATTTG 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1870 AAGAAATGAGGGAAGAGGAGTATGGTTGGCTTCGCAAAGCCTTATATTCTCAGGCTTTTG 1929
Query 1615 TTACTTTCATCTTTTGGAGTTCCCCGATCTTTGTCGCCGCAGTTACATTCGCTACTTCGA 1674
||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1930 TTACTTTTATCTTTTGGAGTTCCCCCATTTTTGTCGCCGCAGTTACATTCGCTACTTCGA 1989
Query 1675 TATTCCTAGGCACTCAACTTACCGCTGGAGGTGTTCTTTCTGCTCTGGCGACATTCAGAA 1734
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 TATTTCTAGGCACTCAACTTACCGCTGGAGGTGTTCTTTCTGCTCTGGCGACATTCAGAA 2049
Query 1735 TCCTTCAGGAGCCACTTCGGAACTTTCCTGATCTGGTATCAATGATGGCTCAGACAAAGG 1794
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2050 TTCTTCAGGAGCCACTTCGGAACTTTCCTGATCTGGTTTCAATGATGGCTCAGACAAAGG 2109
Query 1795 TTTCTCTTGATAGGATTTCCGGGTTCTTGCAGGAGGAAGAGCTTCAGGAAGATGCAACTA 1854
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 2110 TTTCTCTTGATAGGATTTCTGGGTTCTTGCAGGAGGAAGAACTTCAAGAAGATGCAACTG 2169
Query 1855 TTGTAATTCCACGGGGACTTTCGAATATAGCCATAGAGATTAAAGATGGTGTGTTTTGTT 1914
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170 TTGTTATTCCACGGGGACTTTCGAATATAGCCATAGAGATTAAAGATGGTGTGTTTTGTT 2229
Query 1915 GGGACCCTTTTTCTTCAAGGCCGACATTAT-TAGGGATTCAAATGAAAGTGGAGAAGGGT 1973
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2230 GGGACCCTTTTTCTTCAAGGCCGACATTATCT-GGGATTCAGATGAAAGTGGAGAAGGGT 2288
Query 1974 ATGCGTGTGGCTGTCTGTGGCACAGTTGGCTCTGGAAAATCAAGTTTTATCTCTTGCATC 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289 ATGCGTGTGGCTGTCTGTGGCACAGTTGGCTCTGGAAAATCAAGTTTTATCTCTTGCATC 2348
Query 2034 CTCGGGGAAATCCCAAAAATCTCTGGTGAAGTTAGAATATGTGGTACTACTGGTTATGTG 2093
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2349 CTAGGGGAAATCCCAAAAATCTCTGGCGAAGTTAGAATATGTGGTACTACTGGTTATGTG 2408
Query 2094 TCTCAATCGGCTTGGATTCAGTCTGGTAACATTGAAGAAAACATTCTATTTGGCAGTCCA 2153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2409 TCTCAATCGGCTTGGATTCAGTCTGGTAACATTGAAGAAAACATTCTATTTGGCAGTCCA 2468
Query 2154 ATGGAGAAAACAAAGTACAAGAATGTGATGCAAGCATGTTCCCTAAAGAAAGATTTAGAG 2213
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2469 ATGGAGAAAACAAAGTACAAGAATGTGATACAAGCATGTTCCCTAAAGAAAGATATAGAG 2528
Query 2214 CTTTTCTCACATGGGGACCAAACGATTATCGGAGAGAGAGGTATAAATCTCAGTGGAGGC 2273
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2529 CTTTTCTCACATGGGGACCAAACTATTATCGGGGAGAGAGGTATAAATCTCAGCGGAGGT 2588
Query 2274 CAGAAACAGCGTGTCCAACTTGCAAGGGCATTATATCAAGATGCTGACATTTATTTACTA 2333
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 CAGAAACAGCGTGTACAACTTGCAAGGGCATTATATCAAGATGCTGACATTTATTTACTA 2648
Query 2334 GACGACCCTTTTAGTGCTCTTGATGCACACACTGGCTCTGATTTGTTTAGGGATTATATT 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 GACGACCCTTTTAGTGCTCTTGATGCACACACTGGCTCTGATTTGTTTAGGGATTATATT 2708
Query 2394 CTATCTGCATTGGCTGAGAAAACTGTGGTTTTTGTGACGCATCAAGTTGAGTTTCTCCCT 2453
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 CTATCTGCATTGGCTGAGAAAACTGTGGTTTTTGTAACGCATCAAGTTGAGTTTCTCCCT 2768
Query 2454 GCAGCTGATCTAATATTGGTTCTGAAGGAAGGCAGGATTATTCAATCGGGTAAATATGAT 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 GCAGCTGATCTAATATTGGTTCTGAAGGAAGGCAGGATTATTCAATCGGGTAAATATGAT 2828
Query 2514 GATCTGCTACAAGCAGGTACTGATTTTAAGGCCTTAGTGTCTGCCCACCATGAAGCAATC 2573
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829 GATCTGCTGCAAGCAGGTACTGATTTTAAGGCCTTAGTGTCTGCCCACCATGAAGCAATC 2888
Query 2574 GAGGCCATGGATATCCCAAGTCCGTCCTCAGAAGACTCTGATGAAAATCCTATTCGCGAT 2633
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2889 GAGGCAATGGACATCCCAAGTCCCTCCTCAGAAGACTCTGATGAAAATCCTATTCGCGAT 2948
Query 2634 ATTTTGGTCTTGCATAATCCAAAGTCAGATGTTTTTGAAAATGACATCGAGACTTTGGCA 2693
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 AGTTTGGTCTTGCATAATCCAAAGTCTGATGTTTTTGAAAATGACATCGAGACTTTGGCA 3008
Query 2694 AAGGAAGTACAAGAGGGAGGATCTGCTTCAGATCTAAAGGCAATCAAAGAGAAGAAGAAG 2753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 AAGGAAGTACAAGAGGGAGGATCTGCTTCAGATCTAAAGGCAATCAAAGAGAAGAAGAAG 3068
Query 2754 AAAGCTAAGCGCTCCCGCAAAAAGCAGCTTGTTCAAGAAGAGGAACGAGTAAAGGGAAAA 2813
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3069 AAAGCTAAGCGTTCCCGCAAAAAGCAGCTTGTTCAAGAAGAGGAACGAGTAAAGGGAAAA 3128
Query 2814 GTCAGCATGAAGGTGTACTTGTCATACATGGGTGCTGCATATAAA-GGGCTTCTGATTCC 2872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 3129 GTCAGCATGAAGGTGTACTTGTCATACATGGGTGCTGCATATAAAGGGGC-TCTGATTCC 3187
Query 2873 TCTTATTATACTCGCACAAGCTTCTTTCCAATTTCTTCAGATTGCTAGTAATTGGTGGAT 2932
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3188 TCTTATTATACTCGCACAAGCTGCTTTCCAATTTCTTCAGATTGCTAGTAATTGGTGGAT 3247
Query 2933 GGCTTGGGCGAATCCTCAAACTGAAGGTGACCAGTCTAAAGTGGATCCTACACTGCTTCT 2992
||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3248 GGCTTGGGCAAATCCTCAAACTGAAGGTGACGAATCTAAAGTGGATCCTACTCTGCTTCT 3307
Query 2993 CATCGTATATACGGCTTTAGCTTTTGGGAGCTCTGTGTTCATCTTTGTTCGAGCTGCTCT 3052
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3308 CATCGTTTATACGGCTTTAGCTTTCGGGAGCTCTGTGTTCATATTTGTTCGAGCTGCTCT 3367
Query 3053 GGTTGCAACTTTCGGTCTTGCAGCTGCACAGAAACTGTTCTTGAATATGCTCAGAAGTGT 3112
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3368 GGTTGCAACTTTTGGTCTTGCAGCTGCACAGAAACTGTTCTTAAATATGCTCAGAAGTGT 3427
Query 3113 GTTCCGAGCGCCAATGTCATTCTTTGATTCCACTCCTGCAGGAAGAATTTTGAATCGGGT 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3428 GTTCCGAGCGCCAATGTCATTCTTTGATTCCACTCCTGCAGGAAGAATTTTGAATCGGGT 3487
Query 3173 TTCTATTGATCAAAGTGTTGTGGATCTTGACATTCCTTTTAGACTCGGTGGGTTTGCTTC 3232
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3488 TTCTATTGATCAAAGTGTTGTAGATCTTGACATTCCTTTTAGACTCGGTGGGTTTGCTTC 3547
Query 3233 AACAACGATACAACTCTTTGGGATTGTCGCTGTAATGACCAATGTTACCTGGCAAGTTTT 3292
|||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3548 AACAACAATACAACTCTGTGGCATTGTCGCTGTAATGACCAATGTTACCTGGCAAGTTTT 3607
Query 3293 CCTTCTTGTTGTTCCGGTAGCTGTTGCTTGCTTTTGGATGCAGAAATATTACATGGCTTC 3352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3608 CCTTCTTGTTGTTCCGGTAGCTGTTGCTTGCTTTTGGATGCAGAAATATTACATGGCTTC 3667
Query 3353 TTCAAGAGAACTGGTTCGGATTGTTAGTATCCAGAAGTCTCCAATAATTCATCTTTTTGG 3412
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3668 TTCAAGAGAATTGGTTCGGATAGTTAGTATCCAGAAGTCTCCAATAATTCATCTTTTTGG 3727
Query 3413 AGAATCAATTGCTGGTGCTGCCACAATAAGAGGATTTGGCCAGGAAAAAAGATTTATCAA 3472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3728 AGAATCAATTGCTGGTGCTGCCACAATAAGAGGATTTGGCCAGGAAAAAAGATTTATCAA 3787
Query 3473 AAGGAATCTTTATCTTCTCGATTGTTTTGTTCGACCTTTCTTCTGCAGTATCGCTGCTAT 3532
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3788 AAGGAATCTTTATCTTCTAGATTGTTTTGTTCGACCTTTCTTCTGCAGTATCGCTGCTAT 3847
Query 3533 CGAATGGCTTTGTTTACGCATGGAATTACTTTCCACACTTGTATTTGCTTTCTGTATGGT 3592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3848 CGAATGGCTTTGTTTACGCATGGAATTACTTTCCACACTTGTATTTGCTTTCTGTATGGT 3907
Query 3593 TTTACTCGTCAGTTTTCCACATGGAACCATTGATCCAAGCATGGCAGGTCTTGCTGTGAC 3652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3908 TTTACTCGTCAGTTTTCCACATGGAACCATTGATCCAAGCATGGCAGGTCTTGCTGTGAC 3967
Query 3653 ATATGGGCTTAACTTGAATGGACGTCTATCACGATGGATACTTAGCTTTTGTAAGCTTGA 3712
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3968 ATATGGACTTAACTTGAATGGACGTCTATCACGATGGATACTTAGCTTTTGTAAGCTTGA 4027
Query 3713 AAACAAAATAATCTCAATCGAAAGGATTTATCAGTACAGTCAGATTGTAGGAGAGGCCCC 3772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4028 AAACAAAATAATCTCAATCGAAAGGATTTATCAGTACAGTCAGATTGTAGGAGAGGCCCC 4087
Query 3773 AGCAATTATCGAAGATTTCCGCCCGCCTTCCTCGTGGCCTGAAACGGGAACAATTGAGCT 3832
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4088 AGCAATTATAGAAGATTTCCGCCCGCCTTCCTCGTGGCCTGCAACGGGAACAATTGAGCT 4147
Query 3833 ACTTGATGTTAAGGTTCGTTATGCTGAGAATCTTCCAACAGTACTCCATGGGATAAGCTG 3892
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 4148 AGTTGATGTTAAGGTTCGTTATGCTGAGAATCTTCCAACAGTACTCCATGGGGTGAGCTG 4207
Query 3893 TGTGTTTCCTGGTGGAAAAAAGATTGGAATTGTTGGGCGAACGGGAAGCGGAAAGTCAAC 3952
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4208 TGTGTTTCCGGGTGGAAAAAAGATTGGGATTGTTGGGCGAACGGGAAGCGGAAAGTCGAC 4267
Query 3953 TTTGATTCAAGCTTTGTTTCGATTGATTGAGCCAACTGCTGGAAAAATTACTATAGACAA 4012
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4268 TTTGATTCAAGCTTTGTTTCGATTGATTGAGCCAACTGCTGGAAAAATTACTATTGACAA 4327
Query 4013 CATTGACATTTCTCAAATTGGTCTTCATGATCTCCGTAGTCGCCTTGGTATTATACCTCA 4072
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4328 CATTGACATTTCTCAAATTGGTCTTCATGATCTTCGTAGTCGCCTTGGGATTATACCTCA 4387
Query 4073 AGATCCTACATTATTTGAAGGAACAATCCGAGCAAATCTTGACCCCCTTGAAGAACATTC 4132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4388 AGATCCTACATTATTTGAAGGAACAATCCGAGCAAATCTTGACCCACTTGAAGAACATTC 4447
Query 4133 AGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAATCCCAGCTTGGAGACGTTGTTAGAGGAAA 4192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4448 AGATGATAAAATCTGGGAGGCGCTTGATAAATCCCAGCTTGGAGACGTTGTTAGAGGAAA 4507
Query 4193 AGACCTAAAACTTGACTCTCCAGTGCTGGAAAATGGAGATAACTGGAGTGTTGGGCAGAG 4252
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4508 AGACCTAAAACTTGACTCTCCAGTACTGGAAAATGGAGATAACTGGAGTGTAGGGCAGAG 4567
Query 4253 ACAGCTTGTGTCACTTGGACGAGCATTACTGAAACAAGCAAAAATACTTGTTCTTGATGA 4312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4568 ACAGCTTGTGTCACTTGGACGAGCATTACTGAAACAAGCCAAAATACTTGTTCTTGATGA 4627
Query 4313 AGCAACAGCATCAGTTGACACAGCAACAGACAATCTGATCCAGAAGATAATCAGAACCGA 4372
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4628 AGCAACAGCATCGGTTGACACAGCAACAGACAATCTGATCCAGAAGATAATCAGAACAGA 4687
Query 4373 GTTTGAAGACTGCACGGTCTGCACCATTGCTCACCGGATACCAACTGTTATCGACAGTGA 4432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4688 GTTTGAAGACTGCACGGTCTGCACCATTGCTCACCGGATACCAACTGTTATAGACAGTGA 4747
Query 4433 CCTAGTTTTGGTTCTCAGCGACGGTAGAGTAGCAGAGTTTGATACTCCTGCACGGCTTTT 4492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4748 CCTAGTTTTGGTTCTCAGCGACGGTAGAGTAGCAGAGTTTGATACTCCTGCACGGCTATT 4807
Query 4493 AGAAGACAAATCATCGATGTTCTTGAAACTGGTAACAGAATACTCCTCAAGATCTACTGG 4552
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4808 AGAAGACAAATCATCGATGTTCTTGAAATTGGTAACAGAATACTCCTCAAGATCTACTGG 4867
Query 4553 AATCCCTGAATTATGATCATCCATGTTAAAA-TTCAGT 4589
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 4868 AATCCCTGAATTATGATCCTCCATGTTAAAAATTCAGT 4905
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 228861593966
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5