BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg919881
Length=4236
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G10760.1 | Symbols: SEX1, SOP1, SOP, GWD1, GWD | Pyruvate ph... 7160 0.0
> AT1G10760.1 | Symbols: SEX1, SOP1, SOP, GWD1, GWD | Pyruvate
phosphate dikinase, PEP/pyruvate binding domain | chr1:3581034-3590928
REVERSE LENGTH=4670
Length=4670
Score = 7160 bits (3877), Expect = 0.0
Identities = 4126/4247 (97%), Gaps = 13/4247 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGTTTGATTCAGTGACAAGAAAGCATGAGTAACTCTGTAGTGCATAACATACTAAACCG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 270 AAGTTTGATTCAGTGACAAGAAAGCATGAGTAACTCTGTAGTGCATAACTTACTTAACCG 329
Query 61 GGGTTTGATTCGTCCTCTTAACATTGAACATCAAAACAAGCTCAACTCGTCTGTGTACCA 120
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 330 GGGTTTGATTCGTCCTCTTAACTTTGAACATCAAAACAAGCTCAACTCCTCTGTGTACCA 389
Query 121 AACCTCAACGGTAAATTCGGCTGTTGGGAAGATTGGCAGATCAAAACTCTACGGGAAAGG 180
||| ||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 390 AACTTCAACAGCAAATCCGGCTCTTGGCAAGATTGGCAGATCAAAACTTTACGGGAAAGG 449
Query 181 TCTTAA-CAAGGCAGGACGGAGTCTGATCACT-------GA--AAGACCTCTCTCATTTG 230
|||||| | |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 450 TCTTAAGC-AGGCAGGACGCAGTCTGGTCACTGAAACAGGAGGAAGACCTCTCTCATTTG 508
Query 231 TTCCACGAGCTGTTCTTGCCATGGATCCTCAGGCAGCCGAGAAATTTAGTCTTGACGGTA 290
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 509 TTCCACGAGCTGTCCTTGCCATGGATCCTCAGGCAGCCGAGAAATTTAGTCTTGACGGAA 568
Query 291 ATATTGACTTACTGGTTGAAGTCACTTCTACAACTGTAAGAGAAGTAAATATCCAGATAG 350
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 ATATCGATTTACTGGTTGAAGTCACTTCTACAACTGTAAGAGAAGTAAATATCCAGATAG 628
Query 351 CATATACAAGTGACTCATTGTTTCTACACTGGGGTGCAATTCGTGACAACAAAGAAAATT 410
| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 629 CTTATACAAGTGACACATTGTTCCTACACTGGGGTGCAATTCTTGACAACAAAGAAAATT 688
Query 411 GGGTTCTACCTTCTCGCTCTCCGGATAGAACTCAAAACTACAAGAACAGTGCCCTTAGAA 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 689 GGGTTCTACCTTCTCGCTCTCCGGATAGAACTCAAAACTTCAAGAACAGTGCGCTTAGAA 748
Query 471 CTCCATTTGTAAAATCCGGTGGCAATTCTCACCTTAAACTAGAGATAGATGATCCTGCCA 530
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 CTCCATTTGTGAAATCCGGTGGCAATTCTCACCTTAAACTAGAGATAGATGATCCTGCCA 808
Query 531 TACACGCTATTGAGTTCCTTATATTTGACGAGAGTCGGAACAAATGGTATAAAAATAATG 590
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 TACACGCTATTGAGTTCCTTATATTTGACGAAAGTCGGAACAAATGGTATAAAAATAATG 868
Query 591 GTCAGAATTTTCATATACACTTACCAACGGAAAGGAATGCGAAACAAAATGTTTCTGTTC 650
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 869 GTCAGAATTTTCATATAAACTTACCAACGGAAAGGAATGTGAAACAAAATGTTTCTGTTC 928
Query 651 CTGAAGATCTTGTACAGATCCAAGCGTATCTTAGATGGGAACGTAAGGGTAAACAAATGT 710
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 CTGAAGATCTTGTACAGATCCAAGCATATCTTAGATGGGAACGTAAGGGTAAACAAATGT 988
Query 711 ATACCCCTGAGAAAGAGAAGGAGGAGTATGAAGCCGCCCGCATGGAGCTACAGGAGGAAG 770
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||
Sbjct 989 ACAACCCTGAGAAAGAGAAGGAGGAGTATGAAGCCGCCCGGACGGAGCTACGGGAGGAAA 1048
Query 771 TGATGCGAGGTGCTTCAGTGGAAGATCTCAGAGCAAAGTTGTTGAAGAAAGATAACACTA 830
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 1049 TGATGCGAGGTGCTTCAGTGGAAGATCTCAGAGCAAAGCTGTTGAAGAAAGATAACAGTA 1108
Query 831 ATGAATCCCCAAAGTCTAATGGGACTTCATCCAGTGGACGGAAGGAAAAGAAAAAACTTT 890
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1109 ATGAATCCCCAAAATCTAATGGGACATCATCCAGTGGACGGGAGGAAAAGAAAAAAGTTT 1168
Query 891 CCAAGCAACCAGAGCGTaaaaaaaaTTATAACACTGAGAAGATCCAGCGCAAGGAAAGGG 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1169 CCAAGCAACCAGAGCGTAAAAAAAATTATAACACTGACAAGATCCAGCGCAAGGGAAGGG 1228
Query 951 ACCTGAATAAGCTTATCTATAAGCATGTTGCTGATTCTGTTGAACCAGAATCCAAATCCT 1010
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 ACCTGACTAAGCTTATCTATAAGCATGTTGCTGATTTTGTTGAACCAGAATCCAAATCCT 1288
Query 1011 CATCTGAACCACGGTCCTTAACAACCCTGGAGATATACGCCAAAGCAAAGGAGGAACAAG 1070
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289 CATCTGAACCACGGTCCTTAACAACTCTGGAGATATACGCCAAAGCAAAGGAGGAACAAG 1348
Query 1071 AAACCACTCCAGTCTTTAGCAAGAAAACATTCAAGCTTGAAGGCAGTGCGATTTTGGTGT 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 AAACCACTCCAGTCTTTAGCAAGAAAACATTCAAGCTTGAAGGCAGTGCGATTTTGGTGT 1408
Query 1131 TTGTTACTAAACTTTCCGGAAAGACGAAAATTCATGTGGCAACCGATTTCAAAGAGCCGG 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1409 TTGTTACTAAACTTTCCGGAAAGACGAAAATTCATGTGGCAACTGATTTTAAAGAGCCGG 1468
Query 1191 TTACCCTTCACTGGGCTTTGTCTCAAAAGGGTGGAGAATGGTTGGACCCACCTTCAGATA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 TTACCCTTCACTGGGCTTTGTCTCAAAAGGGTGGAGAATGGTTGGACCCACCTTCAGATA 1528
Query 1251 TACTGCCACCAAACTCTTTGCCAGTACGTGGTGCGGTTAATACAAAACTGACCATTACTT 1310
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1529 TACTGCCACCAAACTCTTTGCCAGTACGTGGTGCTGTTGATACAAAACTGACCATCACTT 1588
Query 1311 CAACAGATCTTCCTAGTCCGGTTCAAACTTTTGAGCTGGAAATAGAAGGTGACAGCTACA 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1589 CAACAGATCTTCCTAGTCCGGTTCAAACTTTTGAGCTGGAAATAGAAGGTGACAGCTACA 1648
Query 1371 AGGGCATGCCGTTTGTACTCAATGCTGGTGAAAGGTGGATTAAAAATAATGGCAGTGACT 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1649 AGGGCATGCCGTTTGTACTCAATGCTGGTGAAAGGTGGATTAAAAATAATGACAGTGACT 1708
Query 1431 TTTATGTGGACTTTGCTAAAGAAGAAAAACATGTTCAGAAGGATTATGGCGATGGAAAAG 1490
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1709 TTTATGTGGACTTTGCTAAAGAAGAAAAACATGTTCAGAAGGATTATGGCGATGGAAAGG 1768
Query 1491 GTACAGCCAAGCATTTACTGGATAAAATCGCAGATTTGGAGAGTGAGGCCCAGAAGTCTT 1550
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 GTACAGCCAAGCATTTACTGGACAAAATCGCAGATTTGGAGAGTGAGGCCCAGAAGTCTT 1828
Query 1551 TCATGCATCGATTCAACATTGCAGCAGATCTTGTGGACGAGGCAAAAAGTGCTGGTCAAC 1610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 TCATGCATCGATTCAACATTGCAGCAGATCTTGTGGACGAGGCAAAAAGTGCTGGTCAAC 1888
Query 1611 TGGGCTTCGCAGGGATCCTAGTCTGGATGAGGTTTATGGCTACAAGACAGCTTGTGTGGA 1670
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1889 TGGGCTTTGCAGGGATCCTAGTCTGGATGAGGTTTATGGCTACAAGACAGCTTGTGTGGA 1948
Query 1671 ATAAAAACTATAATGTTAAGCCACGGGAGATAAGCAAAGCGCAGGATAGACTGACTGACC 1730
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 ACAAAAACTATAATGTTAAGCCAAGGGAGATAAGCAAAGCGCAGGATAGACTGACTGACC 2008
Query 1731 TTCTCCAGGACGTTTATGCAACTTATCCCGAGTACAGAGAACTTTTGCGGATGATAATGT 1790
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 TTCTCCAGGACGTTTATGCAAGTTATCCAGAGTACAGAGAACTTTTGCGGATGATAATGT 2068
Query 1791 CTACTGTAGGTCGAGGCGGTGAAGGAGATGTCGGGCAACGAATCCGTGACGAAATTCTAG 1850
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 CTACTGTAGGTCGAGGAGGTGAAGGAGATGTCGGGCAACGAATCCGTGACGAAATTCTAG 2128
Query 1851 TCATCCAGCGGAAAAATAACTGCAAGGGTGGAATTATGGAGGAATGGCATCAGAAGTTGC 1910
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129 TCATCCAGCGGAAAAATGACTGCAAGGGTGGAATTATGGAGGAATGGCATCAGAAGTTGC 2188
Query 1911 ATAACAACACTAGTCCAGATGATGTTGTCATCTGTCAGGCATTGATGGATTATATCAAAA 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2189 ATAACAACACTAGTCCAGATGATGTTGTCATCTGTCAGGCATTGATGGATTATATCAAAA 2248
Query 1971 GTGACTTTGACATAAGTGTTTACTGGAAGACCTTGAACGATAATGGCATAACCAAAGAGC 2030
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2249 GTGACTTTGACTTAAGTGTTTACTGGAAGACCTTGAACGATAATGGCATAACCAAAGAGC 2308
Query 2031 GACTCTTAAGTTATGATCGTGCCATACATTCTGAACCAAATTTTAGAGGAGAACAAAAAG 2090
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309 GACTCTTAAGTTATGATCGTGCTATACATTCTGAACCAAATTTTAGAGGAGAACAAAAAG 2368
Query 2091 ATGGTCTTTTGCGTGATCTTGGACACTACATGAGGACTTTAAAGGCTGTTCATTCAGGGG 2150
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACGGTCTTTTGCGTGATCTTGGACACTACATGAGGACTTTAAAGGCTGTTCATTCAGGGG 2428
Query 2151 CAGACCTTGAGTCGGCTATACAAAATTGCATGGGCTACCAAGATGACGGTGAAGGTTTCA 2210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2429 CAGACCTTGAGTCGGCTATACAAAATTGCATGGGCTACCAAGATGACGGTGAAGGTTTCA 2488
Query 2211 TGGTTGGGGTGCAGATAAATCCTGTATCAGGATTGCCTTCTGGATATCCAGACTTGCTTC 2270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2489 TGGTTGGGGTGCAGATAAATCCTGTATCAGGATTGCCTTCTGGATATCCAGACTTGCTTC 2548
Query 2271 GTTTCGTCCTAGAACATGTTGAAGAAAAGAATGTAGAGCCACTTCTTGAGGGTTTGCTTG 2330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2549 GTTTCGTCCTAGAACATGTTGAAGAAAAGAATGTAGAGCCACTTCTTGAGGGTTTGCTTG 2608
Query 2331 AAGCTCGTCAAGAGCTAAGGCCACTTCTGCTGAAGTCCCATGACCGCCTCAAGGATCTGT 2390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2609 AAGCTCGTCAAGAGCTAAGGCCACTTCTGCTGAAGTCCCATGACCGCCTCAAGGATCTGT 2668
Query 2391 TATTCTTGGACCTCGCTCTCGATTCTACTGTCAGAACAGCTATTGAAAGAGGATATGAGC 2450
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2669 TATTCTTGGACCTCGCTCTTGATTCTACTGTCAGAACAGCGATTGAAAGAGGATATGAGC 2728
Query 2451 AATTGAATGATGCTGGACCTGAGAAAATCATGTACTTCATCAGCCTAGTTCTTGAAAATC 2510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729 AATTGAATGATGCTGGACCTGAGAAAATCATGTACTTCATCAGCCTAGTTCTTGAAAATC 2788
Query 2511 TTGCCCTTTCGTCAGATGACAATGAAGACCTTATATACTGCTTGAAGGGATGGAAATTTG 2570
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2789 TTGCCCTCTCTTCAGATGACAATGAAGACCTTATATACTGCTTGAAGGGATGGCAATTTG 2848
Query 2571 CCCTC-AGCATGTGCAAGAGCAAAAAAGATCACTGGGCTCTGTATGCAAAATCTGTTCTT 2629
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2849 CCCTCGA-CATGTGCAAGAGCAAAAAAGATCACTGGGCTCTGTATGCAAAATCTGTTCTT 2907
Query 2630 GACAGAAGCCGACTAGCACTGGCAAGCAAAGCTGAGAGGTACCTTGAAATTCTGCAACCA 2689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2908 GACAGAAGCCGACTAGCACTGGCAAGCAAAGCTGAGAGGTACCTTGAAATTCTGCAACCA 2967
Query 2690 TCTGCTGAATATCTTGGATCTTGTCTTGGAGTCGATCAGTCGGCTGTTAGTATATTTACT 2749
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2968 TCGGCTGAATATCTTGGATCTTGTCTTGGAGTCGATCAGTCGGCTGTTAGTATATTTACT 3027
Query 2750 GAAGAGATCATTCGAGCTGGATCTGCAGCAGCATTGTCTTCACTTGTTAACCGACTTGAC 2809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 GAAGAGATCATTCGAGCTGGATCTGCAGCAGCATTGTCGTCACTTGTTAACCGACTTGAC 3087
Query 2810 CCAGTTCTTAGGAAGACTGCTAACTTGGGAAGTTGGCAGGTTATAAGTCCTGTAGAGGTC 2869
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3088 CCAGTTCTTAGGAAGACTGCTAACTTGGGAAGTTGGCAGGTTATTAGTCCTGTAGAGGTC 3147
Query 2870 GTCGGTTATGTCATTGTTGTGGATGAATTGCTCACTGTACAGAATAAAACCTACGACAGA 2929
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3148 GTCGGATATGTCATTGTTGTGGACGAATTGCTCACTGTACAGAATAAAACCTACGATAGA 3207
Query 2930 CCTACAATTATAGTAGCAAACAGAGTGAGAGGAGAGGAGGAGATCCCTGATGGTGCAGTT 2989
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3208 CCTACAATTATAGTTGCAAACAGAGTGAGAGGAGAGGAGGAAATCCCTGATGGTGCAGTT 3267
Query 2990 GCGGTACTGACACCTGACATGCCGGATGTACTATCTCATGTTTCTGTTCGAGCAAGAAAT 3049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3268 GCGGTACTGACACCTGACATGCCGGATGTACTATCTCATGTTTCTGTTCGAGCAAGAAAT 3327
Query 3050 GGAAAGATCTGCTTTGCCACATGTTTTGATTCTGGTATCTTATCTGACCTCCAAGGAAAG 3109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3328 GGAAAGATCTGCTTTGCCACATGTTTTGATTCTGGTATCTTATCTGACCTCCAAGGAAAA 3387
Query 3110 GATGGAAAACTGTTGAGCCTAGAACCAACCTCTGCAAATGTAGTCTATAAAGAGGTAAAC 3169
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3388 GATGGAAAACTGTTGAGCCTACAACCAACCTCTGCAGATGTAGTCTATAAAGAGGTAAAC 3447
Query 3170 GATAGTGAGCTTTCGAGTCCAAGTTCAGACAACTTAGAAGATGCCCCTCCAAGTATTTCT 3229
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3448 GATAGTGAGCTTTCGAGTCCAAGTTCAGACAACCTGGAAGATGCCCCTCCAAGTATTTCT 3507
Query 3230 TTGGTCAAGAAACAGTTTGCGGGTAGATATGCTATATCATCTGAGGAGTTCACTAGTGAC 3289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3508 TTGGTCAAGAAACAGTTTGCGGGTAGATATGCTATATCATCTGAGGAGTTCACAAGTGAC 3567
Query 3290 TTGGTTGGTGCTAAATCAAGAAATATCGGATATCTGAAAGGAAAAGTTCCTTCTTGGGTT 3349
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3568 TTGGTTGGTGCTAAATCAAGAAATATCGGGTATCTGAAAGGAAAAGTTCCTTCTTGGGTT 3627
Query 3350 GGTATCCCAACTTCAGTTGCGTTGCCATTTGGTGTTTTTGAGAAGGTTATCTCCGAAAAG 3409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3628 GGTATCCCAACTTCAGTTGCGTTGCCATTTGGTGTTTTTGAGAAGGTTATCTCCGAAAAG 3687
Query 3410 GCGAATCAGGCGGTGAACGAGAAATTGCTAGTATTGAAGAAAACTCTTGATGAGGGGGAC 3469
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3688 GCGAATCAGGCGGTGAACGATAAATTGCTAGTATTGAAGAAAACTCTTGATGAGGGAGAC 3747
Query 3470 CAAGGTGCTCTGAAGGAAATCCGTCAGACACTGTTGGGGCTAGTTGCACCCCCAGAACTG 3529
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3748 CAAGGTGCTCTGAAGGAAATCCGGCAGACACTGTTGGGGCTAGTTGCACCCCCAGAACTG 3807
Query 3530 GTTGAAGAACTGAAAAGTACTATGAAAAGTTCTGACATGCCATGGCCAGGTGATGAAGGT 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3808 GTTGAAGAACTGAAAAGTACTATGAAAAGTTCTGACATGCCATGGCCGGGTGATGAAGGT 3867
Query 3590 GACCAGAGATGGGAGCAAGCTTGGGCAGCCATTAAAAAAGTCTGGGCTTCGAAATGGAAC 3649
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3868 GAACAGAGATGGGAGCAAGCTTGGGCAGCCATTAAAAAGGTCTGGGCTTCGAAATGGAAC 3927
Query 3650 GAGAGAGCATACTTCAGCACGAGGAAAGTAAAACTGGATCATGACTATCTCTGCATGGCT 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3928 GAGAGAGCATACTTCAGCACGAGGAAAGTAAAACTGGATCATGACTATCTCTGCATGGCT 3987
Query 3710 GTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCGGATTACGCATTTGTCATTCACACAACTAACCCA 3769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3988 GTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCGGATTACGCATTCGTCATTCACACAACTAATCCA 4047
Query 3770 TCTTCTGGAGATTCATCAGAGATTTACGCTGAGGTTGTGAAAGGCCTTGGTGAAACTCTT 3829
|||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 4048 TCTTCTGGAGATTCATCAGAGATTTATGCCGAGGTGGTCAAAGGCCTTGGGGAAACTCTT 4107
Query 3830 GTAGGAGCATATCCCGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCTGCAAGAAAAACAACCTTGATTCG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4108 GTAGGAGCATATCCCGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCTGCAAGAAAAACAACCTTGATTCG 4167
Query 3890 CCTCTGGTGTTGGGTTACCCAAGCAAACCGATTGGGTTGTTCATAAGACGTTCAATCATC 3949
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4168 CCTCTGGTGTTGGGCTACCCAAGCAAACCGATTGGGCTGTTCATAAGACGTTCAATCATC 4227
Query 3950 TTCAGATCTGATTCCAATGGAGAAGATCTTGAAGGTTATGCAGGTGCAGGCCTCTACGAC 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4228 TTCAGATCTGATTCCAATGGAGAAGATCTTGAAGGTTATGCAGGTGCAGGCCTCTACGAC 4287
Query 4010 AGTGTCCCAATGGACGAGGAAGACCAAGTCGTGCTCGATTACACTACAGATCCTCTGATC 4069
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4288 AGTGTACCAATGGACGAGGAAGACCAAGTCGTGCTCGATTACACAACAGATCCTCTGATC 4347
Query 4070 ACTGACGAGAGCTTCCAGAAAAAGATTCTCTCAGACATTGCACGCGCCGGAGATGCCATT 4129
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4348 ACTGACTTGAGCTTCCAGAAAAAGGTTCTCTCAGACATTGCACGCGCTGGAGATGCCATT 4407
Query 4130 GAGAAACTCTATGGAACTGCACAGGACATTGAAGGTGTGATCAGAGATGGGAAGCTCTAT 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4408 GAGAAACTCTATGGAACTGCACAGGACATTGAAGGTGTGATCAGAGACGGGAAGCTCTAT 4467
Query 4190 GTCGTCCAGACACGGCCGCAAGTGTGATCAAATTCTCCGACCACTTC 4236
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4468 GTCGTCCAGACACGACCACAAGTGTGATCAAATTCTCTGACCACTTC 4514
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 211152663087
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5