BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg920472
Length=2353
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G15690.1 | Symbols: AVP1, ATAVP3, AVP-3, AtVHP1;1 | Inorgani... 3873 0.0
> AT1G15690.1 | Symbols: AVP1, ATAVP3, AVP-3, AtVHP1;1 | Inorganic
H pyrophosphatase family protein | chr1:5398990-5402519
FORWARD LENGTH=2772
Length=2772
Score = 3873 bits (2097), Expect = 0.0
Identities = 2273/2359 (96%), Gaps = 8/2359 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTCTCTTAT-CGGA-G-GAG-AGATGGTGGCGCCTGCTTTATTACCGGAGCTCTGGACG 56
|||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 102 TTTCTCTTATACGGAGGAGAGAAGATGGTGGCGCCTGCTTTGTTACCGGAGCTCTGGACG 161
Query 57 GAGATCCTTGTACCGATTTGTGCGGTGATTGGTATCGCGTTTTCGCTTTTCCAATGGTAC 116
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 162 GAGATCCTTGTACCGATTTGTGCGGTGATTGGTATCGCCTTTTCGCTTTTCCAATGGTAC 221
Query 117 GTTGTATCTCGCGTGAAACTCACCACTGACCTCGGCGCATCGTCTTCTGGTGGAGCTAAC 176
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 222 GTTGTATCTCGCGTGAAACTCACCTCTGACCTCGGCGCATCGTCTTCCGGTGGAGCTAAC 281
Query 177 AATGGGAAGAATGGATACGGTGATTATCTAATCGAGGAAGAGGAAGGTGTTAATGACCAG 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 AATGGGAAGAATGGATACGGTGATTATCTAATCGAGGAAGAGGAAGGTGTTAATGACCAG 341
Query 237 AGTGTTGTCGCTAAGTGCGCTGAGATTCAGACTGCTATATCTGAAGGTGCAACTTCATTC 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 342 AGTGTTGTCGCTAAGTGCGCTGAGATTCAGACTGCTATTTCCGAAGGTGCAACTTCATTC 401
Query 297 CTGTTCACGGAGTACAAATATGTTGGTGTCTTCATGATTTTCTTTGCTGCTGTTATCTTT 356
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 CTATTCACGGAGTACAAATATGTTGGTGTCTTCATGATTTTCTTTGCTGCTGTTATCTTT 461
Query 357 GTTTTCCTCGGCTCTGTTGAGGGATTCAGCACTGATAACAAGCCTTGTACTTACGACACC 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 GTTTTCCTCGGCTCTGTTGAGGGATTCAGCACTGATAACAAGCCTTGTACTTACGACACC 521
Query 417 ACCAGAACTTGCAAGCCTGCATTGGCTACTGCTGGTTTCAGTACCATTGCTTTCGTGCTT 476
|||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 ACCAGAACCTGCAAGCCTGCATTGGCTACTGCAGCTTTCAGTACCATTGCTTTCGTGCTT 581
Query 477 GGTGCTGTTACCTCTGTTCTCTCTGGTTTCCTTGGGATGAAGATTGCTACATACGCTAAT 536
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 GGTGCTGTTACCTCTGTTCTATCTGGTTTCCTTGGGATGAAGATTGCTACATACGCTAAT 641
Query 537 GCTAGAACCACCTTGGAAGCGAGGAAAGGTGTTGGAAAGGCGTTCATTGTTGCATTCAGG 596
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 GCTAGGACCACTTTGGAGGCGAGGAAAGGTGTTGGAAAGGCGTTCATTGTTGCATTCAGG 701
Query 597 TCTGGTGCTGTGATGGGATTCCTGCTTGCAGCGAGTGGTTTGTTGGTGCTTTACATTACT 656
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 702 TCTGGTGCTGTGATGGGTTTCCTTCTTGCAGCGAGTGGTCTATTGGTGCTTTACATTACT 761
Query 657 ATCAATGTGTTCAAGATCTATTATGGAGATGACTGGGAAGGTCTGTTTGAGGCTATTACT 716
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 762 ATCAATGTGTTCAAGATCTATTACGGAGATGACTGGGAAGGTCTTTTTGAGGCTATTACT 821
Query 717 GGTTACGGGCTTGGTGGGTCTTCCATGGCTCTCTTTGGCCGTGTTGGTGGTGGGATCTAC 776
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 GGTTATGGTCTTGGTGGGTCTTCCATGGCTCTCTTTGGCCGTGTTGGTGGTGGGATCTAC 881
Query 777 ACTAAGGCAGCTGATGTTGGCGCTGACCTTGTCGGTAAAATTGAGAGGAATATTCCTGAG 836
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 882 ACTAAGGCTGCTGATGTCGGCGCTGACCTTGTCGGTAAAATTGAGAGGAATATTCCAGAG 941
Query 837 GATGATCCAAGAAACCCTGCTGTCATTGCTGATAATGTCGGTGACAATGTTGGTGACATT 896
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 GATGATCCAAGAAACCCAGCTGTCATTGCTGATAATGTCGGTGACAATGTTGGTGACATT 1001
Query 897 GCTGGTATGGGATCTGATCTCTTTGGGTCATATGCTGAAGCATCATGTGCTGCTCTTGTT 956
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1002 GCTGGTATGGGATCTGATCTCTTTGGATCATATGCTGAAGCATCATGCGCTGCTCTTGTT 1061
Query 957 GTTGCTTCCATCTCTTCGTTT-GGAATCAACCACGATTTCACTGCCATGTGCTACCCATT 1015
||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 GTTGCCTCGATCTCATC-TTTCGGAATCAACCACGACTTCACTGCCATGTGCTACCCATT 1120
Query 1016 GCTCATCAGTTCAATGGGGATCTTGGTTTGTTTGATCACAACTCTCTTCGCCACCGATTT 1075
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 1121 GCTCATCAGTTCAATGGGAATCTTGGTTTGTTTGATCACAACTCTCTTTGCCACTGACTT 1180
Query 1076 CTTTGAGATCAAGGTTGTTAAGGAGATTGAACCGGCATTGAAGAATCAGCTCATCATCTC 1135
||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1181 CTTTGAGATTAAGCTTGTCAAGGAGATTGAACCAGCATTGAAGAACCAGCTCATTATCTC 1240
Query 1136 AACTGTTATTATGACTGTTGGAATTGCTATTGTGTCATGGGTTGGCTTGCCGACCTCCTT 1195
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1241 AACTGTTATTATGACTGTTGGTATTGCTATTGTGTCATGGGTTGGCTTACCGACCTCCTT 1300
Query 1196 CACCATTTTCAACTTTGGAACACAAAAAGTTGTCAAGAACTGGCAGCTATTCCTGTGTGT 1255
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1301 TACCATCTTCAACTTTGGAACACAAAAAGTTGTCAAGAACTGGCAGCTATTCCTTTGTGT 1360
Query 1256 TTGTGTTGGTCTTTGGGCTGGACTCATTATTGGTTTCGTCACCGAATACTACACTAGCAA 1315
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 1361 TTGTGTTGGTCTTTGGGCTGGACTCATTATTGGTTTCGTCACTGAGTACTACACTAGTAA 1420
Query 1316 CGCATACAGCCCCGTGCAAGATGTTGCAGATTCATGCAGAACTGGTGCAGCTACCAATGT 1375
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421 CGCCTACAGCCCTGTGCAAGATGTTGCAGATTCATGCAGAACTGGTGCAGCTACCAATGT 1480
Query 1376 TATATTCGGACTTGCTCTTGGTTACAAATCCGTCATTATTCCAATCTTTGCAATTGCTAT 1435
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1481 TATCTTCGGCCTTGCTCTTGGTTACAAATCCGTCATTATTCCAATCTTTGCTATTGCTAT 1540
Query 1436 CAGTATATTCGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCTATGTATGGTGTTGCTGTTGCTGCTCTTGG 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 CAGTATATTCGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCTATGTATGGTGTTGCTGTTGCTGCTCTTGG 1600
Query 1496 CATGCTCAGTACCATTGCCACTGGTTTGGCAATTGATGCTTACGGTCCCATCAGTGACAA 1555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1601 TATGCTCAGTACCATTGCCACTGGTTTGGCAATTGATGCTTATGGTCCCATCAGTGACAA 1660
Query 1556 TGCTGGTGGTATTGCTGAAATGGCTGGTATGAGCCACCGCATCCGTGAAAGAACTGATGC 1615
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 TGCTGGTGGTATTGCTGAAATGGCTGGAATGAGCCACCGCATCCGTGAAAGAACTGATGC 1720
Query 1616 TCTTGATGCCGCTGGAAACACCACTGCTGCTATTGGAAAGGGATTTGCCATTGGCTCTGC 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1721 TCTTGATGCCGCTGGAAACACCACTGCTGCTATTGGAAAGGGATTTGCCATTGGCTCTGC 1780
Query 1676 TGCCCTAGTCTCCTTGGCTCTGTTTGGTGCCTTTGTGAGCCGTGCAGGGATCCACACCGT 1735
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 TGCCCTAGTCTCCTTGGCTCTCTTTGGTGCCTTTGTGAGCCGTGCAGGGATCCACACCGT 1840
Query 1736 GGATGTTTTGACCCCTAAAGTTATCATTGGGCTGCTTGTTGGTGCCATGCTTCCTTACTG 1795
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 AGATGTTTTGACCCCTAAAGTTATCATTGGGCTCCTTGTTGGTGCCATGCTTCCTTACTG 1900
Query 1796 GTTCTCTGCCATGACAATGAAGAGTGTGGGAAGTGCAGCTCTTAAGATGGTTGAAGAAGT 1855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901 GTTCTCTGCCATGACAATGAAGAGTGTGGGAAGTGCAGCTCTTAAGATGGTTGAAGAAGT 1960
Query 1856 TCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGACTCATGGAAGGAACCGCAAAACCCGACTACGC 1915
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1961 TCGCAGGCAGTTCAACACCATCCCTGGACTTATGGAAGGAACCGCAAAACCAGACTACGC 2020
Query 1916 CACATGTGTCAAGATCTCCACCGATGCATCCATCAAGGAAATGATTCCTCCTGGTTGCCT 1975
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2021 CACATGTGTCAAGATCTCCACCGATGCTTCCATCAAGGAAATGATACCTCCTGGTTGCCT 2080
Query 1976 TGTCATGCTTACACCTCTCATTGTTGGATTCTTCTTTGGGGTTGAGACCCTCTCTGGTGT 2035
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 TGTCATGCTCACACCTCTCATTGTTGGTTTCTTCTTTGGAGTTGAGACCCTCTCTGGTGT 2140
Query 2036 TCTCGCCGGCTCTCTTGTCTCTGGTGTTCAGATCGCCATATCAGCATCTAACACTGGTGG 2095
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141 CCTCGCCGGATCTCTTGTATCCGGTGTTCAGATCGCCATATCAGCATCTAACACTGGTGG 2200
Query 2096 TGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATTGAGGCTGGTGTATCAGAGCACGCAAAGAGCCT 2155
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2201 TGCCTGGGACAACGCCAAGAAATACATCGAGGCTGGTGTATCAGAGCACGCAAAGAGCCT 2260
Query 2156 TGGGCCAAAGGGATCAGAGCCACACAAGGCAGCTGTGATTGGAGACACAATTGGAGACCC 2215
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2261 TGGACCAAAGGGTTCAGAGCCACACAAGGCAGCTGTGATTGGAGACACAATTGGAGACCC 2320
Query 2216 ATTGAAGGATACTTCAGGACCTTCATTGAACATCCTCATCAAGCTCATGGCTGTTGAGTC 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321 ATTGAAGGATACTTCAGGACCTTCATTGAACATCCTCATCAAGCTCATGGCTGTTGAGTC 2380
Query 2276 TCTCGTCTTTGCTCCCTTCTTTGCCACTCACGGTGGTATCCTTTTCAAGTACCTCTAAAC 2335
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2381 TCTTGTCTTTGCTCCCTTCTTCGCCACTCACGGTGGTATCCTTTTCAAGTACTTCTAAAC 2440
Query 2336 TCAATCCGAGTGGA-GAAG 2353
|||||||||| ||| ||||
Sbjct 2441 TCAATCCGAG-GGAAGAAG 2458
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 116816668215
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5