BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg920834 Length=2625 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 4169 0.0 AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 1744 0.0 > AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | chr1:6528984-6532614 FORWARD LENGTH=3156 Length=3156 Score = 4169 bits (2257), Expect = 0.0 Identities = 2460/2561 (96%), Gaps = 2/2561 (0%) Strand=Plus/Plus Query 21 AATGATACGCCCAAAGCATATTAGTAACCTCTCAAGTACAGCAAGATCCTTTTTTCTGAA 80 |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 422 AATGATACGCGCTAAGCATATTAGTAACCTTTCAAGTACAGCAAGATCCTTTTTTCTGAA 481 Query 81 TGGATCGAGAACAAGTGTAGCTGACGGGAATTCGTGTGCGTACACGGACGATGAAACTTG 140 ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||| Sbjct 482 TGGATCGAGAACAAGTGTAACTGATGGGAATTCTTGTGTGTACTCGGATGATGAAAATTG 541 Query 141 TGTCTCGAGACGTCAGCAACTTAGGAAGGAAGCTGCACAGACTGAAAAACGACCATCCAG 200 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 542 TGTCTCGAAACGTCAGCAACTTAGGAAGGAAGCTGGACAGACTGAAAAACGACCATCCAG 601 Query 201 TATTCTCCCAAAGCCTTCAGTTGTGGGATGTATATTACCAGGAGAGGTAACTAAACCAGT 260 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 602 TATCCTCCCAAAGCCTTCAGTTGTGGGATGTATATTACCAGGAGAGGTAACAAAACCAGT 661 Query 261 GGTTCCAAAGAAGGTTGATGATTTTGGTCGGCCATCTCTATTGCCACAGCATGTTTCTTC 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 662 GGTTCCAAAGAAGGTTGATGATTTTGGTCGGCCATCTCTATTGCCACAGCATGTTTCTTC 721 Query 321 TTCCCCTGCTTTGCCGCTTAAATCAAATTCGGTTAATTATGCATCAACCATCATTAGAGA 380 ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||| Sbjct 722 TTCCCCTGCCTTGCCGCTTAAATCACATTCCGTTAACTATGCATCAACCGTCGTTAGAGA 781 Query 381 GGAGGTGGAAGGTAAAGCTTCTTCAGAACCTATTGGGGATCAGATTTTTAAGGCCGGTAT 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 782 GGAGGTGGAAGGTAAAGCTTCTTCAGAACCTATTGGGGATCAGATTTTCAAGGCTGGTAT 841 Query 441 TGTAGCAGTAAATTTTCTGTCAGATTTAGCGAATTGTAAGATTCCTTCGTATGATGGAGG 500 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 842 TGTTGCAGTAAATTTTCTGTCAGATTTATCGAATTGTAAGATTCCTTCATATGATGGAGG 901 Query 501 AAGTGAGGCATTTGGATTACCGAAAAGCTGTATGGTTGATCCAACACGGCCTATTTCAAG 560 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 902 AAGCGATGCATTTGGATTACCGAAAAGCTGTATGGTTGATCCAACACGGCCTATTTCAAG 961 Query 561 TGTCAAGTCGTCGAATGTGAAAGCTATAAGAAGAGAGCACTTTTCCAAAGTTTACCCTAG 620 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 962 TGTCAAGTCGTCGAATGTGAAAGCTATAAGAAGAGAGCACTTTGCCAAAATTTACCCTAG 1021 Query 621 ATCAGCTGCAAAAGAGTCGTCAATCGGTAAAACTAGAAATCCCAGTAGCAATTTCCGAGG 680 |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1022 ATCAGCTGCAAAAGAGTCGTCAGTTGGTACAACTAGAAATCCCAGTAGCAATTTTCGAGG 1081 Query 681 GGCCAAGGAAGCTGAAAGAACTGGATTTGTTAAAGGATTCAGACAAGTTTCTAATTCTGT 740 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1082 GGCCAAGGAAGCTGAAAGAACTGGGTTTGTTAAAGGATTCAGACAAGTTTCAAATTCTGT 1141 Query 741 GGTAGGAAAGTCATTACCCACAACAAATAACACATATGGCAAGAGGACAAGTGTGTTGCA 800 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1142 GGTAGGAAAGTCATTACCCACAACAAATAACACATATGGCAAGAGGACAAGCGTGTTGCA 1201 Query 801 AAGACCCCATATTGATTCGAACAGGTTTGTGCCAAGCGGTTTCAGTAATTCTTCAATGGA 860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1202 GAGACCCCATATTGATTCGAACAGGTTTGTGCCAAGCGGTTTCAGTAATTCTTCAGTGGA 1261 Query 861 AATGGTGAAAGGGCCTCCAGGGACTGCTCTGACATCAAGGCAGTATTGCAATTCCGGATA 920 |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | Sbjct 1262 AATGATGAAAGGACCTTCAGGGACTGCTCTGACATCAAGACAGTATTGTAATTCCGGACA 1321 Query 921 CATAGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTGCGAAGATTCAGATGGGGCCCTGCTGCCGAAGA 980 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 1322 CATTGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTACGAAGATTCAGGTGGGGGCCTGCTGCTGAAGA 1381 Query 981 GGCCCTTCAAAATCTCGGTTTGAGGATCGATGCATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAACA 1040 ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1382 GGCCCTTCAAAATCTAGGTTTGAGGATAGACGCATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAGCA 1441 Query 1041 GATGAATGACTATGGAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1442 GATGAATGACTATGGAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTT 1501 Query 1101 TAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTGGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATT 1160 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1502 TAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTTGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATT 1561 Query 1161 TGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTCAGAGACGGATGTCAGCCAAACACAGT 1220 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1562 TGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTTAGAGATGGATGTCAGCCAAACACAGT 1621 Query 1221 TACATATAATCGACTTATCCATAGCTATGGCCGCGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAA 1280 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1622 TACATATAACCGACTTATCCACAGCTATGGCCGTGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAA 1681 Query 1281 CGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCT 1340 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1682 TGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCT 1741 Query 1341 TATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTAGATATTGCCATGGATATGTACCAGAGAAT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1742 TATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATATGTACCAGAGAAT 1801 Query 1401 GCAAGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGG 1460 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1802 GCAGGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGG 1861 Query 1461 AAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAGGGTTG 1520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1862 AAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAAGGTTG 1921 Query 1521 TACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGACTTGCATGCCAAAGCGAGAAACTA 1580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1922 TACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGACTTGCATGCCAAAGCGAGAAACTA 1981 Query 1581 TCAGAGTGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAATGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGT 1640 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1982 TCAGAATGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAACGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGT 2041 Query 1641 GACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2042 GACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGC 2101 Query 1701 TGTTTTCACCGAGATGCAGCAGAAGAACTGGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTT 1760 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2102 TGTTTTCACCGAGATGCAACAGAAAAATTGGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTT 2161 Query 1761 GGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAGGCAAT 1820 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2162 GGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAAGCAAT 2221 Query 1821 GCTTCATGCTGGTCTGCTACCTAATGTTCCTACATGCAATTCCCTCCTTAGTACCTTCCT 1880 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 2222 GCTTCATGCTGGTCTGCGACCTAATGTTCCTACATGCAACTCCCTTCTTAGTACCTTCCT 2281 Query 1881 TAGGGTTAACAAGATAGCTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACATGCTGGCACTTGGTCT 1940 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2282 TAGGGTTAACAAGATAGCTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACATGCTGGCGCTTGGTCT 2341 Query 1941 ACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCACAGATGGTCGATCAAA 2000 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 2342 ACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCACGGATGGTCGGTCAAA 2401 Query 2001 ACTTGACATGGGTTTTTGTGGCCAGCTGATGGCAAGCACAGGTCATCCAGCACACATGTT 2060 |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2402 ACTTGATATGGGTTTCTGTGGCCAGTTGATGGCAAGCACAGGTCATCCAGCACATATGTT 2461 Query 2061 TCTCCTCAAGATGCCAGCAGCGGGTCCAAATGGCGAAAACGTGCGCAACCATGCGAACAA 2120 |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2462 TCTCCTCAAGATGCCAGCTGCGGGTCCGGATGGCGAAAACGTGCGCAACCATGCGAACAA 2521 Query 2121 CTTCCTGGATCTTATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGT 2180 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2522 TTTCCTGGATCTTATGCATAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGT 2581 Query 2181 GGTTGACTTTCTACACAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCGGGATCTGTTTGGGAAGTTGC 2240 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 2582 GGTTGACTTTCTACATAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCCGGATCTGTCTGGGAAGTTGC 2641 Query 2241 TGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCGTTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTAT 2300 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2642 TGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCATTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTAT 2701 Query 2301 CAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACTCTTGCTTG 2360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2702 CAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACGCTTGCTTG 2761 Query 2361 GTTCCGTAAGCAGATGTTAGTCT-CAGGAACTTTCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTG 2419 |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2762 GTTCCGTAAGCAGATGTTAG-CTTCAGGAACTTGCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTG 2820 Query 2420 GTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGCACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAAGAGC 2479 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2821 GTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGTACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAGGAGC 2880 Query 2480 TTCTCAACATCTTTGGTTCACCGTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCGGGTTGTTTCGTTG 2539 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2881 TGCTGAACATCTTTGGTTCACCGTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCAGGTTGTTTCGTTG 2940 Query 2540 GATGCGGAGAGCCTCTCAACAAATGGTTGCTGCAGTCTCAT 2580 || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2941 GAAGCGGAGAGCCTCTTAACAGATGGTTGCTGCAGTCTCAT 2981 > AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | chr1:28086800-28089367 FORWARD LENGTH=2568 Length=2568 Score = 1744 bits (944), Expect = 0.0 Identities = 1496/1764 (85%), Gaps = 32/1764 (2%) Strand=Plus/Plus Query 853 TCAATGGAAATGGTGAAAGGGCCTCCAGGGACTGCTCTGACATCAAGGCAGTATTGCAAT 912 |||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || Sbjct 817 TCAAGGGAAATGATGAAAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAA- 875 Query 913 TCC-GGATACATAGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTGCGAAGATTC-AGATGGGGCCCTG 970 || ||||| | || ||||||||||| || | ||||| |||||| || ||||| | || Sbjct 876 CCCTGGATATGTTGTAGAAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAG-TGGGGACATG 934 Query 971 CTGCCGAAGAGGCCCTTCAAAATCTCGGTTTGAGGATCGATGCATACCAAGCAAACCAAG 1030 ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| Sbjct 935 CTGCCGAAGAGGCCCTTCACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAG 994 Query 1031 TTCTTAAACAGATGAATGACTATG-GAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGG 1089 ||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| Sbjct 995 TTCTTAAGCAGATGGATAATTATGCG-AATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGG 1053 Query 1090 CAACCTGGGTTTAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTGGGTAATCTCGGTCGT 1149 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1054 CAACCTGGGTTCAAGCATGATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGT 1113 Query 1150 GCTAAGCAATTTGGTGCA-ATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTCAGAGACGGATGTCA 1208 || |||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||| | Sbjct 1114 GCAAAGCAATTCGGTG-AGATAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAA 1172 Query 1209 GCCAAACACAGTTACATATAATCGACTTATCCATAGCTATGGCCGCGCCAATTACCTGAA 1268 |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || Sbjct 1173 GCCAAATACTGTTACATATAACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAA 1232 Query 1269 CGAAGCTATGAACGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAAC 1328 ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| Sbjct 1233 AGAAGCGATGAATGTTTTTAATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAAC 1292 Query 1329 TTACTGTACCCTTATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTAGATATTGCCATGGATAT 1388 |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 1293 TTACTGTACCCTGATAGATATCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATAT 1352 Query 1389 GTACCAGAGAATGCAAGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAAT 1448 |||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 1353 GTACCAAAGAATGCAAGAAGCAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAAT 1412 Query 1449 AAACTGTCTTGGAAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGT 1508 |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| Sbjct 1413 AAACTGTCTTGGAAAAGCGGGCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGT 1472 Query 1509 TGATCAGGGTTGTACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGAC-TTGCATGCCA 1567 || ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| Sbjct 1473 TGGTCAAGGTTGTACTCCTAATTTGGTCACATTCAACATCATGATAG-CTTTGCATGCCA 1531 Query 1568 AAGCGAGAAACTATCAGAGTGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAATGCTGGGTTTG 1627 | ||| | || ||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| Sbjct 1532 AGGCGCGGAATTATGAGACTGCGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTC 1591 Query 1628 AGCCTGACAAAGTGACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCG 1687 | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct 1592 AACCTGACAAAGTGACCTACAGTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCG 1651 Query 1688 AGGAAGCAGAGGCTGTTTTCACCGAGATGCAGCAG-AAGAACTGGATTCCTGATGAGCCA 1746 |||||||||||| ||||||| | |||||||| | | ||||||||| |||||||||| || Sbjct 1652 AGGAAGCAGAGGGTGTTTTCGCTGAGATGCAAC-GTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCG 1710 Query 1747 GTTTATGGTCTTTTGGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGA-AAAGGCGTGGCA 1805 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| || ||||| Sbjct 1711 GTTTACGGTCTTTTGGTGGACTTGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAA-GCTTGGCA 1769 Query 1806 ATGGTATCAGGCAATGCTTCATGCTGGTCTGCTACCTAATGTTCCTACATGCAATTCCCT 1865 |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1770 GTGGTATCAAGCAATGCTTCAAGCCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCT 1829 Query 1866 CCTTAGTACCTTCCTTAGGGTTAACAAGATAG-CTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACA 1924 || || || ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||||||| || Sbjct 1830 TCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCCACAGGAT-GTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCA 1888 Query 1925 TGCTGGCACTTGGTCTACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCA 1984 ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| Sbjct 1889 TGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTTCTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCA 1948 Query 1985 CAGATGGTCGATCAAAAC-TTGACATGGGTTTTTGTGGCCAGCTGATGGCAAG-CACAGG 2042 |||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | |||| Sbjct 1949 CAGATGCTCGTTC-AAACTTTGACATGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGC-AGTCTCAGG 2006 Query 2043 TCATCCAGCACACATGTTTCTCCTCAAGATGCCAGCAGCGGGTCCAAATGGCGAAAACGT 2102 |||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| |||| || Sbjct 2007 TCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCAAAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGT 2066 Query 2103 GCGCAACCATG-CGAACAACTTCCTGGATCTTATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGC 2161 ||| | |||| | | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 2067 GCGTGATCATGTC-AGCAACTTCCTTGATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGC 2125 Query 2162 GAGGACTCGTGGATGCGGTGGTTGACTTTCTACACAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCGG 2221 |||||||| |||| || || || || ||||| |||||||| || | |||||||||||| | Sbjct 2126 GAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATTTTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTG 2185 Query 2222 GATCTGTTTGGGAAGTTGCTGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCGTTAAGGGAGAAAA 2281 | || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||| Sbjct 2186 GCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTAAGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAA 2245 Query 2282 GCTGCAGCTACTGGCTTATCAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGC 2341 ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | Sbjct 2246 GCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCCATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCAC 2305 Query 2342 TGTCTAGGACTCTTGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTAGTCTCAGGA-ACTTTCCCTTCT 2400 | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||| Sbjct 2306 TTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGT-CCTTCA 2364 Query 2401 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGCACATCAATGGTG 2460 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct 2365 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTT 2424 Query 2461 AGACAAGCAGTTGAAGAGCTT-CTCAACATCTTTGG-TTCACCGTTTTTCACGGAGAGTG 2518 |||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||||||||||| |||| | Sbjct 2425 AGACAAGCAGTTGAGGAA-TTGCTCAACATATTCAACTTC-CCGTTTTTCACTGAGAACG 2482 Query 2519 GAAACTCGGGTTGTTTCGTTGGATGCGGAGAGCCTCTCAACAAATGGTTGCT-GCAGTC- 2576 | ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| | | || Sbjct 2483 GGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAGAGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAA-TCA 2541 Query 2577 TCATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2600 | |||||||||||||||||||||| Sbjct 2542 T-ATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2564 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 130333717914 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5