BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg923242 Length=1533 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G48900.1 | Symbols: | Signal recognition particle, SRP54 su... 2571 0.0 AT5G49500.1 | Symbols: | Signal recognition particle, SRP54 su... 1836 0.0 AT1G15310.1 | Symbols: ATHSRP54A, SRP54-1 | signal recognition ... 1618 0.0 > AT1G48900.1 | Symbols: | Signal recognition particle, SRP54 subunit protein | chr1:18084782-18087879 REVERSE LENGTH=1814 Length=1814 Score = 2571 bits (1392), Expect = 0.0 Identities = 1480/1523 (97%), Gaps = 3/1523 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTGAATTCGCAAAGCAGCGAAAATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGC 60 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 115 TTGAATTCACAAAGCAGCGTAAATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGC 174 Query 61 GATACAGCAGATGAGCAATGTGACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGTTTGAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 175 GATACAGCAGATGAGCAATGTGACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGCTTGAA 234 Query 121 CGAGATCACTCGTGCTCTGCTTCAATCCGATGTTTCGTTTCCTCTTGTGAAGGAGATGCA 180 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| Sbjct 235 CGAGATCACTCGTGCTTTGCTTCAATCCGATGTTTCATTTCCCCTTGTGAAAGAGATGCA 294 Query 181 GAGTAATATCAAGAAGATCGTCAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAACGCCG 240 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 295 GAGTAATATTAAGAAAATCGTCAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAGCGCCG 354 Query 241 GATCATTGAACAGGCTATCTTTAGTGAACTTTGTAAGATGTTGGATCCAGGAAAGCCTGC 300 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 355 GATCATTGAACAGGCTATCTTTAGTGAACTCTGTAAGATGTTGGATCCAGGGAAGCCTGC 414 Query 301 GTTTGCTCCTAAAAAGGCTAAAGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTACAAGGTGCTGG 360 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 415 GTTTGCTCCTAAAAAAGCTAAAGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTACAAGGTGCTGG 474 Query 361 AAAGACGACAACTTGTACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGATACAAACCAGC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 475 AAAGACGACAACTTGTACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGATACAAACCAGC 534 Query 421 CCTAGTTTGTGCGGATACTTTCAGGGCCGGTGCTTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTAC 480 | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 535 TTTGGTTTGTGCGGATACTTTCAGGGCTGGTGCGTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTAC 594 Query 481 CAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 595 CAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGT 654 Query 541 TGAGGGAGTTGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACTAGTGG 600 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 655 TGAGGGAGTAGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACCAGTGG 714 Query 601 TCGCCATAAACAAGAAGCTACTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAA 660 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 715 TCGCCATAAACAAGAAGCTTCTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAA 774 Query 661 ACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 775 ACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGC 834 Query 721 TCAAGCCTTTAAGCAAAGTGTTGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCA 780 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 835 TCAAGCCTTTAAGCAGAGTGTTGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCA 894 Query 781 TGCCAAGGGTGGTGGTGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTAT 840 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 895 TGCCAAGGGTGGTGGGGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTAT 954 Query 841 CGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAACCATTTGTTAGCCG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 955 CGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAACCATTTGTCAGCCG 1014 Query 901 TCTCTTAGGAATGGGTGACTGGTCTGGATTTGTTGATAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAA 960 |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1015 TCTCTTAGGAATGGGTGATTGGTCTGGATTCGTGGATAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAA 1074 Query 961 AGATCAACAGCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACATTGAGAATTAT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1075 AGATCAACAGCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACGTTGAGAATTAT 1134 Query 1021 GTACGACCTGTTCCAGAATATACTGAACATGGGTCCACTTAAGGAGGTTTTCTCGATGCT 1080 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1135 GTACGACCAGTTCCAGAACATACTGAACATGGGTCCACTTAAGGAGGTTTTCTCAATGCT 1194 Query 1081 GCCTGGAATTAGTGCTGAAATGATGCCAAAAGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGAT 1140 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1195 GCCTGGAATTAGTGCTGAAATGATGCCGAAAGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGAT 1254 Query 1141 AAAGCGGTACATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1255 AAAGCGGTACATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCC 1314 Query 1201 AAAGGTGTTTAACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAG 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1315 AAAGGTGTTTAACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAG 1374 Query 1261 AGAAGTGATGGAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCTGCTAGCAAAGATATGGAGCAAGAT 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 1375 AGAAGTGATGGAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCT---AGCGAAGATATGGAGCAAGAT 1431 Query 1321 GAAAGGGCTCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAGTGCACTCTCGAGAAACATGAACGC 1380 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1432 GAAAGGACTCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAGTGCACTCTCGAGAAACATGAACGC 1491 Query 1381 ACAGCACATGAGCAAGGTCCTACCGCCGCAGATGCTCAAGCAGATTGGTGGCATGGGCGG 1440 ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1492 ACAGCACATGAGCAAGGTCCTCCCACCTCAGATGCTCAAGCAGATTGGCGGCATGGGCGG 1551 Query 1441 TCTGCAGAGTCTCATGAAGCAGATGGGTTCCGGCAAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGG 1500 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1552 TCTGCAGAGTCTAATGAAGCAGATGGGTTCCGGCAAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGG 1611 Query 1501 CGGAGACAAGTAGTTTCTTTCTT 1523 |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1612 CGGAGACAAGTAGTATCTTTCTT 1634 > AT5G49500.1 | Symbols: | Signal recognition particle, SRP54 subunit protein | chr5:20077556-20080206 REVERSE LENGTH=1494 Length=1494 Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0 Identities = 1340/1506 (89%), Gaps = 27/1506 (2%) Strand=Plus/Plus Query 23 ATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGCGATACAGCAGATGAGCAATGTG 82 ||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| Sbjct 1 ATGGTGTTGGCGGAGCTTGGAGGTCGGATTATGAGCGCCATACAGAAGATGAACAATGTG 60 Query 83 ACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGTTTGAACGAGATCACTCGTGCTCTGCTT 142 ||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACAATAATCGATGAAAAGGCTCTGAATGATTGCTTGAACGAGATCACTCGTGCTCTGCTC 120 Query 143 CAATCCGATGTTTCGTTT-CCTCTTGTGAAGGAGATGCAGAGTAATATCAAGAAGATCGT 201 || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| Sbjct 121 CAGTCCGATGTTTC-TTTCCCCCTTGTGAAGGAGATGCAGACCAATATTAAGAAAATCGT 179 Query 202 CAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAACGCCGGATCATTGAACAGGCTATCTT 261 ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| Sbjct 180 CAACCTTGAGGATCTAGCAGCCGGCCATAACAAGCGTCGTATCATTGAGCAGGCGATCTT 239 Query 262 TAGTGAACTTTGTAAGATGTTGGATCCAGGAAAGCCTGCGTTTGCTCCTAAAAAGGCTAA 321 |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || Sbjct 240 CAGTGAACTCTGTAAGATGTTGGATCCAGGAAAGTCTGCATTTGCTCCCAAAAAGGCCAA 299 Query 322 AGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTAC-A----AGGTGCTGGAAAGACGACAACTTGT 376 | |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| || ||||||||| Sbjct 300 ACCTAGTGTAGTTATGTTCGTCGGATTACAAGGTGAGGTGCTGGAAAAACCACAACTTGT 359 Query 377 ACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAG-AAAGGATACAAACCAGCCCTAGTTTGTGCGGA 435 || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 360 ACCAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAAGGGTACAAACCAGCTCTAGTGTGTGCGGA 419 Query 436 TACTTTCAGGGCCGGTGCTTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTACCAAGGCTAAGATCCC 495 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 420 TACTTTCAGGGCAGGTGCTTTTGATCAGCTGAAACAGAATGCCACCAAATCTAAGATCCC 479 Query 496 CTTTTATGGAAGCTACAC-GGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGTTGAGGGAGTTGATA 554 || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 CTATTATGGAAGTTACACAGG-ATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGTTGAGGGAGTTGATA 538 Query 555 CGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACTAGTGGTCGCCATAAACAAG 614 ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 539 GGTTCAAGAAAGAAAATTGTGATCTTATTATTGTTGACACCAGTGGTCGCCATAAACAAC 598 Query 615 AAGCTACTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAAACCAGATCTTGTTA 674 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 AAGCTTCTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAATTTCTGAAGCAACGAAACCAGATCTTGTTA 658 Query 675 TATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGCTCAAGCCTTTAAGC 734 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||| | Sbjct 659 TATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAACTGCGTTTGAACAAGCTCGAGCATTTAAAC 718 Query 735 AAAGTGTTGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCATGCCAAGGGTGGTG 794 ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 719 AAACTGTTGCTGTGGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGATGGTCATGCCAAGGGTGGTG 778 Query 795 GTG-CTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTATCGGAACAGGAGAG 853 | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct 779 G-GACTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACAAAAAGTCCTGTCATATTCATTGGAACAGGAGAG 837 Query 854 CATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACG-TCAAACCATTTGTTAGCCGTCTCTTAGGAA- 911 |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 838 CATATGGATGAGTTTGAAGTTTTTGATGCT-AAACCGTTTGTCAGCCGTCTCTTAGGAAA 896 Query 912 TGGGTGAC-TGGTCTGGATTTGTTGA-TAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAAAGATCAACA 969 ||| ||| || |||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 897 TGG-TGATATG-TCTGGATTCGT-GAATAAACTACAAGAGGTGGTACCTAAAGATCAACA 953 Query 970 GCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACATTGAGAATTATGTACGACCT 1029 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 954 GCCTGAACTTCTGGAAATGCTCTCTCATGGTAAATTTACATTGAGAATTATGTACGACCA 1013 Query 1030 GTTCCAGAATATACTGAACATGGGTCCACTTAAGGAGGTTTTCTCGATGCTGCCTGGAAT 1089 ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 1014 GTTCCAGAACATGCTGAACATGGGCCCACTTAAGGAGGTTTTCTCCATGCTACCTGGAAT 1073 Query 1090 TAGTGCTGAAATGATGCCAAAAGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGATAAAGCGGTA 1149 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1074 GCGTGCTGAAATGATGCCAGAGGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGATAAAGCGATA 1133 Query 1150 CATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCCAAAGGTGTT 1209 ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1134 CATGACAATGATGGACTCTATGACTAATGAAGAACTGGACAGCTCAAATCCAAAGGTGTT 1193 Query 1210 TAACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAA-GTAAGAGAAGTGA 1268 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 1194 TAACGAGTCAAGGATAATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGG-ATTGTAAGAGAAGTGA 1252 Query 1269 TGGAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCTGCTAGCAAAGATATGGAGCAAGATGAAAGGGC 1328 |||||||||||||||||||||| ||| | || ||| || ||| | ||| ||||||||| Sbjct 1253 TGGAGATGTTGGAAGAGTACAAAAGG-T--TAACAACTATGTGGGGGAAGGTGAAAGGGC 1309 Query 1329 TCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAGTGCACTCTCGAGAAACATGAACGCACAGCACA 1388 | |||| || | |||| ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||| | ||||| | Sbjct 1310 TTAAGAACCTAGAGAAAGGAAATATGAGCGCACTCTCAAAAAACAAGAACTCGCAGCA-A 1368 Query 1389 T-GAGCAAGGTCCTACCGCCGCAGATGCTCAAGCAGATTGGTGGCATGGGCGGTCTGCAG 1447 | ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| Sbjct 1369 TTGAGTAAGGTCCTACCGGCTCAGATGCTAAAGCAGATTGGCGGCATGAGTGGTCTGCAG 1428 Query 1448 AGTCTCATGAAGCAGATGGGTTCCGGCAAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGGCGGAGAC 1507 ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1429 AGTCTCATGAAGCAGATGGGTTCAGGTAAAGACCTGATGGGAATGTTCGGTGGCCGAGAC 1488 Query 1508 AAGTAG 1513 ||||| Sbjct 1489 GAGTAG 1494 > AT1G15310.1 | Symbols: ATHSRP54A, SRP54-1 | signal recognition particle 54 kDa subunit | chr1:5269019-5272058 REVERSE LENGTH=1705 Length=1705 Score = 1618 bits (876), Expect = 0.0 Identities = 1195/1346 (89%), Gaps = 33/1346 (2%) Strand=Plus/Plus Query 20 AAAATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGCGATACAGCAGATGAGCAAT 79 |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 109 AAAATGGTGTTGGCGGAGCTCGGCGGCCGGATAACCCGCGCCATACAGCAGATGAACAAT 168 Query 80 GTGACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGT-TTGAACGAGATCACTCGTGCTCT 138 |||||||| |||||||| |||| |||||||| || | || |||||||| ||||| ||| | Sbjct 169 GTGACAATAATCGATGAAAAGGTTTTGAATG-ATTTCTTAAACGAGATTACTCGCGCTTT 227 Query 139 GCTTCAATCCGATGTTTCGTTT-CCTCTTGT-GAAGGAGATGCAGAGTAATATCAAGAAG 196 ||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| Sbjct 228 GCTCCAGTCCGATGTTTCTTTTGGC-CTTGTGGAA-AAGATGCAGACCAATATTAAGAAG 285 Query 197 ATCGTCAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAACGCCGGATCATTGAACAGGCT 256 ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||| Sbjct 286 ATCGTTAACCTCGACGATCTAGCAGCTGGCCACAACAAACGCCTGATCATCGAGCAGGCT 345 Query 257 ATCTT-TAGTGAACTTTGTAAGATGTTGGATCCAGGAAAGCCTGCGTTTGCTCCTAAAAA 315 ||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct 346 ATCTTCAAG-GAACTCTGTAGGATGCTGGATCCAGGAAAGCCTGCCTTTGCCCCCAAAAA 404 Query 316 GGCTAAAGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTACAAGGTGCTGGAAAGACGACAACTTG 375 ||| ||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct 405 GGCCAAACCTAGTGTAGTGATGTTCGTCGGTTTACAAGGTGCTGGAAAAACCACAACATG 464 Query 376 TACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGATACAAACCAGCCCTAGTTTGTGCGGA 435 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| Sbjct 465 TACCAAGTATGCTTACTATCATCAGAAGAAAGGGTACAAAGCAGCTCTAGTGTGTGCGGA 524 Query 436 TACTTTCAGGGCCGGTGCTTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTACCAAGGCTAAGATCCC 495 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 525 TACTTTCAGGGCCGGTGCTTTTGATCAGCTGAAACAGAATGCCACCAAGGCTAAGATCCC 584 Query 496 CTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGTTGAGGGAGTTGATAC 555 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 585 CTTTTATGGAAGCTACACAGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGTTGAGGGAGTTGATAG 644 Query 556 GTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACTAGTGGTCGCCATAAACAAGA 615 ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 645 GTTCAAGAAAGAAAAGTGTGATCTTATTATTGTTGACACCAGTGGTCGCCATAAACAAGC 704 Query 616 AGCTACTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAAACCAGATCTTGTTAT 675 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 705 AGCTTCTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGGAACCAGATCTTGTTAT 764 Query 676 ATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGCTCAAGCCTTTAAGCA 735 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | Sbjct 765 ATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGAACAAGCTGAAGCTTTTAAGGA 824 Query 736 AAGTGT-TGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCATGCCAAGGGTGGTG 794 || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 825 AACTGTAT-CTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCATGCCAAGGGAGGTG 883 Query 795 GTGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTATCGGAACAGGAGAGC 854 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 884 GTGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACAAAAAGTCCTGTGATATTCATTGGAACAGGAGAGC 943 Query 855 ATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAACCATTTGTTAGCCGTCTCTTAGGAATGG 914 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || Sbjct 944 ATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTTAAACCATTTGTCAGCCGTCTCTTAGGAAAGG 1003 Query 915 GTGACTGGTCTGGATTTGTTGATAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAAAGATCAACAGCCTG 974 |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || Sbjct 1004 GTGATTGGTCTGGACTCGTGGATAAACTACAAGAGGTGGTACCTAAAGATCTACAGAATG 1063 Query 975 AACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACATTGAGAATTATGTACGACCTGTTCC 1034 ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 1064 AACTTGTAGAAAATCTCTCTCAGGGTAACTTTACGTTGAGAAGTATGTACGACCAGTTCC 1123 Query 1035 AGAA-TATACTGAACATGGGT-CCACTTAAGGAGGTTTTCTCGATGCTGCCTGGAATTAG 1092 || | | ||| | || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1124 AGTGCTCT-CTG--C--GGATTCCACTTAATCAGCTTTTCTCGATGCTGCCTGGAATTAG 1178 Query 1093 TGCTGAAATGATGCCAAAAGGACATGA-GAAAGAAAGCC-AGGCGAAGATAAAGCGGTAC 1150 ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||| ||| Sbjct 1179 TGCTGAAATGATGCCGAAAGGACATGGTGAA-GAAAGCCGAGT-GAAGATGAAGCGATAC 1236 Query 1151 ATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCCAAAGGTGTTT 1210 ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| | ||| Sbjct 1237 ATGACAATGATGGATTCTATGACAAATAAAGAACTTGACAGCCCAAACCCAAAGATTTTT 1296 Query 1211 AACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAGAGAAGTGATG 1270 ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1297 AACGAGTCAAGGATAATGAGGATAGCGAGAGGGTCAGGGAGGTTAGTAAGAGAAGTGATG 1356 Query 1271 GAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCTGCTAGCAAAGATATGGAGCAAGATGAAAGGGCTC 1330 |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || Sbjct 1357 GAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGAT---AGCAAAGA-------CAA--TGAAAGGGATC 1404 Query 1331 AAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAG 1356 |||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1405 AAGATCCCAAAGAACGGAGACATGAG 1430 Score = 189 bits (102), Expect = 7e-47 Identities = 127/139 (91%), Gaps = 2/139 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1386 ACATGAGCAAGGTCCTACCGCCGCAGATGCTCAAGCAGATTGGTGGCATGGGCGGTCTGC 1445 |||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| Sbjct 1424 ACATGAGCAAGGTCATACCGCCTCAGATGCTAAAACAGATGGGCGGCATGAGCGGTCTGC 1483 Query 1446 AGAGTCTCATGAAGCAGATGGGTTCCGGC-AAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGGCGGA 1504 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1484 AGAGTCTCATGAAGCAGATGGGTT-CGGCTAAGGACATGATGGGAATGTTTGGTGGCGGA 1542 Query 1505 GACAAGTAGTTTCTTTCTT 1523 | |||||||||||| |||| Sbjct 1543 GGCAAGTAGTTTCTATCTT 1561 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 75652221315 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5