BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg924211 Length=2154 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G54570.1 | Symbols: | Esterase/lipase/thioesterase family p... 3541 0.0 > AT1G54570.1 | Symbols: | Esterase/lipase/thioesterase family protein | chr1:20380478-20385125 REVERSE LENGTH=2458 Length=2458 Score = 3541 bits (1917), Expect = 0.0 Identities = 2074/2151 (96%), Gaps = 5/2151 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGACTGCCTGAATCAAAAGGCAATGGCAACATGTTCTTCAAGCTTATTGGTGTTACCAAT 60 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 151 GGACTGCCTGAATCAAAAGACAATGGCAACATGTTCTTCAAGCTTATTGGTGTTACCAAA 210 Query 61 TTTGAGATGGAGTTCTAACCAAAGACGCAATTTCAAGGTAAGAGCTCAAATCTCTGGTGA 120 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 211 TTTGAGATTGAGTTCTAACCAAAGACGCAATTTCAAGGTAAGAGCTCAAATCTCTGGTGA 270 Query 121 AAACAAGAAGACGACATCTTTGGAACCAGTGAACAACAACGGTTCGGTCTCTGTGTCTA- 179 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 271 AAACAAGAAGGCGACATCATTGGAACCAGTGAACAACAACGGTTCGGTCTCTTTGTCTAC 330 Query 180 T--TGTCCAAAACCAAAAAGGGGCAAATGAAGTGAATGGGAAAGTAAAATCCCAGAAAAA 237 | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| Sbjct 331 TACTGTTCAAAACCAAAAAGGGGCAAATGAAGTGAATGGGAAAGGGAAATCCAAGAGAAA 390 Query 238 GATAGTGAGTGATGAAATTGAGTTGTTATGGGATGATGGGTATGGCTCTAAATCTGTTAA 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 391 GATAGTGAGTGATGAAATTGAGTTGTTATGGGATGATGGGTATGGCTCCAAATCTGTTAA 450 Query 298 AGATTACTTTGCGGCGGCTAGAGAGATCTTGAAACCTGACGGTGGTCCTCCACGGTGGTT 357 |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 451 AGATTACTTTGCTGCGGCTAAAGAGATTTTGAAGGCTGATGGTGGTCCTCCACGGTGGTT 510 Query 358 TAGTCCCGTTGATTGTGGTCGACCTGTTGAAGATGCTCCTACGTTACTCTTCTTACCTGG 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 511 TAGTCCCGTTGATTGTGGTCGACCTGTTGAAGATGCTCCTACGTTACTCTTCTTACCTGG 570 Query 418 GATGGATGGCACAGGGATGGGCCTCGTTCCACATCACAAAGCTCTTGGCAAGGCTTTTCA 477 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 571 GATGGATGGCACAGGGATGGGCCTTGTTCCACATCACAAAGCTCTTGGCAAGGCTTTTCA 630 Query 478 TGTCTGGTGCCTGCATATTCCTGTACTTGATCGAACTCCATTCGAAGGACTGGTGAAAGT 537 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| Sbjct 631 TGTCTCGTGCCTGCATATTCCTGTACTTGATCGAACTCCATTTGAAGGGCTTCTGAAAGT 690 Query 538 AGTCGAGGATGTTTTGAGGCAGGAGCAGGCTACACGTCCTAATAAGCCGATATATCTTGT 597 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 691 AGTCGAAGATGTTTTGAGGCAGGAGCAGGCTACACGTCCTAATAAGCCGATATATCTCGT 750 Query 598 GGGCGATTCCTTTGGAGGATGCCTGGCTCTTGCTGTTGCTGCCAGAAACCGTTCATTAGA 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 751 GGGCGATTCCTTTGGAGGATGCCTGGCTCTTGCTGTTGCTGCTAGAAACCGTTCGTTAGA 810 Query 658 CTTGGTGTTGATACTAGTCAACCCAGCTACATCATTTGATAGGTCACCGCTACAGCCGTT 717 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 811 CTTGGTGTTGATACTAGTCAACCCAGCTACATCATTTGATAGGTCACCGCTACAGCCGTT 870 Query 718 GCTGCCTATATTAGAGATGGTGCCAGAGGAGCTTCATTTTACTGTTCCATATGCTCTAAG 777 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 871 GCTGCCTATATTAGAGATGGTGCCAGAGGAGCTTCATTTTACTGTTCCATATGCTCTAAG 930 Query 778 CTTTATTATGGGTGATCCGATAAAGATGGCGACACTTGGTATCGACAACCAACTTCCAAC 837 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 931 CTTTATTATGGGTGATCCGATAAAGATGGCGACACTTGGTATCGACAACCAACTTCCAAC 990 Query 838 AGGAATCAAAATGGAAAAGTTGAGACAGAGGCTTACTAAAACTATGCTCCCGCTTCTCTC 897 |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 991 AGGAGTAAAAATTGAAAAGTTGAGACAAAGGCTTACTAAAACAATGCTCCCGCTTCTCTC 1050 Query 898 TGAGCTCGTTGGAATTATTCCACGGGAAACTTTACTTTGGAAGCTTAAGTTACTGAGATC 957 |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1051 TGAGCTCGGTGGAATTATTCCACGGGAAACCTTACTTTGGAAGCTTAAGTTACTGAGATC 1110 Query 958 TGGCTCTGCTTATGCCAATTCCCGCATCCATGCAGTTCAAGCTGAAGTTTTGGTCCTTGC 1017 ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1111 TGGCTGTGCTTATGCCAATTCCCGCATCCATGCTGTTCAAGCTGAAGTCTTGGTCCTTGC 1170 Query 1018 TAGTGGAAAGGACATGATGCTTCCTAGCCAAGAAGAAGCGAAGCGGCTTCACGGGGTACT 1077 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 1171 TAGTGGAAAGGACATGATGCTTCCTAGCCAAGAAGAAGCAAAGCGGCTTCACGGGTTACT 1230 Query 1078 TAAAAACTGTTCAGTTCGATGCTTCAAGGACAATGGGCATACCCTTTTATTGGAAGATAG 1137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1231 TAAAAACTGTTCAGTTCGATGCTTCAAGGACAATGGGCATACCCTTTTATTGGAAGATAG 1290 Query 1138 CATCAGTTTGCTCACAGTTATAAAAGGTACAGGCAAGTACCGGCGGTCCTGGAGATATGA 1197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1291 CATCAGTTTGCTCACAGTTATAAAAGGTACAGGCAAGTACCGGCGGTCCTGGAGATATGA 1350 Query 1198 TTTGGTTTCTGATTTCTTGCCTCCAAGTAAGGGAGAACTTGCTTACGCCCTTGATGAAGT 1257 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1351 TTTGGTTTCTGATTTCTTGCCTCCAAGTAAGGGAGAACTTGCTTACGCCCTTGATGAAGT 1410 Query 1258 GCTTGGATTCTTGCGAAATGCTGTTGGTTCTGTGtttttttCAACTATGGAAGACGGGAG 1317 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1411 GCTTGGATTCTTGCGAAATGCTGTTGGTTCTGTGTTTTTTTCAACTATGGAAGACGGGAA 1470 Query 1318 AATAGTGAAGGGACTTGCTGGTGTTCCAGATGAAGGTCCGGTGCTACTTGTTGGTTACCA 1377 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1471 AATAGTGAAGGGACTTGCTGGTGTTCCAGATAAAGGTCCGGTGCTACTTGTTGGTTACCA 1530 Query 1378 CATGTTGATGGGTCTTGAACTTGGTCCAATGTCCGAGGCATTTATAAAAGAGAAAAACAT 1437 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 1531 CATGTTGATGGGTCTTGAACTTGGTCCAATGTCCGAGGCGTTTATAAAAGAGAAGAACAT 1590 Query 1438 TCTCTTTCGTGGAATGGCCCATCCAGTTCTGTATTCTGATAATGATCCAGCTAAGGCGTT 1497 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1591 TCTCTTTCGTGGAATGGCCCATCCGGTTCTGTATTCTGATAATGATCCAGCTAAGGCGTT 1650 Query 1498 TGATTATGGCGACTGGATTAAGGTATTTGGTGCCTATCCTGTCACCGCAACCAATCTTTT 1557 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1651 TGATTATGGTGACTGGATTAAAGTATTTGGTGCCTATCCTGTCACCGCAACCAATCTATT 1710 Query 1558 TAAGCTGTTATCTTCTAAATCTCATGTCCTTCTCTTCCCTGGCGGTGCACGAGAGGCTCT 1617 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1711 TAAGCTGTTAGATTCTAAATCTCATGTCCTTCTCTTCCCTGGTGGTGCACGAGAGGCTCT 1770 Query 1618 CCATAACCGGGGTGAACAATACAAACTAATTTGGCCTGAACAGCAAGAGTTTGTAAGAAT 1677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1771 CCATAACCGGGGTGAACAATACAAACTAATTTGGCCTGAACAGCAAGAGTTTGTAAGAAT 1830 Query 1678 GGCAGCACGGTTTGGTGCAACAATAGTGCCGTTTGGAACTGTTGGTGAAGACGACATAGC 1737 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1831 GGCAGCACGGTTTGGTGCAACAATAGTGCCGTTTGGAACAGTTGGTGAAGACGACATAGC 1890 Query 1738 TGAATTGGTTCTTGATTACAACGACCTGATGAAGATCCCAATTCTTAATGACTATGTCAC 1797 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 1891 TGAATTGGTTCTTGATTACAACGACCTGATGAAGATCCCTATTCTTAATGACTATATCAC 1950 Query 1798 AGAAATAACTCGCGATACGAAACAATTTAAATTGAGGGAAGAATCAGAAGGAGAGGTGGC 1857 ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1951 GGAAGTTACTCGCGATACCAAACAATTTAAATTGAGGGAAGAGTCAGAGGGAGAGGTGGC 2010 Query 1858 AAACCAGCCGCTCTACATACCAGGACTCATACCGAAAGTCCCGGGTAGGTTCTATTACCT 1917 ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2011 AAACCAGCCACTCTACCTACCAGGACTCATACCGAAAGTCCCGGGTAGGTTCTATTACCT 2070 Query 1918 GTTTGGGAAACCGATAGAGACAAAGGGAAGACCAGAACTTGTGAAAGACAAAGACGAAGC 1977 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 2071 GTTTGGGAAACCGATAGAGACAAAGGGAAGACCAGAGCTTGTAAAAGACAAAGAAGAAGC 2130 Query 1978 AAATCGAGTTTACTTGGAGGTCAAAG-CGGAAGTAGAGAATAGTATAGCCTACTTGTTGA 2036 ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2131 AAATCAAGTTTACTTGGAGGT-AAAGGCGGAGGTAGAGAATAGTATAGCCTACCTGTTGA 2189 Query 2037 AGAAACGAGAGGAAGATCCATACAGAAGTGTCTTAGACAGATTAAACTACAGTTTGACGC 2096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2190 AGAAACGAGAGGAAGATCCATACAGAAGTGTCTTAGACAGATTAAACTACAGTTTGACGC 2249 Query 2097 ATACTACCGCAACTCATGTTCCGTCTTTCGAACCATGATTCGAACACAAAA 2147 | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 2250 ACACTACCGCAACTCATGTTCCATCTTTCGAGCCATGATTCGAACAAAAAA 2300 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 106826759760 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5