BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg924847
Length=3560
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G61690.1 | Symbols: | phosphoinositide binding | chr1:22782... 5544 0.0
> AT1G61690.1 | Symbols: | phosphoinositide binding | chr1:22782607-22786859
REVERSE LENGTH=3811
Length=3811
Score = 5544 bits (3002), Expect = 0.0
Identities = 3388/3573 (95%), Gaps = 31/3573 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 AGAAGAATCAGACGGAAAAATGTTGGAGAAGATCGGATTACCGGCGAAGCCATCTCTGAG 61
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 59 AGAAGAATCAGACGGGAAAATGTTGGAGAAGATCGGATTACCGCCGAAGCCATCTCTAAG 118
Query 62 AGGAAATAGTTGGGTCGTTGATGCTTCTCATTGTCAAGGATGTTCTTCTCAATTCACTTT 121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 AGGAAATAGTTGGGTCGTTGATGCTTCTCATTGTCAAGGATGTTCTTCTCAATTCACTTT 178
Query 122 CATCAATCGAAAGCATCATTGCCGGAGATGTGGGGGATTGTTCTGTGGAACCTGCACTCA 181
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 CATCAATCGCAAGCATCATTGCCGGAGATGTGGGGGATTGTTCTGTGGAACCTGCACTCA 238
Query 182 GCATAGGATGTCACTACGTGGACAAGGTGACTCGGCGGTTCGTATCTGTGAACCATGTAA 241
||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 239 GCAAAGGTTGTCACTACGTGGACAAGGTGACTCACCTGTGCGTATATGTGAACCATGTAA 298
Query 242 GAAACTTGAAGAAGCTGCACGGTTTGAGTTGCGTCATGGTTACAAAAATAGAGCTGCTAA 301
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 GAAAATTGAAGAAGCTGCACGGTTTGAGTTGCGTCATGGTTACAAAAATAGAGCTGCTAA 358
Query 302 AGCAGGTAGCTCTAAAAGGACAGTAAAGAATGAGGATGATGTTCTCAGTGAGATTCTAGG 361
|| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AGGAGGTAGCTCGAAAAGGACTGTAAAGAATGAGGATGATGTTCTCAGTGAGATTCTAGG 418
Query 362 TTCTGATGTTGATGTATCTTCTTCATCGGAATCTGTGTCTAGTACAGACAGGATTGCTTC 421
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 419 CTCTGATGTTGATGTATCTTCTTCATCTGAATCTGTGTCTAGCACAGACAGGAATGCTTC 478
Query 422 TAAAGAAATGGCAAGCAGTAGTAGTAATAAAGATATGGAGTTGGATGTTGTGTCAGCTAG 481
||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | |||||
Sbjct 479 TAAAGAAATGGCAAGTAGCAGTAGTAATAAAGGTATGGAGTTGGA-------T--GCTAG 529
Query 482 TCCTGAAGAATTGCGTAAACAAGCAGTAGAAGAGAAGAATAAGTACAGAGTTCTTAAAGG 541
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 530 TCCTGAAGAATTGCGTAAACAAGCAGTAGAAGCGAAGAATAAGTACAGAATTCTTAAAGG 589
Query 542 AGAAGGGAAATCTGATGAAGCTTTAAAAGCCTTTAAGAGAGGGAGGGAGCTTGAGAGAGA 601
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 590 AGAAGGGAAATCTGATGAAGCTCTAAAAGCATTTAAGAGAGGGAGGGAACTTGAGAGAGA 649
Query 602 GGCTGACGCATTAGAGATATCCTTAAGAAGGAACCGGAAAAGGGATCTGTCCATGCGAAA 661
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 650 GGCCGACGCATTAGAGATATCTTTAAGAAGGAACCGGAAAAGGGAACTGTCTATGCGAAA 709
Query 662 TGTTGCTGAGACGAAAAACAAGGCTGCTACGAAAGAATCTAGTAAATCACAAAAGCCTCC 721
||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 710 TGTTGCTGAGACGCAGAACAAGGCTGCTACCAAAGAATCTAGCAAATCACAAAAGCCTCT 769
Query 722 ACGTCAAGGGGGTAAAGGAAATGATGATCTGGCAGCTGAGCTGAAGGATCTTGGGTGGTC 781
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||
Sbjct 770 ACGTCAAGGGGGTAAAGGAAATGATGATTTGGCAGCTGACCTGAGGGAGCTTGGGTGGTC 829
Query 782 TGACGATGAAGATAAAAAACCAGCAACTGTAAGTTTGGAGGGCGAATTTTCGTCTCTTCT 841
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 TGACGATGAAGATAAGAAACCAGCAACTATAAGTTTGGAGGGCGAATTTTCGTCTCTTCT 889
Query 842 CCGTGAAATTCCCCGAAGGGCTAACCCTCAGAAGAGTGGGGGAATTGAAAAGAGTCAGGT 901
|||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 890 CCGTGAAATTCCGCGAAGTGCTAATCCTCAGAAGACTGGGGGTATTGACAAGAGTCAGGT 949
Query 902 ACTTGCCCTTaa-aaaaaaCGCCCTTGCGCTGAAACGTGAAGGGAAGCTTGCGGAAGCTA 960
| |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 AATTGCCCTTAAGAGAAAA-GCCCTTACGCTGAAACGTGAAGGGAAGCTTGCGGAAGCTA 1008
Query 961 AAGAGGAACTGAAAAAGGCTAAAATTTTGGAAAGGGAACTGGAAGAGCAGGAACTTTTGG 1020
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 AAGATGAACTGAAAAAGGCTAAAATTTTGGAAAGGGAACTGGAAGAGCAGGAACTTTTGG 1068
Query 1021 GTGGGGCTGATGAATCAGATGATGAGTTATCTGCACTTATTAATAGTATGGATGATGACA 1080
|||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GTGGAGCTGATGGATCAGATGATGAGCTATCTGCACTTATTAATAGTATGGATGATGACA 1128
Query 1081 AAGAAGATGATCTGTTAGCTCAATATGAGGGGAGCCATGATTTCGACATTAGTAACCTTG 1140
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 AAGAAGATGATCTGTTAGCTCAATACGAGGGAAGCCATGATTTCGACATTAGTAACCTTG 1188
Query 1141 TGGGAAATGTAGATGATATTGGAGTTCATGGCGAATTTGATGTCACAGACGAAGATATGG 1200
|||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1189 TGGGAAATTTAGATGATATTGGAGTTCATGGTGAATATGATGTCACAGATGAAGATATGG 1248
Query 1201 AGGACCCAGCAATTACTGCTGCATTGAAATCTTTGGGTTGGAGTGAGGATCCTGGACACC 1260
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 AGGACCCAGCAATCGCTGCTGCATTGAAATCTTTGGGTTGGAGTGAGGATCCTGGACACC 1308
Query 1261 GTGAGAATGTCCACTCTCGACCATCTCCTAAAAACAGAGATGAAAGTTTAGCTGAAATTC 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 ATGAGAATGTCCACTCTCGACCATCTCCTAAAAACAGAGATGAAAGTTTAGCTGAAATTC 1368
Query 1321 AGACATTGAAAAGAGAGGCCCTTACTCTAAAACGGGCTGGAAATGTCGTAGAGGCCATGG 1380
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1369 AGACATTGAAAAGAGAGGCCCTTAATCTAAAACGGGCTGGAAATGTCGTTGAGGCCATGG 1428
Query 1381 CTACACTAAAGAAGGCAAAATTACTTGAGAAGGAACTAGAGGCTGCTGATACGTCCTCAC 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1429 CTACACTAAAGAAGGCAAAATTACTTGAGAAGGAACTAGAGGCTGCTGATACTTCCTCTG 1488
Query 1441 AAACTGTTGATACAACTAGGGCAGAGAGGGATACGAGTCTGAAACTTCCTCCCAGAAGCA 1500
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 1489 AAACTGTTGACACAACTAGGGCAGAGAGGGATACGAGTCTTAAACCTCCTCCCAGAAGCA 1548
Query 1501 GGCTAGCGATTCAGAAAGAACTTCTTGCAGTGAAAAAGAAAGCACTTACTTTGAGAAGGG 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 GGCTAGCGATTCAGAAAGAACTTCTTGCAGTGAAAAAGAAAGCACTTACTTTGAGAAGGG 1608
Query 1561 AAGGAAAGTTTAACGAAGCAGAAGAAGAATTGAAGAAAGGAGCGGTTCTCCAAAATCAGC 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 AAGGAAAGTTTAACGAAGCAGAAGAAGAATTGAAGAAAGGAGCGGTTCTCCAAAATCAGC 1668
Query 1621 TTGATGAGCTGGACAATTCGTCAAAGTTAGCTGCCACAGGGAAGGCCACTCGTGAAAAAG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 TTGATGAGCTGGACAATTCGTCAAAGTTAGCTGCCACAGGGAAGGCCACTCGTGAAAAAG 1728
Query 1681 GAAATGATCTGCCTGATATTAGTTCTCTGGATGATGATGGAGAGGTGGATGTAAAAGATG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 GAAATGATCTGCCTGATATTAGTTCTCTGGATGATGATGGAGAGGTGGATGTAAAAGATG 1788
Query 1741 AGGAGTTAAATGATCCGAATTACTTGTCGATGCTAAAGAGCTTAGGTTGGAATGATGAAG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 AGGAGTTAAATGATCCGAATTACTTGTCGATGCTAAAGAGCTTAGGTTGGAATGATGAAG 1848
Query 1801 ATAGTAATCCTCCAGGTTCTTCATCAGAAAAATCTGACCCAGTTAATTCTCGACCAGGGA 1860
||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 1849 ATAATAATCCTGCAGGTCCTTCATCAGAAAAATCTGACCCACTAAATTCTCGACCAGGGA 1908
Query 1861 AAACAACAGAAACTCAAGGTGCATATGAAGT-CAGTGTTACTAAACCAAGAAGAAGTAAA 1919
||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 1909 AAACAGCAGAAGCTCAAGGTGCATATGAAGTAC-GTGTTACTAAACCAAGGAGAACTAAA 1967
Query 1920 GCTGAAATACAACGAGAACTCTTAGGGCTGAAAAGAAAGGCTTTAACTTTGCGACGACAG 1979
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 GCAGAAATACAACGAGAACTCTTAGGGCTGAAAAGAAAGGCTTTAACTTTGCGACGACAG 2027
Query 1980 GGTAATGTTGATGAAGCCGAGGAAGTTCTGAACCAGACAAAAATATTGGAAGCCCAGTTG 2039
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct 2028 GGTAATGTTGATGAAGCTGAGGAAGTTCTGAACCAGACACAAATATTGGAAGCTCAGATA 2087
Query 2040 GTTGAGATTGATTCAGGCAAGAATCTTTATGCTGACAGTGGTCAGCTGAAAGAACGATCC 2099
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||
Sbjct 2088 ATGGAGATTGATTCAGGCAAGAATCTATATGCTGACAGTGATCAGCCGAAAAAACGATCC 2147
Query 2100 AATGATCTTGCCACCGACAGTGGGATCAATGGAGGAGATGATAGCGTTACAGAAAATGAT 2159
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 AATGATCTTGCCACCGACAGTCGGCTCAATGGAGGAGATGATAGCGTTACAGAAAATGAT 2207
Query 2160 ATGAAGGACCCAGCATTATTGTCGACTCTTAAGAATTTGGGATGGGAGGATGAAGAACCA 2219
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 ATGAAGGACCCAGCGTTATTGTCGACTCTTAAGAATTTGGGATGGGAGGATGAAGAACCA 2267
Query 2220 AAGAAAGAAGAAGCTGCTTTCGGCTCTGTGCAGTCAA-CTGGTCCG-GGCATAGCAGCCA 2277
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||
Sbjct 2268 AAGAAAGAAGAAGCTTCTTTCGGCTCTGTGCAGTCAAGC-GGTCCACGG-ATAGCAGCCA 2325
Query 2278 AAAGCAAGGGACAAATCCAAAGAGAACTTCTTGACTTAAAAAGAAAGGCACTTGCCTTCA 2337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2326 AAAGCAAGGGACAAATCCAAAGAGAACTTCTTGACTTAAAAAGAAAGGCACTTGCCTTCA 2385
Query 2338 AGCGTCAAGGGAAAACTGGAGATGCTGATGAATTATATAGTAAGGCCAGCGTATTGGAGG 2397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||
Sbjct 2386 AGCGTCAAGGGAAAACTGGAGATGCTGATGAATTATACAGTAAGGCCAGTGTTTTGGAGG 2445
Query 2398 CACAGCTAGCAGAACTGGAAACCGCAAAGATGGAGATGAAAGGCTCAGCTTCCGAAATTA 2457
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 2446 CACAGCTAGCAGAACTGGAAACCCCCAAGATGGAGATGAAAGGCTCAGCTTCTGCAATTA 2505
Query 2458 A-CTCTGCAAACTATATGGATGTTGATTTATTAGTTGGATCGCAAATGGAAGATAAGGC- 2515
| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2506 AAC-CTGAAAACTACATGGATGTTGATTTATTAGTTGGATCGCAAATGGAGGATAAAGCG 2564
Query 2516 AGTAAAATCTGCGAGTGTTTCTCATGCTGCTCAAGATAGTTATGACTTGTTAGGAGACTT 2575
| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 A-TAAAATCTGCTAGTGTTTCTCATGCTCCTCAAGATAGTTATGACTTGTTAGGAGACTT 2623
Query 2576 TATCTCCCCAGATAAATCCGGTTCCTCTAGCtttttttCTCAGACA-GGCCAGCAGAAAC 2634
||||||||| | |||||| ||||||||| || || ||||||| || ||||||||| |||
Sbjct 2624 TATCTCCCCTGCTAAATCTGGTTCCTCTGGCGTTGTTTCTCA-ACCTGGCCAGCAGCAAC 2682
Query 2635 CAAGTATGATGGATTTGCTGACTGGTGAGCATAGTGAGATGTCTCAAATTCATGCAGTAA 2694
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2683 CAAGTATGATGGATTTGCTGACTGGTGAGCATTCTGAGAGGTCTCAAATTCATGCAGAAA 2742
Query 2695 AAGGAAA-GCCTGAGACTAAGTCAGATTTTGGTTCAGGAAACAATCACGGCACTCAACAA 2753
||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2743 AAGGAAATGC-TGAGACTATGTCAGGCTTTCGTTCAGGAAACAATCACGGCGCTGAACAA 2801
Query 2754 AGAGTGGCACGTGAAGAGTCAGAGCCCAGTAATATTCAATCGGATTCGGTTCAAAATACA 2813
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||
Sbjct 2802 AGAGTGGCACGTGAAGAGTCAGAGCCCAGTCATATTCAATCAGCTTCGATTCAAAATACA 2861
Query 2814 TCTCCTCAGAACACCCTTAAACAAGAAATTGTGGCTCATAAGAAAAAGGCACTTGCGTTA 2873
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2862 TCTCCTCAGAACACCCTTAAACAAGAGATTCTGGCTCATAAGAAAAAGGCACTTGCCTTA 2921
Query 2874 AAGAGAGAAGGAAACATAAGTGAAGCCAAAAAGGCATTGCAACAAGCAAAATTGTTGGAG 2933
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2922 AAGAGAGAAGGAAACATAAGTGAAGCCAAAAAGGCATTGCAAGAAGCAAAATTGTTGGAG 2981
Query 2934 AGGAGACTACAAGAAGGAGAAAATCCCTCTCCTGAAAAGCTCGGACGAGATGATATGGTT 2993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 AGGAGACTACAAGAAGGAGAAAATCCCTCTCCTGAAAAGCTCGGACGAGATGATATGGTT 3041
Query 2994 TCTACAACGCAGGATCCTCCTGCTCGAGAGAATGAGAATAGTCCTTCAAGTTCAGCTCCA 3053
|| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042 TCCACAACGGAGGATCCTCCTGCTCGAGAGAAAGAGAATAGTCCTTCAAGTTCAGCTCCA 3101
Query 3054 AAGGCAATGTCTGGTCGAGACCGATTTAAGCTGCAGCAAGAGTCACTAAGCCACAAACGT 3113
||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3102 AAGGCAATGTCAGGTCGTGACCGTTTTAAGCTGCAGCAAGAGTCACTAAGTCACAAACGT 3161
Query 3114 CAAGCCATGAAGCTTCGGAGGGAAGGTAAAATGCAGGAAGCTGAAGCTGAGTTTGAAATC 3173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3162 CAAGCCATGAAGCTTCGGAGGGAAGGTAAAATGCAGGAAGCTGAAGCTGAGTTTGAAATC 3221
Query 3174 GCCAAAACTCTTGAAGCTCAATTGGAAGATTCAACATCCTCTAAACCAGAACCGGTGGAC 3233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3222 GCCAAAACTCTTGAAGCTCAATTGGAAGATTCAACATCCTCTAAACCAGAACCGGTGGAC 3281
Query 3234 GATGTAGCGGTGGAAGACTTTCTCGATCCTCAACTCTTGTCTGCCCTCAAAGCTATTGGA 3293
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3282 GATGTAGCGGTGGAAGATTTTCTCGATCCTCAACTCCTGTCTGCCCTCAAAGCTATTGGA 3341
Query 3294 TTAGACAATCCCGTGAATCCTCCACCGGTAAGTAAAACAGACACAAGACAAGCTGCGGCA 3353
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3342 TTAGACAATCCCGTGAATCCTCCACCGGTAAGTAAAACAGACACAACACAAGCTGCGGCA 3401
Query 3354 AAACCAAACCCAGTGAAGGAGAGTAATA-A--TA-T--TAGTCAAGAGAGAAGTCAATTG 3407
|||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||
Sbjct 3402 AAACCAAACCCAGTGAAGGAGAGTAATAGAAATACTAATAATCAAGAGAGAAGTCAATTG 3461
Query 3408 GAGGAACGAATTAAAGCAGAGAAGGTAAAAGCTGTGACCTTGAAACGTGCAGGGAAACAA 3467
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3462 GAGGAACGAATCAAAGCAGAGAAGGTAAAAGCTGTGACCTTCAAACGTGCAGGGAAACAA 3521
Query 3468 GCTGAGGCATTAGATGCTCTTCGACGGGCAAAACTTTATGAAAAGAAACTAAACGCTCTT 3527
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3522 GCTGAGGCATTAGATGCTCTTCGACGGGCAAAACTATATGAAAAGAAGCTAAACGCTCTT 3581
Query 3528 GCTTCAAATTGATTCAACTCTCCAGTTTATTGG 3560
||||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3582 GCTTCAAGTTGATTCAACTCTCCAGTTCATTGG 3614
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 177239809619
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5