BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg926183 Length=5191 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G68890.1 | Symbols: | magnesium ion binding;thiamin pyropho... 8442 0.0 > AT1G68890.1 | Symbols: | magnesium ion binding;thiamin pyrophosphate binding;hydro-lyases;catalytics;2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid synthases | chr1:25896945-25906714 FORWARD LENGTH=5352 Length=5352 Score = 8442 bits (4571), Expect = 0.0 Identities = 4998/5204 (96%), Gaps = 29/5204 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 AATTCATCACAGCGAAGAAGATGCGATCTTCGTTTCTAGTTTCGAATCCTCCGTTTCTAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 24 AATTCATCACAGCGAAGAAGATGCGATCTTCGTTTCTAGTCTCGAATCCTCCATTTCTAC 83 Query 61 CTTCTCTAATCCCTCGTCACAGTTCTAGAAACTCCTTCAGACGTAGCAGAGAACGCTTCT 120 ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 84 CTTCTCTAATCCCTCGTTACAGTTCTAGAAAATCCATCAGACGTAGCAGAGAACGCTTCT 143 Query 121 CCTTCGCTGAGTCTCTTCGTGT-T-TC-TCTTCATGGAATCGGAAGAAACATTGAGGTCG 177 ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 144 CCTTCCCTGAGTCTCTTCGTGTCTCTCTTCTTCATGGAATCCGAAGAAACATTGAGGTCG 203 Query 178 CTCATGGAGTTCAATTTGATGGTCCGATTATGGATAGAGATGCTTTGGAGGTGAATTTAG 237 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| | Sbjct 204 CTCAAGGAGTTCAATTCGATGGTCCGATTATGGATAGAGA--C-------GTGAATTT-G 253 Query 238 G-TGATGATTTGA-TGGTTCAAGTGTGTGTGACTCGTACATTGCCTCCAGCTTTGACTCT 295 | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 254 GATGATGATTT-AGTGGTTCAAGTGTGTGTGACTCGTACATTGCCTCCAGCTTTGACTCT 312 Query 296 TGAGCTTGGCCTTGAGAGCCTCAAGGAAGCTGTTAACGAATTGAAGACTAATCCTCCTAA 355 ||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 313 TGAGCTTGGTCTCGAGAGTCTCAAGGAAGCTATTGACGAATTGAAGACTAATCCTCCTAA 372 Query 356 GTCATCTACTGGCGTCTTGCGATTTCAAGTGGCTGTGCCTCCAAGGGCAAAAGCTTTGTT 415 |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 373 GTCATCTAGTGGAGTCTTACGATTTCAAGTGGCTGTGCCTCCAAGGGCTAAAGCTTTGTT 432 Query 416 TTTGTTTTGCTCTCAGCCGAC-ATCTTCTGATGTGTTTCCTGTGTTTTTCCTCTCCAAGG 474 | |||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 433 CTGGTTTTGCTCTCAACCAACGA-CTTCCGATGTGTTTCCTGTGTTTTTCCTCTCCAAGG 491 Query 475 AAACTGTGGAGCCTTCTTATAAATCACTCTATGTAAAGGAACCTCATGGGGTTTTTGGGA 534 | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 492 ATACTGTTGAGCCTTCTTATAAATCACTTTATGTAAAGGAACCTCATGGGGTTTTTGGGA 551 Query 535 TTGGGAATGCACTCTCTTTCGTTCATCCGTCTTCCA-TCGACTCCAAGGGACATAGCATG 593 ||||||||||| || |||| |||||| | |||| || | |||||||| |||||||||||| Sbjct 552 TTGGGAATGCATTCGCTTTTGTTCATTCATCTT-CAGTTGACTCCAATGGACATAGCATG 610 Query 594 ATGAAAACATTCCTCTCAGATGAATCAGCTATGGTGACGGCCTATGGTTTTCCAGATATT 653 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 611 ATCAAAACATTCCTCTCAGATGAATCAGCTATGGTGACGGCCTATGGTTTTCCAGATATT 670 Query 654 GAATTCAACAAATACTCTACTGTCAATAGCAAGGGTGGCTCTTCTTACTTTTTCGTTCCT 713 ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 671 GAATTCAACAAATACTCTACTGTAAATAGCAAAGATGGCTCTTCTTACTTTTTCGTTCCT 730 Query 714 CAGATTGAGTTAGATGAGCACGAGGAGGTCTCTATATTAGCAGTTACACTGGCATGGAAT 773 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 731 CAGATTGAGTTAGATGAGCACGAGGAGGTCTCTATATTAGCAGTTACATTGGCATGGAAT 790 Query 774 GAATCTCTCTCTTACAGATTTGAGCAAACAATTAGTTCATATGAGAAATCAATTTTTCAG 833 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 791 GAATCTCTCTCTTACACAGTTGAGCAAACAATTAGTTCATATGAGAAATCAATTTTTCAG 850 Query 834 GTTTCTTCTCATTTCTGCCCAAATTTAGAGGATCACTGGTTCAAACATCTAAAAAGTTCT 893 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 851 GTTTCTTCTCATTTCTGCCCAAATGTAGAGGATCACTGGTTCAAACATCTAAAAAGTTCT 910 Query 894 CTAGCAAAGTTTAGTGTAGAAGAGATACATCCAATTGAGATGGAGCATATGGGCTTTTTC 953 |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 911 TTAGCGAAGCTTAGTGTTGAAGAGATACATCCACTTGAGATGGAGCATATGGGCTTTTTC 970 Query 954 ACTTTTTCTGGGAGAGATCAGGCTGACGTCAAGGAACTGAAAAGTATACAATCATCATGT 1013 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 971 ACCTTTTCTGGGAGAGATCAGGCTGACGTCAAGGAACTGAAAAGTATACAATCATCATGT 1030 Query 1014 CAGTTCCATTGCAAGCTTTCACCTGACGTTGATTTCTCAAACAATATGCTGAATCGAGAG 1073 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1031 CAGTTCCATTGCAAGCTTTCACCTGACGTTGTTTTCTCAAACAACATGCTGAATCGAGAG 1090 Query 1074 ACTGAAGTGAGCAACTTCTTGAAAGATGAGGCTAACATCAATGCTGTATGGGCATCAGCT 1133 |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1091 ACTGAAGTGAGCAACTTCTTGAGAGATGAAGCTAACATCAATGCTGTATGGGCATCAGCT 1150 Query 1134 ATAATTGAAGAATGCACTCGTCTTGGTTTGACGTACTTTTGTGTAGCTCCTGGATCAAGG 1193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1151 ATAATTGAAGAATGCACTCGTCTTGGTTTGACGTACTTTTGTGTAGCCCCTGGATCAAGG 1210 Query 1194 TCTTCCCATCTTGCAATTGCTGCTGCCAACCATCCCCTTACAACGTGTCTTGCATGCTTT 1253 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1211 TCTTCCCATCTTGCTATCGCTGCTGCCAACCATCCCCTTACAACGTGTCTTGCATGCTTT 1270 Query 1254 GATGAACGATCTCTTGCGTTTCATGCTATTGGTTATGCTAAAGGATCCCTCAAACCAGCA 1313 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1271 GATGAACGATCTCTTGCGTTTCACGCTATTGGTTATGCTAAAGGATCCCTCAAACCAGCA 1330 Query 1314 GTCATTATAACATCATCAGGAACTGCCGTTTCAAATCTTCTTCCAGCGGTTGTTGAAGCC 1373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1331 GTCATTATAACATCATCAGGAACTGCCGTTTCAAATCTTCTTCCAGCGGTTGTTGAAGCC 1390 Query 1374 AGTGAGGATTTCTTACCACTGCTACTACTTACCGCAGATCGTCCTCCTGAACTTCAGGGA 1433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1391 AGTGAGGATTTCTTACCACTGCTACTACTTACCGCAGATCGTCCTCCTGAACTTCAGGGA 1450 Query 1434 GTTGGCGCAAATCAATCAATAAATCAAATAAACCACTTCGGTTCGTTTGTCAGATTCTTC 1493 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1451 GTTGGCGCAAATCAAGCAATAAATCAAATAAACCACTTCGGTTCGTTCGTCAGATTCTTC 1510 Query 1494 TTCAATCTTCCTCCTCCAACTGATCTTATTCCAGTCCGAATGGTCCTTACCACTGTAGAC 1553 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1511 TTCAATCTTCCTCCTCCAACCGATCTTATTCCAGTCCGAATGGTCCTTACGACTGTAGAC 1570 Query 1554 TCTGCTCTACATTGGGCAACAGGTTCTGCTTGTGGACCAGTACATCTCAATTGTCCTTTT 1613 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1571 TCCGCTCTACATTGGGCAACAGGATCTGCTTGTGGACCAGTACATCTCAATTGTCCTTTT 1630 Query 1614 AGAGACCCACTTGACGGTAGTCCAACAAATTGGTCATCCAACTGCTTAAAAGGATTAGAC 1673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 1631 AGAGACCCACTTGACGGTAGTCCAACAAATTGGTCATCTAACTGCTTAAATGGATTAGAC 1690 Query 1674 ATGTGGATGTCGAATGCTGAACCATTCACAAAATATTTTCAAGTACAAAGCCATAAAAGC 1733 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1691 ATGTGGATGTCTAATGCTGAGCCATTCACAAAATATTTTCAAGTACAAAGCCATAAAAGC 1750 Query 1734 -AGTGGTGTAACAACTGGCCAAATTACTGAGGTCTTACAAGTAATCAAAGAGGCTAAGAA 1792 | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1751 GA-TGGTGTAACAACTGGCCAAATTACTGAGATCTTACAAGTAATCAAAGAGGCTAAGAA 1809 Query 1793 GGGTCTTCTTCTTATTGGTGCAATCCATACAGAGGATGAAATTTGGGCTTCGCTTCTGTT 1852 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1810 GGGTCTTCTTCTTATTGGTGCAATCCATACAGAGGATGAAATTTGGGCTTCGCTTCTGTT 1869 Query 1853 GGCGAAAGAGCTGATGTGGCCTGTAGTTGCAGATGTCTTGTCGGGTGTACGGCTGCGCAA 1912 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1870 GGCGAAAGAGCTGATGTGGCCTGTAGTTGCAGATGTCTTGTCTGGTGTACGGCTGCGCAA 1929 Query 1913 GCTTTTTAAACCTTTTCTTGAGAAGTTGACGCCTGTTTTTGTTGATCATCTTGATCATGC 1972 |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1930 GCTTTTTAAACCTTTTGTTGAGAAGTTGACGCATGTTTTTGTTGATCATCTTGATCATGC 1989 Query 1973 CTTGCTTTCAGACTCTGTCAGGAATTTGATAGAGTTTGATGTTGTTATCCAGGTTGGAAG 2032 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1990 CTTATTTTCAGACTCTGTCAGGAATTTGATAGAGTTTGATGTTGTTATCCAGGTTGGAAG 2049 Query 2033 TCGGATAACAAGTAAAAGAGTTTCTCAGGTGCTAGAGAAATGCTTTCCATTTGCATACAT 2092 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2050 TCGGATAACAAGTAAAAGAGTTTCTCAGATGCTAGAGAAATGCTTTCCATTTGCATACAT 2109 Query 2093 TTTGGTTGATAAGCATCCATGCCGACATGACCCATCACACCTGGTCACTCACAGGGTCCA 2152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2110 TTTGGTTGATAAGCATCCATGCCGACATGACCCATCACACCTGGTCACTCACAGGGTCCA 2169 Query 2153 AAGCAACATTGTTCAGTTTGCTGATTGTGTGCTTAACTCTCAATTTCCAAGGAGGAGAAG 2212 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| Sbjct 2170 AAGCAACATTGTTCAGTTTGCTAATTGTGTGCTTAAATCTCGATTTCCATGGAGGAGAAG 2229 Query 2213 CAAGTTGCATGGTCATCTACAAGCATTGGATGGTGCTATTGCCCGGGAAATTTCATTTCA 2272 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2230 CAAGTTGCATGGTCATCTACAGGCATTGGATGGCGCTATTGCCCGGGAAATGTCATTTCA 2289 Query 2273 AATATCTGCTGAAAGCTCCCTGACCGAACCTTACGTTGCACACATGCTTTTTAAAGCACT 2332 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct 2290 AATATCTGCTGAAAGCTCCCTGACTGAACCTTACGTTGCACATATGCTTTCTAAAGCACT 2349 Query 2333 AACATCTAAATCTGCTCTTTTCATCGGGAATAGTATGCCAATAAGGGATGTGGATATGTA 2392 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2350 AACTTCTAAATCTGCTCTTTTCATCGGGAATAGTATGCCAATAAGGGATGTGGATATGTA 2409 Query 2393 TGGATGTAGTTCAGAAAATTCTTCTCATGTGGTAGATAAGATGTTGAGTGCAGAACTACC 2452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2410 TGGATGTAGTTCAGAAAATTCTTCTCATGTGGTAGATATGATGTTGAGTGCAGAACTACC 2469 Query 2453 ATGTCAATGGATACAAGTAACTGGAAATAGAGGAGCTAGTGGCATTGATGGGTTGCTCAG 2512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2470 ATGTCAATGGATACAAGTAACTGGAAATAGAGGAGCTAGTGGCATTGATGGGTTGCTCAG 2529 Query 2513 CTCGGCCACTGGCTTTGCTGTAGGATGCAAGAAGAGAGTGGTCTGTGTGGTGGGGGACAT 2572 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2530 CTCGGCCACTGGCTTTGCTGTAGGATGCAAGAAGAGAGTGGTCTGTGTGGTTGGGGACAT 2589 Query 2573 CTCTTTCCTTCATGATACAAATGGATTGGCGATTTTGAAGCAGAGGATTGCAAGGAAACC 2632 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2590 CTCTTTCCTTCATGATACAAATGGATTGGCGATTTTGAAGCAGAGGATTGCAAGGAAACC 2649 Query 2633 AATGACAATTCTTGTGATAAACAACCGTGGAGGTGGAATCTTCCGACTTCTTCCTATTGC 2692 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2650 AATGACAATTCTTGTGATAAACAACCGTGGAGGTGGAATCTTCCGACTTCTTCCTATTGC 2709 Query 2693 AAAGAGAACAGAGCCTAGCGTGTTAAATCAATATTTCTATACATCACATGACATTTCCAT 2752 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2710 AAAGAAAACAGAGCCTAGCGTGTTAAATCAATATTTCTATACAGCACATGACATTTCCAT 2769 Query 2753 TGAAAACTTGTGTTTGGCACATGGTGTGAGGTATGTACACGTTGGGACGAAAAGTGAACT 2812 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2770 TGAAAACTTGTGTTTGGCACATGGTGTGAGGTATGTTCACGTTGGGACGAAAAGTGAACT 2829 Query 2813 TGAGGATGCTCTATTTGTACCCAGCGTGGAAGAGATGGATTGCATTGTGGAGGTTGAAAG 2872 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2830 TGAGGATGCTCTATTTGTACCAAGCGTGGAGGAGATGGATTGCATTGTGGAGGTTGAAAG 2889 Query 2873 CTCTATAAACGCTAACGCAATCGTTCATAGCACTTTGGAGAGGTTTGCACGCCAAGCTGC 2932 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2890 CTCTATAAACGCTAACGCGATTGTTCATAGCACTTTGGAGAGGTTTGCACGCCAAGCCGC 2949 Query 2933 AGAAAATTCCCTAGGCATTATCTCGGCCAGTTCTCTTCTTCATCCGATGATCGGAAATGT 2992 |||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2950 AGAAAATTCCCTGGGCATTGTTTCTGCCAGTTCTTTTCTTCATCCGATGATCAAAAATGT 3009 Query 2993 ACTTCTTTGCCAAGTCTCTGGAATACAATATTCGCAGTACAGAGTCAAACTGTGTGACAG 3052 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3010 ACTTCTTTGCCAAGTCTCTGGAATACAATATTCGCAGTACAGAGTCAAACTGTGTGACAG 3069 Query 3053 ACCTACCATATGTTCTGATGAATTCTCTCAATTCCATCGAGAAGGATTTATACTCTCCCT 3112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 3070 ACCTACCATATGTTCTGATGAATTCTCTCAATTCCATCGAGAAGGGTTCATACTCTCCCT 3129 Query 3113 CACTTTGGAGGATGGAAGCATTGGCTATGGAGAGGTTGCACCTCTGGACAGTAATGTAGA 3172 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3130 GACTTTGGAGGATGGAAGCATTGGCTATGGAGAGGTTGCACCTCTGAACAGTAATGTAGA 3189 Query 3173 GAACTTAATGGATGTTGAGGGGCAGCTTCAGTTAGTTCTTCACCTCGTGAATGGAGCTAA 3232 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 3190 GAACTTAATGGATGTTGAGGGGCAGCTTCAGTTAGTTCTTCACCTCATGAATGAAGCTAA 3249 Query 3233 ATTTAGTTACATGCTTCCTTTGTTAAATGGCTCTATTTCTTCCTGGATTTGGAGTGAACT 3292 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3250 ATTTAGTTACATGCTTCCTTTGTTAAATGGCTCGATTTCTTCCTGGATTTGGAGTGAACT 3309 Query 3293 TGGAATTACTGCATCATCGATTTTCCCTAGTGTCAGATGTGGTCTGGAAATGGCTCTTCT 3352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3310 TGGAATTACTGCATCATCGATTTTCCCTAGTGTCAGATGTGGTCTGGAAATGGCTCTTCT 3369 Query 3353 AAATGCTATGGCAGTAAGACATGATTCTAGTTTGTTGGGGATACTTCATTATCAGAAAGA 3412 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3370 AAACGCAATGGCAGTAAGACATGATTCTAGTTTGTTGGGGATACTTCATTATCAGAAAGA 3429 Query 3413 CGAAAATGGTTCTGCTCAGCCACATTCTGTTCAAATATGTGCCCTTCTTGATTCTGAAGG 3472 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3430 AGAAAATGGTTCTGCTCAGCCACACTCTGTTCAAATATGTGCCCTTCTTGATTCTGAAGG 3489 Query 3473 TAC-CGCATTGGAGGTCGCATACGTTGCTAGAAAACTTGTTGAAGAAGGGTTCAGTGCTA 3531 ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3490 TACTC-CACTGGAGGTCGCATACGTTGCTAGAAAACTTGTTCAAGAAGGGTTCAGTGCTA 3548 Query 3532 TTAAACTTAAAGTTGGTCGTCGAGTGAACTCTGTTCAAGATGCTTTAGTTATGCAAGAAG 3591 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3549 TTAAACTTAAAGTTGGTCGTCGAGTGAGCTCTGTTCAAGATGCTTTAGTTATGCAAGAAG 3608 Query 3592 TAAGGAGAGCCGTTGGCGATCAAATTGAACTCCGTGCAGATGCAAATTGTCGTTGGACTT 3651 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3609 TAAGGAGAGCCGTTGGCGTTCAAATTGAACTCCGTGCAGATGCAAATTGTCGTTGGACTT 3668 Query 3652 TTGAAGAGGCTACAGAGTTTGGTTTGTTGGTGAAAAGCTGTAATTTAAAATATATTGAGG 3711 |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3669 TTGAAGAGGCTAGAGAGTTTGGTTTATTGGTGAACAGCTGTAATTTAAAATATATTGAGG 3728 Query 3712 AACCTGTCCAGAATAAAGATGACCTTATAAGGTTTCATGAAGAAACTGGATTACCAGTGG 3771 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3729 AACCTGTCCAGAATAAAGATGACCTTATAAGGTTTCATGAAGAAACTGGATTACCAGTGG 3788 Query 3772 CACTTGATGAGACTCTTGATGATTTTGAGGAATGTCCTCTACTTATGCTTACCAAATATA 3831 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct 3789 CACTTGATGAGACTCTTGATGATTTTGAGGAATGTCCTCTGCGTATGCTTACCAAATATA 3848 Query 3832 CCCATCCTGGAATAGTTGCTGTTGTTATTAAACCAAGTGTTGTGGGAGGGTTTGAGAATG 3891 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3849 CGCACCCTGGAATAGTTGCTGTTGTTATTAAACCAAGTGTTGTGGGAGGGTTTGAGAATG 3908 Query 3892 CAGCCCTGATTGCTCGGTGGGCACAGAAGCATGGAAAAATGGCTGTTATTAGTGCTGCAT 3951 |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 3909 CAGCACTGATTGCTCGGTGGGCACAGCAGCATGGAAAGATGGCTGTTATAAGTGCTGCAT 3968 Query 3952 ACGAAAGTGGCCTAGGTTTATCAGCATATATTTTATTTGCATCATATTTGGAGTTGGTA- 4010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct 3969 ATGAAAGTGGCCTAGGTTTATCAGCATATATTTTATTTGCATCATATTTGGAGATGG-AG 4027 Query 4011 AACGTCAAAGCATCCACAGAGCAGAAGCAAGGAACATCGCCTTCTGTAGCCCATGGTCTT 4070 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 4028 AACGTGAAAGCATCCACAGAGCAGAAGCAAGGAACGCCCCCTTCTGTAGCCCATGGTCTT 4087 Query 4071 GGAACTTATCGTTGGCTTAGTGAAGACGTAATGATGAATACATTAGGGATATTTCGTAGC 4130 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4088 GGAACTTACCGGTGGCTTAGTGAAGACGTAATGATGAATACATTAGGGATATTTCGTAGC 4147 Query 4131 CCTTATAGTGGATTTGTTGAAGGATTTGTTGCTGATTCTAGTAGAAATCTAAAGGATGTT 4190 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4148 CCTTACAGTGGATTTGTTGAAGGATTTATTGCTGATGCTAGTAGAAATCTAAAGGATGTT 4207 Query 4191 AAGATAAACAACGATGTTATTGTTAGAACCAGTAAAGGAATTCCTGTCCGGAGGTATGAA 4250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4208 AAGATAAACAACGATGTTATTGTTAGAACCAGTAAAGGAATTCCTGTTCGGAGGTATGAA 4267 Query 4251 CTGAGGGTGGATGTAGATGGGTTCTCTCATTTCATTAGAGTCCACGACATTGGGCAGAAT 4310 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| Sbjct 4268 CTGAGGGTGGATGTAGATGGTTTCTCTCATTTCATAAGAGTCCATGACGTTGGGGAGAAT 4327 Query 4311 GCAGAAGGAAGTGTAGCTTTGTTTCTTCATGGATTTCTTGGAACTGGTGAAGAATGGATC 4370 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4328 GCAGAAGGAAGTGTAGCTTTGTTTCTTCATGGATTTCTTGGAACTGGTGAAGAATGGATC 4387 Query 4371 CCCATCATGAAGGGTATCTTGGGATCTGCGAGATGCATTTCAGTCGATATTCCTGGTCAC 4430 |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4388 CCCATCATGACGGGTATCTCAGGATCTGCGAGATGCATTTCAGTCGATATTCCTGGTCAC 4447 Query 4431 GGAAGGTCAAGGGTACAAAGTCATGCTAGTGAGACCCAGACGGCCCCAACTTTCTCAATG 4490 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4448 GGAAGGTCAAGGGTACAAAGTCATGCTAGTGAGACCCAGACGTCCCCAACTTTCTCAATG 4507 Query 4491 GAGATGATAGCGAAGGCATTGTATAAGTTGATTGAGCAAATTACTCCTGGGAAAGTAACT 4550 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4508 GAGATGATAGCGGAGGCATTGTATAAGTTGATTGAGCAAATTACTCCTGGGAAAGTAACC 4567 Query 4551 ATAGTTGGATATTCCATGGGAGCAAGAATAGCCCTGTACATGGCTTTGAGGTTTAGCAAC 4610 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4568 ATAGTTGGATATTCCATGGGAGCAAGGATAGCACTGTACATGGCTTTGAGGTTTAGCAAC 4627 Query 4611 AAGATCGAAGGAGCTGTCGTGGTATCAGGGAGCCCGGGACTCAAGGATCCAGTGGCAAGG 4670 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct 4628 AAGATCGAAGGAGCTGTCGTGGTATCAGGGAGCCCGGGACTCAAGGATCCAGTAGCACGG 4687 Query 4671 AAAGTTCGAAGTGCAACAGATGATTCCAAAGCACGAATGATGGTTGACAATGGACTCGAA 4730 ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4688 AAAATTCGAAGTGCTACAGATGATTCCAAAGCACGAATGATGGTTGACAATGGACTATAT 4747 Query 4731 ATCTTTCTAGAGAACTGGTACAATGGAGGCTTGTGGAAGAGCTTGAGAAATCATCCCCAT 4790 |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4748 ATCTTTATCGAGAATTGGTACAATGGAGGCTTGTGGAAGAGCTTGAGAAATCATCCCCAT 4807 Query 4791 TTTAGTAAAATAGTTGCAAGCCGCTTGCTACATGATGATGTTCCTAGTGTTGCAAAGCTC 4850 ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4808 TTTAGTAAAATTGCTGCAAGCCGCTTGCTACATGGTGATGTTCCTAGTGTTGCAAAGCTC 4867 Query 4851 CTGTCTGATCTAAGCAGTGGGAGACAACCGTCATTGTGGGAAGAGTTGGAGGATTGTGAT 4910 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4868 CTGTCTGATCTAAGCAGTGGGAGACAACCGTCATTGTGGGAAGAGTTGGAGGATTGTGAT 4927 Query 4911 ACAAATATCTCGCTCGTATTCGGAGAGAAAGATGTCAAATTCAAGCAAATCGCTACTAGA 4970 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4928 ACAAATATCTCGCTCGTATTCGGGGAGAAAGATGTCAAATACAAGCAAATCGCTACTAGA 4987 Query 4971 ATGTACCGCGAGATGAGTAAAAGCAAGAATAGCGTAAACAATATCATCGAGATGGTTGAA 5030 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4988 ATGTACCGCGAGATGAGTAAAAGCAAGAAGAGCGTAAACAATATCATCGAGATAGTTGAA 5047 Query 5031 ATCCCAGAGGCTGGTCACGCTGTCCATCTCGAGAACCCTCTTCACATGATTCTCGCCCTT 5090 || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| Sbjct 5048 ATTCCAGAGGCTGGTCACGCTGTACATCTCGAGAGCCCTCTTCGCGTGATTCTCGCCCTC 5107 Query 5091 AGAAAATTCTTAACAAGAGTGCACAAAAGTTC-ACAGAGACAG--CTTTCTCAGAAGCTC 5147 |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 5108 AGAAAATTCTTAACAAGAGTTCACAACAGTTCTACAGAGACAGAGCTTTCTCAGAAGCTC 5167 Query 5148 TTGTTAGCACTAAAAGAAATGTAAAACAGATTTGAAACATGAAG 5191 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 5168 TTGTTAGCACTAAAAGAAATGTAAAACAGATTTGGAACATGAAG 5211 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 259062093652 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5