BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg927231 Length=2094 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G78240.1 | Symbols: TSD2, QUA2, OSU1 | S-adenosyl-L-methioni... 3450 0.0 > AT1G78240.1 | Symbols: TSD2, QUA2, OSU1 | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | chr1:29432829-29436484 REVERSE LENGTH=2760 Length=2760 Score = 3450 bits (1868), Expect = 0.0 Identities = 2016/2087 (97%), Gaps = 12/2087 (1%) Strand=Plus/Plus Query 15 CAACAAAAATGTCAATGCCACTACAACGTGGCATATCTGGAGTACGAGTTTCTGATAGCA 74 ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 355 CAA-AAAAATGTCAATGCCACTACAACGTGGCATCTCTGGAGTACGAGTTTCTGATAGCA 413 Query 75 GTGATGATTTGAGTGACTCTCAAATGAAAGACAAAACTGAAAGACCTCGTTCTTCTGATA 134 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | Sbjct 414 GTGATGATTTGAGAGACTCTCAAATGAAAGACAAAACTGAAAGAGCTCGTTCTACTGAGA 473 Query 135 AC--C-ACTTAACCTTAAGGTTTCCTTTTGGTTTCCTCTTTAGTAATCAATCTTCTTCCA 191 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 474 ACAACAACTTAACCTTAAGGTTTCCTTTTGGTTTCCTCTTTAGTAATCAATCTTCTTCCA 533 Query 192 AGCACGGTGGTGCCGGCGAAAATGGTTTTTCTGCTGATCCATATAGTGCAAGAAGCAGGC 251 | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 534 AACACGGTGGTGGTGGCGAAAACGGTTTTTCTGCTGATCCATATAGTGCAAGAAGCAGGC 593 Query 252 ACAGATTGATGCTT-ATGTTTCTTAAGATCAGTTTGGTTCTTATTGTGGTTATTGCT-TT 309 | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 594 ATAGATTGATG-TTGTTGTTTCTCAAGATCAGTTTGGTTCTTATTGTGGTTATTGCTCTT 652 Query 310 AGCTGGATCTTTCTGGTGGACCATTTCCATTTCGACTTCTTCGAGAGGTCATGTATATCA 369 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 653 -GCTGGTTCTTTCTGGTGGACTATTTCCATTTCGACTTCTTCCAGAGGTCATGTATATCA 711 Query 370 CAATTATAGGAGATTACAGGAGCAGCTTGTTTCTGACTTGTGGGATATTGGGGAGATTTC 429 |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 712 CAATTATAGGAGGTTACAGGAGCAGCTTGTTTCAGACTTATGGGATATTGGGGAGATTTC 771 Query 430 TCTTGGTCCTAATAGGTGGAAGGAGCTCGAATATTGTAATATAGAGTCTGAGAATTTTGT 489 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 772 TCTTGGTCCTAATAGGTGGAAGGAGCTTGAATATTGTAATATAGAATCTGAGAATTTTGT 831 Query 490 TCCTTGCTTTAATGTTTCTGAGAATCTTGCTCTGGGTTACTCCAATGGTGATGAAAATAA 549 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 832 CCCTTGCTTTAATGTTTCTGAGAATCTTGCTCTGGGTTACTCCAATGGTGATGAAAATGA 891 Query 550 TCGGTTTTGTGGGCCTGGATCAAAGCAAGAATGTTTAGTGTTACCACCGGTGAAATATCG 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 892 TCGGTTTTGTGGGCCTGGATCAAAGCAAGAATGTTTAGAGTTGCCACCGGTGAAATATCG 951 Query 610 AGTTCCTCTTAGGTGGCCGACTGGTAAAGATATCATCTGGTATTCTAATGTTAAGATTAC 669 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 952 AGTCCCTCTTAGGTGGCCGACTGGTAAAGATATAATCTGGCATTCTAATGTTAAGATTAC 1011 Query 670 TGCTCAAGAAGTTGTGTCTTCTGGTAGCATAACCAAGAGGATGATGATGATGGAAGACGA 729 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1012 TGCTCAAGAAGTTGTGTCTTCTGGTAGCATAACCAAGAGGATGATGATGATGGAAGATGA 1071 Query 730 TCAGATATCTTTCCGGTCAGCATCTCCTATGTCTGATGAGGTTGAAGACTATTCCCATCA 789 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1072 TCAGATATCTTTCAGGTCAGCATCTCCTATGTCTGATGAGGTTGAAGACTATTCCCATCA 1131 Query 790 GATCGCTGAAATGATTGGGATTAAGAAGGATAACTTCATAGAAGCTGGTGTGAGAACTAT 849 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1132 GATCGCTGAAATGATCGGGATTAAGAAGGATAACTTCATAGAAGCTGGTGTGAGAACTAT 1191 Query 850 CTTGGATATTGGATGTGGTTATGGTAGCTTTGGGGCACATCTATTGTCCAAACAGATTTT 909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1192 CTTGGATATTGGATGTGGTTATGGTAGCTTTGGGGCACATCTATTGTCCAAACAGATTTT 1251 Query 910 AACCATGTGCATAGCAAACTACGAAGCCTCGGGTAGCCAAGTTCAGCTAACACTCGAAAG 969 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1252 AACTATGTGCATAGCAAACTACGAAGCTTCGGGTAGCCAAGTTCAGCTAACACTCGAAAG 1311 Query 970 GGGTCTCCCTGCAATGATTGGCTCTTTTATATCAAAGCAATTGCCATATCCTTCCCTGTC 1029 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 1312 GGGTCTTCCTGCAATGATTGGCTCTTTTATATCAAAGCAATTGCCATATCCTTCTCTTTC 1371 Query 1030 CTTTGATATGTTGCATTGCTTAAGATGTGGCATTGATTGGGACCAGAAAGATGGGCTTCT 1089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1372 CTTTGATATGTTGCATTGCTTAAGATGTGGCATTGATTGGGACCAGAAAGATGGGCTTCT 1431 Query 1090 CCTTGTAGAAATTGACAGGGTTCTCAAACCCGGTGGTTACTTTGTATGGACATCTCCGCT 1149 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1432 CCTTGTAGAAATTGACAGGGTTCTCAAGCCCGGTGGTTACTTTGTATGGACATCTCCGCT 1491 Query 1150 CACAAACCCTCGTAACAAGGATCATCTTAAAAGATGGAACTTTGTTCATGATTTTGCTGA 1209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1492 CACAAACCCTCGTAACAAGGATCATCTTAAAAGATGGAACTTTGTTCATGATTTTGCTGA 1551 Query 1210 AAGCATCTGTTGGACTCTTTTAAATCAGCAAGACGAGACAGTTGTCTGGAAAAAGACTAT 1269 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1552 AAGCATCTGTTGGACTCTTTTAAATCAGCAAGATGAGACAGTTGTCTGGAAAAAGACTAT 1611 Query 1270 CAACACCAAATGTTATAGTTCCCGGAAACCTGGAGTGGGCCCTTCTGTGTGTACCAAAGG 1329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1612 CAACACCAAATGTTATAGTTCCCGGAAACCTGGAGTGGGCCCTTCTGTGTGTACCAAAGG 1671 Query 1330 ACACGATGTCGAGTCTCCATATTACAGGCCTCTTCAGATGTGTATTGGTGGAACACGTAG 1389 |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1672 GCACGATGTTGAGTCTCCTTATTACAGGCCGCTTCAGATGTGTATAGGTGGAACACGTAG 1731 Query 1390 CCGGAGGTGGATTCCCATTGAAGGCAGGACAAGATGGCCTAGCCGGTCTAACATGAACAA 1449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1732 CCGGAGGTGGATTCCCATTGAAGGCAGGACAAGATGGCCTAGCCGGTCTAACATGAACAA 1791 Query 1450 GACTGAACTTTCATTATATGGTCTTCACCCCGAGGTGCTTGGAGAGGATGCTGAGAACTG 1509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1792 GACTGAACTTTCATTATATGGTCTTCACCCCGAGGTGCTTGGAGAGGATGCTGAGAACTG 1851 Query 1510 GAAGATAACTGTGAGAGAATACTGGTCTCTCTTGTCTCCTCTGATATTCTCTGATCATCC 1569 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1852 GAAGATAACAGTGAGAGAATACTGGTCTCTCTTGTCTCCTCTGATATTCTCTGATCATCC 1911 Query 1570 AAAGAGACCCGGCGATGAAGATCCATCACCGCCTTATAACATGCTCAGAAACGTATTGGA 1629 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1912 AAAAAGACCCGGCGATGAAGATCCATCACCGCCTTATAACATGCTCAGAAACGTACTGGA 1971 Query 1630 TATGAATGCTCAATTCGGTGGTCTCAATTCCGCCTTGTTGGAAGCAAGGAAATCAGTCTG 1689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1972 TATGAATGCTCAATTCGGTGGTCTCAATTCCGCCTTGTTGGAAGCAAGAAAATCAGTCTG 2031 Query 1690 GGTCATGAATGTGGTCCCTACAGCTGGACCTAACCACCTCCCCATGATCCTTGACCGTGG 1749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2032 GGTCATGAATGTGGTCCCTACAGCTGGACCTAACCACCTCCCCATGATACTTGACCGTGG 2091 Query 1750 CTTTGTCGGAGTTTTGCATGACTGGTGTGAACCATTCCCGACTTACCCGAGAACATATGA 1809 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2092 CTTTGTCGGAGTTTTGCACAACTGGTGTGAACCATTCCCGACTTACCCGAGAACATATGA 2151 Query 1810 CCTGGTACATGCAGACAATCTCTTGTCACTTCAGACAAGCCAGCGCCGAAAATCATGTCA 1869 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| Sbjct 2152 CCTGGTACATGCAGACAATCTCTTGTCGCTTCAGACAAGTCAGCCCCGAAAAACATGTCT 2211 Query 1870 ACTTATTGATATATTCACAGAGATTGACCGATTGCTTCGTCCAGAGGGATGGGTGATAAT 1929 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2212 ACTTATTGATATATTCACAGAGATTGACCGATTGCTTCGTCCAGAGGGATGGGTGATAAT 2271 Query 1930 CCGTGACACGGTGCAGCTGGTGGAAA-GCGCGAGAGCGTC-AGTAACGCAGTTGAAGTGG 1987 ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | | | ||||||||||||||||| Sbjct 2272 CCGTGACACGGCACAGCTGGTGGAAAAG-GCGAGAGAGACGA-TAACGCAGTTGAAGTGG 2329 Query 1988 GAGGCTCGAGTAATAGAGGTTGAAAGCAGCAGTGAACAAAGACTTCTCATCTGCCAAAAA 2047 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2330 GAAGCTCGAGTAATAGAGGTTGAAAGCAGCAGTGAACAAAGACTTCTCATCTGCCAAAAA 2389 Query 2048 CCATTCACCAAGCGACAATCAATCTGAAGAAGAAGAAGAACATAGAC 2094 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2390 CCATTCACCAAGCGACAATCAATCTGAAGAAGAAGAAGAACATAGAC 2436 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 103814727060 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5