BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg928125 Length=1680 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G05350.1 | Symbols: | Metallopeptidase M24 family protein |... 2724 0.0 > AT3G05350.1 | Symbols: | Metallopeptidase M24 family protein | chr3:1526963-1533867 REVERSE LENGTH=2297 Length=2297 Score = 2724 bits (1475), Expect = 0.0 Identities = 1618/1687 (96%), Gaps = 10/1687 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTAAACTCTAGTTGGATTCTCATGCGTGCTGGTAATCCGGGAGTCCCCACGGCAAGTGAA 60 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 490 TTAAACTCTAGTTGGATTCTCATGCGGGCTGGTAATCCGGGAGTCCCCACGGCGAGTGAA 549 Query 61 TGGGTAGCTGATGTTTTGGCTCCTGGTGGAAGAGTTGGTATTGACCCTTTCCTTTTTTCC 120 ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 550 TGGATAGCTGATGTTTTGGCGCCTGGTGGAAGAGTTGGTATTGACCCTTTCCTTTTTTCC 609 Query 121 GCCGATGCTGCTGAGGAATTGAAGGAGGTTATAGCGAAGAAGAATCATGAGTTGGTTTAC 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 610 GCCGATGCTGCTGAGGAATTGAAGGAGGTTATAGCAAAGAAGAATCATGAGTTGGTTTAC 669 Query 181 TTGTACAATGTAAATCTTGTGGATGAGATATGGAAGGACTCAAGGCCAAAGCCTCCAAGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 670 TTGTACAATGTAAATCTTGTGGATGAGATATGGAAGGACTCAAGGCCAAAGCCTCCAAGC 729 Query 241 AAACAAATAAGGATACATGACTTGAAGTATGCTGGTGTAGATGTGGCCTCGAAATTGTTG 300 | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 730 AGACAAATAAGGATACATGACTTGAAGTATGCTGGTTTAGATGTGGCCTCGAAATTGTTG 789 Query 301 TCTCTGAGGAATCAAATTATGGATGCTGGCGCATCTGCCATTGTAATATCCATGCTTGAT 360 ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 790 TCTTTGAGGAACCAAATTATGGATGCTGGCACATCTGCCATTGTAATATCCATGCTTGAT 849 Query 361 GAGATTGCATGGGTGCTTAATCTGAGAGGGAGCGATGTTCCACATTCACCTGTAATGTAT 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 850 GAGATTGCATGGGTGCTTAATCTGAGAGGGAGCGATGTTCCACATTCACCTGTAATGTAC 909 Query 421 GCATATCTGATTGTAGAGGTTGACCAAGCCCAACTCTTTGTAGATAATTCTAAAGTATCG 480 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 910 GCATATCTGATTGTAGAGGTTGACCAAGCCCAACTTTTTGTAGATAATTCTAAAGTAACG 969 Query 481 GCGGAGGTGAAAGATCATTTGAAAAACGCACGGATCGAACTTAGACCATACGATTCCATT 540 | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 970 GTGGAGGTGAAAGATCATTTGAAAAACGCAGGGATCGAACTTAGACCTTACGATTCCATT 1029 Query 541 CTTCAAGGAATAGATAGTCTGGCAGAACGAGGAGCTCAGCTCTTGATGGATCCATCAACC 600 |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1030 CTTCAAGGAATAGATAGTTTGGCAGCACGAGGAGCTCAGCTCTTGATGGATCCATCAACC 1089 Query 601 CTCAACGTAGCTATCATTAGTACCTACAAATCTGCGTGTGAAAGATA--C-------TCT 651 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | Sbjct 1090 CTCAACGTAGCTATCATTAGTACCTACAAATCTGCCTGTGAAAGATATTCGAGGAATTTT 1149 Query 652 GAAAGTGAAGACAAAGCTAAGATGAAGTTTACTGATAGCTCCAACGGACAGACTGCCAAT 711 ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| Sbjct 1150 GAAAGCGAAGCCAAAGTTAAGACAAAGTTTACTGATAGCTCCAGCGGATATACTGCCAAT 1209 Query 712 CCCTCTGGTATTTACATGCAATCTCCTATTTCTTGGGCAAAGGCCATTAAAAATGATGCC 771 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1210 CCTTCTGGTATTTACATGCAATCTCCTATTTCGTGGGCAAAGGCCATTAAAAATGATGCT 1269 Query 772 GAGCTACAGGGAATGAAGAACTCTCACTTGAGAGATGCTGCTGCTCTAGCTCATTTCTGG 831 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1270 GAGCTAAAGGGAATGAAGAATTCTCACTTGAGAGATGCTGCTGCCCTAGCTCATTTCTGG 1329 Query 832 GCTTGGCTGGAAGAAGAAGTGCATAAGAATGCGAACCTAACAGAGGTCGATGTGGCTGAC 891 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1330 GCTTGGCTGGAAGAAGAAGTGCATAAGAATGCGAATCTAACAGAGGTCGATGTGGCTGAC 1389 Query 892 AGGCTCCTTGAATTCCGTTCAATGCAAGATGGTTTTATGGATACAAGCTTCGATACAATA 951 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1390 AGGCTTCTTGAATTCCGTTCAATGCAAGATGGTTTTATGGATACAAGCTTTGATACAATA 1449 Query 952 AGTGGTTCCGGTGCAAATGGTGCTATTATACATTATAAACCCGAGCCTGAGAGCTGCAGT 1011 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1450 AGTGGTTCCGGTGCAAATGGTGCTATTATACATTATAAGCCCGAGCCTGAGAGCTGCAGT 1509 Query 1012 CGTGTAGACCCTCAAAAACTTTACTTGCTGGATAGTGGCGCTCAATATGTTGATGGAACA 1071 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1510 CGTGTAGACCCTCAAAAACTTTTTTTGCTGGATAGTGGCGCTCAATATGTTGATGGAACA 1569 Query 1072 ACAGACATCACCAGAACAGTACATTTTAGTGAACCTTCTGCCCGAGAAAAAGAATGTTTC 1131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 1570 ACAGACATCACCAGAACAGTACATTTTAGTGAACCTTCTGCCCGTGAAAAGGAATGTTTC 1629 Query 1132 ACTCGAGTTTTGCAGGGTCATATAGCTCTTGATGAAGCCGTGTTCCCAGAAGGTACTCCT 1191 |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1630 ACTCGAGTCTTGCAGGGTCATATAGCTCTTGATCAAGCCGTGTTCCCAGAAGGTACTCCT 1689 Query 1192 GGTTTTGTATTGGATGGGTTTGCACGCTCTTCTCTTTGGAAAATTGGGCTTGATTACCGC 1251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1690 GGTTTTGTATTGGATGGGTTTGCACGCTCTTCTCTATGGAAAATTGGACTTGATTACCGC 1749 Query 1252 CATGGGACAGGACACGGCGTAGGTGCTGCACTCAATGTGCATGAAGGTCCTCAAAGTATT 1311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1750 CATGGGACAGGACACGGCGTAGGTGCTGCACTCAATGTGCATGAAGGTCCTCAAAGTATT 1809 Query 1312 AGCTTTCGGTATGGAAACATGACCCCTCTTCAGAATGGCATGATAGTAAGCAATGAACCT 1371 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1810 AGCTTTCGGTATGGAAACATGACCCCTCTTCAAAATGGCATGATAGTAAGCAATGAACCT 1869 Query 1372 GGATATTATGAAGACCATGCATTTGGGATTCGAATTGAGAATCTCCTTCATGTGAGAGAT 1431 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1870 GGATATTATGAAGACCATGCATTTGGGATCCGAATTGAGAATCTCCTTCATGTGAGAGAT 1929 Query 1432 GCTGAAACACCAAACCGCTTTGGTGGTACTACATACCTTGGATTTGAGAAGCTTACATTC 1491 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1930 GCTGAAACACCAAACCGCTTTGGTGGTGCTACATACCTTGGATTTGAGAAGCTTACATTC 1989 Query 1492 TTCCCCATTCAGACAAAAATGATTGATGTTTCTTTGCTATGTGATACTGAGATTGACTGG 1551 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| Sbjct 1990 TTCCCCATTCAGACAAAAATGGTTGATGTTTCTTTGCTGTCTGATACTGAGGTTGACTGG 2049 Query 1552 CTTAATCGTTACCACGTGGAAGTCTGGGAAAAGGTTTCACCATTATTGGAAGGTTCTACT 1611 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2050 CTTAATAGTTACCACGCGGAAGTCTGGGAAAAGGTTTCACCATTATTGGAAGGTTCTACT 2109 Query 1612 ACTCAGCAGTGGCTCTGGAACAACACAAGACCGTTAGCCAAAAGATGATCAAACCCGCCA 1671 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 2110 ACTCAGCAGTGGCTCTGGAACAACACAAGACCCTTAGCCAAACCATGATCAAACCCACCA 2169 Query 1672 AGTGTTT 1678 ||| ||| Sbjct 2170 AGT-TTT 2175 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 83031701430 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5