BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg928450 Length=2593 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G07660.1 | Symbols: | Kinase-related protein of unknown fun... 4132 0.0 > AT3G07660.1 | Symbols: | Kinase-related protein of unknown function (DUF1296) | chr3:2444778-2450561 REVERSE LENGTH=3212 Length=3212 Score = 4132 bits (2237), Expect = 0.0 Identities = 2482/2601 (95%), Gaps = 13/2601 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TACCTTTGATATAAGAGAGGATGGTCGGCAGTGGCGCTAGGGTTTCGATTCCGGCCAGTA 60 ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || Sbjct 170 TACGTTTGATAGAAGAGAGGATGGTCGGCAGTGGCGCTAGGGTTTCGATTTCGGCTACTA 229 Query 61 CTCGGAAGACGATTCAGAACATCAAGGAGACCACTGCTGGGAACTATAGCGAGGATGAGA 120 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 230 CTCGGAAGATGATTCAGAACATTAAGGAGACCACTGCTGGGAACTATAGCGAGGATGAGA 289 Query 121 TTCTCGCAATGCTTCATGAATGTAACATGGATCCTGATGAGACCGCTCAACGCTTACTTC 180 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 290 TTATCGCAATGCTTCATGAATGTAACATGGATCCTGATGAGACCGCTCAACGCTTACTTC 349 Query 181 TTCAGGATCCATTCCATGAGGTTaaaaaaaaGCGTGATAAGAGGAAAGAGAACATCCACA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 350 TTCAGGATCCATTCCATGAGGTTAAAAAAAAGCGTGATAAGAGGAAAGAGAACATCAACA 409 Query 241 ACAAGGATTCTGCTGAATCACCATGGAGATCTGGTGGAGGGGGGCGTGGTAGCAGGGGTG 300 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 410 ACAAGGATTCTGCTGAATCACAATGGAGATCTGGTGGAGGGGGCCGTGGTAGCAGGGGTG 469 Query 301 GTCGGATGAATTTCTCTTCTCGTCATGCATCAAATGATGTTGCTGGTGCAAAGAATTCTT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 470 GTCGGATGAATTTCTCTTCTCGTCATGCATCAAATGATGTTGCTGGTGCAAAGAATTCTT 529 Query 361 TCAGAAAAGAAAACGGTCCAAAACAGGTCACTGATCCATCAACTTCAACCTCTCAAGGGA 420 ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 530 TCAAAAAAGAAAACGGTCCAAAGCAGGTTATTGATCCATCAACTTCAACCTCTCAAGAGA 589 Query 421 TAAAAACGAAAGATATGGCTTTGGTCTCAAGCCATTCAGCTGTGATGGATAAAAGTACTG 480 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 590 TAAAAACGAAAGATATAGCTCTGGTCTCAAGCCATTCTGCTGTGATGGATAAAAGTACTG 649 Query 481 TTGGTCTGACATCAGGAAGCTCTGATGTTCGCCATTCTTCCAACCTACCAGCTAGTTCAG 540 |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 650 TTGGTCCGAAATCAGGAAGCTCTGATGTTCGCCAGTCTTCCAACCTACCAGCTGGTTCAG 709 Query 541 GTCAACTGAAAGCT-ACTGGATCTTCAGTGCTCTCAAACAACATTGATGGTGCACCGTCT 599 ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 710 GTCAACTTAAAGCTGGC-CGATCTTCAGTGCCCTCAAACAACATTGATGGTGCACCGTCT 768 Query 600 TCTGTGGAATTAAGCAAAAATCGTTTAGCAGTTGGCTCAAGGGATGTGTATACTGAGCAG 659 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| Sbjct 769 TCTGTGGAATTAAGCAAAAATCGTGTAGCAGTTGGCTCTAGGGTTGTGCATACTGAGCAG 828 Query 660 AAGTCAGCTGATTCTCTGCCACTCCCTCGTCCATCCTCTTCTGAAGTTCGATTCACATCT 719 ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 829 AAGGCAGTTGATTCTCTGCCACTCCCTCGTCCATCCTCTTCTGAAGTTCGATTCACATCT 888 Query 720 TCAAATCCCAAATCAGAGCAAACAGCACATGAACAGCACATTGGAGAAAGCAAGTCCCAT 779 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 889 TCAAATCCCAAATCAGAGCAAACAGCACCTGAACAGCACATTGGAGAAAGCAAGTCCCAT 948 Query 780 GCCAGATCCCGTGGGGTTGGGAAGACTGCCGTGAATG--A-TTAT-GTTCCGAGGCCTGC 835 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||| Sbjct 949 ACCAGATCCCGTGGGGTTGGGAAGACTGCCGTGAATGATACTTATGGTT-CAAGGCCTGC 1007 Query 836 TTCGTCTCATAGCAACAGCACGGGTAGTCGGCCTTCTTCTAACTACAGTAATCGGTCACA 895 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1008 TTCATCTCATAGCAACAGCACGGGTAGTCGGCCTTCTTCTAACTACAGTAATCGGTCACA 1067 Query 896 TCAGACTGTTGGTCCTCAAAGAGGTGCTGGTTCCATTAAGGAATGGAAACCGAAGCC--- 952 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1068 TCAGACTGTCGGTCCTCAAAGAGGTGCTGGTTCCATTAAGGAATGGAAACCGAAGCCAGT 1127 Query 953 AGTGAACCATAACACTACCCAGGGCCCTGGTGCATCATCTACAGGTGAAACCCTTGCAGT 1012 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1128 AGTGAACCATAACACTACCCAGGGCTCTGGTGCATCATCTACAGGTGAAACTCTTGCAGT 1187 Query 1013 TCCTACTGAATCCAGTGAAAAATCTGTTGAGGATGTTATCCCTTCAGCAGAGGCCACATC 1072 |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| || |||||| ||||| |||||||| Sbjct 1188 TCCTACTGAAGCCAGTGACAAATCAGTTGAAGATGCTACCCCTTCGGCAGAAGCCACATC 1247 Query 1073 CAGATTGCAGAGACAGCTTGAAGACTTGCAGATTCAACGTCAGCATGTTATTATTCCAAA 1132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1248 CAGATTGCAGAGACAGCTTGAAGACTTGCAGATTCAACGTCAGCATGTTATTATTCCAAA 1307 Query 1133 CCATATTCTTGTTCCAGAGGCTGAACGAACCAAGTTAAGCTTTGGAAGCTTTGATGCTGG 1192 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1308 CCATATTCTTGTTCCAGAGGCTGAACGAACCAAGTTAAGCTTTGGAAGCTTTGATGCTGA 1367 Query 1193 CTTTTCTATTACGTCTAGCTCAGTAGCCTGTCCTCAGAGTGAAAAGAGATCTGCACCTCT 1252 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1368 CTTTTCTATTACGTCTAGCACAGTAGCCTTTCCTCAGAGTGAAAAGAGATCTGCACCTCT 1427 Query 1253 CTCTCATAATTCGCAGGAAGTTGAAGAAAGTTTTGAAGAGGAGGAATTTAGGCACCCAAC 1312 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1428 TTCTCATAATTCGCAGGAAGTTGAAGAAAGTTTTGCAGAGGAGGAATTTAGGCACCCAAC 1487 Query 1313 TGTCCATTCGACTGAAAAGGAAGAGGACAATAATGTTTACTCCGAGTCACCTTCACAAGT 1372 ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1488 TGTCCATTCGATTGAAAAAGAAGAGGACGGTAATGTTTACTCCGAGTCACCTTCACAAGT 1547 Query 1373 TCCAGAAAATATGGCTGGTGAAGGTATTAGTGCAACAAATGCAGCTCCAGAGTATGATGT 1432 |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1548 TCCAGATAATATGGCTGGTGAAGGTAATACTGCAACAAATACAGCTCCAGAGTATGATGT 1607 Query 1433 CACCAAGCAAGAGAATCTGTTGGAGTCCGAAAGCAATCAAAACTCTTTTGACCATGTTCC 1492 ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1608 CACCAAGCAGGAGAATATGTTGGAGTCCGAAAGCAATCAAAACTCGTTTGACCAGGTTCC 1667 Query 1493 AAGTAGTATTATCGGGCTTGCTCCTCCAGCTCCTGGGAGCCAGCATCCACAATTTGAGAC 1552 ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1668 AAGTAATATTATTGGGATTGTTCCTCCAGCTCCTGGGAACCAGCATCCACAATTTGAGAC 1727 Query 1553 TGCTGACCCTCAAGCACGTGATGCTCTTCGTATTCCCAATTTTGTGGTCCAACCACCTTT 1612 | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||| Sbjct 1728 TTCTGACCCTCAAGCACGTGATGCCCTTCGTCTTCCCAGTTTTATGGGCCAACAACCTTT 1787 Query 1613 TGATACGGCGAGTTACTATGCTCAATTCTACCGCCCAGGTCCTGACAGTGATGGCCGTGT 1672 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1788 TGATACGGCGAGCTACTATGCTCAGTTCTACCGCTCAGGTCCTGACAGTGATGGCCGTGT 1847 Query 1673 TTCTCCCTTTGTTTCCCCAGGGGTTGCCTCCAAATTTAATGGGAATGTTACAGTAATGCC 1732 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| Sbjct 1848 TTCTCCCTTCGTTTCCCCAGGGGTTGCCTCCAAATTTAATGGG-A--TTACAGTATTGCC 1904 Query 1733 TCCGCATTCATCTCAAACCATGCAAGAGGGTGGAAATAACTTAGTTCTGTCTACTGCTAG 1792 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 1905 TCCGCATTCATCTCAAACCATGCAAGAGGGTGGAAATAACTTGGTCCTGTCTACTGCTAG 1964 Query 1793 TCCACCACCACTGGTAACTCAGGCTGCTGGACTAATGCAGAGCTCTATACCTGTCACGCA 1852 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1965 TCCACCACCACTGGTAACTCAAGCTGCTGGACTAATGCAGAGCTCTATACCTGTCACGCA 2024 Query 1853 GCAGCCTGTTCCTGTTTTCCGCCCCCCGGGTTTACATATGTCGCATTATCCACCAAATTA 1912 |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2025 GCAGCCTGTTCCTGTTTTCCGCCCTCCGGGCTTACATATGTCGCATTATCCACCAAACTA 2084 Query 1913 CGTGCCATATGGATACTTCTCCCCATTCTATCTACCTCCCCCTACAATGCACCAATACTT 1972 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2085 CGTGCCATATGGATACTTCTCCCCATTCTATTTACCTCCCCCTACAATGCACCAATACTT 2144 Query 1973 AAGCAATGGTGCATTTGCTCAGCAACCTCAGGCAAGCGGTGTATATCCTCCACCCCCTGG 2032 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2145 AAGCAATGGTGCATATGCTCAGCAACCTCAGGCAAGCGGTGTATATCCTCCACCTCCTGG 2204 Query 2033 AGCTGCAACAGGAGGCAAATACACACTCCCTCATTACAAGCCTGGGACTAATACAGGAAA 2092 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 AACTGCAACAGGAGGCAAATACACACTCCCTCATTACAAGCCTGGGACTAATACAGGAAA 2264 Query 2093 CATGACTCATGTCGGTATGCCTGGTGGTTATGGACCAACATATGGGTCCTTCCCAGCAGG 2152 |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2265 CATGACTCATGTCGGTATTACTGGTGGGTATGGACCAACATATGGGTCTTTCCCAGCAGG 2324 Query 2153 ATATAATCCCACCTCTGCTGCATCAGCCGGGAATTCGACTTCCAATGAGGATCTCAACTC 2212 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2325 ATATAATCCCACCTCTGCTGCATCGGCCGGGAATTCGACTTCCAATGAGGATCTCAACTC 2384 Query 2213 ATTGCAGTTGAAAGAAAACAACGGCTACAGCGCAACAGGGCAACAGAGTGAAGCATTACC 2272 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2385 ATTGCAGTTGAAAGAAAACAACGGCTACAGTACAACAGGGCAACAGAGTGAAGCATTACC 2444 Query 2273 TGTATGGATTACTGGGCCAGGACGAGATGTGTCAAGCTCTTTCTATGGTTTACAGCACCA 2332 ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2445 TGTATGGATTACTGGACCAGGACGAGATGTGCCAAGCTCTTTCTATGGTTTACAGCACCA 2504 Query 2333 TGGGCAACACGTGACTTACGCTCCAGCACAAGCTGGTCACGTCGCGTACCCAGGTATTTA 2392 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || Sbjct 2505 TGGGCAACACGTGACTTATGCTCCAGCACAAGCTGGTCACGTCGCATTCCCAGGTATGTA 2564 Query 2393 CCATCCGGGACAAGCAGTAACAGCAACAGGAGTTCATCATCCGCTTTTACAACAGTCTCA 2452 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2565 CCATCCGGGACAAGCAGTAACAGCAACAGGAGTCCATCATCCGCTTTTACAACAGTCTCA 2624 Query 2453 AGGTGTGGCTGGAGCTGAAATGGTTGCACCTGCGCCTAACGTTTTCCAACAGCCTCAGCA 2512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2625 AGGTGTGGCTGGAGCTGAAATGGTTGCACCTGCGCCTAACGTTTTCCAACAGCCTCAGCA 2684 Query 2513 AACACAGATGAATTGGCCAAGTAATTACTGAAACAGGAAGTATAAAGGAGAAAAAGATTT 2572 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2685 AACACAGATGAATTGGCCAAGTAATTACTGAAACAGGAAGTATAAAGGAGAAAAAGATTT 2744 Query 2573 TGAAGATTCAACAAGTTTCAA 2593 ||||||||||||||||||||| Sbjct 2745 TGAAGATTCAACAAGTTTCAA 2765 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 128728375738 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5