BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg928727 Length=3330 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G10380.1 | Symbols: SEC8, ATSEC8 | subunit of exocyst comple... 5698 0.0 > AT3G10380.1 | Symbols: SEC8, ATSEC8 | subunit of exocyst complex 8 | chr3:3219523-3228933 REVERSE LENGTH=3814 Length=3814 Score = 5698 bits (3085), Expect = 0.0 Identities = 3242/3319 (98%), Gaps = 5/3319 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TCGAGATTTAGCTTTTCTCTTCGTGATCGGCAACGTATTGATCAGATTCTAGCGAGGATT 60 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 105 TCGAGATTTAGCTTTTCTCTTCGTGATCGGGAACGTGTTGATCAGATTCTAGCGTGGATT 164 Query 61 CGT-TCCCCATCTACAGACAGC-TTGATTGGAATGTGCTGAGGAACACTCATTTGGGCTC 118 ||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| Sbjct 165 CGTAT-CCCAGCTACAGAGAGCTTTGATTGGAATGTGCTGAGGAACATTCATTTCGGCTC 223 Query 119 TAATAAGCCAAGCGGAGTGAGTTCGCCAGCATGGGGATTTTCAATGGTTTGCCTGTACCC 178 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 224 TAATAAGCCAATCGGAGTGAGTTCGCCAGCATGGGGATTTTCAATGGTTTGCCTGTACCC 283 Query 179 TCGGATAAAACTTACCTTAGGGAGGAGCTGGCAAGAATAGATGAGAGCTGGGCTGCTGCA 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 284 TCGGATAAAACTTACCTTAGGGAGGAGCTGGCAAGAATAGATGAGAGCTGGGCTGCTGCA 343 Query 239 CGATTTGACTCTTTGCCACATGTTGTGCATATTTTGACATCAAAAGACCGTGAAGCTGAC 298 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 344 CGATTTGACTCTTTACCACATGTTGTTCATATTTTGACATCAAAAGACCGTGAAGCTGAC 403 Query 299 ATTCATATATTAAAGGAACAAAGTGATGTTGTCGAGGAGGTTGTGGATGAAGTTGTCCAC 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 404 ATTCATATATTAAAGGAACAAAGTGATGTTGTCGAGGAGGTTGTTGATGAAGTTGTCCAT 463 Query 359 GCTTATCATGGTGGTTTCAACAAGGCCATTCAAAACTATTCCCAGATCTTGCGATTATTC 418 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 464 GCTTATCATGGTGGTTTCAACAAGGCCATTCAAAACTATTCACAGATCTTGCGATTATTC 523 Query 419 AGTGAGTCCACTGAAAAGATAGGCGACTTGAAGCACGATTTAGCAGAAGCGAAGCAGAGC 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 524 AGTGAGTCCACTGAAAAGATAGGCGACTTGAAGCACGATTTAGCAGAAGCGAAACAGAGC 583 Query 479 TTGGGTGCACGCAATAAACAATTACATCAGTTGTGGTACCGTTCTGTTACATTGCGGCAC 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 584 TTGGGTGCACGCAATAAACAATTACATCAGTTGTGGTACCGTTCTGTTACATTGCGGCAC 643 Query 539 ATCATCTCACTTTTGGATCAAATCGAGGGCATTGCTAAGGTTCCATCTCGTATTGAGAAG 598 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 644 ATCATCTCACTTTTGGATCAAATCGAGGGCATTGCCAAGGTTCCATCTCGTATTGAGAAG 703 Query 599 CTCATTGCTGATAAGCAGTTTTACGCTGCTATTCAAGTGTATCTCCAGTCGTCTCTGATG 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 704 CTCATTGCTGATAAGCAGTTTTACGCTGCTATTCAAGTGTATCTCCAGTCGTCTCTAATG 763 Query 659 CTGGAGCGTGAGGGGCTTCAAACGGTTGGTGCTCTTCAAGATGTCAGATCTGAGCTAACT 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 764 CTGGAGCGTGAGGGGCTTCAAACGGTTGGTGCTCTTCAAGATGTCAGATCTGAGCTAACT 823 Query 719 AAGTTGCGGGGAGCCCTTTTCTTCAAAATTCTAGATGATTTGCATGCACACCTATACAAT 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 824 AAGTTGCGGGGAGCCCTTTTCTTCAAAATTCTAGATGATTTGCATGCACACCTATACAAT 883 Query 779 AGAGGTGAATACAGTTCAGTTGCGTCAAGCATATATGAAAGAGATGATGAAGTACCAACG 838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 884 AGAGGTGAATACAGTTCAGTTGCGTCAAGCATATATGAAAGAGATGATGAAGTACCAACG 943 Query 839 ACAACAGCTGTTGCAGCTAGTCGAATGAGCTCACAACCACTGTCTCGTAGAACACGGACG 898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 944 ACAACAGCTGTTGCAGCTAGTCGAATGAGCTCACAACCACTGTCACGTAGAACACGGACA 1003 Query 899 CTGAAAGGTGATAGTCAGTTTGGTGTTAGAGGGCTCACAAATGGTTCATATAGAACCGGT 958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1004 CTGAAAGGTGATAGTCAGTTTGGTGTTAGAGGGCTCACAAATGGTTCATATAGAACCGCT 1063 Query 959 TCTAATGATGAAAGTTCATCATTTGATGGACATGATGAAGAGGACTCCGTAGAACATGAT 1018 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1064 TCTAATGATGAAAGTTCATCATTTGATGGACATGATGAAGAAGACTCCGTAGAACATGAT 1123 Query 1019 GAATCCACCGCAGATACTGCCAGGAATGGCACTGATAGTAAATTGCTTTCTTACCAACTT 1078 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1124 GAATCCACCGCAGATACTGCCAGGAATGGCACTGATAGTAAATTGCTTTCTCACCAACTT 1183 Query 1079 CCGCCATGGCTTTCTGATTCCACTCCTGACGAGTTTATTGAAGCAATAAGAAAGAGTGAT 1138 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1184 CCTCCATGGCTTTCTGATTCCACTCCTGATGAGTTTATTGAAGCAGTAAGAAAGAGTGAT 1243 Query 1139 GATCCACTGCATGTGAAGTATCTACAGACCCTTGTTCAGTGTCTCTGCATGCTTGGCAAA 1198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1244 GATCCACTGCATGTGAAGTATCTACAGACCCTTGTTCAGTGTCTCTGCATGCTTGGCAAA 1303 Query 1199 GTTGCAGCTGCTGGTGCTATCATATGCCAAAAACTTCGACCCACTATTCATGAGATCATA 1258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1304 GTTGCAGCTGCTGGTGCTATCATATGCCAAAAACTTCGACCCACAATTCATGAAATCATA 1363 Query 1259 ATATCCAAGATTAAAGCCCATATGGAGACTACAAATTTTTCAAAGTCCTCTTGTAGTCAG 1318 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| Sbjct 1364 ATATCCAAGATTAAAGCCCATCTGGAGACTACAAATTTGTCAAAGTCCGCGTGTAGTCAG 1423 Query 1319 GGTGATCGAAATGTAGCTGCCGGATTGCATTTTATCAAAGGACAGTCGGAGGCCTACAGG 1378 |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || Sbjct 1424 GGTGATCGAAGTGTAGCTGCTGGATTGCATTTAATCAAAGGACAGTCAGAGGCCTACCGG 1483 Query 1379 TTATCAAAAGAGAAACCTCAAAATGGGATATCAAATTCAGGAACTCACTTGGCTGTGAGC 1438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 1484 TTATCAAAAGAGAAACCTCAAAATGGGATATCAAATTCAGGAACTCACCTAGCTGTGAGC 1543 Query 1439 CCTGTTTCGCCTCTTATGGCTCCTGGAGGCAAAGCGCAGACTGCAGCAAAAGAACTTCTT 1498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| Sbjct 1544 CCTGTTTCGCCTCTTATGGCTCCTGGAGGCAAAGCGCAGGCTGCAGCGAAGGAACTTCTT 1603 Query 1499 GACTCGATTTTAGATACTATTGTCAAGATATTTGAAAATCATGTTGTTATTGGAGAGCTT 1558 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1604 GACTCAATTTTAGATACTATTGTCAAGATATTTGAAAATCATGTTGTTATTGGAGAGCTT 1663 Query 1559 TTGGAGTTGAAGGCTTTGCAACATGACATTAACACACCAAGGTCATTACCTACTGATGTG 1618 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1664 TTGGAGATGAAGGCTTCACAACATGACATTAACACACCAAGGTCATTGCCTACTGATGTG 1723 Query 1619 AACTGGAACACCGAGTCTGAAGCATCCCAAGCTACTGGAGGCTACACTATCAGTTTTCCC 1678 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1724 AATTGGAACACCGAGTCTGAAGCATCCCAAGCTACTGGAGGCTACACTATCAGTTTTCCC 1783 Query 1679 TTGACAGTCTTACAGAGTGAATGCCAACAACTCATATGTGAGATTCTACGAGCAACTCCA 1738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1784 TTGACAGTCTTACAGAGTGAATGCCAACAACTCATATGTGAGATTCTACGAGCAACTCCA 1843 Query 1739 GAAGCTGCTTCAGCAGATGCTGCCGCACAAACTGCTAAGCTTGCAAAGAAGGCTCCGAAG 1798 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1844 GAAGCTGCTTCAGCAGATGCTGCTGCACAAACTGCTAAGCTTGCAAAGAAGGCTCCGAAG 1903 Query 1799 AAAGACAAAACGGATGCACCTGAAGATGGGCTAACATTCACCTTTCGGTTTACAGATGCA 1858 |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1904 AAAGACAAAAGGGATGCACCTGAGGATGGCCTAACATTCACCTTTCGGTTTACAGATGCA 1963 Query 1859 ACTGTATCGATTTCTAATCAGGGAGCTGATCTCATTCGTCAAGGCTGGGGAAAGAGGGCT 1918 |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1964 ACTGTATCAATATCTAATCAGGGAGCCGATCTCATTCGTCAAGGCTGGGGAAAGAGGGCT 2023 Query 1919 CCAAATGCATCACTGGAAGGTTATGGATCTGCAGCTGTTTTGCCTGAACAAGGAATATAT 1978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2024 CCAAATGCATCACTGGAAGGTTATGGATCTGCAGCTGTTTTGCCTGAACAAGGAATATAT 2083 Query 1979 CTAGCTGCATCTATTTACCGGCCTGTCCTTCAGTTTACAGATAAAATCACTTCAATGTTG 2038 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2084 CTAGCTGCATCTATTTACCGGCCTGTTCTTCAGTTTACAGATAAAATCACTTCAATGTTG 2143 Query 2039 CCCAAAAAGCATTCCCAGCTTGTGAATGATGGATTGCTTACATTCACTGAGAACTTTGTG 2098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2144 CCCAAAAAGCATTCCCAGCTTGTGAATGATGGATTGCTTACATTCACTGAAAACTTTGTG 2203 Query 2099 AAGGACCATCTGTTACCGACAATGTTTGTGGACTATAGGAAAGGCGTACAGCAAGCTATA 2158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2204 AAGGACCATCTGTTACCGACAATGTTTGTGGACTATAGGAAAGGCGTACAGCAAGCTATA 2263 Query 2159 TCAAGCGCTGCCGCATTTCGGCCCCGTGCACATACAACTACTTACACCGCAACCGTAGAA 2218 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2264 TCAAGCGCTGCTGCATTTCGGCCGCGTGCACATACAACTACTTACACCGCAACCGTAGAA 2323 Query 2219 AAGGGTCGACCTATCTTACAAGGTCTTTTGGCAATAGATCTCCTTGCAAAAGAGGTTCTT 2278 ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2324 AAGGGACGACCTATCTTACAAGGTCTTCTAGCAATAGATCTCCTTGCAAAAGAGGTTCTT 2383 Query 2279 GGCTGGGCTCAAGCCATGCCTAAATTTGCTACTGACCTTGTGAAGTATGTTCAGACATTT 2338 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2384 GGCTGGGCTCAAGCCATGCCTAAATTTGCTACTGATCTTGTGAAGTATGTTCAGACATTT 2443 Query 2339 CTTGAGAGGACATTTGAGAGATGTCGAACATCATACATGGAGGCTGTTCTAGAGAAGCTC 2398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2444 CTTGAGAGGACATTTGAGAGATGTCGAACATCATACATGGAGGCTGTTCTAGAGAAGCTC 2503 Query 2399 AGTTACATGCTCATTGGGAGGCATGATATTGAGAAATTGATGCGGCTTGATGCGGCGAGT 2458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2504 AGTTACATGCTCATTGGGAGGCATGATATTGAGAAATTGATGCGGCTTGATGCGGCGAGT 2563 Query 2459 GCTTGTTTGCCATCTACGCTTGGCCATGCCGTTTCTCACTCTGAGGCTGTTGGCACTGAA 2518 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2564 GCTTGTTTACCATCTACGCTTGGCCATGCCGTTTCTCACTCTGAGGCTGTTGGCACTGAA 2623 Query 2519 GTAGAACTCAGTGAACTATTCTTGAGTTTGCGACCTATCAAGCAGGATAATCTAATTCGT 2578 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2624 GTAGAACTCAGTGACCTATTCTTGAGTTTGCGACCTATCAAGCAGGATAATCTAATTCGT 2683 Query 2579 GATGACAACAAACTGATTTTGTTAGCTTCTCTCAGTGACTCGCTTGAATACGTGGCAGAC 2638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2684 GATGACAACAAACTGATTTTGTTAGCTTCTCTCAGTGACTCGCTTGAATACGTGGCAGAC 2743 Query 2639 TCTATTGAGAGGCTTGGACAAGCAGTTCCTCGTGTGGCAAGTCAAGCTGAAGGTAATAGC 2698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2744 TCTATTGAGAGGCTTGGACAAGCAGTTCCTCGTGTGGCGAGTCAAGCTGAAGGTAATAGC 2803 Query 2699 AGAAATCAAGCAGCTTCTCCTAGGAATCTGGCATCATTTGCTGATGAGTACAGAAAACTT 2758 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2804 AGAAATCAAGCAGCTTCTCCTAGGAATCTGGCATCATTTGCAGATGAGTACAGAAAACTT 2863 Query 2759 GCGACTGATTGCCTAAAGGTTCTTCGTGTTGAGATGCAATTGGAAACAGTCTTTCATCTT 2818 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2864 GCGACTGATTGCCTAAAGGTTCTTCGTGTTGAGATGCAATTGGAAACAGTCTTTCATCTT 2923 Query 2819 CAGGAAATGACGAATAGGGAATACTTGGAGGATGAGGATGCTGAAGAGCCGGACGACTTT 2878 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2924 CAGGAAATGACGAATAGGGAATATTTGGAGGATGAGGATGCTGAAGAGCCGGACGACTTT 2983 Query 2879 GTGATATCTCTTACTTCACAGATAACACGTAGGGAGGAGGGAATGGCGCCTTTCATCTCT 2938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2984 GTGATATCTCTTACTTCACAGATAACACGTAGGGAGGAGGGAATGGCGCCTTTCATCTCT 3043 Query 2939 GGTGAGAAGCGGAATTACGTTTTTGGTGGCAT-ATGTGGAATTGCAGCAAATGCGTCCAT 2997 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3044 GGTGAGAAGCGGAATTACGTTTTTGGTGGCATTA-GTGGAATTGCAGCAAATGCGTCCAT 3102 Query 2998 TAAGGCTTTGGCTGACATGAGATCAATCAACCTTTTCGGGGTTCAACAAATATGTCGGAA 3057 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3103 TAAGGCTTTGGCTGACATGAGATCAATCAACCTTTTCGGGGTTCAACAAATATGTCGGAA 3162 Query 3058 CACTATTGCAGTGGAACAGGCCATGGCAGCTATTCCATATATCGATGGTGAAACCGTACA 3117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3163 CACTATTGCAGTGGAACAGGCCATGGCAGCTATTCCATATATCGATGGTGAAACCGTACA 3222 Query 3118 ACAGAACCTAGATCGTGTCCGTACTTACTTTGAACTGTTAAACATGCCATTCGAAGCATT 3177 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3223 ACAGAACCTAGATCGTGTCCGTACTTACTTTGAGCTATTAAACATGCCATTCGAAGCATT 3282 Query 3178 GCTCGCTTTCATAGCAGAACACGACCAAATGTTTACACCCACAGAGTATTCCAATCTTCT 3237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3283 GCTCGCTTTCATAGCAGAACACGACCAAATGTTTACACCCACAGAGTATTCCAATCTTCT 3342 Query 3238 GAAGGTCAATGTTCCTGGAAGAGATACCCCTTCAGATGCTCAGTCACGCCTTTTGGAAAT 3297 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 3343 GAAGGTCAATGTTCCTGGAAGAGATACTCCTTCAGATGCTCAATCCCGCCTTTTGGAAAT 3402 Query 3298 TCTTTCTCACTAATGTCAA 3316 ||||||||| ||||||||| Sbjct 3403 TCTTTCTCATTAATGTCAA 3421 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 165701412729 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5