BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg928923
Length=2245
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G12012.1 | Symbols: CPuORF20 | conserved peptide upstream op... 3358 0.0
AT3G12010.1 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unkn... 3358 0.0
> AT3G12012.1 | Symbols: CPuORF20 | conserved peptide upstream
open reading frame 20 | chr3:3820352-3825765 FORWARD LENGTH=2699
Length=2699
Score = 3358 bits (1818), Expect = 0.0
Identities = 1972/2047 (96%), Gaps = 8/2047 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 188 GGCAAGTGTTGGTTCTGGTGCTTTATCACATGTGTATATACATCATCCAGCCCTACGTTG 247
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 440 GGCAGGTGTTGGTTCTGGTGCTTTATCACATGTCTATATACATCATCCATCCCTACGTTG 499
Query 248 CAATATTCCTGAATCCAGGGGGTTGTTCTATGATGATGCCAACAGATTGCTGATATGTAC 307
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 500 CAATATTCCTGAATCCAATGGGTTATTCTATGATGATGCCAACAGATTGCTAATATGTAC 559
Query 308 CACATCTAGTCAGGTCTTTTCATGGGAAACATCCCCCTTTAATCCAGACGTACCTCCCTC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 560 CACATCTAGTCAGGTCTTTTCATGGGAAACATCCCCCTTTAATCCAGACGTACCTCCTTC 619
Query 368 AGTTGATTCTATAAATGAAGGGCCTATTCTGTCAATCAGATTTTCTCTTGATAAAAAAGC 427
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 AGTTGATTCTATAAGTGAAGGGCCTATTCTATCAATCAGATTTTCTCTTGATAAAAAAGC 679
Query 428 GATAGCTGTCCAAAGATCTGATTGTGAAGTACAGTTGTTTAATCGAGAGACCAAGAAGAT 487
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 680 GATAGCTGTCCAAAGATCTGACTGTGAAATACAGTTGTTTAATCGAGAGACCAAGCAGAT 739
Query 488 ACTAAACCACAGATGTAAGGCAGGATCAGAGAGCATTCTCGGATTCTTTTGGAGTGACTC 547
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ACTTAACCACAAATGCAAGGCAGGATCAGAGAGCATTCTCGGATTCTTTTGGAGTGACTC 799
Query 548 TCCATTATGTGATCTTGCAATTGTAAAGACCAGTGGCATGGACTTGTTCGCTTGTGATTC 607
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 TCCATTATGTGATCTTGCAATTGTAAAGACCAGTGGTATGGACTTGTTCGCTTGTGATTC 859
Query 608 TATGTTGAATTCACTACGTTTGGTGGAAACCAAAAAGGCGAATGTTAATTGGTACACCTA 667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 860 TATGTTGAATTCACTACGTTTGGTGGAAACCAAAAAGGCGAATGTGAATTGGTACATCTA 919
Query 668 TACACATGAAACTCGATTGGTTCTTCTTGCATCAGGATTGCAATGCAAGACATTTAATGG 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 920 TACACATGAAACTCGATTGGTTCTTCTTGCATCAGGACTGCAATGCAAGACATTTAATGG 979
Query 728 ATTTCAGCTTTCCACTGCAGGAGTTGTTCGTTTACCGAGATTTGAGATGACCATGGCTAG 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 980 ATTTCAGCTTTCCACTGCAGGAGTTGTTCGTTTACCGAGATTTGAGATGACAATGGCTAG 1039
Query 788 ATCTGAATCAAACAGTAAACCTATTCTCTCTGCTGGAGATCTCCACTTAGTCACTGTCTA 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 ATCTGAATCAAACAGTAAACCTATTCTCTCTGCTGGAGATCTCCACTTAGTCACTGTCTA 1099
Query 848 TGGCCGAATATATTGCTTACAAGTGGACAGGGAGGCAATGCTACTGCATCTATACAGGTT 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 TGGCCGAATATATTGCTTACAAGTGGACAGGGAGGCAATGCTACTGCATCTATACAGGTT 1159
Query 908 TTACCGAGATGCAGTTGTTCATCAAGGTTCTTTACCAATATACTCAAGCAAATTGTCGGT 967
||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1160 CTACCGTGATGCAGTCGTCCAACAAGGTTCTTTACCAATATACTCAAGCAAGTTGTCGGT 1219
Query 968 GAATGTGGTCGATAATTTATTGCTTGTGCACCAAATCGATGCAAAGGTTGTCATCATCTA 1027
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 GAATGTGGTCGACAATTTATTGCTTGTGCACCAAATCGATGCAAAGGTTGTCATCATCTA 1279
Query 1028 CGACTTATTTGTGGATTCTCGAGCTCCTGTATCTGCGCCTCTTCCTTTGCTGTGGAGGGG 1087
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1280 CGACTTATTTGTGGATTCTCGAGCTCCTGTATCTGCGCCTCTTCCTTTACTGTGGAGGGG 1339
Query 1088 TTACCAAGGCTCTGACACATCGTCTCAAGCTGCTAACAAAGAAATTGAGAGCTCAGAATC 1147
|||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1340 TTACCAAGTCTCTGAGACATCGTCTCAAGCTGTTAACAAAGAAATTGAGAGCTCAGAATC 1399
Query 1148 ATCTACAAGCAATGAAAACATAGTCATGTATGAAGATGGCTGGACCTTTCTTGTTCCAGA 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1400 ATCTACAAGCAATGAAAACATAGTCATGTATGAAGATGGCTGGACCTTTCTGGTTCCAGA 1459
Query 1208 TCTTATTCTGGATGAGACTAACAAAGTTTTATGGAAGATACATTTGGATCTTGAGGCAAT 1267
|||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 CCTTATTCTGGATCAGACAAACAAGGTTTTATGGAAGATACATTTGGATCTTGAGGCAAT 1519
Query 1268 TTCCGCTAGCAGCTCAGACAGGACGTCTCTTCTAGAATTCCTGCAGCGAAGGAAGTTGGA 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1520 TTCCGCTAGCAGCTCAGACAGGACGTCTCTTCTAGAATTCCTGCAGCGAAGGAAGTTGGA 1579
Query 1328 AGCAAATAAGGCCAAACAATTGTGCTTGGGGATAGCAAGGGCTACTATTTTGGAACGTCG 1387
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1580 AGCAAATAAGGCCAAACAATTGTGCTTGGGGATAGCAAGGGCTATTATTTTGGAACGTCG 1639
Query 1388 ACCAGCAACCCAGGTAACTCAGGCAATCGATGTACTAGTCACAGCATATTCCTACTCGGT 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640 ACCAGCAACCCAGGTAACTCAGGCAATCGATGTACTAGTCACAGCATATTCCTACTCGGT 1699
Query 1448 TAAAGCCGGTACATACAAGGAAATAAAGAACGAAAAGGCCACTGCATCTACTCCAACCGC 1507
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1700 TAAAGCCGGTACATACAAGGAAATAAAGAACGAAAACGCCACTGCATCTACTCCAACCCC 1759
Query 1508 TGGTGCATCTCCTGATAACGAAAGACATAGGCCGTCTGGAAGCAATATTGATGAAGATGT 1567
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1760 TGGTGCATCTCCTGATAGCGAAAGACATAGGCAGTCTGGAAGCAATATTGATGAAGAAGT 1819
Query 1568 TGAAATGAACCTATCATCTGGTTCAAAGGAGAACATGTTTTGTGCTGATGAGCAGCAAGA 1627
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1820 TGAGATGAACCTATCATCTGGTTCTCAGGAGAACATGTTTTGTGCTGATGAACAGCAAGA 1879
Query 1628 ATCTCAACTTTCGTCACCGGCAGTTTCACCGGATGAGCTCTACAAGTTTGTATTTGCTTC 1687
||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1880 ATCTCAACTCTCTTCACCGGCAATTTCACCCGATGAGCTCTACAAGTTTGTATTTACTTC 1939
Query 1688 TGTGGAGGAAATGATGGTTGAGGAATCAGAGTACCTAGTTGCTATCATCACCGAGTTCCT 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940 TGTGGAGGAAATGATGGTTGAGGAATCAGAGTACCTAGTTGCTATCATCACCGAGTTCCT 1999
Query 1748 TCGCAGTATAAGTGCAGAAAAACTCAAAGTGGATCTGAACATCTATGTGATGACCATCAG 1807
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 TCGCAGTATAAGTGCAGAAAAACTCAAAGTGGATTTGAACATCTATGTGATGACCATCAA 2059
Query 1808 ACTTTTAGCTTACAGTAAGCGATTTGCAGAACTGTCGCTATTCACCACAAACAAGATAAT 1867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 ACTTTTAGCTTACAGTAAGCGATTTGCAGAACTGTCGCTATTCACCACAAACAAGATAAT 2119
Query 1868 CGAACCCTCAAAGGAAGTTGCGTTCCAACTTCTCGAGAGTGGTCGCCAAAACCAAAATAT 1927
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||
Sbjct 2120 CGAACCATCAAAGGAAGTCGCGTTCCAACTTCTGGATAGTGGTCGTCAAAA------TAT 2173
Query 1928 CAGGGTAAGGAAACTTGGGCTTGATATGTTGAGACAACTCTCCTTGCACCATGATTACAT 1987
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 CCGGGTAAGAAAACTTGGGCTTGATATGTTGAGACAGCTCTCCTTGCACCATGATTACAT 2233
Query 1988 CTCCTCCCTTGTGCAAGATGGATACTACCTTGAAGCTCTGCGATATGCTCAGAAGCATAA 2047
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 CTCCTCCCTTGTGCAAGATGGATACTATCTTGAAGCTCTGCGATATGCTCAGAAGCATAA 2293
Query 2048 GGTGACGAGTGTGCGATCGTCGCTGTTCCTAGAAGCAGCATTCGCGTCGAATGATCTGCA 2107
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2294 GGTGACGAGTGTGCGATCGTCGATGTTCCTAGAAGCAGCATTCGCGTCGAATGATATGCA 2353
Query 2108 GCATTTGGCTGCAATTTTGAGGGTCTTGTCGGAATTGATTCCTGGGTTTAAAGAAACTTC 2167
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2354 GCATTTGGCTGCAATTTTGAGGGTCTTGTCGGAATTGATTCCCGGGTTTAAAGAAACTTC 2413
Query 2168 TGAATATTACAC-TTTCTATGGCCTTCTCAATGACACCAGTTCCTCAGTTGCTGTCTGAA 2226
|||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 TGAATATTACACCTTT-TATGGTCTTCTCAATGACACCAGTTCCTCAGTTGCTGTCTGAA 2472
Query 2227 GAGAATC 2233
|||||||
Sbjct 2473 GAGAATC 2479
Score = 316 bits (171), Expect = 4e-85
Identities = 181/186 (97%), Gaps = 0/186 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 AGCTTCAGCAATGCAGGCATGAAAGAAAAGAATTCCACCACCGCCTCTACACTTGGACGG 62
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 159 AGCTTTAGCAATGCAGGCATGAAAGAAAAGAATTCCACTACCGCCTCTACACTTGGACGG 218
Query 63 ATTTTAGCTACTTGTTCTAAACAGGCCAAAGACTACGGGAGCTGTGTTGCATCTAAAGTC 122
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219 ATTTTAGCTACTTGTTCTAAACAGGCCAAAGACTACGGGAGCTGTGTTGCATCTAAAGTT 278
Query 123 CATGAGGTTGAAAGAGACATATGTTTGAAAGAGTTTCTTGCACTGAAGAGTTGTATGCAG 182
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 279 CATGAGGTTGAAAGAGATATATGTTTGAAAGAGTTTCTTGCGCTGAAGAGTTGTATGCAG 338
Query 183 CATACG 188
||||||
Sbjct 339 CATACG 344
> AT3G12010.1 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unknown;
INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN:
sperm cell, cultured cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Colon
cancer-associated Mic1-like (InterPro:IPR009755); Has 30201
Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12;
Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink).
| chr3:3820352-3825765 FORWARD LENGTH=2699
Length=2699
Score = 3358 bits (1818), Expect = 0.0
Identities = 1972/2047 (96%), Gaps = 8/2047 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 188 GGCAAGTGTTGGTTCTGGTGCTTTATCACATGTGTATATACATCATCCAGCCCTACGTTG 247
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 440 GGCAGGTGTTGGTTCTGGTGCTTTATCACATGTCTATATACATCATCCATCCCTACGTTG 499
Query 248 CAATATTCCTGAATCCAGGGGGTTGTTCTATGATGATGCCAACAGATTGCTGATATGTAC 307
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 500 CAATATTCCTGAATCCAATGGGTTATTCTATGATGATGCCAACAGATTGCTAATATGTAC 559
Query 308 CACATCTAGTCAGGTCTTTTCATGGGAAACATCCCCCTTTAATCCAGACGTACCTCCCTC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 560 CACATCTAGTCAGGTCTTTTCATGGGAAACATCCCCCTTTAATCCAGACGTACCTCCTTC 619
Query 368 AGTTGATTCTATAAATGAAGGGCCTATTCTGTCAATCAGATTTTCTCTTGATAAAAAAGC 427
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 AGTTGATTCTATAAGTGAAGGGCCTATTCTATCAATCAGATTTTCTCTTGATAAAAAAGC 679
Query 428 GATAGCTGTCCAAAGATCTGATTGTGAAGTACAGTTGTTTAATCGAGAGACCAAGAAGAT 487
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 680 GATAGCTGTCCAAAGATCTGACTGTGAAATACAGTTGTTTAATCGAGAGACCAAGCAGAT 739
Query 488 ACTAAACCACAGATGTAAGGCAGGATCAGAGAGCATTCTCGGATTCTTTTGGAGTGACTC 547
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ACTTAACCACAAATGCAAGGCAGGATCAGAGAGCATTCTCGGATTCTTTTGGAGTGACTC 799
Query 548 TCCATTATGTGATCTTGCAATTGTAAAGACCAGTGGCATGGACTTGTTCGCTTGTGATTC 607
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 TCCATTATGTGATCTTGCAATTGTAAAGACCAGTGGTATGGACTTGTTCGCTTGTGATTC 859
Query 608 TATGTTGAATTCACTACGTTTGGTGGAAACCAAAAAGGCGAATGTTAATTGGTACACCTA 667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 860 TATGTTGAATTCACTACGTTTGGTGGAAACCAAAAAGGCGAATGTGAATTGGTACATCTA 919
Query 668 TACACATGAAACTCGATTGGTTCTTCTTGCATCAGGATTGCAATGCAAGACATTTAATGG 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 920 TACACATGAAACTCGATTGGTTCTTCTTGCATCAGGACTGCAATGCAAGACATTTAATGG 979
Query 728 ATTTCAGCTTTCCACTGCAGGAGTTGTTCGTTTACCGAGATTTGAGATGACCATGGCTAG 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 980 ATTTCAGCTTTCCACTGCAGGAGTTGTTCGTTTACCGAGATTTGAGATGACAATGGCTAG 1039
Query 788 ATCTGAATCAAACAGTAAACCTATTCTCTCTGCTGGAGATCTCCACTTAGTCACTGTCTA 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 ATCTGAATCAAACAGTAAACCTATTCTCTCTGCTGGAGATCTCCACTTAGTCACTGTCTA 1099
Query 848 TGGCCGAATATATTGCTTACAAGTGGACAGGGAGGCAATGCTACTGCATCTATACAGGTT 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 TGGCCGAATATATTGCTTACAAGTGGACAGGGAGGCAATGCTACTGCATCTATACAGGTT 1159
Query 908 TTACCGAGATGCAGTTGTTCATCAAGGTTCTTTACCAATATACTCAAGCAAATTGTCGGT 967
||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1160 CTACCGTGATGCAGTCGTCCAACAAGGTTCTTTACCAATATACTCAAGCAAGTTGTCGGT 1219
Query 968 GAATGTGGTCGATAATTTATTGCTTGTGCACCAAATCGATGCAAAGGTTGTCATCATCTA 1027
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 GAATGTGGTCGACAATTTATTGCTTGTGCACCAAATCGATGCAAAGGTTGTCATCATCTA 1279
Query 1028 CGACTTATTTGTGGATTCTCGAGCTCCTGTATCTGCGCCTCTTCCTTTGCTGTGGAGGGG 1087
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1280 CGACTTATTTGTGGATTCTCGAGCTCCTGTATCTGCGCCTCTTCCTTTACTGTGGAGGGG 1339
Query 1088 TTACCAAGGCTCTGACACATCGTCTCAAGCTGCTAACAAAGAAATTGAGAGCTCAGAATC 1147
|||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1340 TTACCAAGTCTCTGAGACATCGTCTCAAGCTGTTAACAAAGAAATTGAGAGCTCAGAATC 1399
Query 1148 ATCTACAAGCAATGAAAACATAGTCATGTATGAAGATGGCTGGACCTTTCTTGTTCCAGA 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1400 ATCTACAAGCAATGAAAACATAGTCATGTATGAAGATGGCTGGACCTTTCTGGTTCCAGA 1459
Query 1208 TCTTATTCTGGATGAGACTAACAAAGTTTTATGGAAGATACATTTGGATCTTGAGGCAAT 1267
|||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 CCTTATTCTGGATCAGACAAACAAGGTTTTATGGAAGATACATTTGGATCTTGAGGCAAT 1519
Query 1268 TTCCGCTAGCAGCTCAGACAGGACGTCTCTTCTAGAATTCCTGCAGCGAAGGAAGTTGGA 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1520 TTCCGCTAGCAGCTCAGACAGGACGTCTCTTCTAGAATTCCTGCAGCGAAGGAAGTTGGA 1579
Query 1328 AGCAAATAAGGCCAAACAATTGTGCTTGGGGATAGCAAGGGCTACTATTTTGGAACGTCG 1387
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1580 AGCAAATAAGGCCAAACAATTGTGCTTGGGGATAGCAAGGGCTATTATTTTGGAACGTCG 1639
Query 1388 ACCAGCAACCCAGGTAACTCAGGCAATCGATGTACTAGTCACAGCATATTCCTACTCGGT 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640 ACCAGCAACCCAGGTAACTCAGGCAATCGATGTACTAGTCACAGCATATTCCTACTCGGT 1699
Query 1448 TAAAGCCGGTACATACAAGGAAATAAAGAACGAAAAGGCCACTGCATCTACTCCAACCGC 1507
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1700 TAAAGCCGGTACATACAAGGAAATAAAGAACGAAAACGCCACTGCATCTACTCCAACCCC 1759
Query 1508 TGGTGCATCTCCTGATAACGAAAGACATAGGCCGTCTGGAAGCAATATTGATGAAGATGT 1567
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1760 TGGTGCATCTCCTGATAGCGAAAGACATAGGCAGTCTGGAAGCAATATTGATGAAGAAGT 1819
Query 1568 TGAAATGAACCTATCATCTGGTTCAAAGGAGAACATGTTTTGTGCTGATGAGCAGCAAGA 1627
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1820 TGAGATGAACCTATCATCTGGTTCTCAGGAGAACATGTTTTGTGCTGATGAACAGCAAGA 1879
Query 1628 ATCTCAACTTTCGTCACCGGCAGTTTCACCGGATGAGCTCTACAAGTTTGTATTTGCTTC 1687
||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1880 ATCTCAACTCTCTTCACCGGCAATTTCACCCGATGAGCTCTACAAGTTTGTATTTACTTC 1939
Query 1688 TGTGGAGGAAATGATGGTTGAGGAATCAGAGTACCTAGTTGCTATCATCACCGAGTTCCT 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940 TGTGGAGGAAATGATGGTTGAGGAATCAGAGTACCTAGTTGCTATCATCACCGAGTTCCT 1999
Query 1748 TCGCAGTATAAGTGCAGAAAAACTCAAAGTGGATCTGAACATCTATGTGATGACCATCAG 1807
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 TCGCAGTATAAGTGCAGAAAAACTCAAAGTGGATTTGAACATCTATGTGATGACCATCAA 2059
Query 1808 ACTTTTAGCTTACAGTAAGCGATTTGCAGAACTGTCGCTATTCACCACAAACAAGATAAT 1867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 ACTTTTAGCTTACAGTAAGCGATTTGCAGAACTGTCGCTATTCACCACAAACAAGATAAT 2119
Query 1868 CGAACCCTCAAAGGAAGTTGCGTTCCAACTTCTCGAGAGTGGTCGCCAAAACCAAAATAT 1927
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||
Sbjct 2120 CGAACCATCAAAGGAAGTCGCGTTCCAACTTCTGGATAGTGGTCGTCAAAA------TAT 2173
Query 1928 CAGGGTAAGGAAACTTGGGCTTGATATGTTGAGACAACTCTCCTTGCACCATGATTACAT 1987
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 CCGGGTAAGAAAACTTGGGCTTGATATGTTGAGACAGCTCTCCTTGCACCATGATTACAT 2233
Query 1988 CTCCTCCCTTGTGCAAGATGGATACTACCTTGAAGCTCTGCGATATGCTCAGAAGCATAA 2047
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 CTCCTCCCTTGTGCAAGATGGATACTATCTTGAAGCTCTGCGATATGCTCAGAAGCATAA 2293
Query 2048 GGTGACGAGTGTGCGATCGTCGCTGTTCCTAGAAGCAGCATTCGCGTCGAATGATCTGCA 2107
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2294 GGTGACGAGTGTGCGATCGTCGATGTTCCTAGAAGCAGCATTCGCGTCGAATGATATGCA 2353
Query 2108 GCATTTGGCTGCAATTTTGAGGGTCTTGTCGGAATTGATTCCTGGGTTTAAAGAAACTTC 2167
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2354 GCATTTGGCTGCAATTTTGAGGGTCTTGTCGGAATTGATTCCCGGGTTTAAAGAAACTTC 2413
Query 2168 TGAATATTACAC-TTTCTATGGCCTTCTCAATGACACCAGTTCCTCAGTTGCTGTCTGAA 2226
|||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 TGAATATTACACCTTT-TATGGTCTTCTCAATGACACCAGTTCCTCAGTTGCTGTCTGAA 2472
Query 2227 GAGAATC 2233
|||||||
Sbjct 2473 GAGAATC 2479
Score = 316 bits (171), Expect = 4e-85
Identities = 181/186 (97%), Gaps = 0/186 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 AGCTTCAGCAATGCAGGCATGAAAGAAAAGAATTCCACCACCGCCTCTACACTTGGACGG 62
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 159 AGCTTTAGCAATGCAGGCATGAAAGAAAAGAATTCCACTACCGCCTCTACACTTGGACGG 218
Query 63 ATTTTAGCTACTTGTTCTAAACAGGCCAAAGACTACGGGAGCTGTGTTGCATCTAAAGTC 122
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219 ATTTTAGCTACTTGTTCTAAACAGGCCAAAGACTACGGGAGCTGTGTTGCATCTAAAGTT 278
Query 123 CATGAGGTTGAAAGAGACATATGTTTGAAAGAGTTTCTTGCACTGAAGAGTTGTATGCAG 182
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 279 CATGAGGTTGAAAGAGATATATGTTTGAAAGAGTTTCTTGCGCTGAAGAGTTGTATGCAG 338
Query 183 CATACG 188
||||||
Sbjct 339 CATACG 344
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 111395009355
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5