BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg929239
Length=5969
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G14570.1 | Symbols: ATGSL04, gsl04, atgsl4 | glucan synthase... 5792 0.0
AT3G14780.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transposa... 220 1e-55
> AT3G14570.1 | Symbols: ATGSL04, gsl04, atgsl4 | glucan synthase-like
4 | chr3:4892643-4902628 FORWARD LENGTH=5931
Length=5931
Score = 5792 bits (3136), Expect = 0.0
Identities = 3313/3401 (97%), Gaps = 1/3401 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2549 GCA-GGGGTCAGACGGCCAGAAAAATAGTATGGCCAAGTTTGTCTTGGTCTGGAACCAAG 2607
||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2531 GCAGGGGGTCTGATGGCCAGAAAAATAGTATGGCCAAGTTTGTCTTGGTCTGGAACCAAG 2590
Query 2608 TCATTAACAGTTTCAGAACAGAAGATCTGATAAGTAACAAGGAATTAGATTTGATGACGA 2667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCATTAACAGTTTCAGAACAGAAGATCTGATAAGTAACAAGGAATTAGATTTGATGACGA 2650
Query 2668 TGCCGATGTCATCGGAGGTATTATCAGGGATCATCCGTTGGCCCATTTTCCTCCTTGCAA 2727
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2651 TGCCGCTGTCATCGGAGGTATTATCAGGAATCATCCGTTGGCCCATTTTCCTCCTTGCAA 2710
Query 2728 ATAAGTTTTCAACAGCTCTGAGCATTGCAAAAGATTTTGTCGAGAAGGATGAGGTTCTTT 2787
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2711 ATAAGTTTTCAACAGCTCTGAGCATTGCAAAAGATTTTGTCGGGAAGGATGAGGTTCTCT 2770
Query 2788 ATCGAAGGATTCGGAAAGACGAGTACATGTACTACGCAGTAAAAGAATGCTATGAATCTT 2847
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2771 ATCGAAGGATTCGGAAAGACGAGTACATGTACTACGCAGTAAAAGAGTGCTATGAATCTT 2830
Query 2848 TGAAGTACATTCTTCAGATTCTTGTTGTTGGTGATCTTGAGAAAAAGATTATATCTGGTA 2907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2831 TGAAGTACATTCTTCAGATTCTTGTTGTTGGTGATCTTGAGAAAAAGATTATATCTGGTA 2890
Query 2908 TAATAAACGAAATAGAGGAAAGCATCAGACAGTCAAGTTTGCTTGAAGAATTTAAGATGA 2967
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2891 TAATAAACGAGATAGAGGAAAGCATCAGACAGTCAAGTTTGCTTGAAGAATTTAAGATGG 2950
Query 2968 CTGAGCTCCCAGCATTGCATGAAAAATGTATTGAGCTGGTTCAACTCCTGGTTGAGGGAA 3027
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2951 CTGAGCTCCCAGCGTTGCATGACAAATGTATTGAGCTGGTTCAACTCCTGGTTGAGGGAA 3010
Query 3028 GTGACGAGCAACTCCAGGAAGAGAAAAGCGAAGAACTGCATGGTAAACTTGTAAAGGCTC 3087
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3011 GTGCCGAGCAACTCCAGGTTGAGAAAAGCGAAGAACTGCATGGTAAACTTGTAAAGGCTC 3070
Query 3088 TTCAGGACATATTTGAGCTAGTAACAAATGATATGATGGTACATGGTGACAGAGTTCTGG 3147
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3071 TTCAGGATATCTTTGAGCTAGTAACAAATGATATGATGGTACATGGTGACAGAATTCTGG 3130
Query 3148 ATTTGCTCCAGTCTCGGGAGGGGTCAGGAGAAGACACAGGTATTTTTATGAGGGTTATAG 3207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3131 ATTTGCTCCAGTCTCGGGAGGGGTCAGGAGAAGACACAGGTATTTTTATGAGGGTTATAG 3190
Query 3208 AACCACAGTTGTTTGAATCTTATGGAGAATGGAGATGCATTCATTTTCCGCTGCCAGATA 3267
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3191 AACCACAGTTGTTTGAATCCTACGGAGAATGGAGATGCATTCATTTTCCGCTGCCAGATA 3250
Query 3268 GTGCTTCATTGAGTGAACAGATCCAGCGTTTTCTGTTATTGTTAACTGTCAAAGATAGTG 3327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3251 GTGCTTCATTGAGTGAACAGATCCAGCGTTTTCTGTTATTGTTAACTGTCAAAGATAGTG 3310
Query 3328 CTATGGACATACCAGAGAACTTAGACGCTCGGCGGCGCCTATCTTTCTTTGCTACTTCGC 3387
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3311 CAATGGACATACCAGAGAACTTAGATGCTCGGCGGCGCCTATCTTTCTTTGCTACTTCGC 3370
Query 3388 TTTTCATGGATATGCCTGACGCTCCGAAAGTACGCCATATGATGTCATTCAGTGTTTTGA 3447
|||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3371 TTTTCATGGATATGCCCGATGCTCCGAAAGTACGCAATATGATGTCATTCAGTGTTTTGA 3430
Query 3448 CTCCGCATTATCAGGAGGATATTAACTTTTCAACGAAGGAACTACATTCCACCACGTCTA 3507
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 3431 CACCGCATTATCAGGAGGATATTAACTATTCAACGAACGAACTACATTCCACCAAGTCTA 3490
Query 3508 GTGTGTCAATCATCTTTTATATGCAGAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTG 3567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3491 GTGTGTCAATCATCTTTTATATGCAGAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTG 3550
Query 3568 AGCGAATGGGATGTGATAATTTGGACGCCTTAAAGAAAGAGGGTAAAGAAGAAGAGCTTC 3627
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3551 AGCGAATGGGATGTGATAATTTAGACGCCTTAAAGAAAGAGGGTAAAGAAGAAGAGCTTC 3610
Query 3628 GAAACTGGGCATCATTTCGTGGACAAACATTGAGTAGAACAGTTCGTGGAATGATGTATT 3687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3611 GAAACTGGGCATCATTTCGTGGACAAACATTGAGTAGAACAGTTCGTGGTATGATGTATT 3670
Query 3688 GCCGTGAAGCTTTGAAATTGCAAGCCTTCCTTGACATGGCAGATGACGAGGATATTCTTG 3747
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3671 GCCGAGAAGCTCTGAAATTGCAAGCCTTCCTTGACATGGCAGATGACGAGGATATTCTTG 3730
Query 3748 AAGGATACAAGGACGTGGAACGAAGTAACCGACCTTTAGCCGCACAACTTGATGCATTAG 3807
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3731 AAGGATACAAGGACGTGGAACGAAGTAACAGACCTTTAGCCGCACAACTTGATGCATTGG 3790
Query 3808 CAGATATGAAATTCACGTATGTTGTGTCTTGCCAAATGTTTGGAGCCCAAAAATCAGCTG 3867
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3791 CAGATATGAAATTCACGTATGTTGTTTCTTGCCAAATGTTTGGAGCCCAAAAATCATCTG 3850
Query 3868 GGGATCCCCACGCGCAGGATATACTTGACCTGATGATAAAGTACCCATCTCTCCGTGTTG 3927
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3851 GGGATCCTCACGCGCAGGATATACTTGACCTGATGATAAAGTATCCATCTCTCCGTGTTG 3910
Query 3928 CATACGTTGAGGAGAGGGAAGAAATCGTGTTGGATGTTCCAAAGAAAGTTTACTACTCAA 3987
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3911 CATACGTTGAGGAGAGGGAAGAAATCGTGTTGGATGTTCCAAAGAAGGTTTACTACTCTA 3970
Query 3988 TTTTGGTAAAAGCTGTCAACGGTTTCGATCAGGAAATTTACCGTGTCAAACTTCCTGGAC 4047
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3971 TATTGGTAAAAGCTGTTAACGGTTTCGATCAGGAAATTTACCGTGTCAAACTTCCTGGAC 4030
Query 4048 CACCTAACATTGGAGAGGGGAAGCCTGAGAATCAAAATCACGCCATAGTTTTCACTCGAG 4107
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4031 CACCTAACATTGGAGAGGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCACGCCATAGTTTTCACTCGAG 4090
Query 4108 GTGAAGCACTTCAGACGATCGACATGAACCAAGATCACTACCTGGAAGAGGCTTTCAAAA 4167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4091 GTGAAGCACTTCAGACGATCGACATGAACCAAGATCACTACCTGGAAGAGGCTTTCAAAA 4150
Query 4168 TGAGAAATCTCCTTCAAGAATTTCTTCGAAACCGTGGAAGAAGACCTCCAACAGTTCTTG 4227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4151 TGAGAAATCTCCTTCAAGAATTTCTTCGAAACCGTGGAAGAAGACCTCCAACAATTCTTG 4210
Query 4228 GGTTAAGGGAACACATATTCACCGGAAGTGTTTCTTCTCTAGCATGGTTCATGTCATATC 4287
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4211 GTTTAAGGGAACACATATTCACCGGAAGTGTTTCTTCTCTAGCATGGTTCATGTCATATC 4270
Query 4288 AAGAAACCAGTTTTGTAACGATCGGTCAAAGGCTGCTTGATAATCCTCTCAGAGTCCGGT 4347
|||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4271 AAGAAACCAGTTTTGTCACAATCGGTCAAAGGCTTCTTGCTAATCCTCTCAGAGTCCGGT 4330
Query 4348 TTCACTATGGGCATCCAGATGTCTTCGACAGAATATTTCACATAACAAGGGGTGGCATCA 4407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4331 TTCACTATGGGCATCCAGATGTCTTCGACAGAATATTTCACATAACAAGGGGTGGCATCA 4390
Query 4408 GTAAATCATCGAGAACTATTAACTTAAGCGAGGACGTTTTCGCGGGTTATAATACCACCC 4467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 4391 GTAAATCATCGAGAACTATTAACTTAAGCGAGGACGTTTTCGCAGGTTATAATACTACCT 4450
Query 4468 TACGACGTGGATGCATAACCTACAATGAGTACCTCCAAGTTGGAAAAGGTCGTGATGTTG 4527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4451 TACGACGTGGATGCATAACCTACAATGAGTACCTCCAAGTTGGAAAAGGTCGTGATGTTG 4510
Query 4528 GCCTCAATCAAATCTCAAAGTTTGAGGCCAAGGTGGCTAACGGAAACAGTGAACAGACTA 4587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4511 GCCTCAATCAAATCTCAAAGTTTGAGGCCAAGGTGGCTAACGGAAACAGTGAACAGACTA 4570
Query 4588 TTAGCCGTGACATATACCGTTTAGGACAACGTTTTGATTTCTTCAGAATGTTGTCTTGTT 4647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4571 TTAGCCGTGACATATACCGTTTAGGACAACGTTTTGATTTCTTCAGAATGTTGTCTTGTT 4630
Query 4648 ATTTCACAACCATTGGATTCTACGTCAGTAGCTTGATTTCCGTGATCGGGATATATATTT 4707
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4631 ATTTCACAACCATTGGATTCTACTTCAGTAGCTTGATTTCCGTGATCGGGATTTATATTT 4690
Query 4708 ATCTATATGGTCAACTCTACCTCGTGCTCAGTGGGTTGCAGAAGACGCTTATTCTTGAGG 4767
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4691 ATCTCTATGGTCAACTCTACCTCGTACTCAGTGGGTTGCAGAAGACGCTTATTCTTGAGG 4750
Query 4768 CCAAGGTGAAAAACATAAAATCATTGGAAACAGCCCTTGCCTCTCAATCATTTATCCAGC 4827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4751 CCAAGGTGAAAAACATAAAATCATTGGAAACAGCCCTTGCCTCTCAATCATTTATCCAGC 4810
Query 4828 TAGGTCTCTTGACTGGTCTACCAATGGTGATGGAGATTGGATTGGAGAAAGGATTTCTTA 4887
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4811 TAGGTCTCTTGACCGGTCTACCAATGGTGATGGAGATTGGGTTGGAGAAAGGATTTCTTA 4870
Query 4888 TAGCCTTTCAAGATTTCATACTCATGCAGCTACAGCTTGCTGCATTCTTCTTCACTTTCT 4947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4871 TAGCCTTTCAAGATTTCATACTCATGCAGCTACAGCTTGCTGCATTCTTCTTCACTTTCT 4930
Query 4948 CTCTAGGAACTAAAACGCATTACTTCGGCAGAACAATTCTCCATGGAGGCGCCAAATACA 5007
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4931 CTCTAGGAACTAAAACGCATTACTTTGGCAGAACAATTCTCCATGGAGGTGCCAAATACA 4990
Query 5008 GACCCACAGGGCGTAAAGTAGTGGTGTTCCATGCCAACTTCAGTGAAAATTACAGATTAT 5067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4991 GACCCACAGGGCGTAAAGTAGTGGTGTTCCATGCCAACTTCAGTGAAAATTACAGATTAT 5050
Query 5068 ATTCTCGAAGCCATTTCATCAAAGGTTTTGAGCTCATGATTCTTCTGGTCGTCTACGAGT 5127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5051 ATTCTCGAAGCCATTTCATCAAAGGTTTTGAGCTCATGATTCTTCTGGTCGTCTACGAGT 5110
Query 5128 TGTTCAAGCATACATCTCAAAGCAACATGGCTTACTCATTTATCACTTTCTCAGTGTGGT 5187
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5111 TGTTCAAGCATACATCTCAAAGCAACATGGCTTACTCATTCATCACTTTCTCAGTGTGGT 5170
Query 5188 TCATGTCTTTTACATGGTTATGCGCCCCGTTTCTCTTTAACCCTTCAGGCTTTACCTGGG 5247
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5171 TCATGTCTTTTACTTGGTTATGCGCCCCGTTTCTCTTCAACCCTTCAGGCTTTACCTGGG 5230
Query 5248 AAATAATAGTCGGTGACTGGAGAGACTGGAACAGGTGGATCAAAGAGCAAGGTGGGATAG 5307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5231 AAATAATAGTCGGTGACTGGAGAGACTGGAACAGGTGGATCAAAGAGCAAGGTGGAATAG 5290
Query 5308 GGATTCAGCAAGACAAGAGTTGGCAATCTTGGTGGAATGACGAGCAAGCCCATCTACGTG 5367
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5291 GGATTCAGCAAGACAAGAGCTGGCAATCTTGGTGGAACGACGAGCAAGCCCATCTACGTG 5350
Query 5368 GCTCTGGTGTTGGAGCTCGCTGTTTGGAGATAATTTTGTCCCTCAGGTTCTTTGTGTATC 5427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5351 GCTCTGGTGTTGGAGCTCGCTGTTTGGAGATAATTTTGTCCCTCAGGTTCTTTGTGTATC 5410
Query 5428 AGTATGGGTTGGTATATCACCTTGACATTACCCAAAGCAACACAAATATCATAGTCTATG 5487
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5411 AGTATGGTTTGGTATATCACCTTGACATTACCCAAAGCAACACAAATATCATAGTCTACG 5470
Query 5488 CGCTTTCTTGGGTCGTGATTCTCGCCACATTCTTCACAGTCAAGGCCGTAGACCTAGGAA 5547
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5471 CGCTTTCTTGGGTCGTGATTCTCGCCACATTCTTCACAGTCAAGGCAGTAGACCTAGGAA 5530
Query 5548 GACAACTCTTCAGCACAAGAAAGCATCTCGTATTTCGGTTCTTCAAAGTCTTCGTCTTCG 5607
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5531 GACAACTCTTCAGCACAAGAAAGCATCTCGTGTTTCGGTTCTTCAAAGTCTTCGTCTTCG 5590
Query 5608 TGAGCATTCTAACAGTCATTATCACTCTATCAAACATCTGTCACCTCTCTGTCAAGGACC 5667
||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5591 TGAGCATACTTACAATCATAATCACTCTAGCAAACATCTGTCACCTCTCTGTCAAGGACC 5650
Query 5668 TTCTAGTCTCTTGCTTAGCTTTCTTGCCCACCGGTTGGGGTCTGATTCTGATTGCACAAG 5727
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5651 TTCTAGTCTCTTGCTTAGCTTTCTTGCCCACTGGTTGGGGTCTGATTCTGATTGCACAAG 5710
Query 5728 CGGTTAGGCCAAAGATAGAAGGGACGAGCTTGTGGGAGTTCACACAGGTTCTTGCCCGAG 5787
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5711 CGGTTAGGCCAAAGATAGAAGGAACGAGCTTATGGGAGTTCACACAGGTTCTTGCTCGAG 5770
Query 5788 CTTATGATTATGGAATGGGAGTTGTTCTGTTTGCACCAATGGCTATCTTAGCTTGGCTTC 5847
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5771 CTTATGATTATGGAATGGGCGTTGTTCTGTTTGCACCAATGGCTATCTTAGCATGGCTTC 5830
Query 5848 CTATCATTTCTGCGTTTCAGACACGCTTTCTCTTCAATGAAGCTTTTAACAGAAGGCTTC 5907
|||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5831 CTATTATTTCTGCGTTTCAGACTCGTTTTCTATTCAACGAAGCTTTTAACAGAAGACTTC 5890
Query 5908 AAATTCAACCTATTCTTGCAGGGAAGAAGAAGAATCGATGA 5948
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5891 AAATTCAACCTATTCTTGCAGGGAAGAAGAAGAATCGATGA 5931
Score = 3642 bits (1972), Expect = 0.0
Identities = 2111/2180 (97%), Gaps = 2/2180 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 327 GATGAAGAGTTTACTGTGAGAAGAAGAAAGGAGAAGAGTGATGTTCGGGAGCTCAAACGT 386
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 355 GATGAAGAGTTCACTGTGAGAAGAAGAAAGGAGAAGAGTGATGTTCGGGAACTCAAACGT 414
Query 387 GTTTATCATGCTTACAAGGAATACATTATCAGACATGGTGCATCATTCAATTTGGATAAT 446
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 415 GTTTATCATGCTTACAAGGAATATATTATCAGACATGGTGCAGCTTTCAATTTGGATAAC 474
Query 447 AGTCAGCGAGAGAAGTTGATTAACGCACGCAGAATTGCTTCTGTTTTGTATGAAGTTCTC 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 AGTCAGCGAGAGAAGTTGATTAACGCACGCAGAATTGCTTCTGTTTTGTATGAAGTTCTC 534
Query 507 AAGACAGTCACAAGTGGCGCTGGCCCCCAGGCCATTGCGGATAGAGAAAGTATTCGGGCA 566
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 535 AAGACAGTCACAAGTGGCGCTGGCCCGCAGGCCATTGCGGATAGAGAAAGTATTCGAGCA 594
Query 567 AAATCTGAATTTTATGTGCCGTATAACATTCTTCCTCTTGATAAAGGAGGGGTACACCAA 626
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 595 AAATCTGAATTTTATGTGCCGTATAACATTCTTCCTCTCGATAAAGGAGGGGTACACCAA 654
Query 627 GCAATTATGCATCTGCCTGAGATTAAAGCTGCTGTTGCAATTGTACGTAACACTCGCGGG 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 GCAATTATGCATCTGCCTGAGATTAAAGCTGCTGTTGCAATTGTACGTAACACTCGCGGG 714
Query 687 TTGCCTCCTCCAGAGGAGTTTCAGAGACACCAGCCTTTTCTGGATTTATTTGAATTTCTG 746
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 TTGCCTCCTCCAGAGGAATTTCAGAGACACCAGCCTTTTCTGGATTTATTTGAATTTCTG 774
Query 747 CAGTATGCCTTTGGGTTCCAGAATGGAAATGTTGCCAATCAGAGAGAGCATATGATCCTA 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 775 CAGTATGCCTTTGGGTTCCAGAATGGAAATGTTGCCAATCAGAGAGAGCATCTGATTCTA 834
Query 807 CTACTCAGTAACACCATTATACGGCAACCTCAGAAGCAGTCTTCAGCACCAAAGTCTGGT 866
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 835 CTACTCAGTAACACCATTATACGGCAACCACAGAAGCAGTCTTCAGCTCCAAAGTCTGGT 894
Query 867 GATGAGGCAGTAGATGCATTAATGAAGAAGTTTTTTAAGAACTACACAAACTGGTGCAAA 926
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 895 GATGAGGCAGTAGATGCATTGATGAAGAAGTTTTTTAAGAACTACACGAACTGGTGCAAA 954
Query 927 TTTCTTGGAAGAAAAAATAACATCAGGTTGCCCTATGTGAAACAGGAAGCCCTACAATAT 986
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TTTCTTGGGAGAAAAAATAACATTAGGTTGCCCTATGTGAAACAGGAAGCCCTACAATAT 1014
Query 987 AAAACACTGTATATAGGACTCTACCTTCTCATATGGGGAGAGGCGTCGAACTTGAGGTTC 1046
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 AAAACATTGTATATAGGACTCTACCTTCTCATATGGGGAGAGGCGTCGAACTTGAGGTTC 1074
Query 1047 ATGCCAGAGTGTCTGTGTTATATTTTCCACCACATGGCATATGAATTGCATGGAGTCTTA 1106
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1075 ATGCCAGAGTGCCTGTGTTATATTTTCCACCACATGGCATATGAATTGCATGGAGTTTTA 1134
Query 1107 ACCAGTGCAGTTAGTATGATAACTGGGGAGAAGGTCGCGCCAGCATATGGTGGAGGACAC 1166
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 ACCGGTGCAGTTAGTATGATAACTGGGGAGAAGGTTGCTCCAGCATATGGTGGAGGACAC 1194
Query 1167 GAATCTTTCCTTGCGAATGTAGTTACCCCCATATATA-GGATTGTCGAAAAGGAAGCTGA 1225
||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||
Sbjct 1195 GAATCTTTCCTTGCGGATGTAGTTACTCCCATATACATGG-TTGTCCAAAAGGAAGCTGA 1253
Query 1226 GAAGAACAAGAATGGAACTGCTGATCATTCTATGTGGAGAAATTACGATGATCTGAATGA 1285
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1254 GAAGAATAAGAATGGAACTGCTGATCATTCTATGTGGAGAAACTACGATGATCTGAACGA 1313
Query 1286 GTTCTTCTGGTCTCTTGAATGCTTCGAAATAGGTTGGCCAATGCGTCCGGAGCACGATTT 1345
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1314 GTTCTTCTGGTCTCTTGAATGCTTCGAAATAGGTTGGCCAATGCGTCCCGAGCACGATTT 1373
Query 1346 CTTCTGTGTAGAATCATTAGACACCAGTAAACCAGGGAGATGGCGAGGAATGCTTAGATT 1405
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 TTTCTGTGTAGAATCATCAGAAACCAGTAAACCAGGGAGATGGCGAGGAATGCTTAGATT 1433
Query 1406 TCGCAAGCAGACAAAGAAAACGGATGAAGAAATGGAGGATGACGAAGAACTTGGGGTTCT 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 TCGCAAGCAGACAAAGAAAACGGATGAAGAAATAGAGGATGACGAAGAACTTGGGGTTCT 1493
Query 1466 CAGTGAGGAACAAACTAAACCAACCTCAAGATGGCTGGGGAAGACAAATTTTGTAGAGAC 1525
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 CAGTGAGGAACAACCTAAACCAACCTCAAGATGGCTGGGGAAGACAAATTTTGTAGAGAC 1553
Query 1526 TCGTTCCTTTTGGCAGATATTCCGGAGCTTTGACAGAATGTGGAGTTTCTTTGTTTTGTC 1585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TCGTTCCTTTTGGCAGATATTCCGGAGCTTTGACAGAATGTGGAGTTTCTTTGTTTTGTC 1613
Query 1586 TCTACAGGCATTGATAATTATGGCTTGTCATGATGTGGGATCTCCACTTCAAATGTTTAA 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 1614 CCTACAGGCATTGATAATTATGGCTTGTCATGATGTGGGATCTCCACTCCAAGTGTTTAA 1673
Query 1646 TGCCAATATATTTGAAGACGTCATGAGCATTTTCATTACCTCTGCAATTCTAAAGCTTAT 1705
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1674 TGCTAATATATTCGAAGACGTCATGAGCATTTTCATTACCTCAGCAATTCTAAAGCTTAT 1733
Query 1706 AAAAGGTATTCTTGACATAATCTTCAAGTGGAAAGCCAGAAACACAATGCCGATCAATGA 1765
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 AAAAGGTATTCTTGACATAATCTTCAAGTGGAAAGCAAGAAACACAATGCCGATCAATGA 1793
Query 1766 AAAGAAGAAGCAGATGGTGAAGTTGGGGTTTGCTGCGATGTGGACTATTATTCTACCAGT 1825
||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 AAAGAAGAAGCGGTTGGTGAAGTTGGGCTTTGCTGCGATGTGGACTATTATTCTACCAGT 1853
Query 1826 GCTGTATTCTCATTCAAGAAGGAAATACATGTGTTATTTCACAGATTACAAAACCTGGCT 1885
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1854 GCTGTATTCTCATTCAAGAAGGAAATACATTTGTTATTTCACAAATTACAAAACCTGGCT 1913
Query 1886 TGGTGAATGGTGTTTTTCTCCATACACGGTGGCAGTCACGATATACATGACAGGAAGTGC 1945
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1914 TGGTGAATGGTGTTTTTCTCCATACATGGTGGCAGTCACGATATACCTGACAGGAAGTGC 1973
Query 1946 GATTGAGTTGGTCTTGTTTTTCGTTCCTGCCATCAGCAAATACATTGAGACCTCCAATCA 2005
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 AATTGAGTTGGTCTTGTTTTTCGTTCCTGCCATCAGCAAATACATTGAGACCTCCAATCA 2033
Query 2006 TCGCATCTTCAAAACTTTGTCTTGGTGGGGACAGCCTAGGTTATATGTTGGGCGAGGAAT 2065
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 TGGCATCTTTAAAACTTTGTCTTGGTGGGGACAGCCTAGGTTATATGTTGGGCGAGGAAT 2093
Query 2066 GCAAGAAACTCAGGTGTCACAATTCAAATACACCTTCTTCTGGATTCTGGTTCTCCTGAC 2125
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 GCAAGAAACTCAGGTGTCACAATTCAAATACACTTTCTTCTGGATTCTGGTTCTCCTGAC 2153
Query 2126 TAAGttttttttCAGCTATGCATTTGAGATAAAGCCTCTAATAGAACCTACACGACTGAT 2185
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 CAAGTTTGCTTTCAGCTATGCATTTGAGATAAAGCCTCTAATAGAACCTACACGACTGAT 2213
Query 2186 AATGAAAGTTGGCGTGCGGAATTATGAATGGCATGAAATTTTCCCAGAAGTGAAGAGTAA 2245
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 AATGAAAGTTGGTGTGCGGAATTATGAATGGCATGAAATTTTCCCAGAAGTGAAGAGTAA 2273
Query 2246 TGCTGCTGCAATTGTCGCAGTATGGGCGCCAATAATGGTGGTCTATTTCATGGATACACA 2305
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 TGCTGCTGCAATTGTTGCAGTATGGGCGCCAATAATGGTGGTCTATTTCATGGATACACA 2333
Query 2306 AATATGGTATTCAGTTTACTGTACGATCTTTGGTGGGCTGTATGGAGTTCTGCATCACCT 2365
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2334 AATATGGTATTCAGTTTACTGTACGATCTTTGGTGGACTGTATGGTGTTCTGCACCACCT 2393
Query 2366 TGGTGAGATTCGAACTTTAGGCATGTTGAGAGGCCGGTTTCATACTTTACCTTCTGCTTT 2425
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2394 TGGTGAGATTCGAACTTTAGGCATGTTGAGAGGCCGGTTTCATACTTTACCTTCAGCTTT 2453
Query 2426 CAATGCATCCCTTATTCCACACTCAGTAAAAGATGAGAAAAGGAGAAAACAAAGAGGCTT 2485
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2454 CAATGCATCCCTTATTCCACACTCAACAAAAGATGAGAAAAGGAGAAAACAAAGAGGTTT 2513
Query 2486 TTTCCCCTTCAATTTAGGCA 2505
||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 TTTCCCCTTCAATTTAGGCA 2533
Score = 429 bits (232), Expect = 1e-118
Identities = 287/313 (92%), Gaps = 6/313 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGTCTCACGAAATCGTCCCCGTTGATCCCATTGATGTCCCGAGCACGAGTTACTCACGG 80
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTCACGAAATCGTCCCCGTTGATCCCATTGATGTTCCTAGCACGAGTTACTCACGG 60
Query 81 CCGAGTCTGGCTCCTCGGGATGATTCGCC--AA-TTGGT--C-AGTTCACGAGATCCCTT 134
|| | ||||| |||||| || |||||||| || || | | ||||||||||||||||
Sbjct 61 CCAATTCTGGGTCCTCGTGAAGATTCGCCGGAACGTGCTACCGAGTTCACGAGATCCCTA 120
Query 135 ACTTTTCGGGAACATGTTTCGTCGGAGCCATTTGATAGCGAGAGGCTTCCGGCGACATTA 194
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 ACTTTTCGGGAACATGTGTCGTCGGAGCCTTTTGATAGCGAGAGGCTTCCAGCGACATTA 180
Query 195 GCTTCTGAGATTCAGAGGTTTCTTCGTATAGCTAACTTGGTTGAGTCTGAGGAACCTCGA 254
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCTTCCGAGATTCAGAGGTTTCTTCGTATTGCTAACTTGGTTGAGTCTGAGGAACCTCGA 240
Query 255 ATTGCTTATCTATGCCGTTTTCATGCTTTCGAGATAGCTCATCATATGGACAGAAACTCT 314
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||
Sbjct 241 ATTGCTTATCTATGCCGATTTCATGCTTTCGAGATAGCCCACCACATGGATAGAAACTCT 300
Query 315 ACCGGAAGAGGTG 327
|||||||||||||
Sbjct 301 ACCGGAAGAGGTG 313
> AT3G14780.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transposase,
Ptta/En/Spm, plant (InterPro:IPR004252); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: glucan synthase-like 4 (TAIR:AT3G14570.2);
Has 315 Blast hits to 313 proteins in 50 species:
Archae - 2; Bacteria - 16; Metazoa - 11; Fungi - 7; Plants
- 181; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 96 (source: NCBI BLink).
| chr3:4961806-4963544 REVERSE LENGTH=1214
Length=1214
Score = 220 bits (119), Expect = 1e-55
Identities = 163/184 (89%), Gaps = 3/184 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 327 GATGAAGAGTTTACTGTGAGAAGAAGAAAGGAGAA-GAGTGATGTTCGGGAGCTCAAACG 385
||||| ||||||||| | |||||||||||||| || | |||| | ||| ||||||||
Sbjct 422 GATGACGAGTTTACTATAAGAAGAAGAAAGGA-AATAAATGATCATAAGGAACTCAAACG 480
Query 386 TGTTTATCATGCTTACAAGGAATACATTATCAGACATGGTGCATCATTCAATTTGGATAA 445
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGTTTATCATGCTTACAATGAATACATCATCAGACATGGTGCATCATTCAATTTGGATAA 540
Query 446 TAGTCAGCGAGAGAAGTTGATTAACGCACGCAGAATTGCTTCTGTTTTGTATGAAGTTCT 505
|||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 541 TAGTCAGCAAGAGAAGTTGATAAATGCACGCAGCATTGCTTCTGTTTTATATGAAATTCT 600
Query 506 CAAG 509
|||
Sbjct 601 -AAG 603
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 297842178881
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5