BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg934284 Length=1400 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G36530.1 | Symbols: LOS2, ENO2 | Enolase | chr2:15320756-153... 2294 0.0 > AT2G36530.1 | Symbols: LOS2, ENO2 | Enolase | chr2:15320756-15323869 REVERSE LENGTH=1743 Length=1743 Score = 2294 bits (1242), Expect = 0.0 Identities = 1347/1399 (96%), Gaps = 2/1399 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TCTCTCTCTCTAGATCTACTCGCTATGGCTACTATCACCGGTGTTAAGGCTAGACAGATC 60 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 60 TCTCTTTCTCTAGATCTACTCGCTATGGCTACTATCACCGTTGTTAAGGCTAGACAGATC 119 Query 61 TTTGACAGCCGTGGTAATCCCACCGTCGAGGTTGATATCCACACATCCAGTGGTGTCAAG 120 || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| | ||| Sbjct 120 TTCGACAGTCGTGGTAATCCCACCGTTGAGGTTGATATCCACACGTCAAATGGTATTAAG 179 Query 121 GTTACAGCAGCTGTACCAAGTGGAGCTTCCACTGGAATCTACGAGGCTCTTGAGCTGAGG 180 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 180 GTTACAGCAGCTGTTCCAAGTGGAGCTTCCACTGGTATCTATGAGGCTCTTGAGCTGAGG 239 Query 181 GATGGAGGATCTGACTACCTTGGAAAGGGTGTCTCTAAGGCTGTTGGCAATGTGAACAAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 GATGGAGGATCTGACTACCTTGGAAAGGGTGTATCTAAGGCTGTTGGCAATGTGAACAAC 299 Query 241 ATCATCGGCCCAGCACTTATTGGCAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGACAACTTC 300 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 ATCATCGGGCCAGCACTTATTGGAAAGGACCCAACTCAGCAGACTGCTATTGACAACTTC 359 Query 301 ATGGTCCATGAACTTGATGGAACCCAGAATGAGTGGGGTTGGTGCAAGCAAAAGCTTGGA 360 ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 360 ATGGTCCATGAACTTGACGGAACCCAAAACGAGTGGGGGTGGTGCAAGCAAAAGCTTGGA 419 Query 361 GCCAATGCGATTCTTGCTGTGTCTCTTGCTGTCTGCAAAGCTGGGGCTGTTGTCAGCGGC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 GCCAATGCGATTCTTGCTGTGTCTCTTGCTGTCTGCAAAGCTGGGGCTGTTGTCAGCGGC 479 Query 421 ATTCCTCTATACAAGCACATTGCCAATCTTGCTGGTAACCCCAAGATTGTGCTACCAGTT 480 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 ATTCCTCTATACAAGCACATTGCCAACCTTGCTGGTAACCCCAAGATTGTGCTACCAGTT 539 Query 481 CCTGCCTTCAACGTCATCAATGGTGGATCCCATGCCGGAAACAAGCTTGCTATGCAGGAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CCTGCCTTCAACGTCATCAATGGTGGATCCCATGCCGGAAACAAGCTTGCTATGCAGGAG 599 Query 541 TTTATGATTCTCCCTGTTGGAGCTTCATCTTTCACGGAAGCCATGAAAATGGGTGTGGAA 600 |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct 600 TTTATGATCCTCCCTGTTGGAGCTGCTTCTTTCAAGGAAGCCATGAAGATGGGTGTGGAA 659 Query 601 GTTTACCACCACTTGAAGTCTGTGATTAAGAAGAAGTACGGCCAGGATGCCACAAATGTT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 GTTTACCACCACTTGAAGTCTGTGATTAAGAAGAAGTACGGCCAGGATGCCACAAATGTT 719 Query 661 GGTGATGAAGGTGGCTTTGCACCAAACATTCAGGAGAACAAGGAAGGTCTTGAATTGCTC 720 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 720 GGTGATGAAGGTGGGTTTGCACCAAACATTCAGGAGAACAAGGAGGGTCTTGAATTGCTC 779 Query 721 AAGACTGCTATCGAGAAGGCTGGCTACACCGGAAAGGTTGTCATTGGAATGGATGTTGCC 780 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 AAGACTGCTATCGAGAAGGCTGGATACACTGGAAAGGTTGTCATTGGAATGGATGTTGCC 839 Query 781 GCTTCAGAGTTCTACTCATCAGACAAGACCTACGACTTGAACTTCAAAGAAGAGAACAAT 840 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 GCTTCAGAGTTCTACTCAGAAGACAAGACCTACGACTTGAACTTCAAAGAAGAGAACAAC 899 Query 841 GATG-CTTCTCAGAAGATTTCTGGTGATGCTCTCAAGGACCTGTACAAGTCCTTTGTTTC 899 ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 900 AATGGCT-CTCAGAAGATTTCTGGTGATGCTCTAAAGGACCTGTACAAGTCCTTTGTCGC 958 Query 900 TGAGTACCCAATTGTGTCCATTGAGGACCCATTTGACCAAGATGATTGGGAGCACTATGC 959 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 959 TGAGTACCCAATCGTGTCCATTGAGGACCCATTTGACCAAGATGACTGGGAGCACTATGC 1018 Query 960 TAAGATGACCACTGAGTGTGGAACCGAGGTTCAGATTGTGGGTGATGATTTGTTGGTCAC 1019 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1019 TAAGATGACCACTGAGTGTGGAACCGAGGTTCAGATTGTCGGTGATGATTTGTTGGTCAC 1078 Query 1020 CAACCCCAAGAGAGTTGCTAAGGCAATCGCCGAAAAGTCTTGCAACGCTCTTCTTTTGAA 1079 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1079 TAACCCCAAGAGAGTTGCTAAGGCAATCGCAGAGAAGTCTTGCAATGCTCTTCTTTTGAA 1138 Query 1080 GGTTAACCAAATCGGATCTGTAACCGAGAGTATCGAGGCAGTTAAGATGTCGAAGAAAGC 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1139 GGTTAACCAAATCGGATCTGTAACCGAGAGTATCGAGGCAGTTAAGATGTCGAAGAAAGC 1198 Query 1140 AGGTTGGGGAGTGATGACCAGCCACCGAAGTGGTGAAACCGAGGACACATTCATTGCTGA 1199 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 AGGTTGGGGAGTGATGACCAGCCACAGAAGTGGTGAAACCGAGGACACATTCATTGCTGA 1258 Query 1200 CTTAGCCGTTGGCTTGTCTACTGGACAAATCAAAACCGGTGCTCCTTGCAGATCCGAGCG 1259 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1259 CTTAGCCGTTGGCTTGTCCACTGGACAAATCAAAACCGGTGCTCCTTGCAGATCCGAGCG 1318 Query 1260 TCTTGCCAAGTACAACCAGCTTTTGCGTATCGAGGAGGAGTTGGGATCAGAGGCAATTTA 1319 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1319 TCTTGCCAAGTACAACCAGCTTTTGCGTATTGAGGAGGAGTTGGGATCAGAGGCAATTTA 1378 Query 1320 CGCTGGAGCCAACTTCCGCAAACCTGTGGAACCCTACTAAGTGGAGCTTTTAGAAGCAAA 1379 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1379 CGCTGGAGTCAACTTCCGCAAACCTGTGGAACCCTACTAAATGGAGCTTTTAGAAGCAAA 1438 Query 1380 GTGGTCTTCTTTGTGACGA 1398 ||||||||||||||||||| Sbjct 1439 GTGGTCTTCTTTGTGACGA 1457 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 68975548830 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5