BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg939058
Length=5243
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G60240.4 | Symbols: EIF4G, CUM2 | eukaryotic translation ini... 4569 0.0
> AT3G60240.4 | Symbols: EIF4G, CUM2 | eukaryotic translation initiation
factor 4G | chr3:22261650-22268445 FORWARD LENGTH=5526
Length=5526
Score = 4569 bits (2474), Expect = 0.0
Identities = 2710/2824 (96%), Gaps = 16/2824 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2429 ATAAATCTGCAT-TTGAAATAAACACGagaagaaatacttctacaaaaggaaagaagaag 2487
|||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 ATAAATCTGC-TGTTGAAACAAACACGAGAAGAAATACTTCTACAAAAGGAAAGAAGAAG 2637
Query 2488 ataaaagaaattcttcaaaaagCAGATGCTGCAGGGACAACTTCTGATCTCTATATGGCT 2547
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 ATAAAAGAAATCCTTCAAAAAGCAGATGCTGCAGGGACAACTTCTGATCTCTATATGGCT 2697
Query 2548 TACAAAGGGCCTGAGGAAAAGAAAGAGCGCTCAAATGTTGTTAATGATGTTTCGAACCAG 2607
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2698 TACAAAGGGCCTGAGGAAAAGAAAGAGAGCTCAAATGTTGTTCATGATGTTTCGAACCAG 2757
Query 2608 AAGCTGGCACCTGCCATACCTCTGGCTGTTGAAGCCACTGTGGATGCTGAACCAGTGAAA 2667
|| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2758 AACCTGTTACCTGCCATACCTCAGGCTGTTGAAGCCATTGTGGATACTGAACCAGTGAAA 2817
Query 2668 AATGAACCAGAAGACTGGGAAGATGCAGCCGATGTTTCTACACCAAAGTTGGAAACTGCA 2727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2818 AATGAACCAGAAGACTGGGAAGATGCAGCCGATGTTTCTACACCAAAGCTGGAAACTGCA 2877
Query 2728 GATAATTCTGTGAATGTAAAGAGAGGTTCCTCAGATGAGGTCAGAGACAGCTGCAGCAAT 2787
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||
Sbjct 2878 GATAATTCTGTGAATGCAAAGAGAGGTTCCTCAGATGAGGTCAGCGACAACTGCATCAAT 2937
Query 2788 ACAGAAAAGAAGTACTCCCGGGATTTCCTGCTAAAGTTTGCAGACCTGTGTACTGCTCTC 2847
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 ACAGAAAAGAAGTACTCCCGGGATTTCCTCCTAAAGTTTGCAGACCTGTGTACTGCTCTT 2997
Query 2848 CCTGAGGGATTTGACGTTTCCCCTGATATTGCTAATGCCTTGATTTTTGCATATATGGGT 2907
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2998 CCTGAGGGATTTGACGTTTCGCCTGATATTGCTAATGCCTTGATTGTTGCATATATGGGT 3057
Query 2908 GCATCACATCATGAACATGATTCATATCCTACTCCTGGAAAGGTTATGGATCGCCAAGCA 2967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3058 GCATCACATCATGAACATGATTCATATCCTACTCCTGGAAAGGTTATGGATCGCCAAGCA 3117
Query 2968 AGTGGTGCTCGTTCAGATCGTCGTCCCAGCAATATGGCTGTTGATGATAGATGGACGAAG 3027
||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3118 AGTGGTGCTCGTTTAGATCGCCGTCCCAGCAACGTGGCTGGTGATGATAGATGGACGAAG 3177
Query 3028 AATCAGGGTTCTCTTCCTGCAGGATATGGCGGTAACCTAGGTTTCCGACCTGGTCAAGGA 3087
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3178 AATCAGGGTTCTCTTCCAGCAGGATATGGGGGTAACGTAGGTTTCCGACCTGGTCAAGGA 3237
Query 3088 GGAAACTTGGGAGTTTTAAGAAACCCTCGTATGCAGGGGCCAATTATATCTAGACCGATG 3147
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3238 GGAAACTCGGGAGTTTTAAGAAACCCTCGTATGCAGGGACCAATTATATCTAGACCGATG 3297
Query 3148 CAACCAGTGGGTCCTATGGGAGGAATGGGCAGAAATACCCCCGACTTAGAAAGGTGGCAA 3207
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 CAACCTGTGGGTCCTATGGGAGGAATGGGTAGAAATACCCCCGACTTAGAAAGGTGGCAA 3357
Query 3208 CGTGGTTCCAATTTCCAACAAAAAGGACTTTTTCCTTCTCCGCATACTCCTATGCAGGTG 3267
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3358 CGTGGTTCAAATTTCCAACAAAAAGGACTTTTTCCTTCTCCGCACACTCCTATGCAAGTG 3417
Query 3268 ATGCACAAAGCCGAGAGAAAATACGAAGTGGGTACAGTTGCAGATGAAGAACAAGCAAAA 3327
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3418 ATGCACAAAGCCGAGAGAAAATACCAAGTGGGGACAATTGCAGATGAAGAACAAGCAAAA 3477
Query 3328 CAAAGGCAATTAAAGGGCATCCTGAACAAGTTGACCCCACAAAACTTTGAGAAACTGTTT 3387
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3478 CAAAGGCAGTTAAAGAGCATCCTGAACAAGTTGACCCCACAAAACTTTGAGAAACTGTTT 3537
Query 3388 GAGCAAGTTAAAAGTGTCAACATTGACAACGCTGTTACACTTACTGGTGTCATTTCACAG 3447
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3538 GAGCAAGTTAAAAGTGTCAACATTGACAACGCTGTTACACTTTCTGGTGTCATTTCACAG 3597
Query 3448 ATATTTGACAAAGCCTTGATGGAGCCAACATTCTGTGAGATGTATGCAGATTTCTGTTTT 3507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3598 ATATTTGACAAAGCCTTGATGGAGCCAACATTCTGTGAGATGTATGCAGATTTCTGTTTT 3657
Query 3508 CATCTGTCTGGGGCGTTACCTGATTTTAATGAGAATGGTGAAAAGATTACCTTCAAAAGA 3567
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3658 CATCTCTCTGGGGCGTTACCTGATTTTAATGAGAATGGTGAAAAGATTACCTTCAAAAGA 3717
Query 3568 TTGCTTCTCAATAAATGTCAGGAAGAATTCGAGAGAGGGGAGAAAGAAGAGGAGGAAGCC 3627
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3718 TTGCTTCTCAATAAATGTCAGGAAGAATTCGAGAGGGGGGAGAAAGAAGAGGAGGAAGCC 3777
Query 3628 AGTAGAGTTGCCGAAGAAGGACAAGTAGAACAAACCGAGGAGGAAAGGGAAGAGAAAAGA 3687
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3778 AGTAGAGTTGCCGAAGAAGGTCAAGTAGAACAAACCGAGGAGGAAAGGGAAGAGAAAAGA 3837
Query 3688 C-TCAAGGTGCGGAGGAGAATGCTCGGTAATATCAGACTTATTGGTGAGTTATACAAGAA 3746
| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3838 CTTC-AGGTGCGAAGGAGAATGCTTGGTAACATCAGACTTATTGGTGAGTTATACAAGAA 3896
Query 3747 AAGGATGTTGACTGAGAAAATCATGCACGCATGCATCCAGAAGTTGCTCGGGTATAATCA 3806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3897 AAGGATGTTGACTGAGAAAATCATGCACGCATGCATCCAGAAGTTGCTCGGGTATAATCA 3956
Query 3807 AGATCCACATGAAGAGAATATTGAAGCTCTGTGTAAACTAATGAGTACGATCGGAGTTAT 3866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3957 AGATCCACATGAAGAGAATATTGAAGCTCTGTGTAAACTAATGAGTACGATAGGAGTTAT 4016
Query 3867 GATCGATCATAACAAAGCCAAGTTCCAGATGGATGGATATTTTGAGAAAATGAAAATGCT 3926
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4017 GATCGATCACAACAAAGCTAAGTTCCAGATGGATGGATATTTTGAGAAAATGAAAATGCT 4076
Query 3927 ATCATGCAAACAAGAATTGTCTTCTAGGGTGAGGTTCATGTTGATTAATGCCATCGATCT 3986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4077 ATCATGCAAACAAGAATTGTCTTCTAGGGTGAGGTTCATGTTGATCAATGCCATCGATCT 4136
Query 3987 GAGAAAGAACAAATGGCAGGAGAGAATGAAGGTTGAAGGGCCGaaaaaaaTTGAGGAAGT 4046
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4137 GAGAAAGAACAAATGGCAGGAGAGAATGAAGGTCGAAGGGCCGAAAAAAATTGAGGAAGT 4196
Query 4047 GCACAGGGATGCTGCACAAGAACGCCAAACTCAAGCTAATAGGCTTTCACGTGGACCCTC 4106
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4197 GCACAGAGATGCTGCACAAGAACGCCAAACTCAAGCGAATAGGCTTTCACGTGGACCCTC 4256
Query 4107 GATGAATTCGTCAGCAAGAAGAGGGCATATGGAGTTTAGT---CCTAGGGGAGGAGGAGG 4163
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4257 AATGAATTCGTCAGGAAGAAGGGGGCATATGGAGTTTAGTAGTCCTAGGGGAGGAGGAGG 4316
Query 4164 AATGCTATCACCTCCAAG-TGCCCAAATGGGTGGCTACCATGGACCACCTCATGGTCGTG 4222
|||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4317 AATGCTATCACCTCCA-GCTGCCCAAATGGGTAGTTACCATGGACCACCTCAAGGTCGTG 4375
Query 4223 GCTTTAGTAATCAGGACATTAGATTTGATGAAAGGCCATCTTATGAGCCTAGGGTGGTTC 4282
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4376 GCTTTAGTAATCAGGACATTCGATTTGATGACAGGCCATCTTATGAGCCTAGGATGGTTC 4435
Query 4283 CAATGCCTCAAAGGTCAGTAGGTGAGGAGCCTATTACCTTGGGTCCGCAAGGTGGTCTTG 4342
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4436 CAATGCCGCAAAGGTCAGTATGTGAGGAGCCTATTACCTTGGGTCCGCAAGGTGGTCTTG 4495
Query 4343 GTCAGGGAATGTCTATGAGAAGGCCTGCAGTAGTATCAAACACTTTTCAGTCTGATGCTA 4402
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4496 GTCAGGGAATGTCTATTAGAAGGCCTGCAGTAGCATCAAACACTTATCAGTCTGATGCTA 4555
Query 4403 CTCAGGCCGGTGGTGGAGATTCTAGGCGACCGGCCGGTGGTTTGAATG-TATTTGGCTCA 4461
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 4556 CTCAGGCCGGTGGTGGAGATTCTAGGCGACCGGCCGGTGGTTTGAATGGT-TTTGGCTCA 4614
Query 4462 CATAGACCTGCAAGTCCTGTTACTCATGGAAGGTCAAGTCCTCAAGAGCGGGGAACAGCT 4521
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4615 CATAGACCTGCAAGTCCTGTTACTCACGGACGGTCAAGTCCTCAAGAGCGGGGAACAGCT 4674
Query 4522 TATGTTCACAGGGACTTTGCAAGTCTGTCGCGTACTTCTGATCCGTCACCAGAAGTTTCA 4581
|||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4675 TATGTTCATAGGGAATTTGCAAGTCTGTCGCGTGCTTCTGATCTGTCACCAGAAGTTTCG 4734
Query 4582 TCTGCTAGGCAAGTACTACAAGGGCCATCATCTACAGTAAACAGTCCTCGAGAAAATGCT 4641
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4735 TCCGCTAGGCAAGTACTACAAGGGCCATCAGCTACAGTAAACAGTCCTCGAGAAAATGCT 4794
Query 4642 TTGTCTGAGGAACGGTTACATAATATGTCACTGTCTGCAATTAAGGAATATTACAGTGCC 4701
|||||||| |||| |||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4795 TTGTCTGAAGAACAGTTAGAGAATCTGTCATTGTCCGCAATTAAGGAATATTACAGTGCC 4854
Query 4702 CGAGATGAGAATGAGATTGGTATGTGCATGAAAGATATGAATTCGCCAGCTTATCACCCA 4761
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 4855 CGAGATGAGAATGAGATTGGTATGTGCATGAAAGATATGAATTCACCAGCTTACCACCCA 4914
Query 4762 ACAATGATTTCTCTCTGGGTAACTGATTCGTTTGAGAGAAAAGACAAAGAAAGGGATCTC 4821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4915 ACAATGATTTCTCTCTGGGTAACTGATTCGTTTGAGAGAAAAGACAAAGAAAGGGATCTC 4974
Query 4822 TTAGCAAAGCTCCTTGTGAACCTCGTGAAATCTGCTGACAACGCCTTAA-CAGAAGTCCA 4880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 4975 TTAGCAAAGCTCCTTGTGAACCTCGTGAAATCTGCTGACAACGCCTTAAAC-GAAGTCCA 5033
Query 4881 GCTAGTGAAAGGGTTTGAATCTGTTTTGACAACCCTGGAGGATGCTGTAAATGATGCTCC 4940
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5034 GCTAGTGAAAGGGTTTGAATCGGTTTTGAAAACCCTGGAGGATGCAGTAAATGATGCTCC 5093
Query 4941 AAAAGCAGCAGAGTTTCTTGGTAAAAT-TGTTGGTAAAAGTGTGACAGAGAAAGTAGTGA 4999
||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5094 AAAAGCAGCAGAGTTTCTTGGTAGAATAT-TTGGGAAAAGTGTGACAGAGAAAGTAGTGA 5152
Query 5000 CATTGACAGAGATTGGTCGGTTAATACGGGAAGGAGGAGAAGAACCAGGAAGTCTGATAG 5059
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5153 CATTGACAGAGATTGGTCGGTTAATCCAGGAAGGAGGAGAAGAACCAGGAAGTCTGATAG 5212
Query 5060 AGTTTGGATTAGGCGGTGATGTTCTTGGTAGTGTTTTGGAGATGATAAAGACAGAAGCAG 5119
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 5213 AGTTTGGATTAGGCGGCGATGTTCTTGGGAGTGTTTTGGAGATGATAAAAACAGAAGCTG 5272
Query 5120 GAGAAGAAGCGTTGGTTGAGATTCGCCGGAGCTCAGGTCTGAGGATTGAAGATTTCAAAC 5179
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5273 GAGAAGAAACGTTGGTTGAGATTCGCCGGAGCTCAGGTCTGAGGATTGAAAATTTCAAAC 5332
Query 5180 CTCATGCACCTAACCGGTCTAAGATATTAGAGAAATTTACTTAGGaaaaaaaaaaTGGAA 5239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5333 CTCATGCACCTAACCGGTCTAAGATATTAGAGAAATTTACTTAGGAAAAAAAAA-TGGAA 5391
Query 5240 CCAT 5243
||||
Sbjct 5392 CCAT 5395
Score = 2627 bits (1422), Expect = 0.0
Identities = 1685/1806 (93%), Gaps = 41/1806 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAAGATTAGGGTTTGTTCTAGATGTCCTACAATCAATCAAGGCCCGACAGAAGCGAGACT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 172 GAAGATTAGGGTTTGTTCTAGATGTCCTACAATCAATCCAGACCCGACAGAAGCGAGACT 231
Query 61 CAATATCGTAGAACTGGTCGATCCGCCGGTAACCATCACCAACAGCAACAACAACAGCAA 120
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | | ||||||| | | |||
Sbjct 232 CAATATCGTAGAACTGGTCGATCCACCGGTAACCA--A-C-A-A-CAACAAC-A-A-CAA 282
Query 121 CACCGATCTTCTTCCGCCGCCGGTTACGGTAAGGGAGCCGGCGCTCCTGCTACTGCGCCT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 283 CACCGATCTTCTTCCGCCGCCGGTTACGGTAAGGGCGCCGGCGCTCCTGGTTCTGCGCCT 342
Query 181 GCCCCTTCCACTTA-CGCTGATAATTCTTCCTTGCCTTCTTCTAATCGCAGTTTTAAGAA 239
|||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 343 GCCCCTTCCACTTATC-CTGATAATTCTTCCTTG---TCTTCCAATCGCAGTTTTAAGAA 398
Query 240 GCCCGGCAATGCTCAAGGAGGTGGGCAGCCTCGGGTGAATCTGCCACCTGTGAATCATCC 299
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 GCCCGGCAATGCTCAAGGAGGAGGGCAGCCTCGGGTGAATCTGCCACCTGTGAATCATCC 458
Query 300 TAACAATCACAACAATGGTCCCAATGCACACTCTCGCTCTCAAGGAGTGCCTGGTGAACC 359
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | || |||||
Sbjct 459 TAATAATCACAACAATGGTCCCAATGCTCACTCTCGCTCTC-A--AGTTACAGGAGAACC 515
Query 360 GGTTGTTGGTGGACCAGCCAATCCAACTGAATCATTCAACAGAAACACTGGACCTATTCC 419
|| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 516 GGGTGTTGGTGGACCAACCAATCCAACTGAATCGTTCAACAGAAACACCGGACCTATTCC 575
Query 420 AAAGGCTCCAACTTCTCAGTCTACCGCCATGAGTTCCAAAAACAATGAGACGCCCAACAC 479
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 576 AAAGGCTCCAACTTCTCAGTCTACCGTCATGAGTTCCAAGATCAATGAGACGCCCAACAC 635
Query 480 AGCT-AA-----AGCCTCTGGAGACGCTTCTCAAGCATTTGCTTTGCAATTTGGGTCACT 533
|||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||||||||
Sbjct 636 AGCTAAAGTGGCAGCCTCTGGAGACGCTTCTCAGGCATTTCCTCTCCAGTTTGGGTCACT 695
Query 534 TGGTCCTGATTTGATGAAGATTCCTGCTCGAACTAGCTCAGCACCTCCGAATATGGATGA 593
|||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 TGGTCCTGATTTGATG--G-TTCCTGCTCGAACTACCTCAGCACCTCCGAATATGGATGA 752
Query 594 GCAGAAACGTGCCCAGATGCAGCAAGCTTCTTTAAGAACGGCACCAAACGTGCCAGCTTC 653
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 753 CCAGAAACGTGCCCAGATGCAGCAATCTTCTTTAAGAACGGCGTCAAATGTGCCAGCTTC 812
Query 654 TGTACCCAAAAAAGATTCATCAAATAAGGGTGCTGATAATCAATTGATGAGGAAAGAGGG 713
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 TGTACCCAAAAAAGATTCATCAAATAAGGGTGCAGATAATCAATTGATGAGGAAAGAGGG 872
Query 714 GCACAATCCATCGAGTGAAAAAGCTGATATCCAAGTCCCACATATATCCCCTCCAAGTCA 773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 873 GCACAATCCATCGAGTGAAAAAGCTGATATCCAAGTCCCACATATAGCCCCTCCAAGTCA 932
Query 774 AACGCAGAAGTCTCCAATTACAAATATCCGCATGCCTTCTGTGCAGACACCATATCAGCA 833
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 AACGCAGAAGTCTCCAATTACAAATATTCGCATGCCTTCTGTGCAGACACCATATCAGCA 992
Query 834 TGCTCAGGTCCCTCACCATGTACATTTTGGTGGGCCGAATATGCATATGCAGCCTCCCGT 893
| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 993 TACTCAGGTCCCTCACCCTGTACATTTTGGTGGGCCGAATATGCATATGCAGACTCCCGT 1052
Query 894 GACTGCAACCTCATTTCAGATGCCAATGCCAATGGCATTATCTATGGGAAATACCCCTCA 953
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1053 GACTGCAACCTCGTTTCAGATGCCAATGCCAATGGCATTATCTATGGGAAATACTCCTCA 1112
Query 954 AATCACGCCGCAGGTGTTTTTTCAGGGTCTCCCATCACATCCATCACATCCAATGCATCA 1013
|||| ||||||||||||||| |||||| | ||| || ||| || ||| ||||||||
Sbjct 1113 AATCCCGCCGCAGGTGTTTTATCAGGGAC----ATC-CA-CCA-CA--TCCGATGCATCA 1163
Query 1014 TCAGGGTATGATGCATCAGGCTCAGGGACATGGTTTTGCAACTCCAATGGGTGCTCAAAT 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1164 TCAGGGTATGATGCATCAGGCTCAGGGACATGGTTTTGCAACTCCAATGGGTGCTCAGAT 1223
Query 1074 TCATCATCAGTTAGGCCATGTGGGTGTGGGTTTGAGCCCGCAGTATCCCCAGCAGCAAGG 1133
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 TCATCCTCAGTTAGGCCATGTGGGTGTGGGTTTGAGCCCTCAGTATCCCCAGCAGCAAGG 1283
Query 1134 AGGAAAATATGGTGGGACACGCAAGACCACGCCTGTAAAGATTACACATCCTGACACACA 1193
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 TGGAAAATATGGTGGGGCACGCAAGACCACCCCTGTAAAGATTACACATCCTGACACACA 1343
Query 1194 CGAAGAGCTGAGGCTTGATCGACGCGGTGACCCGTATTCAGAAGGCGAATCAGCGGCCTT 1253
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||
Sbjct 1344 CGAAGAGCTGAGGCTTGATCGACGTGGTGACCCGTATTCAGAAGGCGATTCAACGGCTTT 1403
Query 1254 AAAACCACATTCTAACCCACTTCCCAGATCACAGCCAGTCTCATCACTTGCTCCACGACA 1313
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1404 AAAACCACATTCTAACCCACCTCCCAGATCACAGCCAGTCTCATCATTTGCTCCAAGACC 1463
Query 1314 AGTCAATTTGGTGCAACCCTCATATAACTCCAATACCATGATATATCCTCCGGTTTCTGT 1373
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1464 AGTCAATTTGGTGCAACCCTCATATAACTCCAATACCATGATATATCCCCCGGTTTCGGT 1523
Query 1374 ACCCTTAAATAGTGGTCCAATATCATCCGCTCAGGCACCGAGATACCATTACCCAGTTAT 1433
||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1524 ACCGTTAAATAATGGTCCAATGTCATCCGCTCAGGCACCGAGATATCATTACCCAGTTAT 1583
Query 1434 TGATGGGTCTCAGAGAGTACAACTTATCAACCAACCTGCTCATACTGCTCCACAGCTTAT 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 TGATGGGTCTCAGAGAGTACAACTTATCAACCAACCTGCTCATACTGCTCCACAGCTTAT 1643
Query 1494 CAGACCCGCAGCTTCTGCTTATGTTTCATCTGATTC-AGCTTCCTCTGTGAAAGCACGCA 1552
||||||||| ||| |||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1644 CAGACCCGCTGCTCCTGCACATCTTTCCTCTGATTCGA-CTTCCTCTGTGAAAGCACGCA 1702
Query 1553 ATACCCAAAATGTAATGTCATCTGCTCTACCTGTAAATGCGAAGGTATCAGTGAAGCCAG 1612
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATGCCCAAAATGTAATGTCATCTGCTCTACCTGTAAATGCGAAGGTATCAGTGAAGCCAG 1762
Query 1613 CTGGGGCTTCTGAAAAGCTTGGATCACCAAAAGCCAGGTCACATGGAGAAGTTAACATTT 1672
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1763 CTGGGGTTTCTGAAAAGCTTGGATCACCAAAAGACAGGTCACATGGAGAAGTTAACATTT 1822
Query 1673 CTCTGTCACAAAAAGA-CGTGGAGGCAGGTTCATTGAGCTCTTCACAGCAGCCGAAACCT 1731
||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1823 CTCTGTCACAAAA-GAACGTGGAGGCATGTTCGTTGAGCTCTTCCCAGCAGCCGAAACCT 1881
Query 1732 GGCTTTGTCTCTGGAGTACCAAATTCGTCTGCTCCGCCAG-AGAAGTCATCTGTGGAGAC 1790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||
Sbjct 1882 AGCTTTGTCTCTGGAGTACCAAATTCGTCTGCTCCGCCAGCA-AAGTCGCCTGTGGAGAC 1940
Query 1791 TGCTCC 1796
|| |||
Sbjct 1941 TGTTCC 1946
Score = 843 bits (456), Expect = 0.0
Identities = 566/615 (92%), Gaps = 23/615 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1760 CTGCTCCGCCAG-AGAAGTCATCTGTGGAGACTGCTCCAGTTGCAACGACTGAAATCAGA 1818
||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1970 CTGTTCCGCCAGTA-AAGTCGTCTGTGGAGACTGCTCCAGTTACAACGACTGAAATCAGA 2028
Query 1819 AGAGCAGAAATGGTGAGTGAGTCGATCTCAGTTGAAGATCAGACATGTAAGGAGGAACCC 1878
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2029 AGAGCGGAAATGGTGAGTGAGTCGATCTCAGTTGAAGATCAGACATGTAAGGTGGAACCC 2088
Query 1879 CCTCATAATC---C---G-A-C-T-G--AGACTATGCCAGACTCTCTGGTCTCTGATCCC 1926
|||||||||| | | | | | | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 CCTCATAATCTGACTGAGAATCGTGGACAGACTATGCCAGACTCTCTGGTCTCTGATCCT 2148
Query 1927 GAAACAAAAACCGTTGCTGCCAAGGAAAATTTATCACTCCCAGCTACCAACGGGTTTAGG 1986
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 GAAACAGCAACCGTTGCTGCCAAGGAAAATTTATCACTCCCAGCTACCAACGGGTTTAGG 2208
Query 1987 AAGCAACTCATGGAAG-TGTCTCCTCCAGCTGATGCTCCAACTTTTGAATCAGTAGATAC 2045
||||||||| || ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2209 AAGCAACTCCTG-AAGGTGTCTACTACATCTGATGCTCCAACTTCTGACTCAGTAGATAC 2267
Query 2046 GAA-TATTGACAAATCTATGGAAGGGTCAAGCCATGCCTCATCTGAGATTTCTGGTTCTT 2104
|| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2268 -AAGTATTGACAAATCTACGGAAGGTTCAAGCCATGCCTCATCGGAGATTTCTGGTTCTT 2326
Query 2105 CACCGCAAGAGAAAGACCTAAAATGTGATGAAC-GGACTGTTTCTGACAAGCTCGTTGAA 2163
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2327 CACCGCAAGAGAAAGACCTAAAATGTGAT-AACCGGACTGCTTCTGACAAGCTCGATGAA 2385
Query 2164 AGGTCTGTAATTTCTGATGAAAAACACGAAACAATGTCAGGTGTGCTTGAGAAGGCACAG 2223
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2386 AGGTCTGTAATTTCTGATGCAAAACACGAAACACTGTCAGGTGTGCTTGAGAAGGCACAG 2445
Query 2224 AATGAGGTAGATGGTGCCACAGAAGTCTGTCCTGTCTCTGAAAAATTAGCTGAAGTTACA 2283
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2446 AATGAGGTAGATGGTGCCACAGATGTCTGTCCTGTCTCTGAAAAACTAGCTG---TTACA 2502
Query 2284 GATGATACAAGCTCTGACCTTCCACATTCTACTCATATTCTGTCTTCTACTGTTCCTCTT 2343
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 GATGATACGAGCTCTGACCTTCCACATTCTACTCATGTTCTGTCTTCTACTGTTCCTCTT 2562
Query 2344 GGACATTCAGAAACA 2358
|||||||| ||||||
Sbjct 2563 GGACATTCGGAAACA 2577
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 261670774688
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5