BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg941041 Length=5584 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G15540.1 | Symbols: EMB2773, ATSCC2, SCC2 | PHD finger famil... 9304 0.0 > AT5G15540.1 | Symbols: EMB2773, ATSCC2, SCC2 | PHD finger family protein | chr5:5047887-5057411 REVERSE LENGTH=5541 Length=5541 Score = 9304 bits (5038), Expect = 0.0 Identities = 5384/5552 (97%), Gaps = 19/5552 (0%) Strand=Plus/Plus Query 21 ATGAGCAATCCAAGCAGTTCCGGCTGGGGTTCAAGTTCGA-GTTTGACTCAGTTCGGGAT 79 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| Sbjct 1 ATGAGCAATCCAAGCAGTTCCGGCTTGGGTTCAAGTTC-AGGTTTGACTCATTTCGGGAT 59 Query 80 CGGTTTGGCTAATACTGTGCAGTCGGAGGTTGCTCCTTACTTGCCGCTACCGTCGTTACC 139 |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60 CGGTTTGGCTAATACTGTTCAGTCGGAAGTTACTCCTTACTTGCCGCTACCGTCGTTACC 119 Query 140 TATATTCTGTGGTGCGGCGGAACCTGGAGAGTTCAAGCTGTTCGATGAGGTTGGCGAAGG 199 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 120 TATATTCTGCGGTGCGGCCGAACCTGGAGAGTTCAAGTTGTTCGATGAGGTTGGCCAAGG 179 Query 200 TAGTAGCTACAGGTCGTTGGATCGCAGTGAGATTCTAGCGCAATCTAGTAGAATCGCAAA 259 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 TAGTGGCTACAGGTCGTTGGATCGCAGTGAGATTCTCGCGCAATCTAGTAGAATCGCAAA 239 Query 260 CATGCTTCAAGAGACTGACGTTTCTTACCTGGATCTTAGAAACGTGGCTAGGGCGCCCGA 319 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 240 TATGCTTCATGAGACTGACGTTTCTTACCTGGATCTTAGAAACGAGGCTAGGGCGCCCGA 299 Query 320 TTGTAATTCTGGGGAGCATTTTCAGTTATATGACCAAGTTCTACGATGCAATCCTGGAGC 379 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 TTGTAATTCTGGGGAGCATTTTCAGTTATATGACCTAGTTCTACGATGCAATCCTGGAGC 359 Query 380 ATTTGAGTATGTTACCCCTGGTCCGACCTGCGATCCAGTCTTTACCAATGAAGTGCCTCA 439 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 360 ATTTGAGTATGTTACCCCCGGTCCGACCTGCGATCCACTCTTTACCAATGAAGGGCCTCA 419 Query 440 AAAGATAATTTCTGAGCCAAGTGTTCCTGTCAAGATGCATCGACAGACGGATAATCATTT 499 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct 420 AAAGATAATTTCTGAACCAAGTGTTCCTGTCAAGATGCAGCGACAGACGGATACTCATTT 479 Query 500 AGCTAGGAGTATCGAACCTGAACCTGTGAAAAGGGTATTACGATCAAATCATGTTGAAGA 559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 480 AGCTAGGAGTATCGAACCTGAACCTGTGAAAAGGGTATTACGACCAAATCATGTT---GA 536 Query 560 AGATCATAGTTGGCAGCACGAAACTCTGACAAACCAGTCACCGAATGATGGTACTGCATA 619 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | Sbjct 537 AGATCATAGTTGGCAGCACGAAACTCTGACAAACCAGTCACCGAAAGATGTTACTGC--A 594 Query 620 TCATGACTCTCGGCCTGAAACGATCACCATGAATGAAATTTCTGCTTCCAAAAAGCCAAA 679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 595 T-ATGACTCTCGGCCTGAAACGATCACCATGAATGAACTTTCTGCTTCCAAAAAGCCAAA 653 Query 680 GGGAAAGAAGAAACGTAAAGATGACTTGTCTTCAGTTCAACCAGATCCATCTGTGCTGCA 739 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 654 GGGAAAGAAGAAACGTAAAGATGACTTGTCATCAGTTCAACCAGATCCATCTGTGCTGCA 713 Query 740 AGAGTCCATCGTA-AATAGCTTTTGTGAGATGTTGGAGGACTTCTGTGGCAGAGCTGAAG 798 ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 714 AGAGTCCATCGTACAA-AACTTTTGTGAGATGTTGGAGGACTTCTGTGGCAGAGCTGAAG 772 Query 799 TCCCTGGTGATGATAGGGATGAAACAGAGTGGTCATCAGTTCCTGTTGATGAAGTTCGTG 858 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 773 TCCCTGGTGATGATAGGGATGAAGCAGAGTGGTCATCAGTGCCCGTTGATGAAGTTCGTG 832 Query 859 TTCTTGTAAATGAATTGATGACTATACGGTCAAAAATGCTTCTGCATATGGTACCTGTTG 918 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 833 TTCTTATAAATGAATTGATGACTATACGGTCAAAAATGCTTCTGCATATGGTACCTGTTG 892 Query 919 ATATTCTATCGAGGTTATTGCGCACTCTGGATCATCAGATACACAGGGCAGAAGGCTTGT 978 |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 893 ATATTCTATCAAGGTTACTGCGCACTCTGGATCATCAGATACACAGGGCAGAAGGCTTGT 952 Query 979 CCATTTATAGTGAACATTCAGATTCAGATTCAGTTTTGTTGGTTCTTGGTGCCCTTGAGT 1038 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 953 CCATTTATAGTGAACATTCAGATTCAGATTCAGTGTTGTTGGTTCTTGGTGCCCTTGAGT 1012 Query 1039 CAATTCATGCATCGCTAGCAGTGATGGCCAACAGTGATTTGCCAAAGCAGCTCTACAAGG 1098 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1013 CAATCCATGCATCGCTAGCAGTGATGGCCAACAGTGATATGCCAAAGCAGCTCTACAAGG 1072 Query 1099 AGGAGATAATTGAGAGAATTCTGGAGTTTTCTAGGCACCAAATGATGGCTGTTATGTCTG 1158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1073 AGGAGATAATTGAGAGAATTCTGGAGTTTTCTAGGCACCAAATGATGGCTGTTATGTCTG 1132 Query 1159 CTTATGATCCATCATACCGCACTGGAAGTAAACCGGCAGAAAATGTGGCATTTGAAGGTG 1218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1133 CTTATGATCCATCATACCGCACTGGAAGTAAACCGGCAGAAAATTTGGCATTTGAAGGTG 1192 Query 1219 ATGATGATGATG---ATCCTGATCATGACATGGGCTCAGCCAGCAAAAGGCGGCGCATAG 1275 |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1193 ATGATGATGATGATAATCCAGATCATGACATGGGGTCAGCCAGCAAAAGGCGGCGCATAG 1252 Query 1276 GAAAAAGCGGCAAAGTAAAGAAGTCGTCAGTGAACAGGATCTCTGGAGCAGTGAATACTG 1335 ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1253 TAAAAAACAGCAAAGTAAAGAAGGCGTCAGTAAACAGGATCTCTGGAGCAGTAAATACTG 1312 Query 1336 CACTACAGAAACTTTGCACAATTCTTGGCTTACTCAAGGACCTGTTGTTGGTAGAAAGGT 1395 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1313 CACTACAGAAACTTTGCACTATTCTTGGCTTACTCAAGGACCTGTTGTTGGTAGAAAGGT 1372 Query 1396 TGTCTGACAGTTGCATTTTACAACTGCTGAAGACAAGTATTACAACATTTCTGGTGGAAA 1455 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1373 TGTCTGACAGTTGCATTTTACAACTGTTGAAGACAAGTATTACAACATTTCTAGTGGAAA 1432 Query 1456 ATATCCAACTTCTGCAACTTAAAGCAATTAGCTTAATCGGTGGTATTTATAATTCATATT 1515 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1433 ATATCCAAATTCTGCAACTTAAAGCAATTAGCTTAATCGGTGGTATTTATAATTCATATT 1492 Query 1516 CTCAACACCGAACATATGTGATAGATGAAATATCTCAATTGCTCTGGAAGTTACCTTCCT 1575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1493 CTCAACACCGAACATATGTGATAGATGAAATATCTCAATTGCTCTGGAAGTTACCTTCCT 1552 Query 1576 CGAAACGAGCATTGAGAGCGTATCTTCTCCCTGATGAAGAACAGAGGCAGATTCAAATGG 1635 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1553 CGAAACGAGCATTGAGAGCGTATCTTCTCCCTGATGAAGAACAGAGGCAGATTCAAATGG 1612 Query 1636 TCACTGCTTTGCTCATTCAGTTGGTTCACAACAGCACAAACCTTCCTGAAACCTCAAGAC 1695 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 1613 TCACTGCTTTGCTCATTCAGTTGGTTCACAACAGCACAAGCCTTCCTGAAACCTCGAGAC 1672 Query 1696 AGGCTTCCAGTGGAAACTCTATACTGGAGACCCCAGTTGATGTTGGCTACCTTACTAAGT 1755 ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1673 AGGCTGCCAGTGGAAACTCTATACTAGAGACCTCAGTTGATGTTGGCTACCTTACTAAGT 1732 Query 1756 GTCATGAAGCTGCTACAGAAACATGTTGCCTCTTCTGGACTCGTGTCCTTGAACGATTTA 1815 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1733 GTCATGAAGCGGCTACAGAAACATGTTGCCTCTTCTGGACTCGTGTCCTTGAACGATTTA 1792 Query 1816 CCAGTTTTAAGGGTCAGGATGCTTCTGAGATAAAATTGATTATTGAGAATCTTGTTATGG 1875 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1793 CCAGTTTTAAGGGTCAGGACGCTTCTGAGATAAAATTGATTATTGAGAATCTTGTTATGG 1852 Query 1876 ACTTACTGACAGCATTAAATCTTCCTGAATATCCGTCTGTGTCTCCTATTCTTGAGGTTC 1935 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1853 ACTTACTGACAGCATTAAATCTTCCTGAATATCCGTCTGTGTCTCCTATTCTTGAGGTTC 1912 Query 1936 TCTGTGTCATACTGCTACATAATGCAGGGTTGAAATCAAAAGATGTCTCTGCTCGAATAA 1995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1913 TCTGTGTCATACTGCTACATAATGCAGGGTTGAAATCAAAAGATGTCTCTGCTCGAATAA 1972 Query 1996 TGGCCATTGACTTGCTAGGTACAATAGCTGCAAGGTTGAAACGTGATGCTGTCCTCTGCA 2055 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1973 TGGCCATTGAGTTGCTAGGTACAATAGCTGCAAGGTTGAAACGTGATGCTGTCCTCTGCA 2032 Query 2056 GTAAAGACAGATTCTGGACGTTACTAGAGTCAGATAGTGAAATTAACGTTGATCAAGTTT 2115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2033 GTAAAGACAGATTCTGGACGTTACTAGAGTCAGATAGTGAAATTAGCGTTGATCAAGTTT 2092 Query 2116 GCACAAAAGATTGCACTATTT-GTTTAGGTAAAAGGGCTGGGAACTTATTGGTCTGTCAA 2174 |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2093 GCACAAAAGATTGCAC-ATTTTGTTTAGGTAAAAGGGCTGGGAACTTATTGGTCTGTCAA 2151 Query 2175 ATTTGTCAAAGGCGGTTTCATGGTGACTGTTTGGGTTTAAAGGAACTAGACATTCCAAGT 2234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2152 ATTTGTCAAAGGCGGTTTCATGGTGACTGTTTGGGTTTAAAGGAACTAGACATTTCAAGT 2211 Query 2235 CGGAATTGGCACTGTCCGTTTTGTGTATGCAAGAGGAAACTTCTTGTACTACAGTCTTAC 2294 || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2212 CGAAATTGGCACTGTCCGCTTTGTGTATGCAAGAGGCAACTTCTTGTACTACAGTCTTAT 2271 Query 2295 TGCAAGACGGACACCAAGGGTACTGGTAAGTTGGAATCAGAAGAAAGCATCGAAAATCCA 2354 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2272 TGCAAGACTGACACCAAGGGTACTGGTAAGTTGGAATCAGAAGAAAGCATCGAAAATCCA 2331 Query 2355 AGTATGATTACAAAGACCGAAGTTGTGCAACAGATGCTCTTGAATTACCTTCAGGATGCA 2414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2332 AGTATGATTACAAAGACCGAAGTTGTGCAACAGATGCTCTTGAATTACCTTCAGGATGTA 2391 Query 2415 GGATCTA-CTGATGATGTGCATACTTTCATTTGCTGGTTTTATCTGTGCCTTTGGTATAA 2473 ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2392 GGATC-AGCTGATGATGTGCATACTTTCATTTGCTGGTTTTATCTGTGCCTTTGGTATAA 2450 Query 2474 AGATGTCCCAAAATCTCAGGATAAATTCAAATATTACATTGCCAGACTGAAAGCAAAGTC 2533 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2451 AGATGTCCCAAAATCTCAGAATAAATTCAAATATTACATTGCCAGACTGAAAGCAAAGTC 2510 Query 2534 AATAATCCGTAACTCTGGAGCAACTACTTCGTTCTTGACAAGAGATGCTATCAAGAAGAT 2593 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2511 AATAATCCGTAACTCTGGAGCAACTACTTCGTTCTTGACAAGAGATGCTATCAAGCAGAT 2570 Query 2594 TACTTTAGCCCTTGGAATGAATAGTTCCTTTTCCAGAGGATTTGATAAGATTCTAAACAT 2653 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2571 TACTTTAGCCCTTGGAATGAATAGTTCCTTTTCCAGAGGATTTGATAAGATTCTGAACAT 2630 Query 2654 GCTCCTGGCTAGTTTAAGAGAGAACGCTCCCAACATTAGGGCCAAAGCTTTGCGAGCAGT 2713 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2631 GCTCCTGGCTAGTTTAAGAGAGAACGCTCCCAACATTAGGGCTAAAGCTTTGCGAGCAGT 2690 Query 2714 TAGTATAATTGTTGAAGCTGATCCAGAGGTACTGTGTGATAAACGTGTTCAGTTGGCTGT 2773 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2691 TAGTATAATTGTTGAAGCTGATCCAGAGGTACTGTGTGATAAGCGTGTTCAGTTGGCTGT 2750 Query 2774 TGAGGGAAGGTTTTGTGATTCTGCAATATCTGTTAGAGAAGCAGCACTGGAACTTGTTGG 2833 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2751 TGAGGGAAGGTTTTGTGATTCTGCAATATCTGTTAGAGAAGCAGCACTGGAACTTGTTGG 2810 Query 2834 TAGGCATATTGCATCACATCCTGATGTTGGTATAAAGTATTTTGAGAAGGTCGCTGAGAG 2893 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2811 TAGGCATATTGCATCACATCCTGATGTTGGTATAAAGTACTTTGAGAAGGTCGCTGAGAG 2870 Query 2894 GATTAAGGATACTGGAGTGAGTGTTCGAAAACGAGCCATCAAGATAATACGTGACATGTG 2953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2871 GATTAAGGATACTGGAGTGAGTGTTCGAAAACGAGCCATCAAGATAATACGTGACATGTG 2930 Query 2954 TACTTCCAATCCCAACTTCTCTGAATTCACAAGTGCGTGCGCTGAGATATTATCTCGTAT 3013 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2931 TACTTCAAATCCCAACTTCTCTGAATTTACAAGTGCGTGCGCTGAGATATTATCTCGTAT 2990 Query 3014 CAGTGATGATGAGTCTAGCGTTCAGGATCTTGTGTGCAAAACTTTCTATGAATTTTGGTT 3073 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2991 CAGTGATGATGAGTCTAGTGTTCAGGATCTTGTGTGCAAAACTTTCTATGAATTTTGGTT 3050 Query 3074 TGAGGAACCTCCAGGGCATCATACTCAGTTTGCTAGTGACGCTAGCTCCATTCCACTGGA 3133 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3051 TGAGGAACCTCCAGGGCATCATACTCAGTTTGCTAGTGATGCTAGCTCCATTCCACTGGA 3110 Query 3134 ACTGGAAAAGAAAACCAAGCAAATGGTTGGGTTGTTAAGCAGGACCTCAAATCAACAGCT 3193 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3111 ACTGGAGAAGAAAACCAAGCAAATGGTAGGGTTGTTAAGCAGGACCCCAAATCAACAGCT 3170 Query 3194 TCTTGTAACAATTATTAAGCGTGCCCTGGCCCTGGAtttttttCCTCAAGCAGCTAAAGC 3253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3171 GCTTGTAACAATTATTAAGCGTGCCCTGGCCCTGGATTTTTTTCCTCAAGCAGCTAAAGC 3230 Query 3254 TGCTGGTATTAACCCAGTTGCTCTTGCATCAGTACGCAGGCGCTGCGAGCTGATGTGCAA 3313 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3231 TGCTGGTATTAACCCAGTTGCTCTTGCATCAGTACGCAGGCGCTGCGAGCTGATGTGCAA 3290 Query 3314 GTGCTTACTGGAAAAAATATTACAGGTAGAAGAAATGAGCCGTGAAGAAGGAGAGTTGCA 3373 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3291 GTGCTTACTGGAAAAAATATTACAGGTAGAAGAAATGAGCCGTGAAGAAGGAGAGGTGCA 3350 Query 3374 AGTACTTCCTTATGTACTTGTTTTACATGCTTTCTGTCTGGTGGATCCTGGGCTGTGTAC 3433 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3351 AGTACTTCCTTATGTACTTGTTTTGCATGCTTTCTGTCTGGTGGATCCTGGGCTGTGTAC 3410 Query 3434 ACCGGCTTCAGACCCTACTAAATTTGTCATCACCTTACAGCCATATCTGAAGAGTCAGGC 3493 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3411 ACCGGCTTCAGACCCTACTAAGTTTGTCATCACCCTACAGCCATATCTGAAGAGTCAGGC 3470 Query 3494 TGATAGTAGAACAGGAGCACAGTTACTAGAGAGTATTATTTTCATTATCGATTCTGTCCT 3553 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3471 TGATAGTAGAACAGGAGCACAGTTACTGGAGAGTATTATTTTCATTATCGATTCTGTCCT 3530 Query 3554 ACCATTGATCCGGAAGCTGCCTCTAAGTGTCACAGAAGATCTGGAACAAGATCTAAAGCA 3613 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3531 ACCCTTGATCCGCAAGCTGCCTCTAAGTGTCACAGAAGATCTGGAACAGGATCTAAAGCA 3590 Query 3614 TATGATTGTTCGGCATTCATTTCTAACTGTTGTTCATGCTTGCGTTAGGTGTCTTTGTTC 3673 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3591 TATGATTGTTCGGCATTCGTTTCTAACTGTTGTGCATGCTTGCGTTAGGTGTCTTTGTTC 3650 Query 3674 TGTGAGTAAATTGGCGGGGAAAGGTGTTAGCATAGTTGAGCATCTTCTTCAGTTCTTTTT 3733 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3651 TGTGAGTAAATTGGCGGGGAAAGGTGTTAGCATAGTTGAGCATCTTCTTCAGTTCTTTTT 3710 Query 3734 TAAGCGGCTGGAGGCCCAAGGTTCCGATAACACACAGATTGCTGGGCGGTCCCTTTTTTG 3793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3711 TAAGCGGCTGGAGGCCCAAGGTTCCGATAACACACAGATTGCTGGGCGGTCCCTTTTTTG 3770 Query 3794 TCTTGGCTTGCTTATTCGCCATGGAAATTCTCTTATTAGCACCTCAGGTGGCAAGAATTT 3853 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3771 TCTTGGCTTGCTTATTCGCCATGGAAACTCTCTTATTAGTACCTCAGGTGGCAAGAATTT 3830 Query 3854 CAATCTCTCTGGCTGTCTCAATTTGTTTAAACGACATCTCCGAACGGAAGATATTGCTTT 3913 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3831 CAATCTCTCTGGCTGTCTTAATTTGTTTAAACGACATCTCCGAACGGAAGATATTGCTTT 3890 Query 3914 GAAAGTCAGGTCGCTGCAGGCTTTAGGATTCATCCTAATTGCACGACCTGAGTACATGTT 3973 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3891 GAAAGTCAGGTCGCTGCAGGCTTTAGGATTCATCCTAATTGCACGACCTGAGTACATGTT 3950 Query 3974 GGAAGAAGACATTGGAAAGATAATCGAGACTACATTAGCAGATGAAGCAAATGGGCGTAT 4033 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3951 GGAAGAAGACATTGGAAAGATAATCGAGACTACATTAGCAGATGAAGCAAATGGGCGTAT 4010 Query 4034 GAAGATGCAAGCATTACAAAACATCTATGAATACCTTCTTGATGCGGAAAAACAATTGGG 4093 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4011 GAAGATGCAAGCATTACAAAACATGTATGAATACCTTCTTGATGCGGAAAAACAATTGGG 4070 Query 4094 ATCCGAGAAAGCCAGTGATAACGTGGTTAACCCAATTGAGCAAGGTGGCCATACTGTACC 4153 ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| Sbjct 4071 ATCAGAGAAAGCCAGTGATAACACGGTTAACTCAGTTGAACAAGGTGGCCATAATGTACC 4130 Query 4154 TGTGGCCGCTGGTGCAGGTGACACCAACATTTGCGGAGGCATTGTGCAGTTGTATTGGGA 4213 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4131 TGTGGCCGCTGGTGCAGGTGACACCAACATTTGCGGAGGCATTGTGCAGTTGTTTTGGGA 4190 Query 4214 TAAGATATTAGGTAGATGCTTAGACTTCGATGATCAAATTCGCCAGAC-TGCTCTCAAGA 4272 ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 4191 TAAAATATTAGGTAGATGCTTGGACTTTGATGATCAAATTCGCCAGACCT-CTCTCAAGA 4249 Query 4273 TAGTGGAAGTTGTACTACGTCAAGGCCTAGTTCATCCTATTACGTGTGTCCCTTATTTGA 4332 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4250 TAGTGGAAGTTGTACTACGTCAAGGCCTAGTGCATCCTATTACGTGTGTTCCTTATTTGA 4309 Query 4333 TTGCCCTCGAGACGGATCCTCAAGAGGCCAACCAAAAGCTGGCCCATCATTTACTAATGA 4392 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4310 TTGCCCTCGAGACAGATCCTCAAGAGGCCAACCAAAAGCTGGCCCATCATTTACTAATGA 4369 Query 4393 ATATGCATGAGAAATATCCGGCtttttttGAGAGCCGTCTCGGTGACGGACTTCAAATGT 4452 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4370 ATATGCATGAGAAGTATCCGGCTTTTTTTGAGAGCCGTCTTGGTGACGGACTTCAAATGT 4429 Query 4453 CGTTTATCTTCATGCAATCCATCAGCCAGGTCACTTCAGAACCAAATCAAAGTCTTCAGC 4512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4430 CGTTTATCTTCATGCAATCCATCAGCCAGGTCACTTCAGAACCAAATCAAAGTCTTCAGC 4489 Query 4513 AAAAGGGTTCAACAAACATGTCGGGCAAAAATGATCATACTAGTAGTACTCTCACACAAG 4572 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct 4490 AAAAGGGTTCAACAAACATGTTGGGCAAAAATGATCATGCTAGTAGTACTCTCACCCAAG 4549 Query 4573 CTAGACTTGGAGTCTCTAGGATCTACAAGCTTATCCGTGGAAACAGGGTTTCTCGAAACA 4632 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4550 CTAGACTTGGAGTCTCTAGGATCTACAAGCTTATCCGTGGAAACCGGGTTTCTCGAAACA 4609 Query 4633 AATTTATGACTTCAATTGTTCGCAAGTTTGATAATCCAACCTGGAGTGGCTCAGTAATAT 4692 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4610 AATTTATGACTTCGATTGTTCGCAAGTTTGATAATCCAACCTGGAATGGCTCAGTAATAT 4669 Query 4693 CCTTTCTGAAGTATTGCACTGAAACCCTTGCTTTACTTCCATTCACATCACCTGATGAGC 4752 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4670 CGTTTCTGAAGTATTGCACTGAAACCCTTGCTTTACTTCCATTCACATCACCTGATGAAC 4729 Query 4753 CACTCTATCTTGTATATTCCATAAACCGAGTTATGCAAATTCGGGCTGGTGCAGTTGAGT 4812 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 4730 CACTCTATCTTGTATATTCCATAAACCGAGTTATGCAGATTCGGGCTGGAGCAGTTGAGT 4789 Query 4813 CAAATTTGAAGGCTTTGTTACATAAAGAGTCCGCAAAGACTCAGCATGGAAATGGAACGT 4872 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 4790 CAAATTTGAAGGCTTTGTTACATAAAGATTCCGCAAAGACTCAGCATGGAAATGGAGCAT 4849 Query 4873 ACCAACAAGGTCCGATTCCCGGACATATGCACATGATGGATCTAAACACAAGAATCCAAG 4932 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4850 ACCAACAAGATCCGATTCCCGGACATATGAACATGATGGATCTAAACACAAGAATCCAAG 4909 Query 4933 AAGAACCAACACATTGGAATTCCTATGCCCATCCAACTCCAATTGACCTCAATGGAGCAG 4992 ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct 4910 AAGAACCAAGACATTGGAATTCCTATGGCCATGCAACTCTAATTGACCTCAATGGATCAG 4969 Query 4993 TATACCAAGATTCAAGGGATCAGTTCACTTCATATCAAGTCCATAATGGGAAAGCAGATG 5052 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4970 TATACCAAGATTCAAGGGATCAGTTCACTTCATATCAAGTCCATAATGGGAAAGCAGATG 5029 Query 5053 TTCACAAAATGACCTCATCTGATCCTCCTGAATTATCTACCGATGATCTGCAGAAAATTA 5112 | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 5030 TGCACAAGATGACCTCATCTGATCCTCCTGAATTATCCACTGATGATCTGCAGAAAATTC 5089 Query 5113 AGGTTGATTGCGCAGCAGCTATAGCTATACAACTTCTTTTGAAGCTCAAGAGATACTTAA 5172 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 5090 AGGTTGATTGCTTAGCAGCTATAGCTATACAACTTCTTTTGAAGCTCAAGAGATACCTAA 5149 Query 5173 AAGTCACATATAGCTTAAATGATGACCGGTGCCAAGCCTATTCTCCAACGGAACCATTGA 5232 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5150 AAGTCACGTACAGCTTAAATGATGACCGGTGCCAAGCCTATTCTCCAACGGAACCATTGA 5209 Query 5233 AGCCAGGAGATCCTCTGTCCAGACAAAGTGTTGCCTTTGACCTCAGTGAAACTCGCACTG 5292 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5210 AGCCAGGAGATCCTCTCTCCAGACAAAGCGTTGCCTTTGACCTCAGCGAAACTCGCACTG 5269 Query 5293 ACTTACCTTCAACATATCCAGACTTAGTTCAGAGATATCAGGAGTTTAAGAACGCAATGA 5352 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5270 ACTTACCTTCAACATATCAAGACTTAGTTCAGAGATATCAGGAGTTTAAGAACGCAATGA 5329 Query 5353 GAGAAGATACGGTTGACTTCACCATCTATTCATCAAACGTCAAGAGAAAACGCCCAACGC 5412 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5330 GAGAAGATACGGTTGACTTCACCATCTATTCAACAAACGTCAAGAGAAAACGCCCAACGC 5389 Query 5413 CAAGAAAAACTTCAAGATCAGCTAAAAAACCAGTGGCCTACAACGAAgatgatgatgatg 5472 |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5390 CAAGGAAAACTTCAAGATCTGCTAAAAAAACAGTGGCCTACAACGAAGATGATGATGATG 5449 Query 5473 acgacgatgatgaCAGAGGATGGCATGGAGGAGGAGGAAGAGGAGCTGCTCGGAGACTGA 5532 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 5450 ACGACAATGATGACAGAGGATGGCATGGAGGAGGAGGAAGAGGAGCTGCTCGGAGACTAA 5509 Query 5533 ATTACAGCACCAGAAGTAGCAACAGAAGGTAA 5564 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5510 ATTACAGCACCAGAAGTAGCAACAGAAGGTAA 5541 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 278777702251 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5