BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg941041

Length=5584
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT5G15540.1 | Symbols: EMB2773, ATSCC2, SCC2 | PHD finger famil...  9304    0.0  


> AT5G15540.1 | Symbols: EMB2773, ATSCC2, SCC2 | PHD finger family 
protein | chr5:5047887-5057411 REVERSE LENGTH=5541
Length=5541

 Score = 9304 bits (5038),  Expect = 0.0
 Identities = 5384/5552 (97%), Gaps = 19/5552 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  21    ATGAGCAATCCAAGCAGTTCCGGCTGGGGTTCAAGTTCGA-GTTTGACTCAGTTCGGGAT  79
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||
Sbjct  1     ATGAGCAATCCAAGCAGTTCCGGCTTGGGTTCAAGTTC-AGGTTTGACTCATTTCGGGAT  59

Query  80    CGGTTTGGCTAATACTGTGCAGTCGGAGGTTGCTCCTTACTTGCCGCTACCGTCGTTACC  139
             |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  60    CGGTTTGGCTAATACTGTTCAGTCGGAAGTTACTCCTTACTTGCCGCTACCGTCGTTACC  119

Query  140   TATATTCTGTGGTGCGGCGGAACCTGGAGAGTTCAAGCTGTTCGATGAGGTTGGCGAAGG  199
             ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct  120   TATATTCTGCGGTGCGGCCGAACCTGGAGAGTTCAAGTTGTTCGATGAGGTTGGCCAAGG  179

Query  200   TAGTAGCTACAGGTCGTTGGATCGCAGTGAGATTCTAGCGCAATCTAGTAGAATCGCAAA  259
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   TAGTGGCTACAGGTCGTTGGATCGCAGTGAGATTCTCGCGCAATCTAGTAGAATCGCAAA  239

Query  260   CATGCTTCAAGAGACTGACGTTTCTTACCTGGATCTTAGAAACGTGGCTAGGGCGCCCGA  319
              |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  240   TATGCTTCATGAGACTGACGTTTCTTACCTGGATCTTAGAAACGAGGCTAGGGCGCCCGA  299

Query  320   TTGTAATTCTGGGGAGCATTTTCAGTTATATGACCAAGTTCTACGATGCAATCCTGGAGC  379
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300   TTGTAATTCTGGGGAGCATTTTCAGTTATATGACCTAGTTCTACGATGCAATCCTGGAGC  359

Query  380   ATTTGAGTATGTTACCCCTGGTCCGACCTGCGATCCAGTCTTTACCAATGAAGTGCCTCA  439
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct  360   ATTTGAGTATGTTACCCCCGGTCCGACCTGCGATCCACTCTTTACCAATGAAGGGCCTCA  419

Query  440   AAAGATAATTTCTGAGCCAAGTGTTCCTGTCAAGATGCATCGACAGACGGATAATCATTT  499
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct  420   AAAGATAATTTCTGAACCAAGTGTTCCTGTCAAGATGCAGCGACAGACGGATACTCATTT  479

Query  500   AGCTAGGAGTATCGAACCTGAACCTGTGAAAAGGGTATTACGATCAAATCATGTTGAAGA  559
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||
Sbjct  480   AGCTAGGAGTATCGAACCTGAACCTGTGAAAAGGGTATTACGACCAAATCATGTT---GA  536

Query  560   AGATCATAGTTGGCAGCACGAAACTCTGACAAACCAGTCACCGAATGATGGTACTGCATA  619
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |
Sbjct  537   AGATCATAGTTGGCAGCACGAAACTCTGACAAACCAGTCACCGAAAGATGTTACTGC--A  594

Query  620   TCATGACTCTCGGCCTGAAACGATCACCATGAATGAAATTTCTGCTTCCAAAAAGCCAAA  679
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  595   T-ATGACTCTCGGCCTGAAACGATCACCATGAATGAACTTTCTGCTTCCAAAAAGCCAAA  653

Query  680   GGGAAAGAAGAAACGTAAAGATGACTTGTCTTCAGTTCAACCAGATCCATCTGTGCTGCA  739
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654   GGGAAAGAAGAAACGTAAAGATGACTTGTCATCAGTTCAACCAGATCCATCTGTGCTGCA  713

Query  740   AGAGTCCATCGTA-AATAGCTTTTGTGAGATGTTGGAGGACTTCTGTGGCAGAGCTGAAG  798
             ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714   AGAGTCCATCGTACAA-AACTTTTGTGAGATGTTGGAGGACTTCTGTGGCAGAGCTGAAG  772

Query  799   TCCCTGGTGATGATAGGGATGAAACAGAGTGGTCATCAGTTCCTGTTGATGAAGTTCGTG  858
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct  773   TCCCTGGTGATGATAGGGATGAAGCAGAGTGGTCATCAGTGCCCGTTGATGAAGTTCGTG  832

Query  859   TTCTTGTAAATGAATTGATGACTATACGGTCAAAAATGCTTCTGCATATGGTACCTGTTG  918
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  833   TTCTTATAAATGAATTGATGACTATACGGTCAAAAATGCTTCTGCATATGGTACCTGTTG  892

Query  919   ATATTCTATCGAGGTTATTGCGCACTCTGGATCATCAGATACACAGGGCAGAAGGCTTGT  978
             |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893   ATATTCTATCAAGGTTACTGCGCACTCTGGATCATCAGATACACAGGGCAGAAGGCTTGT  952

Query  979   CCATTTATAGTGAACATTCAGATTCAGATTCAGTTTTGTTGGTTCTTGGTGCCCTTGAGT  1038
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953   CCATTTATAGTGAACATTCAGATTCAGATTCAGTGTTGTTGGTTCTTGGTGCCCTTGAGT  1012

Query  1039  CAATTCATGCATCGCTAGCAGTGATGGCCAACAGTGATTTGCCAAAGCAGCTCTACAAGG  1098
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1013  CAATCCATGCATCGCTAGCAGTGATGGCCAACAGTGATATGCCAAAGCAGCTCTACAAGG  1072

Query  1099  AGGAGATAATTGAGAGAATTCTGGAGTTTTCTAGGCACCAAATGATGGCTGTTATGTCTG  1158
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1073  AGGAGATAATTGAGAGAATTCTGGAGTTTTCTAGGCACCAAATGATGGCTGTTATGTCTG  1132

Query  1159  CTTATGATCCATCATACCGCACTGGAAGTAAACCGGCAGAAAATGTGGCATTTGAAGGTG  1218
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1133  CTTATGATCCATCATACCGCACTGGAAGTAAACCGGCAGAAAATTTGGCATTTGAAGGTG  1192

Query  1219  ATGATGATGATG---ATCCTGATCATGACATGGGCTCAGCCAGCAAAAGGCGGCGCATAG  1275
             ||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1193  ATGATGATGATGATAATCCAGATCATGACATGGGGTCAGCCAGCAAAAGGCGGCGCATAG  1252

Query  1276  GAAAAAGCGGCAAAGTAAAGAAGTCGTCAGTGAACAGGATCTCTGGAGCAGTGAATACTG  1335
              ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1253  TAAAAAACAGCAAAGTAAAGAAGGCGTCAGTAAACAGGATCTCTGGAGCAGTAAATACTG  1312

Query  1336  CACTACAGAAACTTTGCACAATTCTTGGCTTACTCAAGGACCTGTTGTTGGTAGAAAGGT  1395
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1313  CACTACAGAAACTTTGCACTATTCTTGGCTTACTCAAGGACCTGTTGTTGGTAGAAAGGT  1372

Query  1396  TGTCTGACAGTTGCATTTTACAACTGCTGAAGACAAGTATTACAACATTTCTGGTGGAAA  1455
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1373  TGTCTGACAGTTGCATTTTACAACTGTTGAAGACAAGTATTACAACATTTCTAGTGGAAA  1432

Query  1456  ATATCCAACTTCTGCAACTTAAAGCAATTAGCTTAATCGGTGGTATTTATAATTCATATT  1515
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1433  ATATCCAAATTCTGCAACTTAAAGCAATTAGCTTAATCGGTGGTATTTATAATTCATATT  1492

Query  1516  CTCAACACCGAACATATGTGATAGATGAAATATCTCAATTGCTCTGGAAGTTACCTTCCT  1575
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1493  CTCAACACCGAACATATGTGATAGATGAAATATCTCAATTGCTCTGGAAGTTACCTTCCT  1552

Query  1576  CGAAACGAGCATTGAGAGCGTATCTTCTCCCTGATGAAGAACAGAGGCAGATTCAAATGG  1635
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1553  CGAAACGAGCATTGAGAGCGTATCTTCTCCCTGATGAAGAACAGAGGCAGATTCAAATGG  1612

Query  1636  TCACTGCTTTGCTCATTCAGTTGGTTCACAACAGCACAAACCTTCCTGAAACCTCAAGAC  1695
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct  1613  TCACTGCTTTGCTCATTCAGTTGGTTCACAACAGCACAAGCCTTCCTGAAACCTCGAGAC  1672

Query  1696  AGGCTTCCAGTGGAAACTCTATACTGGAGACCCCAGTTGATGTTGGCTACCTTACTAAGT  1755
             ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1673  AGGCTGCCAGTGGAAACTCTATACTAGAGACCTCAGTTGATGTTGGCTACCTTACTAAGT  1732

Query  1756  GTCATGAAGCTGCTACAGAAACATGTTGCCTCTTCTGGACTCGTGTCCTTGAACGATTTA  1815
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1733  GTCATGAAGCGGCTACAGAAACATGTTGCCTCTTCTGGACTCGTGTCCTTGAACGATTTA  1792

Query  1816  CCAGTTTTAAGGGTCAGGATGCTTCTGAGATAAAATTGATTATTGAGAATCTTGTTATGG  1875
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1793  CCAGTTTTAAGGGTCAGGACGCTTCTGAGATAAAATTGATTATTGAGAATCTTGTTATGG  1852

Query  1876  ACTTACTGACAGCATTAAATCTTCCTGAATATCCGTCTGTGTCTCCTATTCTTGAGGTTC  1935
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1853  ACTTACTGACAGCATTAAATCTTCCTGAATATCCGTCTGTGTCTCCTATTCTTGAGGTTC  1912

Query  1936  TCTGTGTCATACTGCTACATAATGCAGGGTTGAAATCAAAAGATGTCTCTGCTCGAATAA  1995
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1913  TCTGTGTCATACTGCTACATAATGCAGGGTTGAAATCAAAAGATGTCTCTGCTCGAATAA  1972

Query  1996  TGGCCATTGACTTGCTAGGTACAATAGCTGCAAGGTTGAAACGTGATGCTGTCCTCTGCA  2055
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1973  TGGCCATTGAGTTGCTAGGTACAATAGCTGCAAGGTTGAAACGTGATGCTGTCCTCTGCA  2032

Query  2056  GTAAAGACAGATTCTGGACGTTACTAGAGTCAGATAGTGAAATTAACGTTGATCAAGTTT  2115
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2033  GTAAAGACAGATTCTGGACGTTACTAGAGTCAGATAGTGAAATTAGCGTTGATCAAGTTT  2092

Query  2116  GCACAAAAGATTGCACTATTT-GTTTAGGTAAAAGGGCTGGGAACTTATTGGTCTGTCAA  2174
             |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2093  GCACAAAAGATTGCAC-ATTTTGTTTAGGTAAAAGGGCTGGGAACTTATTGGTCTGTCAA  2151

Query  2175  ATTTGTCAAAGGCGGTTTCATGGTGACTGTTTGGGTTTAAAGGAACTAGACATTCCAAGT  2234
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2152  ATTTGTCAAAGGCGGTTTCATGGTGACTGTTTGGGTTTAAAGGAACTAGACATTTCAAGT  2211

Query  2235  CGGAATTGGCACTGTCCGTTTTGTGTATGCAAGAGGAAACTTCTTGTACTACAGTCTTAC  2294
             || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2212  CGAAATTGGCACTGTCCGCTTTGTGTATGCAAGAGGCAACTTCTTGTACTACAGTCTTAT  2271

Query  2295  TGCAAGACGGACACCAAGGGTACTGGTAAGTTGGAATCAGAAGAAAGCATCGAAAATCCA  2354
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2272  TGCAAGACTGACACCAAGGGTACTGGTAAGTTGGAATCAGAAGAAAGCATCGAAAATCCA  2331

Query  2355  AGTATGATTACAAAGACCGAAGTTGTGCAACAGATGCTCTTGAATTACCTTCAGGATGCA  2414
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2332  AGTATGATTACAAAGACCGAAGTTGTGCAACAGATGCTCTTGAATTACCTTCAGGATGTA  2391

Query  2415  GGATCTA-CTGATGATGTGCATACTTTCATTTGCTGGTTTTATCTGTGCCTTTGGTATAA  2473
             ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2392  GGATC-AGCTGATGATGTGCATACTTTCATTTGCTGGTTTTATCTGTGCCTTTGGTATAA  2450

Query  2474  AGATGTCCCAAAATCTCAGGATAAATTCAAATATTACATTGCCAGACTGAAAGCAAAGTC  2533
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2451  AGATGTCCCAAAATCTCAGAATAAATTCAAATATTACATTGCCAGACTGAAAGCAAAGTC  2510

Query  2534  AATAATCCGTAACTCTGGAGCAACTACTTCGTTCTTGACAAGAGATGCTATCAAGAAGAT  2593
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2511  AATAATCCGTAACTCTGGAGCAACTACTTCGTTCTTGACAAGAGATGCTATCAAGCAGAT  2570

Query  2594  TACTTTAGCCCTTGGAATGAATAGTTCCTTTTCCAGAGGATTTGATAAGATTCTAAACAT  2653
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2571  TACTTTAGCCCTTGGAATGAATAGTTCCTTTTCCAGAGGATTTGATAAGATTCTGAACAT  2630

Query  2654  GCTCCTGGCTAGTTTAAGAGAGAACGCTCCCAACATTAGGGCCAAAGCTTTGCGAGCAGT  2713
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2631  GCTCCTGGCTAGTTTAAGAGAGAACGCTCCCAACATTAGGGCTAAAGCTTTGCGAGCAGT  2690

Query  2714  TAGTATAATTGTTGAAGCTGATCCAGAGGTACTGTGTGATAAACGTGTTCAGTTGGCTGT  2773
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2691  TAGTATAATTGTTGAAGCTGATCCAGAGGTACTGTGTGATAAGCGTGTTCAGTTGGCTGT  2750

Query  2774  TGAGGGAAGGTTTTGTGATTCTGCAATATCTGTTAGAGAAGCAGCACTGGAACTTGTTGG  2833
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2751  TGAGGGAAGGTTTTGTGATTCTGCAATATCTGTTAGAGAAGCAGCACTGGAACTTGTTGG  2810

Query  2834  TAGGCATATTGCATCACATCCTGATGTTGGTATAAAGTATTTTGAGAAGGTCGCTGAGAG  2893
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2811  TAGGCATATTGCATCACATCCTGATGTTGGTATAAAGTACTTTGAGAAGGTCGCTGAGAG  2870

Query  2894  GATTAAGGATACTGGAGTGAGTGTTCGAAAACGAGCCATCAAGATAATACGTGACATGTG  2953
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2871  GATTAAGGATACTGGAGTGAGTGTTCGAAAACGAGCCATCAAGATAATACGTGACATGTG  2930

Query  2954  TACTTCCAATCCCAACTTCTCTGAATTCACAAGTGCGTGCGCTGAGATATTATCTCGTAT  3013
             |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2931  TACTTCAAATCCCAACTTCTCTGAATTTACAAGTGCGTGCGCTGAGATATTATCTCGTAT  2990

Query  3014  CAGTGATGATGAGTCTAGCGTTCAGGATCTTGTGTGCAAAACTTTCTATGAATTTTGGTT  3073
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2991  CAGTGATGATGAGTCTAGTGTTCAGGATCTTGTGTGCAAAACTTTCTATGAATTTTGGTT  3050

Query  3074  TGAGGAACCTCCAGGGCATCATACTCAGTTTGCTAGTGACGCTAGCTCCATTCCACTGGA  3133
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3051  TGAGGAACCTCCAGGGCATCATACTCAGTTTGCTAGTGATGCTAGCTCCATTCCACTGGA  3110

Query  3134  ACTGGAAAAGAAAACCAAGCAAATGGTTGGGTTGTTAAGCAGGACCTCAAATCAACAGCT  3193
             |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3111  ACTGGAGAAGAAAACCAAGCAAATGGTAGGGTTGTTAAGCAGGACCCCAAATCAACAGCT  3170

Query  3194  TCTTGTAACAATTATTAAGCGTGCCCTGGCCCTGGAtttttttCCTCAAGCAGCTAAAGC  3253
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3171  GCTTGTAACAATTATTAAGCGTGCCCTGGCCCTGGATTTTTTTCCTCAAGCAGCTAAAGC  3230

Query  3254  TGCTGGTATTAACCCAGTTGCTCTTGCATCAGTACGCAGGCGCTGCGAGCTGATGTGCAA  3313
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3231  TGCTGGTATTAACCCAGTTGCTCTTGCATCAGTACGCAGGCGCTGCGAGCTGATGTGCAA  3290

Query  3314  GTGCTTACTGGAAAAAATATTACAGGTAGAAGAAATGAGCCGTGAAGAAGGAGAGTTGCA  3373
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3291  GTGCTTACTGGAAAAAATATTACAGGTAGAAGAAATGAGCCGTGAAGAAGGAGAGGTGCA  3350

Query  3374  AGTACTTCCTTATGTACTTGTTTTACATGCTTTCTGTCTGGTGGATCCTGGGCTGTGTAC  3433
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3351  AGTACTTCCTTATGTACTTGTTTTGCATGCTTTCTGTCTGGTGGATCCTGGGCTGTGTAC  3410

Query  3434  ACCGGCTTCAGACCCTACTAAATTTGTCATCACCTTACAGCCATATCTGAAGAGTCAGGC  3493
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3411  ACCGGCTTCAGACCCTACTAAGTTTGTCATCACCCTACAGCCATATCTGAAGAGTCAGGC  3470

Query  3494  TGATAGTAGAACAGGAGCACAGTTACTAGAGAGTATTATTTTCATTATCGATTCTGTCCT  3553
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3471  TGATAGTAGAACAGGAGCACAGTTACTGGAGAGTATTATTTTCATTATCGATTCTGTCCT  3530

Query  3554  ACCATTGATCCGGAAGCTGCCTCTAAGTGTCACAGAAGATCTGGAACAAGATCTAAAGCA  3613
             ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3531  ACCCTTGATCCGCAAGCTGCCTCTAAGTGTCACAGAAGATCTGGAACAGGATCTAAAGCA  3590

Query  3614  TATGATTGTTCGGCATTCATTTCTAACTGTTGTTCATGCTTGCGTTAGGTGTCTTTGTTC  3673
             |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3591  TATGATTGTTCGGCATTCGTTTCTAACTGTTGTGCATGCTTGCGTTAGGTGTCTTTGTTC  3650

Query  3674  TGTGAGTAAATTGGCGGGGAAAGGTGTTAGCATAGTTGAGCATCTTCTTCAGTTCTTTTT  3733
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3651  TGTGAGTAAATTGGCGGGGAAAGGTGTTAGCATAGTTGAGCATCTTCTTCAGTTCTTTTT  3710

Query  3734  TAAGCGGCTGGAGGCCCAAGGTTCCGATAACACACAGATTGCTGGGCGGTCCCTTTTTTG  3793
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3711  TAAGCGGCTGGAGGCCCAAGGTTCCGATAACACACAGATTGCTGGGCGGTCCCTTTTTTG  3770

Query  3794  TCTTGGCTTGCTTATTCGCCATGGAAATTCTCTTATTAGCACCTCAGGTGGCAAGAATTT  3853
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3771  TCTTGGCTTGCTTATTCGCCATGGAAACTCTCTTATTAGTACCTCAGGTGGCAAGAATTT  3830

Query  3854  CAATCTCTCTGGCTGTCTCAATTTGTTTAAACGACATCTCCGAACGGAAGATATTGCTTT  3913
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3831  CAATCTCTCTGGCTGTCTTAATTTGTTTAAACGACATCTCCGAACGGAAGATATTGCTTT  3890

Query  3914  GAAAGTCAGGTCGCTGCAGGCTTTAGGATTCATCCTAATTGCACGACCTGAGTACATGTT  3973
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3891  GAAAGTCAGGTCGCTGCAGGCTTTAGGATTCATCCTAATTGCACGACCTGAGTACATGTT  3950

Query  3974  GGAAGAAGACATTGGAAAGATAATCGAGACTACATTAGCAGATGAAGCAAATGGGCGTAT  4033
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3951  GGAAGAAGACATTGGAAAGATAATCGAGACTACATTAGCAGATGAAGCAAATGGGCGTAT  4010

Query  4034  GAAGATGCAAGCATTACAAAACATCTATGAATACCTTCTTGATGCGGAAAAACAATTGGG  4093
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4011  GAAGATGCAAGCATTACAAAACATGTATGAATACCTTCTTGATGCGGAAAAACAATTGGG  4070

Query  4094  ATCCGAGAAAGCCAGTGATAACGTGGTTAACCCAATTGAGCAAGGTGGCCATACTGTACC  4153
             ||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct  4071  ATCAGAGAAAGCCAGTGATAACACGGTTAACTCAGTTGAACAAGGTGGCCATAATGTACC  4130

Query  4154  TGTGGCCGCTGGTGCAGGTGACACCAACATTTGCGGAGGCATTGTGCAGTTGTATTGGGA  4213
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  4131  TGTGGCCGCTGGTGCAGGTGACACCAACATTTGCGGAGGCATTGTGCAGTTGTTTTGGGA  4190

Query  4214  TAAGATATTAGGTAGATGCTTAGACTTCGATGATCAAATTCGCCAGAC-TGCTCTCAAGA  4272
             ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct  4191  TAAAATATTAGGTAGATGCTTGGACTTTGATGATCAAATTCGCCAGACCT-CTCTCAAGA  4249

Query  4273  TAGTGGAAGTTGTACTACGTCAAGGCCTAGTTCATCCTATTACGTGTGTCCCTTATTTGA  4332
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  4250  TAGTGGAAGTTGTACTACGTCAAGGCCTAGTGCATCCTATTACGTGTGTTCCTTATTTGA  4309

Query  4333  TTGCCCTCGAGACGGATCCTCAAGAGGCCAACCAAAAGCTGGCCCATCATTTACTAATGA  4392
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4310  TTGCCCTCGAGACAGATCCTCAAGAGGCCAACCAAAAGCTGGCCCATCATTTACTAATGA  4369

Query  4393  ATATGCATGAGAAATATCCGGCtttttttGAGAGCCGTCTCGGTGACGGACTTCAAATGT  4452
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  4370  ATATGCATGAGAAGTATCCGGCTTTTTTTGAGAGCCGTCTTGGTGACGGACTTCAAATGT  4429

Query  4453  CGTTTATCTTCATGCAATCCATCAGCCAGGTCACTTCAGAACCAAATCAAAGTCTTCAGC  4512
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4430  CGTTTATCTTCATGCAATCCATCAGCCAGGTCACTTCAGAACCAAATCAAAGTCTTCAGC  4489

Query  4513  AAAAGGGTTCAACAAACATGTCGGGCAAAAATGATCATACTAGTAGTACTCTCACACAAG  4572
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct  4490  AAAAGGGTTCAACAAACATGTTGGGCAAAAATGATCATGCTAGTAGTACTCTCACCCAAG  4549

Query  4573  CTAGACTTGGAGTCTCTAGGATCTACAAGCTTATCCGTGGAAACAGGGTTTCTCGAAACA  4632
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  4550  CTAGACTTGGAGTCTCTAGGATCTACAAGCTTATCCGTGGAAACCGGGTTTCTCGAAACA  4609

Query  4633  AATTTATGACTTCAATTGTTCGCAAGTTTGATAATCCAACCTGGAGTGGCTCAGTAATAT  4692
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  4610  AATTTATGACTTCGATTGTTCGCAAGTTTGATAATCCAACCTGGAATGGCTCAGTAATAT  4669

Query  4693  CCTTTCTGAAGTATTGCACTGAAACCCTTGCTTTACTTCCATTCACATCACCTGATGAGC  4752
             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4670  CGTTTCTGAAGTATTGCACTGAAACCCTTGCTTTACTTCCATTCACATCACCTGATGAAC  4729

Query  4753  CACTCTATCTTGTATATTCCATAAACCGAGTTATGCAAATTCGGGCTGGTGCAGTTGAGT  4812
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  4730  CACTCTATCTTGTATATTCCATAAACCGAGTTATGCAGATTCGGGCTGGAGCAGTTGAGT  4789

Query  4813  CAAATTTGAAGGCTTTGTTACATAAAGAGTCCGCAAAGACTCAGCATGGAAATGGAACGT  4872
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct  4790  CAAATTTGAAGGCTTTGTTACATAAAGATTCCGCAAAGACTCAGCATGGAAATGGAGCAT  4849

Query  4873  ACCAACAAGGTCCGATTCCCGGACATATGCACATGATGGATCTAAACACAAGAATCCAAG  4932
             ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4850  ACCAACAAGATCCGATTCCCGGACATATGAACATGATGGATCTAAACACAAGAATCCAAG  4909

Query  4933  AAGAACCAACACATTGGAATTCCTATGCCCATCCAACTCCAATTGACCTCAATGGAGCAG  4992
             ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct  4910  AAGAACCAAGACATTGGAATTCCTATGGCCATGCAACTCTAATTGACCTCAATGGATCAG  4969

Query  4993  TATACCAAGATTCAAGGGATCAGTTCACTTCATATCAAGTCCATAATGGGAAAGCAGATG  5052
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4970  TATACCAAGATTCAAGGGATCAGTTCACTTCATATCAAGTCCATAATGGGAAAGCAGATG  5029

Query  5053  TTCACAAAATGACCTCATCTGATCCTCCTGAATTATCTACCGATGATCTGCAGAAAATTA  5112
             | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| 
Sbjct  5030  TGCACAAGATGACCTCATCTGATCCTCCTGAATTATCCACTGATGATCTGCAGAAAATTC  5089

Query  5113  AGGTTGATTGCGCAGCAGCTATAGCTATACAACTTCTTTTGAAGCTCAAGAGATACTTAA  5172
             |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  5090  AGGTTGATTGCTTAGCAGCTATAGCTATACAACTTCTTTTGAAGCTCAAGAGATACCTAA  5149

Query  5173  AAGTCACATATAGCTTAAATGATGACCGGTGCCAAGCCTATTCTCCAACGGAACCATTGA  5232
             ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5150  AAGTCACGTACAGCTTAAATGATGACCGGTGCCAAGCCTATTCTCCAACGGAACCATTGA  5209

Query  5233  AGCCAGGAGATCCTCTGTCCAGACAAAGTGTTGCCTTTGACCTCAGTGAAACTCGCACTG  5292
             |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  5210  AGCCAGGAGATCCTCTCTCCAGACAAAGCGTTGCCTTTGACCTCAGCGAAACTCGCACTG  5269

Query  5293  ACTTACCTTCAACATATCCAGACTTAGTTCAGAGATATCAGGAGTTTAAGAACGCAATGA  5352
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5270  ACTTACCTTCAACATATCAAGACTTAGTTCAGAGATATCAGGAGTTTAAGAACGCAATGA  5329

Query  5353  GAGAAGATACGGTTGACTTCACCATCTATTCATCAAACGTCAAGAGAAAACGCCCAACGC  5412
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5330  GAGAAGATACGGTTGACTTCACCATCTATTCAACAAACGTCAAGAGAAAACGCCCAACGC  5389

Query  5413  CAAGAAAAACTTCAAGATCAGCTAAAAAACCAGTGGCCTACAACGAAgatgatgatgatg  5472
             |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5390  CAAGGAAAACTTCAAGATCTGCTAAAAAAACAGTGGCCTACAACGAAGATGATGATGATG  5449

Query  5473  acgacgatgatgaCAGAGGATGGCATGGAGGAGGAGGAAGAGGAGCTGCTCGGAGACTGA  5532
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  5450  ACGACAATGATGACAGAGGATGGCATGGAGGAGGAGGAAGAGGAGCTGCTCGGAGACTAA  5509

Query  5533  ATTACAGCACCAGAAGTAGCAACAGAAGGTAA  5564
             ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5510  ATTACAGCACCAGAAGTAGCAACAGAAGGTAA  5541



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 278777702251


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5