BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg942891
Length=3271
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G10710.1 | Symbols: SPT16 | global transcription factor C | ... 5373 0.0
AT4G10670.1 | Symbols: GTC2 | GTC2 | chr4:6584727-6586262 FORWA... 1823 0.0
> AT4G10710.1 | Symbols: SPT16 | global transcription factor C
| chr4:6601989-6606354 REVERSE LENGTH=3639
Length=3639
Score = 5373 bits (2909), Expect = 0.0
Identities = 3154/3273 (96%), Gaps = 13/3273 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTTGCTTCTGGATTCTTTAGATGGCAGACTCTCGGAATGGTAATGCGCGAGCTCCGAGTG 60
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 158 GTTGCTGCTGGACTCTTTAGATGGCAGACTCTCGGAATGGTAATGCCCGAGCCCCTCCTA 217
Query 61 GAGGAGTGCCTCCAAAAGCTGGGAATACTTACTCCATAGATGTTAAAAATTTTATCTCAC 120
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 218 GTGGAGTGCCTCCAAAAGCTGGGAATACTTATTCCATAGATGTTAAAAACTTTATCTCAC 277
Query 121 GTGCAAGAGCTTTGTATGAGCACTGGAAGAAGCACAGTGCAGACTTATGGGGATCTGCAG 180
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 278 GTGCAAGAGCATTGTATGAACACTGGAAGAAGCACAGTGCAGACTTATGGGGATCTGCCG 337
Query 181 ACGCTCTTGCCATTGCTACACCTCCTGCTTCTGATGATCTGCGCTACCTGAAATCGTCAG 240
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 338 ACGCTCTTGCCATTGCTACCCCTCCTGCTTCTGATGATCTGCGTTACCTGAAATCTTCAG 397
Query 241 CGCTGAATATTTGGCTTCTTGGGTATGAGTTTCCAGATACGATAATGGTTTTTACTTC-A 299
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |
Sbjct 398 CGTTGAATATTTGGCTTCTTGGGTATGAGTTTCCAGATACAATTATGGTTTTTAC--CAA 455
Query 300 -AAGCAGATCCATTTCCTGTGTAGTAGGAACAAGGCATCTCTGCTTGAAGTTGTGAAGAA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 456 GAAGCAGATCCATTTCCTGTGTAGTAGGAACAAGGCTTCTCTACTTGAAGTTGTGAAAAA 515
Query 359 AGCTGCACATGATGAGTTGAAGGTTGATGTTATTATGCATGTTAAGCCTAAGGGTGATGA 418
| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 ACCTGCACATGATGAGTTGAAGCTTGATGTTATCATGCATGTTAAGCCTAAGGGTGATGA 575
Query 419 TGGAACAGGGCTGATGGATGCCATATTTC-TAGCCATTCGAGATCTATCCCGGGGTGATG 477
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 576 TGGAACAGGGCTGATGGATGCCATATTTCGT-GCCATCCGTGATCTATCCCGGGGTGATG 634
Query 478 GAAATGATTCACAAGTTGTAGGACACATTGCTCGTGAAGCCCCTGAAGGTAAGCTTCTGG 537
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 GAAATGATTCACAAGTTGTTGGACACATTGCTCGTGAAGCCCCTGAAGGTAAGCTTCTGG 694
Query 538 AGACATGGACTGAGAGGCTAAAGAATGCAAACTTCCAGTTTGTAGATATAACTGGGGGCC 597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 695 AGACATGGACTGAGAGGCTAAAGAATGCAAACTTCCAGTTCGTAGATATAACTGGGGGGC 754
Query 598 TGTCTGATCTCTTTGCTGTTAAAGACGATACTGAGGTCATGAGTGTGAAGAAAGCTGCTT 657
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 755 TGTCTGATCTATTTGCTGTTAAAGACGATACTGAGGTCATGAGTGTGAAGAAAGCTGCGT 814
Query 658 ATCTAGCCTACAGTGTGATGAAAAATGTTGTTGTTCCAAACCTTGAGAGTGCCATTGATG 717
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATCTAGCCTACAGTGTGATGAAAAATGTTGTTGTTCCAAATCTTGAGAGTGCCATTGATG 874
Query 718 AGGAGAAAGACGTCACCCACTCTGCCTTGATGGATATCACTGAGAAAGCGATACTTGAGC 777
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 AGGAGAAAGACGTCACCCACTCTGCCCTGATGGATCTCACTGAGAAAGCGATACTTGAGC 934
Query 778 CAACTAAGGCCAGTGTGAAGCTGAAGGCAGAAAATGTTGACATATGCTACCCTCCGATAT 837
||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 CAACTAAGGCCAGTGTGAAACTGAAGCCAGAGAATGTTGACATATGCTACCCTCCGATAT 994
Query 838 TTCAAAGCGGAGGCAAGTTTGATCTCAAACCAAGTGCTGCAAGCAATGATGAACTGCTCA 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 TTCAAAGCGGAGGCAAGTTTGATCTCAAACCAAGTGCTGCAAGCAATGATGAACTGCTCA 1054
Query 898 CTTATGATCCAGCGAGTATCATAATATGTGCTGTTGGTGCTCGGTATAATAGTTATTGCT 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1055 CTTATGATCCAGCGAGTATCATAATATGTGCTGTTGGTGCTAGGTATAATAGTTATTGCT 1114
Query 958 CAAATGTTGCCAGGACTTACCTAATAGATGCAACTTCTCTTCAGAGCAAGGCATATGAGG 1017
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1115 CAAATGTTGCCAGGACCTACCTAATAGATGCAACTTCTCTCCAGAGCAAGGCATATGAGG 1174
Query 1018 TTCTTCTCAAGGCACATGAGGCTGCTATTGATGCTTTGAGGTCAGGAAGAAAGATAAACA 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 TTCTTCTCAAGGCACATGAGGCTGCTATTGATGCTTTGAGGTCAGGAAGAAAGATAAACA 1234
Query 1078 CTGTATATCAAGCTGCCCTTTCCGTTGTTGAAAAGAATGCCCCTGAGTTCGTTGACAAGC 1137
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235 CTGTCTATCAAGCTGCCCTTTCTGTTGTTGAAAAGAATGCCCCTGAGTTCGTTGACAAGC 1294
Query 1138 TAACTAAATCTGCTGGGACTGGTATCGGTCTGGAATTCCGAGAGTCAGGATTAAATATAA 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 TAACTAAATCTGCTGGGACTGGTATCGGTCTGGAATTCCGAGAGTCAGGATTAAATATAA 1354
Query 1198 ATGCAAAGAATGATAAAGTATTGAGACCGAAGATGGCATTTAATGTGTCTCTTGGTTTCC 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 ATGCAAAGAATGATAAAGTATTGAGACCGAAGATGGCATTTAATGTGTCTCTTGGTTTCC 1414
Query 1258 AGAACTTGGAATGTGAGTCAGAAACCCGCAGCAAGAACAAGAAATTCTCACTTTTGCTAG 1317
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 AGAACTTGGAATGTGAGTCAGAAAGCCGCAGCAAGAACAAGAAATTCTCACTTTTGCTAG 1474
Query 1318 CTGACACAGTTCTCGTCACAGATCAGAAACCGGAGCTTTTAACGAAGTGCTCTAAATCTG 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1475 CTGACACAGTTCTCGTCACAGATCAGAAACCGGAGCTTTTAACCAAGTGCTCTAAATCTG 1534
Query 1378 TTAAGGATGTGGCTTACTCCTTCAAAGAGGATGAAGAAGAAGAGAAACCACGCAAGAAAT 1437
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1535 TTAAGGATGTGGCTTACTCCTTTAAAGAGGATGAAGAAGAAGAGAAACCGCGCAAGAAAG 1594
Query 1438 CTAGGACCAGCGGTTCTGAGAACTACATTACCAAGACAGCTCTTAGATCAGATGATCATG 1497
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 CTAGGACCAGTGGTTCTGAGAACTACATTACCAAGACAGCTCTTAGATCAGATGATCATG 1654
Query 1498 TGGTGTCGAAAGAAGAGCTACGGAAGCAGCACCAGGCAGAGCTGGCACGCCAGAAAAATG 1557
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 TGGTGTCTAAAGAAGAGCTACGGAAGCAGCACCAGGCAGAGCTGGCACGCCAGAAAAATG 1714
Query 1558 AAGAAACTGCCAGAAGGCTTGCTGGTGACAGGTCTGGGGCGGGAGACAGCCGGTCTACTG 1617
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 AAGAAACTGCCAGAAGGCTTGCTGGTGACAGTTCTGGGGCGGGAGACAGCCGGTCTACTG 1774
Query 1618 CAAAGACTTCAGCTGATGTGGTTGCCTACAAGAATGTTAACGACATGCCCCATCGGGATT 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1775 CAAAGACTTCAGCTGATGTGGTTGCCTACAAGAATGTTAACGACATGCCCCATAAGGAAT 1834
Query 1678 TGATGATCCAGGTTGATACGAGGAACGAGGCTGTATTGTTACCCATCTATGGTAGCTTGG 1737
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1835 TGATGATCCAGGTTGATACGAGAAACGAGGCTGTATTGTTACCCATCTATGGGAGCTTGG 1894
Query 1738 TTCCATTCCATGTGGCTACAATAAGAACAGTGTCAGGCAATCAAGATACCAACCGGAACT 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1895 TTCCATTCCATGTGGCTACAATAAGAACAGTGTCAGGCAATCAAGATACCAACCGAAACT 1954
Query 1798 GCTACATCCGTATCATTTTCAATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCAAACT 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1955 GCTACATCCGTATCATTTTCAATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCAAACT 2014
Query 1858 CTTTGAAAAACCAGGGTGCTATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAA 1917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 CTTTGAAAAACCAGGGTGCTATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAA 2074
Query 1918 GGCATAGCAGCGAAGTAACTCAGCAGATTAAGACCCTTAGACGGCAAGTCATGGCCCGGG 1977
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2075 GGCATAGCAGCGAAGTAACTCAACAGATTAAGACCCTTAGACGGCAAGTCATGGCCAGGG 2134
Query 1978 AGTCAGAGAGAGCTGAAAGGGCGACATTGGTGACCCAAGAGAAACTTCAGCTTGCAGGGA 2037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 AGTCAGAGAGAGCTGAAAGGGCGACATTGGTGACCCAAGAGAAACTTCAGCTTGCAGGGA 2194
Query 2038 ACAAGTTCAAACCCCTCAGGTTGTCCGAGCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCA 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 ACAAGTTCAAACCCCTCAGGTTGTCCGAGCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCA 2254
Query 2098 AGAAGATTCCTGGGACACTCGAAGCTCATGCAAATGGTTTCAGGTATTCAACTACCAGAC 2157
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2255 AGAAGATTCCTGGGACACTCGAAGCTCATGCAAATGGTTTCAGGTATTCAACTACCAGGC 2314
Query 2158 CTGACGAGCGCGTGGATGTCCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTCCAGCCTGCTG 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2315 CTGACGAGCGCGTGGATGTCCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTCCAGCCTGCTG 2374
Query 2218 AGAAGGAGATGATCACCCTCCTTCATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAACCA 2277
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2375 AGAAGGAGATGATCACCCTCCTTCATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAACTA 2434
Query 2278 AGAAGACAAAGGACGTCCAATTCTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTG 2337
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 AGAAGACAAAGGACGTTCAATTCTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTG 2494
Query 2338 GTGGGAGGAGATCAGCCTATGATCCAGATGAGATTGATGAAGAACAGCGAGAGCGCGATA 2397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||
Sbjct 2495 GTGGGAGGAGATCAGCCTATGATCCAGATGAGATTGACGAAGAACAGAGGGAGCGCGATA 2554
Query 2398 GGAAGAACAAGATCAACATGGATTTCAATCATTTTGCAAACCGGGTGAATGATATGTGGC 2457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2555 GGAAGAACAAGATCAACATGGATTTCAATCATTTTGCAAACCGGGTGAATGATATGTGGC 2614
Query 2458 AACTACCCCAGTTTGCAAGTCTGGACCTTGAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAGCTTGGTT 2517
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2615 AACTACCACAGTTTGCAAGTCTGGACCTTGAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAGCTTGGTT 2674
Query 2518 TCCATGGTGTTCCGCACAAGACATCTGCATTCATTATACCGACCTCTAGCTGCTTAGTTG 2577
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2675 TCCATGGTGTTCCGCACAAGACATCTGCATTCATAATACCGACCTCCAGCTGCTTAGTTG 2734
Query 2578 AGCTGATAGAATTCCCGTTCCTGGTGGTCAGTCTTAGTGAGATTGAGATAGTGAATCTTG 2637
|||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2735 AGCTGATAGAATACCCGTTCCTCGTGGTGAGTCTGAGTGAGATTGAGATTGTGAATCTTG 2794
Query 2638 AGAGAGTTGGGTTTGGGCAGAAGAACTTTGACATGGCCATCATCTTCAAGGACTTCAAAA 2697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2795 AGAGAGTTGGGTTTGGGCAGAAGAACTTTGACATGGCCATCATCTTCAAGGACTTCAAAA 2854
Query 2698 AAGATGTTCTCAGGGTTGACTCAGTTCCCACAAGTTCGCTAGAGGGGATAAAGGAGTGGC 2757
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2855 AAGATGTTCTCAGGGTTGACTCAGTTCCCACAAGCTCCCTAGAGGGGATAAAGGAGTGGC 2914
Query 2758 TTGACACTACAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGACAGATCC 2817
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2915 TAGACACCACAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGACAGATCC 2974
Query 2818 TGAAGACGATCACGGATGACCCACAGAGCTTTATAGATGATGGAGGATGGGAGTTTTTGA 2877
| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2975 TAAAGACGATCACAGATGATCCGCAGAGCTTTATAGATGATGGAGGATGGGAGTTTCTGA 3034
Query 2878 ATCTGGATGGAAGCGACTCAGAATCTGGAGGCTCTGAGGAGTCGGACAAAGGTTATGAAC 2937
| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3035 ACCTGGACGGAAGCGATTCAGAATCTGGCGGGTCTGAGGAGTCAGACAAAGGATATGAAC 3094
Query 2938 CGTCAGATGTGGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGATGAGGCTTCAGAGAGTGAGTCACTGG 2997
| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3095 CATCAGATGTAGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGACGAGGCTTCAGAGAGTGAGTCACTGG 3154
Query 2998 TGGAGTCCGATGATGAAGAAGAAGAAGAGGACTCAGAGCAAGAGTCGGAGGAAGAGAAAG 3057
||||||| || ||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3155 TGGAGTCAGACGATGATGAAGAAGA-G-G-ACTCAGAGCAAGAGTCAGAGGAAGAGAAAG 3211
Query 3058 GTAAGACTTGGGATGAACTGGAGAGAGAAGCTACCAATGCAGACAGAGAGCATGGAGTTG 3117
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3212 GTAAGACTTGGGATGAACTGGAGAGAGAAGCTACTAATGCAGACAGAGAGCATGGAGTTG 3271
Query 3118 AGTCTGATAGCGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGGAAGATGAAAGCGTTTGGGAAATCACGAC 3177
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3272 AGTCTGATAGCGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGAAAGATGAAAGCGTTTGGGAAATCGCGAC 3331
Query 3178 CTGGAACTAGCGGTGGAGGCGGTCGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCCAAACGCA 3237
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3332 CTGGAACTAGCGGTGGAGGTGGTAGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCTAAACGCA 3391
Query 3238 GCAAGCACAGGTGAAGAAATATAAAAAATTTCG 3270
| ||||||||||||||| | ||||| ||||
Sbjct 3392 --A-GCACAGGTGAAGAAAC-TCAAAAAGTTCG 3420
> AT4G10670.1 | Symbols: GTC2 | GTC2 | chr4:6584727-6586262 FORWARD
LENGTH=1536
Length=1536
Score = 1823 bits (987), Expect = 0.0
Identities = 1392/1581 (88%), Gaps = 54/1581 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1680 ATGATCCA-GGTTGAT-ACGAGGAACGAGGCTGTATTGTTACCCATCTATGGTAGCTTGG 1737
||||| || ||||||| || | || ||| ||||||||||||| || || || || |||
Sbjct 1 ATGAT-CACGGTTGATCAC-AAGAGCGACACTGTATTGTTACCAATATACGGCAGGATGG 58
Query 1738 TTCCATTCCATGTGGCTACAATAAGAACAGTGTCAGGCAATCAAGATACCAACCGGAACT 1797
|||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||| | | | ||| | |
Sbjct 59 TTCCATTCAACGTGACTACAATAAGAACAGTCTTAGGCAATCAA-A-A-C-ACC---A-T 110
Query 1798 GCTACATCCGTATCATTTTCAATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCAAACT 1857
| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | |||
Sbjct 111 -C--CGT--GTA--ATATTCAATGTCCCGGGTACACCCTTAAACCCT-A--A-T--GACT 157
Query 1858 CTTTGAAAAACCAGGGTGCTATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAA 1917
||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 CTTTGAAAAACAAGGACGCTATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAA 217
Query 1918 GGCATAGCAGCGAAGTAACTCAGCAGATTAAGACCCTTAGACGGCAAGTCATGGCCCGGG 1977
||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||
Sbjct 218 GGCATAGCAGCGATGTAGTTCAACAGGTTAAGAGCCTCAGACGGAAAGTCATGGCACGGG 277
Query 1978 AGTCAGAGAGAGCTGAAAGGGCGACATTGGTGACCCAAGAGAAACTTCAGCTTGCAGGGA 2037
|||||||||||||||| || | || |||||| |||||| ||||||||| ||| | |||
Sbjct 278 AGTCAGAGAGAGCTGAGAGAACTTCACTGGTGAACCAAGAAAAACTTCAGATTGTAAGGA 337
Query 2038 ACAAGTTC-AAACCCCTCAGGTTGTCCGAGCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGC 2096
|||| || |||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 338 ACAA-CTCAAAACCCTTAAGTTTGTCCAATCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGACGC 396
Query 2097 AAGAAGATTCCTGGGACACTCGAAGCTCATG-CAAATGGTTTCAGGTATTCAACTACCAG 2155
||||||| || ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| | | | |
Sbjct 397 AAGAAGAATCGTGGGACACTTGAAGCTCATGTC-AATGGTTTTAGGTATTC-A--A-C-G 450
Query 2156 ACCTGACGAGCGCGTGGATGTCCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTCCAGCCTGC 2215
||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 451 ACC-AACGAGCGCGTTGATGTCCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTTCAGCCGGC 509
Query 2216 TGAGAAGGAGATGATCACCCTCCTT-CATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAA 2274
||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 GGAGAAGGAGATGACCACCCT-CTTACATTTTCATCTCCACAACCACATCATGGTAGGAA 568
Query 2275 CCAAGAAGACAAAGGACGTCCAATTCTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAG 2334
||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 CCAAGAAAACAAAAGACGTACAGTTTTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAG 628
Query 2335 GTGGTGGGAGGAG---ATCAGCCTATGATCCAGATGAGATTGATGAAGAACAGCGAGAGC 2391
| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 629 GAGGTAGGAGGAGATCATCAGCTTATGATGCAGATGAGATTGTTGAAGAACAGAGAGAGC 688
Query 2392 GCGATAGGAAGAACAAGATCAACATGGATTTCAATCATTTTGCAAACCGGGTGAATGATA 2451
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||
Sbjct 689 GCGATAGGAAAAATAAGATCAACATGGATTTCAATCACTTTGCAAATCAGGTCAACGATA 748
Query 2452 TGTGGCAACTACCCCAGTTTGCAAGTCTGGACCTT-GAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAG 2510
|||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 TGTGGCAACTACCCCAGTTTGCAAGT-TTGAGCTTAGAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAG 807
Query 2511 CTTGGTTTCCATGGTGTTCCGCACAAGACATCTGCATTCATTATACCGACCTCTAGCTGC 2570
|||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 808 TTTGGTTTCAATGGTGTCCCCCACAAGACATCTACCTTCATAATACCGACCTCAAGCTGC 867
Query 2571 TTAGTTGAGCTGATAGAATTCCCGTTCCTGGTGGTCAGTCTTAGTGAGATTGAGATAGTG 2630
||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||
Sbjct 868 TTAGTTGAGCTGACAGAATCCCCGTTCTTGGTGGTCTGTCTAAGTGAGATTGAGATTGTG 927
Query 2631 AATCTTGAGAGAGTTGGGTTTGGGCAGAAGAACTTTGACATGGCCATCATCTTCAAGGAC 2690
||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 928 AATCTTGAGAGAGTTGGGTTTGGTCAAAAGAGCTTTGACATGGCTATCATCTTCAAGGAC 987
Query 2691 TTCAAAAAAGATGTTCTCAGGGTTGACTCAGTTCCCACAAGTTCGCTAGAGGGGATAAAG 2750
|| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 988 TTGAAGAAAGATGTTCTTAGGGTTGACTCAGTTCCAACAAGTTAGTTAGAGGGGATAAAG 1047
Query 2751 GAGTGGCTTGACACTACAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGA 2810
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 GAATGGCTTGACACTACAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGA 1107
Query 2811 CAGATCCTGAAGACGATCACGGATGACCCACAGAGCTTTATAGATGATGGAGGATGGGAG 2870
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1108 CAGATCCTGAAGACGATCACGGATGATCCGCAGAGCTTTACAGATGCTGGAGGATGGGAG 1167
Query 2871 TTTTTGAATCTGGATGGAAGCGACTCAGAATCTGGAGGCTCTGAGGAGTCGGACAAAGGT 2930
|||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1168 TTTTTGAATCAGGACGGAAGCGATTCAGAGTCTGGCGGCTCTGAGGACTCAGACAAAGGG 1227
Query 2931 TATGAACCGTCAGATGTGGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGATGAGGCTTCAGAGAGTGAG 2990
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 1228 TATGAACCATCAGATGTGGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGACGAGACATCAGAGAGTGAG 1287
Query 2991 TCACTGGTGGAGTCCGATGATGAAGAAGAAGAAGAGGACTCAGAGCAAGAGTCGGAGGAA 3050
||| | | | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1288 TCA--G----A--C-GATGA--A-GAAGAAGAAGAGGACTCAGAGCAAGAGTCAGAGGAA 1335
Query 3051 GAGAAAGGTAAGACTTGGGATGAACTGGAGAGAGAAGCTACCAATGCAGACAGAGAGCAT 3110
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1336 GAGAAAGGTAAGACTTGGGCTGAGCTGGAGAGAGAAGCTACTAATGCAGACAGAGAGCAT 1395
Query 3111 GGAGTTGAGTCTGATAGCGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGGAAGATGAAAGCGTTTGGGAAA 3170
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 GGAGTTGAGTCTGATAGTGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGGAAGATGAAAGCGTTTGGGAAA 1455
Query 3171 TCACGACCTGGAACTAGCGGTGGAGGCGGTCGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCC 3230
|| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1456 TCGCGTCCTGGAAGTAGCGGTGCAGGCGGTAGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCT 1515
Query 3231 AAACGCAGCAAGCACAGGTGA 3251
|||||||||| |||| |||||
Sbjct 1516 AAACGCAGCAGGCACCGGTGA 1536
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 162741563092
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5