BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg943476
Length=4680
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G02510.1 | Symbols: TOC159, TOC86, PPI2, TOC160, ATTOC159 | ... 6453 0.0
AT4G02482.1 | Symbols: | chloroplast outer envelope GTP-bindin... 91.6 6e-17
> AT4G02510.1 | Symbols: TOC159, TOC86, PPI2, TOC160, ATTOC159
| translocon at the outer envelope membrane of chloroplasts
159 | chr4:1104766-1109600 FORWARD LENGTH=4752
Length=4752
Score = 6453 bits (3494), Expect = 0.0
Identities = 3881/4065 (95%), Gaps = 37/4065 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 631 ATGAGGAGGAGAGTGAGTTGAGTGGAAAAGTTGATGTTGACGATAAAAGTGATAATGTTA 690
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 ATGAGGGGGAGAGTGAGTTGGGTGGAAAAGTTGATGTTGACGATAAAAGTGATAATGTTA 640
Query 691 TTGAAGAAGAGGGTGTGAAGTTAACTGATAAAGGAGACGTCATAGTGGACTCGTCCCCTG 750
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 641 TTGAAGAAGAGGGTGTGGAGTTAACTGATAAAGGAGACGTCATTGTGAACTCGTCCCCTG 700
Query 751 TAGAGTCAGTGCATGTTGATGTGGCAAAACCAGGGGTGGCTGTAGTAGGAGACGCAGAGG 810
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 701 TAGAATCAGTGCATGTTGATGTGGCAAAACCAGGGGTGGTTGTTGTAGGAGACGCAGAGG 760
Query 811 GAAGTGAGGAGTTGAAGATTAATGCTGATGCTGAAACTCTTGAAGTGGCGAATAAGTTTG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 761 GAAGTGAGGAGTTGAAGATTAATGCTGATGCTGAAACTCTTGAAGTGGCTAATAAGTTTG 820
Query 871 ATCAAATTGGGGATGATGATGGTGGTGAATTTGAACCTGTGTCTGATAAGGCCATTGAGG 930
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 821 ATCAAATTGGGGATGATGATAGTGGTGAATTTGAACCTGTGTCTGACAAGGCCATTGAGG 880
Query 931 AGGTAGAAGAAAAA--T--T---GAGT-AG--TGGA--GCAGACTCCTCTAAATTAGTAT 978
|||||||||||||| | | || | || | | |||||||||||||| |||| ||
Sbjct 881 AGGTAGAAGAAAAATTTACTAGCGAATCAGACTCTATTGCAGACTCCTCTAAGTTAGAAT 940
Query 979 CTGTGGATACCAATGCTGCAGAGCCAGAGGTCGTAGCTGCCGAGAGTGGGACTGAACCAA 1038
|||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 941 CTGTGGATACCAGTGCTGTAGAGCCAGAGGTTGTAGCTGCCGAGAGTGGGAGTGAACCAA 1000
Query 1039 AGGATGTGGAAGAAA-CTAACGGATTGGAGAAGGGTATGACTTATGCTGAGGTAATCAAG 1097
||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1001 AGGATGTGGAA-AAAGCCAACGGATTGGAGAAGGGTATGACTTATGCTGAAGTAATCAAG 1059
Query 1098 GCAGCTACTGCAGTAGCTGACAATGGAACCAAAGAGGAGGAGAGTGTGTTCAGTGGCGTA 1157
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 1060 GCAGCTAGTGCAGTAGCTGACAATGGAACCAAAGAGGAGGAGAGTGTGCTCGGTGGCATA 1119
Query 1158 GTCGATGATGAAGAAGAAGGTGTTAAGTTAACCAACAAAAGAGACTTTGTGGTGGACTCA 1217
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1120 GTCGATGATGCAGAAGAAGGTGTTAAGTTAAACAACAAAGGAGACTTTGTGGTGGACTCA 1179
Query 1218 TCTGCTATAAAAGCTGTGAATGTAGATGTGGCAAAGCCAGGGGTTGTTGTTGTTGGAGAC 1277
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 TCTGCTATTGAAGCTGTGAATGTAGATGTGGCAAAGCCAGGGGTTGTTGTTGTTGGAGAC 1239
Query 1278 GTAGAGGCAAGTGAGGTGCTGGAAACTGATGGTAAGATCACTGATGTGCATAATAAGTTT 1337
||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 GTAGAGGTGAGTGAGGTGCTGGAAACTGATGGCAACATCCCTGATGTGCATAATAAGTTT 1299
Query 1338 GATCCAGTTGGCCAAGTTGAAGGTGATGGAGTTGAACGTGAATCTGATAAAGCCACTGAG 1397
|||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1300 GATCCAATTGGCCAAGGTGAAGGTGGTGAAGTTGAACTTGAATCCGATAAAGCCACAGAG 1359
Query 1398 GAGGGAGGA-GAGAAGTTGACTAGTGAAGGAGACTCTGTGGTTGATTCATCTGTGGTGGA 1456
||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||
Sbjct 1360 GAGGGAGGAGGA-AAGTTGGTTAGTGAAGGAGACTCTATGGTTGACTCCTCTGTGGTGGA 1418
Query 1457 ATCTGTTGATGCTGATATCAATGTTGCAGAGCCAGGGGTTGTGGTTGTTGGGGCGGCGAA 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1419 CTCTGTTGATGCTGATATCAATGTTGCAGAGCCAGGGGTTGTGGTTGTCGGGGCGGCTAA 1478
Query 1517 GGAGGCTGTAATTAAGGAAGATGATGGAGATGATGAGGTTGACAAGACCATCCCAAATAT 1576
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1479 GGAGGCTGTAATTAAGGAAGATGATAAAGATGATGAGGTTGACAAGACCATCTCAAATAT 1538
Query 1577 TGAGGAACCTGATGACCTGACTGCTGCATATGATGGAAATTTTGAATTGGCTGCTAAGGA 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1539 TGAGGAACCTGATGACCTGACTGCTGCATATGATGGAAATTTTGAATTGGCTGTTAAGGA 1598
Query 1637 AATATCAGAGGCAGCCAAAGTAGAGCCTGACGAACCAAAAGTAGGTGTGGAAGTGGAAGA 1696
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1599 AATATCAGAGGCTGCCAAAGTAGAGCCAGACGAACCAAAAGTAGGTGTGGAAGTAGAAGA 1658
Query 1697 ATCGCCTGTTTCTGAAAGTTTAACAGTGGGTTCGGTTGATGCAAAAGAGGATTCAAATCC 1756
|| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1659 ATTGCCTGTTTCTGAAAGTTTAAAAGTGGGTTCAGTTGATGCAGAAGAGGATTCAATTCC 1718
Query 1757 TGCAGCTGGGTCACAGTTTGAAGCAAACCAAAACTCAGAGGTTCGGGAAGTTTTCGAAGG 1816
|||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1719 TGCAGCTGAGTCACAG-TT---------------T--GAGGTTCGGAAAGTTGTCGAAGG 1760
Query 1817 GGACAATGCTGAAGAGGGTGGAAACAAGCTCCCAGCCGAAGACATTGTTTCTTCTCGTGA 1876
||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 GGACAGTGCTGAAGAGGATGAAAACAAGCTCCCAGTCGAAGACATTGTTTCTTCTCGTGA 1820
Query 1877 GTTTAGCTTTGAAGGCAAGGAAGTGGACCAGGAACCTTCTGGCGAAGGTGTTACCAGGGT 1936
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821 GTTTAGCTTTGGAGGCAAGGAAGTGGACCAGGAACCTTCTGGCGAAGGTGTTACCAGGGT 1880
Query 1937 TGATGGGTCTGAAAGTGAAGAAGAAACTGAAGAGATGATATTTGGGAGTTCTGAAGCTGC 1996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1881 TGATGGGTCTGAAAGTGAAGAAGAAACTGAAGAGATGATATTTGGGAGTTCTGAAGCTGC 1940
Query 1997 AAAACAGTTCTTAGCAGAGCTGGAAAAGGCTTCTTCTGGTATAGAGGCACATTCTGATGA 2056
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941 AAAACAGTTCTTAGCAGAGTTGGAAAAGGCTTCTTCTGGTATAGAGGCACATTCTGATGA 2000
Query 2057 AGCAAACATTTCTAACAATATGTCAGATAGGATTGATGGCCAGATTGTCACCGATTCTGA 2116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2001 AGCAAACATTTCTAACAATATGTCAGATAGGATTGATGGCCAGATTGTCACCGATTCTGA 2060
Query 2117 CGAGGATGTAGACACAGAGGATGAAGGTGAGGAGAAAATGTTTGATTCTGCAGCTTTGGC 2176
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2061 CGAGGATGTAGACACAGAGGATGAAGGTGAGGAGAAAATGTTTGATACTGCAGCTTTGGC 2120
Query 2177 TGCGCTTTTGAAGGCAGCCACTGGTGGTGGAAGTTCAGAAGGTGGCAACTTTACCATAAC 2236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2121 TGCGCTTTTGAAGGCAGCCACTGGTGGTGGAAGTTCAGAAGGTGGCAATTTTACCATAAC 2180
Query 2237 ATCTCAGGATGGCACAAAGCTTTTCTCTATGGATCGACCTGCTGGTTTGAGTTCATCGTT 2296
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2181 ATCTCAGGATGGCACGAAGCTTTTCTCTATGGATCGACCTGCTGGTTTGAGTTCATCGTT 2240
Query 2297 AAGGCCCTTGAAACCTGCAGCAGCTCCACGTGCAAACCGTTCCAACATCTTTTCCAATCC 2356
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2241 AAGGCCCTTGAAGCCTGCAGCAGCTCCACGTGCAAACCGTTCCAACATCTTTTCCAATTC 2300
Query 2357 TAATGTCACAATGGCGGATGAGACTGAGGTTAACTTGAGCGAGGAAGAGAAACAGAAATT 2416
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 TAATGTCACAATGGCAGATGAGACTGAGATTAACTTGAGCGAGGAAGAGAAACAGAAATT 2360
Query 2417 AGAAAAGTTGCAAAGCCTCCGTGTGAAGTTTTTGCGGCTTTTGCAAAAGTTGGGGCATTC 2476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2361 AGAAAAGTTGCAAAGCCTCCGTGTGAAGTTTTTGCGGCTTTTGCAAAGGTTGGGTCATTC 2420
Query 2477 GGCAGAAGATTCAATCGCAGCGCAGGTTCTTTACCGTCTTGCACTACTTGCTGGGAGACA 2536
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 GGCAGAAGATTCAATTGCAGCGCAGGTTCTTTACCGTCTTGCACTACTTGCTGGGAGACA 2480
Query 2537 AACAGGGCAGTTTTTCAGTCTTGATGCTGCAAAGAAGAAGGCTGTGGAGTCTGAGGCTGA 2596
| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2481 AGCAGGGCAGTTATTCAGTCTTGATGCTGCAAAGAAGAAGGCTGTGGAGTCTGAGGCTGA 2540
Query 2597 GGGCAACGAAGATTTGAACTTCTCTCTAAACATACTGGTCCTTGGAAAAGCTGGGGTGGG 2656
|||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2541 GGGCAACGAAGAATTGATCTTCTCCCTAAACATACTGGTCCTTGGAAAAGCCGGGGTGGG 2600
Query 2657 AAAAAGTGCTACTATAAACTCCATTTTGGGAAATCAGAAGGCGTCCATCGATGCTTTTGG 2716
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2601 AAAAAGTGCTACTATAAATTCCATTTTGGGAAACCAGATTGCGTCCATTGATGCTTTTGG 2660
Query 2717 GCTCTCAACTACTTCGGTTAGAGAAATTTCTGAAACCGTGGGTGGTGTCAAGATTACCTT 2776
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2661 GCTCTCAACCACTTCGGTTAGAGAAATTTCTGGAACGGTGAATGGTGTCAAGATTACCTT 2720
Query 2777 TATTGATACTCCGGGTTTGAAGTCTGCTGCGATGGATCAAAGTGCAAATGCAAAAATGTT 2836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2721 TATTGATACTCCGGGTTTGAAGTCTGCTGCGATGGATCAAAGTACAAATGCAAAAATGTT 2780
Query 2837 GTCCTCTGTAAAGAAGGTAATGAAGAAGTGTCCCCCTGATATTGTACTATATGTAGATCG 2896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781 GTCCTCTGTAAAGAAGGTAATGAAGAAGTGTCCCCCTGATATTGTACTATATGTAGATCG 2840
Query 2897 TCTTGACACCCAGACAAGGGACTTGAACAATATGCCCTTGCTAAGGACGATTACTGCTTC 2956
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2841 TCTTGACACCCAGACCAGGGACTTGAACAATTTGCCCTTGCTAAGGACGATTACTGCTTC 2900
Query 2957 TCTTGGTACATCAATATGGAAAAACGCTATAGTGACATTGACCCATGCTGCTTCTGCCCC 3016
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2901 TCTTGGTACATCCATATGGAAAAACGCTATAGTGACATTGACCCATGCGGCTTCTGCCCC 2960
Query 3017 TCCTGATGGCCCATCTGGCACCCCATTGAGCTATGATGTGTTTGTAGCACAGTGCTCACA 3076
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2961 TCCTGATGGCCCATCTGGCACCCCATTGAGCTATGATGTGTTTGTAGCGCAGTGCTCACA 3020
Query 3077 TATTGTGCAACAGTCTATAGGGCAGGCCGTTGGAGATCTACGCTTGATGAATCCAAGTCT 3136
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3021 TATTGTGCAACAGTCTATAGGACAGGCTGTTGGAGATCTACGCTTGATGAATCCAAGTCT 3080
Query 3137 GATGAATCCAGTTTCTCTTGTTGAGAATCACCCCTTGTGTAGGAAGAACCGGGAGGGAGT 3196
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3081 GATGAATCCAGTTTCACTTGTTGAGAATCACCCCTTGTGTAGGAAGAACCGGGAGGGAGT 3140
Query 3197 GAAGGTTCTCCCGAATGGCCAAACTTGGAGACCTCAGCTGTTGCTATTGTGTTACTCCCT 3256
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3141 GAAGGTTCTCCCGAATGGCCAAACTTGGAGATCTCAGCTGTTGCTATTGTGTTACTCCCT 3200
Query 3257 GAAGGTTTTGTCAGAAGCAAATTCTCTATTGAAGCCTCAAGAACCATTGGATCATCGTAA 3316
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3201 GAAGGTTTTGTCAGAAACAAATTCTCTATTGAGGCCTCAAGAACCATTGGACCATCGTAA 3260
Query 3317 AGTATTTGGTTTCCGAGTTCGATCCCCGCCTCTCCCTTACTTGTTGTCTTGGCTGTTACA 3376
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3261 AGTATTTGGTTTCCGAGTTAGATCCCCGCCTCTCCCTTACTTGTTGTCTTGGCTGTTGCA 3320
Query 3377 GTCCCGTGCACACCCTAAGCTCCCTGGAGACCAAGGTGGTGATAGTGTTGACTCTGATAT 3436
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3321 GTCCCGTGCACATCCTAAGCTCCCTGGAGACCAAGGTGGTGATAGTGTTGACTCTGATAT 3380
Query 3437 CGAAATTGATGATGTGTCTGATTCTGAGCAGGAAGATGGGGAAGATGATGAGTATGACCA 3496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3381 CGAAATTGATGATGTGTCTGATTCTGAGCAGGAAGATGGGGAAGATGATGAGTATGACCA 3440
Query 3497 GCTGCCACCATTTAAGCCTCTTCGAAAAACCCAACTTGCAAAACTCTCAAAGGAACAGAG 3556
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 3441 GCTGCCACCATTTAAGCCTCTTCGAAAAACCCAACTTGCAAAGCTCTCAAATGAACAGAG 3500
Query 3557 AAAGGCATATTTCGAGGAGTATGATTACCGGGTAAAGCTCCTGCagaagaagcaatggag 3616
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3501 AAAGGCATATTTCGAGGAGTATGATTACCGTGTAAAGCTCCTGCAGAAGAAGCAATGGAG 3560
Query 3617 agaggaattgaagaggatgaaagaaatgaagaaaaacgggaagaagGTGGGTGAGAGTGA 3676
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 3561 AGAGGAATTAAAGAGGATGAAAGAAATGAAGAAAAACGGGAAGAAGCTGGGTGAAAGTGA 3620
Query 3677 GTTTGGTTATCTGGGAGAAGAAGATGATCCAGAAAACGGGGCTCCAGCTGCAGTGCCAGT 3736
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3621 GTTTGGTTATCCGGGAGAAGAAGATGATCCAGAAAACGGGGCTCCAGCTGCAGTGCCAGT 3680
Query 3737 TCCATTACCCGATATGGTTTTGCCACCTTCATTTGATAGTGATAACTCAGCTTACCGATA 3796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3681 TCCATTACCCGATATGGTTTTGCCACCTTCATTTGATAGTGATAACTCAGCTTACCGATA 3740
Query 3797 CCGATTTCTGGAACCCACTTCACAACTCCTAACCAGGCCAGTGTTGGACACCCATGGTTG 3856
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3741 CCGATATCTGGAACCCACTTCACAACTCCTAACCAGGCCAGTGTTGGATACCCATGGTTG 3800
Query 3857 GGACCATGACTGTGGATATGACGGCGTCAATGCAGAACACAGTCTTACTGTAGC-AGGCC 3915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||
Sbjct 3801 GGACCATGACTGTGGATATGACGGCGTCAATGCAGAACACAGTCTTGCTCTAGCTAG-CC 3859
Query 3916 GGTTCCCTGCCACAGCTACTGTCCAAGTCACCAAGGACAAGAAAGAGTTCAACATTCATC 3975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3860 GGTTCCCTGCCACAGCTACTGTCCAAGTCACCAAGGACAAGAAAGAGTTCAACATTCATC 3919
Query 3976 TGGACTCCTCGGTGTCTGCTAAGCACGGCGAGAATGGATCCACCATGGCAGGGTTCGATA 4035
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3920 TGGACTCCTCTGTGTCTGCTAAGCACGGGGAGAATGGATCCACCATGGCAGGGTTCGATA 3979
Query 4036 TTCAGAATGTAGGTAAGCAGCTGGCATATGTGGTCAGAGGAGAAACCAAATTCAAAAACT 4095
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3980 TTCAGAATGTAGGCAAGCAGCTGGCATATGTGGTCAGAGGAGAAACCAAATTCAAGAATT 4039
Query 4096 TGAGGAAGAACAAGACAACTGTTGGAGGGTCAGTGACATTCTTGGGAGAGAACATCGCCA 4155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4040 TGAGGAAGAACAAGACAACTGTTGGAGGGTCAGTGACATTCTTGGGAGAGAACATCGCCA 4099
Query 4156 CTGGTGTCAAACTCGAGGACCAAATAGCACTGGGGAAAAGGTTTGTGCTTGTGGGCAGCA 4215
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4100 CTGGGGTCAAACTCGAGGACCAAATAGCACTGGGGAAAAGGTTGGTGCTTGTGGGCAGCA 4159
Query 4216 CTGGGACAATGCGATCACAGGGAGATTCGGCCTATGGTGCGAACCTCGAGGTCAGGCTTA 4275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4160 CTGGGACAATGCGATCACAGGGAGATTCGGCCTATGGTGCGAACCTCGAGGTCAGGCTTA 4219
Query 4276 GGGAAGCTGATTTCCCAATTGGACAGGACCAATCTTCTTTTGGGCTGTCTTTGGTGAAGT 4335
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 4220 GGGAAGCTGATTTCCCAATTGGACAGGACCAATCTTCTTTTGGGCTGTCTCTGGTAAAGT 4279
Query 4336 GGAGAGGTGATTTAGCCCTCGGAGCCAATCTCCAATCTCAACTCTCTGTTGGAAGGAACT 4395
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4280 GGAGAGGCGATTTAGCCCTTGGAGCCAATCTCCAATCTCAAGTCTCTGTTGGAAGGAACT 4339
Query 4396 CAAAGATCGCGCTTCGTGCAGGACTTAACAACAAGATGAGCGGACAGATCACAGTCAGAA 4455
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4340 CAAAGATTGCGCTTCGTGCAGGACTTAACAACAAGATGAGCGGACAGATCACAGTCAGAA 4399
Query 4456 CCAGCAGCTCGGATCAGTTGCAGATTGCTCTCACAGCCATTCTTCCAATTGCCATGTCCA 4515
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4400 CCAGCAGCTCGGATCAGTTGCAAATCGCTCTCACAGCCATTCTTCCAATTGCCATGTCCA 4459
Query 4516 TCTACAAGAGCATTCGACCAGAAGCGACAAATGACAAGTACAGCATGTACTAAATATGCT 4575
||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4460 TCTACAAGAGCATTCGACCCGAAGCGACGAACGACAAGTACAGCATGTACTAAATATGCT 4519
Query 4576 GATGAATGCTGCCGAAGGATCttttttttATATTACTGGTTTTTAGTTCATGTTTTTTCC 4635
|||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4520 GATGAATGCTGCAGAATGATCTTTTCTTT-TATTACTGGTTTTTAGTTCATGTTTTTCCC 4578
Query 4636 CCACTTTAATAAAAACTTTGTTGAAGTTTATCAAAGTTGTATTTT 4680
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4579 CCACTTTAATAAAAACTTTGTTGAAGTTTATCAAAGTTGTATTTT 4623
Score = 641 bits (347), Expect = 0.0
Identities = 469/523 (90%), Gaps = 28/523 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGGACTCTAAGTCGGTAACTCCAGAACCAACGAACCCCTTCTACG---CTTCGGGCCAA 77
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1 ATGGACTCAAAGTCGGTTACTCCAGAACCAACCAACCCCTTCTACGCTTCTTCGGGGCAA 60
Query 78 TCAGGAAAAACCTATGCTTCTGTTGTCGCCGCCGCTGCTGCTGCAGCCGCCGATAAGGAG 137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCAGGAAAAACCTATGCTTCTGTTGTCGCCGCCGCTGCTGCTGCAGCCGCCGATAAGGAG 120
Query 138 GATGGTGGTGCTGTGAGTAGTGCCAAGGAGTTGGATTCCTCGTCGGAGGCTTTGTCTGGT 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 121 GATGGTGGTGCTGTGAGTAGTGCCAAGGAGTTGGATTCCTCATCGGAGGCTGTGTCTGGT 180
Query 198 AATTCGGATAAGGTTGGAGCTGATGATTTATCTGA-T---A-A-GGAGAAGCCGAATTTG 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||
Sbjct 181 AATTCGGATAAGGTTGGAGCTGATGATTTATCTGACTCCGAGAAGGAGAAGCCGAATTTG 240
Query 252 GAGGGTGACGGGAAAGTTTCTGACGAGGTGGATGATTCT-----G-------CTA-T--T 296
| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||| | |
Sbjct 241 GTGGGTGATGGGAAGGTTTCCGACGAGGTGGATGGTTCTTTAAAGGAGGATTCTACTACT 300
Query 297 CCTGAGGCTACTCCGAAGCCTGAGGTTGTTTCTGATG-GAACAATTGGGGAAGATGGTGT 355
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| | ||||| |||
Sbjct 301 CCTGAGGCTACTCCGAAGCCTGAGGTGGTTTCTGGTGAGA-CAATTGGTGTAGATGATGT 359
Query 356 GTCATTGCTATCTCCGAAGCCGGAGGATGTTTCTGATGGTGTAGGGGTTGTGGAGGAGAA 415
|||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TTCATCGTTATCTCCGAAGCCGGAGGCTGTTTCTGATGGTGTAGGGGTTGTGGAGGAGAA 419
Query 416 GAAGAAGGTTAATGAGGACGTGGAAGATAATAAAGACGATGGTGAGAGTAAGATTGAAAA 475
||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TAAGAAGGTTAAGGAGGACGTGGAGGATATTAAAGACGATGGTGAGAGTAAGATTGAAAA 479
Query 476 TGGGAGTGTTGATGTTGGA-GAGAAACAAGCTTCCACAGATGG 517
||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||
Sbjct 480 TGGGAGTGTTGATGTTG-ATGTGAAACAGGCTTCCACAGATGG 521
> AT4G02482.1 | Symbols: | chloroplast outer envelope GTP-binding
protein, putative | chr4:1092002-1092484 FORWARD LENGTH=405
Length=405
Score = 91.6 bits (49), Expect = 6e-17
Identities = 176/237 (74%), Gaps = 10/237 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4257 AACCTCGAGGTCAGGCTTAGGGAAGCTGATTTCCCAATTGGACAGGACCAATCTTCTTTT 4316
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | | | |
Sbjct 148 AACCTCGAGCTCAGGCTTAGGGAAGCTGATTTCCCAATAGGCCAAAACCAACCG-CATAT 206
Query 4317 GGGC-TGTCTTTGGTGAAGTGGAGAGGTGATTTAGCCCTCGGAGCCAATCTCCAATC-TC 4374
||| ||||| | || | || || ||||||| | || ||||||||| | | | ||
Sbjct 207 GGGAGTGTCTCTAAAAAATTCGAAAGATGATTTAACAGTCACAGCCAATCTACGA-CATC 265
Query 4375 AACTCTCTGTTGGAAGGA-ACTCAAAGATCGCG-CTTCGTGCAGGACTTAACAACAAGAT 4432
|| ||||||| ||||| | | ||||| | | ||| || | | ||| ||| |||||
Sbjct 266 AAGTCTCTGTGGGAAG-ACAGACAAAGGTAACAACTTT-TGTAAGTCTTGACAGCAAGAG 323
Query 4433 GAGCGGACAGAT-CACAGTCAGAACCAGCAGCTCGGATCAGTTGCAGATTGCTCTCA 4488
|| ||| | | ||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 324 GACCGGGT-GTTTCACTGTCCGAACAAACAGCTCAGATCAGTTGCAGATTGCTGTCA 379
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 233426785779
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5