BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg943823
Length=5696
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G38600.1 | Symbols: KAK, UPL3 | HEAT repeat ;HECT-domain (ub... 9439 0.0
> AT4G38600.1 | Symbols: KAK, UPL3 | HEAT repeat ;HECT-domain (ubiquitin-transferase)
| chr4:18041031-18049292 REVERSE LENGTH=6139
Length=6139
Score = 9439 bits (5111), Expect = 0.0
Identities = 5515/5705 (97%), Gaps = 48/5705 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGGAAACTCGGAGCCGCAAGCGGGCGGAGGCGACCTCAGCTGCCCCATCTTCTTCTCCT 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1 ATGGAAACTCGGAGCCGCAAGCGGGCGGAGGCGACCTCAGCTGCCCCATCTTCTTCTTCT 60
Query 81 TCTTCACCT-C-CCT-CTGCCTCTG---CTGGTCCCACCACCCGCAGCAAACGCGCTCG- 133
||||| ||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTTCTCCTCCTCCTCCTCCCTCTGCCTCTGGTCCCACCACCCGCAGCAAACGCGCTCGT 120
Query 134 ---TC-T-TTCTTCTTCTTCCTCACTTG---------C-CC--CTTCCT---CCACCACC 173
|| | |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||
Sbjct 121 CTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCACTTGCCCCCACTCCTCCTTCTTCCTCCACCACCACC 180
Query 174 CGCTCTCGTTCTTCTCGCTCTGCCGCCGCCACTGCTCCAGCTCCCATGGACACCTCCACT 233
|||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CGCTCTCGTTCTTCTCGCTCTGCCGCCG-C-C-GCT---GCTCCCATGGACACCTCCACC 234
Query 234 GACTCTTCTTCTGGATTTCGCCGAGGCGGTCGTGGTAACAGGGGAAACACCGATAAC-AC 292
|| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |
Sbjct 235 GA--C-TCTTCTGGATTTCGCCGAGGCGGACGTGGTAACAGGGGAAACA---ACAACGA- 287
Query 293 CAACTCTGACAAGGGTAAGGAGAAGGAACATGACGTTAGGATTAGGGA-CAGAGAAAGAG 351
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 288 TAATTCTGACAAAGGTAAGGAGAAGGAACATGACGTTAGGATTAGGGAGC-GTGAAAGAG 346
Query 352 AAAGAGACCGAGCCAGAGAACAACTCAACATGGATGCTGCTGCCGCCGCTGCTAGGAGCG 411
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 347 AAAGAGACCGAGCCAGAGAACAACTCAACATGGATGCTGCCGCCGCCGCTGCTAGGAGCG 406
Query 412 CTGACGAGGATGACGACAATGACAGTGAGGATGGCAACGGCGGATTCATGCATCCTAACA 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 407 CTGACGAGGATGACGACAATGACAGTGAGGATGGCAACGGCGGTTTCATGCATCCTAACA 466
Query 472 TGAGCTCTGCCAGCAGTGCTTTACAAGGCTTGCTCAGGAAGCTTGGAGCTGGATTGGATG 531
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 467 TGAGCTCTGCGAGCAGTGCTTTACAAGGCTTGCTCAGGAAGCTCGGTGCTGGATTGGATG 526
Query 532 ACTTGCTTCCTTCTTCCGGTATCGGCTCTGCTTCATCTTCCCACTTGAATGGAAGGATGA 591
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 ACTTGCTTCCTTCTTCCGGTATCGGCTCTGCTTCTTCCTCCCACTTGAATGGAAGGATGA 586
Query 592 AGAAGATTCTCTCTGGCTTGCGCTCTGAAGGAGAAGAGGGAAAGCAGGTCGAGGCCTTAA 651
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 587 AGAAGATTCTCTCTGGCTTGCGCGCTGAAGGAGAAGAGGGAAAACAGGTCGAGGCTTTAA 646
Query 652 CCCAGCTGTGTGAGATGTTATCCATTGGAACCGAAGACTCGCTAAGCACCTTCTCTGTTG 711
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 647 CCCAGCTTTGTGAGATGTTATCCATTGGGACCGAAGACTCGCTTAGCACCTTCTCTGTTG 706
Query 712 ATTCCTTCGTGCCAGTTCTTGTGGGTCTACTTAACCATGAAAGCAATCCCGACATTATGC 771
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 ATTCCTTCGTCCCAGTTCTTGTCGGTCTACTTAACCATGAAAGCAATCCCGACATTATGC 766
Query 772 TTCTTGCAGCCAGGGCTCTTACCCATCTATGTGATGTCTTGCCGTCTTCTTGTGCTGCTG 831
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 TTCTTGCTGCCAGGGCTCTTACCCATCTATGTGATGTCTTGCCGTCTTCTTGTGCTGCTG 826
Query 832 TTGTACATTACGGGGCAGTTTCATGCTTAGTGGCTAGATTGCTAACCATTGAATACATGG 891
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 827 TTGTACATTACGGGGCAGTTTCATGCTTGGTGGCCAGATTGCTAACCATAGAATACATGG 886
Query 892 ACTTGGCGGAGCAGTCTCTGCAAGCTCTCAAAAAGATATCTCAGGAGCACCCAACTGCCT 951
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 ACTTGGCGGAACAGTCTCTGCAAGCTCTCAAAAAGATATCTCAGGAGCACCCAACTGCCT 946
Query 952 GTTTGCGAGCTGGCGCTCTTATGGCTGTGCTCTCGTATCTGGATTTCTTCTCCACTGGTG 1011
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 GTTTGCGAGCTGGTGCTCTTATGGCTGTGCTCTCGTATCTGGATTTCTTCTCCACTGGTG 1006
Query 1012 TTCAGCGCGTAGCACTATCTACTGCTGCAAACATGTGTAAGAAACTGCCTTCGGATGCAT 1071
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1007 TTCAGCGCGTAGCACTATCTACTGCTGCCAACATGTGCAAGAAACTACCTTCTGATGCAT 1066
Query 1072 CTGATTATGTTATGGAAGCTGTACCATTGCTGACAAACCTACTTCAGTATCATGATGCGA 1131
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1067 CTGATTATGTTATGGAAGCTGTACCTTTGCTGACAAACCTACTTCAGTATCATGATTCGA 1126
Query 1132 AGGTTTTGGAATATGCTTCTATATGTCTGACTCGGATTGCTGAAGCATTTGCACCGTATC 1191
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 AGGTTTTGGAATATGCTTCTATCTGTCTGACTCGAATTGCTGAAGCATTTGCACCGTATC 1186
Query 1192 CTGAGAAATTAGATGAATTATGTAACCATGGCCTGGTGACGCAAGCTGCGTCTCTTATTT 1251
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 CCGAGAAATTAGATGAATTATGTAACCATGGCCTGGTGACGCAAGCTGCGTCTCTTATTT 1246
Query 1252 CCACGAGCAATTCAGGAGGTGGGCAAGCATCTCTTAGTGTGTCAACATACACGGGGTTAA 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 CCACGAGCAATTCAGGAGGTGGGCAAGCATCTCTTAGTGTGTCAACATACACGGGGTTAA 1306
Query 1312 TCCGATTACTTTCTACCTGTGCGAGTGGGTCACCTCTTGGATTCAGGACATTACTTCTTC 1371
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 TCCGATTACTTTCTACCTGTGCGAGCGGGTCACCTCTTGGATTCAGGACATTACTTCTTC 1366
Query 1372 TTGGTATTAGTAGCATTCTTAAGGATATTCTGTTGGGTTCTGGGGTCTCTGCTAATACAT 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1367 TTGGTATTAGTAGCATTCTTAAGGATATTCTGTTGGGTTCTGGGGTCTCTGCTAATGCAT 1426
Query 1432 CTGTATCCCCAGCACTGAGCCGGCCTGCAGATCAGATTTTTGAGATAGTCAACCTAGCGA 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1427 CTGTATCCCCAGCACTGAGCCGGCCTGCAGATCAGATTTATGAGATAGTCAACCTAGCGA 1486
Query 1492 ATGAGCTACTCCCTCCATTGCCAGAAGGAGTTATCTCTCTTCCTACTAGCACAAACGCTT 1551
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 ATGAGCTCCTCCCTCCATTGCCAGAAGGAGTTATCTCTCTTCCTACTAGCACAAACGCTC 1546
Query 1552 TTGTGAAAGGTTCATGCCAAAAGAAATCTTGTCCAAGTACTTCAGGAAAACAAGAAGATG 1611
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 TTGTGAAAGGTTCATGCCAAAAGAAATCTAGTCCAAGTACTTCAGGAAAACAAGAAGATA 1606
Query 1612 CTCTAAAAATTTCACCAAGAGAAAAATTACTTGGTGATCAACCTGAACTTCTGCAGCAAT 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1607 TTCTAAAAATTTCACCAAGAGAAAAATTACTTGGTGATCAACCTGAACTTCTGCAGCAGT 1666
Query 1672 TTGGATTGGATCTTCTTCCAGTTTTAGTGCAGATCTATGGTTCTAGTGTCAATGGTACTA 1731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1667 TTGGATTGGATCTTCTTCCAGTTTTAGTGCAGATCTATGGTTCTAGTGTCAATGGTACGA 1726
Query 1732 TTCGCCATAAATGTCTCTCAGTCATCGGAAAGTTGATGTATTTCAGCAGTTCAGAGATGA 1791
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1727 TTCGCCATAAATGTCTCTCAGTCATTGGAAAGTTGATGTATTTCAGCAGTTCAGAAATGA 1786
Query 1792 TTCAATCTCTAATTGGTGACACAAATATTTCGAGCTTCTTGGCTGGTGTCTTGGCATGGA 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1787 TTCAATCTCTAATTGGTGACACAAATATTTCGAGCTTCTTGGCTGGTGTCTTGGCATGGA 1846
Query 1852 AAGACCCACAGGTCTTGGTTCCTGCTCTACAAGTTGCAGAGATATTGATGGAAAAGCTTC 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1847 AAGACCCACAGGTCTTGGTTCCTGCTCTACAAGTTGCAGAGATTTTGATGGAAAAGCTTC 1906
Query 1912 CTGAAACATTCTCGAAAGTGTTTGTGAGGGAAGGGGTGGTCCATGCTGTAGATCAACTTG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 CTGAAACATTCTCGAAAGTGTTTGTGAGGGAAGGGGTAGTCCATGCTGTAGATCAACTTG 1966
Query 1972 TCTTGGTTGGTAAATCTTCTCATGCCTCACCTACTGATAAGGACAATGACTGTGTGCCCG 2031
|||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1967 TCTTGGTTGGTAAACCATCCCATGCCTCACCTACTGATAAGGACAATGACTGTGTACCCG 2026
Query 2032 GATCTGCACGATCTAGGCGTTATAGACGGCGAAGTAGTAATGCCAATTCCGATGGAAACC 2091
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027 GATCTGCACGATCTAGGCGTTATAGACGGCGCAGTAGTAATGCCAATTCCGATGGAAACC 2086
Query 2092 AGTCGGAAGAGCCTAAGAATTCTGCGTCCCTTAACATAGGTGCAAACCATAATTCCCTGG 2151
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2087 AGTCGGAAGAGCCTAAGAATCCTGCGTCCCTTACCATAGGGGCAAACCATAATTCCCTTG 2146
Query 2152 ATACTCCTACAGCTAGCTTCATGCTAAGGGAAACAGTTAGTTCCTGTGCCAAAGCATTCA 2211
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2147 ATACTCCTACAGCTAGCTTCATGCTAAGGGAAACAGTTAGTTCCTGCGCCAAAGCATTCA 2206
Query 2212 AAGACAAGTACTTCCCGTCTGATGGTGGGGATCTTGATGTTGGAGTTACAGATGATCTCT 2271
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2207 AAGACAAGTACTTCCCGTCTGATGGTGGGGATGTTGATGTTGGAGTTACAGATGATCTTT 2266
Query 2272 TACATCTGAAGAATCTTTGCACGAAGCTAACTGCTGGTATAGATGATCATAAAGTGAAAG 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267 TACATCTGAAGAATCTTTGCACGAAGCTAACTGCTGGTATAGATGATCATAAAGTGAAAG 2326
Query 2332 GGAAGGGAAAATCTAAAGCCTCTGGGCCATGCCTTGGCGATTTCTCTGCTAGCAAGGAAG 2391
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2327 GAAAGGGAAAATCTAAAGCCTCTGGGCCATTCCTTGGCGATTTCTCTGCTAGCAAGGAAG 2386
Query 2392 AGTACTTGATTGGTGTCATTTCTGAGATACTTGGCGAGCTAAGTAAAGGGGATGGTGTCT 2451
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2387 AGTACTTGATTGGTGTCATTTCTGAGATACTTGGCGAGATAAGTAAAGGGGATGGTGTCT 2446
Query 2452 CAACTTTTGAGTTTATTGGCAGTGGTGTGGTTGCAGCATTGCTTAACTATTTTTCTTGTG 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2447 CAACTTTTGAGTTTATTGGCAGTGGTGTGGTTGCAGCATTGCTTAACTATTTTTCTTGTG 2506
Query 2512 GATACTTTTCCAAAGAGAAGATCTCCGAACTT-ATATTGCCCAAACTTCGCCAGGAGGGA 2570
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 GATACTTTTCCAAAGAGAAGATCTCCGAACTTAAT-TTGCCCAAACTTCGCCAGGAGGGA 2565
Query 2571 CTCAGAAGGTTCAAAGCTTTTCTAGAAGTCGCTCTTCCTTTTGATGGTAATGAGGGAAAG 2630
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566 CTCAGAAGGTTTAAAGCTTTTCTAGAAGTCGCTCTTCCTTTTGATGGTAATGAGGGAAAG 2625
Query 2631 GTCCCTCCTATGACAGTTTTGATTCAGAAACTTCAAAATGCTTTATCGTCACTGGAACGC 2690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2626 GTCCCTCCTATGACAGTTTTGATTCAGAAACTTCAAAATGCTTTATCGTCACTGGAGCGC 2685
Query 2691 TTTCCCGTTGTCCTTAGCCATCCCTCAAGGTCACTAAGTGGAAGTGCTCGGCTCTCCTCT 2750
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2686 TTTCCTGTTGTCCTTAGCCATCCCTCAAGGTCACTAAGTGGAAGTGCTCGGCTCTCCTCG 2745
Query 2751 GGATTGAGTGCTTTGGCACATCCTTTAAAGTTGCGATTATGCCGTGCACCTGGAGAGAAA 2810
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2746 GGTTTGAGTGCTTTGGCACATCCTTTAAAGTTGCGATTATGCCGAGCATCTGGAGAGAAA 2805
Query 2811 ACACTACGTGATTACTCCTCCAATATTGTACTTATAGATCCATTGGCAAGCATAGCAGCG 2870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2806 ACACTACGTGATTACTCCTCCAATATTGTACTTATAGATCCATTGGCAAGCTTAGCAGCA 2865
Query 2871 GTGGAGGAATTTCTGTGGCCCCGAGTTCAACGCAGTGAATCTGCTCTGAAGCCGGCAGCG 2930
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2866 GTGGAGGAATTTCTGTGGCCCCGAGTTCAACGGAGTGAATCTGCTCTGAAGCCGGCAGCG 2925
Query 2931 CCTGCTGGAAATACAGAGCCAGGCACGTTACCTAGCGGTGCTGGTGTTTCATCACCATCT 2990
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2926 CCTATTGGCAATACAGAGCCAGGCACGTTACCTAGCGGTGCTGGTGTTTCATCACCATCT 2985
Query 2991 TCGTCAACTCCAGCTTCCACCACTCGTCGTCATTCTTCTAGATCTCGATCGGCAATTAAC 3050
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2986 TCGTCAACTCCAGCTTCAACCACTCGTCGTCATTCTTCTAGATCTCGATCGGCAATTAAC 3045
Query 3051 ATAGGTGATGCCTCAAAGAAAGATCCTGTGCCTGAGAAAGGTACCAGCTCATCGAAAGGA 3110
|| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3046 ATCGGTGATACTTCAAAGAAAGATCCTGTGCATGAGAAAGGTACCAGCTCATCGAAAGGA 3105
Query 3111 AAAGGTAAAGGCGTTATGAAACCGGCTCAGGCGGATAAGGGGCCTCAAACAAGGAGCAGT 3170
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3106 AAAGGTAAAGGCGTTATGAAACCGGCTCAGGCGGATAAGGGGCCTCAAACAAGGAGCAAT 3165
Query 3171 GCTCAAAAGAGAGCTGTCCTTGACAAAGATACTCAAATGAAACCAGCTAGCGGAGACTCC 3230
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3166 GCTCAAAAGAGAGCTGTTCTTGACAAAGATACTCAAATGAAACCAGCTAGCGGAGACTCC 3225
Query 3231 AGTTCTGAGGATGAGGAATTGGATATATCCCCAGTCGACATtgatgatgccttggtgatt 3290
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3226 AGTTCTGAGGATGAGGAATTGGAAATATCCCCAGTCGACATTGATGATGCCTTGGTGATT 3285
Query 3291 gaagaggatgacatttctgatgatgaagatgatgataatgaagatgttttggatgaCAGT 3350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3286 GAAGAGGATGACATTTCTGATGATGAAGATGATGATAATGAAGATGTTTTGGATGACAGT 3345
Query 3351 CTTCCCATGTGCACGCCTGATAAAGTGCATGATGTGAAATTGGCGGACTCAGTGGATGAT 3410
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3346 CTTCCCATGTGCACGCCTGATAAAGTCCATGATGTGAAATTGGCGGACTCAGTGGATGAT 3405
Query 3411 GATGGTCTAGCAACCAGTGGCCGACAAATGAATCCAGCTTCTGGAGGCACTAGTGGAGCA 3470
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3406 GATGGTCTAGCAACCAGCGGCCGACAAATGAATCCAGCTTCTGGAGGCACTAGTGGAGCC 3465
Query 3471 GCAGCAGCACGGGGATCTGATTCTACTGATACTGGCATTGGGAATTCTTATGGTTCTAGG 3530
||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3466 GCAGCAGCAAGGGCATCTGATTCTATTGATACTGGCATTGGGAATTCCTATGGTTCTAGA 3525
Query 3531 GGTGCACTCTCCTTTGCTGCTGCAGCGATGGCTGGGCTTGGAGCTGCCAGTGGTAGAGGT 3590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3526 GGTGCACTCTCCTTTGCTGCTGCAGCGATGGCTGGGCTTGGAGCTGCCAGTGGTAGAGGT 3585
Query 3591 ATCAGGGGAAGTAGGGACTTGCATGGACGTACCCTAAATCGAAGTTCAGATGAGCCCTCT 3650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3586 ATCAGGGGAAGTAGGGACTTGCATGGACGTACCCTAAATCGAAGTTCAGATGAGCCCTCT 3645
Query 3651 AAGTTGATATTTACTGCGGGAGGAAAGCAACTTAGTAGGCATTTGACGATTTATCAGGCT 3710
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3646 AAGTTGATATTTACTGCGGCAGGAAAACAACTTAGTAGGCATTTGACGATTTATCAGGCT 3705
Query 3711 GTACAGCGACAACTTATGCTAGATGAAGATGATGATGACAGGTTTGGTGGCAGTGATCTA 3770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3706 GTACAGCGACAACTTATGCTAGATGAAGATGATGATGACAGGTTTGGTGGCAGTGATCTA 3765
Query 3771 ATCTCAAGTGATGGAAGCAGATTCAATGATATTTACACCATCATGTACCAGAGGCCAGAT 3830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3766 GTCTCAAGTGATGGAAGCAGATTCAATGATATTTACACCATCATGTACCAGAGGCCAGAC 3825
Query 3831 AGCCAAGTGAATAGGTTGTCTGTTGGTGGAGCAAGTTCTACCACACCGTCAAAATCCACG 3890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3826 AGCCAAGTGAATAGGTTGTCTGTTGGTGGAGCAAGTTCTACCACACCGTCAAAATCCACG 3885
Query 3891 AAATCTGCTACTACTACCAATTCCAGTGTAGAATCTCAGTCACATAGGGCATCTCTTTTG 3950
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3886 AAATCTG---CTACTACCAATTCCAGTGTAGAATCTCAGTCACATAGGGCATCTCTTTTG 3942
Query 3951 GATAGTATCTTACAAGGGGAGCTTCCATGCGACCTTGAGAAGTCGAATTCTACATATAAT 4010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3943 GATAGTATCTTACAAGGGGAGCTTCCATGCGACCTTGAGAAGTCGAATTCTACATATAAT 4002
Query 4011 GTTCTGGCACTGTTACGTGTATTAGAGGGTTTAAATCAGCTTTGCCCTCGTTTAAGAGCC 4070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4003 GTTCTGGCACTGTTACGTGTATTAGAGGGTTTAAATCAGCTTTGCCCTCGTTTAAGAGCC 4062
Query 4071 CAAACTCTTTCCGATCGTTTTGCAGAGGGTAAAATTACAAGTCTAGATGATCTGAGTACA 4130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4063 CAAACTCTTTCCGATCGTTTTGCAGAGGGTAAAATTACAAGTCTAGATGATCTGAGTACA 4122
Query 4131 ACTGCTGCTAAGGTTCCTCATGAAGAATTCGTCAATAGCAAACTTACACCCAAATTAGCT 4190
||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4123 ACTGCTGCTAAGGTTCCTCTTGATGAATTTGTCAATAGCAAACTTACACCCAAATTGGCT 4182
Query 4191 CGACAAATCCAGGATGCGCTTGCTTTGTGCAGTGGAAGTCTTCCCTCTTGGTGCTACCAG 4250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4183 CGACAAATCCAGGATGCGCTTGCTTTGTGCAGTGGAAGTCTTCCCTCTTGGTGCTACCAG 4242
Query 4251 TTGACTAGAGCATGCCCATTTCTATTCCCGTTTCAAACCCGGAGACAGTATTTCTACTCA 4310
||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4243 TTGACTAGAGCATGCCCATTTTTGTTTCCGTTTCAAACCCGGAGACAGTATTTCTACTCG 4302
Query 4311 ACTGCTTTTGGGTTGTCTCGTGCATTGAATCGTTTGCAGCAGCAGCAAGGTGCTGACGGC 4370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4303 ACTGCTTTTGGGTTGTCTCGTGCATTGAATCGTTTGCAGCAGCAGCAAGGTGCTGACGGC 4362
Query 4371 AGTGGGTCTACAAATGAACGAGAGATGAGAATAGGGAGATTGCAGCGCCAGAAAGTCCGT 4430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4363 AGTGGGTCTACAAATGAACGAGAGATGAGAATAGGGAGATTGCAGCGCCAGAAAGTCCGT 4422
Query 4431 GTATCCCGAAATAGGATATTAGATTCTGCTGCGAAAGTTATGGAGATGTATTCTAGCCAG 4490
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4423 GTATCCCGAAATAGGATATTAGATTCTGCTGCAAAAGTTATGGAGATGTATTCTAGCCAG 4482
Query 4491 AAAGCTGTTCTTGAAGTAGAATATTTTGGTGAAGTTGGTACTGGTCTAGGACCTACCCTT 4550
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4483 AAAGCTGTGCTTGAAGTAGAATATTTTGGTGAAGTTGGTACTGGTCTAGGCCCTACCCTT 4542
Query 4551 GAGTTTTACACACTTTTAAGCCATGATCTGCAAAAGGTTTCCCTAGGGATGTGGAGATCA 4610
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4543 GAGTTTTACACACTTCTAAGCCATGATCTGCAAAAGGCTTCCCTAGGGATGTGGAGATCA 4602
Query 4611 AGTTCTGGTGACAAGGTATCTATGCAAATTGATAGAGATGAGATTGAAGATGGAAAATCA 4670
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 4603 AGTTCTGGTGACAAGGTATCTATGCAAATTGGTAGAGATGAGATTGAAGACGGAAAACCA 4662
Query 4671 TCTGCAGCTAACAGAGATATAGTTCTGGCACCACTTGGGTTGTTTCCTCGACCTTGGCCC 4730
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 4663 TCTGCAGCTAACAGAGATATAGTTCTGGCACCACTTGGATTGTTTCCTCGGCCTTGGCCC 4722
Query 4731 TCAACAGCTGACATATCTGAAGGTGGTCAGTTTCATAAAGTCATTGAATATTTCCGCCTT 4790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4723 TCAACAGCTGACATATCTGAAGGTGGTCAGTTTCATAAAGTCATTGAATATTTCCGCCTT 4782
Query 4791 TTAGGGCGTGTGATGGCCAAAGCACTTCAAGATGGACGGCTATTGGACGTCCCATTGAGT 4850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4783 TTAGGGCGTGTGATGGCCAAAGCACTTCAAGATGGACGGCTATTGGACGTCCCATTGAGT 4842
Query 4851 ACAGCGTTTTATAAACTTATTCTTGGTCAAGAGCTTGATTTGCATGATATTGTATTATTT 4910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4843 ACAGCGTTTTATAAACTTATTCTTGGTCAAGAGCTTGATTTGCATGATATTGTATTATTT 4902
Query 4911 GACGCTGAACTTGGCAAGACCTTGCAAGAGCTGCGTGTTCTCGTTGCCCGCAAGCACTAT 4970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 4903 GACGCTGAACTTGGCAAGACCTTGCAAGAGCTGCGTGTTGTTGTTGCCCGCAAGCACTAT 4962
Query 4971 CTGGAGGCAGTAGGTGGTGACAATAGCAGCACGGTTTCTGATTTATGTTTACGTGGATCC 5030
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4963 CTGGAGGGAGTAGGTGGTGACAATAGCAGCACGATTTCTGATTTATGTTTACGTGGATGC 5022
Query 5031 CGAATAGAAGATCTCTTCTTGGACTTCACGCTACCTGGCTATCCTGAGTACATTCTGAGA 5090
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5023 CGAATAGAAGATCTCTCCTTGGAATTCACGCTACCTGGCTATCCTGAGTACATCCTGAGA 5082
Query 5091 TCAGGAGATGAAATTGTTGATATTACTAATCTTGAGGAGTATATATCCCTTGTCGTTGAG 5150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5083 TCAGGAGATGAAATTGTTGATATTACTAATCTTGAGGAGTATATATCCCTTGTCGTTGAT 5142
Query 5151 GCTACTGTGAAGAGAGGAGTCACTCGGCAGATCGAAGCCTTCAGATCTGGATTCAATCAG 5210
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5143 GCTACTGTCAAGAGAGGAGTCACTCGGCAGATCGAAGCCTTCAGATCTGGATTCAATCAG 5202
Query 5211 GTGTTTGACATAACATCTCTACAAATATTCACCCCTTCTGAGCTGGACTACTTGCTGTGT 5270
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5203 GTGTTTGACATAACATCTCTACAAATATTCACCCCTTCTGAGCTGGACTATTTGCTGTGT 5262
Query 5271 GGTCGTAGAGAGTTGTGGGAGGTGGAGACTCTTGCTGAACATATCAAATTTGATCACGGT 5330
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5263 GGTCGTAGAGAGTTGTGGGAGGTGGAGACTCTTGCTGAACATATCAAATTTGATCATGGG 5322
Query 5331 TACACTGCCAAAAGTCCGGCAATCATTAACTTACTGGAGATCATGGGAGAACTTACAGCA 5390
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5323 TATAATGCCAAAAGTCCGGCAATCATTAACTTACTGGAGATCATGGGAGAACTTACAGCA 5382
Query 5391 GATCAGCAGAGGGCTTTCTGCCAATTTGTAACTGGAGCTCCTAGGCTTCCTCCTGGTGGC 5450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5383 GATCAGCAGAGGGCTTTCTGCCAATTTGTAACTGGAGCTCCTAGGCTTCCTCCTGGTGGC 5442
Query 5451 TTAGCTGTTCTGAACCCAAAGCTCACGATTGTAAGAAAGCACTCATCGACCTCAAGTGCA 5510
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5443 TTAGCTGTTCTGAACCCAAAGCTTACGATTGTGAGAAAGCACTCATCGACCTCAAGTGCA 5502
Query 5511 GCAGCCAATGGAGCAGGGGCTTCGGAGACAGCAGATGATGATTTGCCCAGTGTCATGACT 5570
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5503 GCAGCCAACGGAGCAGGGGCTTCGGAGACAGCAGATGATGATTTGCCCAGTGTCATGACT 5562
Query 5571 TGCGCAAACTACCTTAAACTCCCTCCTTATTCTACAAAGGAAATAATGTACAAGAAACTG 5630
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5563 TGCGCAAACTACCTTAAACTCCCTCCTTATTCTACAAAGGAAATCATGTACAAGAAACTG 5622
Query 5631 CTCTACGCCATCAACGAAGGGCAAGGATCGTTTGACCTCTCATAAGCAACAGATGGCTCT 5690
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 5623 CTCTACGCCATCAACGAAGGGCAAGGATCGTTCGACCTCTCATAAGCAACATATGGCTGT 5682
Query 5691 GTTTC 5695
|||||
Sbjct 5683 GTTTC 5687
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 284396399867
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5