BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg945184
Length=2913
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G28470.1 | Symbols: RPN1B, ATRPN1B | 26S proteasome regulato... 4588 0.0
AT2G20580.1 | Symbols: RPN1A, ATRPN1A | 26S proteasome regulato... 3038 0.0
> AT4G28470.1 | Symbols: RPN1B, ATRPN1B | 26S proteasome regulatory
subunit S2 1B | chr4:14066875-14072545 REVERSE LENGTH=3071
Length=3071
Score = 4588 bits (2484), Expect = 0.0
Identities = 2780/2921 (95%), Gaps = 27/2921 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGTGCTAGTCTGACTAACAATGGCTCCAGTTCCGGATCCGAACAGTGTTGGCGGTGGTG 60
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 AGGTGATAGTCTGACTTACAATGGCTCCAGTTCCGGATCCGAACAGTGTTGGCGGTGGTG 228
Query 61 CGAAGCGGGACGAAGCTACGACGAAGGTTCCTTCTAAAGATTCCAAGAAGAAGGATGATA 120
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 229 CGAAGCGGGACGAAGCTACGACGAAGATTCCTTCTAAGGATTCCAAGAAGAAAGATGATA 288
Query 121 AGAAGGAAGAGGATCTGTCTGAAGAGGACTTGCAACTAAAGCAGAACCTGGAGCTCTATG 180
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 289 AAAAGGAAGAGGATCTGTCTGAAGAGGACTTGCAACTAAAGCAGAATCTGGAGCTCTATG 348
Query 181 TTGAGAGAGTTCAGGACCCCAATCCTGAGTTACAGAAGGCTGCTCTTGAAAGCATGAGGC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 349 TTGAGAGAGTTCAGGACCCCAATCCTGAGTTACAGAAGATTGCTCTTGAAAGCATGAGGA 408
Query 241 AGGAAATTCGAGACTCAACAAGCTCCATGACATCAGTTCCAAAACCCCTCAAGTTTCTCC 300
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 AGGAAATTCGTGACTCAACAAGCTCCATGACATCAGTTCCAAAACCCCTCAAGTTTCTCC 468
Query 301 GTCCTCATTATGGAGTTCTTAAGGAATTTCATGTAAAAATGGCGGAGTCTGATCTCaaaa 360
| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 469 GCCCTCATTATGGAGTTCTTAAAGAATTTCATGCAAAAATGGCAGAGTCTGATCTCAAAA 528
Query 361 aaaTGTTGGCTGATATACTTTCTGTCCTGGCACTGACCATGTCTGCTGAAGGTGAAAGGG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 AAATGTTGGCTGATATACTTTCTGTCCTGGCACTGACCATGTCTGCTGAAGGTGAAAGGG 588
Query 421 AAAGCTTAAACTATAGGTTGACTGGATCAGAGGGTGACATCGGATCGTGGGGTCACGAGT 480
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 AAAGCTTAAACTATAGGTTGAATGGATCAGAGAGTGACATCGGATCGTGGGGTCACGAGT 648
Query 481 ATGTCAGGAATTTGGCCGGAGAGATTGCAGAAGAGTATACAATGCGTCAGGGTGAAGAGT 540
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 649 ATGTCAGGAATTTGGCTGGAGAGATTGCAAAAGAGTATACAATACGTCAGGGTGAAGAGT 708
Query 541 CCTCTATTGAAGACTTAATGGATCTTGTGCAGCAAATTGTTTCTTTTCACATGAAGCATA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 CCTCTATTGAAGACTTAATGGATCTTGTGCAGCAAATTGTTTCTTTTCACATGAAGCATA 768
Query 601 ATGCCGAAACCGAAGCTGTTGACCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 ATGCCGAAACCGAAGCTGTTGACCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTG 828
Query 661 AGCATGTTGACAGCACAAATTTCAGGAGGACATGCAACTATCTCACGAGTGCAGCAAAGT 720
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 AGCATGTTGACAATACAAATTTCAGGAGGACGTGCAACTATCTCACGAGTGCAGCAAAGT 888
Query 721 ATCTTCCAGGACCAGATGACATGTTGGTTCTAGATATTGCTTACATGATCTACATTAAGT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCTTCCAGGACCAGATGACATGTTGGTTCTAGATATTGCTTACATGATCTACATTAAGT 948
Query 781 TTGCAGAATATCCAAACGCGCTGCAAATTGCATTATTTCTTGACAACATGCAGTATGTGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 949 TTGCAGAATATCCAAACGCGCTGCAAATTGCATTATTTCTTGATAACATGCAGTATGTGA 1008
Query 841 AGCAAGTTTTTACCTCATGTACCGATCTGCTAAAAAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTG 900
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 AGCAAGTATTTACCTCATGTACCGATCTGGTAAAAAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTG 1068
Query 901 CACGTCATGGTATCACCTTTGTGCTTGACCAGGAGATGGTTGCAAATGA-GCAGGACAGA 959
||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| |
Sbjct 1069 CACGTCATGGTATGACCTTTGAGCTTGACCAAGAGATGGTTGCAAATGACGAAG-ACAAA 1127
Query 960 GAAGCCCTACAGGATATTGTTAACAA-TACTAAGCTGAGTGAAGGATATCTGACACTTGC 1018
||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1128 GAAGCGCTACAGGATATTGTTAACAACT-CTAAGTTGAGTGAAGGATATCTGACGCTTGC 1186
Query 1019 TAGGGATATTGAGGTCATGGAGGCCAAGACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTGCT 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 TAGGGATATTGAGGTCATGGAGGCCAAGACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTGCT 1246
Query 1079 TGATGGCAGGGTTAGCTCTGGTGCAAGTGTGGATTCAGCTAGACAAAATCTGTCTGCGAC 1138
|||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1247 TGATGGTAGGGCTAGCTCTGGTCCAAGTGTGGACTCAGCTAGGCAAAATCTATCTGCGAC 1306
Query 1139 TTTTGTGAATGCATTTGTAAATGCTGGATTCGGCCAGGACAAATTAATGACAGTGCCATC 1198
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1307 TTTTGTGAATGCATTTGTAAATGCTGGATTCGGCCAGGACAAATTAATGACAGTACCATC 1366
Query 1199 TGACTCAACCAGTGGATCAGCTGGAAACTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGCAAGAC 1258
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1367 TGACTCAACCAGTGGATCGGCTGGAAACTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGAAAGAC 1426
Query 1259 CAGTGCAGCTGCTAGTCTGGGTATGATTCAATTGTGGGATGTGAACACTGGACTAGCTCA 1318
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||
Sbjct 1427 CAGTGCAGTTGCTAGTCTGGGTATGATTCAATTGTGGGATGTGGAGACCGGACTAGGTCA 1486
Query 1319 ACTCGACAAATATTTCCATAGTAGTGATAATCCCGTCATTGCTGGAGCTCTGCTGGGAGT 1378
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 TCTCGACAAATATTTCCATAGTAACGATAATCCCGTCGTTGCTGGAGCTCTGCTGGGAGT 1546
Query 1379 TGGGATTGTTAATTGTGGCATTAAGGATGATTGTGAACCTGCATTCGCCCTTCTCGCAGA 1438
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 1547 TGGGATTGTTAATTGTGGCATTAAGAATGATTGTGACCCTGCATTTGCCCTTCTTTCAGG 1606
Query 1439 CTATATTGACAATGAGGATTCATCTGTCCGAATTGGTGCTATTATGGGTCTCGGGATTGC 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607 TTATATTGACAATGAGGATTCATCTGTCCGAATTGGTGCTATTATGGGTCTCGGGATTGC 1666
Query 1499 ATATGCGGGTTCCCAAAAAGATCAGATAAGAAGCCGTTTGTCTCCAATACTAAATGATGC 1558
|||||||||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 ATATGCGGGTTCCCAAAATGATCAGATAAAAATCAGGTTGTCTCCAATACTAAATGATGC 1726
Query 1559 AAAAGCACCTCTCGATGTGATTGCATTTGCTGCACTTAGTTTGGGGATGATTTACGTTGG 1618
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1727 CAACGCACCTCTCGATGTGATTGCATTTGCTGCACTTAGTTTGGGGATGATTTATGTTGG 1786
Query 1619 TTCATGTAACGAAGAGGTTGCGCAATCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGGAGCGAGGC 1678
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1787 TTCGTGTAACGAAGAGGTTGCACAATCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGGAGCGAGGC 1846
Query 1679 AGAACTGGGTGAAGCCCTTACTCGATTCTTGCCTCTTGGACTTGGACTTTTGTACCTTGG 1738
||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1847 AGAGCTGGGTGAAGCCCTCACTCGTTTCTTGCCTCTTGGACTTGGTCTTTTGTACCTTGG 1906
Query 1739 TAAACAGGAAAGTGTGGAGGCTACTGCGGAAGTTTCAAAGACGTTCAATGAGAAAATCAG 1798
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 CAAACAGGAAAGTGTGGAGGCTACTGCAGAAGTTTCAAAGACGTTCAATGAGAAAATCAG 1966
Query 1799 AAAGTATTGTGATATGACACTTCTTTCATGTGCATATGCTGGAACCGGGAATGTCCTTAA 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 AAAGTATTGTGATATGACACTTCTTTCATGTGCATATGCTGGAACCGGGAATGTCCTTAA 2026
Query 1859 GGTCCAAGACCTTCTGGCTCAGTGTGGAGAGCATCTGGAGAAAGGTGATATCCACCAGGG 1918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2027 GGTCCAAGACCTTCTGGCTCAGTGTGGAGAGCATCTGGTGAAAGGTGATATCCACCAGGG 2086
Query 1919 TCCAGCTGTGATTGGATTAGCTATGGTTGCTATGTCTGAGGAATTGGGTCTGGATATGGA 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 TCCAGCTGTGATTGGATTAGCTATGGTTGCTATGTCTGAGGAATTGGGTCTGGATATGGA 2146
Query 1979 GATCCGTTCTTTGGAGCGCGTGCTACAGTATGGAGAACCGAACATTCGGCGTGCAGTGCC 2038
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||
Sbjct 2147 GATCCGTTCTTTGGAGCGCGTACTACAGTATGGAGAGCAGAACATTCGACGTGCAGTGCC 2206
Query 2039 TTTGGCTCTTGGTCTCCTATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACTTTGAG 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2207 TTTGGCTCTTGGTCTCCTATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACTTTGAG 2266
Query 2099 CAGGCTAAGCCATGACACAGATTCAGAAGTTGCCATGGCAGCTATTATCTCCCTTGGATT 2158
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2267 CAGACTAAGCCATGACACAGATTCAGAAGTTGCAATGGCAGCAATTATCTCCCTTGGATT 2326
Query 2159 GATAGGCGCTGGAACCAACAATGCAAGGATAGCTGGGATGCTTAGAAATCTCTCCAGCTA 2218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2327 GATAGGCGCTGGAACCAACAATGCAAGGATAGCTGGCATGCTTAGAAATCTCTCCAGCTA 2386
Query 2219 TTATTACAAGGATGCCAACCTTCTCTTCTGTGTGCGAATTGCTCAAGGGTTTGTGCATAT 2278
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2387 TTATTACAAGGATGCCAGCCTTCTTTTCTGTGTGCGCATCGCTCAAGGGTTTGTGCATAT 2446
Query 2279 GGGAAAGGGTCTCTTAACTCTCAATCCTTTCCACTCCGAACGGCTCTTGCTATCACCAAC 2338
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2447 GGGAAAGGGTCTCTTAACTCTCAATCCTTTCCACTCCGAACGGCTCTTGCTATCGCCAAC 2506
Query 2339 CGCACTTGCTGGTATAGTGACATTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAGATCCATTATACT 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2507 CGCACTTGCTGGTATAGTGACATTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAAATCCATTATACT 2566
Query 2399 GGGGAAATACCACTATGTGCTCTACTTCCTTGTTTTGGCGATGCAGCCAAGGATGATGCT 2458
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567 GGGGAAATATCACTATGTGCTCTACTTCCTTGTTTTGGCGATGCAGCCAAGGATGATGCT 2626
Query 2459 GACAGTGGATGAGAACCTGAAGCCCATCTCGGTGCCAGTACGGGTAGGACAAGCGGTTGA 2518
||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 GACGGTGGATCAGAGCCTGAAGCCCATCTCGGTGCCAGTGCGGGTAGGACAAGCGGTTGA 2686
Query 2519 TGTGGTTGGACAGGCTGGTCGACCAAAGACAATCACTGGGTTCCAAACGCACTCAACACC 2578
||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2687 TGTGGTTGGACAGGCAGGCCGACCTAAGACAATCACTGGGTTCCAAACGCACTCAACACC 2746
Query 2579 TGTTCTCCTTGCTGCTGGGGAGAGAGCCGAACTCGCAACCGAGAAGTACATTCCGTTGTC 2638
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2747 TGTTCTCCTTGCTGCTGGGGAGAGAGCTGAACTCGCAACCGAGAAGTACATTCCGTTGTC 2806
Query 2639 GCCCATATTAGAAGGTTTCATCATATTGAAGGAAAATCCAGACTACAGAGAGGAGTAAAT 2698
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807 GCCCATATTAGAAGGTTTCGTCATATTGAAGGAAAATCCAGACTACAGAGAGGAGTAAAT 2866
Query 2699 TCAAAGTTGCAAGCATTTGAAGAAAGAGATAGAGCCTTTGAATACTTTCACTATGGTTTT 2758
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2867 CCAAAGTTGCAAGCATTTGAAGAAAGAGAGAGAGCCTTTGAATACTTTCACTACGGTT-- 2924
Query 2759 ATGTGCACATTCAGTCAAATTTTTCTTAGTTTTACTCGAGTCTGTTCCCAGGAAATGGTT 2818
|| || | ||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||
Sbjct 2925 --GT-CAAA---AGT----TTTTT---AGTTT-ATTCCCGTCTGTTCCCAGGAAATGGTT 2970
Query 2819 CACAAATCTCTCCTTTTTAA-GAAAAAGTCGTTTCATTGCAATATGTAGGAGCTTCTTGT 2877
||||| ||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2971 CACAA-TCTCTCCTTTTAAAAGAAAAAATAGCTTCATTGCAATATATAGGAACTTCTTGT 3029
Query 2878 GCACTTC---AATATC--ATTCTAAAAGCTGGATAAGTTTC 2913
||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3030 GCACTACTTTAATATCGCATTCTAAAAGCTGGATAAGTTTC 3070
> AT2G20580.1 | Symbols: RPN1A, ATRPN1A | 26S proteasome regulatory
subunit S2 1A | chr2:8858988-8864865 FORWARD LENGTH=3065
Length=3065
Score = 3038 bits (1645), Expect = 0.0
Identities = 2343/2686 (87%), Gaps = 24/2686 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGGCTCCAGTTCCGGATCCGAACAGTGTTGGCGGTGGTGCGAAGCGGGACGAAGCTACG 80
||||||||| || |||||| |||||||| || || ||||||||| || ||||||||
Sbjct 224 ATGGCTCCAACTCAGGATCCCAACAGTGTCGGAGGCGGTGCGAAGAAAGATGAAGCTACC 283
Query 81 ACGAAGGTTCCTTCTAAAGATTCCAAGAAGAAGGATGATAAGAAGGAAGAGGATCTGTCT 140
||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||
Sbjct 284 TTGAAGGTTCCGTCTAAGGATCCCAAGAAGAAGGACGAGAAAAAGGATGAGGATTTGTCT 343
Query 141 GAAGAGGACTTGCAACTAAAGCAGAACCTGGAGCTCTATGTTGAGAGAGTTCAGGACCCC 200
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 344 GAAGAGGACTTGGAACTAAAGCAGAACCTTGAGCTCTATGTTGAGAGGGTTCAGGATCCT 403
Query 201 AATCCTGAGTTACAGAAGGCTGCTCTTGAAAGCATGAGGCAGGAAATTCGAGAC-TCAAC 259
||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||
Sbjct 404 AATCCGGAATTGCAGAAGGCTGCCCTTGAGAGCATGAGGCAGGAAATCCGAG-CTTCAAC 462
Query 260 AAGCTCCATGACATCAGTTCCAAAACCCCTCAAGTTTCTCCGTCCTCATTATGGAGTTCT 319
||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||
Sbjct 463 AAGTTCCATGACTTCAGTTCCCAAACCACTAAAGTTTCTGCGTCCCCATTATGGAACTCT 522
Query 320 TAAGGAATTTCATGTAAA-AATGGCGGAGTCTGATCTCaaaaaaaT-GTTGGCTGATATA 377
||| | ||||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||| | || | |||||
Sbjct 523 TAAAGCGTTTCATG-AAACAATGGCTGATTCTGATCTC-AAAAAGTACCTGTCCGATATC 580
Query 378 CTTTCTGTCCTGGCACTGACCATGTCTGCTGAAGGTGAAAGGGAAAGCTTAAACTATAGG 437
|| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 581 CTGTCTGTCCTGGCCCTTACCATGTCTGCAGATGGTGAAAGGGAAAGCTTAAGGTTTAGA 640
Query 438 TTGACTGGATCAGAGGGTGACATCGGATCGTGGGGTCACGAGTATGTCAGGAATTTGGCC 497
|||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||
Sbjct 641 TTGATTGGAACAGAGGGTGACATTGGATCGTGGGGTCATGAATATGTCAGGAATTTAGCT 700
Query 498 GGAGAGATTGCAGAAGAGTATACAATGCGTCAGGGTGAAGAGTCCTCTATTGAAGACTTA 557
|||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| || |||
Sbjct 701 GGAGAGATTGCACAAGAGTATACAAAGCGTCAGAGTGAGGAGGCCTCTATTGACGATTTA 760
Query 558 ATGGATCTTGTGCAGCAAATTGTTTCTTTTCACATGAAGCATAATGCCGAAACCGAAGCT 617
||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 761 ATGGAGCTTGTGCAACAAATTGTTGCTTTTCACATGAAGCATAATGCAGAAACCGAAGCT 820
Query 618 GTTGACCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTGAGCATGTTGACAGCACA 677
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 821 GTTGATCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTGAGCATGTAGACAAAACA 880
Query 678 AATTTCAGGAGGACATGCAACTATCTCACGAGTGCAGCAAAGTATCTTCCAGGACCAGAT 737
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||
Sbjct 881 AATTTCAAGAGGACATGCAACTATCTCACAAGTGCAGCTAGGTACCTTCCTGGACCAGAT 940
Query 738 GACATGTTGGTTCTAGATATTGCTTACATGATCTACATTAAGTTTGCAGAATATCCAAAC 797
||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||
Sbjct 941 GACATGTTGGTTCTAGATATTTCCTACATGATTTACATGAAGTTTGAAGAGTATCCAAAC 1000
Query 798 GCGCTGCAAATTGCATTATTTCTTGACAACATGCAGTATGTGAAGCAAGTTTTTACCTCA 857
|| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 1001 GCTCTGCAGATTGCACTATTTCTTGATAACACGCAGTATGTTAAACAAGTATTTACCTCA 1060
Query 858 TGTACCGATCTGCTAAAAAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTGCACGTCATGGTATCACC 917
||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1061 TGTACGGATCTGCTGAAGAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTGCTCGTCATGGTATAACC 1120
Query 918 TTTGTGCTTGACCAGGAGATGGTTGCAAATGA-GCAGGACAGAGAAGCCCTACAGGATAT 976
|||| |||||| | |||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||||||
Sbjct 1121 TTTGAACTTGACGATGAGATGGTTGCAGATGATG-ATGACCGGGAAGCCCTACAGGATAT 1179
Query 977 TGTTAACAATACTAAGCTGAGTGAAGGATATCTGACACTTGCTAGGGATATTGAGGTCAT 1036
||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1180 TGTTAACAACACTAAGTTAAGTGAAGGATATCTGACCCTTGCAAGGGATATTGAGGTCAT 1239
Query 1037 GGAGGCCAAGACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTGCTTGATGGCAGGGTTAGCTC 1096
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||
Sbjct 1240 GGAGGCCAAAACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTACTCGACGGCAGGGCTAGCTC 1299
Query 1097 TGGTGCAAGTGTGGATTCAGCTAGACAAAATCTGTCTGCGACTTTTGTGAATGCATTTGT 1156
|||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||| || ||||| |||||||| ||
Sbjct 1300 CGGTGCAAGCGTGGATTCTGCTAGACAGAATTTGGCTGCTACCTTTGTCAATGCATTCGT 1359
Query 1157 AAATGCTGGATTCGGCCAGGACAAATTAATGACAGTGCCATCTGACTCAACCAGTGGATC 1216
||||||||| || || ||||||||| |||||||||| || || |||||||||| |||||
Sbjct 1360 AAATGCTGGTTTTGGTCAGGACAAACTAATGACAGTACCTTCAGACTCAACCACCGGATC 1419
Query 1217 AGCTGGAAACTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGCAAGACCAGTGCAGCTGCTAGTCT 1276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1420 TTCTGGAAACTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGCAAGACTAGTGCAGCTGCTAGTCT 1479
Query 1277 GGGTATGATTCAATTGTGGGATGTGAACACTGGACTAGCTCAACTCGACAAATATTTCCA 1336
||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 GGGTATGATTCAACTGTGGGATGTGGACTCTGGACTTTCCCAACTCGACAAATATTTCCA 1539
Query 1337 TAGTAGTGATAATCCCGTCATTGCTGGAGCTCTGCTGGGAGTTGGGATTGTTAATTGTGG 1396
||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1540 TAGTAATGATAATCCTATCATTGCTGGAGCACTGCTGGGAGTTGGGATTGTAAATTGTGG 1599
Query 1397 CATTAAGGATGATTGTGAACCTGCATTCGCCCTTCTCGCAGACTATATTGACAATGAGGA 1456
||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1600 CATTAAGAACGATTGTGATCCTGCATTGGCACTTCTTGGAGACTATATAGACAAAGAGGA 1659
Query 1457 TTCATCTGTCCGAATTGGTGCTATTATGGGTCTCGGGATTGCATATGCGGGTTCCCAAAA 1516
|||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||||||
Sbjct 1660 TTCATCTGTCAGAATCGGTGCTATCATGGGTCTTGGAATTTCATACGCAGGTTCCCAAAA 1719
Query 1517 AGATCAGATAAGAAGCCGTTTGTCTCCAATACTAAATGATGCAAAAGCACCTCTCGATGT 1576
|| ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1720 TGACCAGATTCGAAACAAATTGTCCCCGATACTGAATGATGCAAAAGCGCCTCTTGATGT 1779
Query 1577 GATTGCATTTGCTGCACTTAGTTTGGGGATGATTTACGTTGGTTCATGTAACGAAGAGGT 1636
||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1780 GATTGCATTTGCTTCACTTTCTTTGGGAATGATATATGTTGGTTCCTGTAACGAAGAAGT 1839
Query 1637 TGCGCAATCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGGAGCGAGGCAGAACTGGGTGAAGCCCT 1696
|| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1840 AGCCCAGTCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGAAGTGAGGCAGAACTGGGTGATGCCCT 1899
Query 1697 TACTCGATTCTTGCCTCTTGGACTTGGACTTTTGTACCTTGGTAAACAGGAAAGTGTGGA 1756
||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||
Sbjct 1900 CACTCGTTTCTTGCCACTTGGTCTTGGACTTCTATACCTGGGCAAACAGGAAAGTGTAGA 1959
Query 1757 GGCTACTGCGGAAGTTTCAAAGACGTTCAATGAGAAAATCAGAAAGTATTGTGATATGAC 1816
|||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1960 GGCTACAGCTGAAGTTTCGAAGACCTTCAATGAGAAGATTAGAAAGTATTGTGATATGAC 2019
Query 1817 ACTTCTTTCATGTGCATATGCTGGAACCGGGAATGTCCTTAAGGTCCAAGACCTTCTGGC 1876
||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2020 ACTTCTTTCTTGTGCTTATGCTGGAACTGGAAATGTCCTAAAGGTACAAGACCTTCTTGC 2079
Query 1877 TCAGTGTGGAGAGCATCTGGAGAAAGGTGATATCCACCAGGGTCCAGCTGTGATTGGATT 1936
||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 2080 TCAGTGTGGCGAGCATCTTGAGAAAGGTGACATCCACCAGGGTCCAGCTGTGCTTGGGTT 2139
Query 1937 AGCTATGGTTGCTATGTCTGAGGAATTGGGTCTGGATATGGAGATCCGTTCTTTGGAGCG 1996
||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2140 AGCAATGGTTGCTATGTCTGAAGAACTGGGAGTTGATATGGAGATCCGTTCTCTGGAGCG 2199
Query 1997 CG-TGCTACAGTATGGAGAACCGAACATTCGGCGTGCAGTGCCTTTGGCTCTTGGTCTCC 2055
| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2200 -GATGCTACAATACGGAGAACAAAACATTCGGCGTGCTGTGCCTTTGGCCCTTGGTCTCC 2258
Query 2056 TATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACTTTGAGCAGGCTAAGCCATGACA 2115
| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||
Sbjct 2259 TTTGTATATCCAATCCAAAGGTGACTGTAATGGACACCTTGAGCCGGCTTAGCCATGACA 2318
Query 2116 CAGATTCAGAAGTTGCCATGGCAGCTATTATCTCCCTTGG-ATTGATAGGCGCTGGAACC 2174
||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||| | |||| |||||||||||
Sbjct 2319 CAGATTCGGAAGTTGCCATGTCAGCAATTATATCA-TTGGGACTGATTGGCGCTGGAACT 2377
Query 2175 AACAATGCAAGGATAGCTGGGATGCTTAGAAATCTCTCCAGCTATTATTACAAGGA--TG 2232
|| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2378 AATAACGCAAGGATAGCCGGGATGCTTCGGAACCTCTCCAGCTATTATTACAAAGACATG 2437
Query 2233 CCAACCTTCTCTTCTGTGTGCGAATTGCTCAAGGGTTTGTGCATATGGGAAAGGGTCTCT 2292
| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2438 --AGTCTTCTCTTCTGTGTGCGTATTGCTCAAGGGCTTGTGCACATGGGAAAGGGTCTCT 2495
Query 2293 TAACTCTCAATCCTTTCCACTCCGAACGGCTCTTGCTATCACCAACCGCACTTGCTGGTA 2352
| || |||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2496 TGACACTCAGCCCCTTCCACTCTGAACGGTTCTTGCTATCGCCAACCGCACTTGCTGGTA 2555
Query 2353 TAGTGACA-TTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAGATCCATT-ATACTGGGGAAATACCA 2410
|||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| |||||
Sbjct 2556 TAGTGACACTT-TTGCATGCATGCCTTGACATGAAA-CCAATCATACTCGGGAAGTACCA 2613
Query 2411 CTATGTGCTCTACTTCCTTGTTTTGGCGATGCAGCCAAGGATGATGCTGACAGTGGATGA 2470
|||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2614 TTATGTGCTGTACTTCCTCGTTTTGGCGATGCAACCAAGGATGATGTTGACAGTGGATGA 2673
Query 2471 GAACCTGAAGCC-CATCTCGGTGCCAGTACGGGTAGGACAAGCGGTTGATGTGGTTGGAC 2529
||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2674 AAACCTGAAGCCAC-TGTCAGTGCCAGTGCGGGTAGGACAAGCAGTTGATGTGGTTGGGC 2732
Query 2530 AGGCTGGTCGACCAAAGACAATCACTGGGTTCCAAACGCACTCAACACCTGTTCTCCTTG 2589
| || ||||| || ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2733 AAGCGGGTCGGCCCAAGACCATAACCGGTTTCCAGACACACTCCACACCTGTTCTCCTGG 2792
Query 2590 CTGCTGGGGAGAGAGCCGAACTCGCAACCGAGAAGTACATTCCGT-TGTCGCCCATATTA 2648
||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| | ||||||| ||| ||
Sbjct 2793 CTGCTGGAGAGAGAGCCGAACTAGCCACGGACAAATACATTCC-TCTGTCGCCAATACTA 2851
Query 2649 GAAGGTTTCATCATATTGAAGGAAAATCCAGACTACAGAGAGGAGT 2694
||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2852 GAAGGATTCATCATCTTAAAGGAGAACCCAGACTACAGAGAGGAGT 2897
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 144781797498
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5