BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg945228
Length=5537
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G28080.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 5319 0.0
AT1G01320.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 521 2e-146
> AT4G28080.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr4:13948603-13957840 REVERSE LENGTH=5850
Length=5850
Score = 5319 bits (2880), Expect = 0.0
Identities = 3195/3347 (95%), Gaps = 22/3347 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2202 GGTGGCAGACTTTGGATCTCTTGAACTCTCACCCGTCGATGGAAGAACTCTTACAGACTT 2261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2145 GGTGGCAGACTTTGGATCTCTTGAACTCTCACCCGTCGATGGAAGAACTCTGACAGACTT 2204
Query 2262 TATGCACACCAGAGGCTTGCAAATGCATTCCTTGGGGAGAGTGGTCGAGCTGGCTGAAAA 2321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 TATGCACACCAGAGGCTTGCAAATGCATTCCTTGGGAAGAGTGGTCGAGCTGGCTGAAAA 2264
Query 2322 GCTCCCTCATGTGCAATCCCTCTGTGTTCATGAAATGGTTGTTCGGGCATACAAGCATAT 2381
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 2265 GCTTCCTCATGTGCAATCCCTCTGTGTTCATGAAATGATTGTTCGGGCGTACAAGCATAT 2324
Query 2382 ACTGCAGGCTGTTGTTGCAGCTGTTGAAAACACCGCTGATGTGGCCACCTCAATAGCAAC 2441
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 ACTGCAGGCTGTTGTAGCAGCTGTTGAAAACACCGCTGATGTGGCCACCTCAATAGCAAC 2384
Query 2442 ATGCTTAAATGTCCTATTGGGAACACCGTCTGACACTGATAGTGTATACGATGAAAAGAT 2501
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2385 ATGCTTAAATGTCCTATTGGGGACACCGTCTGACACTGAGAGTGTATACGATGAAAAGAT 2444
Query 2502 CAAGTGGACCTGGGTGGAAACGTTCATTTCCAAGAGGTTTGGGTGGGACTGGAAGCATGA 2561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2445 TAAGTGGACCTGGGTGGAAACGTTCATTTCCAAGAGGTTTGGGTGGGATTGGAAGCATGA 2504
Query 2562 AGGCTGCCAGGAACTGAGAAAATTCGCCATTCTTAGAGGACTGTCACACAAGGTTGGACT 2621
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 AGGCTGCCAGGAACTGAGAAAATTTTCCATTCTTAGAGGACTGTCACACAAGGTTGGACT 2564
Query 2622 GGAGCTTGTTCCTAAAGACTATGAGATGGACACTTCATATCCTTTTAAGAAGTTTGATAT 2681
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 GGAGCTTGTTCCTAAAGACTATGAGATGGACACGTCTTATCCTTTTAAGAAGTTTGATAT 2624
Query 2682 TATCAGTATGGTTCCTGTGTATAAGCACGTAGCATGTTCATCTGCTGATGGACGCACTTT 2741
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 2625 TATCAGTATGGTTCCTGTGTATAAGCACGTAGCATGTTCATCCGCAGATGGGCGCACTTT 2684
Query 2742 GTTGGAATCATCCAAAACCTCCTTAGATAAAGGAAAACTGGAGGATGCTGTCAATTATGG 2801
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2685 GTTGGAATCATCCAAAACCTCCTTAGATAAAGGCAAACTGGAGGATGCTGTCAATTATGG 2744
Query 2802 CACCAAGGCATTGGCGAAGCTTGTAGCAGTGTGCGGCCCATATCATCGAATGACCGCTGG 2861
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2745 CACCAAGGCATTGGCCAAGCTTGTAGCTGTGTGCGGCCCATATCATAGAATGACCGCTGG 2804
Query 2862 AGCATATAGTCTTCTCGCGGTTGTGCTTTACCATACTGGGGATTTTAACCAGGCTACCAT 2921
||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2805 AGCGTATAGTCTTCTCGCTGTTGTGCTGTACCATACTGGGGATTTTAACCAGGCTACCAT 2864
Query 2922 TTATCAGCAGAAAGCACTCGACATAAATGAAAGGGAACTTGGACTTGATCACCCAGACAC 2981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 TTATCAGCAGAAAGCACTCGACATAAATGAAAGGGAACTTGGACTTGATCACCCAGACAC 2924
Query 2982 TATGAAAAGCTACGGCGACCTGGCCGTCTTCTATTATCGTCTTCAGCACACAGAGTTAGC 3041
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2925 AATGAAAAGCTACGGCGACCTGGCTGTCTTCTATTATCGTCTTCAGCACACAGAGTTAGC 2984
Query 3042 TTTGAAGTACGTCAACCGTGCATTGTACCTTTTGCATCTAACATGTGGACCATCACATCC 3101
|||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 CTTGAAGTATGTCAACCGTGCCTTGTATCTTTTGCATCTAACATGTGGACCATCACATCC 3044
Query 3102 AAATACGGCTGCCACTTATATTAACGTAGCAATGATGGAAGAAGGTATGAAGAATGCCCA 3161
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3045 AAATACAGCTGCCACTTATATAAACGTAGCAATGATGGAAGAAGGTATGAAGAATGCCCA 3104
Query 3162 TGTCGCTTTAAGATACCTTCATGAAGCTTTGAAATGTAACCAGAGACTACTTGGAGCTGA 3221
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3105 TGTGGCTTTAAGATACCTTCATGAAGCATTGAAATGTAACCAGAGACTACTTGGAGCTGA 3164
Query 3222 TCATATCCAGACTGCTGCAAGCTACCATGCCATTGCTATTGCTCTCTCTCTGATGGACGC 3281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3165 TCATATCCAGACTGCTGCAAGCTACCATGCCATTGCTATTGCTCTTTCTCTGATGGACGC 3224
Query 3282 ATACTCCTTGAGCGTTCAACACGAGCAGACCACTCTGCAGATTCTACAAGCAAAGCTAGG 3341
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3225 ATACTCCTTGAGCGTTCAACATGAGCAGACCACTCTACAGATTCTACAAGCAAAACTAGG 3284
Query 3342 CCCTGAGGATCTTCGGACACAGGATGCGGCTGCGTGGCTTGAATATTTCGAGTCTAAAGC 3401
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3285 CCCTGAGGATCTTCGGACACAGGATGCGGCTGCGTGGCTTGAATATTTCGAGTCCAAAGC 3344
Query 3402 TCTGGAACAGCAAGAAGCTGCACGAAATGGTACTCCCAAGCCAGACGCCTCTATATCCAG 3461
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3345 TCTGGAACAGCAAGAAGCTGCACGAAATGGTACTCCCAAGCCAGACGCCTCTATTTCCAG 3404
Query 3462 CAAAGGCCATCTCAGTGTATCAGACCTGTTGGATTATATAACCCCGGATTCTGGTATTAA 3521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CAAAGGCCATCTCAGTGTATCAGACCTGTTGGATTATATAACCCCGGATTCTGGTATTAA 3464
Query 3522 AGCAAGGGACGCTCAAAGGAAAGCTCGCCCGAAGGTCAAGGGAAAACCAGGACAAAGTCC 3581
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3465 AGCAAGGGACGCTCAAAGGAAAGCTCGCCCAAAGGTCAAGGGAAAGCCAGGTCAAAGTCC 3524
Query 3582 AGGACCAGTGTCAGAAGAAAATCAGAAAGATGATGAAATTTTGAGTCAGGCTCATCTCAC 3641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3525 AGGACCAGTGTCAGAAGAAAATCAGAAAGATGATGAAATTTTGAGTCCGGCTCATCTCAC 3584
Query 3642 TGGGGAGAGTTCAAGTGATAAAGAGAACAAATCCGAAGCAAAATTTGAAGAGAAAAAGGT 3701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||
Sbjct 3585 TGGGGAGAGTTCAAGTGATAAAGAGAACAAATCCGAAACAAAATCTGAAGAAAAAAAGGT 3644
Query 3702 TGAGAACTTTGATTTGGAAC---C------TCAAGAACATCTGACGCTGGTTAAGCCTGA 3752
||| || ||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||| ||
Sbjct 3645 TGAAAATTTTGATTTGGAACAATCAAAACCTCAAGACCAGCTGAAGCTGGTTAAGCCCGA 3704
Query 3753 AGCCATTGTCCAAGAAGATGATGATTCTGACGAAGGATGGCAAGAAGCTGTCCCGAAAAA 3812
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3705 AGCCACGGTCCACGAAGATGATGATTCTGACGAAGGATGGCAAGAAGCTGTCCCCAAAAA 3764
Query 3813 TCGTTATTCTTCTGGGCGTAGAACACGGCCCAGCCTGGCAAAGCTGAACACCAACTTCAT 3872
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3765 TCGTTTTTCTTCTGGGCGTAGAACACGGCCCAGCCTGGCAAAGCTGAACACCAACTTCAT 3824
Query 3873 GAACGTGACCCAGCAGCCATCAAGAAGCAGAGGAAAATCCACCAATTTCACATCCCCAAG 3932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3825 GAACGTGACCCAGCAGCCATCAAGAAGCAGAGGAAAATCCACCAATTTCACATCCCCAAG 3884
Query 3933 GACTAGTTCTAATGAGCTTTCAATTTCTGTTGCTGGTTCCACTTCTTCCCCAGCCTCGAA 3992
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3885 AACCAGTTCTAATGAGCTTTCAATTTCTGTTGCTGGTTCCACTTCTTCCCCAGCCTCGAA 3944
Query 3993 GATGTTTGTAAAGAGCCCATTGAACAGAAAGCAAAACAATTCCAGTGTAGTGGGAGAAAG 4052
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3945 GATGTTTGTAAAGAGCCCATTGAACAAAAAGCAAAACAATTCCAGTGTAGTGGGAGAAAG 4004
Query 4053 ACCAGTCAACGATAAATCAGGCCCAG-CAAGCCCAGCTTGCACTGAACAGATCAACAAGC 4111
|||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4005 ACCAGTCAACGATAAATCAG-CCCTGGCAAGCTCAGCTTGCACTGAACAGATCAACAAGC 4063
Query 4112 CAACTCCGATGGTGAGTCCTGTCACTCCTGTGAGTGTCAAAGCTGGAAAACTGTTTTCCT 4171
||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4064 CAACTCCGATGTTGAGTCCTGT-------G--AGTGTCAAAGCTGGAAAACTGTTTTCCT 4114
Query 4172 ATAAGGAGGTTGCACTGGCACCCCCTGGAACGATTGTTAAAATAGTTGCAGAGCAGTTGC 4231
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4115 ATAAGGAGGTTGCACTGGCTCCCCCTGGAACGATTGTAAAAATAGTTGCAGAGCAGTTGC 4174
Query 4232 CAGAAGAAACGAAGGCCCCAGAGATTTTGGAAACGGCAAAAATTGCAGTAGATGGTCCTG 4291
|||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4175 CAGAAGAAACAAAGGCCCCACAGAATTTGGATGCGGCAAAAATTGCAGTAGATGGTCCTG 4234
Query 4292 AACAAGTTAATGCTCAGGATGCTGAGAGCGAGAATAAGCATGTGGCTACAGAAATGGAAG 4351
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4235 AAAAAGTTAATGCTCAGGATGCTGAGAGCGAGAATAAGCATGTGGCTACAGAAACGGAAG 4294
Query 4352 CCGAAAGCACTGATAGCGGTGAACGAGGAGGGGTGGTTGTTGGTGGATCGGAGTTGACTA 4411
| |||| ||||||| || ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4295 CGGAAAACACTGATTGCAATGAACAAGGAAGAGTTGTTGTTGGTGGATCGGAGTTGACTA 4354
Query 4412 GTTCTCCAAAGGAAATCAAGAATGTGGAGGCCGAGAAGGCAGCTGAAGAAGCATTTCCAA 4471
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4355 GTTCTCCAAAGGAAATCAAGAATGTGGAGGTCGAAAAGGCAGCTGAAAAAGCATTTCCAA 4414
Query 4472 CT-GAGACAGCCGTATCAAATGCAAGACAAGGAAAATCTGAGAGTGCACAAATGGCTGAG 4530
| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4415 -TAGAAACAGCCGTATCAAATGCAAGACCAGGAAAATCTAAGAGTGCACAAATGGCTGAG 4473
Query 4531 GATTCAAATAAATGTCTCTTGAATAAGTCACTAACAGCAAATGATTCAAATGGCAGTGAA 4590
|||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4474 GATTCAGATACATGTCTCTTGAATAAGTCACCAACAGCAAATGATTCAAATGGCAGTGAA 4533
Query 4591 TCAGTTATTGGAGTGAAGCTACAAAAGGATTTATCTGATGCTGAACTGAAACCAGTAGAT 4650
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4534 TCAGTTATTGGAGTGAAGCTTCAAAAGGATTTATGTGATGCTGAACTGAAAACAGTAGAT 4593
Query 4651 GGCGAAACAGAAAATCTGCCCAATGGAGACTCAAGCCCAAAGTCATCAATAGCTGCAGAT 4710
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4594 GGTGAAACCGAAAATCTGCCCAATGGAGACTCAAGCCCAAAGTCATCAGTAGCTGCAGAT 4653
Query 4711 GGAGAAAAGCAAGACGCGTGCGAGGCTCAAAAAGAGATGAGCAAGAAGCTCTCTGCTTCT 4770
|||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4654 GGAGAAAAGCAAGATGCATGTGAGGCACAAAAAGAGATGAGCAAGAAGCTCTCTGCTTCT 4713
Query 4771 GCACCGCCGTATACCCCAACCACCATTCCAATATTTGGATCAATTGCAGTTCCAGGATTC 4830
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4714 GCACCGCCGTATACCCCAACAACCATTCCAATATTTGGATCAATTGCAGTTCCAGGATTC 4773
Query 4831 AAAGAGCACGGAGGAATCCTCCCCTCTCCATTGAATATGCCACCAATGCTTCCTGTTAAC 4890
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4774 AAAGACCACGGTGGAATCCTCCCCTCTCCATTGAATATGCCACCAATGCTTCCTATTAAC 4833
Query 4891 CATGTCCGCAGATCTACTCCTCATCAGTCTGTAACAGCTCGAGTTCCTTATGGGCCTAGA 4950
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4834 CATGTCCGCAGATCAACTCCTCATCAGTCTGTAACAGCTCGAGTTCCTTATGGGCCTAGA 4893
Query 4951 CTCTCGGGTGGTGGTTACAACCGATCTGGAAACAGGGTTCTGCGTAACAAACCAAGCTTC 5010
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4894 CTCTCTGGTGGTGGTTACAACCGATCTGGAAACAGGGTTCCGCGTAACAAACCAAGCTTC 4953
Query 5011 CCCAATAGCACCGAGTCCAATGGCGAGGCTAATCAATTCAATGGCCCAAGAATAATGAAC 5070
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4954 CCCAATAGCACCGAGTCCAATGGTGAGGCTAATCAATTCAATGGCCCAAGAATAATGAAC 5013
Query 5071 CCCCATGCGGCTGAGTTCATACCGAGTCAACCTTGGGTTTCTAATGGGTATCCAGTGTCA 5130
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5014 CCCCATGCTGCTGAGTTCATACCGAGTCAACCTTGGGTTTCTAATGGGTATCCAGTGTCA 5073
Query 5131 CCAAATGGCTATTTAGCATCCCCAAATGGGGCAGAAATAACACAGAATGGGTATCCACTG 5190
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 5074 CCAAATGGCTATTTAGCATCCCCAAATGGTGCAGAAATAACACAGAATGGGTACCCTTTG 5133
Query 5191 TCACCAGTAGCAGGTGGATATCCATGTGACATGTCCGTTACACAGCCTCAGGATGGACTT 5250
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5134 TCACCAGTAGCAGGTGGATATCCGTGTAACATGTCCGTTACACAGCCTCAGGATGGACTT 5193
Query 5251 GTTTCGGAGGAATTACCTGGTTCTGGAAGCTCTGAGGAGAAGAGCGGAAGCGAAGAAGAA 5310
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5194 GTTTCAGAGGAATTACCTGGTGCTGGAAGCTCTGAGGAGAAGAGCGGAAGCGAAGAAGAA 5253
Query 5311 AGCAACAACGAGAAAAAAGCTGGAGAGGATGAAGAAGCCGTTGTACAAGAAACTTCAGAT 5370
||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 5254 AGCAACAACGACAAAAATGCTGGAGAGGATGACGAAGCCGTTGGACAAGAAACTACAGAT 5313
Query 5371 ACACCTGAAAATGGACATTCGACAGTAGGTGAAGTGGAAACTACATCACATGAGACCTCT 5430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
Sbjct 5314 ACACCTGAAAATGGACATTCGACAGTAGGTGAAGTGGAAACCACATCACATGAGACTTGT 5373
Query 5431 GATGAGAAAAATGGAGAACGACAGGGAGGCAAGTGCTGGGGAGATTACAGCGATAATGAA 5490
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5374 GATGAGAAAAATGGAGAACGACAAGGAGGCAAGTGCTGGGGAGATTACAGCGATAATGAA 5433
Query 5491 ATTGAGCAAATTGAAGTTACAAGTTGAAGAAGCAACTGTCTGTCACT 5537
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 5434 ATCGAGCAAATTGAAGTTACAAGTTGAAGACGCAACTGTCTGTTACT 5480
Score = 3489 bits (1889), Expect = 0.0
Identities = 2064/2150 (96%), Gaps = 6/2150 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 22 ATGGCTCCTAAAGCTGGGAAAACAAAGCCACACaagagtaaaggagagaagaagaagaag 81
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCCTAAAGCGGGGAAAACAAAGCCACACAAGAGTAAAGGAGAGAAGAAGAAGAAG 60
Query 82 gaagagaaagTTTTGCCCACTGTCATTGAGATAAGTGTTGAAACACCAGACGAATCCCAA 141
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 GAAGAGAAAGTTTTGCCCACTGTCATTGAGATAAGTGTTGAAACACCAGATGAATCCCAA 120
Query 142 GTGACACTCAAGGGTATCTCCACAGACAGAATCTTAGATGTAAGGAAGCTCTTGGCGGTC 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTGACACTCAAGGGTATCTCCACAGACAGAATCTTAGATGTGAGGAAGCTCTTGGCGGTC 180
Query 202 CATGTTCAGACATGCCACTTCACCAACTtctctctctctcACCAGGTGCGTGGCACTAGA 261
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 181 CATGTTCAGACATGCCACTTCACCAACTTCTCTCTCTCTCACCAGGTGCGTGGCACTAAA 240
Query 262 CTCAAGGATTCCGTTGACATCGTATCGCTCAAGCCTTGCCACCTCACCATCGTCGAAGAG 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||
Sbjct 241 CTCAAGGATTCCGTTGACATCGTATCGCTCAAGCCCTGCCACCTCACTATTGTTGAAGAG 300
Query 322 GATTATACGGAGGAGCAAGCCACCGCGCACATACGGCGGCTCCTCGATATCGTCGCTTGC 381
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 GACTATACGGAGGAGCAAGCCACCGCGCACATACGGCGGCTCCTCGACATCGTCGCTTGC 360
Query 382 ACCACCGCATTCGGTCCGTCGAAACCGCCGGTGTCTCGCACGCCTCCTAAGGATTCTGAA 441
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 361 ACCACCGCATTTGGTCCGTCGAAACCCCCGGTGTCTCGTACGCTTCCTAAGGATTCTGAA 420
Query 442 AAGAAGGAGTCAGGCTCGACGGATGGAGATTCTCCGGCCGAAAAGGATGCCGGTGATTCA 501
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 421 AAGAAGGAGTCAGGCTCGACGGATGGAGATTCTCCGACCGAAAAAGATGCCGGTGATTCA 480
Query 502 AATTCCGGTCTCAGCCCTAAATCTAAGGAATCAGAGAGGAAATCCGTCGGCGGATGTGAG 561
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 481 AATTCCGGTCTCAGCCCTAAACCTAAGGAATCAGAGAAGAAATCCGTCGGCGCATGTGAG 540
Query 562 GCTCAGTCGGTGGAAGGAGCGGCTAAGAGTGACATCGACATGTGCCCACCGACTCGTCTC 621
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCTCAGTCGGCGGAAGGAGCGGCCAAGAGTGACATTGACATGTGCCCACCGACTCGTCTC 600
Query 622 GGACAATTTTACGAATTTTTCTCCTTCTCCTACCTTACTCCTCCAATTCAATATATCAGA 681
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 601 GGACAATTTTACGAATTTTTCTCATTCTCCTACCTTACTCCTCCGATTCAATACATCAGA 660
Query 682 AGGTCTGTTCGTCCATCTAAAGATGATAAAGGATTAGATGATTTGTTTCAAGTCGATATT 741
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 661 AGGTCTGTTCGTCCATCCAAAGAGGATAAAGGATTAGATGATTTGTTTCAAATCGATATT 720
Query 742 AAAGTTTCAAGTGGGAAGCCATTCACGGTTGTTGCTTCAAGAACAGGTTTTTATCCAGCT 801
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 721 AAAGTTTCAAGTGGGAAGCCGTTCACGGTTGTTGCTTCAAGAACAGGTTTTTATCCACCT 780
Query 802 GGGAAACAGCAGCTTCTGTGTCACTCTTTGGTTGAGTTGCTGCAACAGATAAGCCGGCCT 861
||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGGAAACAGCAACTTCTGTGCCACTCCTTGGTTGAGCTGCTGCAACAGATAAGCCGGCCA 840
Query 862 TTTGATGCGGCTTATGATGCTCTTATGAAAGCTTTCATTGAGCACAATAAGTTTGGCAAC 921
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTTGATGCGGCTTATGACGCTCTTATGAAAGCTTTCATTGAGCACAATAAGTTTGGCAAC 900
Query 922 CTTCCTTATGGTTTCCGGGCAAACACTTGGGTAGTTCCTCCCGTTGTTGCAGATAGTCCA 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTTCCTTATGGTTTCCGGGCAAACACTTGGGTAGTTCCTCCGGTTGTTGCAGATAGTCCA 960
Query 982 TCTACTTTTCCGTCACTTCCAGTGGAGGATGAGACATGGGGAGGGGATGGTGGTGGGGTT 1041
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCTACTTTTCCGTCACTTCCAGTGGAGGATGAGACATGGGGAGGGGATGGTGGTGGGGTA 1020
Query 1042 GGCCGGTCTGGGAAGTATGACCAAAGAAAGTGGGCAAAGGAATTTGCGATTTTGGCTGCA 1101
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1021 GGCCGGTCTGGAAAGTATGACAAAAGAAAGTGGGCTAAGGAATTTGCCATTTTGGCAGCA 1080
Query 1102 ATGCCTTGTAAAACACCTGAAGAGAGACAGGTTCGAGATAGGAAGGCCTTCCTACTCCAC 1161
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1081 ATGCCTTGTAAAACACCTGAAGAGAGACAGGTTCGAGATAGGAAGGCCTTTCTACTCCAC 1140
Query 1162 AGTTTATTTGTCGACGTTTCAGTTTTCAAAGCAGTGGAAATAATAAAAAATG-TAGTAGA 1220
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 1141 AGTTTATTTGTCGACGTTTCAGTTTTCAAAGCAGTGGAAATAATAAAAAA-GATAGTAGA 1199
Query 1221 GAGTAATCAACGCTCACCAAAGGATCCTGCTGCATTGGGTTTCCAAGAAGAAAGAATAGG 1280
|| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1200 GAATAATCAATGCTCACTTAAGGATCCTGCTGCATTGGGTTTCCATGAAGAAAGAATAGG 1259
Query 1281 TGATTTGATCATAAGGGTGGCTAGAGATGATCCTGACGCCAGTGCCAAGCTTGACCGAAA 1340
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1260 TGATTTGATCGTAAGGGTGGCTAGAGATGATCCTGACGCCAGTGCCAAGCTTGACCGGAA 1319
Query 1341 GAGTGATGGGATCCAGGTTCTAGAGATCTCTCAGGAAGAGCTTGCTCAAAGGAATTTGCT 1400
||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GAGCGATGGGACCCAGGTTCTGGAGATTTCTCAGGAAGAGCTTGCTCAAAGGAATTTGCT 1379
Query 1401 TAAAGGGATCACTGCTGATGAGAGTGCGACAGTTCATGATACTTCTACCTTGGGGGTGGT 1460
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1380 TAAAGGGATCACTGCTGATGAGAGTGCGACAGTTCATGATACGTCTACTTTGGGGGTGGT 1439
Query 1461 GGTTGTAAGGCATTGTGGTTTTACAGCCATTGTAAAGGTTGCTCCTGAATTTAAGTTAAA 1520
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 1440 GGTTGTAAGACATTGTGGTTGTACAGCCATTGTAAAGGTTGCTTCTGAATTTAAGTTGAA 1499
Query 1521 TGATGGCCAGATCCTACAGGATATTGACATTGAAGAGCAATCCGAAGGAGGTGCAAATGC 1580
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TGATGGCCATATCCTACAGGATATTGACATTGAAGACCAATCCGAAGGAGGTGCAAATGC 1559
Query 1581 ACTGAATGTAAATAGCTTGAGAAGTCTATTGCACAAGTCGTCAACACCTTCTAGCTTAGC 1640
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1560 ACTGAATGTAAATAGCTTGAGAACTCTATTGCACAAGTCGTCAACGCCTTCTAGCTTAGC 1619
Query 1641 TCAGAGATCACCAAATGCAGACTCGGAACAAATACGTGTGGCTAAGTCTCTTGTGAGGAA 1700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 ACAGAGATCACCAAATGCAGACTCGGAACAAATACGTGTGGCTAAGTCTCTTGTGAGGAA 1679
Query 1701 AGTAATCGAGGATAGTTTAAAGAAATTGGAGATTGAGCCCTCAAGA-A-ACGCTAAGCCT 1758
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||
Sbjct 1680 AGTAATCGAGGATAGTTTGAAGAAATTGGAGATTGAGCCCTCAAGATATA-G-TAAGCCG 1737
Query 1759 ATAAGGTGGGAATTAGGAGCTTGTTGGGTGCAACATCTACAAAATCAAGCTTCAAGTAAA 1818
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 ATAAGGTGGGAATTAGGAGCCTGTTGGGTGCAACATCTGCAAAATCAAGCTTCAAGTAAA 1797
Query 1819 AGTGAGTCTAAGAAAACTGAAGATGCTAAGCCTGAACCAGCTGTTAAGGGTCTTGGAAAG 1878
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1798 AGTGAGTCTAAGAAAACTGAAGATCCCAAGCCTGAACCAGCTGTCAAGGGTCTTGGAAAG 1857
Query 1879 CAAGGTGCACTGCTGAAGGAGATAAAAAGGAAGATCGATGTGAAAGCTAACAAGACTGAA 1938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 CAAGGTGCACTGCTGAAGGAGATAAAAAGGAAGATCGATGTGAAAGCTAACAAGACTGAA 1917
Query 1939 CAGGGCAAAGAGGCCCTTGCTAATGACACTGACAATAAATCAGAAACTGAGGATCAGAAG 1998
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1918 CAGGGCAAAGAGGCCCCTGCTAATGACACTGACAATACATCAGAGACTGAGGATCAAAAG 1977
Query 1999 GAACTCGAGAAACATAACGAGGAAATGGAAAAGATGTGGAAAGAACTGGTGACAGAAACT 2058
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 GAACTCGAGAAACAAAACGAGGAAATAGAAAAGATGTGGAAAGAACTGGTGACAGAAACT 2037
Query 2059 GCATATCAGCGCCTTAAAGAATCAGAAACTGGTTTCCATCTCAAGTCACCCAAAGAGCTG 2118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 GCATATCAGCGCCTTAAAGAATCAGAAACTGGTTTCCATCTCAAGTCACCCAAAGAGCTG 2097
Query 2119 ATTGAAATGGCCCGCAAATACTACACTGACACTGCTCTTCCAAAACTGGT 2168
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 ATTGAAATGGCCCGCAAATATTACACTGACACTGCTCTTCCAAAACTGGT 2147
> AT1G01320.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr1:121124-130570 REVERSE LENGTH=6015
Length=6015
Score = 521 bits (282), Expect = 2e-146
Identities = 643/816 (79%), Gaps = 29/816 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 2705 AGCACGTAGCATGTTCATCTGCTGATGG-ACGC-ACTTTGTTGGAATCATCCAAAACCTC 2762
|||| | ||||||||||||||||||||| | || || || |||| ||||| ||||| |
Sbjct 2861 AGCAAGCAGCATGTTCATCTGCTGATGGAAGGCAAC-TT-CTGGAGTCATCTAAAACAGC 2918
Query 2763 CTTAGATAAAGGAAAACTGGAGGATGCTGTCA-ATTATGGCACCAAGGCAT-TGGCGAAG 2820
||||| |||||||| || || ||||| || | | ||||| || ||||| | | || ||
Sbjct 2919 TTTAGACAAAGGAAAGCTTGAAGATGCAGTTACA-TATGGAACGAAGGC-TCTTGCTAAA 2976
Query 2821 CTTGTAGCAGTGTGCGG-CCCATATCATC-GAATGACCGCTGGAGCATATAGTCTT-CTC 2877
|| |||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||| || ||||| || ||| || ||
Sbjct 2977 CTCGTAGCAGTTTGCGGTCCC-TATCA-CAGAATGACAGCCGGAGCTTACAGT-TTACTT 3033
Query 2878 GCGGTTGTGCTTTACCATACTGGGGATTTTAACCAGGCTACCATTTATCAGCAGAAA-GC 2936
|| || || || || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||| ||
Sbjct 3034 GCTGTGGTTCTATATCACACTGGTGACTTTAACCAGGCTACAATATATCAGCA-AAAGGC 3092
Query 2937 ACTCGACATAAATGAAAGGGAACTTGGACTTGATCACCCAGACACTATGAAAAGCTACGG 2996
| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||
Sbjct 3093 TTTAGACATCAATGAGAGGGAACTTGGACTTGATCATCCAGATACAATGAAGAGTTATGG 3152
Query 2997 CGACCTGGCCGTCTTCTATTATCGTCTTCAGCACACAGAGTTAGCTTTGAAGTACGTCAA 3056
|| || || |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||| | ||||| || ||
Sbjct 3153 TGATCTTGCTGTCTTCTATTATAGGCTTCAGCATACAGAGCTGGCTCTCAAGTATGTTAA 3212
Query 3057 CCGTGCATTGTACCTTTTGCATCTAACATGTGGACCATCACATCCAAATACGGCTGCCAC 3116
||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3213 GCGTGCGTTGTATCTCTTACATCTCACATGCGGTCCATCTCATCCAAATACTGCTGCTAC 3272
Query 3117 TTATATTAACGTAGCAATGATGGAAGAAGGTATGAAG-AATGCCCATGTCGCTTTAAGAT 3175
|| || || ||||| |||||||| |||||| | | | |||| ||||| || || || |
Sbjct 3273 ATACATCAATGTAGCCATGATGGAGGAAGGTCT-AGGAAATGTGCATGTTGCCTTGAGGT 3331
Query 3176 ACCTTCATGAAGCTTTGAAATGTAACCAGAGACTACTTGGAGCTGATCATATCCAGACTG 3235
| ||||| ||||| | || ||||| || || | ||||| | || |||||||||||||
Sbjct 3332 ATCTTCACAAAGCTCTCAAGTGTAATCAAAGGTTGCTTGGTCCGGACCATATCCAGACTG 3391
Query 3236 CTGCAAGCTACCATGCCATTGCTATTGCTCTCTCTCT-GATGGACGCATACTCCTTGA-G 3293
||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| |||||| | || | |
Sbjct 3392 CTGCAAGCTACCATGCCATAGCAATTGCGCTCTC-CTTGATGGAGGCATAC-CATTTAAG 3449
Query 3294 CGTTCAACACGAGCAGACCACTCTGCAGATTC-TACAAGCAAAGCTAGGCCCTGAGGATC 3352
||||| || ||||| || || || ||| || | | ||||||||| || || || |||
Sbjct 3450 TGTTCAGCATGAGCAAACAAC-CTTAAGAATCCTTCGAGCAAAGCTGGGGCCAGATGAT- 3507
Query 3353 TT-CGGACACAGGATGCGGCTGCGTGGCTTGAATA-TTTCGAGTCTAAAGCTCTGGAACA 3410
|| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||| || ||| | |||||
Sbjct 3508 TTACGTACTCAGGATGCTGCTGCTTGGCTAGAATACTTT-GAGTCCAAGGCTTTTGAACA 3566
Query 3411 GCAAGAAGCTGCACGAAATGGTACTCCCAAGCCAGACGCCTCTATATCCAGCAAAGGCCA 3470
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 3567 ACAAGAAGCTGCGCGAAATGGTACTCCTAAGCCAGACGCGTCTATAGCCAGCAAAGGCCA 3626
Query 3471 TCTCAGTGTATCAGACCTGTTGGATTATAT-AACCC 3505
|| ||||| || || || | || ||||| |||||
Sbjct 3627 CCTAAGTGTTTCCGATCTACTCGACTATATCAACCC 3662
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 276419855930
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5