BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G09570.1
Length=3829
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg471053 jgi|Araly1|471053|fgenesh2_kg.1__1007__AT1G09570.1 6268 0.0
> Ahg471053 jgi|Araly1|471053|fgenesh2_kg.1__1007__AT1G09570.1
Length=3795
Score = 6268 bits (3394), Expect = 0.0
Identities = 3677/3812 (96%), Gaps = 25/3812 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGGGCATACGTATTCGGGGTGGTCCCATTCA---TCGTCGTCGTCTGTGTTAGGGAGCAC 57
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGGGCATGCGTATTCGGGGTGGTCCCATTCATCGTCGTCGTCGTCTGTGTTAGGGAGCAC 60
Query 58 AAATAATAGAGAGGCGTAGCACAAGAGAGAAGGTGGTGATCGAGGCCAAGATTTAGAATT 117
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 61 AAATAATAGAGAGGCGTAGCAGAAGAGAGAAGGCGGTGATCGAGGTCAAGATTTAG---- 116
Query 118 TAACTATAACAAAAAGCCTCTGACGAGTGTGACTAGTCACAAGATCTGATCATGGcttct 177
|||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 117 -----------AAAA-CCTCTGAAGAGTGTGACTAGACACGAGATCTGATCATGGCTTCT 164
Query 178 tgaaacttcttcttcttc--t-ttcttctcttTAAAGGaaaaaaaTGTCAGGCTCTAGGC 234
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 165 TGAAACTTCTTCTTCTTCTTTCTTCTTCTCTTTAAAGGAAAAAAATGTCAGGGTCTAGGC 224
Query 235 CGACTCAGTCCTCTGAGGGCTCAAGGCGATCAAGGCACAGCGCTAGGATCATTGCGCAGA 294
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 225 CGACTCAGTCCTCTGAGGGCTCGAGGCGATCAAGGCACAGCGCTAGGATCATTGCGCAGA 284
Query 295 CCACTGTAGATGCGAAACTCCATGCTGATTTTGAGGAGTCAGGCAGCTCCTTTGATTACT 354
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 CCACTGTAGATGCGAAGCTCCATGCTGATTTTGAGGAGTCAGGCAGCTCCTTTGATTACT 344
Query 355 CAACCTCAGTGCGTGTCACTGGCCCGGTTGTGGAGAATCAGCCACCAAGGTCTGACAAAG 414
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
Sbjct 345 CAACCTCAGTGCATGTCACTGGCCCGGGCGTGGAGAACCAGCCACCGAGGTCTGACAAGG 404
Query 415 TTACCACGACTTATCTTCATCATATACAGAAGGGAAAGCTGATTCAGCCCTTCGGTTGTT 474
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 TTACCACGACTTATCTTCATCACATACAGAAGGGAAAGCTGATTCAGCCCTTCGGTTGTT 464
Query 475 TACTTGCCTTGGATGAGAAGACCTTCAAAGTTATTGCATACAGCGAGAATGCATCTGAGC 534
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 TGCTTGCCTTGGATGAGAAGACCTTCAAAGTCATTGCATACAGCGAGAATGCATCTGAGC 524
Query 535 TGTTGACAATGGCCAGTCATGCAGTTCCTAGTGTTGGCGAACACCCTGTTCTAGGCATTG 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 TGTTGACAATGGCCAGTCATGCAGTTCCTAGTGTTGGTGAACACCCTGTTCTAGGCATTG 584
Query 595 GGACAGATATAAGGAGTCTTTTCACTGCTCCTAGTGCGTCTGCATTGCAGAAAGCCCTTG 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 GGACAGATATAAGGAGTCTTTTCACTGCTCCTAGTGCCTCTGCATTGCAGAAAGCCCTTG 644
Query 655 GATTTGGAGATGTCTCTCTTTTGAATCCCATTCTTGTGCACTGCAGGACTTCTGCAAAGC 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 645 GATTTGGAGATGTCTCTCTTTTGAATCCCATTCTTGTGCACTGCAAGACTTCTGCCAAGC 704
Query 715 CCTTTTATGCGATTATCCACAGGGTTACAGGGAGCATCATCATCGACTTTGAACCCGTGA 774
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 705 CCTTTTATGCGATTATCCACCGGGTTACAGGGAGCATCATCGTCGACTTTGAACCGGTGA 764
Query 775 AGCCTTATGAAGTCCCCATGACAGCTGCTGGTGCCTTACAATCATACAAGCTCGCTGCCA 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 AGCCTTATGAAGTCCCCATGACAGCTGCTGGTGCCTTACAATCATACAAGCTCGCTGCCA 824
Query 835 AAGCAATCACTAGGCTGCAATCTTTACCCAGCGGGAGTATGGAAAGGCTTTGTGATACAA 894
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 825 AAGCAATCACTAGGTTGCAATCTTTACCCAGCGGGAGCATGGAAAGGCTTTGCGATACAA 884
Query 895 TGGTTCAAGAGGTTTTTGAACTCACGGGGTATGACAGGGTGATGGCTTATAAGTTTCATG 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 TGGTTCAAGAGGTTTTTGAACTCACGGGGTATGACAGGGTGATGGCTTATAAGTTTCATG 944
Query 955 AAGATGATCACGGTGAGGTTGTCTCCGAGGTTACAAAACCTGGGCTGGAGCCTTATCTTG 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 945 AAGATGATCACGGTGAGGTTGTCTCCGAGGTTACAAAACCTGGGCTGGAGCCTTATCTTG 1004
Query 1015 GGCTGCATTATCCTGCCACCGACATCCCTCAAGCAGCCCGTTTTCTGTTTATGAAGAACA 1074
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 GGCTGCATTATCCAGCCACCGACATCCCTCAAGCAGCCCGTTTTCTGTTTATGAAGAACA 1064
Query 1075 AGGTCCGGATGATAGTTGATTGCAATGCAAAACATGCTAGGGTGCTTCAAGATGAAAAGC 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 AGGTCCGGATGATAGTTGATTGCAATGCAAAACATGCTAGGGTGCTTCAAGATGAAAAGC 1124
Query 1135 TTTCCTTTGACCTTACCTTGTGTGGCTCCACCCTTAGAGCACCGCACAGCTGCCATTTGC 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 TTTCCTTTGACCTTACCTTGTGTGGCTCCACCCTTAGAGCACCGCACAGCTGCCATTTGC 1184
Query 1195 AGTACATGGCCAACATGGATTCAATTGCATCTCTGGTTATGGCGGTTGTAGTTAACGAGG 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGTACATGGCCAACATGGATTCAATTGCATCTCTGGTTATGGCGGTTGTAGTTAACGAGG 1244
Query 1255 AAGATGGAGAAGGGGATGCTCCTGATGCTACTACACAGCCTCAAAAGAGAAAGAGACTAT 1314
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 AAGATGGAGAAGGGGATGCTCCTGATTCTACTACACAGCCTCAAAAGAGAAAGAGACTAT 1304
Query 1315 GGGGTTTAGTGGTTTGTCACAATACGACTCCGAGGTTTGTTCCATTTCCTCTCAGGTATG 1374
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 GGGGTTTAGTGGTTTGTCACAACACAACTCCGAGGTTTGTTCCATTTCCTCTCAGGTATG 1364
Query 1375 CCTGTGAGTTTCTAGCTCAAGTGTTTGCCATACACGTCAATAAGGAGGTGGAACTCGATA 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1365 CCTGTGAGTTTCTAGCTCAAGTGTTTGCCATACACGTCAATAAGGAGGTGGAACTGGAGA 1424
Query 1435 ACCAGATGGTGGAGAAGAACATTTTGCGCACGCAGACACTCTTGTGCGATATGCTGATGC 1494
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1425 ACCAGATGGTGGAGAAGAACATTTTGCGTACGCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGC 1484
Query 1495 GTGATGCTCCACTGGGTATTGTGTCGCAAAGCCCCAACATAATGGACCTTGTGAAATGTG 1554
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 GTGATGCTCCACTTGGTATTGTGTCGCAAAGCCCCAACATAATGGACCTTGTGAAATGTG 1544
Query 1555 ATGGAGCAGCTCTCTTGTATAAAGACAAGATATGGAAACTGGGAACAACTCCAAGTGAGT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 ATGGAGCAGCTCTCTTGTATAAAGACAAGATATGGAAACTGGGAACAACTCCAAGTGAGT 1604
Query 1615 TCCACCTGCAGGAGATAGCTTCATGGTTGTGTGAATACCACATGGATTCAACGGGTTTGA 1674
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1605 TCCATCTGCAGGAGATAGCTTCATGGTTGTGTGAATACCACTTGGATTCAACGGGTTTGA 1664
Query 1675 GCACTGATAGTTTGCATGACGCCGGGTTTCCTAGGGCTCTATCTCTCGGGGATTCGGTAT 1734
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665 GCACTGATAGTTTGCATGACGCTGGGTTTCCTAAGGCTCTATCTCTCGGGGATTCGGTAT 1724
Query 1735 GTGGGATGGCAGCTGTGAGGATATCATCGAAAGACATGATTTTCTGGTTCCGTTCTCATA 1794
|||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 GTGGAATGGCGGCTGTGAGGATATCATCCAAAGACATGATTTTCTGGTTCCGTTCTCATA 1784
Query 1795 CCGCTGGTGAAGTGAGATGGGGAGGTGCGAAGCATGATCCAGATGATAGGGATGATGCAA 1854
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 CTGCTGGTGAAGTGAGATGGGGAGGTGCAAAGCATGATCCAGATGATAGGGATGATGCAA 1844
Query 1855 GGAGAATGCACCCAAGGTCATCGTTCAAGGCTTTCCTTGAAGTGGTCAAGACAAGGAGTT 1914
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 GGAGAATGCACCCGAGGTCATCGTTCAAGGCTTTCCTTGAAGTGGTCAAGACAAGGAGTT 1904
Query 1915 TACCTTGGAAGGACTATGAGATGGATGCCATACACTCCTTGCAACTTATTTTGAGGAATG 1974
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1905 TACCTTGGAAGGACTATGAGATGGATGCCATTCACTCCTTGCAACTTATTCTGAGGAATG 1964
Query 1975 CTTTCAAGGATAGTGAAACTACTGATGTGAATACAAAGGTCATTTACTCGAAGCTAAATG 2034
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||
Sbjct 1965 CTTTCAAGGATGGTGAAACTACTGATGTGAATACAAATGTCATTCACTCAAAGCTAAATG 2024
Query 2035 ATCTCAAAATTGATGGTATACAAGAACTAGAAGCTGTGACCAGTGAGATGGTTCGTTTAA 2094
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2025 ATCTAAAAATTGATGGTATACAAGAATTAGAAGCTGTGACCAGTGAGATGGTTCGTTTGA 2084
Query 2095 TTGAGACTGCTACGGTGCCAATATTGGCGGTTGATTCTGATGGACTGGTTAATGGTTGGA 2154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2085 TTGAGACTGCTACGGTGCCAATATTGGCGGTTGATTCTGATGGATTGGTTAATGGTTGGA 2144
Query 2155 ACACGAAAATTGCTGAGCTGACTGGTCTTTCGGTTGATGAAGCAATCGGGAAGCATTTCC 2214
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2145 ACACGAAAATTGCTGAGCTGACTGGTCTTACGGTTGATGAAGCAATCGGGAAGCATCTCC 2204
Query 2215 TCACACTTGTTGAAGATTCTTCAGTGGAAATCGTTAAAAGGATGCTAGAGAACGCATTAG 2274
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2205 TCACACTTGTTGAAGATTCTTCAGTAGAAATCGTCAAAAGGATGCTAGAGAATGCATTAG 2264
Query 2275 AAGGAACTGAGGAGCAGAATGTCCAGTTTGAGATCAAGACACATCTGTCCAGGGCTGATG 2334
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 AAGGAACTGAAGAGCAGAATGTCCAATTTGAGATCAAGACACATCTGTCCAGGGCTGATG 2324
Query 2335 CTGGGCCAATAAGTTTAGTTGTAAATGCATGCGCAAGTAGAGATCTCCATGAAAACGTGG 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 CTGGGCCAATAAGTTTAGTTGTAAATGCATGCGCAAGTAGAGATCTCCATGAAAACGTGG 2384
Query 2395 TTGGGGTGTGTTTTGTAGCCCATGATCTTACTGGCCAGAAGACTGTGATGGACAAGTTTA 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2385 TTGGGGTGTGTTTTGTAGCCCATGATCTTACTGGCCAGAAGACTGTGATGGACAAGTTTA 2444
Query 2455 CGCGGATTGAAGGTGATTACAAGGCAATCATCCAAAATCCAAACCCGCTGATCCCGCCAA 2514
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 CTCGGATTGAAGGTGATTACAAGGCAATCATCCAAAATCCAAACCCGCTGATCCCGCCAA 2504
Query 2515 TATTTGGTACCGATGAGTTTGGATGGTGCACAGAGTGGAATCCAGCAATGTCAAAGTTAA 2574
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2505 TATTTGGCACCGATGAGTTTGGATGGTGCACAGAGTGGAATCCAGCGATGTCAAAGTTAA 2564
Query 2575 CCGGTTTGAAGCGAGAGGAAGTGATTGACAAAATGCTCTTAGGAGAAGTATTTGGGACGC 2634
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 2565 CCGGTTTGAAGCGAGAGGAAGTGATCGACAAAATGCTCTTAGGAGAAGTCTTCGGGACAC 2624
Query 2635 AGAAGTCATGTTGTCGTCTAAAGAATCAAGAAGCCTTTGTAAACCTTGGGATTGTGCTGA 2694
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2625 AGAAGTCATGTTGTCGTCTAAAGAACCAAGAAGCCTTTGTAAACCTTGGAATTGTACTGA 2684
Query 2695 ACAATGCTGTGACCAGTCAAGATCCAGAGAAAGTATCGTTTGCTTTCTTTACAAGAGGTG 2754
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2685 ACAATGCTGTGACCAGTCAAGATCCAGAGAAAGTGTCGTTTGCTTTCTTTACAAGAGGTG 2744
Query 2755 GCAAGTATGTGGAGTGTCTGTTGTGTGTGAGTAAGAAACTGGACAGGGAAGGTGTAGTGA 2814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 GCAAGTATGTGGAGTGTCTGTTGTGTGTGAGTAAGAAACTGGACAGGGAAGGTGTAGTGA 2804
Query 2815 CAGGTGTCTTCTGTTTCCTGCAACTTGCCAGCCATGAGCTGCAGCAAGCGCTCCATGTTC 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2805 CAGGTGTCTTCTGTTTCCTGCAACTTGCCAGCCATGAGCTGCAGCAAGCGCTCCATGTTC 2864
Query 2875 AACGTTTAGCTGAGCGAACCGCAGTGAAGAGACTAAAGGCTCTAGCATACATAAAAAGAC 2934
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2865 AGCGTCTAGCTGAGCGAACCGCAGTGAAGAGACTAAAGGCTCTAGCATACATAAAAAGGC 2924
Query 2935 AGATCAGGAATCCGCTATCTGGGATCATGTTTACAAGGAAAATGATAGAGGGTACTGAAT 2994
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2925 AGATCAGGAATCCGCTATCTGGTATCATGTTTACAAGGAAAATGATAGAGGGTACTGAAT 2984
Query 2995 TAGGACCAGAGCAAAGACGGATTTTGCAAACTAGCGCGTTATGTCAGAAGCAACTAAGCA 3054
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 TAGGACCAGAGCAGAGACAGATTTTGCAAACTAGCGCGTTATGTCAGAAGCAACTAAGCA 3044
Query 3055 AGATCCTCGATGATTCGGATCTTGAAAGCATCATTGAAGGATGCTTGGATTTGGAAATGA 3114
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 3045 AGATCCTTGATGATTCGGATCTTGAAAGCATCATTGAAGGGTGCTTGGATCTGGAAATGA 3104
Query 3115 AAGAATTCACCTTAAATGAAGTGTTGACTGCTTCCACAAGTCAAGTAATGATGAAGAGTA 3174
||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3105 AAGAATTTAGCTTAAACGAAGTGTTGACTGCTTCCACAAGCCAAGTAATGATGAAGAGTA 3164
Query 3175 ACGGAAAGAGTGTTCGGATAACAAATGAGACCGGAGAAGAAGTAATGTCTGACACTTTGT 3234
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3165 ACGGGAAGAGTGTTCGGATAACAAATGAGACCGGAGAAGAAGTAATGTCTGACACTTTGT 3224
Query 3235 ATGGAGACAGTATTAGGCTTCAACAAGTCTTGGCAGATTTCATGCTGATGGCTGTAAACT 3294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3225 ATGGAGACAGTATTAGGCTTCAACAAGTCTTGGCAGATTTCATGCTGATGTCTGTAAACT 3284
Query 3295 TTACACCATCCGGAGGTCAGCTAACTGTTTCAGCTTCCCTGAGGAAGGATCAGCTCGGGC 3354
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3285 TTACACCATCCGGAGGTCAGCTAACTGTTACAGCTTCCCTGAGCAAGGATCAGCTCGGGC 3344
Query 3355 GTTCTGTGCATCTTGCTAATCTAGAGATCAGGTTAACGCATACCGGAGCTGGGATACCTG 3414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3345 GTTCTGTGCATCTTGCTAATCTAGAGATCAGGTTAACGCATACAGGAGCTGGGATACCTG 3404
Query 3415 AGTTTTTACTAAACCAAATGTTTGGGACTGAGGAAGATGTGTCAGAAGAAGGATTGAGCT 3474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AGTTTTTACTAAACCAAATGTTTGGGACTGAGGAAGATGTGTCAGAAGAAGGATTGAGCT 3464
Query 3475 TAATGGTTAGCCGGAAACTGGTGAAGCTGATGAATGGAGATGTTCAGTACTTGAGACAAG 3534
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3465 TGATGGTTAGCCGGAAACTAGTGAAGCTGATGAATGGAGATGTTCAGTACTTGAGACAAG 3524
Query 3535 CTGGGAAATCAAGTTTCATTATCACTGCGGAACTCGCTGCAGCAAACAAGTAGTCCCCAA 3594
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3525 CTGGGAAATCGAGTTTCATTATCACTGCGGTACTCGCTGCAGCAAACAAGTAGTCCTCGA 3584
Query 3595 AAGAAAAGGGGTC-TGGCTTGATATAAAATAGTCACTGGTTGTTCTTTGCTTGTAACTTT 3653
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 3585 AAGAAAAGGGGTCATGGCTTGATATAAAATAGTCACTGGTTGTTCTTTGTTTGTAACGTT 3644
Query 3654 CCTTATCGCTTTTGTTTTCGTTTTCAAATTTCAGTAACGATGAAATATCCATCCATTTAC 3713
||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3645 GCTTGGCGCTTTTGCTTTCGTTTTCAAATTTCAATAACGATGAAATATCCATCCATTTAC 3704
Query 3714 ATCTTCTGTTGAACTCTTTTCTGAAGCTGTAAATATGGATGCATATCTAATCTCCTCCT- 3772
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3705 ATCTTCTCTTAAACTCTTTTCTGAAGCTGTAAATATGGATGCATATTTAATCTCC-CCTT 3763
Query 3773 GAGTGTTTTGGTTTCATGATGTATCATTCAAA 3804
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3764 GAGTGTTTTGGTTTCATGATGTATCATTCAAA 3795
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 144694892546
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5