BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G10760.1
Length=4670
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg919881 jgi|Araly1|919881|scaffold_101162.1 7160 0.0
> Ahg919881 jgi|Araly1|919881|scaffold_101162.1
Length=4236
Score = 7160 bits (3877), Expect = 0.0
Identities = 4126/4247 (97%), Gaps = 13/4247 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 270 AAGTTTGATTCAGTGACAAGAAAGCATGAGTAACTCTGTAGTGCATAACTTACTTAACCG 329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 1 AAGTTTGATTCAGTGACAAGAAAGCATGAGTAACTCTGTAGTGCATAACATACTAAACCG 60
Query 330 GGGTTTGATTCGTCCTCTTAACTTTGAACATCAAAACAAGCTCAACTCCTCTGTGTACCA 389
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 61 GGGTTTGATTCGTCCTCTTAACATTGAACATCAAAACAAGCTCAACTCGTCTGTGTACCA 120
Query 390 AACTTCAACAGCAAATCCGGCTCTTGGCAAGATTGGCAGATCAAAACTTTACGGGAAAGG 449
||| ||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 121 AACCTCAACGGTAAATTCGGCTGTTGGGAAGATTGGCAGATCAAAACTCTACGGGAAAGG 180
Query 450 TCTTAAGC-AGGCAGGACGCAGTCTGGTCACTGAAACAGGAGGAAGACCTCTCTCATTTG 508
|||||| | |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTTAA-CAAGGCAGGACGGAGTCTGATCACT-------GA--AAGACCTCTCTCATTTG 230
Query 509 TTCCACGAGCTGTCCTTGCCATGGATCCTCAGGCAGCCGAGAAATTTAGTCTTGACGGAA 568
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 231 TTCCACGAGCTGTTCTTGCCATGGATCCTCAGGCAGCCGAGAAATTTAGTCTTGACGGTA 290
Query 569 ATATCGATTTACTGGTTGAAGTCACTTCTACAACTGTAAGAGAAGTAAATATCCAGATAG 628
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 ATATTGACTTACTGGTTGAAGTCACTTCTACAACTGTAAGAGAAGTAAATATCCAGATAG 350
Query 629 CTTATACAAGTGACACATTGTTCCTACACTGGGGTGCAATTCTTGACAACAAAGAAAATT 688
| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 351 CATATACAAGTGACTCATTGTTTCTACACTGGGGTGCAATTCGTGACAACAAAGAAAATT 410
Query 689 GGGTTCTACCTTCTCGCTCTCCGGATAGAACTCAAAACTTCAAGAACAGTGCGCTTAGAA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 411 GGGTTCTACCTTCTCGCTCTCCGGATAGAACTCAAAACTACAAGAACAGTGCCCTTAGAA 470
Query 749 CTCCATTTGTGAAATCCGGTGGCAATTCTCACCTTAAACTAGAGATAGATGATCCTGCCA 808
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471 CTCCATTTGTAAAATCCGGTGGCAATTCTCACCTTAAACTAGAGATAGATGATCCTGCCA 530
Query 809 TACACGCTATTGAGTTCCTTATATTTGACGAAAGTCGGAACAAATGGTATAAAAATAATG 868
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 TACACGCTATTGAGTTCCTTATATTTGACGAGAGTCGGAACAAATGGTATAAAAATAATG 590
Query 869 GTCAGAATTTTCATATAAACTTACCAACGGAAAGGAATGTGAAACAAAATGTTTCTGTTC 928
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GTCAGAATTTTCATATACACTTACCAACGGAAAGGAATGCGAAACAAAATGTTTCTGTTC 650
Query 929 CTGAAGATCTTGTACAGATCCAAGCATATCTTAGATGGGAACGTAAGGGTAAACAAATGT 988
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 CTGAAGATCTTGTACAGATCCAAGCGTATCTTAGATGGGAACGTAAGGGTAAACAAATGT 710
Query 989 ACAACCCTGAGAAAGAGAAGGAGGAGTATGAAGCCGCCCGGACGGAGCTACGGGAGGAAA 1048
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||
Sbjct 711 ATACCCCTGAGAAAGAGAAGGAGGAGTATGAAGCCGCCCGCATGGAGCTACAGGAGGAAG 770
Query 1049 TGATGCGAGGTGCTTCAGTGGAAGATCTCAGAGCAAAGCTGTTGAAGAAAGATAACAGTA 1108
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 771 TGATGCGAGGTGCTTCAGTGGAAGATCTCAGAGCAAAGTTGTTGAAGAAAGATAACACTA 830
Query 1109 ATGAATCCCCAAAATCTAATGGGACATCATCCAGTGGACGGGAGGAAAAGAAAAAAGTTT 1168
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 831 ATGAATCCCCAAAGTCTAATGGGACTTCATCCAGTGGACGGAAGGAAAAGAAAAAACTTT 890
Query 1169 CCAAGCAACCAGAGCGTaaaaaaaaTTATAACACTGACAAGATCCAGCGCAAGGGAAGGG 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 891 CCAAGCAACCAGAGCGTAAAAAAAATTATAACACTGAGAAGATCCAGCGCAAGGAAAGGG 950
Query 1229 ACCTGACTAAGCTTATCTATAAGCATGTTGCTGATTTTGTTGAACCAGAATCCAAATCCT 1288
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 ACCTGAATAAGCTTATCTATAAGCATGTTGCTGATTCTGTTGAACCAGAATCCAAATCCT 1010
Query 1289 CATCTGAACCACGGTCCTTAACAACTCTGGAGATATACGCCAAAGCAAAGGAGGAACAAG 1348
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 CATCTGAACCACGGTCCTTAACAACCCTGGAGATATACGCCAAAGCAAAGGAGGAACAAG 1070
Query 1349 AAACCACTCCAGTCTTTAGCAAGAAAACATTCAAGCTTGAAGGCAGTGCGATTTTGGTGT 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 AAACCACTCCAGTCTTTAGCAAGAAAACATTCAAGCTTGAAGGCAGTGCGATTTTGGTGT 1130
Query 1409 TTGTTACTAAACTTTCCGGAAAGACGAAAATTCATGTGGCAACTGATTTTAAAGAGCCGG 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1131 TTGTTACTAAACTTTCCGGAAAGACGAAAATTCATGTGGCAACCGATTTCAAAGAGCCGG 1190
Query 1469 TTACCCTTCACTGGGCTTTGTCTCAAAAGGGTGGAGAATGGTTGGACCCACCTTCAGATA 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 TTACCCTTCACTGGGCTTTGTCTCAAAAGGGTGGAGAATGGTTGGACCCACCTTCAGATA 1250
Query 1529 TACTGCCACCAAACTCTTTGCCAGTACGTGGTGCTGTTGATACAAAACTGACCATCACTT 1588
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1251 TACTGCCACCAAACTCTTTGCCAGTACGTGGTGCGGTTAATACAAAACTGACCATTACTT 1310
Query 1589 CAACAGATCTTCCTAGTCCGGTTCAAACTTTTGAGCTGGAAATAGAAGGTGACAGCTACA 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CAACAGATCTTCCTAGTCCGGTTCAAACTTTTGAGCTGGAAATAGAAGGTGACAGCTACA 1370
Query 1649 AGGGCATGCCGTTTGTACTCAATGCTGGTGAAAGGTGGATTAAAAATAATGACAGTGACT 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1371 AGGGCATGCCGTTTGTACTCAATGCTGGTGAAAGGTGGATTAAAAATAATGGCAGTGACT 1430
Query 1709 TTTATGTGGACTTTGCTAAAGAAGAAAAACATGTTCAGAAGGATTATGGCGATGGAAAGG 1768
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1431 TTTATGTGGACTTTGCTAAAGAAGAAAAACATGTTCAGAAGGATTATGGCGATGGAAAAG 1490
Query 1769 GTACAGCCAAGCATTTACTGGACAAAATCGCAGATTTGGAGAGTGAGGCCCAGAAGTCTT 1828
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 GTACAGCCAAGCATTTACTGGATAAAATCGCAGATTTGGAGAGTGAGGCCCAGAAGTCTT 1550
Query 1829 TCATGCATCGATTCAACATTGCAGCAGATCTTGTGGACGAGGCAAAAAGTGCTGGTCAAC 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TCATGCATCGATTCAACATTGCAGCAGATCTTGTGGACGAGGCAAAAAGTGCTGGTCAAC 1610
Query 1889 TGGGCTTTGCAGGGATCCTAGTCTGGATGAGGTTTATGGCTACAAGACAGCTTGTGTGGA 1948
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 TGGGCTTCGCAGGGATCCTAGTCTGGATGAGGTTTATGGCTACAAGACAGCTTGTGTGGA 1670
Query 1949 ACAAAAACTATAATGTTAAGCCAAGGGAGATAAGCAAAGCGCAGGATAGACTGACTGACC 2008
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 ATAAAAACTATAATGTTAAGCCACGGGAGATAAGCAAAGCGCAGGATAGACTGACTGACC 1730
Query 2009 TTCTCCAGGACGTTTATGCAAGTTATCCAGAGTACAGAGAACTTTTGCGGATGATAATGT 2068
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 TTCTCCAGGACGTTTATGCAACTTATCCCGAGTACAGAGAACTTTTGCGGATGATAATGT 1790
Query 2069 CTACTGTAGGTCGAGGAGGTGAAGGAGATGTCGGGCAACGAATCCGTGACGAAATTCTAG 2128
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 CTACTGTAGGTCGAGGCGGTGAAGGAGATGTCGGGCAACGAATCCGTGACGAAATTCTAG 1850
Query 2129 TCATCCAGCGGAAAAATGACTGCAAGGGTGGAATTATGGAGGAATGGCATCAGAAGTTGC 2188
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCATCCAGCGGAAAAATAACTGCAAGGGTGGAATTATGGAGGAATGGCATCAGAAGTTGC 1910
Query 2189 ATAACAACACTAGTCCAGATGATGTTGTCATCTGTCAGGCATTGATGGATTATATCAAAA 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 ATAACAACACTAGTCCAGATGATGTTGTCATCTGTCAGGCATTGATGGATTATATCAAAA 1970
Query 2249 GTGACTTTGACTTAAGTGTTTACTGGAAGACCTTGAACGATAATGGCATAACCAAAGAGC 2308
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 GTGACTTTGACATAAGTGTTTACTGGAAGACCTTGAACGATAATGGCATAACCAAAGAGC 2030
Query 2309 GACTCTTAAGTTATGATCGTGCTATACATTCTGAACCAAATTTTAGAGGAGAACAAAAAG 2368
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 GACTCTTAAGTTATGATCGTGCCATACATTCTGAACCAAATTTTAGAGGAGAACAAAAAG 2090
Query 2369 ACGGTCTTTTGCGTGATCTTGGACACTACATGAGGACTTTAAAGGCTGTTCATTCAGGGG 2428
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 ATGGTCTTTTGCGTGATCTTGGACACTACATGAGGACTTTAAAGGCTGTTCATTCAGGGG 2150
Query 2429 CAGACCTTGAGTCGGCTATACAAAATTGCATGGGCTACCAAGATGACGGTGAAGGTTTCA 2488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151 CAGACCTTGAGTCGGCTATACAAAATTGCATGGGCTACCAAGATGACGGTGAAGGTTTCA 2210
Query 2489 TGGTTGGGGTGCAGATAAATCCTGTATCAGGATTGCCTTCTGGATATCCAGACTTGCTTC 2548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 TGGTTGGGGTGCAGATAAATCCTGTATCAGGATTGCCTTCTGGATATCCAGACTTGCTTC 2270
Query 2549 GTTTCGTCCTAGAACATGTTGAAGAAAAGAATGTAGAGCCACTTCTTGAGGGTTTGCTTG 2608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271 GTTTCGTCCTAGAACATGTTGAAGAAAAGAATGTAGAGCCACTTCTTGAGGGTTTGCTTG 2330
Query 2609 AAGCTCGTCAAGAGCTAAGGCCACTTCTGCTGAAGTCCCATGACCGCCTCAAGGATCTGT 2668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331 AAGCTCGTCAAGAGCTAAGGCCACTTCTGCTGAAGTCCCATGACCGCCTCAAGGATCTGT 2390
Query 2669 TATTCTTGGACCTCGCTCTTGATTCTACTGTCAGAACAGCGATTGAAAGAGGATATGAGC 2728
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2391 TATTCTTGGACCTCGCTCTCGATTCTACTGTCAGAACAGCTATTGAAAGAGGATATGAGC 2450
Query 2729 AATTGAATGATGCTGGACCTGAGAAAATCATGTACTTCATCAGCCTAGTTCTTGAAAATC 2788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451 AATTGAATGATGCTGGACCTGAGAAAATCATGTACTTCATCAGCCTAGTTCTTGAAAATC 2510
Query 2789 TTGCCCTCTCTTCAGATGACAATGAAGACCTTATATACTGCTTGAAGGGATGGCAATTTG 2848
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2511 TTGCCCTTTCGTCAGATGACAATGAAGACCTTATATACTGCTTGAAGGGATGGAAATTTG 2570
Query 2849 CCCTC-GACATGTGCAAGAGCAAAAAAGATCACTGGGCTCTGTATGCAAAATCTGTTCTT 2907
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 CCCTCAG-CATGTGCAAGAGCAAAAAAGATCACTGGGCTCTGTATGCAAAATCTGTTCTT 2629
Query 2908 GACAGAAGCCGACTAGCACTGGCAAGCAAAGCTGAGAGGTACCTTGAAATTCTGCAACCA 2967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 GACAGAAGCCGACTAGCACTGGCAAGCAAAGCTGAGAGGTACCTTGAAATTCTGCAACCA 2689
Query 2968 TCGGCTGAATATCTTGGATCTTGTCTTGGAGTCGATCAGTCGGCTGTTAGTATATTTACT 3027
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 TCTGCTGAATATCTTGGATCTTGTCTTGGAGTCGATCAGTCGGCTGTTAGTATATTTACT 2749
Query 3028 GAAGAGATCATTCGAGCTGGATCTGCAGCAGCATTGTCGTCACTTGTTAACCGACTTGAC 3087
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 GAAGAGATCATTCGAGCTGGATCTGCAGCAGCATTGTCTTCACTTGTTAACCGACTTGAC 2809
Query 3088 CCAGTTCTTAGGAAGACTGCTAACTTGGGAAGTTGGCAGGTTATTAGTCCTGTAGAGGTC 3147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2810 CCAGTTCTTAGGAAGACTGCTAACTTGGGAAGTTGGCAGGTTATAAGTCCTGTAGAGGTC 2869
Query 3148 GTCGGATATGTCATTGTTGTGGACGAATTGCTCACTGTACAGAATAAAACCTACGATAGA 3207
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2870 GTCGGTTATGTCATTGTTGTGGATGAATTGCTCACTGTACAGAATAAAACCTACGACAGA 2929
Query 3208 CCTACAATTATAGTTGCAAACAGAGTGAGAGGAGAGGAGGAAATCCCTGATGGTGCAGTT 3267
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2930 CCTACAATTATAGTAGCAAACAGAGTGAGAGGAGAGGAGGAGATCCCTGATGGTGCAGTT 2989
Query 3268 GCGGTACTGACACCTGACATGCCGGATGTACTATCTCATGTTTCTGTTCGAGCAAGAAAT 3327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 GCGGTACTGACACCTGACATGCCGGATGTACTATCTCATGTTTCTGTTCGAGCAAGAAAT 3049
Query 3328 GGAAAGATCTGCTTTGCCACATGTTTTGATTCTGGTATCTTATCTGACCTCCAAGGAAAA 3387
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 GGAAAGATCTGCTTTGCCACATGTTTTGATTCTGGTATCTTATCTGACCTCCAAGGAAAG 3109
Query 3388 GATGGAAAACTGTTGAGCCTACAACCAACCTCTGCAGATGTAGTCTATAAAGAGGTAAAC 3447
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 GATGGAAAACTGTTGAGCCTAGAACCAACCTCTGCAAATGTAGTCTATAAAGAGGTAAAC 3169
Query 3448 GATAGTGAGCTTTCGAGTCCAAGTTCAGACAACCTGGAAGATGCCCCTCCAAGTATTTCT 3507
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 GATAGTGAGCTTTCGAGTCCAAGTTCAGACAACTTAGAAGATGCCCCTCCAAGTATTTCT 3229
Query 3508 TTGGTCAAGAAACAGTTTGCGGGTAGATATGCTATATCATCTGAGGAGTTCACAAGTGAC 3567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3230 TTGGTCAAGAAACAGTTTGCGGGTAGATATGCTATATCATCTGAGGAGTTCACTAGTGAC 3289
Query 3568 TTGGTTGGTGCTAAATCAAGAAATATCGGGTATCTGAAAGGAAAAGTTCCTTCTTGGGTT 3627
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 TTGGTTGGTGCTAAATCAAGAAATATCGGATATCTGAAAGGAAAAGTTCCTTCTTGGGTT 3349
Query 3628 GGTATCCCAACTTCAGTTGCGTTGCCATTTGGTGTTTTTGAGAAGGTTATCTCCGAAAAG 3687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3350 GGTATCCCAACTTCAGTTGCGTTGCCATTTGGTGTTTTTGAGAAGGTTATCTCCGAAAAG 3409
Query 3688 GCGAATCAGGCGGTGAACGATAAATTGCTAGTATTGAAGAAAACTCTTGATGAGGGAGAC 3747
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3410 GCGAATCAGGCGGTGAACGAGAAATTGCTAGTATTGAAGAAAACTCTTGATGAGGGGGAC 3469
Query 3748 CAAGGTGCTCTGAAGGAAATCCGGCAGACACTGTTGGGGCTAGTTGCACCCCCAGAACTG 3807
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3470 CAAGGTGCTCTGAAGGAAATCCGTCAGACACTGTTGGGGCTAGTTGCACCCCCAGAACTG 3529
Query 3808 GTTGAAGAACTGAAAAGTACTATGAAAAGTTCTGACATGCCATGGCCGGGTGATGAAGGT 3867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3530 GTTGAAGAACTGAAAAGTACTATGAAAAGTTCTGACATGCCATGGCCAGGTGATGAAGGT 3589
Query 3868 GAACAGAGATGGGAGCAAGCTTGGGCAGCCATTAAAAAGGTCTGGGCTTCGAAATGGAAC 3927
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3590 GACCAGAGATGGGAGCAAGCTTGGGCAGCCATTAAAAAAGTCTGGGCTTCGAAATGGAAC 3649
Query 3928 GAGAGAGCATACTTCAGCACGAGGAAAGTAAAACTGGATCATGACTATCTCTGCATGGCT 3987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 GAGAGAGCATACTTCAGCACGAGGAAAGTAAAACTGGATCATGACTATCTCTGCATGGCT 3709
Query 3988 GTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCGGATTACGCATTCGTCATTCACACAACTAATCCA 4047
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3710 GTTTTGGTCCAAGAAGTCATCAATGCGGATTACGCATTTGTCATTCACACAACTAACCCA 3769
Query 4048 TCTTCTGGAGATTCATCAGAGATTTATGCCGAGGTGGTCAAAGGCCTTGGGGAAACTCTT 4107
|||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3770 TCTTCTGGAGATTCATCAGAGATTTACGCTGAGGTTGTGAAAGGCCTTGGTGAAACTCTT 3829
Query 4108 GTAGGAGCATATCCCGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCTGCAAGAAAAACAACCTTGATTCG 4167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3830 GTAGGAGCATATCCCGGTCGGTCTCTGAGTTTCATCTGCAAGAAAAACAACCTTGATTCG 3889
Query 4168 CCTCTGGTGTTGGGCTACCCAAGCAAACCGATTGGGCTGTTCATAAGACGTTCAATCATC 4227
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3890 CCTCTGGTGTTGGGTTACCCAAGCAAACCGATTGGGTTGTTCATAAGACGTTCAATCATC 3949
Query 4228 TTCAGATCTGATTCCAATGGAGAAGATCTTGAAGGTTATGCAGGTGCAGGCCTCTACGAC 4287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3950 TTCAGATCTGATTCCAATGGAGAAGATCTTGAAGGTTATGCAGGTGCAGGCCTCTACGAC 4009
Query 4288 AGTGTACCAATGGACGAGGAAGACCAAGTCGTGCTCGATTACACAACAGATCCTCTGATC 4347
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4010 AGTGTCCCAATGGACGAGGAAGACCAAGTCGTGCTCGATTACACTACAGATCCTCTGATC 4069
Query 4348 ACTGACTTGAGCTTCCAGAAAAAGGTTCTCTCAGACATTGCACGCGCTGGAGATGCCATT 4407
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4070 ACTGACGAGAGCTTCCAGAAAAAGATTCTCTCAGACATTGCACGCGCCGGAGATGCCATT 4129
Query 4408 GAGAAACTCTATGGAACTGCACAGGACATTGAAGGTGTGATCAGAGACGGGAAGCTCTAT 4467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4130 GAGAAACTCTATGGAACTGCACAGGACATTGAAGGTGTGATCAGAGATGGGAAGCTCTAT 4189
Query 4468 GTCGTCCAGACACGACCACAAGTGTGATCAAATTCTCTGACCACTTC 4514
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4190 GTCGTCCAGACACGGCCGCAAGTGTGATCAAATTCTCCGACCACTTC 4236
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 176701311439
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5