BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G15290.1 Length=5145 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg312521 jgi|Araly1|312521|fgenesh1_pm.C_scaffold_1001301 5463 0.0 > Ahg312521 jgi|Araly1|312521|fgenesh1_pm.C_scaffold_1001301 Length=4869 Score = 5463 bits (2958), Expect = 0.0 Identities = 3353/3545 (95%), Gaps = 21/3545 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1330 TGTTCATGATACTCCGGCTTTAGGCAAAGTTATTGTAAGACAGTGTGGATATACTGCGGT 1389 ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1332 TGTCCAGGATACTCCGGCTTTAGGCACAGTTATCGTAAGACACTGTGGATATACTGCGGT 1391 Query 1390 GGTAAATGTCAAGGGTCAAACTCAGAAGGCAATGTCTGATTTCCGTGATATTTTAATCGA 1449 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1392 GGTAAATGTCAAGGGTAAAACTCAGAAGGCAATATCTGATTTCCGTGATATTTTGATCGA 1451 Query 1450 TGACCTGCCGGATGGAGGAGCTAATGCTCTTAACCTTAACAGCTTACGGGTAGAGTTTCA 1509 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| Sbjct 1452 TGACCTGCCGGATGGAGGAGCTAATGCTCTTAACCTTAACAGCTTAAGGGTTCAGCTTCG 1511 Query 1510 CAGGCCCCATAGTGTTGGAACATCTGTAGAGAACCAGCCCACACAGCTTGATTGGGATGA 1569 |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1512 CAGGTCCCATAGTGTTAGAATATCTGGAGAGAACCAGCCCACACTGCTTGATTCGGATGA 1571 Query 1570 TTTAGAATCTTATAGATGTATTATACAGGAGTTAGTAAAAATTAACTTAACAAAGTTAGA 1629 |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1572 TTTAGAGTCTTATAGATGTATTGTACAGGATTTAGTAAAAGTTAACTTAACAAAGTTAGA 1631 Query 1630 AGAAACAAGGGTATCTTCTGTAAGACCCATCAGATGGGAACTCGGTTCTACCTGGGTTCA 1689 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 1632 AGAAAAAAGGGTATCTTCTGTAAGACCCATCAGATGGGAGCTCGGTTCTTGCTGGGTTCA 1691 Query 1690 GCATCTACAGAAGAAAGAAACAGACGTCTGTGGAAAGCCTGCAACTAATGATGAAACTGA 1749 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1692 GCATCTACAAAAGAAAGAAACAGACGTCTGTGGAAAGCCTGCAACTAATGATGAGACTGA 1751 Query 1750 ACTTTCAGTTAAAGGCTTGGGAAAACAATTTAAAGATCTAAAGAGCAAAAGTAAGAAATC 1809 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1752 ACTTTCAATTAAAGGCTTGGGAAAACAATTTAAAGTTCTAAAGAGCAAAAGTAAGAAATC 1811 Query 1810 AGAAAATATAAGTGCCGT----G--AATGAAAAAGATACCAGACTGCACGAGTTAAATGA 1863 |||| ||||||| |||| | || |||||||||| |||||| | ||||||||||| Sbjct 1812 AGAATCTATAAGTACCGTGAAGGAAAAGGAAAAAGATATCAGACTACGCGAGTTAAATGG 1871 Query 1864 GGAGGATGATCTAGGGCAGAAAAGCATTGATGGACTCTTTACTGAACTGAAGGAACTGCT 1923 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1872 GGAGGCTGATCTAGGGCAGAAAAGCATTGATGGACACTTTACTGAACTGAAGGAGCTGCT 1931 Query 1924 TTCTGAAGAAGCTTTCTCTCGCCTAAAAGAAACTGGAACTGGTCTCCATTTAAAGTCAAA 1983 ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1932 TTCTGAAGAAGCTTTCTCTCGTCTACAAGAAACTGGAACTGGTCTCCATTTAAAGTCAAA 1991 Query 1984 AGAAGAGCTTACCAATATGGCATATGGTTACTATGATGAAATTGCTTTGCCAAGGCTGGT 2043 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1992 AGAAGAGCTTACCAAGATGGCATATGGTTACTATGATGAAATTGCTTTGCCAAGGCTGGT 2051 Query 2044 AGCAGATTTCGGGTCACTGGAGCTTTCTCCAGTTGATGGTCGCACTTTGACTGATTTCAT 2103 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct 2052 AGCAGATTTCGGGTCACTGGAGCTTTCTCCAGTTGATGGTCGCACAATGACTGACTTCAT 2111 Query 2104 GCATATAAGAGGACTCCAAATGCGTTCTCTAGGACATGTGGCTAAACTTGCTGAGAAACT 2163 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2112 GCATATAAGAGGACTCCAAATGCGTTCTCTAGGACATGTGGCTAAAATTGCTGAGAAACT 2171 Query 2164 TCCTCATATACAGTCCCTCTGTATTCATGAGATGATTACAAGAGCTTTCAAGCATCTTCT 2223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2172 TCCTCATATACAGTCCCTCTGTATTCATGAGATGATTACAAGAGCTTTCAAGCATCTTTT 2231 Query 2224 TAGGGCGGTTATTGCATCTGTTAATAATATGGCAGAGCTACCTGTGGCGGTAGCTGCTTC 2283 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 2232 TAGGGCGGTTATTGCATCTGTCAATAATATGGCTGAGATACCTGTGGCAGTAGCTGCTTC 2291 Query 2284 ATTAAATTTTATGCTTGGCCGCCGTGAATTGGAAGGGTGC-GATAGAATCCCCGGTGAAG 2342 ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| Sbjct 2292 ATTAAATTTCATGTTTGGCCACCGTGAATTGGAAGGGT-CTGATAGGATCCCCAGTGAAG 2350 Query 2343 AGTACTGTCTCAGATTACAGTGGCTACAGAAATTTCTCTCCAGAAAATTTGGTTGGATAC 2402 |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2351 AGTATTGTCTCAGATTACGGTGGCTACAGAAATTTCTCTCCAGAAAATTTGGTTGGATAC 2410 Query 2403 AGAAAGATGAGTTCCATCATTTAAAAAAGTTTTCTATCCTCCGAGGACTCTGCCAGAAGG 2462 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2411 AGAAAGATGAGTTCAATCATTTGAAAAAGTTTTCTATCCTCCGAGGACTCTGCCAGAAGG 2470 Query 2463 TTGGTTTAGAACTAGTTTCAAGAGATTTTGACTTCGATTCTCCAAATCCTTTCATGAGCT 2522 |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| Sbjct 2471 TTGGGTTAGAACTAGTTGCAAGAGATTATGACTTCGATTCTCCAAATCCCTTCACGAGCT 2530 Query 2523 CTGACATTATTGGATTGGTACCTGTGTGCAAGCATGTGCTGTGTATTTCATCTGACGGAA 2582 |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2531 CTGACATTTTTGGCTTGGTACCTGTGTGCAAGCATGTGCTGTGTATTTCATCTGACGGAA 2590 Query 2583 GGACACTCTTGGAGTCATCAAAACTTGCTCTTGACAAAGGAAAACTAGATGATGCTGTGA 2642 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2591 GGACACTCTTGGAGTCATCAAAACTTGCCCTTGACAAAGGAAAACTTGATGATGCTGTGA 2650 Query 2643 GCTATGGAACAAAGGCATTAGTCAAGATGATTGCTGTCTGTGGGCCTTATCATAGAAATA 2702 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2651 ACTATGGAACAAAGGCATTAGTCAAGATGATTGCTGTCTGTGGGCCTTATCACAGAAATA 2710 Query 2703 CTGCATGTGCGTACAGTCTTCTCGCAGTTGTACTATACCACACTGGCGATTTTAACCAGG 2762 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2711 CTGCTTGTGCGTACAGCCTTCTCGCAGTTGTACTATACCACACTGGCGATTTTAACCAGG 2770 Query 2763 CAACAATATATCAGCAGAAGGCTCTAGATATAAATGAGAGAGAACTTGGTCTCGACCATC 2822 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2771 CAACAATATATCAGCAGAAGGCTCTAGATATAAATGAGAGAGAACTTGGTCTCGACCATC 2830 Query 2823 CCGACACTATGAAAAGCTATGGGGATCTTTCTGTATTTTACTATCGTCTTCAACATTTTG 2882 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2831 CCGACACTATGAAAAGCTATGGGGATCTTTCTGTATTTTACTATCGTCTTCAACACTTTG 2890 Query 2883 AATTGGCACTAAAATATGTGAACCGGGCGTTGTTTCTTCTTCACTTCACTTGTGGGCTAT 2942 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2891 AATTGGCACTAAAATATGTGAACCGTGCGTTATTTCTCCTTCACTTCACTTGTGGGCTAT 2950 Query 2943 CTCACCCAAATACTGCTGCCACATATATCAATGTGGCTATGATGGAAAAAGAAGTAGGGA 3002 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2951 CTCACCCAAATACTGCTGCCACATATATCAATGTGGCTATGATGGAAAAAGAAGTAGGGA 3010 Query 3003 ATGATCATCTAGCTCTAAGGTACCTGCATGAAGCTCTAAAGAGCAATAAAAGATTGCTAG 3062 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3011 ATGATCATCTAGCTCTAAGATACCTGCATGAAGCGCTAAAGTGCAATAAAAGATTGCTAG 3070 Query 3063 GAGCTGACCATATTCAGACTGCGGCAAGCTATCATGCAATAGCAGTGGCTCTCTCTTTCA 3122 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || Sbjct 3071 GAGCTGACCATATTCAGACTGCGGCAAGCTATCATGCAATAGCGGTGGCTCTCTCTTCCA 3130 Query 3123 TGGAAGCACATTCATTGAGTGTGCAACATGAACAAACTACACTTCAGATACTTACTGCAA 3182 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3131 TGGAAGCACATTCATTGAGTGTGCAACACGAACAAACTACACTTCAGATACTTACAGCAA 3190 Query 3183 AACTTGGAGCAGATGACCTTCGTACACAGGATGCTGCTGCATGGCTCGAATATTTTGAAT 3242 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3191 AACTTGGATCAGATGACCTTCGTACACAGGATGCTGCTGCATGGCTCGAATATTTTGAAT 3250 Query 3243 CAAGAGCCATAGAGCAGCAGGAAGCAGGC-CGAAATGGAATCCCAAAGCCTGATGCTTCC 3301 ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3251 CAAGAGCCATAGAGCAGCAGGAAGCAG-CACGAAATGGAATCCCAAAGCATGATGCTTCC 3309 Query 3302 ATCGCGAGCAAAGGCCACCTTAGTGTATCAGATCTCCTGGACTATATAAGTTCTGATCCA 3361 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3310 ATCGCAAGCAAAGGCCACCTTAGTGTATCAGATCTCCTGGACTATATAAGTTCTGATCCA 3369 Query 3362 GACACTAAGGGAAATGTTGCTCACAGGAAACATCGGCGTGCCAGGATATTACAGGTCAAT 3421 ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3370 GACACCAAAGGAAGTGTTGCTCACAGGAAACATCGGCGTGCCAGGGCATTACAGGTCAAT 3429 Query 3422 GATAAG-GTTGCATCAGCTGATGATGACGCCCATAGAGTTGCTTCACAGATTGACATTGT 3480 |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| Sbjct 3430 GATA-GTGTTGCATCAGCTGATGATGACGCCCATAGAGTTGATTCTCAGATTGGCATTGT 3488 Query 3481 TACATGGAACAATGTGGCAGAAGCGGATGTCACTAAGAGTAGGAGC-GAAGTAAATGATC 3539 | |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 3489 TGCATGGAACGACGTGGCAGAAGCGGATGCCATTAAGAGTAGGA-CTGAAGTAAATGATC 3547 Query 3540 CTGATACAGTTGTTGATAAGACCAATATTGAGACAGGTGATATTGTAGTACACAGGCTAA 3599 || || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3548 CTAATGCAGTTGTTGATGAGATCAAAATTGAGACAGGTGATATTGTAGTACACAGGCTAA 3607 Query 3600 ATGTAGACAGGCAAACTGTGGAAGAGTCAACTTTAGACGAGGGCTGGCAAGAGGCATACT 3659 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 3608 ATGTAGACAGCCAAACTGTGGAAGAGTCAACTTTAGATGATGGCTGGCAAGAGGCATACT 3667 Query 3660 CAAAGGGGAGATCCGGAAATGGTGCTGGAAGGAAATCCAGACAAAGGCAGCCTGATCTTA 3719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3668 CAAAGGGGAGATCCGGAAATGGTGCTGGAAGGAAATTCAGACAAAGGCAGCCTGATCTTA 3727 Query 3720 TGAAAAAGAGAATGTTGCTTAATAAACATCACAACAGGA-ATCAGGATGTTCAGCAACAG 3778 ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 3728 TGAAAAAGAGAATGTCGCTTAATAAACATTTCAACAGGAGA-CAGGATGTTCAGCAACAG 3786 Query 3779 AATATATATTCTCCCTTGCAGAAAACAAGCAAAGGACCCTCCCTCTCTAAGTCATCACCC 3838 ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3787 AATATATCTTC-C--TTGCAGAAAACAAGCAAAAGACCCTCCCTCTCTAAGTCATCATCC 3843 Query 3839 CGTAGGGCTCTAAAGAATGCAGAGATAGATGTCAGTACAAATACAACTAAACCACAGTTA 3898 | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3844 CATAGGGCTATGAAGAATGCAGAGATAGATGTCAGTACAAATACAACTAAACCACAGTTA 3903 Query 3899 AAGGCTTCTGGTGCTGCTGCTGTGACCAGTACTACTTTGGCCTCAAAGTCTCTCTCATAC 3958 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3904 ATGGCTTCTGGTTCTGCTGCTGTGACCAGTACTACTTTGGCTTCAAAGTCTCTCTCATAC 3963 Query 3959 AAAGAGGTTGCTTTGGCACCACCAGGTACAGTTCTGAAGCCAATGTTAGAAAAATTAGAA 4018 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3964 AAAGAGGTTGCTTTGGCACCACCAGGTACAGTTCTGAGGCCAATGTTAGAAAAATTAGAA 4023 Query 4019 CTGAATTTGGAGAGAACTGAAACTCAGATATACAGGACTTCAAGTGCGTCATCTGGAGAA 4078 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4024 CTGAATTTGGAGAGAACTGAAACTCAGATATACAGGACTTCAAGTGCGTCAACTGGAGAA 4083 Query 4079 GAAAGCAAGTCCGACACTGTAATGTTGGATTTGCCAATCGAAGGCACAGAGCTTCACTGT 4138 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4084 GAAAGCAAGTCTGACACTGTAATGTTGGATTTGCCAATCGAAGGCACAGAGCTTCCCTGT 4143 Query 4139 GAGAAACAAGAATCACAAGAAAGTGCTGAGTCAGTGGAAAACTTAACGTCAGAGTCTGAA 4198 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4144 GAAAAACAAGAATCACAAGAAAGTGCTGAGTCAGTGGAAAATTTAACGTCAGAGTCTGAA 4203 Query 4199 GGGGATCTGGGGTCCTATCGTGGGaaaaaaaCTTCTGATATAAGCCGGACAAAGCTATCA 4258 |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4204 GGGGATCTGGGGTCCTATTGTGGGCAAAAGGCTTCTGATATAAGCCAGACAAAGCTATCA 4263 Query 4259 GCCTCCGCAGAGCCTTACAACCCTGGAGGTTTCTTGGTTATTGATCTGCAAAGCTCAGCA 4318 ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4264 GCCGCTGCAGAGCCTTACAACCCTGGAGGTTTCTTGTTTATTGATCTGCAAAGCTCAGCA 4323 Query 4319 GCAACAATAGGCAGCTACCCAATTATGGTTGCAGACCCTATTTCCTGGGCTGTAGTTTCA 4378 ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct 4324 GCAACAACAGGCAACTACCCGATTATGGTTGCAGACCCTATTTCCTGGGCTGGAGTTCCA 4383 Query 4379 TGTGGGATTCACTCACCACCATATTATAGTGCTATTCACTCAAATGGAGTTGGGACGCCA 4438 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| Sbjct 4384 TGTGGGATTCACTCACCACCATATTATAGTGCTAATCACTCCCATGGAGTTGGGATGCCA 4443 Query 4439 AGAAGCATGAATCCAGATGCACCAGAGTTTGTTCCGA-GAAGATCCTTGCAGAATAGCTC 4497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| Sbjct 4444 AGAAGCATGAATCCAGATGCACCAGAGTTTGTTCCAATGA-GATCCGTGCAGAATAGCTC 4502 Query 4498 TCAACATGCAGGTGAAGATGCAAGTGTATCCGTCGACTCCAGCAGTTGCCTAAAGGCTGA 4557 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4503 ACAACATGCAGGTGGAGATGCAAGTGTATCCGTCGACTCCAGCAGTTTCCTAAAGGCTGA 4562 Query 4558 GAAAGATGCAGTTGATTTGAAGAAGCGAGAGCTTGCCAGCTTCATAGTAAAGTCATCACA 4617 |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4563 GAAAGAAGCAGTTGCTTTGAAGAAGCGAGAGCTAGCCAGCTTCATAGTAAAGTCATCCCA 4622 Query 4618 GAAAGAGGTTCCGGCTGCTCTTAGCAAAACGAGCCCCGAAGCTGAGTCAGGAGGTACCTC 4677 ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 4623 GAAGGAGGTTCCGGCTGCTCTGAGGAAAACGAGCCCAAAAGCTGAGTCAGGAGATACCTC 4682 Query 4678 CGAAAAGGATAGTGCAGTAACCGAGATAGTTTATAGTAGAGAAGAGGAGAATGGAGCGAA 4737 || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4683 CGCAAAGGATAGTGCATTAACCGAGGTAGTTTATAGTAGAGAAGAGGAGAGTGGAGCGAA 4742 Query 4738 TGCAAATGAGACAAATGGAGGTGAAGGGTTTGTGATTGTGGCAAAGAAAAGGAGAAGGAA 4797 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 4743 TGCAAATGAGACAAATGGAGGTGAAGGGTTTGTGATTGTGGCAAAGAAGAGGAGGAGGAA 4802 Query 4798 GAACAAGGTGCGACTTACAAATGTTGCGGCTGGGCTGTACCATCAACCGTCGTCAGTTTG 4857 ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4803 GAACAAGCTGCGGCTTACAAATGTTGGGGCTGGGCTGTACCATCAACCGTCGTCAGTTTG 4862 Query 4858 TGCAT 4862 ||||| Sbjct 4863 TGCAT 4867 Score = 1995 bits (1080), Expect = 0.0 Identities = 1234/1308 (94%), Gaps = 11/1308 (1%) Strand=Plus/Plus Query 38 ATGGCACCGAGGTCAAGCAAAGGGAAATCAAACAACAAAGGGAAAGGAGGAGATAAGAAG 97 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGCACCGAGGTCAAGCAAAGGGAAATCAAACAACAGAGGGAAAGGAGGAGATAAGAAG 60 Query 98 AAGAGAGACGATAAACTGTTGGCTCCGAGTCTGGTTGAAATCACAGTCACCACTCCGTAC 157 |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAGAGAGAAGACAAACTGTTGGCACCGAGTCTTGTTGAAATCACAGTCACCACTCCGTAC 120 Query 158 GAAACTCAAGTGATACTCAAGGGAGTTTCTACTGACAAAATCATTGACGTGAGAAGGCTT 217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 121 GAAACTCAAGTGATACTCAAGGGAGTTTCTACTGACAAAATCATTGATGTGAGAAGGCTT 180 Query 218 TTAGCATCTCACGTTGAGACTTGCCATTTCACCAACTATTCTCTCTCCCATAAGGTGAAG 277 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTGGCATCTCACGTTGAGACTTGCCATTTCACCAACTATTCTCTCTCCCATAAGGTGAAA 240 Query 278 GGGCATAAATTGAATGACAACATCCAAGTACTTTCCCTCAAGCCTTGTTTTCTCCGCATG 337 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 241 GGGCATAAATTGAATGACAACATCCAAGTGCTTTCCCTCAAGCCTTGTTTCCTCCGCATG 300 Query 338 ATTCCAGAGGAGTATCTAGAGGAAAGTCAGGCGTTGACTCAGGTACGGAGAGTCATCGAC 397 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 301 ATTCCAGAGGAGTATCTAGAGGAAAGCCAGGCGTTGACTCAGGTACGGAGAGTCATAGAC 360 Query 398 ATTGTAGCATGCACCACCAGGTTC-T-T---C-T---CCAAATCTCCCAACAAATCCATC 448 || ||||||||||||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||| Sbjct 361 ATCGTAGCATGCACCACCAGGTTCTTCTCCGCTTCCCCCAAATCCCCCAACAAATCCATA 420 Query 449 GTTGCCGGCAATGCCAATCCGACACCGGCGCCGGACGGCCTCGACATGGTCGCTATCCAC 508 | ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 421 GCCGCCGGCAATGCCACTCAGACGCCGGAGCCGGACGGCCTCGACATGGTCGCCATCCAC 480 Query 509 ACCACACCCAAACTTTCTCAGTTCTACGAGTTCTTCTCCATTCAC-CACCTATCTCCTCC 567 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| Sbjct 481 CCCACTCCCAAACTTTCTCAGTTCTACGAGTTTTTCTCCATTC-CTCACCTCTCTCCTCC 539 Query 568 GATTCTTCATTTGAAGAAAGTTGATGGTGAAGAAGCTGGAGAGAAGCGTGATGGTGACTA 627 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 GATTCTTCACTTGAAGAAAGTTGATGGTGAAGACGCTGGAGAGAAGCGTGATGGTGACTA 599 Query 628 TTTTGGACTTAAGGTTAAGATTTGCAATGGCAAGGTTATACATGTGATTGCTTCTGTAAA 687 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 600 TTTTGGACTCAAGGTTAAGATTTGCAATGGGAAGGTTATACATGTGATTGCTTCGGTGAA 659 Query 688 AGGGTTCTTCGCCGTTGGAAAACAGCTCTCACATTGTCATTCCATTGTTGATTTGCTCCA 747 ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || Sbjct 660 AGGGTTCTTCGCCGTTGGAAAGCAGCTCACACATTGCCACTCCATTGTTGATTTGCTTCA 719 Query 748 GAATGTCAGCAATGCTTTTGCCAAGGCATATGAATCTTTAATGAAAGCTTTCACTGATCG 807 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || Sbjct 720 GAATGTCAGCAATGCTTTTGCCAAGGCATATGAATCTCTAATGAAAACTTTCACTGACCG 779 Query 808 GAATAAGTTTGGCAACCTCCCGTTTGGATTACGCTCAAACACATGGCTTGTACCTTCTCC 867 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 780 GAATAAGTTTGGCAACCTCCCGTGTGGATTACGCTCAAATACATGGCTTGTACCTTCTCC 839 Query 868 TGTTTCTGAGTCTGCTTCTCCTTTACCAACAGAGGATGAACATTGGGGCGGGAATGGTGG 927 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TGTTTCTGAGTCTGCTTCTCCTTTACCAGTAGAGGATGAACATTGGGGCGGGAATGGTGG 899 Query 928 AGGTCAGGGGAGAAATGGTGAATATGATCATCGACCTTGGGCGGCTGAGTTTTCTGTATT 987 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 900 AGGTCAGGGGAGAAATGGTGAATATGATCATCGACCTTGGGCGGCACAGTTTTCTGTATT 959 Query 988 AGCTACGCTTCCTTGCAAGACTGAGGAGGAGAGAGTTATTCGAGATAAGAAAGCTTTTTT 1047 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 AGCTACGCTTCCTTGCAAGACGGAGGAGGAGAGAGTTATTCGAGATAAGAAAGCTTTTTT 1019 Query 1048 GCTTCATAGCCAGTTTATTGATACCTCAGTGCAAAGAGCTGTTAGAGCCATTTGCAACGT 1107 |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1020 GCTTCATAGCCAGTTTATCGACACCTCGGTGCAAAGAGCTGTTAGAGCCATTTGCAATTT 1079 Query 1108 GATGGATACTAATCAACAAACAAGTGGGACTACTGACTTACCTGCTGGCTCGATCCTTCT 1167 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 GATGGATACTAATCAACACACAAGTGGGACTACTGACTTACCTGCTGGCTCGATCCTTCT 1139 Query 1168 TGAGGATCATGTTGGAGATTTGTCTATTGTTGTAAAACGTGATATAGCCAGCCTTGACTC 1227 ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | Sbjct 1140 TGAGGATCATGTTGGGGATTTGTCTATTATTGTAAAACGCGATATAGCCACCCTTGACCC 1199 Query 1228 AAAGCCTGAAGCTACATTTCAAAATGATGCATTTGTTCTATCATCCGAGGAACTTGCTGA 1287 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct 1200 AAAGCCTGAAGCTACATTTCAAAATGAAGCATTTGTTCTATCATCCCAGGAACTTGCCGA 1259 Query 1288 AAGGAATTTGCTAAAAGGGATTACAGCTGATGAGAGTGTGATTGTTCA 1335 || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1260 AAAGAATTTGCTAAAAGGGATAACAGCTGATGAGAGTGTGATTGTTCA 1307 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 194778658614 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5