BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G15750.1 Length=3829 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg471773 jgi|Araly1|471773|fgenesh2_kg.1__1727__AT1G15750.2 6185 0.0 Ahg927456 jgi|Araly1|927456|scaffold_203017.1 2555 0.0 > Ahg471773 jgi|Araly1|471773|fgenesh2_kg.1__1727__AT1G15750.2 Length=3851 Score = 6185 bits (3349), Expect = 0.0 Identities = 3588/3700 (97%), Gaps = 29/3700 (1%) Strand=Plus/Plus Query 57 GAGATGCGAAGTTTCTGGATAATTATTCAGATATAGATCTGGTGATAG-TTTGGTTAGTT 115 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | Sbjct 171 GAGATGCGAAGTTTCTGGATATTTTTTCAGATATAGATCTGGTGATAGTTTTGG-TAGGT 229 Query 116 GTTGTGCATCTGAGTTAGAAAAAAGTCTTTTAAGGAAGTGAG-AGAAAACATGTCTTCTC 174 |||||| ||| | | | |||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 230 GTTGTGAATC-----T-G-----A----TTTAAGGAAGTGAGAAAAAAACATGTCTTCTC 274 Query 175 TTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTCGATGAAGAGAAGTTTAAAGAGA 234 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 275 TTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTTGATGAAGAGAAGTTTAAAGAGA 334 Query 235 CTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTATTTTGAGGATG 294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 335 CTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTATTTTGAGGATG 394 Query 295 AGGTTCACAATGGAAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTTTCACTAAAGTAG 354 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 395 AGGTGCACAATGGTAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTTTCACTAAAGTAG 454 Query 355 ATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGAAGTATCTCGAGG 414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 455 ATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGAAGTATCTCGAGG 514 Query 415 CTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGGATTTGAAAGTGT 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515 CTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGGATTTGAAAGTGT 574 Query 475 TTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACACAGCTCTTGACATTGGAGAACT 534 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 575 TTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACGCAGCTCTTGACATTGGAGAACT 634 Query 535 TCCGGGAGAATGAACAGTTATCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAAGAGCGATCATGT 594 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct 635 TCCGGGAGAATGAACAGTTGTCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAAGAGCTATAATGT 694 Query 595 TGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCTTTATTCCGTGATAAATTGCAGTTCC 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 695 TGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCGTTGTTCCGTGATAAATTGCAGTTCC 754 Query 655 CTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAAATTGGCAACACC 714 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 755 CTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAAATTGGCAGCATC 814 Query 715 AGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATCAAGACTCTTTTTGTGGATCACTCTT 774 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 815 AGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATAAAGACTCTTTTTGTGGATCACTCTT 874 Query 775 GTGGCCCTCCAAATGGCGCACGAGCTCCATCTCCTGTGAACAATCCACTGCTTGGAGGGA 834 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 875 GTGGCCCTCCAAATGGCGCACGGGCTCCATCGCCTGTGAACAATCCTCTGCTTGGAGGAA 934 Query 835 TACCAAAGGCTGGAGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTTCAACCAACGGCGT 894 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 935 TACCAAAGGCTGGAGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTTCAACCAACGGCAT 994 Query 895 CACCTGTTCCAACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTCTGTCCCACATCCAG 954 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 995 CACCCGTTCCAACGCCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTCTGTCCCACATCCAG 1054 Query 955 CTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGCGGCGTTGAAGCACC 1014 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1055 CTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGCGGCATTGAAGCACC 1114 Query 1015 CGAGAACTCCTCCAACTAATGCTTCTTTAGACTACCCGTCAGCAGATTCTGAACATGTCT 1074 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1115 CGAGAACTCCTCCAACTAATGCTGCTTTAGACTACCCGTCAGCAGATTCTGAACATGTCT 1174 Query 1075 CAAAAAGAACAAGACCAATGGGAATCTCTGACGAGGTGAATCTAGGCGTGAACATGTTAC 1134 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1175 CAAAAAGAACAAGGCCAATGGGAATTTCTGACGAGGTGAATCTAGGCGTGAACATGTTAC 1234 Query 1135 CGATGTCATTTTCAGGGCAGGCCCATGGTCATTCTCCGGCTTTCAAAGCACCTGACGACT 1194 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1235 CGATGTCATTTTCAGGGCAGGCCCATGGTCATACTCCGGCTTTCAAAGCACCTGATGACT 1294 Query 1195 TGCCCAAGACAGTTGCGAGAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCATGAGCATGGATTTCC 1254 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1295 TGCCCAAGACAGTTGCGCGAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCATGAGCATGGATTTCC 1354 Query 1255 ATCCAATTAAACAGACCCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTGATATCGGGCTGTGGG 1314 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1355 ATCCAATTAAACAGACTCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTGATATCGGGCTGTGGG 1414 Query 1315 AAGTTGGTTCTCGCGAAAGATTAGTACAGAAGACGTTCAAAGTCTGGGATTTGAGTAAAT 1374 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1415 AAGTTGGTTCTCGCGAAAGATTAGTACAGAAGACCTTCAAAGTCTGGGATTTGAGTAAAT 1474 Query 1375 GTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCTGTCAACCGTGTGA 1434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1475 GTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCTGTCAACCGTGTGA 1534 Query 1435 TATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGACATATTGTACAACTAT 1494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1535 TATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGACATATTGTGCAACTAT 1594 Query 1495 ACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTGATGCTCATGTTGGTG 1554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1595 ACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTGGAGATTGATGCTCATGTTGGTG 1654 Query 1555 GTGTGAATGATATTTCCTTCTCGACTCCAAACAAGCAACTATGTGTAATAACTTGTGGTG 1614 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1655 GTGTGAACGATATTTCCTTCTCGACTCCGAACAAGCAACTATGTGTAATAACTTGTGGTG 1714 Query 1615 ATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAAAGGCATACTTTTGAAG 1674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1715 ATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAAAGGCATACTTTTGAAG 1774 Query 1675 GCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGAAAACATTCAGTTCATAT 1734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1775 GCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGAAAACATTCAGTTCATAT 1834 Query 1735 TTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCTTGGTTGTATGATAATATGGGTTCCCGAG 1794 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1835 TTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCATGGTTGTATGATAATATGGGTTCCCGAG 1894 Query 1795 TTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTATAGTGCCGATGGTACTA 1854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1895 TTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTATAGTGCCGATGGTACTA 1954 Query 1855 GGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCATTGTTGAGTGGAATGAAA 1914 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1955 GGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCATTGTTGAGTGGAATGAAA 2014 Query 1915 GCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCTCTAGGTGTTGTGC 1974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2015 GCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCTCTAGGTGTTGTGC 2074 Query 1975 AGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGATTTCTCCATCAAGTTCT 2034 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2075 AGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGACTTCTCCATCAAGTTCT 2134 Query 2035 GGGATATGGACGCTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGCGATGGAGGCCTCCAGGCAA 2094 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2135 GGGATATGGACACTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGCGATGGAGGCCTCCAGGCAA 2194 Query 2095 GCCCGCGTATCCGGTTCAACAAGGAAGGCTCTCTCCTGGCCGTGTCTGGCAACGAGAATG 2154 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2195 GCCCGCGTATCCGGTTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCGTGTCTGGAAACGAGAATG 2254 Query 2155 TGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGCACACTTTTGAGAACATAT 2214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2255 TGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGCACACTTTTGAGAACATAT 2314 Query 2215 CATCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATAAACAGCATAGCAGCGGCAGCGGCAGCTGCTGCAA 2274 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2315 CATCTGAATCCTCTAAGCCTGCAATAAACAGCATTGCAGCGGCAGCGGCAGCTGCTGCAA 2374 Query 2275 CAAGTGCTGGTCACGCAGATCGATCAGCCAATGTAGTTTCCATCCAAGGAATGAATGGAG 2334 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2375 CGAGTGCTGGTCACGCAGATCGATCAGCCAATGTAGTTTCCATCCAAGGAATGAATGGAG 2434 Query 2335 ATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAGTGATCACAGAAGAATCAAATGATAAGTCTA 2394 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 2435 ATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAGTGATTACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTA 2494 Query 2395 AGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGCCTTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTG 2454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2495 AGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGCCTTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTG 2554 Query 2455 AGAATCTGAGAGTAGCCAAGATATCAAGATTGATTTTCACGAATTCGGGAAATGCTATTT 2514 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2555 AGAATCTGAGAGTCGCCAAGATATCAAGATTGATTTTCACGAATTCGGGAAACGCTATTT 2614 Query 2515 TGGCTCTGGCATCAAACGCAATTCATCTTCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACG 2574 ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2615 TGGCTTTGGCATCAAACGCCATTCATCTTCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACG 2674 Query 2575 CAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACCGCCTCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATCC 2634 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2675 CAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACCGCCTCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATAC 2734 Query 2635 TCATGACTAACGATGTTGCTGAAACCAAT-C--CCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTT 2691 | ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2735 TAATGACTAACGACGTTGCTGAAACCAATACTACCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTT 2794 Query 2692 TATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAGCCTCCGGAGGAAAGATATCCTTATTTAACA 2751 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2795 TATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAGCCTCCGGAGGAAAGATCTCCTTATTTAACA 2854 Query 2752 TGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTCATGCCCCCACCACCGGCTGCTACTTTTCTTG 2811 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 2855 TGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTTATGCCCCCACCGCCGGCTGCAACTTTTCTTG 2914 Query 2812 CTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATCGCTATTGGGATGGATGATAGCACGATTCAGA 2871 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 2915 CTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATTGCTATCGGAATGGATGATAGCACGATTCAGA 2974 Query 2872 TTTATAATGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGAGTAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAA 2931 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2975 TTTATAACGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGAGTAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAA 3034 Query 2932 CTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAACGTGTTGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGC 2991 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3035 CTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAATGTGTTGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGC 3094 Query 2992 TTTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAAAAGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCAC 3051 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3095 TCTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAAAAGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCAC 3154 Query 3052 AGGGAAGACCAAACAGTGCACCTTCAGATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCTC 3111 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3155 AGGGAAGACCAAACAGTGCACCTTCAGATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCTC 3214 Query 3112 ACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGCAACTTGCTATATACGAAACTACCAAGCTCGAATGCA 3171 ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3215 ACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGCAGCTCGCTATATACGAAACGACCAAGCTCGAATGCA 3274 Query 3172 TGAAACAGTGGGCTGTTCGAGAATCATTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCG 3231 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3275 TGAAACAGTGGGCTGTACGAGAATCATTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCG 3334 Query 3232 ATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTTTTATGGATGCAACAGTTTGTGTATTTAGCTCTGCAA 3291 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3335 ATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTTTTATGGATGCAACAGTTTGTGTATTTAGCTCTGCAA 3394 Query 3292 ATCTACGGCTGCGTTGCCGGGTCAACCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATT 3351 ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3395 ATCTAAGATTGCGTTGCCGGGTCAACCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATT 3454 Query 3352 CAAACGTACATCCACTAGTGATTGCTGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCAGTTG 3411 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3455 CAAACGTACATCCACTAGTGATTGCGGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCAGTTG 3514 Query 3412 GTCTCTCAGACGGGGGAGTGCACATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAG 3471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3515 GTCTCTCAGACGGGGGAGTGCACATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAG 3574 Query 3472 TCGCTCCACCGGCTGAGAACGGGTCGGCTAGCGGTGCA-CCAACTGCACCTTCCGTTGGA 3530 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 3575 TCGCTCCACCTGCTGAGAACGGGTCGGCTAGCGGGGCAGCCA-CTGCACCTTCCGTTGGA 3633 Query 3531 GCCTCTGCATCTGATCAGCCTCAGAGATGATCTGATCCGAGAGCCACCTACCTCTCTGAT 3590 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3634 GCCTCTGCATCTGATCAGCCTCAGAGATGATCTGAGCCGAGAGTCACCTACCTCTCTGAT 3693 Query 3591 TCCCTTTCTTCTATTTAAAAGTCTTT-TCTTTCTT--AtttttttGGTAGAAAAATTTAT 3647 |||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||||| Sbjct 3694 TCCCTTTCTTCTTTTTAAAAGTCTTTCTTTTTATTTTATTTTTTTGGTAGAAAGATTTAT 3753 Query 3648 GACCCAGAGATTCTTAACATTTAGATGTAACATATT-TTCACAGTAATTCAGTAGTGAAG 3706 |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3754 GACCCAAAGATTCT-AACATTTAGATGTAACATATTATTCACAGTAATTCAGTAGTAAAG 3812 Query 3707 TTTGGATAAAAACAGTGACTGATGTTGTTTCTCTCTCTTT 3746 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3813 TT-GGATAAAAACAGTGACTGATGTTGTTTCTCTCTCTTT 3851 > Ahg927456 jgi|Araly1|927456|scaffold_203017.1 Length=3406 Score = 2555 bits (1383), Expect = 0.0 Identities = 1859/2093 (89%), Gaps = 16/2093 (1%) Strand=Plus/Plus Query 164 CATGTCTTCTCTTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTCGATGAAGAGAA 223 |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| Sbjct 23 CATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTGTTCTTGATCTTACAGTTTTTAGACGAAGAGAA 82 Query 224 GTTTAAAGAGACTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTA 283 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 83 GTTCAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGTA 142 Query 284 TTTTGAGGATGAGGTTCACAATGGAAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTTT 343 ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 143 TTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAGGTATCTCTCTGGTTT 202 Query 344 CACTAAAGTAGATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGAA 403 || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| Sbjct 203 TACCAAAGTTGATGATAATAGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAGAA 262 Query 404 GTATCTCGAGGCTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGGA 463 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || Sbjct 263 GTATCTCGAGGCCTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGAAATTCTAGTCAAAGA 322 Query 464 TTTGAAAGTGTTTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACACAGCTCTTGAC 523 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 323 TTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTGAC 382 Query 524 ATTGGAGAACTTCCGGGAGAATGAACAGTTATCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAAG 583 || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct 383 CTTAGAAAACTTCCGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCCCG 442 Query 584 AGCGATCATGTTGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCTTTATTCCGTGATAA 643 ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| Sbjct 443 AGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCATTGTTCCGTGATAA 502 Query 644 ATTGCAGTTCCCTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAAA 703 ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | || || ||||||||||| Sbjct 503 ATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAAATTCACGGCTGAGGACTCTCATTAATCAGAGCTTAAA 562 Query 704 TTGGCAACACCAGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATCAAGACTCTTTTTGT 763 ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 563 TTGGCAACATCAGCTTTGTAAAAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTTGT 622 Query 764 GGATCACTCTTGTGGCCCT-CCAAATGGCGCACGAGCTCCATCTCCTGTGAACAATCCAC 822 |||||| || || ||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| | Sbjct 623 GGATCATTCCTGCCGCC-TACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCGC 681 Query 823 TGCTTGGAGGGAT-ACCAAAGGCTGGAGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 881 |||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 682 TGCTTGGATC-ATTACCAAAAGCCGGGGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 740 Query 882 CAACCAACGGCGTCACCTGTTCCAACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTCT 941 |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 741 CAACCAACATCTTCTCCTGTTCCTACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTCT 800 Query 942 GTCCCACATCCAGCTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGCG 1001 ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| Sbjct 801 GTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGAGCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGCA 860 Query 1002 GCGTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATGCTTCTTTAGACTACCCGTCAGCAGAT 1061 || |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||| ||| Sbjct 861 GCCTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGAT 920 Query 1062 TCTGAACATGTCTCAAAAAGAACAAGACCAATGGGAATCTCTGACGAGGTGAATCTAGGC 1121 || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 921 TCAGACCATGTCTCAAAGCGAACAAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGGT 980 Query 1122 GTGAACATGTTACCGATGTCATTTTCAGGG-CAGGCCCATGGTCATTCTCCGGCTTTCAA 1180 || ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||||||| || | ||||| Sbjct 981 GTCAACATGTTACCAATGACATTCCC-GGGACAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAA 1039 Query 1181 AGCACCTGACGACTTGCCCAAGACAGTTGCGA-GAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCA 1239 ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 1040 AGCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTAGC-ACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCA 1098 Query 1240 TGAGCATGGATTTCCATCCAATTAAACAGACCCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTG 1299 ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | Sbjct 1099 TGAGCATGGATTTCCATCCTAGTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGG 1158 Query 1300 ATATCGGGCTGTGGGAAGTTGGTTCTCGCGAAAGATTAGTACAGAAGACGTTCAAAGTCT 1359 |||| ||||| |||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| | Sbjct 1159 ATATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACGACTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTT 1218 Query 1360 GGGATTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1419 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1219 GGGACTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1278 Query 1420 CTGTCAACCGTGTGATATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGAC 1479 |||||||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||| || |||| Sbjct 1279 CTGTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGATGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCAAGAC 1338 Query 1480 ATATTGTACAACTATACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTG 1539 |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 1339 ATATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGATATGAGGCAACACCTCGAGATTG 1398 Query 1540 ATGCTCATGTTGGTGGTGTGAATGATATTTCCTTCTCGACTCCAAACAAGCAACTATGTG 1599 ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 1399 ATGCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTCTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTG 1458 Query 1600 TAA-TAACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAA 1658 | | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| Sbjct 1459 TTACTA-CTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGT-AAA 1516 Query 1659 A-GGCATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGA 1717 | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||||| Sbjct 1517 ACGGCATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGA 1576 Query 1718 AAACATTCAGTTCATATTTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCTTGGTTGTATGA 1777 ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| Sbjct 1577 AAACATTCAGTTCATCTTTTCAACTGCGCTTGACGGGAAAATAAAAGCATGGTTATATGA 1636 Query 1778 TAATATGGGTTCCCGAGTTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTA 1837 |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct 1637 TAATATGGGTTCTCGGGTTGACTATGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTA 1696 Query 1838 TAGTGCCGATGGTACTAGGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCAT 1897 ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| Sbjct 1697 CAGTGCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCAT 1756 Query 1898 TGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 1957 |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1757 AGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCAGTTAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 1816 Query 1958 TTCTCTAGGTGTTGTGCAGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGA 2017 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1817 TTCTCTTGGTGTTGTGCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGA 1876 Query 2018 TTTCTCCATCAAGTTCTGGGATATGGACGCTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGC-G 2076 |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | | Sbjct 1877 CTTCTCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACTATACAGCTTTTGACTGCCATTGATG-CTG 1935 Query 2077 ATGGAGGCCTCCAGGCAAGCCCGCGTATCCGGTTCAACAAGGAAGGCTCTCTCCTGGCCG 2136 ||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1936 ATGGAGGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCG 1995 Query 2137 TGTCTGGCAAC-GAGAATGTGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTG 2195 | |||| ||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1996 TTTCTG-CAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTTAGGCTATTG 2054 Query 2196 CACACTTTTGAGAACATATCATCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATAAACAGCAT 2248 ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2055 CACACAGTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCAT 2107 Score = 1290 bits (698), Expect = 0.0 Identities = 1082/1268 (85%), Gaps = 24/1268 (2%) Strand=Plus/Plus Query 2306 TGTAGTTTCCA-TCCAAGGAATGAATGGAGATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAG 2364 ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2132 TGTCGTTTCCATTCC-TGGAATGAATGGAGATTCACGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAG 2190 Query 2365 TGATCACAGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGC 2424 ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | Sbjct 2191 TGATCACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAACTCGGCGAAC 2250 Query 2425 CTTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTGAGAATCTGAGAGT-AGCCAAGATATCAAGA 2483 | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| Sbjct 2251 CCTCTCAATGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGCCA-CCAAGATATCGAGA 2309 Query 2484 TTGATTTTCACGAATTCGGGAAATGCTATTTTGGC-TCTGGCATCAAACGCAATTCATCT 2542 ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||| Sbjct 2310 TTGATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCAT-TGGCATCAAATGCTATTCATCT 2368 Query 2543 TCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACGCAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACC 2602 |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 2369 GCTATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGAAAGGCAACGGCTTCTTTACC 2428 Query 2603 GCCTCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATCCTCATGACTAACGATGTTGCTGAAACCAA 2662 |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||| | |||||| || Sbjct 2429 TCCTCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGATCTTAATGACAAACGATGTGGTTGAAACTAA 2488 Query 2663 TCCCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTTTATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAGC 2722 ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| Sbjct 2489 TCCAGAAGAAGCCGTACCATGTTTTGCTTTATCCAAAAATGATTCCTACGTAATGTCAGC 2548 Query 2723 CTCCGGAGGAAAGATATCCTTATTTAACATGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTCAT 2782 || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2549 ATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCTACTTTCAT 2608 Query 2783 GCCCCCACCACCGGCTGCTACTTTTCTTGCTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATCGC 2842 ||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct 2609 GCCGCCGCCCCCTGCTGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAATATCATTGC 2668 Query 2843 TATTGGGATGGATGATAGCACGATTCAGATTTATAATGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGAG 2902 || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 2669 GATCGGGATGGATGATAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAGGTTAAGAG 2728 Query 2903 TAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAACTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAACGT 2962 ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||| ||||||| Sbjct 2729 CAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTACTAAACGT 2788 Query 2963 GT-TGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGCTTTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAAA 3021 | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | Sbjct 2789 -TCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGTGTATGGAACACGGATGGATGGGAGA 2847 Query 3022 AGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCACAGGGAAGACCAAACAGT--GCACCT-TCAG 3078 |||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | || || | | |||| Sbjct 2848 AGCAGAAAAGCAAGGTCCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCGA-C-GTCTGCTC-TGTCAG 2904 Query 3079 ATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCT-CACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGCAA 3137 | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || || || || || || Sbjct 2905 ACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAG-TACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACTCAG 2963 Query 3138 CTTGCTATATACGAAACTACCAAGCTCGAATGCATGAAACAGTGGGCTGTTCGAGAATCA 3197 || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| Sbjct 2964 CTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAATCA 3023 Query 3198 TTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCGATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTTTT 3257 | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| | ||||| Sbjct 3024 TCAGCTCCAATCACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAACTGATATACACAAGTTTC 3083 Query 3258 ATGGATGCAACAGTT-TGTGTATTTAGCTCTGCAAATCTACGGCTGCGTTGCCGGGTCAA 3316 ||||| || || | | ||||| || ||||||||||| || || |||||||| | ||||| Sbjct 3084 ATGGACGCTAC-GATATGTGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTCAA 3142 Query 3317 -CCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATTCAAACGTACATCCACTAGTGATTG 3375 |||| |||| ||| | |||||| ||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | Sbjct 3143 TCCCT-CTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAACGTCCATCCGCTGGTGATAG 3201 Query 3376 CTGCACATCCGCAAGAACCAAACATGTTTGCAGTTGGTCTCTCAGACGG-GGGAGTGCAC 3434 | || |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| || || Sbjct 3202 CGGCTCATCCGCAAGAATCGAATATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGG-GTCCAT 3260 Query 3435 ATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAGTCGCTCCACCGGCTGAGAACGGG 3494 |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || Sbjct 3261 ATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACCGCCTGAAAATGGC 3320 Query 3495 TCGGCTAGCGGTGC-ACCAACTGCACCTTCCGTTGGAGCCTCTGCATCTGATCAGCCTCA 3553 || || |||| || || || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct 3321 TCAGCCAGCGCTGTTACGG-CTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCCTCA 3379 Query 3554 GAGATGAT 3561 |||||||| Sbjct 3380 GAGATGAT 3387 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 144694892546 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5