BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G17220.1
Length=3686
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg471925 jgi|Araly1|471925|fgenesh2_kg.1__1879__AT1G17220.1 5995 0.0
> Ahg471925 jgi|Araly1|471925|fgenesh2_kg.1__1879__AT1G17220.1
Length=3629
Score = 5995 bits (3246), Expect = 0.0
Identities = 3519/3646 (97%), Gaps = 37/3646 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATAGAAGCAGCCACACCCACACAAGCTCAAGTTCAAAGTTATCTCCGCActctcttcttc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATAGAAGCAGCCACACCCACACAAGCTCAAGTTCAAAGTTATCTCCGCACTCTCTTCTTC 60
Query 61 ttctt-c--ctccttcacttatcttcttcttcctctctctctttctctcACCATATATCT 117
||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||
Sbjct 61 TTCTTCCTTCTCCTTCACTTATCTTCTTCTTCCTCTCAC-C---CTCT---C-----TCT 108
Query 118 AAATTGCTCATCGATTCTCAATTCAGCTTCATGCTTTCGGATTTGATTCGTCGATAACCC 177
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 AAATTTCTCATCGATTCTCAATTCAGCTTGATGCTCTCGGATTTGATTCGTCGATAACCC 168
Query 178 CAATTTCTTTAC-AAAGTTGAAGTTTTTATGTCATTTCTGGTTCGAAATTCGTTGCAATT 236
|||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 169 CAATTTCTTT-CGAAATTTGAAGTTTTTATGTCATTTCTGGTTCGAAATTCGTTGGAATT 227
Query 237 GGAATGAGATAAAGTCTCTGAATTTGCTATCGCTTTGTT-TTATTCGTTTTCTGtttttt 295
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| |||
Sbjct 228 GGAATGAGATAAAGTCTCTGACTTTGCTATCGGTTTGTTGTT-TTCG-TTTCTGGGTTTA 285
Query 296 ttGAGATGCCATCGATGCTTGTTCTCGTCGGCACAATGCCGTCCTTGGCTTCTCTGGTTA 355
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286 TTGAGATGCCGTCGATGCTTGTTCTCGTCGGCACAATGCCGTCCTTGGCTTCTCTGGTTA 345
Query 356 GTCTAGGTGGTGCTTGTGCAAGCGTTTCTGGAACGAGTTCTTCGGATGCATCGTATGCTT 415
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 GTCTAGGTGGTGCTTGTGCAAGCGTTTCAGGAACGAGTTCTTCGGATGCATCGTATGCTT 405
Query 416 TAGTTAAGAGGGTTTCTTTGTCAAGGAGAAGTGTTAAGGGGACTAAGAAATGGCTGTGTA 475
||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 TAGTTAAGAGGGTATCGTTGTCAAGGAGAAGTGTCAAGGGGACTAAGAAATGGCTGTGTA 465
Query 476 GATATTCTGTTTCGTCTTCAACTACTACTACTACTGCTGACTTCATTGCTGACCAAAACA 535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 466 GATATTCTGTTTCGTCTTCAACTACTACTACTACTGCTGACTTCATTGCTGAGCAAAACA 525
Query 536 ACAACTCAGTTTCTATAGATTCTAACTCGTTTAGGGGGAGTAAAGATGGGGATGATAGTG 595
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 526 ACAACTCAGTTTCTATAGATTCTAACTCGTTTAGGGGGAGTAAAGAAGGGGATGATAGTG 585
Query 596 AGGTTGTGCTGAAGCAGACTCCTAAACCTGTCTTGAAACCCCCTGTGGCAAGGGTAGAAA 655
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 AGGTTGTGCTGAAGCAGACTCCTAAACCTGTGTTGAAACCCCCTGTGGCAAGGGTAGAAA 645
Query 656 GAGGTTTGGGGGTGAATACTGCTCCTTGGAGTAAAGATTTGTCGAATGGGGGTAAGTTTG 715
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 646 GAGGTTTGGGGGTGAATACTGCTCCTTGGAGTAAAGATTTATCTAATGGGGGTAAGTTTG 705
Query 716 ATGGAGAAGAAGAGAGGAATAAGGTTATTGAATCTCTTGGTGAAGTTTTAGATAAAGCTG 775
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 706 ATGGAGAAGAAGAGAGGAATAAGATTATTGAATCTCTTGGTGAAGTGTTAGATAAAGCTG 765
Query 776 AGAAGTTGGAAATTCCGAAACCGGGTAACAAAGAGGGTGGTGAGGCTGTTAAGCCGTCAC 835
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 766 AGAAGTTGGAAATTCCGAAACCGGGTAACAAAGAGGGTGGTGAGGCTGTTAAACCGTCAC 825
Query 836 AGCCTAGTGCCAACAGTAGTAACTCAAGAAATGGTAGCTATGCGAATGCGAGTGATGGAG 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 826 AGCCTAGTGCCAACAGTAGTAACTCAAGAAATGGTAGCTATGCGAGTGCGAGTGATGGAG 885
Query 896 GAACAAGGAAGACGAAAACCATGAAGAGTGTGTGGCGTAAGGGCGATGCTGTTGCTGCTG 955
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 GGACAAGGAAGACGAAAACCATGAAGAGTGTGTGGCGTAAGGGCGATGCTGTTGCTGCTG 945
Query 956 TGCAAAAAGTTGTTAAGGAATCACCTAAAATTTTTAATAGAGGAGTGCAGACCGAACCTA 1015
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 946 TGCAAAAAGTTGTTAAGGAATCACCTAAAATTGTTAATAGAGGAATGCAGGTGGAACCTA 1005
Query 1016 GAACGAGAGAAGAGGGAGAGGTGAATGCCAAAGCAGGCACTCCATTGGCACCACCTCAGC 1075
|| ||| ||| || | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1006 GATCGAAAGAGGATGAAGAGGTGAATGCCATAGCTGGCACTCAATTGGCACCACCTCAGC 1065
Query 1076 CACCTTTTAGACCTCAACCGCCTGTAAGACCCCAGCCAATGTTACAAGGGAAGCCTATGG 1135
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 CACCTTTTAGACCTCAACCACCTGTAAGACCCCAGCCAATGTTACAAGGGAAGCCTATGG 1125
Query 1136 TAGCT---CCACCCGTAAAGAAATCACCCATCTTAAAAGATCTTGGTATGGCAGCAAAAC 1192
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 TAGCTCCGCCACCCGTAAAGAAATCACCCATCTTAAAAGATCTTGGTATGGCAGCAAAAC 1185
Query 1193 CTTTAGTTTCTGAAGAAGTTGATTCTAGCGTTAAAAGTAAAGAAAGGAAGCCTATTTTGG 1252
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1186 CTTTAGTTTCTGAAGAAGTTGATTCTAGCGTAAAAAGTAAAGATAGGAAGCCTATTTTGG 1245
Query 1253 TTGACAAATTTGCTTCGAAGAAAAAAGGTGTTGATCCTGCGGCCTCTCAGGCTGTGTTAG 1312
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1246 TTGACAAATTTGCTTCCAAGAAAAAAGGTGTTGATCCTGTGGCCTCTCAGGCTGTGTTAG 1305
Query 1313 CTCCTACTAAGCCTGGAAAGGGTCCTCCCTCTAACAAGTTCAGAGTTGAGCACCGTAATa 1372
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 CTCCTACTAAGCCTGGAAAGGGTCCTCCCGCTAACAAGTTCAGAGTTGAGCACCGTAATA 1365
Query 1373 aaaaaaaTGCATCAGCTAGTCCAAGACGAAGAATTGTTGCTGAAGACGACGGCGACGATG 1432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1366 AAAAAAATGCATCAGCTAGTCCAAGACGAAGAATTGTTGCTGAAGATGACGGCGACGAAG 1425
Query 1433 ATGCATCCATTTCTCGATCAGGTAGAAAAGGGAGAAAATGGAGTAAAGCTAGTAGGAAGG 1492
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 ATACATCCATTTCTCGATCAGGTCGAAAAGGGAGAAAATGGAGTAAAGCTAGTAGGAAGG 1485
Query 1493 CTGTAAGACTCCAGGCTGCAAAAGACGCAGCACCTGTCAAAGCTGAAATCTTAGAGGTAG 1552
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1486 CTGTAAGACTCCAAGCTGCAAAAGACGCAGCACCTGTCAAAGCTGAAATCTTAGAGGTAG 1545
Query 1553 AGGAAGAAGGCATGTCCATCGAGGATTTGGCTTACAACCTAGCCATCGGAGAAGGTGACA 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 AGGAAGAAGGCATGTCCATCGAGGATTTGGCTTACAACCTAGCCATCGGAGAAGGTGACA 1605
Query 1613 TCCTTGGGTACCTATATTCAAAAGGGATTAGACCTGATGGTGTGCACACTTTGGACCGCG 1672
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1606 TCCTTGGGTACCTATATTCAAAAGGGATTAGACCTGATGGTGTGCAGACCTTGGACCGCG 1665
Query 1673 AGATGGTGAAGATGATTTGTAGAGATTACGATGTTGAGGTCCTTGATGCTGATTCAGTTA 1732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666 AGATGGTGAAGATGATTTGTAGAGATTACGATGTTGAGGTCCTTGATGCTGATTCAGTTA 1725
Query 1733 AAGTAGAAGAGATGGCAAAGAAAAGGCAAACTTTTGATGAAGAAGATTTGGACAAGTTAG 1792
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1726 AAGTAGAAGAGATGGCAAAGAAAAGGCAAACTTTTGATGAAGAAGATTTGGATAAGTTAG 1785
Query 1793 AGGACAGACCTCCTGTCATAACGATAATGGGTCATGTGGACCATGGAAAGACCACTCTTC 1852
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786 AGGACAGACCTCCAGTCATAACGATAATGGGTCATGTGGACCATGGAAAGACCACTCTTC 1845
Query 1853 TCGACTATATCAGAAAAAGCAAGGTTGCTGCGTCAGAAGCAGGAGGAATTACACAAGGAA 1912
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 TAGACTATATCAGAAAAAGCAAGGTTGCTGCGTCAGAAGCAGGAGGAATTACACAAGGAA 1905
Query 1913 TTGGTGCATATAAGGTGTCAGTGCCTGTTGATGGAAAGTTGCAGTCCTGCGTTTTCCTTG 1972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906 TTGGTGCATATAAGGTGTCAGTGCCTGTTGATGGAAAGTTGCAGTCCTGCGTTTTCCTTG 1965
Query 1973 ATACTCCTGGACATGAGGCATTTGGTGCAATGAGAGCTCGCGGAGCACGAGTCACTGACA 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1966 ATACTCCTGGACATGAGGCATTTGGTGCAATGAGAGCTCGCGGAGCACGGGTCACTGACA 2025
Query 2033 TTGCAATCATTGTGGTTGCTGCTGATGATGGAATTCGTCCTCAAACAAATGAAGCAATAG 2092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2026 TTGCAATCATTGTGGTTGCTGCTGATGATGGAATTCGTCCTCAAACAAATGAAGCAATAG 2085
Query 2093 CTCACGCAAAGGCTGCTGCTGTACCAATAGTTATAGCTATAAATAAGATAGATAAAGAAG 2152
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2086 CTCACGCAAAGGCTGCTGCTGTACCAATAGTCATAGCTATAAATAAGATAGATAAAGAAG 2145
Query 2153 GAGCTAGTCCAGATAGAGTGATGCAAGAGCTTTCTTCAATTGGTTTGATGCCTGAAGATT 2212
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 GAGCTAGTCCAGAGCGAGTGATGCAAGAGCTTTCTTCAATTGGTTTGATGCCTGAAGATT 2205
Query 2213 GGGGTGGTGATGTTCCAATGGTTCAGATCAGTGCTTTGAAAGGGGAAAATGTCGATGATC 2272
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 2206 GGGGTGGTGATGTTCCAATGGTTCAGATAAGTGCATTGAAAGGGGAGAATATCGATGATC 2265
Query 2273 TGTTGGAAACTGTCATGCTTGTTGCAGAGCTTCAAGAGTTGAAAGCAAATCCACACAGAA 2332
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2266 TGTTGGAAACTGTCATGCTTGTTGCAGAGCTGCAAGAGTTGAAAGCAAATCCACACAGAA 2325
Query 2333 ATGCCAAGGGCATTGTAATCGAGGCTGGACTTGATAAAGCAAAAGGACCATTTGCGACGT 2392
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2326 ATGCCAAGGGCATTGTTATCGAGGCTGGACTTGATAAAGCAAAAGGACCATTTGCGACAT 2385
Query 2393 TCATTGTTCAGAAGGGGACTTTGAAAAGAGGGGATGTTGTTGTTTGCGGAGAAGCTTTCG 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2386 TCATTGTTCAGAAGGGGACTTTGAAAAGAGGGGATGTTGTTGTTTGCGGAGAAGCTTTCG 2445
Query 2453 GAAAGGTACGAGCTTTATTTGATCACAGTGGGGAACGAGTTGATGAAGCTGGACCCTCCA 2512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446 GAAAGGTACGAGCTTTATTTGATCACAGTGGGGAACGAGTTGATGAAGCTGGACCCTCCA 2505
Query 2513 TACCTGTACAGGTGATTGGTTTAAATAATGTCCCCATTGCTGGTGATGAATTTGAGATCG 2572
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2506 TACCTGTACAGGTGATTGGTTTAAATAATGTCCCCATTGCTGGTGACGAATTTGAGATTG 2565
Query 2573 TCTCTTCCCTTGATGTGGCGCGGGAGATGGCAGAGGCACGTGCGGTATCACTACGAGATG 2632
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566 TCTCTTCCCTTGATGTGGCACGTGAGATGGCAGAGGCACGTGCGGTATCACTACGAGATG 2625
Query 2633 AAAGAATATCTGCAAAGGCTGGGGATGGAAAGGTCACGCTTTCCTCCTTAGCTTCTGCTG 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2626 AAAGAATATCTGCAAAGGCTGGGGATGGAAAGGTCACGCTTTCCTCCTTAGCTTCTGCTG 2685
Query 2693 TATCAGCGAAAAAGATGTCAGGCTTAGATTTGCATCAGCTTAATATCATCTTGAAGGTCG 2752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2686 TATCAGCGAAAAAGATGTCAGGCTTAGATTTGCATCAGCTTAATATCATCTTGAAGGTCG 2745
Query 2753 ATGTACAGGGATCCATTGAAGCTGTAAGACAAGCCCTTCAAGTCCTCCCTCAGGAGAATG 2812
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2746 ATGTACAGGGATCCATTGAAGCTGTCAGACAAGCCCTGCAAGTCCTCCCTCAGGAGAATG 2805
Query 2813 TCACCTTGAAATTCTTGCTACAAGCAACAGGGGATGTGAGCAACAGTGATGTTGATCTAG 2872
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806 TCACCTTGAAATTCTTGCTACAAGCGACAGGGGATGTGAGCAACAGTGATGTTGATCTAG 2865
Query 2873 CATCAGCGAGTGAAGCTATCGTTTTTGGATTTAATGTCAAAGCGTCTGGTTCTGTTAAGA 2932
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2866 CATCAGCGAGTGAAGCCATCATTTTTGGATTTAATGTCAAAGCGTCTGGTTCTGTTAAGA 2925
Query 2933 AAGCTGCAGAAAACAAAGGTGTTGAAATCCGACTATATAGAGTTATATATGAGCTTATTG 2992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2926 AAGCTGCAGAAAACAAAGGTGTTGAAATCCGACTATATAGAGTTATATATGAGCTTATTG 2985
Query 2993 ACGATGTGCGAAACGCAATGGAAGGACTTCTTGAGTCTGTTGAGGAACAAATCCCAATTG 3052
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2986 ACGATGTACGAAACGCAATGGAAGGACTTCTTGAGTCTGTTGAGGAACAAATCCCAATTG 3045
Query 3053 GCTCAGCAGAAGTTCGAGCTACTTTCAGCAGTGGAAGTGGTCGTGTGGCTGGATGCATGG 3112
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3046 GCTCAGCAGAAGTTCGGGCAACTTTCAGCAGTGGAAGTGGCCGTGTGGCTGGATGCATGG 3105
Query 3113 TGAATGAAGGAAAATTTGTCAAAGATTGTGGCATCAGGGTGGTCCGGAAGGGTAAAACTG 3172
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3106 TGAATGAAGGGAAATTTGTCAAAGATTGTGGCATCAGGGTGGTCCGGAAGGGTAAAACTG 3165
Query 3173 TCCATGTCGGTGTTCTTGATTCTCTTAAACGGGTTAAAGAAAACGTGAAAGAGGTGAGTG 3232
|||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3166 TCCACGTCGGTGTCCTTGATTCTCTTAAACGAGTTAAAGAAAACGTGAAAGAGGTGAGTG 3225
Query 3233 CTGGATTAGAATGTGGTATTGGTATGGATGACTACGATGATTGGATAGAAGGAGACATCA 3292
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3226 CTGGATTAGAATGTGGTATCGGTATGGATGACTACGATGATTGGATAGAAGGAGACATCA 3285
Query 3293 TCGAGGCCTTTAACGCAGTTCAAAAGAGGCGAACGCTAGAAGAAGCATCAGCTTCAATGT 3352
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3286 TCGAGGCCTTTAATGCAGTTCAAAAGAGGCGAACACTAGAAGAAGCATCAGCTTCAATGT 3345
Query 3353 CTGCTGCGATTGAAGAGGCTGGAGTTTAATTGTGATCCAGGTTTTGCTTCTAAAGTCATC 3412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3346 CTGCTGCGATTGAAGAGGCTGGAGTTTAATTGTGATCCAGGTTTTGCTTCTAAAGTCATC 3405
Query 3413 AAAGAAACTCAAGCAAACAACAAAATCAGACTCTCAGGGTAAGATTTTTGGTCACACAAC 3472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3406 AAAGAAACTCAAGCAAACAACAAAATCAGACTCTCAGGGTATGATTTG-GGTCACACAAC 3464
Query 3473 AGTT-GGTTGGTACATTGTTTGTAATGGTCTCATTTTGTACATGGCAAATGTT-C-CTAC 3529
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3465 AGTTTGGTTGGTACATTGTTTGTAATGGTCTCATTTTGTACATGGCAAATGTTTCTCTAC 3524
Query 3530 ATTT-GGTTGATTGATGTAGGAA-GaaaaaaaTGAACCAAATATAACAATATTATCTTGA 3587
|||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3525 ATTTTGGTTGATTGATGTAGGAAAGAAAAAAA-GACCCAAATATAACAATATTATCTTGA 3583
Query 3588 AAA-AAG---TCCTT-T--ATAATGTCTATAAATTCATTACTTTAT 3626
||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3584 AAAGAAAAAATCCTTATTTATAATGTCTATAAATTCATTACTTTAT 3629
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 139252659607
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5