BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G18270.3 Length=4501 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg472044 jgi|Araly1|472044|fgenesh2_kg.1__1998__AT1G18270.2 4294 0.0 > Ahg472044 jgi|Araly1|472044|fgenesh2_kg.1__1998__AT1G18270.2 Length=4305 Score = 4294 bits (2325), Expect = 0.0 Identities = 2500/2585 (97%), Gaps = 9/2585 (0%) Strand=Plus/Plus Query 75 CGGAGAATTGTAGTGATCGGAGAAAATGAGTGGCGTGGTTGGGTTTGTTGGTCTTGATTC 134 |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CGGAGAATCGTAGTGATCGGAGAAGATGGGAGGCGTCGTTGGGTTTGTTGGTCTTGATTC 60 Query 135 TTTCAGCTTCGAATTAGCTTCTTCGCTTCTTCGTTCTGGGTTTAAGGTTCAAGCATTCGA 194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTTCAGCTTCGAATTAGCTTCTTCGCTTCTTCGTTCTGGGTTTAAGGTTCAAGCATTCGA 120 Query 195 GATAAGTACAGAATTAGTGGAGAAGTTCATTGAATTGGGAGGACACAAATGTGACAGCCC 254 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GATAAGTACAGAATTAGTGGAGAAGTTCACTGAATTGGGAGGACACAAATGTGACAGCCC 180 Query 255 TGCAGATGTTGGGAAAGCTGCAGCAGCCGTTGTGGTTGTACTATCCCACCCTGACCAAAT 314 ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TGCTGATGTTGGGAAAGGTGCAGCAGCCGTGGTGGTTTTACTATCCCACCCTGACCAAAT 240 Query 315 TCAAGATGTCATTTTTGGTGATGAGGGTGTTATGAAAGGTCTACAGAAGGACGCTGTATT 374 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 241 TCAAGATGTCATTTTTGGTGATGAGGGTGTTATGAAAGGCCTACAGAAGGACACTGTATT 300 Query 375 GCTTTTGTCTTCGACAATATCGACTTTGCAACTCCAGAAACTAGAGAAACAACTTACAGA 434 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 301 GCTTTTGTCTTCGACAATTTCGACTTTGCAACTCCAGAAGCTAGAGAAACAACTTACAGA 360 Query 435 GAAAAGAGAGCAGATTTTTGTAGTTGATGCCTATGTTTTAAAAGGGATGTCTGAGCTTCT 494 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAACAGAGAGCAGATTTTTGTAGTTGATGCCTATGTTTTAAAAGGGATGTCTGAGCTTCT 420 Query 495 TGATGGAAAACTAATGATAATAGCATCTGGAAGGTCAGATTCGATCACAAGAGCACAACC 554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TGATGGAAAACTAATGATAATAGCATCTGGAAGGTCAGATTCGATCACAAGAGCACAACC 480 Query 555 CTATCTTACTGCAATGTGTCAAAATCTGTACACCTTTGAGGGAGAAATTGGTGCTGGAAG 614 || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 481 CTTTCTTACTGCAATGTGTCAGAAGCTGTACACTTTTGATGGAGAAATTGGTGCTGGAAG 540 Query 615 TAAAGTTAAAATGGTGAATGAGTTGCTTGAGGGCATACATCTTGTTGCTGCTGTGGAGGC 674 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TAAAGTTAAAATGGTGAATGAGCTGCTTGAGGGCATTCATCTTGTTGCTGCTGTGGAGGC 600 Query 675 TATATCTTTAGGTTCTCAGGCGGGTGTGCATCCATGGATACTTTATGACATAATTTCCAA 734 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 601 TATATCTTTAGGTTCTCAGGCGGGTGTGCATCCGTGGATACTGTATGACATCATTTCCAA 660 Query 735 TGCTGCTGGAAATTCATGGATTTACAAGAATCATATTCCGTTGTTGCTAAAAGATGACAT 794 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 661 TGCTGCTGGAAATTCATGGATTTACAAGAATCATATTCCGTTGTTGCTAAAAGATGATAT 720 Query 795 AGAGGGTCGCTTCCTCGATGTTCTCTCTCAGAATCTGGCCATTGTTGAAGATAAAGCCAA 854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 721 AGAGGGTCGCTTCCTCGATGTTCTCTCTCAGAATCTGGGCATTGTTGAAGATAAAGCCAA 780 Query 855 ATCGCTCCCATTTCCTGTCCCACTTTTGGCAGTTGCACGCCAACAACTAATCTCTGGAAT 914 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 781 ATCGCTCCCATTTCCTGTCCCACTTTTGGCAGTTGCACGCCAACAACTAATCTCCGGAAT 840 Query 915 ATCACAGATGCAGGGAGATGATACAGCTACTTCATTGGCTAAGATCTCGGAAAAAGTACT 974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| Sbjct 841 ATCACAGATGCAGGGAGATGATACAGCTACTTCATTAGCTAAGATCTGGGAAAAAGTACT 900 Query 975 TGGTGTTGGCATATTAGAAGCAGCCAATAGAGAACTTTATAAGCCAGAGGATTTGGCCAA 1034 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TGGTGTTGGCATATTGGAAGCAGCCAATAGAGAACTTTATAAGCCAGAGGATTTGGCCAA 960 Query 1035 AGAAATTACTACTCAAGCAAAGCCTGTGAATAGAATTGGTTTTATTGGTCTTGGAGCAAT 1094 ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 AGAAATTACTACTCAAGCAAAGCCTGTTAATAGAGTTGGTTTTATTGGTCTTGGAGCAAT 1020 Query 1095 GGGTTTTGGCATGGCAGCACACCTGTTGAAATCAAATTTTTCTGTCTGTGGTTATGACGT 1154 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1021 GGGTTTTGGCATGGCAGCACACCTGTTGAAATCAAACTTTTCTGTCCGTGGTTATGACGT 1080 Query 1155 ATACAAGCCAACACTTGTCAGATTTGAGAATGCCGGGGGATTGGCGGCAAATTCTCCAGC 1214 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 ATACAAGCCAACACTTGTCAGATTTGAGAATGTCGGGGGATTGGCGGCAAATTCTCCAGC 1140 Query 1215 TGAAGTGACGAAAGATGTAGATGTTCTTGTAATTATGGTAACAAACGAGGTTCAGGCTGA 1274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 TGAAGTGACGAAAGATGTAGATGTTCTTGTAATTATGGTAACAAACGAGGTTCAGGCTGA 1200 Query 1275 GGATGTCTTGTATGGACATCTTGGAGCGGTTGAAGCTATACCATCTGGAGCAACTGTTGT 1334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1201 GGATGTCTTGTATGGACATCTTGGAGCGGTTGAAGCTATTCCATCTGGAGCAACTGTTGT 1260 Query 1335 ACTTGCGTCAACAGTATCTCCCGCGTTTGTTAGCCAACTTGAAAGGCGTCTAGAAAATGA 1394 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 ACTTGCGTCAACAGTCTCTCCCGCGTTTGTTAGCCAACTTGAAAGGCGTCTAGAAAATGA 1320 Query 1395 GGGAAAAGACCTAAAGCTAGTTGATGCTCCTGTGTCTGGTGGTGTCAAGAGGGCTGCCAT 1454 |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GGGAAAGGACCTAAAGCTGGTGGATGCTCCTGTTTCTGGTGGTGTCAAGAGGGCTGCCAT 1380 Query 1455 GGGGGAGCTTACGATAATGGCTTCAGGTACCGATGAAGCACTTAAGTCTGCGGGACTTGT 1514 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 GGGGGAACTTACGATAATGGCTTCAGGTACCGATGAAGCACTTAAGTCTGCGGGACTTGT 1440 Query 1515 GTTATCAGCATTAAGTGAGAAGCTCTACGTGATTAAAGGAGGTTGTGGGGCAGGAAGTGG 1574 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 GTTATCAGCATTAAGTGAGAAGCTCTACGTGATTCAAGGAGGTTGTGGGGCAGGAAGTGG 1500 Query 1575 TGTAAAAATGGTCAATCAATTGCTTGCGGGAGTTCATATCGCATCAGCTGCCGAGGCAAT 1634 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1501 TGTAAAAATGGTCAATCAATTGCTTGCGGGAGTTCATATCGGATCAGCTGCCGAGGCAAT 1560 Query 1635 GGCATTTGGAGCTCGGTTAGGTCTGAATACTCGAAAGCTATTCAATGTTATTTCCAACAG 1694 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1561 GGCATTCGGAGCTCGGTTAGGTCTGAATACTCGAAAGCTATTCAATGTGATTTCCAACAT 1620 Query 1695 CGGTGGAACATCTTGGATGTTTGAAAATCGTGTTCCGCACATGCTGGATAATGATTACAC 1754 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1621 CGGTGGAACATCTTGGATGTTTGAAAATCGTGTTCCGCACATGCTCGATAATGATTATAC 1680 Query 1755 ACCATACTCTGCTCTTGATATTTTTGTCAAGGATTTGGGAATTGTTACCCGAGAAGGTTC 1814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1681 ACCATACTCTGCTCTTGATATTTTTGTCAAGGATTTGGGAATTGTTACTCGAGAAGGTTC 1740 Query 1815 ATCCCGTAAAGTTCCACTCCATATATCAACAGTGGCACACCAGCTATTCTTAGCCGGCTC 1874 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 ATCCCGTAAAGTTCCACTCCATATATCAACAGTGGCACACCAGCTATTCTTAGCCGGCTC 1800 Query 1875 TGCTGCGGGCTGGGGACGGATAGATGATGCTGGAGTGGTGAAGGTTTATGAAACCCTTGC 1934 ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 1801 TGCAGCGGGCTGGGGACGGATTGATGATGCTGGAGTGGTGAAGGTATATGAAACCCTTAC 1860 Query 1935 TGGAATTAAAGTCGAAGGGAGACTTCCTGTTCTGAAGAAACAAGACCTACTGAAATCTCT 1994 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1861 TGGGATTAAAGTCGAAGGGAGACTTCCTGTTCTGAAGAAACAAGACCTACTGAATTCTCT 1920 Query 1995 TCCAGCTGAATGGCCTTCAGACCCTACAACTGACATACATAGACTAAATATGGGAAACTC 2054 |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 TCCATCTGAATGGCCTTTAGACCCTACAGCTGACATACATAGACTAAATATGGGAAACTC 1980 Query 2055 GAAGACATTGGTTGTTCTTGATGATGATCCAACTGGCACACAAACTGTTCATGACGTAGA 2114 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 GAAGACATTGGTTGTTCTTGATGATGATCCAACCGGGACACAAACTGTTCATGACGTAGA 2040 Query 2115 GGTTTTAACTGAATGGAGTGTTGAATCTATTTCTGAGCAGTTTAGAAAAAAGCCTGCATG 2174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2041 GGTTTTAACTGAATGGAGTGTTGAATCTATTTCTGAGCAGTTCAGAAAAAAGCCTGCATG 2100 Query 2175 CTTCTTCATTTTGACAAATTCAAGGTCCCTGAGCCCTGAGAAGGCTAGTGAATTGATCAA 2234 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2101 CTTCTTCATTTTGACAAATTCAAGGTCATTGAGCCCTGAGAAGGCTAGTGCGTTGATCAA 2160 Query 2235 AGACATCTGTTCCAACCTATGTGCTGCATCAAAAGAAGTTGGCAATGCTGACTACACGAT 2294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || Sbjct 2161 AGACATCTGTTCCAACCTATGTGCTGCATCAAAAGAAGTTGGGAACGCTGACTACACTAT 2220 Query 2295 TGTTCTGAGGGGTGATTCAACATTACGTGGTCATTTTCCTCAGG-AAG--------CAGA 2345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 2221 TGTTCTGAGGGGTGATTCAACATTACGTGGTCATTTTCCTCAGGCAAGTTTGGAAGCAGA 2280 Query 2346 TGCTGCTGTCTCAATACTTGGGGAAATGGATGCATGGATTATTTGCCCCTTCTTCCTTCA 2405 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2281 TGCTGCTGTCTCAATACTTGGGGAAATGGATGCGTGGATTATTTGCCCCTTCTTCCTTCA 2340 Query 2406 AGGGGGACGTTATACTATTGATGATGTGCATTATGTTGCGGATTCTGATAGGCTCGTTCC 2465 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2341 AGGTGGACGTTATACTATTGATGATGTGCATTATGTTGCAGATTCTGATAGGCTCGTTCC 2400 Query 2466 TGCAGGAGAGACAGAGTTTGCCAAAGATGCATCCTTTGGATATAAATCCTCAAATCTCCG 2525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2401 TGCAGGAGAGACAGAGTTTGCCAAAGATGCATCCTTTGGATATAAATCCTCAAATCTCCG 2460 Query 2526 TGAGTGGGTTGAGGAGAAAACAGCTGGCGTCATTCCGGCTAACAGCGTTCAGTCGATCTC 2585 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2461 TGAGTGGGTTGAGGAGAAAACAGCTGGCATCATTCCGGCTAACAGCGTTCAGTCGATCCC 2520 Query 2586 AATTCAGCTTTTAAGAAAAGGTGGCCCTGATGCAGTGTGTGAGTTTCTGTGCAGTTTAAA 2645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2521 AATTCAGCTTTTAAGAAAAGGTGGCCCTGATGCAGTGTGTGAGTTTCTATGCAGTTTAAA 2580 Query 2646 GAAGG 2650 ||||| Sbjct 2581 GAAGG 2585 Score = 2728 bits (1477), Expect = 0.0 Identities = 1652/1735 (95%), Gaps = 18/1735 (1%) Strand=Plus/Plus Query 2709 GGGGTCTACATGTATTGTCAACGCCGCTAGTGAAAGAGACATGGCTGTATTTGCAGCCGG 2768 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2584 GGGGTCTGCATGTATTGTCAACGCCGCTAGTGAAAGAGACATGGCTGTATTTGCAGCGGG 2643 Query 2769 GATGATCCAGGCAGAACTGAAAGGGAGATCCTTTTTATGCCGCACTGCTGCTAGCTTTGT 2828 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2644 GATGATCCAGGCAGAACTGAAAGGAAGATCCTTTTTATGCCGCACTGCTGCTAGCTTTGT 2703 Query 2829 GTCTGCTCTAATAGGGATTATTCCAAAAGATCCTGTGTTGCCAAAAGATTTCGAATCTAA 2888 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| Sbjct 2704 GTCTGCTCTAATAGGGATTATTCCAAAAGATCCAGTGTTGCCGAAAGATTTCGCATCTAA 2763 Query 2889 CAAAGAAAGCAGTGGTGCACTAATAGTTGTAGGCTCATATGTCCCGAAAACAACAAAGCA 2948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2764 CAAAGAAAGCAGTGGTGCACTAATAGTTGTAGGCTCATATGTCCCGAAAACAACAAAGCA 2823 Query 2949 GGTTGAAGAACTTCAATCACAACATAACCAGAATTTAAGGAGCATCGAGATCTCTGTAGA 3008 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2824 GGTTGAAGAACTTCAATTACAACATAAGCAGAAGTTAAGGAGCATCGAGATCTCTGTAGA 2883 Query 3009 AAAAGTTGCTCTCAAGTCATCTGAAGTGAGAGATGAAGAAATCAGAAGAGCAGTTGAGAT 3068 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2884 AAAAGTTGCTCTCAAGTCATCCGAAGTGAGAGAGGAAGAAATCAGAAGAGCAGTTGAGAT 2943 Query 3069 GGCCGATGCTTTCCTTCGGGCTGGCAGGGAGACTCTAATTATGAGCAGTCGTGAACTCAT 3128 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2944 GGCTGATGCTTTCCTTCGGGCTGGCAGGGAGACTCTGATTATGAGCAGTCGTGAACTCAT 3003 Query 3129 CAC-GGGAAAAACATCTTCGGAAAGTCTTGATATTAACAGCAAAGTGAGCTCCGCTCTGG 3187 ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3004 CACAGGG-AAAACATCTTCGGAAAGTCTTGATATTAACAGCAAAGTGAGCTCCGCTCTGG 3062 Query 3188 TTGAAGTAGTGAGCCAGATATCGACCAGACCTCGTTATATTCTTGCTAAGGGTGGAATTA 3247 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3063 TTGAAGTAGTGAGCCAGATATCTACCAGACCTCGTTATATTCTTGCTAAGGGTGGAATTA 3122 Query 3248 CGTCATCAGACACAGCAACGAAAGCCCTGAAAGCACGACGTGCACTTGTGATTGGTCAAG 3307 ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3123 CGTCATCAGACACAGCAACAAAAGCACTTAAAGCAAGACGTGCACTTGTGATTGGTCAAG 3182 Query 3308 CCCTTGCTGGTGTTCCAGTATGGAAGTTAGGTCCAGAAAGTAGACATCCAGGGGTCCCCT 3367 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 3183 CCCTTGCTGGTGTTCCAGTATGGAAGTTAGGTCCAGAAAGTAGACATCCCGGAGTCCCCT 3242 Query 3368 ACATTGTTTTCCCTGGTAATGTTGGTAACAGCACAGCGCTTGCAGAAGTTGTGAAGTCTT 3427 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3243 ACATTGTTTTCCCAGGTAATGTTGGTAACAGCACAGCTCTTGCAGAAGTTGTGAAGTCTT 3302 Query 3428 GGTCAGTGGTAGCAGGACGGTCGACAAAAGAGCTGCTTCTGAATGCAGAAAAAGGTGGAT 3487 ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3303 GGTCAGTTGTAGCAAGACGGTCGACAAAAGAGCTGCTTCTTAATGCAGAAAAAGGTGGAT 3362 Query 3488 ATGCAGTTGGAGCATTTAACGTGTATAACCTGGAAGGAATAGAAGCTGTTGTAGCGGCCG 3547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | Sbjct 3363 ATGCAGTTGGAGCATTTAACGTGTATAACCTGGAAGGAGTAGAAGCTGTTGTAGCAGCTG 3422 Query 3548 CAGAGGAAGAAAATAGTCCTGCTATATTGCAGGTCCATCCAGGTGCCTTTAAACAAGGAG 3607 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 3423 CAGAGGAAGAAAACAGTCCTGCCATATTGCAGGTCCATCCAGGTGCCTTCAAGCAAGGAG 3482 Query 3608 GCATTCCTTTGGTTTCATGTTGCATCTCTGCAGCTGAACAAGCCAGGGTTCCAATATCCG 3667 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3483 GCATTCCGTTGGTTTCATGTTGCATCTCTGCAGCTGAACAAGCAAGGGTTCCAATATCCG 3542 Query 3668 TACACTTTGATCATGGAACTACAAAGCATGAGCTATTAGAAGCTCTTGAGCTAGGACTAG 3727 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3543 TACACTTTGACCATGGAACTACAAAGCATGAGCTATTAGAAGCTCTTGAGCTAGGATTAG 3602 Query 3728 ATTCAGTGATGGTAGATGGTTCTCATCTTTCCTTCACAGAAAATTTATCCTACACGAAAT 3787 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3603 ATTCAGTGATGGTAGATGGTTCTCATCTTTCCTTCACAGAAAATTTATCCTACACGAAAT 3662 Query 3788 CCATAACAGAGTTGGCCCGTTCCAAAAACATTATGGTGGAAGCTGAACTAGGCCGACTCT 3847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3663 CCATAACAGAGTTGGCCCGTTCCAAAAACATTATGGTGGAAGCTGAACTAGGACGACTCT 3722 Query 3848 CAGGAACAGAGGATGGCTTGACTGTTGAAGACTATGAAGCAAAGCTCACCAACGTTAACC 3907 ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3723 CAGGAACGGAGGATGGCTTGACTGTTGAAGATTATGAAGCAAAGCTCACCAACGTTCACC 3782 Query 3908 AGGCTCAGGAATTTATGGAAACTGGTATAGATGCTTTGGCTGTGTGTATAGGAAATGTCC 3967 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3783 AGGCTCAGGAATTTATGGAAACTGGTATAGATGCTTTGGCTGTGTGTATAGGAAATGTCC 3842 Query 3968 ATGGAAAGTACCCCAAGTCCGGTCCAAACCTCAAGCTTGATTTACTTAAGGAACTGCACG 4027 ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3843 ATGGAAAATACCCCGAGTCCGGTCCAAACCTCAAGCTTGACTTACTTAAGGAACTGCACA 3902 Query 4028 CCTTAAGCTCGAAGAAAGGCGTTTTTCTTGTTCTTCACGGAGCTTCTGGTTTGTCTGAGA 4087 |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3903 CCTTAAGCTCAAAGAAAGGCGTCTTTCTCGTTCTTCATGGAGCTTCTGGTTTGTCTGAGA 3962 Query 4088 ACCTTATCAAGGAATGCATTGAGAATGGAGTGAGGAAGTTCAACGTGAACACAGAAGTAA 4147 | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3963 AGCTTATCAAGGAATGCATTGAAAATGGAGTGAGGAAGTTCAACGTGAACACAGAAGTAA 4022 Query 4148 GAACGGCTTACATGGAAGCTCTTAGCTCTGGGAAGAAGACCGACATTGTTGATGTCATGT 4207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4023 GAACGGCTTACATGGAAGCTCTTAGCTCTGGGAAGAAGACCGACCTTGTTGATGTCATGT 4082 Query 4208 CCGCAACAAAAGCAGCCATGAAAGCTGTGATCGCAGATAAGATCCGTCTCTTTGGCTCTG 4267 | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4083 CGGCAACAAAAGCAGCCATGAAAGCTGTGATCACCGATAAGATCCGTCTCTTTGGCTCTG 4142 Query 4268 CCGGAAAAGCTTGAGTT---GTTGATaaaaaaaTGTCCGATCAATTAGTTAAGTACAATT 4324 | ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||| ||| || || Sbjct 4143 CTGGAAAAGCTTGAGTTATTGTTGATGAACAC-TGTCCGATCAATTTGTTTAGTTCAGTT 4201 Query 4325 GTACATCACATCCAAAGAATaaaaaaaCAACA-AATATTACATCACATCCAAAGAAGATG 4383 |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4202 GTACATCACATCCAAAGAATAAAAAA-CAA-ATAATATTAGATCACATCCAAAGAAGATG 4259 Query 4384 AATGCATTGTATGCAATGCAGATGCAGTGTTGTTGGAAATAAAGAAATCATTTTT 4438 |||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4260 AATGCA----ATGCA--G-A--TGCACTGTTGTTGGAAATAAAGAAATCAGTTTT 4305 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 170269581602 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5