BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G18900.3 Length=3156 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg920834 jgi|Araly1|920834|scaffold_102115.1 4169 0.0 Ahg476612 jgi|Araly1|476612|fgenesh2_kg.2__1742__AT1G74750.1 1738 0.0 > Ahg920834 jgi|Araly1|920834|scaffold_102115.1 Length=2625 Score = 4169 bits (2257), Expect = 0.0 Identities = 2460/2561 (96%), Gaps = 2/2561 (0%) Strand=Plus/Plus Query 422 AATGATACGCGCTAAGCATATTAGTAACCTTTCAAGTACAGCAAGATCCTTTTTTCTGAA 481 |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 21 AATGATACGCCCAAAGCATATTAGTAACCTCTCAAGTACAGCAAGATCCTTTTTTCTGAA 80 Query 482 TGGATCGAGAACAAGTGTAACTGATGGGAATTCTTGTGTGTACTCGGATGATGAAAATTG 541 ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||| Sbjct 81 TGGATCGAGAACAAGTGTAGCTGACGGGAATTCGTGTGCGTACACGGACGATGAAACTTG 140 Query 542 TGTCTCGAAACGTCAGCAACTTAGGAAGGAAGCTGGACAGACTGAAAAACGACCATCCAG 601 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 141 TGTCTCGAGACGTCAGCAACTTAGGAAGGAAGCTGCACAGACTGAAAAACGACCATCCAG 200 Query 602 TATCCTCCCAAAGCCTTCAGTTGTGGGATGTATATTACCAGGAGAGGTAACAAAACCAGT 661 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 201 TATTCTCCCAAAGCCTTCAGTTGTGGGATGTATATTACCAGGAGAGGTAACTAAACCAGT 260 Query 662 GGTTCCAAAGAAGGTTGATGATTTTGGTCGGCCATCTCTATTGCCACAGCATGTTTCTTC 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 261 GGTTCCAAAGAAGGTTGATGATTTTGGTCGGCCATCTCTATTGCCACAGCATGTTTCTTC 320 Query 722 TTCCCCTGCCTTGCCGCTTAAATCACATTCCGTTAACTATGCATCAACCGTCGTTAGAGA 781 ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||| Sbjct 321 TTCCCCTGCTTTGCCGCTTAAATCAAATTCGGTTAATTATGCATCAACCATCATTAGAGA 380 Query 782 GGAGGTGGAAGGTAAAGCTTCTTCAGAACCTATTGGGGATCAGATTTTCAAGGCTGGTAT 841 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 381 GGAGGTGGAAGGTAAAGCTTCTTCAGAACCTATTGGGGATCAGATTTTTAAGGCCGGTAT 440 Query 842 TGTTGCAGTAAATTTTCTGTCAGATTTATCGAATTGTAAGATTCCTTCATATGATGGAGG 901 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 441 TGTAGCAGTAAATTTTCTGTCAGATTTAGCGAATTGTAAGATTCCTTCGTATGATGGAGG 500 Query 902 AAGCGATGCATTTGGATTACCGAAAAGCTGTATGGTTGATCCAACACGGCCTATTTCAAG 961 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501 AAGTGAGGCATTTGGATTACCGAAAAGCTGTATGGTTGATCCAACACGGCCTATTTCAAG 560 Query 962 TGTCAAGTCGTCGAATGTGAAAGCTATAAGAAGAGAGCACTTTGCCAAAATTTACCCTAG 1021 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 561 TGTCAAGTCGTCGAATGTGAAAGCTATAAGAAGAGAGCACTTTTCCAAAGTTTACCCTAG 620 Query 1022 ATCAGCTGCAAAAGAGTCGTCAGTTGGTACAACTAGAAATCCCAGTAGCAATTTTCGAGG 1081 |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 621 ATCAGCTGCAAAAGAGTCGTCAATCGGTAAAACTAGAAATCCCAGTAGCAATTTCCGAGG 680 Query 1082 GGCCAAGGAAGCTGAAAGAACTGGGTTTGTTAAAGGATTCAGACAAGTTTCAAATTCTGT 1141 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 681 GGCCAAGGAAGCTGAAAGAACTGGATTTGTTAAAGGATTCAGACAAGTTTCTAATTCTGT 740 Query 1142 GGTAGGAAAGTCATTACCCACAACAAATAACACATATGGCAAGAGGACAAGCGTGTTGCA 1201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 741 GGTAGGAAAGTCATTACCCACAACAAATAACACATATGGCAAGAGGACAAGTGTGTTGCA 800 Query 1202 GAGACCCCATATTGATTCGAACAGGTTTGTGCCAAGCGGTTTCAGTAATTCTTCAGTGGA 1261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 801 AAGACCCCATATTGATTCGAACAGGTTTGTGCCAAGCGGTTTCAGTAATTCTTCAATGGA 860 Query 1262 AATGATGAAAGGACCTTCAGGGACTGCTCTGACATCAAGACAGTATTGTAATTCCGGACA 1321 |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | Sbjct 861 AATGGTGAAAGGGCCTCCAGGGACTGCTCTGACATCAAGGCAGTATTGCAATTCCGGATA 920 Query 1322 CATTGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTACGAAGATTCAGGTGGGGGCCTGCTGCTGAAGA 1381 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 921 CATAGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTGCGAAGATTCAGATGGGGCCCTGCTGCCGAAGA 980 Query 1382 GGCCCTTCAAAATCTAGGTTTGAGGATAGACGCATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAGCA 1441 ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 981 GGCCCTTCAAAATCTCGGTTTGAGGATCGATGCATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAACA 1040 Query 1442 GATGAATGACTATGGAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTT 1501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1041 GATGAATGACTATGGAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTT 1100 Query 1502 TAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTTGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATT 1561 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1101 TAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTGGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATT 1160 Query 1562 TGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTTAGAGATGGATGTCAGCCAAACACAGT 1621 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1161 TGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTCAGAGACGGATGTCAGCCAAACACAGT 1220 Query 1622 TACATATAACCGACTTATCCACAGCTATGGCCGTGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAA 1681 ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1221 TACATATAATCGACTTATCCATAGCTATGGCCGCGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAA 1280 Query 1682 TGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCT 1741 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1281 CGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCT 1340 Query 1742 TATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATATGTACCAGAGAAT 1801 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1341 TATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTAGATATTGCCATGGATATGTACCAGAGAAT 1400 Query 1802 GCAGGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGG 1861 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1401 GCAAGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGG 1460 Query 1862 AAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAAGGTTG 1921 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1461 AAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAGGGTTG 1520 Query 1922 TACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGACTTGCATGCCAAAGCGAGAAACTA 1981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1521 TACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGACTTGCATGCCAAAGCGAGAAACTA 1580 Query 1982 TCAGAATGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAACGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGT 2041 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1581 TCAGAGTGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAATGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGT 1640 Query 2042 GACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGC 2101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1641 GACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGC 1700 Query 2102 TGTTTTCACCGAGATGCAACAGAAAAATTGGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTT 2161 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1701 TGTTTTCACCGAGATGCAGCAGAAGAACTGGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTT 1760 Query 2162 GGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAAGCAAT 2221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1761 GGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAGGCAAT 1820 Query 2222 GCTTCATGCTGGTCTGCGACCTAATGTTCCTACATGCAACTCCCTTCTTAGTACCTTCCT 2281 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1821 GCTTCATGCTGGTCTGCTACCTAATGTTCCTACATGCAATTCCCTCCTTAGTACCTTCCT 1880 Query 2282 TAGGGTTAACAAGATAGCTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACATGCTGGCGCTTGGTCT 2341 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1881 TAGGGTTAACAAGATAGCTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACATGCTGGCACTTGGTCT 1940 Query 2342 ACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCACGGATGGTCGGTCAAA 2401 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1941 ACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCACAGATGGTCGATCAAA 2000 Query 2402 ACTTGATATGGGTTTCTGTGGCCAGTTGATGGCAAGCACAGGTCATCCAGCACATATGTT 2461 |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2001 ACTTGACATGGGTTTTTGTGGCCAGCTGATGGCAAGCACAGGTCATCCAGCACACATGTT 2060 Query 2462 TCTCCTCAAGATGCCAGCTGCGGGTCCGGATGGCGAAAACGTGCGCAACCATGCGAACAA 2521 |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2061 TCTCCTCAAGATGCCAGCAGCGGGTCCAAATGGCGAAAACGTGCGCAACCATGCGAACAA 2120 Query 2522 TTTCCTGGATCTTATGCATAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGT 2581 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2121 CTTCCTGGATCTTATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGT 2180 Query 2582 GGTTGACTTTCTACATAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCCGGATCTGTCTGGGAAGTTGC 2641 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 2181 GGTTGACTTTCTACACAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCGGGATCTGTTTGGGAAGTTGC 2240 Query 2642 TGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCATTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTAT 2701 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2241 TGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCGTTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTAT 2300 Query 2702 CAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACGCTTGCTTG 2761 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2301 CAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACTCTTGCTTG 2360 Query 2762 GTTCCGTAAGCAGATGTTAG-CTTCAGGAACTTGCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTG 2820 |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2361 GTTCCGTAAGCAGATGTTAGTCT-CAGGAACTTTCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTG 2419 Query 2821 GTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGTACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAGGAGC 2880 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2420 GTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGCACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAAGAGC 2479 Query 2881 TGCTGAACATCTTTGGTTCACCGTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCAGGTTGTTTCGTTG 2940 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2480 TTCTCAACATCTTTGGTTCACCGTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCGGGTTGTTTCGTTG 2539 Query 2941 GAAGCGGAGAGCCTCTTAACAGATGGTTGCTGCAGTCTCAT 2981 || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2540 GATGCGGAGAGCCTCTCAACAAATGGTTGCTGCAGTCTCAT 2580 > Ahg476612 jgi|Araly1|476612|fgenesh2_kg.2__1742__AT1G74750.1 Length=2538 Score = 1738 bits (941), Expect = 0.0 Identities = 1486/1750 (85%), Gaps = 34/1750 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1239 GGTTTCAGTAATTCTTC-AGTGGAAATGATGAAAG-GACCTTCAGGGACTGCTCTGACAT 1296 |||||| |||| | || || ||||||||||| || || || |||||||||||| ||| Sbjct 772 GGTTTCGGTAAACCCTCAAG-GGAAATGATGAGAGTGA-CTCCAGGGACTGCTCCAACAC 829 Query 1297 CAAGACAGTATTGTAATTCC-GGACACATTGTGGAAAATGTTTCCAGCGT-T-TTACGAA 1353 | || ||||||||||| || ||| || |||| |||||||||| | | || | || || | Sbjct 830 CTAGGCAGTATTGTAA-CCCTGGATACGTTGTAGAAAATGTTT-CTG-GTATATTGCGGA 886 Query 1354 GATTCAGGTGGGGGCCTGCTGCTGAAGAGGCCCTTCAAAATCTAGGTTTGAGGATAGACG 1413 |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || | Sbjct 887 GATTCAAATGGGGACATGCTGCTGAAGAGGCCCTTCACAATTTCGGTTTCAGGATGGATG 946 Query 1414 CATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAGCAGATGAATGACTATG-GAAATGCTCTTGGTTTC 1472 |||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||| | ||||| ||||||||| Sbjct 947 CATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATAATTATGCG-AATGCGCTTGGTTTC 1005 Query 1473 TTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATG 1532 ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1006 TTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATGACGGGCATACTTATACCACTATG 1065 Query 1533 GTTGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATTTGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATG 1592 || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||| Sbjct 1066 GTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGCGATAAACAGGCTTCTTGATGAGATG 1125 Query 1593 GTTAGAGATGGATGTCAGCCAAACACAGTTACATATAACCGACTTATCCACAGCTATGGC 1652 |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| Sbjct 1126 GTTAAAGATGGATGTAAGCCAAATACTGTTACATATAACCGGCTCATCCATAGCTACGGC 1185 Query 1653 CGTGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAATGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGC 1712 ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || Sbjct 1186 CGTGCAAATTACCTCAATGAAGCTATGAATGTTTTTAAGCAGATGCAAGAGGCTGGTTGT 1245 Query 1713 AAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTTATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTT 1772 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1246 GAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGACATCCATGCTAAAGCTGGATTTCTG 1305 Query 1773 GACATTGCCATGGATATGTACCAGAGAATGCAGGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTC 1832 ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| Sbjct 1306 GACATTGCCTTGGACATGTACCAAAGAATGCAAGCAGCAGGGCTTTCTCCTGATACTTTC 1365 Query 1833 ACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGGAAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAG 1892 || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | | Sbjct 1366 ACCTACAGTGTTATAATAAATTGTCTTGGAAAAGCGGGCCACTTACCTGCTGCCCATAGG 1425 Query 1893 CTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAAGGTTGTACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATG 1952 ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 1426 CTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACCCCTAATTTGGTCACATTCAACATCATG 1485 Query 1953 ATGGAC-TTGCATGCCAAAGCGAGAAACTATCAGAATGCGTTGAAGCTTTACCGTGACAT 2011 || | | ||||||||||| ||| | || ||| ||| |||||||||||| ||| | ||||| Sbjct 1486 ATAG-CTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTGCGTTGAAGCTCTACAGAGACAT 1544 Query 2012 GCAAAACGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGTGACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGG 2071 |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 1545 GCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACATACAGTATTGTTATGGAGGTACTTGG 1604 Query 2072 ACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGCTGTTTTCACCGAGATGCAACAG-AAAAATT 2130 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || || | Sbjct 1605 ACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTTGCTGAGATGCAA-TGTAAGAACT 1663 Query 2131 GGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTTGGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATG 2190 || |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| Sbjct 1664 GGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACTTGTGGGGAAAAGCTGGCAATG 1723 Query 2191 TGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAAGCAATGCTTCATGCTGGTCTGCGACCTAATGTTC 2250 ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| Sbjct 1724 TGGAAAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCACGCCGGTCTGCAACCTAATGTTC 1783 Query 2251 CTACATGCAACTCCCTTCTTAGTAC-CTTCCTTAGGGTTAACAAGATAG-CTGAAGCTTA 2308 | |||||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||| ||| | ||||||| || Sbjct 1784 CCACATGCAATTCCCTTCTCAGCACAC-TCCTTAGGGTTCACAGGAT-GTCTGAAGCCTA 1841 Query 2309 TGAGTTATTACAAAACATGCTGGCGCTTGGTCTACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTT 2368 | | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || Sbjct 1842 TAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTTCTTTGCAGACATACACATT 1901 Query 2369 ACTCTTGAGCTGTTGCACGGATGGTCGGTCAAAAC-TTGATATGGG-TTTCTGTGGCCAG 2426 || ||||| |||||||| |||| ||| || |||| |||| ||||| ||| ||||||||| Sbjct 1902 GCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTC-AAACTTTGACATGGGCTTT-TGTGGCCAG 1959 Query 2427 TTGATGGCAAG-CACAGGTCATCCAGCACATATGTTTCTCCTCAAGATGCCAGCTGCGGG 2485 | ||||| || | |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| || Sbjct 1960 CTAATGGC-AGTCTCAGGCCATCCGGCTCACATGTTTCTCCTCAAAATGCCACCTGCAGG 2018 Query 2486 TCCGGATGGCGAAAACGTGCGCAACCATG-CGAACAATTTCCTGGATCTTATGCATAGCG 2544 ||| |||||| |||| ||||| | |||| | | ||| ||||| ||| ||||||| || | Sbjct 2019 TCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTC-AGCAACTTCCTTGATTTTATGCACAGTG 2077 Query 2545 AGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGTGGTTGACTTTCTACATAAGTCCG 2604 |||| || |||||||||||||||||| |||| || || || || ||||| || ||||| | Sbjct 2078 AGGATAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATTTTCTCCACAAGTCAG 2137 Query 2605 GGCAAAAAGAAGAGGCCGGATCTGTCTGGGAAGTTGCTGCACAAAAGAATGTGTTTCCTG 2664 | | |||||||||||| || || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| | Sbjct 2138 GTCTAAAAGAAGAGGCTGGTTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGTTAAGAATGTGTATCCAG 2197 Query 2665 ATGCATTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATCAATCTCCATGTAATGTCAGAGG 2724 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | Sbjct 2198 ATGCATTGAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATAAATCTCCATGTAATGTCGGAAG 2257 Query 2725 GAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACGCTTGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTAGCTT 2784 |||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | || Sbjct 2258 GAACTGCAGTCATCGCACTTTCTAGGACACTTGCATGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTTT 2317 Query 2785 CAGGA-ACTTGCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTC 2843 ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2318 CAGGAGA-ATGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGAAGTAGAGTC 2376 Query 2844 ACCGGTACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAGGAGCTGCTGAACATCTTTGG-TTCACC 2902 || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || Sbjct 2377 ACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACATATTCAACTTC-CC 2435 Query 2903 GTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCAGGTTGTTTCGTTGGAAGCGGAGAGCCTCTTAACA- 2961 |||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| || | Sbjct 2436 GTTTTTCACGGAGAACGGGAACTCGGGCTGTTTTGTAGGATGCGGAGAGCCTCTCAAGAA 2495 Query 2962 GATGGTTGCT 2971 | |||||||| Sbjct 2496 G-TGGTTGCT 2504 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 119222466850 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5