BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G23230.1 Length=4889 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg472581 jgi|Araly1|472581|fgenesh2_kg.1__2535__AT1G23230.1 7251 0.0 > Ahg472581 jgi|Araly1|472581|fgenesh2_kg.1__2535__AT1G23230.1 Length=4920 Score = 7251 bits (3926), Expect = 0.0 Identities = 4160/4276 (97%), Gaps = 4/4276 (0%) Strand=Plus/Plus Query 616 AGGTGAAATCTG-TGGAGAATGGGCAGCAGATTGCAAGAGCTGGCCAGATTGTAAGAGAG 674 |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct 647 AGGTTAAATC-GTTGGAGAATGGGCAGCAGATTGCAAGAGCAGGCCAGACTGTAAGAGAG 705 Query 675 AATGCTATGAGAAATAGTCAACGGATTAGAGCTGCTGCTGTAAACAGTCTGCGTCAGCTC 734 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| Sbjct 706 AATGCTATGAGAAATAGTCAACGGATTAGAGCTGCTGCTATAAACAGTCTGCGCCAGCTC 765 Query 735 AGTTGCAAGATTATCTTGATTGGCGTTGAATCTAGTCTCAAACCCGTTACTCATGCCGAG 794 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 766 AGTTGCAAGATTATCTTGATTGGCGTTGAATTTAGTCTCAAACCCGTTACTCATGCCGAG 825 Query 795 ATTTTCCAGTACATGATGAATTGGCTTGTTAACTGGGACAGGAGAGATCTGGGAACTGAG 854 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 826 ATTTTCCAGTACATGTTGAATTGGCTTGTTAACTGGGACAGGAGAGATCCGGGAACTGAG 885 Query 855 GACTCTGTAGGAAAGTCGTGGAGATCTGAGAAGACTTTAGCTGAATGGTTGCGGAGTTGT 914 ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 886 GACTCTGCAGGTACGTCGTGGAGATCTGAGAAGACTTTAGCTGAATGGTTGCGGAGTTGT 945 Query 915 TTGGATGTGATCTGGCTGTTGGTAGAAGAGGGTGAATCTCGAATTCCGTTTTATGAGTTA 974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 946 TTGGATGTGATCTGGCTGTTGGTAGAAGAGGGTGAATCTCGAATTCCGTTTTATGAGTTA 1005 Query 975 TTGCGCAGTGGTCTACAGTTTATAGAGAACATACCTGATGATGAAGCCTTGTTCACTCTT 1034 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1006 TTGCGCAGTGGTCTACAGTTTATAGAGAACATACCTGATGATGAAGCCTTGTTCACTCTT 1065 Query 1035 ATCATGGAGATACACCGGAGGCGAGATGCGATGGCCATGCATATGCTCATGTTGGACCAA 1094 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1066 ATCATGGAGATACACCGGAGGCGAGATGCGATGGCCATGCACATGCTCATGTTGGACCAA 1125 Query 1095 CATCTTCACTGTCCATCATTTGGTACCCATCGTATAGTCTCCCAAATAACTGCCAATGTT 1154 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct 1126 CATCTTCACTGTCCAACATTTGGTACCCATCGTATAGTGTCCCAAGTAACTGCCAATGTT 1185 Query 1155 CCACCCGAAGCTGTGCCACACTTACGACATTCACCAATTACATATCCAAGTGTGCTTGGG 1214 || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1186 TCAGCCGAAGCTGTGCAACACTTACGACATTCACCAATTACATATCCAAGTGTGCTTGGG 1245 Query 1215 GAACCTTTATATGGAGAGGATCTGGCGATGTCTATTCCAAAAGGAAGCCTGGATTGGGAG 1274 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1246 GAACCTTTGTATGGAGAGGATCTGGCGATGTCTATTCCAAAAGGAAGCCTCGATTGGGAG 1305 Query 1275 AGAGCAGTGCGTTGCATTAGACATGCTATTCGCACTACACCGTCACCGGACTGGTGGAAG 1334 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1306 AGAGCAGTGCGTTGCATTAGACATGCTATCCGCACTACGCCGTCACCGGACTGGTGGAAA 1365 Query 1335 CGTGTTCTTGTTGTGGCCCCTTGTTATAGACCATCTACACAAGCAGGGCCTATCCCTGGT 1394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1366 CGTGTTCTTGTTGTGGCCCCTTGTTATAGACCATCTACACAACCAGGGCCTATCCCTGGT 1425 Query 1395 GCTGTATTCACTTCTGACATGATTTGTGAGGCAATCATTGACAGAATTGTTGAGCTTCTT 1454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1426 GCTGTATTCACTTCTGACATGATTTGTGAGGCAATCATTGACAGGATTGTTGAGCTTCTT 1485 Query 1455 AAGCTGACCAACTCAGGCAATGATTGCTTTGGTATTGATTTGGTATCTGTTACTTTTCCC 1514 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1486 AAGCTGACCAACTCAGGCAATGATTGCTTTGGTATTGATTTGGTATCTGTTACTTTTTCC 1545 Query 1515 CCTCTCTATGCAGATGCAAATTGCTGGCAAGAGTGGCTGGTTTTCTCGGATATATTCTTC 1574 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1546 CCTCTCTATGCAGATGCAAATTGTTGGCAAGAGTGGCTGGTTTTCTCGGATATCTTCTTC 1605 Query 1575 TTTCTAATCAAAAGTGGGTGTACTGATTTTGTTGATTTCATTGACAAGTTGGTTTTACGC 1634 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1606 TTTCTAATTAAAAGTGGGTGTACTGATTTTGTTGATTTCATTGACAAGTTGGTTTCACGT 1665 Query 1635 CTTAACGGTGTTGATAACCATATTCTTCGGACGAATCATGTGACTTGGCTGCTTGCACAA 1694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1666 CTTAACGGTGTTGATAACCATATTCTTCGGACGAATCATGTGACGTGGCTGCTTGCACAA 1725 Query 1695 ATAATACGCGTGGAGCTTGTGATGACTGCTTTGAACTCAGATGCTAAAAAGGTGGAGACT 1754 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1726 ATAATACGCGTGGAGCTTGTGATGACTGCTTTGAACTCAGATGCTAAAAAGGTGGAGACT 1785 Query 1755 ACTAGGAAGATCTTATCATTTCACAGGGAAGACAGAAATTCTGATCCCAACAATCCTCAG 1814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1786 ACTAGGAAGATCTTATCATTTCACAGGGAAGACAGAAATTCTGATCCCAATAATCCTCAG 1845 Query 1815 AGTGTGTTGCTTGACTTCGTAAGCAGTTGTCAGAATCTACGGATTTGGTCACTAAGCACA 1874 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1846 AGTGTGTTGCTTGACTTCGTTAGCAGTTGTCAGAATCTACGGATTTGGTCACTAAGCACA 1905 Query 1875 ACAACTAGGGCATACCTAAACAATGAACAGCTGTTGAAGGGAAAACAGATCGATGAGTGG 1934 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1906 ACAACTAGGGCATACCTAAACAATGAACAGCTGTTGAAGGGAAAACAGATCGATGAGTGG 1965 Query 1935 TGGAGAAGCAAAGGAGAGCGGATGATGGATTATATGAATATGGATGATAGGTCGATTGGC 1994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1966 TGGAGAAGCAAAGGAGAGCGGATGATGGATTATATGAATATGGATGATAGGTCGATTGGC 2025 Query 1995 ATGTTTTGGGTTGTTTCCTACACCATGGCACAACCAGCATGTGAAACAGTTATAAATTGG 2054 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2026 ATGTTTTGGGTTGTTTCCTACACTATGGCACAACCAGCGTGTGAAACAGTTATAAATTGG 2085 Query 2055 CTATCTTCAGCTGGCATGGCTGAGTTACCGGGATTACAGCCAAACGACCGAGTAATGATG 2114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2086 CTATCTTCAGCTGGCATGGCTGAGTTACCGGGATTACAGCCAAACGACCGAGTAATGATG 2145 Query 2115 ACGCAGGAAGTTACCCCGTTACCTATGTCATTGCTATCTGGCTTTTCAATGAATTTGTGC 2174 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2146 ACGCAGGAAGTGACCCCGTTACCTATGTCATTGCTATCTGGCTTTTCAATGAATTTGTGC 2205 Query 2175 TTGAAATTGGCCCTTCAGATGGAAGAAGCTTTGTTTGTTAGCCAGGTTGTTCCTAGCATT 2234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2206 TTGAAATTGGCCCTTCAGATGGAAGAAGCTTTGTTTGTTAGCCAGGTTGTTCCTAGCATT 2265 Query 2235 GCAATGGTTGAGACATACACAAGATTGCTTCTGATTTCCCCTCATTCGATGTTCCGTTCA 2294 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2266 GCAATGGTTGAGACATACACAAGATTGCTTCTGATTTCCCCTCATTCGATGTTCCGTTCG 2325 Query 2295 CATTTCAGTCAATTGGCCCAGCGAAATGCTTCTCTGCTAAGCAAGCCTGGAGTGACGTTA 2354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2326 CATTTCAGTCAATTGGCCCAGCGAAATGCTTCTCTGCTAAGCAAGCCTGGAGTGACTTTG 2385 Query 2355 CTTGTTCTTGAGATTCTGAACTATCGGTTGCTGCCACTCTACAGATACCAAGGAAAGAGT 2414 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2386 CTTGTTCTTGAGATTCTGAACTATCGGTTGCTTCCGCTCTACAGATACCAAGGAAAGAGT 2445 Query 2415 AAAACTTTAATGTATGATGTTACTAAAATAATATCTGCATTGAAAGGAAAACGTGGTGAC 2474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2446 AAAACTTTAATGTATGATGTTACTAAAATAATATCTGCATTGAAAGGAAAACGTGGTGAC 2505 Query 2475 CACCGTATATTCAGACTAGCTGAAAACTTATGCATGAATCTCATTTTATCACTCAGAGAC 2534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2506 CACCGTATATTCAGACTAGCTGAAAACTTATGCATGAATCTCATTTTATCACTCAGAGAC 2565 Query 2535 TTTTTCTCTGTGAAACGGGAGGGAAAAGGGCCAACTGAATTCACTGAGACGTTAAATCGC 2594 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct 2566 TTTTTTTCTGTGAAACGGGAGGGAAAAGGGCCAACTGAATTCACTGAAACATTAAACCGC 2625 Query 2595 ATAACCATCATGACTCTTGCTATCACTATCAAAACACGTGGTATCGCAGACCCTGATCAC 2654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2626 ATAACCATCATGACTCTTGCTATCACTATCAAAACACGTGGTATCGCAGACCCTGATCAC 2685 Query 2655 ATGGTTTATCTGCAAACCATGTTGGAACAAATACTCGCGACGAGTCAGCATACATGGTCA 2714 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2686 TTGGTTTATCTGCAAACCATGTTGGAACAAATACTCGCGACGAGTCAGCATACATGGTCA 2745 Query 2715 GAGAAGACGATGCGGCATTTCCCATCCCTTCTCCGTGAAACTTTGAAAGGACGGGTAGAC 2774 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| Sbjct 2746 GAGAAGACGATGCGGCATTTCCCATCCCTTCTCCGTGACACATTGAATGGACGGGTAGAC 2805 Query 2775 AAGAGGGGCCTATCAATTCAGGCATGGCAACAGGCTGAAACAACTGTGATAAACCAGTGC 2834 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2806 AAGAGGGGCCTATCCATTCAGGCATGGCAACAGGCTGAAACAACTGTGATAAACCAGTGC 2865 Query 2835 ACTCAACTTCTCTCACCATCTGCTGAACCCGCTTACGTTTCAACATACCTCAGTCACAGT 2894 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2866 ACTCAGCTTCTCTCACCATCTGCTGAACCCGCTTACGTTTCAACATACCTCAGTCACAGT 2925 Query 2895 TTTCCTCAACACCGTCAGTATCTATGTGCTGGTGCTTGTCTGCTGATGCAAGGCCACGCT 2954 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2926 TTTCCTCAACACCGTCAGTATCTATGTGCTGGTGCTTGTCTGCTGATGCAAGGCCACGCT 2985 Query 2955 GAAAACATCAACAGCACAAATCTGGCACGAGTTCTGAGAGAAGTTTCTCCTGAAGAAGTC 3014 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2986 GAAAACATCAACAGCACAAATCTGGCACGGGTTCTGAGAGAAGTTTCTCCTGAAGAAGTC 3045 Query 3015 ACTGCTAACATATACACTTTGGTCGATGTTTTGCTTCACCACGTTCATGTAGACCTTCAG 3074 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3046 ACTGCTAACATATACACTTTGGTCGATGTTTTGCTTCACCACGTTCATGTAGACCTTCAG 3105 Query 3075 CAAGGACAATCTCTAGAGGCAGTTCTAGACAAGGCAGGCGCAAATCTTGCATTTTTCTTC 3134 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3106 CAAGGACAATCTTTAGAGGCAGTTCTAGACAAGGCAGGCGCAAATCTTGCATTTTTCTTC 3165 Query 3135 TGGACACATGAAATGCTTCCTCTCGACATTTTTCTTTTGGCGCTCATTGACCGTGATGAT 3194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3166 TGGACACATGAAATGCTTCCTCTCGACATTTTTCTTCTGGCGCTCATTGACCGTGATGAT 3225 Query 3195 GATCCTCACGCCTTGATAATTGCAATGAGCCTACTTAAAACGCCAGACCTTCTGCTGAGG 3254 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3226 GATCCGCACGCCTTGATAATTGCAATGAGCCTACTTAAAACGCCAGACCTTCTGCTGAGG 3285 Query 3255 ATAAAAAACTACTGCCAAAACCGTGGGTCTCCTGAGCACTGGCTTGTCACACAGGTGTTC 3314 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3286 ATTAAAAACTACTGCCAAAACCGTGGGTCTCCTGAGCACTGGCTTGTCACACAGGTGTTC 3345 Query 3315 AAACGCAATGAACTCCAGAAGGCCCTGGGTAACCATCTTTCTTGGAAGGACAGGTATCCA 3374 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3346 AAACGCAATGAACTCCAGAAGGCCCTTGGTAACCATCTTTCTTGGAAGGACAGGTATCCA 3405 Query 3375 ACGTTCTTTGATGATATTGCAGCGCGTTTGCTTCCAGTTATCCCTCTAGTGCTTTACAGG 3434 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3406 ACGTTCTTTGATGATATTGCAGCGCGTTTGCTTCCAGTTATCCCTCTAGTGGTTTACAGG 3465 Query 3435 CTCATCGAGAACAATGCGATGGAGCAAGCTGATAATCTTTTGCTTGCACACTCGCATTTT 3494 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3466 CTCATCGAGAACAATGCGATGGACCAAGCTGATAATCTTTTGCTTGCACACTCGCATTTT 3525 Query 3495 CTAGCGTATCATCCTCTCAGATTCACGTTTGTCCGTGATATACTAGCCTATTTCTATGGC 3554 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 3526 CTAGCTTATCATCCTCTCAGATTCACGTTTGTCCGAGATATACTCGCCTATTTCTATGGT 3585 Query 3555 CATCTTCCTGGGAAACTTGTTCTGCGCATGCTCAAAGTACTTGATCTCAGCAAGATTCCA 3614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3586 CATCTTCCTGGGAAACTTGTTCTGCGCATGCTCAAAGTACTTGATCTCAGCAAGATTCCA 3645 Query 3615 TTCTCTGAATCATTCCCGCAGTACATTAGCCCTACCGGTGCAC-CTGTATGCCCACCTCT 3673 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 3646 TTCTCTGAATCATTCCCGCAGTACATTAGCCCTGCCGGTGC-CGCTGTATGCCCACCTCT 3704 Query 3674 AGATTACTTTGCCTCTCTTCTGCTTAATCTCGTAAACAATGTTATACCTCCACTTAGCAG 3733 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3705 AGATTACTTTGCCTCTCTTCTGCTTAATCTTGTAAACAACGTTATACCTCCACTTAGCAG 3764 Query 3734 CAGCAGCAACTGCAGCTCGAGGTCTGGCTCAATGGCAGACATCTTAAACAGCTCAGCAAG 3793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3765 CAGCAGCAACTGCAGCTCGAGGTCTGGCTCAATGGCAGACATCTTAAACAGCTCAGCAAG 3824 Query 3794 ACCTCCTCATGGAAAAACTCCAGGAACATCTCAGCCTGGACCAGCAAACGCCTCTGAGGG 3853 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3825 ACCTCCTCATGGAAAAACTCCAGGAACATCTCAGCCTGGACCAGCAAACGCCTCTGAGGG 3884 Query 3854 CCAGAAAGCATTCTATCAGATCCAGGACCCAGGAACTTACACGCAACTGGTTCTTGAGAC 3913 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 3885 CCAGAAAGCATTCTACCAGATCCAAGACCCAGGAACTTACACTCAATTGGTTCTTGAGAC 3944 Query 3914 AGCCGTGATCGAGATCCTCTCGCTTCCTGTCTCTGCTGCTCAGATTGTCTCTTCGCTTGT 3973 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3945 AGCCGTGATCGAGATCCTCTCGCTTCCCGTCTCCGCTGCTCAGATTGTCTCTTCGCTTGT 4004 Query 3974 CCAGATAATTGTCAACATACAATCGACTCTGATTCAATCTGGAAACGGGTTCCACGGCGC 4033 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4005 CCAGATAATTGTCAACATACAATCGACTCTGATTCAATCTGGAAACGGGTTCCACGGCGC 4064 Query 4034 TGCCAACGGGGTGGGACAAGGGTCGGTACTGCCAACGTCTCCCTCTGGAGGGAGCACAGA 4093 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 4065 TGCGAACGGGGTGGGGCAAGGGTCGGTACTGCCAACGTCTCCCTCAGGAGGGAGCACGGA 4124 Query 4094 CTCCATGAGCGCTAGCCGGTCCACTTGTCTGATTCCTGGTATCAACACAGCGAGCTTTGT 4153 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4125 CTCCATGAGCGCTAGCCGGTCCACTTGTCTGATTCCTGGTATCAACACGGCGAGCTTTGT 4184 Query 4154 CTCTAGAAGCGGTTATACATGTCAGCAACTGTCGTGTCTGTTGATTCAAGCTTGTGGACT 4213 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 4185 CTCTAGAAGTGGTTATACATGTCAGCAACTGTCGTGTCTTTTGATTCAAGCTTGTGGGCT 4244 Query 4214 TCTGTTGGCTCAGCTCCCTCCAGATTTTCACGTACAGCTTTACTTGGAGGCAGCACGTGT 4273 |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4245 TCTGCTGGCCCAGCTCCCTCCAGATTTTCACATGCAGCTTTACTTGGAGGCAACACGTGT 4304 Query 4274 GACAAGGGAAACATGGTGGCTTAAGGACGGGAAGAGATCACAAGGTGAACTAGACTCAGC 4333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4305 GACAAGGGAAACATGGTGGCTTAAGGACGGGAAGAGATCACAAGGTGAACTAGACTCGGC 4364 Query 4334 TGTTGGATACGCTTTGATGGATCCTACATGGGCTGCTCAGGATAACACCTCGACCGCCAT 4393 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 4365 TGTTGGATACGCTTTGATGGATCCGACATGGGCTGCTCAGGACAACACCTCGACCGCAAT 4424 Query 4394 AGGAAATATTGTCGCCTTGCTTCATGCTTTCTTCAGCAATCTCCCACAAGAATGGCTTGA 4453 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4425 AGGAAATATAGTCGCCTTGCTTCATGCTTTCTTCAGCAATCTCCCACAAGAATGGCTTGA 4484 Query 4454 TGGCACGAATGCTATCATCACGAACCTCCGGCCTGTGACATCTGTGGCAATGCTCAGAGT 4513 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4485 TGGCACGAATGCCATCATCAAGAACCTCCGGCCTGTGACATCTGTCGCAATGCTCAGAGT 4544 Query 4514 TGTATTCCGTATCATGGGGCCACTGCTTCCGAGGCTTGCCAGTACACATACTCTCTTTAA 4573 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4545 TGTATTCCGTATTATGGGGCCACTGCTTCCGAGGCTTGCCAGCACACATACTCTCTTTAA 4604 Query 4574 CAAGACGCTAATGCTTCTCTTAAGCGCACTGGTCGATGTTTTTGGAAAGACCGCACAGAC 4633 ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct 4605 CAAGACGTTAACCCTTCTCTTATCCGCGCTGGTCGATGTTTTCGGAAAGAACGCACAGAC 4664 Query 4634 AACAGCCCCTGTTGAAGCATCCCAGATTGCAGATCTTATTGATTTCCTACACCATATTAT 4693 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4665 AACAGCCCCTGTTGAAGCATCCCAGATTACAGATCTTATTGATTTCCTACACCATATTAT 4724 Query 4694 TCACTACGAGGGACAAGGAGGAGCTGTTCAAACTAGCAGCAAGCCGAGACCGGACATCTT 4753 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4725 TCACTACGAGGGACAAGGAGGAGCTGTCCAAACTAGCAGCAAGCCGAGACCCGACATCTT 4784 Query 4754 GGCGTTAATCGGAAGAGCAGCAGAGACTCTCCGACCAGATGTACAACACCTTCTCGCTCA 4813 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4785 GGCGTTAATCGGAAGAGCAGCAGATTCTCTCCGACCAGATGTACAACACCTTCTCGCTCA 4844 Query 4814 CCTCAAAACCAACCCGAATTCTTCCATATACGCAGCTGCTCATCAGCAGAATACTGCAAA 4873 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4845 CCTCAAAACCAACCCGAATTCTTCGATATACGCAGCTGCTCATCAGCAGAATACCGCAAA 4904 Query 4874 GACTAACACCTCTTAA 4889 ||| |||||||||||| Sbjct 4905 GACCAACACCTCTTAA 4920 Score = 837 bits (453), Expect = 0.0 Identities = 505/530 (95%), Gaps = 3/530 (1%) Strand=Plus/Plus Query 36 aaaaaaaTGGATCAATCGCAGCGAACAGTCGCTGCAACGCCATCGTCTTCTCGATCGTAC 95 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1 AAAAAAATGGATCAATCTCAGCGAACAGTCGCTGCAACGCCTTCGTCTTCTCGATCGTAC 60 Query 96 CAATTCCACCCAGCTCGTGCTGCAATTATCGATCTTTTCAATCTCTACTTAGGGAGAGGA 155 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAATTCCACCCTGCCCGTGCTGCAATTATCGATCTTTTCAATCTCTACTTAGGGAGAGGA 120 Query 156 AGCCGTCAAAAGCCTGATGAGTCCCTCCGAGATCCCCCGAACAAATCACAGAAGCGTGTT 215 |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGCCGTCAAAAGCCCGATGAGTCCCTCAGAGATCCTCCGAACAAATCACAGAAGCGTGTT 180 Query 216 CATGCTCCTAATAGAGACTTACCACCAAGAAACGAGCAATTCCTTTTGGATTTTGAGCTG 275 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct 181 CATGCTCCAAACAGAGACTTACCACCAAGAAACGAGCAATTCATTTTGGATTTTGAGCAG 240 Query 276 CTTCAGAGCCAATTCAATGATCCAGAGCAATTGAGGACGATTACTGAGTCAGTTTTGATA 335 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTTCAAAGCCAATTCAATGATCCAGAGCAATTGAGGACGATTACTGAGTCAGTTTTGATA 300 Query 336 TCTCTGGTGGTGCAATGTAGCAATCATGCGCCTCGTGCTGAGTTTCTACTCTTTGCTTTG 395 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 301 TCTTTGGTGGTGCAATGTAGCAATCATGCGCCTCGTGCTGAGTTTCTTCTCTTTGCTTTG 360 Query 396 CGTACATTGTGTAGGATTAGTTATATCAATTGGGATACTTTTTTACCATCCCTTCTCTCT 455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CGTACATTGTGTAGGATTAGTTATATCAATTGGGATACTTTTTTACCATCCCTTCTCTCT 420 Query 456 TCCGTTTCCGCTGCTGAGGCGTCGTTAAGCCAAGGTGTTCAAGCAGCAGCGGCAACGGCT 515 || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 421 TCGGTTTCTGCTGCTGAGGCTTCGTTAAGCCAAGGTGTTCAAGC--C-GCGGCAACGGCT 477 Query 516 GGTTCTTCTGCTACTTCTTCGCAGTCTGTAGTTCCTGTGTCTGTGAATCC 565 | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct 478 GCTTCTTCTGCTACTTCTTCACAGTCTTTAGTTCCTGTGTCTGCCAATCC 527 Score = 97.1 bits (52), Expect = 1e-18 Identities = 54/55 (98%), Gaps = 0/55 (0%) Strand=Plus/Plus Query 561 AATCCAACGTCATTGCTGCCTTCAGCTCATGGTATTGGTTCTCCATCAGCTTCAG 615 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 559 AATCCAACGTCATTGTTGCCTTCAGCTCATGGTATTGGTTCTCCATCAGCTTCAG 613 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 185035919926 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5