BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G42470.1 Length=3899 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg913522 jgi|Araly1|913522|Al_scaffold_0001_3776 6082 0.0 > Ahg913522 jgi|Araly1|913522|Al_scaffold_0001_3776 Length=3786 Score = 6082 bits (3293), Expect = 0.0 Identities = 3610/3766 (96%), Gaps = 9/3766 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCAGATTCTGTTTGTTGGTTATGGAGTGGAAGCAAAACAATCAGCAGGATATTGTGCT 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1 ATGCAGATTCTGTTTGTTGGTTATGGAGTGGAAGCAAAACAATCAGCCGGATATTGTGCT 60 Query 61 ATGTATGATATCTGTGGAGCAAGAAGTGATGGGAAAGTACTAAATTGCCCTTTCAACATT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATGTATGATATCTGTGGAGCAAGAAGTGATGGGAAAGTACTAAATTGCCCTTTCAACATT 120 Query 121 CCTTCTGTGAAGCCTGATGATTTGTTATCTTCAAAGATTCAAAGCTTATGTCCAACAATC 180 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CCTGCTGTGAAGCCTGATGATTTGTTATCTTCAAAGATTCAAAGCTTATGTCCAACAATC 180 Query 181 ACTGGCAATGTTTGTTGCACAGAGACTCAATTTGATACATTACGTTCGCAAGTTCAACAG 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 181 ACTGGCAATGTTTGTTGCACAGAGACTCAATTTGATACATTACGTTCACAAGTTCAACAG 240 Query 241 GCTATTCCTTTTATTGTTGGTTGTCCAGCATGTTTGAGGAACTTTCTGAATCTTTTTTGT 300 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 241 GCTATTCCTTTCATTGTAGGTTGTCCAGCATGTTTGAGGAATTTTCTGAATCTTTTCTGT 300 Query 301 GAACTTACTTGTTCTCCGGATCAGAGTTTGTTTATCAATGTAACTTCTACTACAAAGGTC 360 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GAACTTACTTGTTCTCCGGATCAGAGTTTATTCATCAATGTAACTTCTACTACAAAGGTC 360 Query 361 AAGAATAATTCTACTGTAGATGGAATTCAGTACTATATAACTGATGATTTTGGAGCTGGG 420 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 361 AAGAATAATTCGACTGTAGATGGGATTCAGTACTATATAACTGATGATTTTGGAGCGGGG 420 Query 421 ATGTATGAATCTTGCAAAAATGTAAAATTTGGTAGCTCGAATAGCCGAGCTTTAGACTTT 480 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATGTATGAATCTTGCAAAAATGTGAAATTCGGTAGCTCTAATAGCCGAGCTTTAGACTTT 480 Query 481 CTCGGAGCCGGTGCAAAGAACTTTAAGGAGTGGTTTACATTTATTGGTCAGAAAGCGGGT 540 |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CTCGGAGCCGGTGCAAAGGATTTTAAGGAGTGGTTTGCATTTATTGGTCAGAAAGCGGGT 540 Query 541 GTCAATTTGCCAGGCTCACCGTATGGGATCGCTTTTTTGCCAACACCGCCTGTGTCGTCT 600 |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| Sbjct 541 GTCAATGTGCCAGGCTCACCGTATGGGATTGCGTTTTTGCCAACACCACCAGTGTCATCT 600 Query 601 GGAATGAGGCCTATGAATGTGTCTATTTATTCATGTGGTGATGAGTCTCTTGGCTGTTCT 660 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GGAATGAGGCCTATGAATGTGTCTACTTATTCATGCGGTGATGAGTCTCTTGGCTGTTCT 660 Query 661 TGTGGTGATTGTCCTTCTGCAGCTACTTGCTCTAGTAAAGCAGAAGTGCCTACTCAGAAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 661 TGTGGTGATTGTCCTTCTGCAGCTACTTGCTCCAGTAAAGCAGAAGTTCCTACTCAGAAA 720 Query 721 AAACATTCTTGCTCTATCAAGATTGGATCACTTGAGGTGAAATGTGTTGATTTCATATTA 780 || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct 721 AAGCACTCTTGTTCTATCAAAATTGGATCACTTGAGGCGAAATGTGTTGATTTCATACTA 780 Query 781 GCCATTTTGTATATTGTATTGGTTTCATTGTTTCTTGGAGGAGGTTTACTTCACCCAGTA 840 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 781 GCCATTGTGTATATTGTATTGGTTTCACTGTTTCTCGGAGGCGGTTTACTTCACCGAGTA 840 Query 841 AGGGGTAAGAAAAAGACCTCACAGATGGGAACATTGTCAGAAGCTAGTGGAGAACGAAA- 899 ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| | ||| Sbjct 841 AGGGGTAAGAAAAAGACCTCACAGATGAGACCATCGTCAGAAGCTGGTGGAGAGC-AAAG 899 Query 900 TTCTGTTAATCAGCAAAAACCAGACACTATTCAAT-CGCAGATGTTACAAAATACTCCAC 958 ||||| |||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||| Sbjct 900 TTCTGCTAATTTGCAAAAACCAGACACTA-TCCATGCACAGATGTTACAAAATACTCCAC 958 Query 959 AGAGAAACTGGGGTCAGCTATCGACAGTACAAGGACACTTGGCCAACTTTTACGGGAAGT 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 959 AGAGAAACTGGGGTCAGCTATCGACAGTACAAGGACACTTGGCCAATTTTTACAGGAAGT 1018 Query 1019 ATGGGATTTGGGTAGCAAGACACCCCACTCTTGTTTTGTGTTTGTCAGTCTCTGTAGTTC 1078 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 ATGGGATTTGGGTAGCAAGACACCCAACTCTTGTTTTGTGTTTGTCAGTCTCTGTAGTTC 1078 Query 1079 TTCTCCTTTGTGTGGGTCTGATCCGGTTCAAAGTTGAGACACGGCCTGATAAGCTGTGGG 1138 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1079 TTCTCCTTTGTGTGGGTCTGATCCGATTCAAAGTGGAGACACGGCCTGATAAGCTATGGG 1138 Query 1139 TAGGATCAGGTAGCAGAGCTGCTGAAGAGAAACAATTCTTTGACACTCATCTTGCTCCTT 1198 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1139 TAGGATCAGGGAGCAGAGCTGCTGAAGAGAAACAATTCTTTGACACCCATCTTGCTCCTT 1198 Query 1199 TCTACAGAATTGAACAGCTAATAATAGCAACAGTTCAAACATCTTCTCACGAAAAGGCGC 1258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1199 TCTACAGAATTGAACAGCTAATAATAGCAACAGTTCAAAAATCTTCTCACGAAAAGGCGC 1258 Query 1259 CAGAGATTTTGACAGATGACAATATTAAGTTACTTTTTGACATACAAAAGAAGGTCGATG 1318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1259 CAGAGATTTTGACAGATGACAATATTAAGTTACTTTTTGACATACAAAAGAAGGTCGATG 1318 Query 1319 GACTTCGGGCAAATCACTCAGGTTCAATGGTTTCTCTGACAGATATCTGCATGAAACCCC 1378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1319 GACTTCGGGCAAATCACTCAGGTTCAATGGTTTCTCTGACAGATATTTGCATGAAACCCC 1378 Query 1379 TGGGAGAGGATTGTGCCACACAGAGTGTTCTGCAGCAGTATTTCAAAATGAAACCAGAAA 1438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 1379 TGGGAGAGGATTGTGCCACACAGAGTGTTCTGCAG---TATTTCAAGATGAAACCAGAAA 1435 Query 1439 ATTATGACGACTATGGAGGCGTTGATCATGTTAAATATTGTTTTGAGCATTTCACCTCGA 1498 ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1436 ATTATGATGACTTTGGAGGCGTCGATCATGTTAAATATTGCTTTGAGCATTTCACCTCGA 1495 Query 1499 CAGAATCATGTTTGAGTGCATTTAAGGGTCCACTTGATCCAACTACTGCACTGGGAGGTT 1558 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1496 CAGATTCATGTTTGAGTGCATTTAAGGGTCCACTTGATCCAACTACTGCACTGGGAGGTT 1555 Query 1559 TCTCAGGGAACAGTTTTAGTGAGGCTTCTGCTTTTCTTGTGACTTATCCTGTGGACAATT 1618 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1556 TCTCAGGGAACAGTTTTAGTGAGGCTTCTGCTTTTCTTGTGACTTATCCTGTGGACAATG 1615 Query 1619 TTGTTGACAATAAAGGTAACAAAACTGAGAAAGCAGTAGCATGGGAGAAAGCCTTTATCC 1678 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1616 CTGTTGACAATAAAGGTAACAAAACTGAGAAAGCAGTAGCATGGGAGAAAGCCTTTATCC 1675 Query 1679 AACTGGCCAAGGATGAGTTGTTGCCAATGGTTCAAGCAAAAAATTTAACTCTTTCTTTCT 1738 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1676 AACTGGCCAAGGATGAGTTGTTGCCAATGGTTAAAGCAAAAAATTTAACTCTTTCTTTCT 1735 Query 1739 CGTCGGAAAGTTCTATTGAAGAAGAACTGAAAAGAGAAAGCACAGCAGATGTCATAACTA 1798 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1736 CTTCGGAAAGTTCTATTGAAGAAGAATTGAAAAGAGAAAGCACAGCAGATGTCATAACTA 1795 Query 1799 TAGCCATAAGTTATCTTGTCATGTTTGCCTATATATCACTCACACTTGGAGATTCACCTC 1858 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1796 TAGCCATAAGTTATCTTGTCATGTTTGCCTATATATCACTCACACTTGGAGATTCACCTC 1855 Query 1859 GCTTAAAGTCCTTTTACATTACATCCAAGGTTCTGCTTGGTCTATCTGGTGTTCTACTTG 1918 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1856 GCTTAAATTCCTTTTACATAACATCCAAGGTTCTGCTTGGTCTATCTGGTGTTCTACTTG 1915 Query 1919 TCATGCTTTCTGTCCTTGGCTCTGTAGGATTTTTCAGTGCCGTTGGGATGAAATCGACTC 1978 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1916 TCATGCTTTCCGTCCTCGGCTCTGTAGGATTTTTCAGTGCCGTTGGGATGAAATCGACTC 1975 Query 1979 TAATCATAATGGAAGTTATACCTTTTCTTGTTTTGGCTGTCGGTGTTGATAATATGTGCA 2038 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1976 TTATAATAATGGAAGTTATACCTTTTCTTGTTTTGGCTGTCGGTGTTGATAATATGTGCA 2035 Query 2039 TCCTGGTTCATGCTGTCAAGAGGCAAGAGCAAGAGCTGCCTTTGGAAAGAAGAATTAGCA 2098 | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 2036 TACTGGTTCATGCTGTGAAGAGGCAAGAGCAAGAGCTGCCTTTGGAAAGACGAATAAGCA 2095 Query 2099 ATGCCCTTATGGAAGTTGGACCATCGATTACTCTAGCAAGTTTAGCCGAGATTTTAGCTT 2158 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2096 ATGCCCTTATGGAAGTTGGACCATCGATTACTCTTGCAAGTTTAGCCGAGATTTTAGCTT 2155 Query 2159 TCGCTGTTGGTGCTTTCATTAAAATGCCAGCTGTTCGAGTATTCTCCATGTTTGCTGCAT 2218 | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2156 TTGCTGTTGGTGCTTTTATTAAAATGCCAGCTGTTCGAGTGTTCTCCATGTTTGCTGCAT 2215 Query 2219 TGGCTGTCCTTTTGGACTTTCTTCTCCAGATTACCGCGTTTGTAGCTTTGATAGTTTTTG 2278 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2216 TGGCTGTCCTTTTGGACTTTCTTCTCCAGATTACTGCGTTTGTAGCTTTGATAGTTTTTG 2275 Query 2279 ACTTCCGACGGACGGAGGATAAGCGAGTTGATTGCTTCCCGTGTATTAAGACATCAAAAT 2338 |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 2276 ACTTCCAACGGACAGAGGATAAGCGGGTTGATTGCTTCCCATGTATTAAGACATCGAAAT 2335 Query 2339 CATCTATTAGTGCTGAAAAAGGGGTTGGTCAAAGAAAAGCTGGCCTTTTGACTCGATATA 2398 |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2336 CATCTAATAGCGCTGACAAAGGGGTTGGTCAGAGAAAAGCTGGCCTTTTGACTCGATATA 2395 Query 2399 TGAAGGAAGTCCATGCACCTGTTCTTAGCCATTGGATAGTCAAAATAGTGGTCATTGCCT 2458 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| Sbjct 2396 TGAAGGAAGTCCATGCACCCGTTCTTAGCCATTGGGCAGTCAAAATATTGGTTATTGCCT 2455 Query 2459 TCTTCTTTGGCTTAGCAATGGCTGGAATTGCATTGTCGACTCGTATTGAGCCTGGTTTGG 2518 |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| Sbjct 2456 TCTTCTTTGGCTTAGCTATGGCTGGAATTGCAATGTCCACTCGGATTGAGCCTGGCTTGG 2515 Query 2519 AGCAACAGATTGTTCTTCCTCAAGACTCATATCTTCAGGGTTACTTCAACAATATTTCTA 2578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2516 AGCAACAGATTGTTCTTCCTCAAGACTCATATCTTCAGGGTTACTTCAACAATATTTCAA 2575 Query 2579 CATATCTTCGAATCGGTCCACCTTTATACTTTGTTCTGAAGAATTATAACTACAGCTCAG 2638 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2576 CATATCTTCGTATTGGTCCACCTTTATACTTTGTTCTGAAGAATTATAACTACAGCTCAG 2635 Query 2639 AATCAAGACATACAAATCAACTTTGTTCCATTAACAAGTGTAATCCTAACTCTCTTTTAA 2698 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 2636 AATCAAGACAGACTAATCAACTTTGTTCCATTAACAAGTGTGATTCTAACTCTCTTTTAA 2695 Query 2699 ATGAGATTGCAAGGGCTTCTTTGACTCCGGAACTAAGCTACATAGCTAAGCCAGCTGCTT 2758 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2696 ATGAGATTGCAAGGGCTTCTTTGACTCCAGAACTAAGCTACATAGCTAAGCCAGCTGCTT 2755 Query 2759 CGTGGCTCGATGACTTTCTTGTGTGGTTATCTCCCGAGGCGTTTGGATGTTGCAGAAAGT 2818 | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| Sbjct 2756 CATGGCTTGATGACTTTCTCGTGTGGTTATCTCCCGAGGCGTTTGGCTGTTGCCGAAAGT 2815 Query 2819 TTACAAATGGTACCTTTTGCCCCCCTGATGACCAGCCTCCTTGTTGCCCTCCTGGTCAAA 2878 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 2816 TTACAAATGGTACCTTTTGCCCCCCTGATGACCAGCCTCCTTGTTGCTCTCCTGATCAAG 2875 Query 2879 -CGAGCTGTGGCCTAAGTGAAGTATGCAAAGATTGTACCACGTGCTTCCGGCATGCAGAT 2937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2876 GC-AGCTGTGGCCTAAGTGAAGTATGCAAAGATTGTACCACGTGCTTCCGTCATGCAGAT 2934 Query 2938 TTAAGTAGTGACCGCCCTTCCACAACACAATTCAAAGAGAAACTTCCTTGGTTCCTCAAC 2997 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2935 TTAAGTAGTGACCGCCCATCCACAACCCAATTCAAAGAGAAACTTCCTTGGTTCCTCAAC 2994 Query 2998 GCGCTCCCTTCTGCTGATTGTGCTAAAGGTGGACATGGTGCTTATTCTAGTAGTGTTGAT 3057 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2995 GCGCTTCCTTCCGCTGATTGTGCTAAAGGTGGACATGGTGCTTATTCTAGTAGTGTTGAT 3054 Query 3058 TTGCAAGGCTATGCAAATGGTATCATTCAAGCTTCATCGTTCCGTACTTATCACACACCC 3117 || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3055 TTACAAGGCTATGAAAATGGTATAATTCAAGCTTCATCGTTCCGCACTTATCACACACCC 3114 Query 3118 CTTAACAAGCAGGTTGACTTTGTTAATTCAATGAGAGCTGCTCAAGAATTTAGTGCAAAA 3177 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3115 CTTAACAAGCAGGCTGACTTTGTTAATTCAATGAGAGCTGCTCAAGAATTTAGTGCAAAA 3174 Query 3178 GTTTCCCGTTCCTTAAAGATGGAGATATATCCTTATTCAGTGTTTTATATGTTCTTTGAG 3237 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3175 GTTTCCCGTTCCTTAAAGATGGAGATATATCCATATTCAGTGTTTTATATGTTCTTTGAG 3234 Query 3238 CAATATCTTGACATATGGAAAACTGCATTAATCAACCTCTCCATAGCCATCGCTGCCGTG 3297 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3235 CAATATCTTGACATATGGAAAACTGCACTAATCAACCTCTCCATAGCCATTGCTGCCGTG 3294 Query 3298 TTTGTCGTGTGTTTAATCATCACATGCAGCTTTTGGAGCTCGGCAATTATTTTGCTGGTG 3357 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3295 TTTGTCGTGTGTTTAATCATCACATGCAGCTTTTGGAGCTCCGCAATTATTTTGCTGGTG 3354 Query 3358 ATCGCGATGATCATTATTGATCTCCTGGGAGTTATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAAC 3417 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3355 ATCGCAATGATCATTATTGATCTCTTGGGAGTTATGGCAGTCTTTCATATCCAGCTAAAC 3414 Query 3418 GCACTATCGGTTGTAAATCTAATCATGTCCGTGGGCATAGCGGTTGAGTTTTGCGTACAC 3477 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 3415 GCACTATCGGTTGTAAATCTAATCATGTCCGTGGGCATAGCGGTTGAGTTTTGTGTGCAC 3474 Query 3478 ATAACACACGCTTTCTCGCACTGGGGACAGAAACCATCGGATGAAAGAGGCGTTGGGTGG 3537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3475 ATAACACACGCTTTCTCGCACTGGGGACAGAAACCATCGGATGAAAGAGGCGTTGGGTGG 3534 Query 3538 GATGGGAGCTTCAGTTTTCAGTGGAATTACATTGACGAAACTAGTTGGGGTGATTGTGCT 3597 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 3535 GATGGGAGCTTCAGTTTTCAGTGGAATTACATTGACGAAGCTAGTTGGGGTAATTGTGCT 3594 Query 3598 CGGTTTCTCAAGATCAGAAGTCTTTGTGGTGTACTACTTCAAGATGTATTTGGCACTAGT 3657 | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3595 CAGTTTCTCAAGATCAGAAGTCTTTGTGGTCTACTACTTCAAGATGTATCTGGCACTAGT 3654 Query 3658 CCTTCTCGGTTTCTTACACGGCCTTGTATTTTTACCGGTGTTCTTGAGCATGTTTGGTCC 3717 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3655 CCTCCTCGGTTTCTTGCACGGCCTTGTATTTTTACCGGTGTTCTTGAGCATGTTTGGTCC 3714 Query 3718 AGCTCCAAGACATGTAGAAGGGGAAAGGCAAGATCATCGACCTTCG 3763 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3715 TTCTCCAAGACATGTAGAAGGGGAAAGGCAAGATCATCGACCTTCG 3760 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 147358922656 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5