BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G48900.1 Length=1814 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg923242 jgi|Araly1|923242|scaffold_104523.1 2571 0.0 Ahg923241 jgi|Araly1|923241|scaffold_104522.1 2571 0.0 Ahg911335 jgi|Araly1|911335|Al_scaffold_0001_1589 1223 0.0 Ahg359800 jgi|Araly1|359800|fgenesh1_pg.C_scaffold_1105000001 132 1e-29 > Ahg923242 jgi|Araly1|923242|scaffold_104523.1 Length=1533 Score = 2571 bits (1392), Expect = 0.0 Identities = 1480/1523 (97%), Gaps = 3/1523 (0%) Strand=Plus/Plus Query 115 TTGAATTCACAAAGCAGCGTAAATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGC 174 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTGAATTCGCAAAGCAGCGAAAATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGC 60 Query 175 GATACAGCAGATGAGCAATGTGACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGCTTGAA 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 61 GATACAGCAGATGAGCAATGTGACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGTTTGAA 120 Query 235 CGAGATCACTCGTGCTTTGCTTCAATCCGATGTTTCATTTCCCCTTGTGAAAGAGATGCA 294 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| Sbjct 121 CGAGATCACTCGTGCTCTGCTTCAATCCGATGTTTCGTTTCCTCTTGTGAAGGAGATGCA 180 Query 295 GAGTAATATTAAGAAAATCGTCAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAGCGCCG 354 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 181 GAGTAATATCAAGAAGATCGTCAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAACGCCG 240 Query 355 GATCATTGAACAGGCTATCTTTAGTGAACTCTGTAAGATGTTGGATCCAGGGAAGCCTGC 414 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 241 GATCATTGAACAGGCTATCTTTAGTGAACTTTGTAAGATGTTGGATCCAGGAAAGCCTGC 300 Query 415 GTTTGCTCCTAAAAAAGCTAAAGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTACAAGGTGCTGG 474 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GTTTGCTCCTAAAAAGGCTAAAGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTACAAGGTGCTGG 360 Query 475 AAAGACGACAACTTGTACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGATACAAACCAGC 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AAAGACGACAACTTGTACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGATACAAACCAGC 420 Query 535 TTTGGTTTGTGCGGATACTTTCAGGGCTGGTGCGTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTAC 594 | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CCTAGTTTGTGCGGATACTTTCAGGGCCGGTGCTTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTAC 480 Query 595 CAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGT 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGT 540 Query 655 TGAGGGAGTAGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACCAGTGG 714 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 541 TGAGGGAGTTGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACTAGTGG 600 Query 715 TCGCCATAAACAAGAAGCTTCTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAA 774 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TCGCCATAAACAAGAAGCTACTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAA 660 Query 775 ACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGC 834 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGC 720 Query 835 TCAAGCCTTTAAGCAGAGTGTTGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCA 894 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TCAAGCCTTTAAGCAAAGTGTTGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCA 780 Query 895 TGCCAAGGGTGGTGGGGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTAT 954 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TGCCAAGGGTGGTGGTGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTAT 840 Query 955 CGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAACCATTTGTCAGCCG 1014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 841 CGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAACCATTTGTTAGCCG 900 Query 1015 TCTCTTAGGAATGGGTGATTGGTCTGGATTCGTGGATAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAA 1074 |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TCTCTTAGGAATGGGTGACTGGTCTGGATTTGTTGATAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAA 960 Query 1075 AGATCAACAGCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACGTTGAGAATTAT 1134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 961 AGATCAACAGCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACATTGAGAATTAT 1020 Query 1135 GTACGACCAGTTCCAGAACATACTGAACATGGGTCCACTTAAGGAGGTTTTCTCAATGCT 1194 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1021 GTACGACCTGTTCCAGAATATACTGAACATGGGTCCACTTAAGGAGGTTTTCTCGATGCT 1080 Query 1195 GCCTGGAATTAGTGCTGAAATGATGCCGAAAGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGAT 1254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GCCTGGAATTAGTGCTGAAATGATGCCAAAAGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGAT 1140 Query 1255 AAAGCGGTACATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCC 1314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 AAAGCGGTACATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCC 1200 Query 1315 AAAGGTGTTTAACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAG 1374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 AAAGGTGTTTAACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAG 1260 Query 1375 AGAAGTGATGGAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCT---AGCGAAGATATGGAGCAAGAT 1431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 1261 AGAAGTGATGGAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCTGCTAGCAAAGATATGGAGCAAGAT 1320 Query 1432 GAAAGGACTCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAGTGCACTCTCGAGAAACATGAACGC 1491 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GAAAGGGCTCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAGTGCACTCTCGAGAAACATGAACGC 1380 Query 1492 ACAGCACATGAGCAAGGTCCTCCCACCTCAGATGCTCAAGCAGATTGGCGGCATGGGCGG 1551 ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1381 ACAGCACATGAGCAAGGTCCTACCGCCGCAGATGCTCAAGCAGATTGGTGGCATGGGCGG 1440 Query 1552 TCTGCAGAGTCTAATGAAGCAGATGGGTTCCGGCAAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGG 1611 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 TCTGCAGAGTCTCATGAAGCAGATGGGTTCCGGCAAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGG 1500 Query 1612 CGGAGACAAGTAGTATCTTTCTT 1634 |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1501 CGGAGACAAGTAGTTTCTTTCTT 1523 > Ahg923241 jgi|Araly1|923241|scaffold_104522.1 Length=1533 Score = 2571 bits (1392), Expect = 0.0 Identities = 1480/1523 (97%), Gaps = 3/1523 (0%) Strand=Plus/Plus Query 115 TTGAATTCACAAAGCAGCGTAAATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGC 174 |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTGAATTCGCAAAGCAGCGAAAATGGTGTTGGCGGAGCTAGGCGGGCGGATTACCCGCGC 60 Query 175 GATACAGCAGATGAGCAATGTGACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGCTTGAA 234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 61 GATACAGCAGATGAGCAATGTGACAATTATCGATGAGAAGGCTTTGAATGAATGTTTGAA 120 Query 235 CGAGATCACTCGTGCTTTGCTTCAATCCGATGTTTCATTTCCCCTTGTGAAAGAGATGCA 294 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| Sbjct 121 CGAGATCACTCGTGCTCTGCTTCAATCCGATGTTTCGTTTCCTCTTGTGAAGGAGATGCA 180 Query 295 GAGTAATATTAAGAAAATCGTCAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAGCGCCG 354 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 181 GAGTAATATCAAGAAGATCGTCAATCTTGAAGATCTAGCAGCTGGTCACAACAAACGCCG 240 Query 355 GATCATTGAACAGGCTATCTTTAGTGAACTCTGTAAGATGTTGGATCCAGGGAAGCCTGC 414 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 241 GATCATTGAACAGGCTATCTTTAGTGAACTTTGTAAGATGTTGGATCCAGGAAAGCCTGC 300 Query 415 GTTTGCTCCTAAAAAAGCTAAAGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTACAAGGTGCTGG 474 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GTTTGCTCCTAAAAAGGCTAAAGCTAGTGTAGTTATGTTTGTTGGATTACAAGGTGCTGG 360 Query 475 AAAGACGACAACTTGTACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGATACAAACCAGC 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AAAGACGACAACTTGTACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAGGATACAAACCAGC 420 Query 535 TTTGGTTTGTGCGGATACTTTCAGGGCTGGTGCGTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTAC 594 | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CCTAGTTTGTGCGGATACTTTCAGGGCCGGTGCTTTCGATCAGCTGAAACAGAATGCTAC 480 Query 595 CAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGT 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTGTGAAAATTGCTGT 540 Query 655 TGAGGGAGTAGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACCAGTGG 714 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 541 TGAGGGAGTTGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTGTTGATACTAGTGG 600 Query 715 TCGCCATAAACAAGAAGCTTCTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAA 774 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TCGCCATAAACAAGAAGCTACTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTGCTGAAGCAACGAA 660 Query 775 ACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGC 834 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGC 720 Query 835 TCAAGCCTTTAAGCAGAGTGTTGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCA 894 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TCAAGCCTTTAAGCAAAGTGTTGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGCCA 780 Query 895 TGCCAAGGGTGGTGGGGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTAT 954 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TGCCAAGGGTGGTGGTGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGTCCTGTGATATTTAT 840 Query 955 CGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAACCATTTGTCAGCCG 1014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 841 CGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAACCATTTGTTAGCCG 900 Query 1015 TCTCTTAGGAATGGGTGATTGGTCTGGATTCGTGGATAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAA 1074 |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TCTCTTAGGAATGGGTGACTGGTCTGGATTTGTTGATAAGCTACAAGAGGTAGTACCTAA 960 Query 1075 AGATCAACAGCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACGTTGAGAATTAT 1134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 961 AGATCAACAGCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTTACATTGAGAATTAT 1020 Query 1135 GTACGACCAGTTCCAGAACATACTGAACATGGGTCCACTTAAGGAGGTTTTCTCAATGCT 1194 |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1021 GTACGACCTGTTCCAGAATATACTGAACATGGGTCCACTTAAGGAGGTTTTCTCGATGCT 1080 Query 1195 GCCTGGAATTAGTGCTGAAATGATGCCGAAAGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGAT 1254 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GCCTGGAATTAGTGCTGAAATGATGCCAAAAGGACATGAGAAAGAAAGCCAGGCGAAGAT 1140 Query 1255 AAAGCGGTACATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCC 1314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 AAAGCGGTACATGACAATGATGGATTCTATGACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCC 1200 Query 1315 AAAGGTGTTTAACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAG 1374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 AAAGGTGTTTAACGAGTCACGGATGATGCGGATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAG 1260 Query 1375 AGAAGTGATGGAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCT---AGCGAAGATATGGAGCAAGAT 1431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 1261 AGAAGTGATGGAGATGTTGGAAGAGTACAAGAGGCTGCTAGCAAAGATATGGAGCAAGAT 1320 Query 1432 GAAAGGACTCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAGTGCACTCTCGAGAAACATGAACGC 1491 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GAAAGGGCTCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATGAGTGCACTCTCGAGAAACATGAACGC 1380 Query 1492 ACAGCACATGAGCAAGGTCCTCCCACCTCAGATGCTCAAGCAGATTGGCGGCATGGGCGG 1551 ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1381 ACAGCACATGAGCAAGGTCCTACCGCCGCAGATGCTCAAGCAGATTGGTGGCATGGGCGG 1440 Query 1552 TCTGCAGAGTCTAATGAAGCAGATGGGTTCCGGCAAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGG 1611 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 TCTGCAGAGTCTCATGAAGCAGATGGGTTCCGGCAAGGACATGATGGGAATGTTCGGTGG 1500 Query 1612 CGGAGACAAGTAGTATCTTTCTT 1634 |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1501 CGGAGACAAGTAGTTTCTTTCTT 1523 > Ahg911335 jgi|Araly1|911335|Al_scaffold_0001_1589 Length=1335 Score = 1223 bits (662), Expect = 0.0 Identities = 950/1082 (88%), Gaps = 47/1082 (4%) Strand=Plus/Plus Query 407 AAG-CCTG-CGTTTGCTCCTAAAAAAGCTAAAGC---TAGTGTAGTTATGTTTGTTGGAT 461 ||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| || || | Sbjct 156 AAGACCTGTC-TTTGCTCCCAAAAAGGCCAAACCTAGTAGTGTAGTTATGTTCGTCGGGT 214 Query 462 TACAAGGTGCTGGAAAGACGACAACTTGTACTAAGTATGCTTATTATCATCAGAAGAAAG 521 |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 215 TACAAGGTGCTGGAAAAACCACAACATGTACCAAGTATGCTTACTATCATCAGAAGAAAG 274 Query 522 GATACAAACCAGCTTTGGTTTGTGCGGATACTTTCAGGGCTGGTGCGTTCGATCAGCTGA 581 | |||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | Sbjct 275 GGTACAAAACAGCTCTAGTGTGTGCAGATACTTTCAGGGCCGGTGCTTTCGATCAGCTCA 334 Query 582 AACAGAATGCTACCAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACGGAATCCGATCCTG 641 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 335 AACAGAATGCCACCAAGGCTAAGATCCCCTTTTATGGAAGCTACACAGAATCCGATCCTG 394 Query 642 TGAAAATTGCTGTTGAGGGAGTAGATACGTTTAAGAAAGAAAACTGTGATCTCATTATTG 701 |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 395 TGAAAATTGCTGCTGAGGGAGTTGATAGGTTCAAGAAAGAAAAATGTGATCTTATTATTG 454 Query 702 TTGATACCAGTGGTCGCCATAAACAAGAAGCTTCTCTCTTTGAAGAAATGCGTCAAGTTG 761 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 455 TTGACACCAGTGGTCGCCATAAACAAGAAGCTTCTCTCTTTGAAGAAATTCTTCAAGTTG 514 Query 762 CTGAAGCAACGAAACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTG 821 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515 CTGAAGCAACGGAACCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTG 574 Query 822 CATTTGATCAAGCTCAAGCCTTTAAGCAGAGTGT-TGCTGTTGGAGCTGTAATTATTACT 880 ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 575 CATTTGATCAAGCTCAAGCATTTAAGCAAACTGTAT-CTGTTGGAGCTGTTATTATTACT 633 Query 881 AAGATGGACGGCCATGCCAAGGGTGGTGGGGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGT 940 ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 634 AAGATGGACGGCCATGCCAAGGGGGGTGGTGCTCTTAGCGCTGTAGCAGCTACAAAAAGT 693 Query 941 CCTGTGATATTTATCGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGACGTCAAA 1000 ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 694 CCTGTGATATTCATTGGAACAGGAGAGCATATGGATGAGTTTGAAGTGTTTGATGTCAAA 753 Query 1001 CCATTTGTCAGCCGTCTCTTAGGAATGGGTGATTGGTCTGGATTCGTGGATAAGCTACAA 1060 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| Sbjct 754 CCATTTGTCAGCCGTCTCTTAGGAAAGGGTGATTGGTCTGGACTCGTGAATAAACTACAA 813 Query 1061 GAGGTAGTACCTAAAGATCAACAGCCTGAACTTCTGGAAAAGCTCTCTCAGGGTAACTTT 1120 ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 814 GAGGTGGTACCTAAAGATCTACAGCATGAACTTGTAGAAAATCTCTCTCAGGGTAACTTT 873 Query 1121 ACGTTGAGAATTATGTACGACCAGTTCCAGAA--CATACTGAACATGGGTCCACTTAA-- 1176 |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| | || ||| ||||| Sbjct 874 ACGTTGAGAACTATGTACGACCAGTTCCAGTGTTC-T-CTGCAGAT---TCCTCTTAATC 928 Query 1177 -GG--AGG-T-T-TTCT-CAAT-GCT-GCCTGGAATTAGTGCTGAAATGATGCCGAAAGG 1227 || || | | || | |||| | | ||||| | | ||||||| ||||||||||||| Sbjct 929 AGGTCAGAATCTCTTGTTCAATAG-TAGCCTGTACC-ATTGCTGAATTGATGCCGAAAGG 986 Query 1228 ACATGA-GAAAGAAAGCC-AGGCGAAGATAAAGCGGTACATGACAATGATGGATTCTATG 1285 ||||| || ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 987 ACATGGTGAC-GAAAGCCGAG-CGAAGAGA------TACATGACAATGATGGATTCTATG 1038 Query 1286 ACAAATGATGAACTGGACAGCTCAAACCCAAAGGTGTTTAACGAGTCACGGATGATGCGG 1345 ||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 1039 ACAGATAAAGAACTGGACAGCTCAAACACAAAGGTGTTTAACGAGTCAAGGATAATGCGG 1098 Query 1346 ATAGCAAGAGGGTCAGGGAGGCAAGTAAGAGAAGTGATGGAGATGTTGGAAGAGTACAAG 1405 ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1099 ATAGCGAGAGGGTCAGGGAGGTTAGTAAGAGAAGTGATGGAGTTGTTGGAAGAGTACAAG 1158 Query 1406 AGGCTAGCGAAGATATGGAGCAAGATGAAAGGACTCAAGATCCCAAAGAATGGAGATATG 1465 ||| ||| || | | | | | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1159 AGGAAAGC-AA-A---G-A-CTA--TGAAAGGAATCAAGATCCCAAAGAATGGAGACATG 1209 Query 1466 AG 1467 || Sbjct 1210 AG 1211 > Ahg359800 jgi|Araly1|359800|fgenesh1_pg.C_scaffold_1105000001 Length=621 Score = 132 bits (71), Expect = 1e-29 Identities = 197/255 (77%), Gaps = 20/255 (8%) Strand=Plus/Plus Query 776 CCAGATCTTGTTATATTTGTTATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGCT 835 |||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4 CCAGCTCGTGTTGTATATGTCATGGATAGCAGTATTGGTCAAGCTGCATTTGATCAAGCT 63 Query 836 CAAGCCTTTAAGCAGAGTGTTGC--T-GTTGGAGCTGTAATTATTACTAAGATGGACGGC 892 ||||| || ||||| | |||| | | || |||| ||| ||||||||||| || ||||| Sbjct 64 CAAGCATTCAAGCA-A-TGTTTCACTCGT-GGAGTTGTCATTATTACTAATATACACGGC 120 Query 893 CA-TGCCAAGGG-TGGTGGGGCTCTTAGCGCTGTTGCAGCTACGAAAAGT--CCTGTGAT 948 | | |||| | || ||| ||| | | | |||||||||| | | ||||| || |||| Sbjct 121 AACT-CCAAAGCATG-TGGTGCTATCATCTCTGTTGCAGC-A-GCAAAGTGTCCCATGAT 176 Query 949 ATTTATCGGAA-CAGGAGAGCATATG-GATGAGTTTGAAGTGTTTGACG-TCAAACCATT 1005 ||| | | ||| |||||||| | | | || || ||||||| ||||| | | || | || Sbjct 177 ATT-AGCTGAAACAGGAGAGAAGA-GAGAGGATTTTGAAGCATTTGAAGCTGAAGCT-TT 233 Query 1006 TGTCAGCCGTCTCTT 1020 |||||| ||||||| Sbjct 234 TGTCAGGAGTCTCTT 248 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 68105358060 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5