BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G55350.5
Length=7308
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg924045 jgi|Araly1|924045|scaffold_105326.1 7094 0.0
> Ahg924045 jgi|Araly1|924045|scaffold_105326.1
Length=6499
Score = 7094 bits (3841), Expect = 0.0
Identities = 4076/4192 (97%), Gaps = 6/4192 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 414 GTAGGTGGGAGAAGAAGCCATGGAAGGGGATGAGCGAGGAGTCTTACTTGCTTGTGTAAT 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 GTAGGTGGGAGAAGAAGCCATGGAAGGGGATGAGCGAGGAGTCTTACTTGCTTGTGTAAT 63
Query 474 TTCGGGTACCCTTTTCACGGTTTTCGGTTCGGGTTCGTTTTGGATACTTTGGGCTGTTAA 533
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TTCGGGTACCCTTTTCACGGTTTTCGGTTTGGGTTCGTTTTGGATACTTTGGGCTGTTAA 123
Query 534 TTGGCGGCCATGGCGTCTCTACAGTTGGATCTTTGCTAGAAAATGGCCAAAAGTATTGCA 593
||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 TTGGCGGCCATGGCGGCTCTATAGCTGGATCTTTGCTAGAAAATGGCCAAAAGTATTGCA 183
Query 594 AGGTCCTCAGCTTGATATACTATGTGGTGTTCTATCTCTTTTTGCTTGGATTGTGGTAGT 653
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 AGGTCCCCAGCTTGATGCACTATGTGGTGTTCTATCTCTTTTTGCTTGGATTGTGGTAGT 243
Query 654 ATCCCCTATTGCAATCTTGATAGGATGGGGTTCTTGGCTGATTGT-GATATTGGATCGAC 712
||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 244 ATCTCCTATTGCAATCTTGATAGGGTGGGGTTCCTGGCTGATT-TCGATATTGGATCGAG 302
Query 713 ATATCATTGGGCTGGCGATAATAATGGCTGGAACAGCCCTTTTACTGGCATTCTACTCAA 772
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 ATATCATTGGGCTTGCGATAATAATGGCTGGAACAGCCCTTTTACTGGCATTCTACTCAA 362
Query 773 TCATGCTTTGGTGGAGGACCCAGTGGCAAAGCTCAAGAGCTGTCGCTTTACTTCTCCTTC 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 TCATGCTTTGGTGGAGGACCCAGTGGCAAAGCTCAAGAGCTGTCGCTTTACTTCTCCTTC 422
Query 833 TTGGTGTTGCCTTACTATGTGCGTATGAACTCTGTGCTGTCTATGTTACGGCTGGTGCGC 892
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 TTGGTGTTGCCTTACTCTGTGCGTATGAACTTTGTGCTGTCTATGTTACGGCTGGTGCGC 482
Query 893 ATGCATCTCAGCAATATTCTCCTTCTGGTTTCTTTTTCGGTGTATCAGCAATCGCGTTGG 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 ATGCATCTCAGCAATATTCTCCTTCTGGTTTCTTTTTCGGTGTATCAGCAATCGCGTTGG 542
Query 953 CAATTAACATGCTATTTATCTGCCGCATGGTCTTTAATGGAAATGGTTTAGATGTGGACG 1012
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 543 CAATTAACATGCTATTTATCTGCCGCATGGTCTTTAATGGAAATGGGTTAGATGTGGATG 602
Query 1013 AATATGTAAGGAGGGCATATAAATTTGCTTATTCAGATTGTATAGAAGTGGGTCCTGTGG 1072
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 AATATGTAAGGAAGGCATATAAATTTGCTTATTCAGATTGTATAGAAGTGGGTCCTGTGG 662
Query 1073 CTTGTTTGCCTGAACCTCCTGATCCTAATGAATTATATCCCCGGCAAACCAGCAGGGCTT 1132
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 CTTGTTTGCCAGAACCTCCTGATCCCAATGAATTATATCCCCGGCAAACCAGCAGGGCTT 722
Query 1133 CACATCTTGGCCTTCTGTACCTGGGCTCACTCGTAGTTCTCCTTGCCTACTCAGTCCTAT 1192
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 CACATCTTGGCCTCCTGTACCTGGGCTCACTCGTAGTTCTCCTTGCCTACTCAGTCCTAT 782
Query 1193 ATGGTCTCACAGCTAGGGAATCACGTTGGCTTGGAGGAATCACATCAGCTGCAGTTATTG 1252
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 783 ATGGCCTCACAGCTAGGGAATCACGTTGGCTTGGAGGAATTACATCAGCTGCAGTTATTG 842
Query 1253 TTCTTGACTGGAATATTGGGGCATGCTTGTATGGGTTTAAGCTTCTTCAGAATCGTGTTC 1312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 TTCTTGACTGGAATATTGGGGCATGCTTGTATGGGTTTAAGCTTCTTCAGAATCGTGTTC 902
Query 1313 TGGCACTTTTTGTTGCTGGCATATCCCGTCTTTTCCTAATATGTTTTGGCATACACTACT 1372
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 TGGCACTTTTTGTTGCTGGCACATCCCGTCTTTTCCTAATATGTTTTGGCATACACTACT 962
Query 1373 GGTACCTAGGGCATTGTATTAGTTACATTTTCGTAGCATCAGTTCTATCAGGTGCTGCTG 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGTACCTAGGGCATTGTATTAGTTACATTTTCGTAGCATCAGTTCTATCAGGTGCTGCTG 1022
Query 1433 TTTCTCGGCATCTATCTA-TAACAGACCCATCAGCTGCAAGAAGAGATGCCTTACAGAGC 1491
|||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TTTCCCGGCATCTATC-AGTAACAGACCCATCAGCTGCAAGAAGAGATGCCTTACAGAGC 1081
Query 1492 ACAGTGATCCGCTTGAGAGAAGGTTTTCGGAGAAAAGAGCAGAATAGTTCTTCAAGTTCT 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1082 ACAGTGATCCGCTTGAGAGAAGGTTTTCGGAGAAAGGAGCAGAATAGTTCATCAAGTTCT 1141
Query 1552 TCAGATGGTTGTGGCTCAAGTATAAAAAGAAGTAGTAGTATCGATGCTGGCCATACTGGT 1611
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1142 TCAGATGGTTGTGGCTCAAGTATGAAAAGAAGTAGTAGTATCGATGCTGGCCATGCTGGT 1201
Query 1612 TGTACTAATGAAGCAAATCGTACGGCAGAATCTTGCACGGCTGACAATCTAACTCGAACA 1671
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 TGTACTAATGAAGCTAATCGTACCGCAGAATCTTGCACGGCTGACAATCTAACTCGAACA 1261
Query 1672 GGCAGCTCTCAGGAGGGAATCAATAGCGACAAAAGCGAAGAAAGTGGAAGACCAAGCTTA 1731
|||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 GGCAGCTCCCAGGAGGGTATCAATAGCGAGAAAAGCGTAGAAAGTGGAAGACCAAGCTTA 1321
Query 1732 GGTTTACGTAGTAGTTCATGTCGTTCTGTGGTCCAAGAGCCCGAAGCAGGAACGTCTTAT 1791
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 GGTTTACGTAGTAATTCATGTCGTTCTGTGGTCCAAGAGCCCGAAGCAGGAACGTCTTAT 1381
Query 1792 TTTATGGACAAAGTTTCTGATCAAAATAACACTCTTGTTGTTTGTTCGAGCAGTGGTCTA 1851
||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1382 TTTCTGGACAAAGTTTCTGATCAGAATAACACTCCTGTTGTTTGTTCTAGCAGTGGTCTA 1441
Query 1852 GATAGCCAAGGTTACGAGTCTAGCACATCGAATTCTGCAAACCAGCAGCTTTTGGATATG 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1442 GATAGCCAAGGTTACGAGTCTAGCACATCGAATTCTGCAAACCAGCAGCTTTTGGATTTG 1501
Query 1912 AATTTGGCTCTTGCTTTCCAGGACCAGTTAAACAATCCTAGGATAGCCTCGATACTTAAG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 AATTTGGCTCTTGCTTTCCAGGACCAGTTAAACGATCCTAGGATAGCCTCGATACTTAAA 1561
Query 1972 AAGAAAGCAAAAGAAGGTGATCTTGAACTGACTAATTTGCTGCAAGACAAGGGGTTGGAC 2031
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 AAGAAAGCAAAAGAAGGTGATCTTGAACTCACTAGTTTGCTGCAAGACAAGGGGTTGGAC 1621
Query 2032 CCTAACTTTGCTGTAATGTTGAAGGaaaaaaaCTTGGATCCTACTATATTGGCACTACTT 2091
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1622 CCTAACTTTGCTGTAATGCTGAAGGAAAAAAACTTGGATCCAACTATATTGGCACTACTT 1681
Query 2092 CAGAGGAGTAGTTTGGATGCAGATAGAGATCACCGCGACAATACTGATATTACAATCATT 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1682 CAGAGGAGTAGTTTGGATGCAGATAGAGATCACCGCGACAACACTGATATTACAATCATT 1741
Query 2152 GACTCAAACAGTGTTGACAATACTTTGCCAAATCAGATTTCTTTATCCGAAGAATTGAGA 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 GACTCAAACAGTGTTGACAATACTTTGCCAAATCAGATTTCTTTATCCGAAGAATTGAGA 1801
Query 2212 CTCCGTGGACTAGAGAAGTGGCTTAAGTTGTCTAGACTTCTTCTGCACCATGTAGCGGGG 2271
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802 CTCCGTGGACTAGAGAAGTGGCTTAAGCTGTCCAGACTTCTTCTGCACCATGTAGCGGGC 1861
Query 2272 ACACCAGAGAGAGCATGGGGCCTCTTTAGTCTTGTCTTTATCCTTGAAACAATCATTGTG 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1862 ACACCAGAGAGAGCATGGGGCCTCTTTAGTCTTGTCTTTATCCTTGAAACAATCATTGTG 1921
Query 2332 GCCATTTTTCGCCCAAAGACCATCACGATTATAAATTCTAGTCATCAACAGTTCGAATTT 2391
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 GCCATTTTTCGCCCGAAGACCATCACGATTATAAATTCTAGTCATCAACAGTTCGAATTT 1981
Query 2392 GGTTTCTCTGTGCTGCTATTGTCACCTGTTGTCTGTTCAATAATGGCTTTTCTTCGGTCT 2451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982 GGTTTCTCTGTGCTGCTATTGTCACCTGTTGTCTGTTCAATAATGGCTTTTCTTCGGTCT 2041
Query 2452 CTTCAAGTTGAGGAAATGGCCTTGACATCAAAATCTCGCAAGTATGGCTTTGTTGCCTGG 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 CTTCAAGTTGAGGAAATGGCCTTGACATCAAAATCTCGCAAGTATGGCTTTGTTGCCTGG 2101
Query 2512 CTTCTGAGCACATCAGTTGGATTGTCACTCTCGTTCTTGAGTAAATCGTCAGTACTTCTG 2571
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102 CTTCTGAGCACTTCAGTTGGATTGTCACTCTCGTTCTTGAGTAAATCGTCAGTACTTCTG 2161
Query 2572 GGAATATCCTTGACTGTGCCCCTCATGGCAGCATGCCTGTCTATTGCTGTTCCCATATGG 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2162 GGAATATCCTTGACTGTGCCCCTCATGGCAGCATGCCTGTCTATTGCTGTTCCCATATGG 2221
Query 2632 ATGCATAATGGGTACCAATTTTGGGTTCCACAGTTATCATGTGGTGACCAGGCAAGAGAT 2691
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2222 ATTCATAATGGGTACCAATTTTGGGTACCACAGTTATCATGTGGTGACCAGGCAAGAGAT 2281
Query 2692 TTACGATCTCCCAGGATAAAGGGGTTTATTCTTTGGATTTGTGTTGTGTTGTTTGCGGGT 2751
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282 TTACGATCTCCCAGGATAAAGGGGTTTATTCTTTGGATTTGTGTTGTGTTGTTTGCGGGA 2341
Query 2752 TCTGTAATTTCTCTTGGTGCGATTATATCTGCTAAACCTTTGGATGATTTAAAGTATAAG 2811
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342 TCTGTAATTGCTCTTGGTGCAATTATATCTGCTAAACCTTTGGATGATTTAAAGTATAAG 2401
Query 2812 CTGTTTAGTGCCAGAGAAAACAACGTCACGTCACCATATACATCTTCTGTATACCTTGGT 2871
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2402 CTGTTTAGTGCCAGAGAAAACAACGTCATGTCACCATATACATCTTCTGTATACCTTGGT 2461
Query 2872 TGGGCAATGTCATCTGGAATTGCTTTAGTAGTTACCGCCATTCTACCAATAGTTTCATGG 2931
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2462 TGGGCAATGGCATCTGGAATTGCTTTAGTAGTTACCGCCATTCTGCCAATAGTTTCATGG 2521
Query 2932 TTTGCAACTTATAGGTTTTCCCACTCTTCTGCTGTCTGTCTCATGATATTCTCAGTTGTT 2991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2522 TTTGCAACTTATAGGTTTTCCCACTCTTCTGCTGTCTGTCTCATGATATTCTCAGTTGTT 2581
Query 2992 CTCGTGGCATTTTGTGGAACTTCATATTTGGAAGTTGTAAAATCTAGAGATGATCAGTTG 3051
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2582 CTCGTGGCATTTTGTGGAACATCATATTTGGAAGTTGTGAAATCTAGAGATGATCAGTTG 2641
Query 3052 CCCACAAAGGGTGATTTCCTTGCGGCCTTGCTTCCACTTGCATGCATTCCGGCGCTGCTT 3111
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2642 CCCACAAAGGGTGATTTCCTTGCGGCCTTGCTTCCACTTGCATGCATTCCGGCGCTACTT 2701
Query 3112 TCACTATGCTGTGGGATGGTTAAATGGAAGGACGATTGTTGGATACTCTCTCGAGGTGTA 3171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2702 TCACTATGCTGTGGGATGGTTAAATGGAAGGACGATTGTTGGATACTATCTCGAGGTGTA 2761
Query 3172 TATGTTTTCT-TTTCAATAGGTCTTCTTCTTCTTTTTGGTGCGATAGCAGCTGTCATTGC 3230
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2762 TATGTTTT-TGTTTCAATAGGTCTTCTTCTTCTTTTTGGTGCAATAGCAGCTGTTATTGC 2820
Query 3231 AGTCAAACCATGGACGATAGGCGTATCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCCTTATGGTGGTAAC 3290
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2821 AGTCAAACCATGGACGATAGGCGTGTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCATTATGGTGGTAGC 2880
Query 3291 AATTGGTGTAATCCATCTTTGGGCGTCAAACAATTTCTATTTAACCAGGAAACAGACATC 3350
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2881 AATTGGTGTAATCTATCTTTGGGCGTCAAACAATTTCTATTTGACCAGGAAACAGACATC 2940
Query 3351 CTTTGTCTGCTTTCTTGCTCTTCTTTTGGGTTTGGCCGCATTCCTTCTCGGATGGCATCA 3410
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2941 CTCTGTCTGCTTTCTTGCCCTTCTTTTGGGTTTGGCCGCATTCCTTGTCGGATGGCATCA 3000
Query 3411 AGATAAAGCATTTGCTGGAGCATCTGTTGGTTACTTTACATTCCTGTCTCTGTTGGCTGG 3470
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 AGATAAACCATTTGCTGGAGCATCTGTTGGTTATTTTACATTCCTGTCTCTGTTGGCTGG 3060
Query 3471 AAGAGCATTAGCTGTTCTTCTATCCCCACCAATTGTAGTATATTCTCCAAGGGTGCTACC 3530
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct 3061 AAGAGCATTAGCTGTTCTTCTATCCCCACCAATTGTGGTATATTCTCCAAGAGTACTACC 3120
Query 3531 AGTATATGTCTACGATGCTCATGCTGATTGCGGAAAGAATGTCAGTGCTGCATTTCTTGT 3590
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3121 AGTATATGTCTACGATGCTCATGCGGATTGTGGAAAGAATGTCAGTGCTGCATTTCTTCT 3180
Query 3591 CCTGTATGGAATTGCTTTGGCAACAGAAGGCTGGGGTGTTGTTGCTAGTCTGATAATTTA 3650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3181 TCTGTATGGAATTGCTTTGGCAACAGAAGGCTGGGGTGTTGTTGCTAGTCTGATAATATA 3240
Query 3651 TCCTCCGTTTGCGGGTGCTGCTGTATCAGCTATCACCCTTGTAGTAGCCTTTGGGTTTGC 3710
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 TCCTCCGTTCGCTGGTGCTGCTGTATCAGCTATCACCCTTGTAGTAGCCTTTGGGTTTGC 3300
Query 3711 TGTTTCTCGCCCATGTTTGACTCTTGAGATGATGGAGGTTGCTGTACGCTTTCTTAGCAA 3770
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3301 TGTTTCTCGCCCGTGTTTGACTCTTGAGATGATGGAGGTTGCTGTACGTTTTCTTAGCAA 3360
Query 3771 GGATACTATAGTGCAAGCTATCTCTCGATCTGCCACGAAAACAAGAAATGCTCTATCCGG 3830
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 GGATACTATAGTGCAAGCTATCTCTCGATCTGCAACGAAAACAAGAAATGCTCTATCCGG 3420
Query 3831 CACGTATTCAGCTCCCCAAAGGTCCGCCAGCTCTGCAGCTCTTCTGGTTGGGGATCCCTC 3890
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3421 CACGTATTCAGCTCCCCAAAGGTCTGCCAGCTCTGCAGCTCTTCTGGTTGGAGACCCCTC 3480
Query 3891 TGCAATGCGTGATAAAGCAGGGAACTTTGTGCTTCCTAGAGATGATGTCATGAAATTAAG 3950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 TGCAATGCGTGATAAAGCAGGGAACTTTGTGCTTCCTAGAGATGATGTCATGAAATTAAG 3540
Query 3951 GGATCGTCTCAGGAACGAAGAAAGAGTTGCTGGATCAATCTTCTACAAAATGCAATGCAG 4010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 GGATCGTCTCAGGAACGAAGAAAGAGTTGCTGGATCAATCTTCTACAAAATGCAATGCAG 3600
Query 4011 GAAAGGATTCCGTCATGAACCACCTACAAATGTAGATTATAGAAGAGACATGTGTGCCCA 4070
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3601 GAAAGGATTCCGTCTTGAACCACCTTCAAATGTAGATTACAGAAGAGACATGTGTGCCCA 3660
Query 4071 TGCAAGAGTTTTGGCACTGGAAGAGGCAATTGATACAGAATGGGTGTATATGTGGGACAA 4130
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3661 TGCAAGAGTTTTGGCGCTGGAAGAGGCAATTGATACAGAATGGGTGTATATGTGGGACAA 3720
Query 4131 ATTTGGTGGTTATTTACTACTATTGTTAGGTTTGACAGCTAAGGCGGAGAGAGTTCAGGA 4190
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3721 GTTTGGTGGTTATTTACTCCTATTGTTAGGTTTGACAGCTAAGGCGGAGATAGTTCAGGA 3780
Query 4191 TGAGGTACGGTTGCGGCTCTTCTTAGATAGCATTGGGTTCTCGGATTTAAGTGCCAGAAA 4250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3781 TGAGGTACGGTTGCGGCTCTTCTTAGATAGCATTGGGTTCTCGGACTTAAGTGCCAGAAA 3840
Query 4251 AATCAGTAAATGGAAGCCAGAGGATAGAAGACAATTCGAAATTATTCaagagagttatct 4310
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3841 AATCAGTAAATGGAAGCCGGAGGATAGAAGACAATTTGAAATTATTCAAGAGAGTTATCT 3900
Query 4311 gagagagaaagagatggaagaggaaagccttatgcagagacgtgaagaagaagggagagg 4370
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3901 GAGAGAGAAAGAGATGGAAGAGGAAACCCTTATGCAGAGACGTGAAGAAGAAGGGAGAGG 3960
Query 4371 taaagaaagaaggaaagctcttttggagaaggaagagCGCAAATGGAAGGAAATTGAAGC 4430
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3961 TAAAGAAAGAAGGAAAGCTCTTTTGGAGAAGGAAGAACGCAAATGGAAGGAAATTGAAGC 4020
Query 4431 GTCCCTTATTCCATCTATTCCTAATGCTGGTAGCAGGGAGGCAGCAGCCATGGCAGCTGC 4490
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4021 TTCCCTTATTCCATCTATTCCTAATGCTGGTAGCAGGGAGGCAGCAGCCATGGCAGCTGC 4080
Query 4491 AATACGTGCTGTTGGGGGTGATTCTGTCCTTGAGGATTCCTTCGCAAGAGAGAGGGTCTC 4550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 4081 AATACGTGCTGTTGGGGGTGATTCTGTCCTTGAGGATTCCTTTGCAAGAGAGAGAGTCTC 4140
Query 4551 GGGTATTGCACGTAGGATACGCACTGCTCAACTAGAACGACGTGCACAACAG 4602
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 4141 GGGTATTGCGCGTAGGATACGCACTGCTCAACTAGACCGACGCGCACAACAG 4192
Score = 4019 bits (2176), Expect = 0.0
Identities = 2264/2308 (98%), Gaps = 0/2308 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4684 CAGACTGGAATATCTGGGGCAGTTTGTGTTCTTGATGATGAACCAATGATAAGTGGTAAA 4743
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4190 CAGACTGGAATATCTGGGGCAGTTTGTGTTCTTGATGATGAACCTATGATAAGTGGTAAA 4249
Query 4744 CATTGCGGCCAAATGGACTCAAGTGTCTGTCAAAGTCAGAAGATTAGCTTTTCCGTTACA 4803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4250 CATTGCGGCCAAATGGACTCAAGTGTCTGTCAAAGTCAGAAGATTAGCTTTTCCGTTACA 4309
Query 4804 GCAATGATCCAATCCGATTCTGGACCTGTATGTCTTTTTGGCACTGAATTTCAAAAGAAA 4863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 GCAATGATCCAATCCGATTCTGGACCTGTATGTCTTTTTGGCACTGAATTTCAAAAGAAA 4369
Query 4864 GTATGTTGGGAGATTCTGGTTGCTGGTTCTGAGCAAGGAATTGAGGCTGGCCAAGTTGGG 4923
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4370 GTCTGTTGGGAGATTCTGGTTGCTGGTTCTGAACAAGGAATTGAGGCTGGCCAAGTTGGG 4429
Query 4924 CTTAGGTTGATAACAAAAGGTGAGAGGCAGACAACCGTTGCTAGAGAGTGGTATATTGGT 4983
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 CTTAGGTTGATAACAAAAGGTGAGAGGCAGACAACCGTGGCTAGAGAGTGGTATATTGGT 4489
Query 4984 GCAACCAGCATAACTGATGGAAGGTGGCATACAGTGACAATCACAATTGATGCTGATGCG 5043
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4490 GCAACCAGCGTAACTGATGGAAGGTGGCATACAGTGACAATCACAATTGATGCTGATGCG 4549
Query 5044 GGGGAAGCTACTTGTTACATAGATGGTGGGTTTGATGGCTACCAGAATGGGTTACCTCTA 5103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 4550 GGGGAAGCTACTTGTTACATAGATGGTGGGTTTGATGGCTATCAGACTGGGTTACCTCTA 4609
Query 5104 AGTATTGGCAGTGCCATTTGGGAACAAGGAGCTGAAGTTTGGTTGGGTGTTAGGCCACCT 5163
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4610 AGTACTGGTAGTGCCATTTGGGAACAAGGAGCTGAAGTTTGGTTGGGTGTTAGGCCACCT 4669
Query 5164 ATAGATGTTGATGCATTCGGGAGATCAGATAGTGATGGCGTCGAATCAAAGATGCATATT 5223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4670 ATAGATGTTGATGCATTCGGGAGATCAGATAGTGATGGAGTCGAGTCAAAGATGCATATT 4729
Query 5224 ATGGATGTTTTCCTTTGGGGGAAATGCTTAAGTGAAGAAGAGGCCGCTTCTTTGCATGCA 5283
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4730 ATGGATGTTTTCCTTTGGGGGAAATGTTTAAGTGAAGACGAGGCCGCTTCTTTGCATGCA 4789
Query 5284 GCCATTGGCATGGCTGACTTAGACATGATTGATTTGTCTGATGACAATTGGCAATGGACG 5343
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4790 GTCATTGGCATGGCTGACTTAGACATGATTGATTTGTCTGATGACAATTGGCAATGGACG 4849
Query 5344 GATTCACCCCCCAGAGTCGATGGTTGGGATAGTGATCCTGCCGATGTTGATCTCTATGAT 5403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4850 GATTCACCCCCCAGAGTCGATGGTTGGGATAGTGATCCTGCCGATGTTGATCTCTATGAT 4909
Query 5404 AGGGATGACGTAGATTGGGATGGACAATATTCCAGTGGGAGGAAAAGAAGATCAGGTCGG 5463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4910 AGGGATGACGTAGATTGGGATGGACAATATTCCAGTGGGAGGAAAAGAAGATCAGGTCGG 4969
Query 5464 GATTTTGTAATGAGTGTCGATTCCTTTGCCAGGAGACACAGGAAACCCAGGATGGAGACA 5523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4970 GATTTTGTAATGAGTGTCGATTCCTTTGCCAGGAGACACAGGAAACCCAGGATGGAGACA 5029
Query 5524 CAAGAAGATATAAATCAAAGAATGCGTTCAGTTGAGTTGGCTGTCAAAGAAGCTCTCTCT 5583
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5030 CAAGAAGATATAAATCAAAGAATGCGTTCAGTTGAGTTGGCTGTCAAAGAAGCTCTATCT 5089
Query 5584 GCACGAGGTGATAAGCAATTTACTGACCAGGAATTTCCTCCAAATGATCGCTCTTTATTT 5643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5090 GCACGAGGTGATAAGCAATTTACTGACCAGGAATTTCCTCCAAATGATCGCTCTTTATTT 5149
Query 5644 GTGGATACACAAAATCCCCCATCAAAATTGCAGGTTGTTTCTGAATGGATGAGACCTGAC 5703
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5150 GTGGATACACAAAATCCCCCTTCAAAATTGCAGGTTGTTTCTGAATGGATGAGACCTGAC 5209
Query 5704 TCCATTGTGAAAGAAAACGGTAGTGATTCCCGTCCCTGCCTGTTCTCTGGGGATGCAAAT 5763
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5210 TCCATTGTGAAAGAGAACGGTAGTGATTCCCGTCCCTGCCTGTTCTCTGGGGAAGCAAAT 5269
Query 5764 CCTTCAGATGTTTGCCAGGGGCGTTTGGGGGATTGTTGGTTCTTAAGCGCCGTTGCAGTT 5823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5270 CCTTCAGATGTTTGCCAGGGGCGTTTGGGGGATTGTTGGTTCTTAAGCGCCGTTGCAGTT 5329
Query 5824 TTGACAGAGGTTTCACGAATATCTGAAGTGATCATTACTCCTGAATACAACGAGGAAGGG 5883
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5330 TTGACAGAAGTATCACGAATATCTGAAGTGATCATTACTCCTGAATACAACGAGGAAGGG 5389
Query 5884 ATCTACACTGTTCGTTTTTGTATTCAGGGTGAGTGGGTTCCTGTTGTTATCGATGACTGG 5943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5390 ATCTACACTGTTCGTTTTTGTATTCAGGGTGAGTGGGTTCCTGTTGTGATCGATGACTGG 5449
Query 5944 ATTCCATGTGAATCACCTGGTAAACCAGCTTTTGCTACTAGCAGAAAGCTCAATGAACTC 6003
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5450 ATTCCATGTGAATCGCCTGGTAAACCAGCTTTTGCTACTAGCAAAAAGCTCAATGAACTC 5509
Query 6004 TGGGTCTCCATGGTGGAGAAAGCATATGCCAAGCTCCATGGTTCTTATGAGGCACTGGAG 6063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5510 TGGGTCTCCATGGTGGAGAAAGCATATGCCAAGCTCCATGGTTCTTATGAGGCACTGGAG 5569
Query 6064 GGGGGACTGGTTCAGGATGCTCTTGTCGACCTAACTGGAGGAGCTGGTGAGGAGATTGAC 6123
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5570 GGGGGACTGGTTCAGGATGCACTTGTTGACCTAACTGGAGGAGCTGGTGAGGAGATTGAC 5629
Query 6124 TTGCGGAGTGCTCAAGCACAAATAGATCTTGCAAGTGGCAGATTGTGGTCTCAATTGTTA 6183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5630 TTGCGGAGTGCTCAAGCACAAATAGATCTTGCAAGTGGCAGATTATGGTCTCAATTGTTA 5689
Query 6184 CGTTTTAAACAAGAGGGGTTCTTACTTGGTGCTGGAAGTCCATCAGGATCTGATGTTCAT 6243
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5690 CGCTTTAAACAAGAGGGGTTCTTACTTGGAGCTGGAAGTCCATCAGGATCTGATGTTCAT 5749
Query 6244 GTATCTTCCAGTGGCATTGTGCAAGGGCATGCTTACTCCGTCTTACAGGTGAGAGAGGTT 6303
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5750 GTATCTTCCAGTGGCATTGTGCAAGGGCATGCTTACTCCGTCTTACAGGTGAGAGAGGTC 5809
Query 6304 GATGGGCACAGACTTGTTCAGATTCGAAATCCATGGGCTAATGAAGTTGAGTGGAATGGT 6363
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5810 GATGGGCACAGACTTGTTCAGATCCGGAATCCATGGGCTAATGAAGTTGAGTGGAATGGT 5869
Query 6364 CCCTGGTCAGACTCATCCCCAGAGTGGACTGATAGGATGAAGCACAAGCTGAAGCATGTT 6423
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5870 CCATGGTCAGACTCATCCCCAGAGTGGACTGATAGGATGAAGCACAAGCTGAAGCATGTT 5929
Query 6424 CCACAGTCAAAAGAAGGTATATTCTGGATGTCTTGGCAAGATTTCCAGATTCATTTCAGA 6483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5930 CCACAGTCAAAAGAAGGTATATTCTGGATGTCTTGGCAAGATTTCCAGATTCATTTCAGA 5989
Query 6484 TCAATATATGTGTGTCGGGTTTACCCCCGTGAGATGCGCTACTCTGTAAATGGCCAATGG 6543
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5990 TCAATATATGTTTGTCGGGTTTACCCCCGTGAGATGCGCTACTCTGTACATGGCCAATGG 6049
Query 6544 CGAGGTTATAGTGCCGGTGGCTGCCAAGATTATAGCTCATGGCATCAAAATCCACAATTC 6603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6050 CGAGGTTATAGTGCCGGTGGCTGCCAAGATTATAGCTCATGGCATCAAAATCCACAATTC 6109
Query 6604 AGGCTGAGGGCAACTGGTTCTGATGCATCTTTACCAATTCATGTGTTCATCACCTTAACT 6663
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6110 AGGCTGAGGGCAACTGGTTCTGATGCATCTTTGCCAATTCATGTGTTCATCACCTTAACT 6169
Query 6664 CAGGGCGTAGGTTTCTCGAGAACAACTCCTGGATTTCGTAACTACCAATCAAGCCATGAT 6723
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6170 CAGGGCGTAGGTTTCTCAAGAACAACTCCTGGATTTCGTAACTACCAATCAAGCCATGAT 6229
Query 6724 TCACAGTTGTTCTATATCGGATTGAGGATTCTTAAAACTCGTGGACGTCGTGCTGCTTAC 6783
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6230 TCACAGTTGTTCTATATCGGAATGAGGATTCTTAAAACTCGTGGACGTCGTGCTGCTTAT 6289
Query 6784 AACATATTTCTTCATGAATCTGTTGGTGGAACAGACTATGTGAATTCCCGTGAGATTTCA 6843
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 6290 AACATATTTCTTCATGAATCTGTTGGTGGAACAGACTATGTGAATTCCCGGGAGATATCA 6349
Query 6844 TGTGAAATGGTTCTTGACCCTGATCCTAAGGGTTATACTATTGTCCCAACCACGATACAC 6903
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 6350 TGCGAAATGGTTCTTGACCCTGATCCTAAGGGTTATACTATTGTCCCAACCACTATACAC 6409
Query 6904 CCAGGGGAAGAAGCACCTTTTGTCCTTTCAGTCTTCACAAAAGCATCCATTGTTCTTGAA 6963
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6410 CCTGGGGAAGAAGCACCTTTTGTCCTTTCAGTCTTCACAAAAGCATCCATTGTTCTTGAA 6469
Query 6964 GCTTTGTAGTGCCCGTATTGTCAGATGG 6991
|||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6470 GCTTTGTAGTGCCCGTATAGTCAGATGG 6497
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 277097189013
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5