BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G56070.1 Length=2958 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg924144 jgi|Araly1|924144|scaffold_105425.1 4242 0.0 Ahg318060 jgi|Araly1|318060|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001076 1640 0.0 Ahg359025 jgi|Araly1|359025|fgenesh1_pg.C_scaffold_9000065 361 2e-98 > Ahg924144 jgi|Araly1|924144|scaffold_105425.1 Length=2607 Score = 4242 bits (2297), Expect = 0.0 Identities = 2501/2600 (96%), Gaps = 12/2600 (0%) Strand=Plus/Plus Query 63 atctttctctctAAGAGATTTTGTAGGTGACAATCAAAAGTTTGACAAAATGGTGAAGTT 122 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 ATCTTTCTCTCT---AGATTTTGTAGGTGACAATCAAAAGTTTGACAAAATGGTGAAGTT 66 Query 123 TACAGCTGATGAGCTTCGAAGGATTATGGACTACAAACACAACATCCGTAATATGTCTGT 182 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 67 TACAGCTGATGAGCTTCGAAGGATTATGGACTACAAACACAACATCCGTAATATGTCCGT 126 Query 183 TATTGCTCATGTCGACCACGGGAAATCCACTCTTACTGATTCTTTGGTTGCTGCTGCTGG 242 |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || Sbjct 127 TATTGCCCATGTTGACCACGGGAAATCCACTCTCACTGATTCCTTGGTTGCTGCTGCGGG 186 Query 243 TATCATTGCCCAAGAGGTTGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATACCAGAGCTGATGAGGC 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 187 TATCATTGCCCAAGAGGTTGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATACCAGAGCTGATGAGGC 246 Query 303 TGAACGTGGTATCACTATCAAGTCCACTGGTATTTCTCTCTACTACGAGATGACTGATGA 362 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 247 TGAACGTGGTATTACTATCAAGTCCACTGGTATTTCTCTCTACTACGAGATGACGGATGC 306 Query 363 ATCCTTGAAGAGTTTCACTGGAGCCAGAGACGGAAACGAGTACCTCATCAATCTTATTGA 422 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || Sbjct 307 GTCCTTGAAGAGTTTCACTGGAGCCAGAGATGGCAACGAATACCTTATCAACCTTATCGA 366 Query 423 TTCACCTGGGCACGTTGACTTTTCTTCTGAGGTTACTGCTGCTCTCCGTATTACTGATGG 482 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 TTCTCCTGGGCACGTTGACTTTTCTTCTGAGGTTACTGCTGCTCTCCGTATTACTGATGG 426 Query 483 TGCTCTTGTGGTGGTCGACTGCATTGAGGGTGTGTGTGTTCAGACTGAGACTGTTCTACG 542 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 427 TGCTCTTGTGGTGGTCGACTGTATTGAGGGTGTGTGTGTTCAGACTGAGACTGTTCTACG 486 Query 543 TCAGGCTCTTGGTGAGAGGATTCGACCTGTCTTGACTGTCAACAAGATGGACAGGTGTTT 602 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 487 TCAGGCTCTTGGTGAGAGGATTCGACCTGTCTTGACTGTTAACAAGATGGACAGGTGTTT 546 Query 603 CCTTGAGCTTCAGGTTGATGGTGAGGAGGCTTACCAGACTTTCTCGAGGGTTATTGAGAA 662 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 547 CCTTGAGCTTCAGGTTGATGGTGAGGAGGCTTACCAGACTTTCTCCAGGGTCATTGAGAA 606 Query 663 CGCTAATGTCATCATGGCTACATACGAGGATCCTCTCCTTGGTGATGTTCAGGTTTACCC 722 || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 607 TGCCAACGTTATCATGGCTACCTATGAGGATCCTCTCCTTGGTGATGTTCAGGTATACCC 666 Query 723 AGAGAAGGGAACTGTGGCGTTTTCTGCTGGTCTCCATGGATGGGCGTTTACACTGACCAA 782 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 667 AGAGAAGGGAACTGTGGCGTTTTCTGCTGGTCTCCACGGTTGGGCGTTTACACTGACCAA 726 Query 783 CTTCGCCAAGATGTATGCTTCCAAGTTCGGTGTTGTTGAATCTAAGATGATGGAGAGGCT 842 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 727 CTTTGCCAAGATGTATGCTTCCAAGTTCGGTGTCGATGAAACTAAGATGATGGAGAGGCT 786 Query 843 CTGGGGTGAGAATTTCTTTGACCCTGCCACCAGGAAGTGGAGTGGCAAAAACACTGGTTC 902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 787 CTGGGGTGAGAATTTCTTTGACCCTGCCACCAGGAAATGGAGTGGCAAAAACACTGGTTC 846 Query 903 CCCGACCTGCAAGCGTGGGTTTGTTCAGTTCTGCTATGAACCCATCAAGCAAATTATTGC 962 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 847 CCCGACCTGCAAGCGTGGGTTTGTCCAGTTCTGCTATGAACCCATCAAGCAAATCATCGC 906 Query 963 TACTTGCATGAATGACCAGAAGGATAAGTTGTGGCCTATGTTGGC-GAAGCTTGGTGTCT 1021 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct 907 TACTTGCATGAATGACCAGAAGGACAAGTTGTGGCCCATGTT-GCAGAAGCTTGGTGTCA 965 Query 1022 CAATGAAGAATGATGAGAAGGAGCTTATGGGTAAACCTCTAATGAAGCGTGTTATGCAGA 1081 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 966 CAATGAAGAATGATGAGAAAGAGCTTATGGGTAAACCTCTAATGAAGCGTGTTATGCAGA 1025 Query 1082 CTTGGCTCCCTGCAAGTACTGCACTACTTGAGATGATGATCTTTCATTTGCCATCTCCCC 1141 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1026 CTTGGCTCCCTGCAAGTACTGCACTACTTGAGATGATGATCTATCATTTGCCATCTCCCC 1085 Query 1142 ACACTGCCCAGAGGTACCGTGTTGAGAATCTGTATGAAGGTCCTCTTGATGATCAGTATG 1201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1086 ACACTGCCCAGAGGTACCGTGTTGAGAATCTGTATGAAGGTCCTCTTGATGATCAGTATG 1145 Query 1202 CAAATGCCATCAGGAACTGTGACCCCAATGGACCTCTCATGCTCTACGTATCCAAGATGA 1261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1146 CAAATGCCATCAGGAACTGTGACCCCAATGGACCTCTCATGCTCTACGTATCTAAGATGA 1205 Query 1262 TTCCAGCCTCTGACAAGGGTAGATTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTTTGCTGGTAAGGTTT 1321 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1206 TTCCAGCCTCTGACAAGGGTAGGTTCTTTGCCTTTGGTCGTGTCTTTGCTGGTAAGGTTT 1265 Query 1322 CTACTGGTATGAAGGTCAGAATCATGGGTCCCAACTATATCCCTGGTGAGAAGAAGGATC 1381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1266 CTACTGGTATGAAGGTCAGAATCATGGGTCCCAACTATGTCCCTGGTGAGAAGAAGGATC 1325 Query 1382 TGTACACTAAGAGTGTTCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAGGCAAGAGACAGTGG 1441 |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1326 TGTATACTAAGAGTGTTCAGAGGACTGTTATTTGGATGGGTAAGAGGCAAGAGACGGTGG 1385 Query 1442 AGGATGTCCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCATCACCAAGA 1501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1386 AGGATGTCCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCATCACCAAGA 1445 Query 1502 ATGCTACATTGACTAATGAGAAGGAAGTTGATGCTCACCCCATTCGTGCTATGAAGTTTT 1561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1446 ATGCTACATTGACTAATGAGAAGGAAGTTGATGCTCACCCCATTCGTGCCATGAAGTTTT 1505 Query 1562 CTGTGTCTCCTGTTGTTCGTGTTGCTGTTCAGTGTAAGGTTGCGTCTGACCTTCCCAAGT 1621 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1506 CTGTGTCTCCTGTTGTTCGTGTTGCTGTTCAGTGTAAGGTTGCATCTGACCTTCCCAAGC 1565 Query 1622 TGGTTGAGGGTCTCAAGAGGTTGGCCAAGTCTGATCCTATGGTTGTGTGTACAATGGAGG 1681 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 1566 TGGTTGAGGGTCTCAAGAGGCTGGCCAAGTCTGATCCTATGGTTGTGTGCACAATGGAAG 1625 Query 1682 AATCAGGTGAGCACATTGTTGCTGGTGCAGGAGAACTCCATCTTGAGATTTGTCTTAAGG 1741 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1626 AATCAGGTGAGCACATTGTTGCTGGTGCAGGAGAGCTCCATCTTGAGATTTGTCTGAAGG 1685 Query 1742 ATCTTCAGGATGATTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATCAAGTCAGACCCTGTGGTCTCCT 1801 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1686 ATCTGCAGGATGATTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATCAAGTCAGACCCTGTGGTCTCCT 1745 Query 1802 TCCGTGAGACAGTTTGTGATAGATCTACTCGCACAGTTATGAGTAAGTCTCCTAACAAGC 1861 |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1746 TCCGTGAGACAGTTAGTGATAGGTCTATTCGCACTGTTATGAGTAAGTCTCCTAACAAGC 1805 Query 1862 ATAACCGTCTGTACATGGAAGCAAGACCCATGGAGGAAGGTCTAGCTGAGGCTATTGATG 1921 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| Sbjct 1806 ATAACCGTCTCTACATGGAAGCAAGACCCATGGAAGATGGTCTAGCTGAGGCGATTGATG 1865 Query 1922 ATGGACGTATTGGCCCAAGGGATGACCCTAAGATCAGATCCAAGATCTTGGCTGAGGAGT 1981 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1866 ATGGACGTATTGGCCCAAGGGATGACCCTAAGATCAGGTCCAAGATCTTGGCTGAGGAGT 1925 Query 1982 TTGGATGGGACAAGGATCTTGCAAAGAAGATCTGGGCTTTTGGACCTGAAACCACAGGGC 2041 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1926 TTGGATGGGACAAGGATCTTGCAAAGAAGATCTGGGCTTTTGGACCTGAAACCACAGGGC 1985 Query 2042 CTAACATGGTTGTCGATATGTGTAAGGGAGTTCAGTACCTTAACGAAATCAAGGATTCAG 2101 ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 1986 CTAACATGGTTGTTGATATGTGTAAAGGAGTTCAGTACCTTAATGAAATCAAGGACTCAG 2045 Query 2102 TTGTTGCTGGTTTCCAGTGGGCGTCCAAGGAAGGTCCTCT-TGCTGAAGAGAACATGAGA 2160 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 2046 TGGTGGCTGGTTTCCAGTGGGCGTCCAAGGAAGGTCCTCTATG-TGAAGAGAACATGAGA 2104 Query 2161 GGTATCTGTTTTGAGGTATGTGATGTGGTGCTTCACTCTGATGCCATCCACAGAGGAGGT 2220 || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2105 GGCATCTGTTTCGAGGTTTGTGATGTGGTGCTTCACTCTGATGCCATCCACAGAGGAGGT 2164 Query 2221 GGTCAGGTTATCCCCACAGCCAGAAGGGTCATATACGCTTCCCAGATCACAGCTAAGCCC 2280 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2165 GGTCAGGTTATCCCAACAGCCAGAAGGGTCATATACGCTGCCCAGATCACAGCTAAGCCC 2224 Query 2281 AGACTTTTGGAGCCGGTTTACATGGTTGAGATCCAGGCACCAGAGGGAGCTCTTGGAGGA 2340 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2225 AGGCTTTTGGAGCCAGTTTACATGGTTGAGATCCAGGCACCAGAGGGAGCTCTTGGAGGA 2284 Query 2341 ATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACACGTGTTCGAGGAGATGCAGAGGCCAGGA 2400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2285 ATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACACGTCTTCGAGGAGATGCAGAGGCCAGGA 2344 Query 2401 ACTCC-CTTGTACAACATCAAGGCATACCTGCCTGTTGTGGAGTCTTTCGGATTCTCAAG 2459 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2345 ACTCCGCT-GTACAACATCAAGGCATACCTGCCTGTTGTGGAGTCTTTCGGATTCTCGAG 2403 Query 2460 TCAGCTTAGGGCAGCAACCTCAGGACAGGCATTCCCACAGTGTGTGTTTGATCATTGGGA 2519 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2404 TCAGCTTAGGGCAGCAACCTCAGGACAGGCTTTCCCACAGTGTGTGTTTGATCATTGGGA 2463 Query 2520 AATGATGTCTTCTGACCCTCTTGAGCCAGGTACTCAGGCTTCAGTTTTGGTGGCTGATAT 2579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2464 AATGATGTCTTCTGACCCTCTTGAGCCAGGTACTCAGGCTTCAGTTCTGGTGGCTGATAT 2523 Query 2580 CAGGAAGAGGAAGGGATTGAAGGAAGC-GATGACTCCACTATCTGAGTTCGAAGACAAGC 2638 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 2524 CAGGAAGAGGAAGGGATTGAAGGAA-CAGATGACTCCACTATCTGATTTTGAAGACAAGC 2582 Query 2639 TTTAAGCTT-CACCAAGACT 2657 ||||||||| |||||||||| Sbjct 2583 TTTAAGCTTTCACCAAGACT 2602 > Ahg318060 jgi|Araly1|318060|fgenesh1_pm.C_scaffold_3001076 Length=2499 Score = 1640 bits (888), Expect = 0.0 Identities = 1438/1699 (85%), Gaps = 55/1699 (3%) Strand=Plus/Plus Query 964 ACTTGCATGAATGACCAGAAGGATAAGTTGTGGCCTATGTTGGCGAAGCTTGGTGTCTCA 1023 ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||| Sbjct 823 ACTTGTATGAATGACCAGAAGGATAAGCTGTGGCCGATGTTGGAGAAGCTTGGTAT-TCA 881 Query 1024 -ATGAAGAATGATGAGAAGGAGCTT-ATGGGTAAACCTCTAATGAAGCGTGTTATGCAGA 1081 |||||| |||||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| Sbjct 882 GATGAAGCCCGATGAGAAAGAG-TTGATGGGTAAACCTTTGATGAAGCGTGTCATGCAGG 940 Query 1082 CTTGGCTCCCTGCAAGTACTGCACTACTTGAGATGATGATCTTTCATTTGCCATCTCCCC 1141 | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| Sbjct 941 CATGGCTCCCTGCGAGTACTGCTCTGCTTGAAATGATGATATTTCACTTACCATCACCCT 1000 Query 1142 ACACTGCCCAGAGGTACCGTGTTGAGAATC-TGTATGAAGGTCCTCTTGATGATCAGTAT 1200 ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 1001 ACACTGCGCAGAGGTACCGTGTTGAGAA-CTTGTATGAAGGTCCCCTTGATGATAAGTAT 1059 Query 1201 GC-AAATGCCATCAGGAACTGTGACCCCA-ATGGACCTCTCATGCTCTACGTATCCAAGA 1258 || | || ||||| |||||||| ||| | || ||| | ||||||||||| || |||| Sbjct 1060 GCTGCA-GCTATCAGAAACTGTGA-TCCAGAAGGTCCTTTGATGCTCTACGTCTCTAAGA 1117 Query 1259 TGATTCCAGCCTCTGACAAGGGTAGATTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTTTGCTGGTA-AG 1317 ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | Sbjct 1118 TGATTCCTGCATCTGACAAGGGTAGGTTCTTTGCCTTGGGTCGTGTCTTTTCTGGTACA- 1176 Query 1318 GTTTCTACTGGTATGAAGGTCAGAATCATGGGTCCCAACTATATCCCTGGTGAGAAGAAG 1377 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct 1177 GTTTCTACTGGTATGAAAGTCAGGATCATGGGTCCCAACTATGTCCCTGGTGAAAAGAAA 1236 Query 1378 GATCTGTACACT-AAGAGTGTTCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAGGCAAGAGAC 1436 |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1237 GATCTGTA-TGTCAAGAGTGTGCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAGCAAGAGAC 1295 Query 1437 AGTGGAGGATGTCCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCATCAC 1496 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1296 AGTGGAGGATGTTCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTAGATCAGTTCATCAC 1355 Query 1497 CAAGAATGCTACATTGACTAATGAGAAGGAAGTTGATGCTCACCC-CATTCGTGCTATGA 1555 |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||||||| |||| Sbjct 1356 CAAGAACGCTACCTTGACGAATGAGAAGGAAGTGGACGCACACCCGC-TTCGTGCCATGA 1414 Query 1556 AGTTTTCTGTGTCTCCTGTTGTTCGTGTTGCTGTTCAGTGTAAGGTTGCGTCTGACCTTC 1615 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||| Sbjct 1415 AGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGTTCGTGTTGCTGTAAAATGCAAGCTAGCGTCTGACCTTC 1474 Query 1616 CCAAG-TTGGTTGAGGGTCTCAAGAGGTTGGCCAAGTCTGATCCTATGGTTGTGTGTACA 1674 ||||| || || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| Sbjct 1475 CCAAGCTT-GTAGAAGGTCTTAAGAGGCTGGCCAAGTCTGACCCTATGGTTTTATGCACA 1533 Query 1675 ATGGAGGAATCAGGTGAGCACATTGTTGCTGGTGCAGGAGAACTCCATC-TTGAGATTTG 1733 ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||| Sbjct 1534 ATGGAAGAGTCTGGTGAGCACATTGGTGCAGGTGCTGGAGAACTCCA-CATTGAAATTTG 1592 Query 1734 TCTTAAGGATCTTCAGGATGATTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATCA-AGTCAGACCCTG 1792 | | ||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || || | |||||| |||| Sbjct 1593 TGTCAAGGATCTTCA--A-GATTTTATGGGTGGTGCGGAGATCAT-AGTGTCAGATCCTG 1648 Query 1793 TGGTCTCCTTCCGTGAGACAGT-TTGTGATAGATC-TACTCGCACAGTTATGAGTAAGTC 1850 | || || || || |||||||| || ||| || || | | ||||| || ||||||||||| Sbjct 1649 TTGTTTCGTTGCGAGAGACAGTCTT-TGAGAGGTCTTGC-CGCACTGTGATGAGTAAGTC 1706 Query 1851 TCCTAACAAGCATAACCGTCTGTACATGGAAGCAAGACCCATGGAGGAAGGTCTAGCTGA 1910 || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || Sbjct 1707 CCCAAACAAGCACAACCGTCTTTACATGGAAGCCAGACCAATGGAGGATGGTCTAGCAGA 1766 Query 1911 GGCTATTGATGATGGACGTATTGGCCCAAGGGATGA-CCCTAAGATCAGATCCAAGAT-C 1968 ||||||| |||| || || || || ||| ||||| ||| |||||| |||||||||| | Sbjct 1767 GGCTATTAATGAAGGTCGCATCGGTCCATCTGATGATCCC-AAGATCCGATCCAAGATCC 1825 Query 1969 TTGGCTGAGGAGTTTGGATGGGACAAGGATCTTGCAAAGAAGATCTGGGCTTTTGGACCT 2028 || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| Sbjct 1826 TT-GCAGAAGAGTTTGGATGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAAATATGGGCATTTGGACCT 1884 Query 2029 GAAACCACAGGGCCTAACATGGTTGTCGATATGTGTAAGGGAGTTCAGTACCTT-AACGA 2087 || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| || || Sbjct 1885 GACACCACAGGGCCCAACATGGTGGTTGATATGTGTAAGGGAGTGCAGTA-CTTGAATGA 1943 Query 2088 AATCAAGGATTCAGTTGTTGCTGGTTTCCAGTGGGCGTCCAAGGAAGGTCCTCTT-GCTG 2146 ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || || | Sbjct 1944 AATCAAGGACTCAGTGGTTGCTGGTTTCCAATGGGCTTCAAAGGAAGGCCCT-TTAGCAG 2002 Query 2147 AAGAGAACATGAGAGGTATCTGTTTTGAGGTATGTGATGTGGTGCTTCACT-CTGATGCC 2205 |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| || | |||||| Sbjct 2003 AAGAAAACATGAGAGGGGTCTGTTATGAGGTGTGTGATGTTGTGCTCCA-TGTTGATGCA 2061 Query 2206 ATCCACAGAGGAGGTGGTCAGGTTATCCCCACAGCCAGAAGGGTCATATACGCTTCCCAG 2265 ||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||| | ||| || || || ||| Sbjct 2062 ATCCACAGAGGAGGTGGTCAGATGATTTCAACAGCAAGAAGAGCCATCTATGCATCACAG 2121 Query 2266 ATCACAGCTAAGCCCAGACTT-TTGGAGCCGGTTTACATGGTTGAGATCCAGGCACCAGA 2324 |||| || ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || Sbjct 2122 CTCACGGCCAAGCCAAGACTTCTT-GAGCCGGTTTACATGGTCGAGATACAAGCACCTGA 2180 Query 2325 GGGAGCTCTT-GGAGGAATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACACGTGTTCGAGG 2383 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | Sbjct 2181 GGGAGCT-TTGGGAGGAATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACATGTGTTTGAAG 2239 Query 2384 AGATGCAGAGGCCAGGAACTCC-CTTGTACAACATCAAGGCATACCTGCCTGTTGTGGAG 2442 | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| Sbjct 2240 AAATGCAAAGGCCAGGAACACCTCTC-TACAACATCAAAGCCTACCTTCCTGTGGTCGAG 2298 Query 2443 TC-TTTCGGATT-CTCAAGTCAGCTTAGGGCAGCAACCTCAGGACAGGCATTCCCACAGT 2500 || ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||| Sbjct 2299 TCGTTTA--ATTTCTCAGGTCAGCTAAGGGCTGCAACCTCAGGACAAGCCTTTCCTCAGT 2356 Query 2501 GTGTGTTTGATCATTGGGAAATGATGTCTTCTGACCCTCTTGAGCCAGG-TACTCAGGCT 2559 |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||| | || | | |||||| Sbjct 2357 GTGTGTTTGACCATTGGGACATGATGTCTTCTGATCCGCTGGAGGCTGGCT-CACAGGCT 2415 Query 2560 TC-AGTTTTGGTGGCTGATATCAGGAAGAGGAAGGGATTGAAGGAAGC-GATGACTCCAC 2617 | | || ||| ||||||||||||||||| || || |||||| | | ||||||||||| Sbjct 2416 GCTACATT-GGTAGCTGATATCAGGAAGAGAAAAGGTTTGAAGCTA-CAGATGACTCCAC 2473 Query 2618 TATCTGAGTTCGAAGACAA 2636 | ||||| ||||||||||| Sbjct 2474 TCTCTGATTTCGAAGACAA 2492 Score = 887 bits (480), Expect = 0.0 Identities = 712/822 (87%), Gaps = 24/822 (3%) Strand=Plus/Plus Query 112 ATGGTGAAGTTTACAGCTGATGAGCTTC-GAAGGATTATGGACTAC--AAACACAACATC 168 ||||||||||| |||| ||| |||| | ||| |||||||| | | |||||||||||| Sbjct 1 ATGGTGAAGTTCACAGTTGAAGAGCAACGGAA-AATTATGGA-T-CGTAAACACAACATC 57 Query 169 CGTAATATGTCTGTTATTGCTCATGTCGACCACGGGAAATCCACTCTTACTGATTC-TTT 227 ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || Sbjct 58 CGTAACATGTCTGTTATTGCCCATGTCGATCATGGGAAATCTACTCTTACGGATTCACTT 117 Query 228 GGTTGCTGCTGCTGGTATCATTGCCCAAGAGGT-TGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATA 286 ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 118 -GTTGCTGCTGCTGGTATTATTGCACAAGA-ATCTGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATA 175 Query 287 C-CAGAGCTGATGAGGCTGAACGTGGTATCACTATCAAGTCCACTGGTATTTCTCTCTAC 345 | | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 176 CGC-GAGCTGATGAAGCAGAACGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGGTATCTCTCTCTAC 234 Query 346 TACGAGATGACTGATGAATCCTTGAAGAGTTTCACTGGAGCCAGAGACGGAAACGAGTAC 405 || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| Sbjct 235 TATGAGATGACTGATGAGTCTTTGAAGAGTTTCACTGGAGCTAGAGATGGCAATGAGTAC 294 Query 406 CTCATCAATCTTATTGATTCACCTGGGCACGTTGACTTTTCTTCTGAGGTTACTGCTGCT 465 || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| Sbjct 295 CTGATCAACCTCATTGACTCTCCTGGACACGTTGACTTTTCATCAGAAGTCACTGCTGCT 354 Query 466 CTCCGTATTACTGATGGTGCTCTTGTGGTGGTCGACTGCATTGAGGGTGTGTGTGTTCAG 525 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| Sbjct 355 CTCCGTATTACTGATGGTGCTCTTGTGGTTGTTGACTGCATTGAAGGCGTTTGTGTGCAG 414 Query 526 ACTGAGACTGTTCT-ACGTCAGGCTCTTGGTGAGAGGATTCGACCTGTCTTGACTGTCAA 584 || |||||||| || | | || |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| Sbjct 415 ACCGAGACTGTGCTCAGG-CAATCTCTTGGTGAAAGGATAAGGCCTGTTTTGACTGTCAA 473 Query 585 CAAGATGGACAGGTGTTTCCTTGAGCTTCAGGTTGATGGTGAGGAGGCTTACCAGACTTT 644 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| Sbjct 474 CAAAATGGACAGGTGTTTCCTTGAGCTTAAGGTTGATGGTGAAGAGGCTTATCAGAATTT 533 Query 645 CTC-GAGGGTTATTGAGAACGCTAATGTCATCATGGCTACATACGAGGATCCTCTCCTTG 703 | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| Sbjct 534 C-CAGAGGGTCATTGAGAATGCTAATGTCATCATGGCGACGTATGAGGATCCTCTCCTTG 592 Query 704 GTGATGTTCAGGTTTACCCAGAGAAGGGAACTGTGGCGTTT-TCTGCTGGTCTCCATGGA 762 ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||| Sbjct 593 GTGATGTTCAGGTTTACCCTGAAAAGGGGACAGTGGC-TTTCTCTGCTGGTCTCCACGGA 651 Query 763 TGGGCGTTT-ACACTGACCAACTTCGCCAAGATGTATGCTTCCAAGTTCGGTGTTGT-TG 820 ||||| ||| || || ||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||| | || Sbjct 652 TGGGC-TTTCACTCTTACCAATTTTGCTAAGATGCATGCTTCCAAGTTTGGTGTT-TCTG 709 Query 821 AATCTAAGATGATGGAGAGGCTCTGGGGTGAGAATTTCTTTGACCCTGCCACCAGGAAGT 880 ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | Sbjct 710 AATCTAAAATGATGGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGATCCTGCAACCAGAAAAT 769 Query 881 GGAGTGGC-AAAAACACTGGTTCCCCGACCTGCAAGCGTGGG 921 ||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 770 GGAC-GACCAAAAACACTGGCTCCGCGACCTGCAAGCGTGGG 810 > Ahg359025 jgi|Araly1|359025|fgenesh1_pg.C_scaffold_9000065 Length=1179 Score = 361 bits (195), Expect = 2e-98 Identities = 286/330 (87%), Gaps = 6/330 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1278 GGGTAGATTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTT-TGCTGGTAAGGTTTCTACTGGTATGAAGG 1336 ||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| | Sbjct 567 GGGCAGGTTCTTTGCCTTTGGTCGTGTCTTCT-CTGGAAAGGTGGCTACTGGTATGAAAG 625 Query 1337 TCAGAATCATGGGTCCCAACTATATCCCTGGTGAGAAGAAGGATCTGTACA-CT-AAGAG 1394 |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || | | ||||| Sbjct 626 TCAGGATCATGGGTCCCAACTTTGTCCCTGGTGAGAAGAAGGAT-T-TATATGTCAAGAG 683 Query 1395 TGTTCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAGGCAAGAGACAGTGGAGGATGTCCCTTG 1454 ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || Sbjct 684 TGTGCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAACATGAGACAGTGGAAGATGTTCCGTG 743 Query 1455 TGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCATCACCAAGAATGCTACATTGAC 1514 |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 744 TGGTAATACAGTTGCTATGGTTGGGCTAGACCAGTTCATCACCAAGAATGCTACCTTGAC 803 Query 1515 TAATGAGAAGGAAGTTGATGCTCACCCCATTCGTGCTATGAAGTTTTCTGTGTCTCCTGT 1574 ||||| |||||||| | || ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||| Sbjct 804 GAATGAAAAGGAAGTCAAAGCCCACCCGATCCGTGCCATGAGGTTTTCTGTCTCTCCTGT 863 Query 1575 TGTTCGTGTTGCTGTTCAGTGTAAGGTTGC 1604 ||| || |||||||||||||| |||||||| Sbjct 864 TGTCCGAGTTGCTGTTCAGTGCAAGGTTGC 893 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 111680598340 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5