BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G77460.1
Length=7084
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg476910 jgi|Araly1|476910|fgenesh2_kg.2__2040__AT1G77460.1 1.153e+04 0.0
> Ahg476910 jgi|Araly1|476910|fgenesh2_kg.2__2040__AT1G77460.1
Length=7066
Score = 1.153e+04 bits (6245), Expect = 0.0
Identities = 6829/7105 (96%), Gaps = 63/7105 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TATTGTTGTTCTCCAATTGATCCAACGAAACTACGAAATCCATTCTTTG----TTTTAtt 58
||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1 TATTGCTATTCTCCAATTGATCCAACGAAACTA-GGAATCCATTCTTTGTTTTTTTTTTT 59
Query 59 tttttA---GCCCTAGGATTCTGTGATCCAATCTCTGTTTTCTTCTTCGCTGATTCTGG- 114
|||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||
Sbjct 60 TTTTTATTTGCCCTAGGATTCTGTGATCC-A----TG--------GTCGCTGATTCTGGA 106
Query 115 AAGGTTCTTTTGCTTC-TTTGAATTTCTAGAAGCGGAACTTTGAAGGTTAAGTGTTACTT 173
|||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 107 AAGG-TCTGTTGCTTCTTTTGAATTTCCAGAAGCGGAACTTTGCAGGTTAGGTGTTACTT 165
Query 174 TGACCGGACAGATGGATTCTGACTCGGAACTTTATAT-CCCGGCGCCGTTTGGAGATTTT 232
||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 166 TGAGCGGAGAGATGGATTCTGTCTCGGAACTTT-TATCCCCGGCGCCGTTTGGTGATTTT 224
Query 233 ACGGTGATGCGGATTTTGAGTTAGAAGCGACGCGGA--GA--GATTTCATAGGTTTCTTC 288
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||
Sbjct 225 ACGGTGATGCGGATTTTGAGTTAGAAGCGAGGCGGAGTGACTGATTTCGTAGCTTTCTTC 284
Query 289 TGCACCACATTCCAC---GAG-G-AAACCAGAGGCTGAAGCTAAAAGC-GATGTTGAAGG 342
|||| | | |||||| | | | || | | | | | | | | || |||||||||||
Sbjct 285 TGCA-C-C-TTCCACTAGGTGTGTAATCTAAAAG-AG-TG-TTTATGCAGATGTTGAAGG 338
Query 343 CCTTTCTTCCTGGAACGCAGGAGGAGGAAACATTATCTTCTTTGCAGTCTGGGAAAGTCG 402
|||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 339 CCTTCCTTCCTGGAACGC---AGGAGGAAACATCATCTTCTTTGCAGTCTGGGAAACTCA 395
Query 403 ATGCAAAAATGGAAATGGACGACCCAGAGAAGGCAATGGCTACAGTTGCTCAGCTCATAG 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 ATGCAAAAATGGAAATGGACGACCCAGAGAAGGCAATGGCTACAGTTGCTCAGCTCATAG 455
Query 463 AGCAACTTCATGCGAAAACATCTTCACCGCAAGATAAAGAACTCACAACAGCTCGTCTAC 522
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 AGCAACTTCATGCGAAAACATCTTCTCCGCAAGACAAAGAACTCACAACAGCTCGTCTAC 515
Query 523 TAGGTATTGCAAAAGGCAAAAGGGAGGCAAGAAGGCTCATCGGTTCGTATGGCCAAGCAA 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 TAGGTATTGCAAAAGGCAAAAGGGAGGCAAGAAGGCTGATCGGTTCGTATGGCCAAGCAA 575
Query 583 TGCCTTTATTTATTTCCATGCTTAGAAATGGGACGACTTTGGCCAAAGTAAATGTCGCTT 642
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 576 TGCCTTTATTTATTTCCATGCTTAGAAATGGGACGAGTATGGCCAAAGTAAATGTCGCTT 635
Query 643 CAATCCTTTGTGTATTGTGCAAAGACAAAGACTTGCGACTAAAAGTGCTTCTAGGAGGAT 702
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 636 CAATCCTTTGTGTTTTATGCAAAGACAAAGACTTGCGACTAAAAGTTCTTCTAGGAGGAT 695
Query 703 GCATCCCGCCATTACTCTCGGTTTTGAAGTCCGGAACCATGGAAACTAGAAAAGCAGCAG 762
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 696 GCATCCCGCCATTACTCTCGGTTTTGAAGTCTGGAACCATTGAAACTAGAAAAGCAGCCG 755
Query 763 CAGAAGCTATATATGAGGTTTCTTCTGCTGGTATTTCCAATGACCACATTGGAATGAAAA 822
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 756 CAGAAGCTATATGTGAGGTTTCTTCTGCTGGAATTTCCAATGACCACATTGGCATGAAAA 815
Query 823 TATTTATCACAGAAGGTGTTGTTCCAACTTTGTGGGATCAACTTAGCCTGAAAGGAAATC 882
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 TATTTATCACAGAAGGTGTTGTGCCAACATTGTGGGATCAACTTAGCCTGAAAGGAAATC 875
Query 883 AGGATAAAGTTGTTGAAGGGTATGTTACTGGCGCTTTGAGGAATCTTTGTGGCGTTGATG 942
|||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 AGGAGAAAGTGGTTGAAGGGTATGTTACTGGAGCTTTGAGGAATCTTTGTGGCGTTGATG 935
Query 943 ATGGTTATTGGAGACTGACACTAGAGGGTAGTGGTGTAGACATAGTTGTGTCTCTTTTGT 1002
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 936 ATAGTTATTGGAGACTGACACTAGAGGGTAGTGGTGTAGACATAGTCGTGTCTCTTTTGT 995
Query 1003 CATCTGATAACCCTAATTCTCAAGCAAATGCTGCTTCTCTGCTGGCTCGTCTAGTTCTGT 1062
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 CATCTGATAACCCTCATTCTCAAGCAAATGCTGCTTCTCTGCTGGCTCGTCTAGTTCTGT 1055
Query 1063 CCTTTTGTGATAGCATCCAGAAAATATTAAATTCTGGAGTTGTCAAGTCTCTGATACAGC 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 CCTTTTGTGATAGCATCCAGAAAATATTAAATTCTGGAGTTGTCAAGTCTCTGATACAGC 1115
Query 1123 TTTTGGAACAGAAAAATGATATCAATGTTCGTGCTAGTGCAGCAGATGCTTTGGAAGCTC 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 TTTTGGAACAGAAAAATGATATCAATGTTCGTGCTAGTGCAGCAGATGCTTTGGAAGCTC 1175
Query 1183 TTTCAGCAAATTCCGATGAGGCTAAGAAATGTGTCAAAGATGCAGGAGGTGTTCATGCTC 1242
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1176 TTTCATCAAAATCCGATGAGGCTAAGAAATGTGTCAAAGAGGCAGGAGGTGTTCATGCTC 1235
Query 1243 TCATTGAAGCCATTGTTGCTCCATCGAAAGAGTGTATGCAGGGAAAACATGGACAATCTC 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TCATTGAAGCCATTGTTGCTCCATCGAAAGAGTGTATGCAGGGAAAACATGGACAATCTC 1295
Query 1303 TACAAGAACATGCAACTGGAGCTTTAGCAAATGTGTTTGGTGGGATGCGCCATTTGATTA 1362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1296 TACAAGAACATGCAACTGGAGCTTTAGCAAATGTGTTTGGTGGGATGCTCCATTTGATTA 1355
Query 1363 TATATCTTGGACAAGTCTCACAATCCCCTCGTCTAACGGAACCAATTGGTGATGTAATTG 1422
||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1356 TATATCTTGGAGAAGTATCACAATCCCCACGTCTAACGGAACCAATTGGTGATGTAATTG 1415
Query 1423 GAGCCCTTGCCTATGCTCTAATGATTTTCAAACAACCAGAGAGTTCCGAGAATATATTTG 1482
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1416 GAGCCCTTGCCTATGCTCTAATGATTTTCAAACAACCAGAGAGTTCGGAGAAGATATTTG 1475
Query 1483 ATCCAAGCGTGATAGAGAGCATTTTGGTAAAGTTACTAAAGCCTCGTGACACAAAGTTAA 1542
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 ATCCAAGCGTGACAGAGAGCATTTTGGTAAAGTTACTAAAGCCTCGTGACACAAAGTTAA 1535
Query 1543 TCCAAGAACGGATCTTAGAGGCTATGGCGAGCTTGTACGGAAACAGTAGTCTGTCGTGTT 1602
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1536 TCCAAGAACGGATCTTAGAGGCTATGGCGAGCTTGTACGGAAACAGTAGTCTATCGTGTT 1595
Query 1603 ACCTAGATGATGCAGAAGCTAAGAGAGTTCTTATCGCTCTCATAACCATGGCTTCTGCTG 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1596 ACCTAGATGATGCAGAAGCTAAGAGAGTTCTTATCGCTCTCATAACCATGGCTTCTGCTG 1655
Query 1663 ATGTACGAGAGCGTCTGATAATTTGCTTGTCTGGCTTATGCCATGACAAGGTTGGAATTT 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1656 ATGTACGAGAGCGTCTGATAATTTGCTTGTCTGGCTTATGCCATGACAAAGTTGGAATTT 1715
Query 1723 GGGAGGCGATTGGAAAGAGAGAAGGAATCCAGTTATTTATATCATTTCTAGGTTTGTCTA 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 GGGAGGCGATTGGAAAGAGAGAAGGAATCCAGTTATTTATATCATTTCTAGGTTTGTCTA 1775
Query 1783 GTGAGCAACACCAAGAGTATGCTGTTGAAATGTTGAAAATTTTGACGGCTCAGGTGGATG 1842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 GTGAGCAACACCAAGAGTATGCTGTTGAAATGTTGAAAATTTTGACGGCTCAGGTGGATG 1835
Query 1843 ATAGTAAATGGGCTGTAACAGCAGCCGGGGGGATACCTCCACTTGTCCAGTTGCTCGAGA 1902
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 ATAGTAAATGGGCTGTAACAGCAGCCGGGGGGATTCCTCCACTTGTCCAGTTGCTCGAGA 1895
Query 1903 CTGGATCTCAGAAGGCCAAGGAAGATGCTGCCTGCATTCTCTGGAATTTGTGTTGTCACA 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CTGGATCTCAGAAGGCCAAGGAAGATGCTGCCTGCATTCTCTGGAATTTGTGTTGTCACA 1955
Query 1963 GTGAGGAAATCCGTGATTGTGTTGAAAGAGCTGGTGGTATTCCAGCATTCTTGTGGCTTC 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956 GTGAGGAAATCCGTGATTGTGTTGAAAGAGCTGGTGGTATTCCAGCATTCTTGTGGCTTC 2015
Query 2023 TGAAGACTGGTGGACCAAATTCCCAGGAAACATCTGCAAAGACACTTGTGAAGCTTGTCC 2082
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2016 TGAAGACTGGTGGACCAAATTCCCAGGACACATCTGCAAAGACACTTGTGAAGCTTGTCC 2075
Query 2083 ATACAGCTGATCCTGCCACAATAAATCAGTTGTTGGCTTTACTTCTGGGAGATGATCCGA 2142
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2076 ATACAGCTGATCCTGCCACAGTTAATCAGTTGTTGGCTTTACTTCTGGGAGATGATCCAA 2135
Query 2143 CTTCAAAGATTCAGGTAATAGAAGTGTTGGGTCATGTGCTCTCAAAAGCTTCACAAGAGG 2202
||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136 CTTCAAAGATTCATGTAATAAAAGTATTGGGTCATGTGCTCTCAAAAGCTTCACAAGAGG 2195
Query 2203 ATCTTGTTCATAGAGGATGTGCCGCTAACAAAGGACTGAGGTCCCTAGTCGAGTCCCTAA 2262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2196 ATCTTGTTCATAGAGGATGTGCCGCTAACAAAGGACTGAGGTCCCTTGTCGAGTCCCTAA 2255
Query 2263 CATCTTCCAGAGAAGAAACAAAGGAGCATACAGCTTCAGTTTTAGCTGATCTGTTCAGCT 2322
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256 CATCTTCCAGGGAAGAAACAAAGGAGCATACAGCTTCAGTTTTAGCTGATCTGTTCAGCT 2315
Query 2323 CAAGACAAGATATTTGTGGTCATCTTGCGACGGATGACATTATTAATCCCTGGATCAAGC 2382
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2316 CAAGACAAGATATCTGTGGTCATCTTGCGACTGATGACATTATTAATCCCTGGATCAAGC 2375
Query 2383 TGCTTACAAACAACACTCAGAATGTGGCAAAACAGGTGGCTAGGGCTTTGGACGCACTGT 2442
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2376 TGCTTACAAACAACACCCAGAATGTGGCCAAACAGGTGGCTAGGGCTTTAGACGCACTGT 2435
Query 2443 CCCGCCCAGTTAAGAACAATAATAATAAAAAGAAGTCTTACATTGCCGAAGGAGATATTA 2502
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2436 CCCGCCCGGTTAAGAAAAATAATAATAAAAAGAAGTCTTACATTGCAGAAGGAGATATTA 2495
Query 2503 AGTCACTCATAAAATTGGCTAAGAACTCTTCCATTGAGTCTGCAGAAAATGCGGTATCTG 2562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2496 AGTCACTCATAAAATTGGCTAAGAACTCTTCCATTGAGTCTGCAGAAAATGCGGTTTCTG 2555
Query 2563 CCCTCGCAAATCTTCTGTCTGATCCGGATATAGCTGCAGAAGCACTAGCTGAAGATGTTG 2622
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2556 CCCTCGCAAATCTTCTGTCTGATCCGGATATCGCTGCAGAAGCACTAGCTGAAGATGTTG 2615
Query 2623 TTTCCGCTTTCACAAGAATTTTGGCTGATGGATCTCCAGAGGGTAAGAGAAATGCGTCAC 2682
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2616 TTTCAGCTTTCACAAGAATTTTGGCTGATGGATCTCCAGAGGGTAAGAGAAATGCGTCAC 2675
Query 2683 GCGCACTTCATCAGTTACTTAAGAACTTTCCAGTTTGTGATGTGCTAAAGGGAAGTGCTC 2742
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2676 GGGCACTTCATCAGTTACTTAAGAACTTTCCAGTTTGTGATGTGCTAAAGGGAAGTGCTC 2735
Query 2743 AGTGCCGTTTTGCTATACTTTCACTCGTTGATTCTCTAAAATCAATTGATGTGGATAGCG 2802
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 AGTGCCGTTTTGCTATACTTTCGCTCGTTGATTCTCTAAAATCAATTGATGTGGATAGCC 2795
Query 2803 CAGATGCTTTCAACATATTAGAAGTAGTTGCGCTCTTGGCAAAGACTAAGAGTGGGGTGA 2862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2796 CAGATGCTTTCAACATATTAGAAGTAGTTGCGCTCTTGGCAAAGACTAAGAGTGGGGTGA 2855
Query 2863 ATTTCTCTTACCCTCCATGGATTGCCCTTGCCGAAGTGCCATCAAGCCTGGAGACTCTTG 2922
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2856 ATTTCTCTTATCCTCCATGGATTGCCCTTGCCGAAGTGCCTTCAAGCCTGGAGACCCTTG 2915
Query 2923 TGCAATGCCTTGCCGAAGGCCATACTCTTGTGCAAGATAAGGCAATAGAAGTTTTGTCCA 2982
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2916 TGCAATGCCTTACTGAAGGCCATACTCTTGTGCAAGATAAGGCAATAGAAGTTTTGTCCA 2975
Query 2983 GGCTTTGCTCTGATCAACAGTTTCTGCTCAGTGAACTTATAGTTTCAAGACCCAAGTCAA 3042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2976 GGCTTTGCTCTGATCAACAGTTTCTGCTCAGTGAACTTATAGTTTCAAGACCCAAGTCAA 3035
Query 3043 TGTTGGTTCTGGCTGATAGAATAGTGAATGCATCCAGCTTAGAAGTGAGAGTTGGGAGCA 3102
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3036 TGGGGGTTCTGGCTGATAGAATAGTGAATGCATCCAGCTTAGAAGTGAGAGTTGGGGGGA 3095
Query 3103 CAGCGCTGCTCTTATGTGCTGCAAAGGAAAAGAAGCAGCTGATCACGGAGACACTTGATC 3162
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3096 CGGCGCTGCTCTTATGTGCTGCAAAGGAAAAGAAGCAGCTGATCACAGAGACACTTGATC 3155
Query 3163 AGTCTGGTTTTTTAAAGCTCTTGTTACATGCCCTCGTTGATATGATAAAGCACAATTCTA 3222
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3156 AGTCTGGTTTTTCAAAACTCTTGTTACATGCCCTCGTTGATATGATAAAGCACAATTCTA 3215
Query 3223 CAAGCTTTTCTCTAGAGACTGAAGTCCAGACACCTAAAGGTTTTTTGGaaaaaaaTGTTT 3282
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3216 CATGCTTTTCTCTAGAGACTGAAGTCCAGACACCTAAAGGTTTTTTGGAAAAAAAAGTTT 3275
Query 3283 TCCAGGATACAGGTAGTTTTTATTTTCCTGATCCAGCTAAAATCTTGGGTGGTACAGTCG 3342
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3276 TCCAGGATACAGGTAGCTTTTATTTTCCTGATCCAGCTAAAATCTTGGGTGGTACAGTCG 3335
Query 3343 CATTGTGGCTGCTATGCATACTCACTTCCGTTGATGCTAAGTCAAAGGTCATTGTTATGG 3402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3336 CATTGTGGCTGCTATGCATACTCACTTCCGTTGATGCTAAGTCAAAGGTCATTGTTATGG 3395
Query 3403 AAGCTGGCGGACTTGAGGTGCTCGTGGGGAAGCTTGCTAGGTATACTTCCAGTGCTCAGG 3462
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3396 AAGCTGGCGGACTTGAGGTGCTCTTGGGGAAGCTTGCTAGGTATACTTCCAGTCCTCAGG 3455
Query 3463 CTGAATTTGAGGATACAGAAGGCATTTGGATTAGTGCTCTCCTCCTGGCTATCATGTTCC 3522
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3456 CTGAATTTGAGGATACAGAAGGCATTTGGATTAGTGCTCTCCTCCTGGCTATTATGTTCC 3515
Query 3523 AGGATGACAATGTGTCCTTTTCTTCAACGACAATGCGGATCATTCCAACACTTGCAGTTT 3582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3516 AGGATGACAATGTGTCCTTTTCTTCAACGACAATGCGGATCATTCCAACACTTGCAGTTT 3575
Query 3583 TGCTAGGATCTGATGAACTGATAGATCGGTATTTCGCTGCCCACGCAATGGCTAGTCTTG 3642
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3576 TGCTAGGATCTGATGAACTGGTAGATCGGTATTTCGCTGCCCACGCAATGGCTAGTCTTG 3635
Query 3643 TTTGTACTAGGAACAGAGGAATAAATCTGACAATTGCAAACTCTGGTGCTGTTTCTGGGA 3702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3636 TTTGTACTAGGAACAGAGGAATAAATCTGACAATTGCAAACTCAGGTGCTGTTTCTGGGA 3695
Query 3703 TAATAAACCTTCTTGGCTATGTGGAATCGGAGATACTGAACTTGGTTGCTTTGGCAAATG 3762
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3696 TAATAAACCTTCTTGGCTATGTGGAATCGGACATACTGAACTTGGTTGCTTTGGCAAATG 3755
Query 3763 AATTTTCTCTCGTGAAAGAGCCTGATCAAGTTATTCTTCAACACCTTTTTGAAATTGAAG 3822
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3756 AATTTTCTCTGGTGAAAGAGCCTGATCAAGTTATTCTTCAACACCTTTTTGAAATTGACG 3815
Query 3823 ATGTGAGGCTTGGCTCCACTGCACGTAAATCTATCCCGCTGCTTGTAGATCTCTTAAGGC 3882
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 3816 ATGTGAGGCTTGGCTCCACTGCACGCAAATCTATCCCACTACTTGTCGATCTCTTAAGGC 3875
Query 3883 CAATTCCAGATAGGCCTGGAGCCCCTCAGTTTGCTGTCCAAATCCTGATTCGCATTGCTG 3942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3876 CAATTCCAGATAGGCCTGGAGCCCCTCAGTTTGCTGTCCAAATCCTGATTCGCATTGCTG 3935
Query 3943 ATGGAAGTGACACAAATAAATTACTTATGGCTGAAGCTGGAGCTGTTGAAGCTTTAACAA 4002
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3936 ATGGAAGTGACACAAATAAATTACTAATGGCTGAAGCTGGAGCCGTTGAAGCTTTAACAA 3995
Query 4003 AGTACCTTTCTCTAAGTCCTCAAGATTCAACTGAGTACGCCATATCTGAATTGCTTAGGG 4062
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3996 AGTACCTTTCGCTTAGTCCTCAAGATTCAACTGAGTACGCCATATCTGAATTGCTTAGGG 4055
Query 4063 TATTATTTAGCAACCACGAGCTTAGACAAAACGAAATGGCACTAAGTTCCTTGAATCAGC 4122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4056 TATTATTTAGCAACCACGAGCTTAGACAAAACGAAATGGCACTAAGTTCCTTGAATCAGC 4115
Query 4123 TTATCGCAGTACTGCGGCTAGGTTCACGAAGTGCAAGATACAGCGCAGCTGGGGCTCTGA 4182
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4116 TTATCGCAGTACTGCGGCTAGGTTCAAGAAGTGCAAGATACAGCGCAGCTGGGGCTCTGA 4175
Query 4183 ATGAACTATTTGATGCTGAAAACATCAGAAATTCTGAAATCGCCTGCCAGGCTGTTCAAC 4242
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4176 ATGAACTATTTGAAGCTGAAAACATAAGAAATTCTGAAATCGCCTGCCAGGCTGTTCAAC 4235
Query 4243 CACTTATGGACATACTCGGTTCTGTATCAGAAAGTGAGCAAGAGGTAGCTCTCTCTGCAT 4302
|||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4236 CACTAATGGACATATTCGGTACTGTATCAGAAAGTGAGCAAGAGGTAGCTCTCTCTGCAT 4295
Query 4303 TGATCAAACTAAGCTCAGGAAATACTTCGAATACAGCTCTTCTGATTGATGTGGAAGGAA 4362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4296 TGATCAAACTAAGCTCAGGAAATACTTCGAATACAGCTCTTCTGATTGATGTGGAAGGAA 4355
Query 4363 GTCTGCTGGAAAACGTGATCAAAATCTTATCATCTGCTACTGCTTCAGAGGAGTTAAAGA 4422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4356 GTCTGCTGGAAAACGTGATCAAAATCTTATCATCTGCTTCTGCTTCAGAGGAGTTAAAGA 4415
Query 4423 TAAATGCTGCCAGACTTTGTTCTGTTGTTTTCTCGAATAAAAACATCAGAACAAGTGCAT 4482
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4416 TAAATGCTGCCAGACTTTGTTCTGTTGTTTTCTTGAATAAAAACATCAGAACAAGTCCAT 4475
Query 4483 CCGCCTCCGGATGCATGAAGCCGTTAATAACACTTATGCAGTCTGAAAGAAGTGCAGCAG 4542
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4476 CCGCATCCGGATGCATGAAGCCTTTGATAACACTTATGCAGTCTGAAAGAAGTGCAGCAG 4535
Query 4543 TTGAAGCAGCAGTTTTTGCTATTAAGATATTATTGGATGACGAGCAACATTTAGAACTAG 4602
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4536 TTGAAGCAGCAATTTGTGCTATTAAGATATTATTGGATGACGAGCAACATTTAGAACTAG 4595
Query 4603 CAGCCGCACATAACATTCAGGAGCTTCTTGTTGGCTTGGTTTCCGGGAA-AAATTACGTT 4661
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4596 CAGCCGCACATAACATTCAAGAGCTTCTTGTTGGCTTGGTTTCCGG-AAGAAATTACGTT 4654
Query 4662 ATTATTGAGGCTAGCTTATCAGCTCTCATTAAGTTGGGAAAAGACAGAGTACCACGCAAG 4721
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4655 ATTATTGAGGCTAGCTTATCAGCTCTCATTAAGTTGGGGAAAGACAGAGTACCACGCAAG 4714
Query 4722 TTGGACATGGTGGAAGCTGGAATAATTGAGCGATGTCTTGAGCTACTACCTGGAGCCTCG 4781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4715 TTGGACATGGTGGAAGCTGGAATAATTGAGCGATGTCTTGAGCTACTACCTGGAGCCTCG 4774
Query 4782 AGTTCGTTATGTTCCGCTGTTGTAGAGCTGTTTCGTATTTTAACAAATAGTGGAGTAATC 4841
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4775 AGTTCGTTATGTTCTGCTGTTGCAGAGCTGTTTCGAATTTTAACAAATAGTGGAGTAATT 4834
Query 4842 GCGAGAAGACCAGATGTTGCAAAAACTGTAGAGCCTCTCTTCGCGGTCTTGCTGCGGTCA 4901
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 4835 GCGAGAAGACCAGATGTTGCAAAAACTGTTGAGCCTCTATTCGCAGTCTTGCTCCGGTCA 4894
Query 4902 GACTTGACCTTATGGGGGCAACATAGTGCCCTGCAAGCACTCGTAAACATATTGGAAAAA 4961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 4895 GACTTGACCTTATGGGGGCAACATAGTGCCCTGCAAGCACTTGTAAATATATTGGAAAAA 4954
Query 4962 CAGCAAACCCTTGAAGCTTTTAGTTTTACACCCAGTGAAGCCATTGTGCCGCTGATTTCT 5021
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4955 CAGCAAAGCCTTGAAGCTTTTAGTTTTACACCCAGTGAAGCCATCGTGCCGCTGATTTCC 5014
Query 5022 TTTTTAGAATCTTCATCCCAAGCTATCCAGCAGCTTGGAGCAGAACTGCTGAGCCATTTT 5081
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5015 TTTTTAGAATCTTCACCCCAAGCTATCCAGCAGCTTGGAGCAGAACTGCTGAGCCATTTT 5074
Query 5082 CTTACAATGGAAGATTTCCAGCAAGACATCACAACACAGAGTGCTGTTGTTCCTCTGGTC 5141
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5075 CTTACAATGGAAGATTTCCAGCAAGACATCACAACACAGAGTGCTGTTGTCCCTCTGGTC 5134
Query 5142 CGGCTTGCAGGAATTGGAATACTGAGCCTGCAGGAAACTGCGATAAAGGCATTGGAGAAG 5201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5135 CGGCTTGCAGGAATTGGAATACTGAGCCTGCAGGAAACTGCGATAAAGGCATTGGAGAAG 5194
Query 5202 ATATCTGCTAGCTGGCCTAAGGCTGTTCTTGATGCTGAAGGTATTTTTGAGCTATCCAAG 5261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5195 ATATCTGCTAGCTGGCCTAAGGCTGTTCTTGATGCTGGAGGTATTTTTGAGCTATCCAAG 5254
Query 5262 GTTATTCTTCAGGAAGATCCTCAGCCCCCTCTTGATCTATGGGAGTCAGCTGCCTTTGTT 5321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5255 GTTATTCTTCAGGAAGATCCTCAGCCCCCTCTTGATCTATGGGAGTCAGCTGCTTTTGTT 5314
Query 5322 CTTTCCAACATTCTGCAGTATGATGCAGAATGCTTTTTCAGAGTTGAACTGCCAGTGTTG 5381
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5315 CTTTCCAACATTCTGCAGTATGATGCAGAATGCTTTTTCAGAGTTGAACTGCCAGTTTTG 5374
Query 5382 GTAAAATTGTTGTTCTCGACAATTGAAAGCACAGTGTTACTGGCTCTTAAAGCTTTGATG 5441
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5375 GTAAAATTATTGTTCTCGACAATTGAAGGCACAGTATTACTGGCTCTTAAAGCATTGATG 5434
Query 5442 CTTCATGAGAAGAACGACGCTTCAAGTACAGTACAAATGGCTGAGCTTGGTGCAATCGAT 5501
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5435 CTTCATGAGAAGAACGATGCTTCAAGCACAGTACAAATGGCTGAGCTTGGCGCAATCGAT 5494
Query 5502 GCATTGCTGGACCTCCTGAGATCTCATCAATGCGAGGAAGAATCTGGAAGCTTACTTGAA 5561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 5495 GCATTGCTGGACCTCCTGAGATCTCATCAATGCGAGGAAGAGTCGGGAAGCTTACTTGAA 5554
Query 5562 GTAATATTTAACAATCCAAGAGTAAGAGAGTTGAAGTTATGCAAATATGCAATAGCACCA 5621
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5555 GTAATATTCAACAATCCGAGAGTAAGAGAGTTGAAGTTATGCAAATATGCAATAGCACCA 5614
Query 5622 CTATCTCAATATCTGTTGGACCCTCATACAAGATCAGAACCTGGTAGGCTTCTTGCTGCT 5681
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5615 CTATCTCAATATCTGTTGGACCCTCAGACAAGATCAGAACCTGGTAGGCTTCTTGCTGCT 5674
Query 5682 CTGGCACTGGGGGATCTATCTCAGCATGAAGGGCTTTCTAGATCCAGTGGTTCTGTTTCC 5741
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5675 CTGGCACTTGGGGATCTTTCTCAGCATGAAGGGCTTTCTAGATCCAGTGGTTCTGTTTCC 5734
Query 5742 GCTTGTCGGGCACTCATTAGCGTGCTAGAAGAACAACCAACAGAAGAAATGAAAGTGGTG 5801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5735 GCTTGTCGGGCACTCATTAGCGTGCTAGAAGAACAACCAACAGAAGAAATGAAAGTGGTG 5794
Query 5802 GCCATCTGTGCGTTGCAGAATTTTGTGATGAATAGTAGAACGAATAGACGAGCTGTTGCA 5861
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5795 GCCATCTGTGCGTTGCAGAATTTTGTGATGAATAGTAGAACGAATAGACGAGCTGTCGCA 5854
Query 5862 GAGGCTGGTGGCGTATTGTTAATTCAAGAGCTACTGCTTTCTTGCAACCCAGAAGTTTCT 5921
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 5855 GAGGCTGGTGGCGTATTATTAATTCAGGAGCTACTGCTCTCTTGCAATGCAGAAGTTTCT 5914
Query 5922 GGGCAGGCTGCACTGATGGTCAAATTTTTGTTTTCCAACCACACACTCCAAGAATATGTC 5981
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5915 GGGCAGGCTGCACTAATGGTCAAATTTTTGTTTTCCAACCACACACTCCAAGAATATGTC 5974
Query 5982 TCGAATGAGCTTATAAGATCACTAACAGCTGCACTTGAGAGAGGCTTGTGGTCTACAGCA 6041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5975 TCGAATGAGCTTATAAGATCACTAACAGCTGCACTTGAGAGAGGCTTGTGGTCTACAGCA 6034
Query 6042 ACTATAAATATTGAAGTTTTGAGAACCTTAAATGTGATTTTCTCCAATTTTCCTAAGCTC 6101
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6035 ACTATAAATATCGAAGTTTTGAGAACCTTAAATGTGATTTTCTCCAATTTTCCTAAGCTC 6094
Query 6102 CGTGCCTCAGAAGCTGCTACTTTCTGCATCCCTCATTTGGTAGGGGCGCTCAAATCTGGT 6161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6095 CGTGCCTCAGAAGCTGCTACTTTCTGCATCCCTCATTTGGTAGGGGCCCTCAAATCTGGT 6154
Query 6162 GTTGAAGACGTCCAGGGATTAGTATTGGATATTCTTTACTTGCTAAGACACTCCTGGACG 6221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6155 GTTGAAGACGTCCAGGGATTAGTATTGGATATTCTTTACTTGCTAAGGCACTCCTGGACG 6214
Query 6222 AATATGTCTATAGATGTTGCAAAGTCTCAAGCCATGATTGCAGCTGAAGCAATTCCCGTC 6281
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6215 AATATGTCTATAGATGTTGCAAAGTCCCAAGCCATGATTGCAGCTGAAGCAATTCCCGTC 6274
Query 6282 CTGCAAATGCTGATGAAAACATGCCCTCCTAGGTTTCACGACAAGGCAGATAGCTTATTG 6341
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6275 CTGCAAATGCTGATGAAAACATGCCCTCCTAGGTTCCACGACAAGGCAGACAGCTTATTG 6334
Query 6342 CACTGCTTACCAGGTTGCTTAACAGTGAACGTCATGCGTGCCAATAACTTAAAGCAGTCT 6401
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6335 CACTGCTTACCAGGTTGCTTAACAGTGAACGTCATGCGTGCCAATAACTTAAAGCAGTCC 6394
Query 6402 ATGGCAACCACAAACGCCTTTTGTCAATTAACAATAGGAAACTGCCCTCCACGGCAAACT 6461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6395 ATGGCAACCACAAACGCCTTTTGTCAATTAACAATAGGAAACTGCCCTCCACGGCAAACT 6454
Query 6462 AAGGTCGTGAGCAATAGCACTACTCCTGAATGGAAAGAAGGCTTTACTTGGGCATTTGAT 6521
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6455 AAGGTCGTTAGCAATAGCACAACTCCTGAATGGAAAGAAGGCTTTACTTGGGCATTTGAT 6514
Query 6522 GTTCCCCCCAAAGGACAAAAGCTTCACATCATATGCAAGAGCAAAAGCACATTTGGAAAG 6581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6515 GTTCCCCCCAAAGGACAAAAGCTTCACATCATATGCAAGAGCAAAAGCACATTTGGAAAG 6574
Query 6582 ACGACTCTAGGGCGAGTTACTATCCAAATCGACAAAGTCGTGACAGAAGGAGAGTACAGT 6641
|| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 6575 ACAACTCTAGGCCGTGTTACTATCCAAATCGACAAAGTTGTGACAGAAGGAGAGTACAGT 6634
Query 6642 GGATCTCTAAGCCTGAATCATGAAAATAGCAAAGATGCTTCTTCCAGATCACTCGACATT 6701
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 6635 GGATCTCTAAGCCTGAATCATGAAAACAGCAAAGATACTTCTTCCAGATCACTTGACATT 6694
Query 6702 GAGATAGCATGGTCCAATAGGACAACGGATGAGACTCATTGATCTTCACAAGCACAATGC 6761
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6695 GAGATTGCATGGTCCAATAGGACAACGGATGAGACTCATTGATCTTCACAAGCACAATGC 6754
Query 6762 ACTTGGTCATTGGAAGACTGAAATCTGTCTAATGCTCCTAATGACTGCATTTTGGTAGTA 6821
||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 6755 ACTTGGTCAAGGGAAGACTTAA-TCTGTCTAATG--------G-CTGCATTTTGGTAGTA 6804
Query 6822 GAAGAAGGAAAGCAAAGTCTGCAGCAGATGTATAGCAATACGTATATATGGGTAGA-GAA 6880
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||
Sbjct 6805 GAAGAAGGAAAGCAAACTCTGCAGCAGATGTATAGCAATACGTGTATATGAGTA-ATGAG 6863
Query 6881 TATGGTGTGTGAAAAGGAACATAGAAGCAAAGAGTTCCTGCCTAGCAAGAGAGAAGGGTC 6940
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||
Sbjct 6864 TATGGTGTGTGAAAAGGAACGTAGAAGCAAAGAGTTCCTGCCTAGCAAGAAAGAAAG-TC 6922
Query 6941 TTATTGTATAGGTTGAATCTCTTCttttttttGGTCTGCGATGTTCGGTATTTGACAGTT 7000
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 6923 TTATTGTATAGGTTGTTTCTCTTCTTTTTTT-GGTCTGCGATCTTCGGTATTTGTCAGTT 6981
Query 7001 TGTTTACGAACCTT-TT-CGCTCGGGGATCAACTAAGCAGCACAAAGTGCTCTGATTTCT 7058
|||| || || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 6982 TGTTCACAAAAATTCTTTCGCTCGGGGATCAACTAAGCAGCACGAAGTGCTCTGATTCCT 7041
Query 7059 GTAGCGATGTTCAAGTTATTTTACC 7083
||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 7042 GTAGCGATGTTTAAGTTATTTTACC 7066
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 268572292661
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5