BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G79930.1 Length=2997 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1 4006 0.0 Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2 3009 0.0 > Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1 Length=2534 Score = 4006 bits (2169), Expect = 0.0 Identities = 2419/2541 (95%), Gaps = 11/2541 (0%) Strand=Plus/Plus Query 179 TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGCC 238 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1 TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAACTGCC 60 Query 239 TTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG 298 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTGTTGCCGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG 120 Query 299 AGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG 358 ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGACTCCCGCTATTGTCTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG 180 Query 359 CTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTCGCC 418 |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 181 CTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAACGCTTAATTGGTCGCC 240 Query 419 AGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCGAAG 478 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct 241 AGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAAG 300 Query 479 GCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTACCC 538 | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 301 GGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGAGAGCCTTTACCC 360 Query 539 CGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA 598 |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CGACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA 420 Query 599 ATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGTA 658 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 421 ATGCAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGAA 480 Query 659 GGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCACGAGA 718 |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 481 GGGCTGTTCTCGATGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCCTGCGCTTGATCCACGAGA 540 Query 719 CTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGACCAGC 778 | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 541 CAACAGCTACAGCTTTGGCATATGGAATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAATGAACAGC 600 Query 779 TCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTTA 838 |||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 601 TCAACGTCGCTTTCATTGACATTGGGCATGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTCA 660 Query 839 AAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGACT 898 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 661 AAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCGCTTGGGGGAAGGGACT 720 Query 899 TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGACG 958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 721 TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGACG 780 Query 959 TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAAAAGG 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| Sbjct 781 TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAAGG 840 Query 1019 TTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAAGATG 1078 |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 841 TTCTAAGCGCAAATCCTGTGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGACGAGAAAGATG 900 Query 1079 TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCGTG 1138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 901 TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTCTGGAGCGTG 960 Query 1139 TAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTACATA 1198 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 961 TTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACATA 1020 Query 1199 TGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGAT-TCTAACTGAG 1257 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 1021 TGGTCGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATAT-TAACTGAG 1079 Query 1258 TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGATGT 1317 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1080 TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATGT 1139 Query 1318 GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG 1377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG 1199 Query 1378 AGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAATGGA 1437 ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 1200 AGCTTTCCTTTCTCAATATCGCTGGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGATGCTCAAATTGGA 1259 Query 1438 GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC 1497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1260 GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC 1319 Query 1498 AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGATGTG 1557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1320 AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTATGGTGATGTG 1379 Query 1558 AACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGT-CCGTTCCAGTCATC 1616 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1380 AACGATTTGCAAGCACCTCCGAAAATCAGCACATACACGATTGGTACC-TTCCAGTCATC 1438 Query 1617 AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTCTC 1676 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1439 AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCTC 1498 Query 1677 AGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAACA 1736 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1499 AGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGATCA 1558 Query 1737 TTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCTTC 1796 |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1559 ATCAGTGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCTTC 1618 Query 1797 TGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACTGA 1856 ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| Sbjct 1619 TGGTGACTCTGATATTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCTGA 1678 Query 1857 CAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCTGA 1916 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1679 CAATGGTGTTGCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCTGA 1738 Query 1917 GGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGTGC 1976 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1739 GGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGTGC 1798 Query 1977 CTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA 2036 ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 CTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA 1858 Query 2037 CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT 2096 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT 1918 Query 2097 GCGGAACAAACTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGACT-CGGAGAGGGAAGCAT 2155 ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| Sbjct 1919 GCGAAACAAATTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGA-TGCTGAGAGGGAAGCAT 1977 Query 2156 TCCTGGCGAATCTGCAGGAAGTTGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA 2215 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1978 TCCTGGCGAAGCTGCAGGAAGTGGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA 2037 Query 2216 AAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGC 2275 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2038 AAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTAC 2097 Query 2276 GTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA 2335 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2098 GTTACAAAGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA 2157 Query 2336 GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTTTGATCACATTGAATTGGCAGAGA 2395 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 2158 GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTTTGACCACATTGAATTGGCTGAGA 2217 Query 2396 AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGCTGCGGG-GAAAGCAGCAG 2454 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || || Sbjct 2218 AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGTTGCGGGAGAA-GAAGAAG 2276 Query 2455 CAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC 2514 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2277 CAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC 2336 Query 2515 AAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTGGCT 2574 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2337 AAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGG---CT 2393 Query 2575 AAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGCGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCA 2634 |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || Sbjct 2394 AAAGCAGAAGCACCACAAGCCAAGGGATGTGAGCCGGCAGATGAGGGCAAGAGTGAGGCA 2453 Query 2635 GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAA 2694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 2454 GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCCGAAGGTAGTGCCTAA 2513 Query 2695 ATGAATGACGAGAGAGAGATG 2715 |||||||||||||| |||||| Sbjct 2514 ATGAATGACGAGAGCGAGATG 2534 > Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2 Length=2694 Score = 3009 bits (1629), Expect = 0.0 Identities = 1835/1937 (95%), Gaps = 4/1937 (0%) Strand=Plus/Plus Query 178 ATTGAATAACAC--AGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATT 235 |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 14 ATTGAAGAACACAAAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATT 73 Query 236 GCCTTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC 295 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 74 GCCTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC 133 Query 296 GTGAGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAG 355 |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 134 GTGAGACTCCCGCTATTGTATGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAG 193 Query 356 CTGCTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTC 415 ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 194 CTGCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAGCGCTTAATTGGTC 253 Query 416 GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCG 475 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 254 GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCC 313 Query 476 AAGGCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTA 535 |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 314 AAGGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAGTTATTTGGGAGAGACTAGAGCCTTTA 373 Query 536 C-CCCGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT 594 | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 374 CTCCC-ACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT 432 Query 595 TTGAATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAG 654 |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 433 TTGAATGCTGCAGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACAGACCTCCAG 492 Query 655 CGTAGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCAC 714 || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 493 CGAAGGGCTGTTCTCGACGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCAC 552 Query 715 GAGACTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGAC 774 ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 553 GAGACTACAGCAACGGCTTTGGCTTATGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGAC 612 Query 775 CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC 834 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 613 CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC 672 Query 835 TTTAAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGG 894 || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 673 TTCAAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGGTTTCGATCCCTCCCTTGGAGGAAGG 732 Query 895 GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATT 954 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 733 GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATT 792 Query 955 GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAA 1014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| Sbjct 793 GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAA 852 Query 1015 AAGGTTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA 1074 |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 853 AAGGTTCTAAGCGCAAATCCTGTCGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA 912 Query 1075 GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAG 1134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct 913 GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCTATTCTGGAG 972 Query 1135 CGTGTAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTA 1194 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 973 CGTGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTA 1032 Query 1195 CATATGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT 1254 |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1033 CATATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT 1092 Query 1255 GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGA 1314 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1093 GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGA 1152 Query 1315 TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT 1374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1153 TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT 1212 Query 1375 GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAAT 1434 ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||| Sbjct 1213 GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCGCTGGCGTGGACAGGAGCAGCTTCCGATGCTCAAAAT 1272 Query 1435 GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1494 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1273 GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACTGTTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1332 Query 1495 GTCAAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGAT 1554 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1333 GTCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGAT 1392 Query 1555 GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCGTTCCAGTCA 1614 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1393 GTGAATGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCA 1452 Query 1615 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTC 1674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 1453 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC 1512 Query 1675 TCAGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAA 1734 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1513 TCAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAT 1572 Query 1735 CATTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCT 1794 || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1573 CAATCAGAGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT 1632 Query 1795 TCTGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACT 1854 | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || Sbjct 1633 TTTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCT 1692 Query 1855 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCT 1914 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1693 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCT 1752 Query 1915 GAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGT 1974 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1753 GAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT 1812 Query 1975 GCCTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 2034 ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1813 GCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 1872 Query 2035 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 2094 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1873 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 1932 Query 2095 ATGCGGAACAAACTGAG 2111 ||||| ||||||||||| Sbjct 1933 ATGCGAAACAAACTGAG 1949 Score = 924 bits (500), Expect = 0.0 Identities = 604/651 (93%), Gaps = 19/651 (3%) Strand=Plus/Plus Query 2193 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2030 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2089 Query 2253 GGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGCGTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2312 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2090 GGTGGGAGACCCTGTGGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2149 Query 2313 TCAGCTTGGTTACTGTATTAACAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTT 2372 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2150 TCAGCTTGGTTACTGTATTAAGAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTT 2209 Query 2373 TGATCACATTGAATTGGCAGAGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2432 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2210 TGACCACATTGAATTGGCAGATAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2269 Query 2433 ATGGCTGCGGGGA-AAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTC 2491 |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2270 ATGGCTAC-GGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACTCCGGCTC 2328 Query 2492 TCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA 2551 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2329 TCTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA 2388 Query 2552 TGACCAAACCAAAGCCGGTGGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGG 2611 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2389 TGACCAAACCAAAACC---GGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCCGG 2445 Query 2612 CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA 2671 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2446 CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA 2505 Query 2672 ATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAAATGAATGACGAGAGAGAGATGGTGTTGTATCGATTTT 2731 ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2506 ATCCCGCTGAAGGGAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGTATCGATTTT 2565 Query 2732 GTTCTTAACTCTTTTTGATTTACCTAGTGGAACCTCTTTTTCTGGTTTCGCTATTATTCC 2791 ||| |||| | || | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || Sbjct 2566 GTT-TTAA-T-TT----A----CGTAGTGGAACCTCTTATTCTAGTTTCGCTATTATCCC 2614 Query 2792 CGGAAAAAATCTATATTGTTAATTCTTCCTTTTCGAAAACAATTTTTAGGA 2842 | |||| | ||||| || | | |||||||||| ||| |||| ||||||||| Sbjct 2615 CCGAAAGATTCTATCTT-T-AGTTCTTCCTTT-CGACAACAGTTTTTAGGA 2662 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 113166117895 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5