BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G79930.1

Length=2997
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1                       4006    0.0  
  Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2        3009    0.0  


> Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1
Length=2534

 Score = 4006 bits (2169),  Expect = 0.0
 Identities = 2419/2541 (95%), Gaps = 11/2541 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  179   TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGCC  238
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1     TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAACTGCC  60

Query  239   TTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG  298
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TTGTTGCCGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG  120

Query  299   AGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG  358
             ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   AGACTCCCGCTATTGTCTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG  180

Query  359   CTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTCGCC  418
             |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct  181   CTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAACGCTTAATTGGTCGCC  240

Query  419   AGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCGAAG  478
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct  241   AGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAAG  300

Query  479   GCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTACCC  538
             | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  301   GGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGAGAGCCTTTACCC  360

Query  539   CGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA  598
             |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   CGACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA  420

Query  599   ATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGTA  658
             || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  421   ATGCAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGAA  480

Query  659   GGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCACGAGA  718
             |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  481   GGGCTGTTCTCGATGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCCTGCGCTTGATCCACGAGA  540

Query  719   CTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGACCAGC  778
             | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct  541   CAACAGCTACAGCTTTGGCATATGGAATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAATGAACAGC  600

Query  779   TCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTTA  838
             |||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  601   TCAACGTCGCTTTCATTGACATTGGGCATGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTCA  660

Query  839   AAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGACT  898
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  661   AAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCGCTTGGGGGAAGGGACT  720

Query  899   TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGACG  958
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  721   TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGACG  780

Query  959   TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAAAAGG  1018
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct  781   TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAAGG  840

Query  1019  TTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAAGATG  1078
             |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  841   TTCTAAGCGCAAATCCTGTGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGACGAGAAAGATG  900

Query  1079  TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCGTG  1138
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  901   TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTCTGGAGCGTG  960

Query  1139  TAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTACATA  1198
             | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  961   TTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACATA  1020

Query  1199  TGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGAT-TCTAACTGAG  1257
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct  1021  TGGTCGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATAT-TAACTGAG  1079

Query  1258  TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGATGT  1317
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1080  TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATGT  1139

Query  1318  GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG  1377
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1140  GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG  1199

Query  1378  AGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAATGGA  1437
             ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct  1200  AGCTTTCCTTTCTCAATATCGCTGGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGATGCTCAAATTGGA  1259

Query  1438  GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC  1497
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1260  GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC  1319

Query  1498  AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGATGTG  1557
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
Sbjct  1320  AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTATGGTGATGTG  1379

Query  1558  AACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGT-CCGTTCCAGTCATC  1616
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct  1380  AACGATTTGCAAGCACCTCCGAAAATCAGCACATACACGATTGGTACC-TTCCAGTCATC  1438

Query  1617  AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTCTC  1676
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct  1439  AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCTC  1498

Query  1677  AGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAACA  1736
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1499  AGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGATCA  1558

Query  1737  TTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCTTC  1796
              |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1559  ATCAGTGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCTTC  1618

Query  1797  TGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACTGA  1856
             ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||
Sbjct  1619  TGGTGACTCTGATATTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCTGA  1678

Query  1857  CAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCTGA  1916
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1679  CAATGGTGTTGCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCTGA  1738

Query  1917  GGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGTGC  1976
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1739  GGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGTGC  1798

Query  1977  CTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA  2036
             ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1799  CTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA  1858

Query  2037  CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT  2096
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1859  CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT  1918

Query  2097  GCGGAACAAACTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGACT-CGGAGAGGGAAGCAT  2155
             ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct  1919  GCGAAACAAATTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGA-TGCTGAGAGGGAAGCAT  1977

Query  2156  TCCTGGCGAATCTGCAGGAAGTTGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA  2215
             |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1978  TCCTGGCGAAGCTGCAGGAAGTGGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA  2037

Query  2216  AAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGC  2275
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2038  AAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTAC  2097

Query  2276  GTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA  2335
             ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2098  GTTACAAAGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA  2157

Query  2336  GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTTTGATCACATTGAATTGGCAGAGA  2395
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct  2158  GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTTTGACCACATTGAATTGGCTGAGA  2217

Query  2396  AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGCTGCGGG-GAAAGCAGCAG  2454
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||
Sbjct  2218  AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGTTGCGGGAGAA-GAAGAAG  2276

Query  2455  CAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC  2514
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2277  CAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC  2336

Query  2515  AAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTGGCT  2574
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
Sbjct  2337  AAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGG---CT  2393

Query  2575  AAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGCGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCA  2634
             |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct  2394  AAAGCAGAAGCACCACAAGCCAAGGGATGTGAGCCGGCAGATGAGGGCAAGAGTGAGGCA  2453

Query  2635  GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAA  2694
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct  2454  GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCCGAAGGTAGTGCCTAA  2513

Query  2695  ATGAATGACGAGAGAGAGATG  2715
             |||||||||||||| ||||||
Sbjct  2514  ATGAATGACGAGAGCGAGATG  2534


> Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2
Length=2694

 Score = 3009 bits (1629),  Expect = 0.0
 Identities = 1835/1937 (95%), Gaps = 4/1937 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  178   ATTGAATAACAC--AGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATT  235
             |||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct  14    ATTGAAGAACACAAAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATT  73

Query  236   GCCTTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC  295
             |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  74    GCCTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC  133

Query  296   GTGAGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAG  355
             |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  134   GTGAGACTCCCGCTATTGTATGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAG  193

Query  356   CTGCTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTC  415
             ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  194   CTGCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAGCGCTTAATTGGTC  253

Query  416   GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCG  475
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 
Sbjct  254   GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCC  313

Query  476   AAGGCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTA  535
             |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||
Sbjct  314   AAGGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAGTTATTTGGGAGAGACTAGAGCCTTTA  373

Query  536   C-CCCGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT  594
             | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  374   CTCCC-ACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT  432

Query  595   TTGAATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAG  654
             |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  433   TTGAATGCTGCAGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACAGACCTCCAG  492

Query  655   CGTAGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCAC  714
             || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  493   CGAAGGGCTGTTCTCGACGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCAC  552

Query  715   GAGACTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGAC  774
             ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct  553   GAGACTACAGCAACGGCTTTGGCTTATGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGAC  612

Query  775   CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC  834
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613   CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC  672

Query  835   TTTAAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGG  894
             || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct  673   TTCAAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGGTTTCGATCCCTCCCTTGGAGGAAGG  732

Query  895   GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATT  954
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  733   GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATT  792

Query  955   GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAA  1014
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||
Sbjct  793   GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAA  852

Query  1015  AAGGTTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA  1074
             |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853   AAGGTTCTAAGCGCAAATCCTGTCGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA  912

Query  1075  GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAG  1134
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct  913   GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCTATTCTGGAG  972

Query  1135  CGTGTAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTA  1194
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct  973   CGTGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTA  1032

Query  1195  CATATGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT  1254
             |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1033  CATATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT  1092

Query  1255  GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGA  1314
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1093  GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGA  1152

Query  1315  TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT  1374
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1153  TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT  1212

Query  1375  GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAAT  1434
             ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||
Sbjct  1213  GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCGCTGGCGTGGACAGGAGCAGCTTCCGATGCTCAAAAT  1272

Query  1435  GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT  1494
             ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1273  GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACTGTTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT  1332

Query  1495  GTCAAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGAT  1554
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1333  GTCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGAT  1392

Query  1555  GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCGTTCCAGTCA  1614
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1393  GTGAATGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCA  1452

Query  1615  TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTC  1674
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  1453  TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC  1512

Query  1675  TCAGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAA  1734
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1513  TCAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAT  1572

Query  1735  CATTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCT  1794
             || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1573  CAATCAGAGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT  1632

Query  1795  TCTGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACT  1854
             | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||
Sbjct  1633  TTTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCT  1692

Query  1855  GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCT  1914
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1693  GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCT  1752

Query  1915  GAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGT  1974
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1753  GAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT  1812

Query  1975  GCCTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA  2034
             ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1813  GCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA  1872

Query  2035  GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT  2094
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1873  GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT  1932

Query  2095  ATGCGGAACAAACTGAG  2111
             ||||| |||||||||||
Sbjct  1933  ATGCGAAACAAACTGAG  1949


 Score =  924 bits (500),  Expect = 0.0
 Identities = 604/651 (93%), Gaps = 19/651 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2193  TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA  2252
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2030  TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA  2089

Query  2253  GGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGCGTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA  2312
             |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2090  GGTGGGAGACCCTGTGGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA  2149

Query  2313  TCAGCTTGGTTACTGTATTAACAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTT  2372
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2150  TCAGCTTGGTTACTGTATTAAGAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTT  2209

Query  2373  TGATCACATTGAATTGGCAGAGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC  2432
             ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2210  TGACCACATTGAATTGGCAGATAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC  2269

Query  2433  ATGGCTGCGGGGA-AAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTC  2491
             |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2270  ATGGCTAC-GGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACTCCGGCTC  2328

Query  2492  TCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA  2551
             |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2329  TCTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA  2388

Query  2552  TGACCAAACCAAAGCCGGTGGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGG  2611
             ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2389  TGACCAAACCAAAACC---GGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCCGG  2445

Query  2612  CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA  2671
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2446  CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA  2505

Query  2672  ATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAAATGAATGACGAGAGAGAGATGGTGTTGTATCGATTTT  2731
             ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2506  ATCCCGCTGAAGGGAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGTATCGATTTT  2565

Query  2732  GTTCTTAACTCTTTTTGATTTACCTAGTGGAACCTCTTTTTCTGGTTTCGCTATTATTCC  2791
             ||| |||| | ||    |    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||
Sbjct  2566  GTT-TTAA-T-TT----A----CGTAGTGGAACCTCTTATTCTAGTTTCGCTATTATCCC  2614

Query  2792  CGGAAAAAATCTATATTGTTAATTCTTCCTTTTCGAAAACAATTTTTAGGA  2842
             | |||| | ||||| || | | |||||||||| ||| |||| |||||||||
Sbjct  2615  CCGAAAGATTCTATCTT-T-AGTTCTTCCTTT-CGACAACAGTTTTTAGGA  2662



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 113166117895


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5