BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G16485.1 Length=5647 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg319845 jgi|Araly1|319845|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002861 2250 0.0 Ahg319846 jgi|Araly1|319846|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002862 1991 0.0 Ahg480812 jgi|Araly1|480812|fgenesh2_kg.3__3513__AT2G16485.1 1936 0.0 > Ahg319845 jgi|Araly1|319845|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002861 Length=2019 Score = 2250 bits (1218), Expect = 0.0 Identities = 1335/1393 (96%), Gaps = 2/1393 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3343 ATGCTTACGCTGCGAGAATGTGTTGAGAAACTGCAACTGTTAAAATCTCCAGAGGAACGG 3402 ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGTTTACGCTACGAGAATGTGTTGAGAAACTGCAACTGTTAAAATCTCCAGAGGAACGG 60 Query 3403 CAGCGCAGGCTAGAAGAAATTCCAGAAATACATGCTGATCCCAAAATGGATCCAGATTGT 3462 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAGCGCAGGCTAGAAGAAATTCCAGAAATACATGCTGATCCCAAAATGGATCCAGATTGT 120 Query 3463 GAATCGgaagatgaagatgaaaaagaagaaaaggaaaaagagaaaCAACTGAGGCCGCGA 3522 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GAATCAGAAGATGAAGATGAAAAAGAAGAAAAGGAAAAAGAGAAACAACTGAGGCCGCGA 180 Query 3523 AGCAGTAGCTTTAACAGAAGAGGAAGAGATCCAATATCTCCACGAAAAGGAGGATTTAGT 3582 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| Sbjct 181 AGCAGTAGCTTTAACAGAAGAGGAAGAGATCCAATATCTCCACGAAAGGGAGTATTTAGT 240 Query 3583 TCCAATGAATCATGGACTGGCACAAGTAACTACTCAAATACAAGTGCAAATCGTGAGTTA 3642 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 241 TCCAATGAATCATGGACTGGCACAAGTAACTACTCGAATACAAGTGCAAATCGTGAATTA 300 Query 3643 AGCAGAAGTTATTCTGGTAGAGGTTCTACTGGGAGAGGGGATTATCTTGGTAGTTCTGAC 3702 | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ACCAGAAGTTATTCGGGTAGAGGTTCTACTGGTAGAGGGGATTATCTTGGTAGTTCTGAC 360 Query 3703 GACAAGGTTAGTGATAGTATGTGGACTTCAGCTAGAGAAAGAGAAGTGCAACCATCTTTA 3762 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GACAAAGTTAGTGAAAGTATGTGGACTTCAGCTAGAGAAAGAGAAGTGCAACCATCTTTA 420 Query 3763 GGCTCTGAGAAGCCAAGATCTGTTTCAATTCCTGAAACTCCTGCCAGAAGTTCTCGTGCT 3822 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 421 GGCCCTGAGAAGCCAAGATCTGTTTCAATTCCTGAAACTACTCCCAGAAGTTCTCGTGCT 480 Query 3823 ATTGCACCACCAGAATTATCTCCTAGGATTGCCTCTGAAATTTCAATGGCACCTCCTGCT 3882 |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 481 GTTGCGCCACCACAATTATCTCCTAGGATTGCCTCTGAAATTTCAACGGCACCTCCTGCT 540 Query 3883 GTTGTTTCGCAGCCTGTTCCCAAGTCAAATGATTCAGAGAAAATATGGCATTACAAGGAC 3942 |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GTTGTTCCGCAGCCTGTTCCCAAGGCAAATGAGTCAGAGAAAATATGGCATTACAAGGAC 600 Query 3943 CCATCTGGTAAAGTTCAAGGACCTTTTTCGATGGCGCAGCTCCGTAAATGGAACAACACT 4002 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CCATCTGGTAAAGTTCAAGGACCTTTTTCGATGGCGCAGCTCCGTAAATGGAACAACACT 660 Query 4003 GGGTACTTCCCTGCTAAGTTGGAAATCTGGAAAGC-AAATGAGTCACCGTTGGACTCTGT 4061 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| Sbjct 661 GGGTACTTCCCTGCTAAGTTGGAAATCTGGAAAGCTAAA-GAGTCAGCGTTGGACTCTGT 719 Query 4062 TCTACTGACTGATGCATTGGCTGGACTATTTCAGAAGCAAACCCAGGCGGTGGATAATAG 4121 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 TCTCCTGACTGATGCATTGGCTGGACTATTTCAGAAGCAAACCCAGGCGGTGGATAATAG 779 Query 4122 CTATATGAAAGCTCAGGTAGCAGCTTTTTCTGGTCAATCAAGCCAATCTGAACCCAATTT 4181 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 CTATACGAAAGCTCAGGTAGCAGCTTATTCTGGTCAATCAAGCCAATCTGAACCCAATTT 839 Query 4182 AGGTTTTGCTGCTAGGATTGCTCCAACAACCATTGAGATTCCTAGGAATTCCCAAGATAC 4241 ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 AGGTTCTACTGCTAGGACTGCTCCATCAACCATTGAGATTCCTAGGAATTCCCAAGATAC 899 Query 4242 TTGGAGTCAAGGTGGTAGTCTTCCATCCCCTACTCCAAATCAAATCACAACTCCAACAGC 4301 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 900 TTGGAGTCAAGGTGGGAGTCTTCCATCCCCTACTCCAAATCAAATCACTACTCCAACAGC 959 Query 4302 AAAAAGGCGAAATTTTGAGAGCAGATGGTCTCCAACCAAGCCATCTCCACAGTCAGCTAA 4361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 AAAAAGGCGAAATTTTGAGAGCAGATGGTCTCCAACCAAGCCATCTCCACAGTCAGCTAA 1019 Query 4362 TCAGTCGATGAATTATTCAGTAGCACAATCTGGACAGAGTCAAACTTCTAGGATAGATAT 4421 ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1020 TCAGTCGATGAATTACTCAGTAGCACAATCTGTACAGAGTCAAGCTTCTAGGATAGATAT 1079 Query 4422 CCCTGTGGTTGTAAATTCTGCTGGTGCTCTACAGCCTCAAACTTACCCTATTCCAACACC 4481 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| Sbjct 1080 CCCTGTGGTTGTAAATTCTGCTGGTACTCTACAGCCTCAAGCCTACTCTATTCCAACACC 1139 Query 4482 AGATCCGATCAACGTTTCTGTTAATCACTCTGCGACTCTTCATTCTCCAACACCAGCAGG 4541 |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 AGATTTGATTAACGTTTCTGTTAATCACTCTGCGACTCTTCATTCTCCAACACCAGCAGG 1199 Query 4542 TGGAAAGCAAAGCTGGGGGAGCATGCAGACAGATCATGGAGGAAGCAACACTCCCTCTTC 4601 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| Sbjct 1200 TGGGAAGCAAAGCTGGGGGAGCATGCAGACAGATCATGGAGGAAGTAATGCTCCTTCTTC 1259 Query 4602 TCAGAATAACTCTACGTCTTATGGCACCCCATCTCCTAGTGTTCTCCCCTCACAGAGTCA 4661 |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1260 TCAGAATAGCTCTACATCTTATGGCACCCCATCTCCTAGTGTTCTACCCTCACAGAGTCA 1319 Query 4662 ACCAGGATTTCCTCCATCTGATTCTTGGAAGGTTGCAGTTCCAAGCCAACCGAATGCTCA 4721 |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| Sbjct 1320 ACCAGGCTTTCCTCCATCTGATACTTGGAAGGTTGCAGTCCCAAGCCAACCAAATGTTCA 1379 Query 4722 GGCTCAGGCCCAG 4734 ||||||||| ||| Sbjct 1380 GGCTCAGGCTCAG 1392 Score = 900 bits (487), Expect = 0.0 Identities = 574/614 (93%), Gaps = 13/614 (2%) Strand=Plus/Plus Query 4717 GCTCAGGCTCAGGCCCAGTGGGGTATGAACATGGTGAACAACAACCAAAACTCAGCACAA 4776 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1411 GCTCAGGCTCAGGCTCAGTGGGGTATGAACATGGTGAACAACAACCAAAACTCAGGACAA 1470 Query 4777 CCTCAGGCT----C-C-AGCAAACCAGAACAGCAGCTGGGGTCAAGGGACTGTAAATCCA 4830 ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1471 CCTCAGGCTCAGGCTCTAGCAAACCAGAACAGCAGCTGGGGTCAAGGGACTGTAAATCCA 1530 Query 4831 AACATGGGATGGGTTGGTCCTGCTCAAACTGGAGTGAATGTAAATTGGGGTGGATCTTCT 4890 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1531 AACATGGGATGGGTTGGTCCTGCTCAAGCTGGAGTGAATGTAAACTGGGGTGGATCTTCT 1590 Query 4891 GTTCCCTCAACT-GTGCAAGGAATCACTCATTCTGGCTGGGTCGCGCCTGTCCAAGGACA 4949 |||||||||||| || || |||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 1591 GTTCCCTCAACTGGT-CAGGGAATCCCTAATTCTGGCTGGGGCGGGCCTGTCCAAGGACA 1649 Query 4950 AACACAAGCTTATCCAAATCCAGGATGGGGCCCAACAGGCCACCCTCAATCTCAATCCC- 5008 |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1650 AACACAAGCTTATCCAAACCCAGGGTGGGGCGCAACAGGCCACCCTCAAGCTCAACCCCA 1709 Query 5009 AGTCTCAAGTTCAAGCTCAAGCGGGTACTACGGGCTCGGGATGGATGCAACCAGGTCAAG 5068 || ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1710 AG-CTCAAGTTCAAGCTCAAGCGGGTACCACAAGCGCGGGATGGATGCAACCAGGTCAAG 1768 Query 5069 GGATTCAGTCTGGAAACAGTAATCAAAATTGGGGAACTCAAAATCAGACAGCGATCCCAA 5128 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1769 GGATTCAGTCTGGAAACGGTAATCAAAATTGGGGAACTCAAAATCAGACAGCGATCCCAA 1828 Query 5129 GCGGAGGGTCAGGAGGGAACCAAGCCGGTTACTGGGGAAACCAACAACAGAGCCAGAATG 5188 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1829 GTGGTGGGTCAGGAGGGAACCAAGCCGGTTACTGGGGAAACCAACAACAGAGCCAGAATG 1888 Query 5189 GAGATTCTGGGTATGGTTGGAACAGGCAGTCAGGTGGGCAGCAGAACAACTTCAAGGGAC 5248 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| | Sbjct 1889 GAGATTCTGGGTATGGTTGGAACAGGCAGTCAAGTGGGCAG-A-A-CAACTTCAAGGGGC 1945 Query 5249 AAAGAGTATGCAAGTTCTTCCGCGAAAATGGACATTGTCGGAAAGGAGCATCCTGCAATT 5308 |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1946 AAAGAGTATGCAAGTTCTTCCGCGAAGATGGGTATTGTAGGAAAGGAGCATCCTGCAATT 2005 Query 5309 ACCTCCACAACTAA 5322 |||||||||||||| Sbjct 2006 ACCTCCACAACTAA 2019 > Ahg319846 jgi|Araly1|319846|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002862 Length=1152 Score = 1991 bits (1078), Expect = 0.0 Identities = 1121/1142 (98%), Gaps = 1/1142 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1987 ATGTTTTCATTATGCAAGGGATGTGCCAAGGATGCTGTCTTCTTTTGCATCAGAGGTAAT 2046 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGTTTTCATTATGCAAGGGCTGCGCCAAGGATGCTGTCTTCTTTTGCATCAGAGGTAAT 60 Query 2047 AAGGGTTTGTGTGAGACATGCATGGAGACAGTCAAGTTGATAGAAAGAAAACAGCAGGAA 2106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 61 AAGGGTTTGTGTGAGACATGCATGGAGACAGTCAAGTTGATAGAAAGAAAAGAGCAGGAA 120 Query 2107 AAGGAGCCGGCGCAGTTGGATTTTAATGACAAGACCAGCTGGGAATATCTCTTTAAGGAT 2166 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 121 AAGGAGCCGGCGCAGTTGGATTTTGATGACAAGACCAGCTGGGAATATCTTTTTAAGGAT 180 Query 2167 TACTGGATTGATTTGAAAACCCAGCTATCTTTAAGTCCAGAGGAACTTGATCAGGCTAAG 2226 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TACTGGATTGATTTGAAAACCCAGCTATCTTTAAGTCCAGAGGAACTTGATCAGGCTAAG 240 Query 2227 AGGCCACTGAAAGGACATGAGACCAATGCTAGCAAACAGGGAACAGCCAGTGAGACTGAC 2286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGGCCACTGAAAGGACATGAGACCAATGCTAGCAAACAGGGAACAGCCAGTGAGACTGAC 300 Query 2287 TATGTTACTGATGGAGGATCAGATTCAGATAGTTCTCCAAAAAAGAGGAAGACCAGGAGT 2346 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TATGTTACTGATGGAGGATCAGATTCAGATAGTTCTCCAAAAAAGAGGAAGACCAGGAGT 360 Query 2347 CGATCAAAGTCTGGTTCTGCTGAGAAAATCCTATCATCAGGCGATAAGAATTTGTCAGAT 2406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | Sbjct 361 CGATCAAAGTCTGGTTCTGCTGAGAAAATCCTATCACCAGCCGATAAGAATTTGTCAGGT 420 Query 2407 GAAACTATGGAGTGGGCTTCCAAGGAACTTTTGGATCTGGTCGTGCACATGAGACGTGGT 2466 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 421 GAAACTATGGAGTGGGCTTCCAAGGAACTTTTGGATCTGGTCGTCCACATGAGACGTGGT 480 Query 2467 GACAGATCTTTCTTACCTATGTTAGAAGTACAGACTCTCCTACTGGCTTATATAAAAAGA 2526 ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GACAGATCTTTCTTACCTATGACAGAAGTACAAACTCTCCTACTGGCTTATATAAAAAGA 540 Query 2527 TACAATCTTCGTGATCCCCGTCGTAAAAGCCAGGTTATCTGCGACTCCAGGCTTCAGAAT 2586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TACAATCTTCGTGATCCCCGTCGTAAAAGCCAGGTTATCTGCGACTCCAGGCTTCAGAAT 600 Query 2587 TTGTTCGGCAAATCACATGTTGGACACTTTGAGATGTTAAATCTTCTTGACTCTCATTTT 2646 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 601 TTGTTCGGAAAATCACATGTTGGACACTTTGAGATGTTAAATCTCCTTGACTCTCATTTT 660 Query 2647 CTGAAAAAAGAGCAAAATCAGGCAGATGATATTCAAGGTGACATAGTTGATACAGAAGAA 2706 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CTTAAAAAGGAGCAAAATCAGGCAGATGATATTCAAGGTGACATAGTTGATACAGAAGAA 720 Query 2707 CCTAATCATGTGGATGTTGATGAAAACTTGGACCATCCAGTCAAAAGTGGGAAGGATAAG 2766 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 721 CCTAATCATGTGGATGTTGATGAAAACTTGGACCATCCAATGAAAAGTGGGAAGGATAAG 780 Query 2767 AAACGTAAAACACGCaaaaaaaaTGTCAGGAAAGGACGTCAATCTAATCTTGATGATTTT 2826 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AAACGTAAAACACGCAAAAAAAATGTCAGGAAAGGACGCCAATCTAATCTTGATGATTTT 840 Query 2827 GCTGCTGTTGATATGCACAACATTAATTTGATATACTTAAGGCGGAGCTTGGTGGAAGAT 2886 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 841 GCTGCTGTTGATATGCACAACATTAATTTGATATACTTAAGGCGGAGCTTAGTGGAAGAT 900 Query 2887 CTACTTGAAGATTCTACAGCATTCGAAGAAAAAGTTGCTAGTGCATTTGTTAGGTTAAGG 2946 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CTACTTGAAGATTCTACAGCATTCGAAGAAAAAGTTGCTAGTGCATTTGTTAGGTTAAGG 960 Query 2947 ATATCTGGAAATCAAAAGCAAGATTTATATCGACTGGTTCAAGTTGTTGGCACAAGCAAA 3006 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 ATATCTGGAAATCAAAAGCAAGATTTATATCGACTGGTTCAAGTTGTTGGCACAAGCAAA 1020 Query 3007 GCTCCTGAACCTTATAAAGTTGGCaaaaaaaCAACAGACTATGTACTTGAGATATTGAAC 3066 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 GCTCCTGAACCTTATAAAGTTGGCAAAAAAACAACAGACTATGTACTTGAGATATTGAAC 1080 Query 3067 TTGGACAAAACGGAAGTGATATCCATTGACATTATATCAAATCAAGATTTCACTGAGGAT 3126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1081 TTGGACAAAACGGAAGTGATATCCATTGACATTATATCAAATCAAGATTTCACTGAGG-T 1139 Query 3127 GA 3128 || Sbjct 1140 GA 1141 > Ahg480812 jgi|Araly1|480812|fgenesh2_kg.3__3513__AT2G16485.1 Length=1863 Score = 1936 bits (1048), Expect = 0.0 Identities = 1659/1928 (86%), Gaps = 145/1928 (8%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGATTCTGATTCTGAGAGAGCTTCTCTGGAGTCGATTAAAGATAATTCTGAATGTGTT 60 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1 ATGGATTCTGATTCTGAGAGAGCTTCTCTCGAGTCGATTAAAGATGATTCTGAATGTCTT 60 Query 61 CATGTTTCCAACGAACCTAATCTCACGGCAACATGCGTTGATTCGTCTGTT--------- 111 |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| Sbjct 61 CATGTTTCGAACGAACCTAGTCTCACGGGAACATGCGGTGATTCGTTTGTTGGAGAGGAA 120 Query 112 ---GGA-GAGGA----A-GGAGTTACGGATGTAAATTCGTCCGCCGCTGTGTCGGAGCTC 162 ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 121 GAAGGAGGAGGAGGCGACGGAGTTACGGATGTGAATTCGTCCGCCGCGGTGTCAGAGCTC 180 Query 163 GTGCCGCCGGAGCAAGGAGAAGGTGCGCTTTTGAATTCCGTCCCTGAGATC----A---- 214 | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | Sbjct 181 GCGCCTCCGGAGCAAGGAGAAGGTGCGGTTTTGAATTCCGTCTCTGAGATCAGTGATGTG 240 Query 215 G-TGAAAGGGGGATTCCTGTTGATGTCGTTTCCTCGGTAGATGGAGGAGGAGAAGAAAAT 273 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTTGAAAGGGGGATTCCTGTTGATGTCGTTTCCTCGGTAGGTGGAGGAGGAGAAGAAAAT 300 Query 274 GCAGCTTTTAATATTCAGGAGATTGATTCTGTTGGCGGTGACGCTGCGGCGGTGGAGGAG 333 |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct 301 GCAGCTTTTAATGTTCAGGAGATGGATTCGGTTGGTGGTGACGCTGCGGCGGTGGAGGTG 360 Query 334 GTTCCTCTGAAATCGTCTTCGGTGGTTGGGGAAGGAAGAGAAGAGGAAGCTGGGGCTTCA 393 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | Sbjct 361 GTTCCTCTGAAACCGTCTTCGGTGGTTGGGGAAGGGGGAGAAGAGGAAGGTGCGGCTTTA 420 Query 394 ATCGTCAAAGAAGAGGATTTTGTAGCTGAAGCTAATTTGTCAGGAGATAGGCTTGAGGAA 453 || | | || || || | | ||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 421 AT--T---GGCAG-TGA--TT-CA-C--AAGCTAATTCGTCAGGAGATAGGCTTGAGGGA 468 Query 454 AACAAAGAAGTTTCCATGGAAGAAGAACCTTCATCACATGAGCTCTCGGTTTGTGAGGTA 513 ||| || | | | || ||||| |||||||||| | | || Sbjct 469 AAC----AA------A--G-A-AA-AACCTCCATCACATGA---C-C-----------TA 498 Query 514 AACGGAGTTGATTCTTTGAATGAT-GAGGAAAATAGAGAGGTAGGTGAACA-GATAGTTT 571 ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| | ||||| ||| | |||||| Sbjct 499 AACGGAGTTGATTCTCTGAATG-TCGAGGAAAAGAGAGATGAAGGTGGACATG-TAGTTT 556 Query 572 GTGGAAGTATGGGTGGTGAGGAGATAGAGAGTGATTT------------AGAGTCTAAAA 619 |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 557 GTGGAAGTATGGCTGTTGAGGAGATAGAGAATGATTTAGGGCAGAACACAGAGTCTAAAA 616 Query 620 AGGAAAAGGTAGATGTGATAGAGGAGGAAACCACAGCGCAAGCTGCTTCCTTGGTTAATG 679 |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 617 TGGAAAAGGTAGATGTGATGGAGGAGGAAACTACAGCGCAAGCTGCTTCCTTGGTTAATG 676 Query 680 CA-ATTGAAATTCCTGATGATAAAGAGGTAGCTTGCGTGGCTGGGTTTACGGAAATTTCC 738 | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || Sbjct 677 -ACATTGAAATTCCTGATGATAAAGAGGTAGCTTGTGTGGCTGGGTTTACAGAAATTCCC 735 Query 739 TCTCAAGATAAAGGGTTAGACGAATCA--G-G-AAAT--GG-A-T---TTT-TAGATGAA 786 |||||||||||||| ||||||| ||| | | || | || | | ||| |||| ||| Sbjct 736 ACTCAAGATAAAGGGGTAGACGATTCAGTGCGTAACTCAGGAAGTGAATTTGTAGAAGAA 795 Query 787 GAGCCAGTGAAAGAGTTGCAAATAGGTGAAGGAGCTAAAGATCTGACAGATGGAGATGCA 846 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 796 GAGCCAGTGAAAGAGTTGCAAATAGGTGAAGGAGCTAAAGATCTGACAGATGGAGATGCA 855 Query 847 AAAGAAGGTGTGGATGTTACAGAAGATGAAATGGATATACAGGTATTGAAGAAATCTA-A 905 ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 856 AAAGATGGTGTCGATGTTACAGAAGATGCAATGGATATACAGGTATTGAAGAAATC-AGA 914 Query 906 GGAGGAAGAAAAGGTTGATAGTACTACTGAATTAGAGATAGAAACTATGCGCCTAGAGGT 965 |||||||||||| | | | || | | | | | | ||| || || |||||| Sbjct 915 GGAGGAAGAAAA----G---G---T--TG-A-T-G-G-T-G---CTAAGCCCCAAGAGGT 953 Query 966 -GCATGACGTGGCTACTGAGATGTCCGAC-AAA---A-----C--T-GTTATATCATCAG 1012 | |||| |||||||||||||| |||||| ||| | | | | ||||||||||| Sbjct 954 AG-ATGATGTGGCTACTGAGATCTCCGACAAAATTGAGGTTTCAGTGGATATATCATCAG 1012 Query 1013 CTGTTGTTACTCAGTTTACTGGGGAAACAAGTAATGATAAGGAAACTGTTATGGATGATG 1072 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1013 CTGTTGTTACTCAGTTTGCTGGGGAAACAAGTAATGATAAGGAAACTGTTATGGATGATG 1072 Query 1073 TCAAAGAAGATGTTGACAAGGATTCAGAAGCTGGTAAATCACTGGACATACATGTACCAG 1132 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1073 GCAAAGAAGATGTTGAGAAGGATTCAGAAGCTGGTAAATCACTGGACATACATGTACCAG 1132 Query 1133 AGGCTACAGAAGAAGTAGACACAGATGTTAATTACGGTGTTGGGATAGAGAAAGAAGGCG 1192 ||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1133 AGGCTGTAGAAGAAGTAGAGTCAGACGTTAAGTATAGTGCTGGGATAGAGAAAGAAGGCG 1192 Query 1193 ATGGGGTGGGTGGTGCGGAAGAAGCAGGGCAGACAGTTGATTTGGAGGAAATTCGAGAAG 1252 ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct 1193 ATGGGATGGGTGGTGCGGGAGAAGTACGGCAGACAGTGGATATGGAGGAAATTCGAGAAG 1252 Query 1253 AAAACCAAGAACTGTCTAAGGAACTGGCTCAAGTAGATGAAACCAAGATTTCTGAAATGT 1312 ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| Sbjct 1253 AAACCCAAGAACTATCTGAGGAACTGGCTAAAGTAGATGAGACAAAGATTTCTGAAGTGT 1312 Query 1313 CGGAAGTAACGGAGACAATGATCAAAGATGAGGATCAGGAGAAAGATGACAATATGACTG 1372 | |||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 1313 CAGAAGAAACGGTGACAACAATCAGGGGTGAGGATCAGGAGAAAGATGATGACATGACTG 1372 Query 1373 ATTTGGCGGAGGATGTGGAAAACCATAGAGATTCCTCAGTAGCTGATATTGAGGAGGGAA 1432 ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1373 ATTTGGCGGAGGATGTGGAAACCCATGGAGACTCCCCAGTAGCTGGTATTGAGGAGGGAA 1432 Query 1433 GGGAAGATCATGAAGATATGGGAGTGACAGAGACACAGAAGGAGACTGTTTTGGGTAAAG 1492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 1433 GGGAAGATCATGAAGATATGGGAGTGACAGAGACACAGGAGGAGACTGTTATGGGTAAAG 1492 Query 1493 TAGACAGAACAAAAATTGCTGAAGTGTCAGAAGAAACAGACACAAGGATTGAAGATGAGG 1552 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1493 TAGACGGAACAAAAATTGCTGAAGTGTCAGAAGAAACAGAGACAAGGATTGAAGATGAGG 1552 Query 1553 ATCAGGAGAAAGATGATGAGATGACTGATGTTGCGGAAGATGTGAAAACGCATGGAGACT 1612 ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1553 ATCAGGAAAAAGATGATGAGATGACTGATGGGGCGGAGGATGTGAAAACGCATGGAGACT 1612 Query 1613 CCTCAGTAGCTGATATTGAAGAGGGAAGGGAAAGTCAAGAAGAGATGACAGAGACACAGG 1672 | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1613 CTTCAGTAGCTGATATTGAAGAGGGGAGGGAAAATCATGAAGAGATGACAGAGACACAGG 1672 Query 1673 AGGACAGTGTTATGGCTGA--TG----A--A-GAGCCTGAGGAAGTTGAGGAAGAAAATA 1723 |||| |||||||||||||| || | | ||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1673 AGGAGAGTGTTATGGCTGAGATGGGTGATGAAGAGACTGATGAAGTTGAGGAAGAAAATA 1732 Query 1724 AGAGTGCTGGAGGAAAGAGGAAACGGGGGAGAAATACAAAGACAGTCAAAGGGACAGGAA 1783 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| Sbjct 1733 AGAGTGCTGGAGGAAAGAGGAAACGGGGGAGAAATTCAAAGACAGTGAAAGGAACGGGAA 1792 Query 1784 AGAAGAAAGAGGAAGATGTTTGTTTTATGTGCTTTGATGGGGGTGATCTTGTCCTTTGTG 1843 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1793 AGAAGAAAGAGGAAGACGTTTGTTTCATGTGCTTTGATGGGGGTGATCTTGTCCTTTGTG 1852 Query 1844 ACCGCAGG 1851 |||||||| Sbjct 1853 ACCGCAGG 1860 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 213883560260 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5