BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G17190.1 Length=2181 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg480601 jgi|Araly1|480601|fgenesh2_kg.3__3302__AT2G17190.1 3005 0.0 Ahg480602 jgi|Araly1|480602|fgenesh2_kg.3__3303__AT2G17200.1 1934 0.0 > Ahg480601 jgi|Araly1|480601|fgenesh2_kg.3__3302__AT2G17190.1 Length=2156 Score = 3005 bits (1627), Expect = 0.0 Identities = 1972/2130 (93%), Gaps = 57/2130 (3%) Strand=Plus/Plus Query 20 TCATTTAATTGGCCGTTCGGGG-C--CAAATAA-------CTCTTTAATTTTCTGCAG-- 67 |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| Sbjct 1 TCATTTAATTGGCCGTTCGGGGCCAACAAATAAGTCCTTTCTCTTTAATTCGCTGCAGTC 60 Query 68 -TC-TCATTTGTTATTCGACCAAAAATAATTTATATCCCTTTCCTCAAGAAATCT-T-CA 123 || |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | | Sbjct 61 TTCTTCATTTTTTATTCGACCAAAATTTTTTTATATCCCTTTCCTCACGAAATCTCTAAA 120 Query 124 GAACCGACTTATTAG-AGCTTCGAGTCTCCTCAAATCTTCTTCTACGATTTTTTCTTCTA 182 ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 121 GAACCGACTTA-GAGCTGGTTCGAGTCTCCTCAAATCTTCTTCTTCGATTTTTT-TTCTA 178 Query 183 GGTTTAGAGCTTTTGATTCTCCGATCAATTTCGCGATTTGTTGAACTAGGATCTGAAATT 242 || |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 179 GGGTTAGAGATTTTAAGTCTCCGATCGATTTCGCGATTTGTTGAACTAGGATCTGAAATT 238 Query 243 AGAATGGGTGGTGAAGCAGATTCGAGGCAGCCGCTGACTGCTGAAGGCGTAGCTGTTGCC 302 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 239 AGAATGGGTGGTGAAGCAGATTCGAGTCAGCCGCTGACTGCTGAAGGAGAAGCTGTTGCC 298 Query 303 GTGAACGTCAGATGCTCCAATGGCACGAAATTTAGTGTGACGACGAGCCTCGATTCCACG 362 ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 299 GTGAACGTCCGGTGTTCCAATGGCTCGAAATTTAGTGTGACGACGAGTCTCGATTCGACG 358 Query 363 GTGGAGTCTTTCAAAGAGTTAATTGCGCAGAACAGCGATGTGCCGGCAAATCAGCAGCGT 422 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 359 GTCGAGTCTTTCAAAGAGTTGATTGCGCAGAACAGCGATGTGCCAGCTAATCAGCAGCGT 418 Query 423 TTGATTTACAAGGGACGTATCCTCAAAGACGATCAGACTCTCCTCAGCTATGGTTTGCAG 482 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 419 TTGATTTACAAGGGACGTATCCTCAAGGACGATCAGACGCTTCTCAGCTATGGTTTGCAG 478 Query 483 GCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGTTTTGTGCCTTCTTCTCCTTCTGCTCCCGCT 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 GCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGTTTTGTGCCTTCTTCTCCTTCTGCTCCCGCT 538 Query 543 GCAAATGCTGGAAACCAAACCACTGCTCCTCAAGCGGTTGGTTCAAATGATAGCTCAAAC 602 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 539 GCAAATGCTGGAAACCAAACCACTGCTCCGCAAGCGGTTAGTTCAAATGATACCTCAAAC 598 Query 603 CTCGGAGGAGGTGAATCTTTGTTCCCTGGCCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAAT 662 ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 CTCGGAGGAGGGGAGTCTTTGTTCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAAT 658 Query 663 GCTATGGCTGGATTATTTGGATCTGGTCTTCCTGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTA 722 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 GCTATGGCTGGGTTATTTGGATCTGGTCTTCCTGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTA 718 Query 723 GCTCAGAACCCTAACATGATTAGAGAGATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAATCTTATG 782 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 GCTCAAAACCCTAACATGATTAGAGATATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAATCTTATG 778 Query 783 AACAACCCAGAATTTATGAGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTA 842 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 779 AACAACCCAGAATTTATGAGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTG 838 Query 843 GATCGCAATCCTGAGCTTGGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTA 902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 GATCGCAATCCTGAGCTTGGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTA 898 Query 903 GAAGCGGCGAGAAACCCAGAGCTTATGCGTGAAATGATGAGAAATACTGATAGGGCTATG 962 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| Sbjct 899 GAAGCGGCAAGAAACCCAGAGCTTATGCGTGAAATGATGCGGAATACCGATAGGGCTATG 958 Query 963 AGTAATATTGAGTCTATGCCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTC 1022 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 AGTAATATTGAGTCTATGCCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTT 1018 Query 1023 CAGGAACCGTTAATGAATGCTACCACTATGTCCGAGAATGCTGGAAACAATACGAG-CTC 1081 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| Sbjct 1019 CAAGAACCGTTAATGAATGCTACCACTATGTCCGGGAATGCTGGAAGCAATAC-AGGCTC 1077 Query 1082 TAATCCATTTGCTGCTCTTCTGGGAAACCAGGGGGTTACTACACAAGGAAGCGA--TACT 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || Sbjct 1078 TAATCCATTTGCTGCTCTTCTGGGAAACCAGGGGGTCACTACACAAGGAAGCGACGT-CT 1136 Query 1140 TCTAATAATATTTCGGCACCGAATGCTGAAACGGGTACACCTAATGCAAATCCACTTCCT 1199 ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 -CTAATAATACTTCGACACCGAATGCTGAAACGGGTACACCTAATGCAAATCCACTTCCT 1195 Query 1200 AATCCTTGGGGTGCCACGGCTGGCCAGACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGCTGGACTT 1259 ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1196 AATCCATGGGGTGCTACGGCTGGCCAAACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGCTGG--T- 1252 Query 1260 GGTGGTCTTGGTGGGCTTGGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTGGGAGCGGACTCACCT 1319 ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1253 GGTGGACTTGGTGGTCTTGGTGGCCTTGCTGGTCTTGGTATGCTGGGAGCAGACTCACCT 1312 Query 1320 CTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAAATACTGCAAAACCCCGCTATGTCG 1379 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1313 CTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAGTTGAGCCAAATACTGCAAAACCCAGCTATGTCG 1372 Query 1380 CAGATGATGCAAAGCGTACTTTCCAATCCACAGTACATGAATCAGCTTATGAGTCTTAAC 1439 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1373 CAGATGATGCAAAGTGTACTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAGTCTCAAC 1432 Query 1440 CCACAACTCCGAAGCATGCTAGATATGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAACCCT 1499 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1433 CCGCAACTCCGAAGCATGCTAGATATGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAACCCT 1492 Query 1500 GATTTCCTTCGCCAGTTTAGCTCTCCCGAGATGATGCAGCAAATGATGTCTCTACAACAA 1559 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1493 GAATTCCTTCGCCAGTTTAGCTCTCCAGAGATGATGCAGCAAATGATGTCTCTACAACAA 1552 Query 1560 TCACTTTTCTCTCAGAATAGGAACACGGCTGGCCAGGATCCTACGCAAACTGGTGCTGCG 1619 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1553 TCACTTTTCTCTCAGAATAGGAACACGGTTGGCCAGGATCCAACGCAAACTGGTGCTGCG 1612 Query 1620 ACAGGGACAGCCAATAACGGAGGACTAGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGCCTTGGT 1679 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1613 ACAGGGACAGCCAATAACGGAGGGCTGGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGTCTTGGT 1672 Query 1680 GCTGGCGGCCTAAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGATTTGCGACT 1739 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1673 GCTGGCGGCCTGAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGATATGCGACT 1732 Query 1740 CAGTTGCAACAGTTGCAAGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGGGCTTTG 1799 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 1733 CAGTTGCAGCAGTTGCAAGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGAGCGTTG 1792 Query 1800 CTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATTGGCCAG 1859 |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1793 CTTGCAACTAATGGCAATGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATTGGCCAG 1852 Query 1860 TAACATACAGGATCGCGAACTTGTGGATAGAAAAGCCGCTCATCGATACACTATTTGTTT 1919 || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| Sbjct 1853 TAGCATACAGGATCGTGAACTTGTGGATAGAAAAGCTGCGCATGGATACAGTATTTGTTT 1912 Query 1920 TCAATGGTCATCTTCTTTCCTCTTTACCCAATCCCCACAACCTTTTTTACATACTTTGGG 1979 | | ||| |||||||||| | ||| | ||| | || | || ||| Sbjct 1913 TTAGTGGCCATCTTCTTT--T-TTT------T----ACA---T-----AC-T--TT-GGG 1947 Query 1980 TCGTCTGTTATCTTTCAGATTCTATTTGAAGTTGTTACCTCGTACATCTGTAGAAGTTGA 2039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1948 TCGTCTGTTATCTTTCAGATTCTATTTGAAGTTGTTACAACGTACATCTGTAGAAGTTGA 2007 Query 2040 TTTCGAAATGTGGAATGGTTACATTTACGTTTTCTTATCTCCATTT-TACTTATTAAATA 2098 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| Sbjct 2008 TTTCGAAATGTGGAATGGTTACATTTACGTTATCTTTTCTCCATTTAT-CTTAT-AAATA 2065 Query 2099 TAGCTGTAGTG-ACGTTGATAATTTGTGAT 2127 |||| || || |||||||||||||||||| Sbjct 2066 TAGCCGTTGTATACGTTGATAATTTGTGAT 2095 > Ahg480602 jgi|Araly1|480602|fgenesh2_kg.3__3303__AT2G17200.1 Length=1947 Score = 1934 bits (1047), Expect = 0.0 Identities = 1497/1707 (88%), Gaps = 59/1707 (3%) Strand=Plus/Plus Query 229 TAGGATCTGAAATTAGAATGGGTGGTGA---AGCAGATTCGAGGCAGCCGCTGACTGCTG 285 ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||| | Sbjct 83 TAGGATCCGAAATTAGAATGGGTGGAGAGGGAGGAGATTCGAGTCAGCCGCAGACTGGAG 142 Query 286 AAGGCGTAGCTGT-TGCCGTGAACGTCAGATGCTCCAATGGCACGAAATTTAGTGTGACG 344 |||| | |||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct 143 AAGGAGAAGCTGTCT-CCGTGAACATCAGGTGCTCAAATGGCACGAAATTTAGTGTGAAG 201 Query 345 ACGAGCCTCGATTCCACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTAATTGCGCAGAACAGCGATGTG 404 |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| Sbjct 202 ACGAGCCTTGATTCGACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTGGTGGCTCAGAGCAGCGATGTT 261 Query 405 CCGGCAAATCAGCAGCGTTTGATTTACAAGGGACGTATCCTCAAAGACGATCAGACTCTC 464 || || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||| Sbjct 262 CCAGCCAATCAGCAACGCTTGATTTATAAGGGTCGGATCCTCAAGGACGATCAAACTCTC 321 Query 465 CTCAGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGTTTTGTGCCTTCT 524 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| Sbjct 322 CTCAGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACAATTCATATGGTTCGAGGCTCTGCACCTTCT 381 Query 525 T------CTCCTTCTGCTCCCGCTGCAAATGCTGGAAACCAAACCACTG---C------T 569 | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | Sbjct 382 TCAGCACCACCTTCTGCTCCGGCTGCGAATGCTGGAAACCAAACCACTGCACCTAGTGTT 441 Query 570 CCTCAAGCGGTTGGTTCAAATGATAGCTCAAACCTCGGAGGA---GG---T---GAATCT 620 ||| || |||||||||| || ||||||| || || |||||| || | |||||| Sbjct 442 ACTCGAGGGGTTGGTTCAGATAATAGCTCGAATCTAGGAGGAGCGGGTCCTGGGGAATCT 501 Query 621 TTGTTCCCTGGCCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAATGCTATGGCTGGATTATTT 680 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 502 TTGTTCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAATGCTATGGCTGGGTTATTT 561 Query 681 GGATCTGGTCTTCCTGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTAGCTCAGAACCCTAACATG 740 ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 562 GGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTAGCTCAAAACCCTAATATG 621 Query 741 ATTAGAGAGATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAATCTTATGAACAACCCAGAATTTATG 800 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 622 ATTAGAGATATGATGAATACACCAGCCATCCAGAATCTTATGAATAACCCAGAATTTATG 681 Query 801 AGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTT 860 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 682 AGGAGTATGATTATGAGTAACCCACAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTT 741 Query 861 GGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTAGAAGCGGCGAGAAACCCA 920 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| Sbjct 742 GGCCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGGCAAACTTTAGAGGCAGCGAGAAACCCA 801 Query 921 GAGCTTATGCGTGAAATGATGAGAAATACTGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATG 980 ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 802 GAGCTTATGCGTGAAATGATGCGGAATACCGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATG 861 Query 981 CCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCGTTAATGAAT 1040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 862 CCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCTTTCTTGAAT 921 Query 1041 GCTACCACTATGTCCGAGAATGCTGGAAACAATACGAGCTCTAATCCATTTGCTGCTCTT 1100 ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 922 GCTACTACTATGTCAGGGAATGCTGGAAACAATACGAGCTCCAATCCGTTTGCTGCTCTC 981 Query 1101 CTGGGAAACCAGGGGGTTACTACACAAGGAAGCGATACTTCTAATAA-TATTTCGGCACC 1159 ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| | || | || | Sbjct 982 CTGGGAAACCAGGGGGTTACTACTCAAGGAAGTGTTGCTTCTAATAACTCTTCCA-CAAC 1040 Query 1160 GAATGCTGAAACGGGTAC-A--CCTAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCCAC 1216 ||| ||| |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1041 AAATACTGGAACGGGGACTATTCCGAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCTAC 1100 Query 1217 GGCTGGCCAGACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGCTG--G---A--CTTG--G---TGG 1264 || |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | | | | ||| Sbjct 1101 GGGTGGCCAGACAACTGTCCCTGGAAGGACCGATGCTGCTGGGGATGCGAGAAGCCCTGG 1160 Query 1265 TCTTGG-----T-GGG---CTTGGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTGGGAGCGGACTC 1315 ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || Sbjct 1161 CCTTGGCGGCCTTGGGGGTCTTGGAGGCCTCGGTGGACTTGGTATGCTTGGAGCGGATTC 1220 Query 1316 ACCTCTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAAATACTGCAAAACCCCGCTAT 1375 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || Sbjct 1221 ACCTCTTGGTGCCACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAGTTATTGCAAAACCCAGCCAT 1280 Query 1376 GTCGCAGATGATGCAAAGCGTACTTTCCAATCCACAGTACATGAATCAGCTTATGAGTCT 1435 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1281 GTCGCAGATGATGCAAAGCGTATTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAATCT 1340 Query 1436 TAACCCACAACTCCGAAGCATGCTAGATAT-GAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGA 1494 |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1341 TAACCCACAACTCCGAAGTATGCTAGAT-TCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGA 1399 Query 1495 ACCCTGATTTCCTTCGCCAGTTTAGCTCTCCCGAGATGATGCAGCAAATGATGTCTCTAC 1554 | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1400 ATCCAGATTTCCTTCGTCAGTTTAGTTCTCCGGAGATGATGCAGCAAATGATGACTCTAC 1459 Query 1555 AACAATCACTTTTCTCTCAGAATAGGAACACGGCTGGCCAGGATCCTACGCAAACTGGTG 1614 | ||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| | ||||||||||| Sbjct 1460 AGCAATCACTTTTATCTCAGAATAGAAACGCAGCCAGCCAGGATGCGGGGCAAACTGGTG 1519 Query 1615 CTGCGACAGGGAC-AGCCAATAACGGAGGACTAGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGC 1673 |||| |||||||| | | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1520 CTGCCACAGGGACGAAC-AATAACGGGGGGCTGGATTTATTAATGAATATGTTTGGCAGT 1578 Query 1674 CTTGGTGCTGGCGGCCTAAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGATTT 1733 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | Sbjct 1579 CTTGGTGCTGGCGGCCTGAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCCGAGGAGCGCTAT 1638 Query 1734 GCGACTCAGTTGCAACAGTTGCAAGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGG 1793 || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1639 GCTACTCAGTTGCAACAGTTACAGGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGA 1698 Query 1794 GCTTTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATT 1853 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1699 GCATTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAATGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATC 1758 Query 1854 GGCCAGTAACATACAGGATCGCGAACT 1880 || ||||| |||||||| | | ||||| Sbjct 1759 GGACAGTAGCATACAGGTTGGTGAACT 1785 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 82084477975 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5